هنا على الصورة هذه، على الخط اللي فوق أول شيء، هنا
عرفنا الصيغة العامة والـ structure العامة للحمض
الأميني إنه بيتكون من جمعة كاربو المركزية مرتبطة
بهيدروجين وارتشين وكاربوكسيل وامينوجروب
هالخط اللي فوقها على رموز جيت عنه أن أول خط أحمر
فوق اللي هي الـ repeat units في عندنا صيغة عاملة
الحمض الأميني في في النص مجموعة carbon من فوق مرتبط
فيها مجموعة هيدروجين من الأسفل مرتبط فيها الـ R
group اللي هي الـ side chain على اليمين مرتبط فيها
الـ C double bond O اللي هي الكربوكسيل group على
اليسار مرتبط فيها N-H اللي هي مجموعة الأمين
الأمينوجروب تمام؟ هي أول حمض أميني جنبه مرتبط فيه
حمض أميني تاني اللي هي الكربونة المركزية وهيدروجين
في الأعلى و R في الأسفل وعلى اليمين كاربوكسيل جروب
وعلى الجمال أمينوجروب هدول مجموعة أحماض أمينية أجت
اترتبت جانب بعض مرتبطة مع بعضها البعض في
بيبتايدبوند رابطة بيبتيدية فكونتلي البروتين طب وين
الـ peptide bond جاية؟ الـ peptide bond أجت ورتبطت
بمجموعة كربوكسيل من الحمض الأميني الأول ومجموعة
أمين من الحمض الأميني الثاني إذا ملاحظين الحمض
الأميني الأول و الحمض الأميني الثاني في بينهم
رابطة هي الرابطة اللي في النص اللي فصلت الحمض
الأميني الأول عن الثاني بنسميها peptide bond و
موقعها تيجي بين مجموعة كربوكسيل من حمض أميني
ومجموعة أمين من حمض أميني آخر ما ش عملة هاي
الـpeptide bond هي المفروض ان الـCOOH الكربوكسيلي
جروب و الـN و الـAmino group NH2 هي بتعمل على نزع
جزء ما تنزع H2O تنزع جزء ما بتاخد من الكربوكسيلي
جروب بتاخد منها OH تبدلها C double bond O و بتاخد
من الـNH2 بتاخد مجموعة هيدروجين فهيك الصراطين
ياخدوا OH من هنا و Hydrogen من هنا يعني H2O اللي
هو جزء ماء فالرابطة البيبتيدية تكون الرابطة
البيبتيدية بينتج عنها خروج ماء وهذا التفاعل يسمى
Condensation Reaction تفاعلات اللي بتنتج عنها خروج
ماء بنسميها Condensation Reaction لأنه كون عنها
جزء ماء إذا انتفاع التكون الرابط البيبتيدية يعتبر
Condensation Reaction لأنه نتج عنه جزيع ماء H2O طيب
تمام، إذا البروتين بيتكون عن طريق مجموعة أحماض
أمينية ترتبط في روابط بيبتيدية وين بتيجي الرابطة
بين مجموعة كربوكسيل ومجموعة أمين؟ إيش بينتج عنها
خروج ماء، نزع جزء ماء؟ لذلك سمينا التفاعل تكون
رابط البيبتيدية بـ Condensation Reaction اللي جيت
على الأطراف في البروتين في البروتين هذا اللي اتكون
في السلسلة اللي فوق اللي أنتو شايفينها على
الأطراف في حمض أميني فيه مجموعة أمين و group
مرتبطتش بحمض أميني آخر وعلى الطرف من الجهة الثانية
من اليمين في عندنا مجموعة حمض أميني فيه مجموعة
Carboxyl مرتبطتش يعني في عندنا مجموعة Carboxyl
free حرة في مجموعة أمين free برضه حرة على الأطراف
بتكون هذه بنسميها مجموعة الأمين الحرة بنسميها
N-terminus N-terminus هو الحمض الأميني الذي
يحتوي على free amino group لم تشارك في تكوين
الرابطة البيبتيدية إذا مجموعة الأمين الـ free بتكون
الحرة التي لم تشارك في تكوين الرابطة بنسميها
N-terminus طب و الـ C-terminus .. C-terminus برضه
هي الحمض الأميني اللي يحتوي على free carboxyl
group لم تشارك في تكوين الرابط اللي بيبتديها يعني
بنفهم احنا عند تكول الـ protein تيجي مجموعة أحماض
أمينية ترتبط مع بعضها البعض في روابط بيبتيدية وين
بتتكون الروابط البيبتيدية؟ بين Carboxyl group من
حمض أميني أميني group من حمض أميني آخر وشو بتعمل
على نزع جزاق ماء؟ بسمّينا التفاعل Condensation
Reaction لأنه بينتج عنه جزاق ماء في مجموعة الأحمض
الأمينية هاي بيضل على الأطراف مجموعة أمينو جروب مش
مرتبطة على الطرف من جهة مجموعة كربوكسيل جروب مش
مرتبطة على جهة المجموعة الكربوكسيلة الحرة التي لم
ترتبط ولم تشارك في تكوين الرابطة اللي بيبتديها
بسميها C-terminus ومجموعة الـ amino group الحرة ال
free التي لم تشارك في تكوين الرابطة بسميها N
-terminus
و أنا classification of amino acid according to source
تقسيم الأحماض الأمينية بناء على مصدر بيقسموها
لقسمين في عندنا أحماض أمينية أساسية essential
amino acid وفي non-essential amino acid غير ضرورية
الأحماض الأمينية الأساسية هي الأحماض اللي بيكون
الجسم غير قادر على تصنيعها لازم تكون موجودة في
الوجبة incapable of forming requests and must be
required in time الجسم غير قادر على تصنيعها و لازم
تكون موجودة في الواجبات، في الأكل اليومي اللي
بيتناوله، فعددها تسعة الـ Non-essential أمينواسد
الغير ضرورية الجسم قادر على تصنيحها بيقدر يصنحها
مش ضروري أني أتأكد أنها موجودة في وجباتي وعددها 11
Non-essential الجسم قادر على تصنيحها Essential
الجسم غير قادر على تصنيحها لازم أتأكد أن أنا
أخدتها عن طريق الوجبات اليومية وعددها 9 الـ get non
-essential أكثر 11 يعني صح ولا خطأ إذا حكيت الجسم
قادر على تصنيع معظم الأحماض الأمنية صح الجسم قادر
على تصنيع معظم الأحماض الأمنية اللي هي عددها 11 طيب
عندنا أبسط حمض أميني هو simplest and smallest
amino acid هو عبارة عن الـ glycine الـ glycine هو
أبسط حمض أميني ليش؟ لأنه احنا حكينا كل حمض أميني
يختلف عن الثاني بالـ side chain بالـ R والـ R في الـ
glycine هي عبارة عن ذرة هيدروجين فقط عبارة عن H
ذرة هيدروجين فهو بسيط جدا يكون عبارة عن كربونة
مركزية
ذرة هيدروجين من الجهة الأخرى الـ R-group هي عبارة
عن ذرة هيدروجين فهو أبسط حمض أميني لـ glycine أما
الحمض الأمين الشهد الفريد هو الـ proline حكينا
الـ proline هو الحمض الأمين الوحