الجزء الـ slide هذا بعد ما اتكلمنا كيف الـ DNA
شكله وكيف بتم عملية انقسام الخلايا أو نوعين
الانقسام بهدف ابقاء عدد الخلايا كما هما اللي هو
الـ Mitosis عشان يظل عدد الخلايا زي ما هماوالـ
Meiosis اللي هو موضوع لما يكون اللي هو الانخسام
المنصف حيث أنه يطلع عند الـ Gametes و بالـ Males و
الـ Females بتتبع فطوات قريبة من بعض على مرحلتين،
المرحل الأولى بتبدأ الخلية 2N بتصير 4N و بعدين
بتنقسم إلى الخلايا تبعتهااللي هو سواءً الـ Sperms
أو الـ Egg اللي بتطلع الآن الموضوع الثاني راح نبدأ
اليوم إحنا بعد ما بدأنا نحكي إنه الـ DNA هو المصدر
اللي بيحدد كيف راح يكون ترتيب البروتين أو الـ
Primary Structure تبع البروتين اللي هو ترتيب الـ
ترتيب الـ Amino Acids اللي هو الـ Primary
Structure للبروتين ويكون ترتيب الـ Amino Acids
طبعاً لازم تكونوا عارفين من ال Biochemistry أنه في
عنا عشرين أو واحد وعشرين Amino Acids حسب مرات تبقى
هيك ولي هيك فأحد هذه الطرق اللي هو حاطينها تحت
اللي هي هنا Abbreviations for Amino Acids فعنا
الألانين والأرجانين والأسبارجانين بالشكل هذاففي
ثلاث نظم لكتابة أسماء الـ Amino Acids في الـ
.. أنا والله خلّيني أشوف الكاميرا الـ .. إيه قاعد
المشاركة؟ المشكلة زي الـ «زوم» ما كنت أنا أدخل من
قبل مش راضي .. إيش اسمه؟stop recording share
screen start video
ناخذ التطبيق PowerPoint
وأقول له start my video هذا الجهاز مش جهازي ما هو
اسمه؟ مش جهازي؟ فمش عارف 100% طيب فبالنسبة لهناك
ثلاثة أنظمة للتعريف الـ «among us» بالعشرين اللي
هما يأمل ثلاث أحرف ذلك ألانين أو حرف الـA أو بالتو
كامل ألانين فهذه أسماءالـ Amino Acids وكتير من
الظواهر الحيوية والظواهر في حياة الإنسان نعتمد
على الـ Amino Acids يعني مثلا فينال، كيوتون،
نيوريا، مرض نتيجة الفينال الأنانين Metabolism
Problemأو مثلًا في عندنا Serine Protease أو عندنا
كذا فنستخدم كثير مصطلحات اللي دخل بالـ Amino Acids
فالآن حتى نفهم القطع اللي فوق اللي هي الـ Genetic
Code هذه طريقة ترميز الـ Amino Acids من خلالأحرف و
الـ Bases أو الـ Nitrogenous Bases تبعات الـ
Nucleotides فمن تركيب الـ DNA بنحوله لتركيب أو
ترتيب الـ Amino Acids فلو كان اللي اكتشفوه العلماء
أنه لو كان الأمر بيكون من خلال Single Nucleotide
كان نقدر نعمل شفرة لـ 4 amino acids لو كان عندي
Two Nucleotides بيثيروا هم اللي بيعملوا الـ
الـ Coding أو التشفير أنه Two Amino Acids فالأول
أربعة فينا واحد من أربع احتمالات والثاني أربع
احتمالات ثانية ففي الحالة دي راح يكون ستاشر
Nucleus ستاشر Amino Acids نقدر نرمز إليهم فثبت إنه
لأ هم ثلاثة كل ثلاثة بنقروا مع بعض وكل ثلاثة مع
بعض برمزوا ل Amino Acid واحدفعشان هيك بنسميهم
Codon أو Triplet أو كده عبارة عن ثلاث من الـ
Nucleotides حتى يرمزوا لواحد من الـ Amino Acid
طبعاً أربعة بأربعة بأربعة بتصير أربعة و ستين
فالأربعة و ستين زيادة عن الأشرين Amino Acid بس
بتغطيهم و راح نشوف كيف الأمور تتطور
الجدول هذا أمامكم حاطين بالأول ما هي الـ First
Base مرات بتكون U, C, A أو G طبعاً الـ U لأنها حلت
في الـ RNA مش الـ DNA الـ RNA حلت بدل الـ T الـ
Second Base هذا اللي هو ترتيبهم U, C, A, G وبعدين
هنا الـ Third Baseحاطينها بالترتيب شُلّي عندنا
فبنلاحظ إذا كان عندنا ترتيب مثلا كودون ثلاثي U U U
هذا فلع الألاني U U C فلع الألاني كمان U U A لـ C
U U G لـ C C U U لـ C C U C لـ Cالـ PUA Lucy يعني
إنها أربعين، إنها أربعة وستين، بده رمز للعشرين
فيكم، فبصير عنده تكرارات، بعض الـ Amino Acids يمكن
مالهاش غير مثلًا زي المستانيينين الـ AUG هذا
الترتيب تبعها، فالـ
الآن الترتيبات هذه زي ما أنتم شايفين عشان يكون الـ
… نرمز لـ 20 Amino Acids من خلال ثلاثيات من الـ
Nucleotides ثلاثيات من الـ Nitrogen Bases بحيث أنه
يعطينا إياها بس بدنا نلاحظ كمان شغل تاني إذا
بتنتبهوا للجدولUAA وUAG وUGA هدولة stop كودهم
انتبهوا هدولة الثلاثة حاطينهم انه يعني عشان
القراءة تبدأ من محل معين وتنتهي في محل معين بالأول
لازم يكون عندي أنا بدور على ال well startهي لازم
يكون start كده مش
شايف أين برولين وكده وفيه ال stop ال stop عشان
يوقف قراءة ال RNA في محل معين هنا ال start مانيش
شايفه بس
لازم يكون في محلبيخلّي النظام
في قراية الـ Messenger RNA ويعني في عملية الـ
Transcription للـ DNA لـ Messenger RNA بدي يقولّه
ابدأ من هذه المكانة فالمحل البداية لازم يكون ترتيب
معين بيقولّه ابدأ من هنا وفي نفس الوقت في إشي
بيقولّه انتهي هنا فهذه النقطة اللي بدنا إياهاوهيك
النظام اللي بتتم من خلاله ترميز الـ Amino Acids
اللي بتدخل في ترتيب البروتيد الناتج عن هذا الجين
فالجين هو اللي في الـ DNA هو اللي راح يعطينا الـ
Messenger RNA هو اللي راح يعطينا إياه فأظن هنا الـ
ATG وطبعاً يعني الفكرة أنه إحنا بنقرا الـ
Transcription
كل ثلاثة مع بعض، كل ثلاثة مع بعض، كل ثلاثة مع بعض
فالـ Transcription أعطانا الـ Messenger RNA والـ
Translation راح تعطينا الـ Amino Acids حطين هنا
الأسماء اللي هي المفروض بالأحرف لـ Amino
Acids اللي تدخل في تركيب البروتين هذافهذه اسمها
كلمات مهمة كثير اللي هي أنه في عندي startup Start
on Codon و بعدين ببدأ عملية Transcription وعطينا
الـ Messenger RNA الـ Messenger RNA كل ثلاثة بدخل
فيه اللي هو Transferial RNAبتبركب على الـ ribosome
اللي فيه ribosome RNA على الـ messenger RNA بحيث
يقرأ الـ الـ الـ الـ البروتينات الموجودة بحيث
يعطينا بالأقيل البروتين ماشي فالـ translational
reading frame is determined by the AUG initiator
codon اللي حفظ عليه السحنوالـ Subsequent Codewords
Specifying the Binary Assets ‏are indicated in
blue، ناشي ‏The two other potential frames are not
tuned، ناشي فالـ هنا الـ AUG هو البداية يعني هذا
أجى Messenger RNA عشان يكون خربط أو لا إشيلحد
بيصير الـ Ribosome يبدأ يلف ويشبك عليه وينتبه لحد
ما يشكوك هدولة في ثلاثة بعدين بيصير يقرا فيهم فهيك
الظاهرة اللي بتتم في عملية
بناء البروتين من الـ Messenger RNA من الـ DNA
وبتكون هي هيك موجودة إن شاء الله الأمور واضحة
على الـ WhatsApp احكولي إذا أنا آسف جدا اليوم غريب
يعني إن شاء الله المرة الجاية بتكون أحسن وانا ماني
عارف شو اللي صار يعني بدا يمكن أعد فرمات الـ hard
disk إذا في أسئلة ابعتلي إياها على الـ WhatsApp
أنا أفتح الأثنين أثناء اللي نيجي نتطلع على بعض الـ
الآن هناك ترتيب مطلوبة حتى يلف السلك تبع الـ DNA
على حاله ففيه إيش اسمه الـ nucleosomes وإيش اسمه
الـ histones والسنتين مطلوبات حتى الـ DNA يلف على
حاله بغض انه يصير عملية برضه بالشكل المطلوب لعملية
الـ meiosis و الـ mitosisالـ .. الآن اتكلمت هيك
بشكل .. حتى يعني نفهم جانب آخر وشو ضرورة الواحد
يكون فاهم هيك بشكل مبدأ Concept هيك ال .. ال .. ال
.. ليش الـ Nucleosomes و الـ Histones غير قضية
احتجاج نقلهم في عملية .. في عملية انقسام الخلية
اللي هي ظاهرة التحكم إنه أحيانًا كثيرة بتتم التحكم
بالـ DNA عن طريق آليات، Mechanisms تستطلب أنه أدد
كبير من الجينات يتم تشغيلها في مكان معين أو
توقيفها في مجال آخروهذه إليها دخل أحيانًا أو إليها
دخل مهم في اللي بنسميهم الـ Polygenic Diseases
يعني الأمراض اللي فيها عدد كبير مشترك من الجينات
بتسبب المرض هذه بتكون أنه عدد كبير مش جين واحد
يعني إحنا راح ناخد بعد شوية بإنه بنقسم الأمراض
لثلاث أنواع ورافياًفيه كرموزومال يعني كرموزوم كامل
بار، ذاد، نقص، كده وفيه Mendelian يعني One-G اللي
هو اللي عامل المشكلة فدول أمراض بشكل عام نادرة
الأمراض غالبية العظمة زي السكري، الضغط، الربوء،
كده هذه أشياء بتلاقي أن مجموعة كبيرة من الجينات
بتتم تأثير
عليهاطريقة كيف إنه عدد كبير من الجينات سواء تشتغل
كثير أو تشتغل قليل أو كيف تختلط بطريقة معينة أو
أخرى باعتمد على ما يسمى الـ Epigenetic Mechanisms
فالـ Epigenetic Mechanisms على قل المشهورات منهم
غير اللي بيسموه Micro RNA بتصير عملية الـ DNA
Methylationيعني الـ Retinal Group بتيجي وتشبك على
قطعة معينة أو على نيوكلوتايد معين في الـ DNA لما
تصير عندي الـ DNA methylation بتغير وظيفة الجين
هذا وطريقة تانية اللي هي الـ Modification لـ
Histone Tail الـ Histone و الـ Nucleosomes و الـ
Histonesبصيرهم برضه عمليات «metallation» وهدولة
يعني بيغيروا
في شكل وظيفة الـ «DNA» بس ما بيغيروا في ترتيب الـ
«Nucleotides» و لا بيغيروا يعني ما بنقدر نعتبرهم
تفرات ما بنقدر نعتبرهم زي بقية الأمراض لما ناخد
عليها الـ «coding» فـ Epigenetic يعني بيسموه علم
التخلقبكون إنه فيه اختلالات في وظيفة الـ DNA على
مستوى حدد كبير من الجينات مع بعض بكون نتيجة ظواهر
زي عملية الـ methylation للـ DNA أو تغيير على الـ
histones أو الـ nucleosomes اللي مطلوبة حتى لف الـ
DNA بالشكل اللي بنشوفه فوق حتى يعطينا كرومزوم شكل
مضغوط يعرف يفصل عن بعضهفيه آليات أخرى للـ
Epigenetics نحكي عنها بعدين بس يعني هاي بواهر
موجودة وأشياء مهمة هنا الفرق الكيماوي لـ Cytosine
مع الـ 5-Methylcytosine وممكن 5
-Hydroxynethylcytosine كيف أنه بتصير تغييراتالـ
DNA على مستوى الـ DNA لطبيعة الـ methylation وهاي
حسب درجتها وكمياتها بتأثر على وظيفة الـ DNA اليوم
والآن نتيجة ضرفنا يعني يمكن راح يكون صعب أن أسمع
منكم بس إذا فيها أي أسئلة ان شاء الله بالـ group
أو بكذا بنسويها مرة تانية
الآن أحيانًا الترتيب
وكيف الـ DNA راح يصيرأحنا بالـ Nucleus الأصل إنه
الكرموزومات كلها بالأول يعني زي ما تقولوا خاردة
حالها و تستخدم عشان تقرأ الجينات و كده و إنه
دايماً لما يصير عندي قراءة لجين معين لازم بالأول
يصير عملية تنشيط لهذا الجينيفك حتى يبدأ يقرأ أمن
الـ DNA تبعه ويعطينا الـ Messenger RNA في عندي
بيسموها الـ Promoter Regions يعني إشي بده يفهم
آليات النسخ أنه ابدأ من هنا وهي اللي هي بتتم عملية
استفادة منها في التحكم في وظيفة الـ DNA عشان يبدأ
يشتغلوهدولة يعني آليات التحكم ممكن إشي مباشر قبل
الـ DNA زي هيك الـ Promoter Region بنسميها أو
أحيانًا بتكون قطعة أخرى من مسافة بعيدة يعني زي هيك
ممثلينا إنه إشي قبله مسافة طويلة بس برضه بتدخل إنه
يتحكم Long Range Regulatory Element فبتلاقي من محل
بعيدحتى يتحكم بالـ Intel وهذا يعني يبدو
الواحد يستوعبها على إنه هي الظواهر
اللي احنا الآن بلاحظها
وبتحاول تفسر كيفية وظيفة هذا النظام المعطليعني
احنا صحيح في عندنا 25 ألف جين بس مش بس ان الواحد
جين وانتهينا يعني نفس الجين ممكن أكتر من قطعة لازم
الجين إله بداية وإله نهاية 25 ألف جين لكل أنواع
خلايا الجسم في الخلية مثلا الفلانية مثلا خلية عضلة
بدها Acetinomycin عشان هي عضلةبينما مثلًا خليط
الدم الحمراء بدها Hemoglobin خليط المناعة بدها
Immunoglobulin البروتين تبعها فكيف كل واحدة تهتزي
إنه تنشط ولا تتطبط ولا تغير ولا كذا من خلال أنظمة
التحكم فجزء من أنظمة التحكم في شكل الـ DNA نفسه
طريقة تركيبه و تركيبه حتى يستطيع إنه ينقص من قسم
الخلاياوفي نفس الوقت حتى تكون وظيفة يعني حتى تقوم
الخلية بوظيفتها الـ Methylation هي سؤال احنا يعني
حالياً أنا لست على الطلاع إنه إله فايدة أو وظيفة
معينة، ظاهرة و بتحدث يعني الأحيان
إذا قعدت نستفيد منها البروتينات مثلا بتمن عملية
الـ glycosylation للبروتين كل البروتين وقعدت
نستفيد منها في التحكم في السكري لإنه بنشوف قداش
نسبة الـ glycosylated hemoglobin percentage فهي
أعتبرها ظاهرة بتحدث ودرجتها ووجودها
يعني هي ظاهرة بتحدث، هاي أولاً، بسشو هدفها؟ أنا
ماعندي اطلاع إنه إلها وظيفة معينة بس لما تحدث
بتأثر في وظيفة الـ Gene بحيث أنه بنتج عنه اختلافات
والجيار المختلفة ممكن
يعني بقول إنه بيأثر على وظيفة الـ Gene سواءأحيانًا
بعضها ممكن يتنشط وبعضها ممكن يتطبط، أنا مش
بالضرورة يعني في كثير من الأمراض مثلًا، الأمراض
اللي ربه أنا على خيلها عليها، في مجموعة جينات
كثيرة بتصير لها عملية تنشيط، وفي جينات أخرى بتصير
عملية تخبير، وهذه يعني زي ما بقول يعني رابط المثال
قبل ذلك، زي فرقة موسيقية يعنيالـ Orchestra
بتشوفوهم مثلا قاعدين حوالي ميت عازف فالمية مثلا في
لحظة معينة بدك كلهم أو ربعهم أو جزء معين أو نوعي
معين يتنشطوا الجزء بدك ياهم يتطبطوا فهذه كلها
واردة يعني فهي ظاهرة بتحدث وهي ظاهرة تشارك في
التحكم في وظيفة الـ DNA وبالتالي قد تكون لها يعني
دور في حكينا الأمراض اللي بنعتبرها polygenic يعني
الأمراض اللي فيها ليس جين واحد، مش مندالين، راح
تكون الأمراض اللي هي زي الضغط والسكري والربو أشياء
ويراتية، أشياء تكثر في عائلات معينة بس وجزة منها
ويراتي صحيح ولكن مش مندالين، مش جين واحد هو المسبب
للمرض
فأحيانًا اللي بدنا
ننتبهه من الظواهر الأخرى اللي بتعمل واحنا بنحاول
نصف شو بيصير في جسم الإنسان أنه مثلًا
أنا لأني متأكد 100% من هذا الكلام وفي جانب درسته
بشكل كبيربالنسبة للـ Protein تبع الـ
Immunoglobulin تبع اللي موجود بيشتغل في الـ B
-Lymphocyte ماشي ال Immunoglobulin أنا عندي Two
copies of the DNA واحد من أبوي واحد من أمي أثنانهم
عليهم جزء من الـ DNA للـ Heavy Chain للـ Heavy
Chain وفيه لل Light Chain أربع copies يعني فنتين
فنتينوالـ Heavy Chain واحد بواحد ففيه Syntax بس في
أي خلية من الـ B-Lymphocyte لوحدها بتكون فقط نسخة
واحدة من الـ Heavy Chain ونسخة واحدة من الـ Light
Chain هم اللي شقالين بالنسبة للـ Heavy Chain كان
عندي خيارين طلعلي خيار واحد أو بس واحد هو الفعال
الثاني بيبقى له ساكن لأن لا يتم عملية الـ
Transcription و Translation لهوبالنسبة للـ Light
Chain مع أن عندي أربع احتمالات بس في أي خلية بيكون
واحد فقط هو اللي شغال فاللي بدنا نذكره هنا أنه هذه
بدنا نسميه «mono-allelic expression» يعني في هذه
الخلية الـ DNA الـ RNA أو الناتج اللي هو نتيجة الـ
DNA بيكون من كوفي واحدةفمثلًا هنا في عندى بنسميه
«mono-allelic expression» وهنا «balanced
expression» يعني الأثنين بيشتركوا أنه يصير عملية
الـ Transcription وبعدين Translation في اللوم وفي
أحيانًا بيكون عندى ظواهر اللي يسمونه «allelic
imbalance» يعني هنا الغالبين العظمى جاي من هنا بس
هداك موجود بس كمية قليلة فالـ Snapsاللي موجودة في
الـ RNA مش عارف ليش حطوا هاي الـ SNP بالذات اللي
هي Single Nucleotide Polymorphism يعني الـ SNP
هدولة هما القاليه اللي استخدمناهم عشان نعرف أن هاي
أجت من هذا وهنا أجن بالنص من هنا وهنا يعني الـ SNP
هو Single Nucleotide Polymorphism راح نحكي عنه بعد
شوية فمن خلاله بقدر أعرف أني نسخةالـ DNA اللي تم
الـ Transcription تبعها بحيث أنه أعطاني الـ
RNA هذا فالفكرة
هنا أنه صحيح أنا عند جينين أو نسختين من الـ
Chromosomes ونسختين من الجينات وكذا بس مش دايماً
أنه أثنين لازم أثنين يشتغلوا أحياناًالإثنين
بيشتغلوا زي بعض تمامًا وبكون موجودين يعني مثلًا
الـ Hemoglobin في Alpha و Beta Chain راح ناخدها
الـ Beta Chain فيها نسخة واحدة واسنتين شغلتها الـ
Alpha Chain فيه أربعة لأنه فيه على كل كروموزوم Two
Alpha Chain Gen فبصير عندي أربعة مصادر ممكن أنا
أخد أي واحدة منهاممكن الأربع كلهم يشتغلوا ممكن بس
واحد اللي يشتغل ممكن أثنان يشتغلوا ممكن ثلاثة
يشتغلوا ممكن الأربع
جاية من الـ Beta
-Gene الأصل والـ Beta-Gene موجودة في نسكتين عندي
واحدة من أبوي واحدة من أمي فلما
نكون ندرس هذا الموضوع بشكل تفصيلي من خلالدراسة
الفروق الدقيقة هتكون على مستوى Single Nucleotide
Substitution لليه SNP؟ لليه Single Nucleotide
Polymerism؟ لما أستخدم هذه التقنية أني أنا أدرس
الجين هذا من وين أجا البروتين هل هو من الكروموزوم
اللي أجاني من أبوي ولا الكروموزوم اللي أجاني من
أمي بقدر أنا أدرس هذا الموضوع فلما أجي أدرس هذا
الموضوع ماشيبلاقي إن أنا عندي أكثر من احتمال في
حالات بتلاقي هذا الـ chromosome مثلا نفترض هذا الـ
chromosome اللي وردته من أبوي وكان في الجانب
الإفلاني يعني مثلا ناخد نفترض مثلا افتراض اللي هو
مثلا الـ ABO blood group راح تلاقي إن هنا الموقع
تبع الـ ABO blood groupوهذا الـ «جينات» الـ «جين»
المسؤول عن هذه الخاصية أو هذه الـ Blood Group
فاللي راح ألاقيه بالأخير هو أن أنا شايف الـ
Protein الـ Protein من أين بدي ييجي؟ بدي ييجي من
الـ RNA وبعدين بيعطيني الـ Protein
لو أنا هنا في الفتحة هذه بالضبط أنا بدرس على مستوى
شو صار للـ RNA يعني لسه ماكملت أني أشوف شو هو الـ
Protein وقفت التفاعل ووقفت الوضع المرحلة المعينة
ففي حالة الـ ABO System ماشي إذا واحد مثلا أخد
كروموزوم وعليه موقع TA من أبوهوأخد B من أمه شو
اللي راح يصير في جسمه راح تلاقي في الغالب Balance
Expression هتلاقي الـA والـB موجودة ويعني اثنان هم
شغلات واثنان موجودين بنفس الطريقة بنفس الكمية في
أوقات أو في جينات أخرى بكونفحيح عندى جينين طبعاً
خاصة لوسختين من نفس الجين واحياناً يعني مثلا الـ
Alpha Chain تبعت الـ Hemoglobin فيها Two copies
يعني Total يصير عندى أربع Two copies على One
chromosome وTwo copies على ال chromosome التاني
فعندي أربعولكن برغم وجود الأربعة مش الأربعة كلهم
شغالات لأ بيكون عندى واحد بس شغال فيه ظاهرة هي
بتحدث وانا هي في المناعة ندرسها ونعرفها ونفهمها
حتى بيسموها ان الواحد هذا لما ينجح ويشتغل ويكون هو
الناجح بيسكر على التانية بيسموها Allelic Exclusion
يعني إنه بمنع النسخ
الأخرى من الجينات إنها تشتغل فاحنا بنقول ما بين
هدولة الـ …
يعني ما بين هدولة الـ Two Extremes أو الـالأشياء
المطرفة كثير إنه 100% قد بعض إثنين أو 100% بس واحد
والتاني صفر يعني ما بين خمسين وخمسين وصفر ومية في
مرات حالات بتكون Unbalanced يعني الـ gene بيشتغل
ثمانين و الـ gene بيشتغل عشرين يعني هيك كلمة
Genomic Imprint لا والله ماني فاهمها مش هي اللي
مقصودة هنايعني القصد في الموضوع هذا إنه فيه آليات
للتحكم في الـ Transcription بحيث إنه ممكن في ظواهر
تكون أثنين تماماً شغلين و أثنين على أقصى سرعة
شغلين وأحياناً بيكون واحد بيشغل 100% والثاني صفر
فهذه موجودة وهدولة يعني بدنا نفهمهم كظواهريا إما
بكون عندي Balanced Expression، يا إما Unbalanced
Expression، يا إما Monoallelic Expression والـ
Monoallelic Expression هي الـ Parental Germline
Genomic Imprinting هذه حاطين Epigenetic Silencing
Ovaries in Imprinted Region أنا الـ Imprinting ما
بفهمهاش، يعني بيكون تسكير عليهمالـ Monoallelic
Expression في الـ T-cells والـ B-cells هو بتمن
خلال بعدها قضية Somatic Rearrangement اللي هي قطع
و لسق في الـ DNA بس هاي يعني فقط في الـ T-cells
مرة ثانية لما نقول «mono
expression» أو «balanced expression» أو
«imbalanced expression» التفكير الأول هيك أنه
الأصل أننا جينين نصف اختين منهم الأصل أنه فنتان
يشتغلوا وهي أحيانًا بتحدث فبتكون أنه في فنتان
شغلها بس أحيانًا أخرىبكون لمستوى إنه بس نسخة واحدة
هي اللي تشتغل يعني هنا فقط الأزرق هو الشغال الجين
التاني اللي موجود على الـ Chromosome الأحمر مالوش
أي دور أو فعلية في الجسم، في خلايا معينة، في جينات
محددة، في حالات معينة بتلاقي هذا الظاهر اللي بتصير
إنه كلها بس جين واحد، نسخة واحدة هي اللي شغالة،
التاني مش شغالةوأحيانًا أثنين شغلات قد بعض
وأحيانًا واحدة أكتر من الثانية ما أظن أنها مش صعبة
يعني ماشي الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ
الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ
الـ الـ الـ الـ
الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ
الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الوأي
إنسان عنده Two قليل من الممكن يعني مثلا الـ ABO
System فيله تلاتة قليل يا A يا B يا O وبالتالي لما
يكون عند إنسان AB إثنين شغلات ماشي لما يكون عنده
AO الـ A شغال الـ O مش شغال أصلا مافيش فيه إشي
يعنيفمافيش إيش ناتج منه هذا بدنا نسميه Unbalanced
Expression الأول اللي هو الـ Mono أقل لك إذا كان
AB إذا كان AO أما إن إذا الأصل AB إثنين Co
-dominant إثنين زي بعض بيشتغلوا فبيبين الـ A
وبيبين الـ B ماشي للـ X-Chromosome أنا اللي كنت
ناوي يعني كنت قاعد بحكي اللي هو بالنسبة للـ X
-Chromosome بالذاتبتلاقي أحيانًا الـ Infant الـ
Female اللي هي XX الأصل أنه يكون حتى لو عندها
Disease جين نسخة واحدة و Recessive الأصل أنها ما
يظهر عليها شيء لأنها Career لأن عندها ثاني شغال بس
حقيقة برغم أنه لو ال disease X-linked Recessive
بالرغم من أنه Recessive ويعني
الأصل بما أن أنا عنده نسخة تانية شغالة طبيعية
كويسة بتلاقيها بعض النساء عندهم ضواهر للمرض يعني
المتنحي اشتغل السبب أنه بيصير عندي Random X
-Chromosome Inactivation هذه ظاهرة بتحدث أنه
بطريقة عشوائيةالخلية بتقرر إن واحد من هالـ X
-Chromosomes بدنا ما نستخدموه، خلاص نستخدم واحد
معين طبعاً بتستخدمه لكل شيء فبقول لما نستخدمه لكل
شيء وكون هو المرض فيه كـ Recessive gene Recessive
trait، ظاهرة متنحية بتلاقيها تظهر فهي بتفسر ليش
أحياناً بعض الأمراضاللي حتى لو كان المرض مثنحي
والـ Female Carrier الأصل لأنه ما يظهر عليها شيء
بيتكون أنت بعض مظاهر المرض وهي تحدث في الـ Area of
Embryogenesis يعني هنا اللي بدي تكون تخرجه فيه أنه
صحيح عندي أنا كروموزومات و DNA وبنتج عنه RNAوبنتج
عنه بعدين بروتيل بس بس فيه نقطة
الأخيرة من قبل أنا على الأقلفي غالبية الجينات قد
تكون مثلًا نسخة واحدة فقط منها أحيانًا بعض الجينات
بيكون أكثر من نسخة من هذا الـGene يعني مثلًا
الـAlpha Chain تبع الـHemoglobin اللي مع الـBeta
Globin بيعطينا الـHemoglobin كاملكجين فيه له
نسختين على كل كروموزوم وبالتالي Total في أي خلية
بيكون فيه أربعة ماشي أو أحيانًا أثنين أو أقل أو
أكتر يعني أو أكتر فالآن دايما مش أنه دايما الأثنين
الأثنين بيشتغلوا زي بعض بيلاحظ أنهفيه ظواهر إن
الخلايا بتكون تشتغل بشكل مش متكافئ من النسختين
والنسختين هدولة زي ما اتفقنا بتكون واحدة من الأب
وواحدة من الأم ففي أحيانًا النسختين بيشتغلوا
تمامًا يعني مثلًا الـ AB blood group الـ locus للـ
blood group اللي ABO system بنسميهاللي هو على قلته
قليل A وB وإذا إنسان عنده A وB وواحد من الأب وواحد
من الأم إثنين بيشتغلوا بيشتغلوا مائة بالمائة قد
بعد يعني خمسين وخمسين هاي جهة وبتحدث في المقابل في
أحيانًا دواهر بتكون عندى ماشية في نسختين أو أربعة
من الـGene بس بتكون فقط ده واحد شغالةزي ما حكينا
في حكاية الـ Immunoglobulin الـ Immunoglobulin الـ
Light Chain فيه أربعة كتب للجينات بس كل B
-Lymphocyte بتكون بس واحدة شغالة كل البقية
مابيشتغلوش فبيصير هذا نوع من الـ Unbalanced
Expression Unbalanced Expressionما بين هدول
الحالات الطرفية كثيرة يعني يا أما خمسين بالمية
خمسين بالمية شغل يا أما صفر ومية بالمية شغل بتلاقي
فيه نسب تيجي بالنص ممكن من مصدر أشرين بالمية ومن
مصدر تمانين بالمية ممكن من مصدر سبعين بالمية ومن
مصدر تلاتين بالمية ففيه دايما فروقات في عمليةتشغيل
وتوظيف الـ DNA وهذا بيبين على مستوى الـ RNA يعني
أنا صحيح إن سكتين موجودات على مستوى الـ DNA بس مش
بالضرورة أثنانهم يشتغلوا وهذا تتدخل في دواهر زي
الـ Ionization اللي هو الـ X-linked deactivation
أو اللي حكينا عنها اللي بيصير بالنسبة للـ females
بعض خلايا الـ females وشرحناها والثاني
الآن اللي بنتكلم عنه حتى الواحد يعني يفهم تحفيظ
هذا الموضوع مش غلط يعني حتى يفهم كيف البشرية يعني
أفضلبدرجة بصعوبة كبيرة استطعنا نعرف نقرأ التسعة
مليارات حرف تبع الـ DNA وصوّناها الآن الإنسان أو
العالم أو الطبيب أو الباحث أو كده بإمكانه أنه يعني
يدرس أي جيل ويكون عندنا reference المرجع الأساسي
أستفيد منه من خلاله عشان أفهم شو الاختلافات
بتذكروا أنه الـ Human Genome Project اللي بدناه
كان أنه درسنا الـ DNA تبع إنسان معين فحتى يعني
الواحد يعرف يتعامل مع هذه الجوانب كلها لازم يكون
عنده آلية لـ
لاستفادة من المعلومات اللي بتيجي من دراسات الـ
Sequencing اللي هو عملية يعني قراءة الـ
Nucleotides على مستوى الـ DNA أو الـ RNA أو
البروتين حتى واحنا دايماً يعني هذا الجانب هنا بعض
المراجع من مصادر مختلفة الأصل لما واحديقوم مثلًا
عنده شاف عائل مريض أو درس الـ Sequence تبعها أو
كان إنسان مريض عنده جانب معين وأجى درسله الموضوع
هذا النقاط
هذه بتكون من خلال إنك أنت اللي طلعته من الإنسان
هذا أو من المريض هذا أو من العائل المريضة هذهأقوم
وأشوف شو هي الـ References للقطع هذه، شو بيحكوا
الموجود ففي الـ Human Genome Project في الـ
Database تبعت الـ SNPs اللي هو Single Nucleotide
Polymorphism اللي هو يعني أنه جزء من الموضوعقضية
إنه اللي صرفوا على كثير من الأبحاث بالذات اللي مش
بشكل تجاري زي الحكومات أو الجامعات أو كده بتلاقيهم
بتطلبوا إنه هذه المعلومة تكون مشاركة مع الجميع
يعني ما يكون هي ملك فقط للباحث بحيث يخبّي عليها
ومايعطيها لحد تاني فبطلبوا إنه كل الناس تشارك في
إنه تحطالترتيب الـ Nucleotides اللي طلعتها وترتيب
الـ Amino Acids والبروتين اللي طلعوا والـ RNA اللي
طلعوا فأهم مرجع للمصادر العلمية الآن إذا واحد بده
يدرس أي موضوع تعرفه اللي هو الـ PubMedالـ PubMed
موضع في ولايات المتحدة الأمريكية ومحطين فيه الـ
DNA والـ RNA والبروتين وكذا ويعني نتذكر يعني من
سبب أنه في عندي 64 من الـ Nucleotide Sequence حتى
يعمل الـ 20 Mino Acids لإنه فيه اشتراكات يعني
أحيانًا الـ SNAP هذهمالهاش قيمة، ما هي بتساعدنا أن
نشوف من وين أجى هذا الـ DNA من الأب، من الأم، هل
صار فيه تغير معين ولا لأ، أو أنه بس على مستوى الـ
Protein قد لا يكون له قيمة يعني، فهنا مجموعة مراجع
حتى الواحد لو طلع إشي يشوف بشبه إيش حد اكتشفه من
قبل، وأحيانًا هذه المراجع مش بس للـ Human Genetic
Diversityفي أول Whole-Genome Sequencing كان لذبابة
الفاكهة أو لحيوانات أخرى أو الـ بيروسات والبكتيريا
والنباتات وكذا ففي قواعد بيانات الـ Databases
بيكون فيها كل المعلومات الوراثية لكل المُركّبات
اللي نعرف عنها سواء Human وNon-Human وبالتالتبس
إحنا لما نيجي نتعامل إنه أنا والله عندى عائلة
مريضة أخدت الـ DNA منهم درست شو الترتيب الـ
Sequence سبعتهم فوق الـ PCR وعرفت الترتيب ممكن
أقارنه بـ Database يعنيلما نقول Diversity
وVariation بنبدأ بإنه في أشياء شائعة منهم مثلًا
اللي هي SNP اللي هي Single Nucleotide Polymorphism
يعني إنه بس حرف واحد على مستوى الـ DNA وكل ثلاث
أحرف تعطينا أمينو أسد واحد فـ Single Nucleotide
وPolymorphism تغيير بس واحد من الـ Base Pair وهذا
عادةً ممكن مايكونش له قيمة بس ممكن يكون عندي ظاهرة
أكتر من الـ Base Pair واحد لحد مية نسميه Insertion
وDeletion أحيانًا فيه Copy Number Variation يعني
قضية راح ناخد مثلًا بالهيموفيلياعبارة عن إذا في
هيموفيليا اللي أخذ الـ «ثلاثيميا» في Alpha و Beta
إذا تبعات الـ Alpha هي Copy Number Variation
فبتلاقي قطعة كبيرة أكبر من يعني عشر تلاف Base عشر
تلاف كيلو Base أو مليون One Mega Base أو قضية إنه
يصير Inversion يعني إنه نتيجة لفة الـ DNA إن حطت
طريقة مختلفةهي أنواع الـ Variations اللي ممكن مرات
تحدث هي تشبه من اللي حاطنناها مرة من قبل أنه هي
عندي Different Sequence في قطعة معينة بشتغل عليها
إذا كان زي هيك هذا الإنسان عنده القليل الأول
والثانيالأليلين زي بعض بس في واحد هذا عنده Snaps
هاي بدنا نسميها هنا اللي هي deletion أو insertion
هنا اللي بنلاحظه شوفوا هدولة هذا الأليل الأول اللي
هو بيشبه ال reference اللي صار هنا صار عندي
insertion يعني هاي أجت الزيادة فالـ Tكانت هنا
مفروض تجيب ورا الـ G ثم A ثم A ثم C ثم T ثم كده
فهذا النوع بدنا نسميه Indel صحيح A بس هو حقيقة هو
insertion single nucleotide طبعا هذا بيخرّب الدنيا
الـ SNP في الغادر ما راح يعمل أي شيء لأنهيمكن مرات
كثيرة أنه بتكون نفس البروتين بالتالي مش ضروري أن
يكون له تأثير بس أحياناً طبعاً بيأثر هنا هذا
بيسموه لما يكون insertion لواحد راح يخرّب كل ال
copy هذه راح تكون لأنه نقرأ ثلاث ثلاث ثلاث لما تحط
واحد زيادة راح تخرّب الثلاثيات أما لو صارالـ
insertion لثلاثة ممكن ما يكونش إيها تأثير كبير
لأنه بالأخير بيظل البروتين ممكن انتاجه من هذا الـ
DNA هنا صار عملية deletion،
deletion لإثنين لما يكون إثنين الـ deleted يعني
أنا هنا هاي تمام زي البقية هذولة الـ T والـ T طال
الـ C صارت تشبك ورا الـ T والبقية بنزل زي ما هو
فالأصل كان يعني عملوا زي هنا الـ Rectare Deletion
حطوا هاي ورا هاي على طول وجرّوا البقية فهذه أنواع
من بعض الـ Polymorphisms اللي بنشوفها فالـ
غير
الـ SNP حكينا
Single أو Limited يا إماinsertion أو deletion
أحياناً هنا copy number variant يعني أنا هنا FG
مرة واحدة قطيت FG FG FG طبعاً هنا يعني على مستوى
الجينات كلها ناشي يعني أنا بدل القليل الأولالـ «H»
هنا وبعدين «G» «F» يعني «A» «B» «C» «D» «E» «F»
«G» هذا على مستوى الجين كله فأحياناً في إنسان غير
إنسان ثاني إنه هنا بيصير ثلاثي copy بدل ما هي واحد
اللي كان لازم تكون وفي inverse polymorphism إذا
كان عندي مثلا ترتيب الجينات «A» «B» «C» «D» «E»
«F» «G» «H» كدهصار قطع ولسف بطريقة غلط بحيث أنه
صار AB بعدين EDC هنا الله عليه يعلم يعني مايكونش
تأثير كبير على الوظيفة بقدر ما أنه على مستوى الـ
DNA فيه اختلافات، Polymorphism Micro-satellite
polymorphism هي تكرار
لمجموعات معينة وMobile element insertion
polymorphismبغيّر تفتيح خيفقرات الـ DNA وأشياء
مختلفة فيه
يعني هذه الظواهر اليوم بنوقف لهذه اللحظة أنا آسف
اليوم خربطة من عندي بس إن شاء الله المرة اللي جاي
بنراجع الأشياء وده فيه أسئلة وجروب الـ WhatsApp
فاتحة يعني
إذا حد عنده أسئلة ممكن نتناقش فيها يعطيكم العافية
السلام عليكم السلام ورحمة الله يعطيك العافية مش
عارف إذا دكتورة ده كنت سامعني لأ لكن عموما يعطيك
العافية يعطيكم العافية يا دكاترا وإن شاء الله يعني
إلى لقاءة قادمة بإذن الله السلام عليكم يعطيكم
العافية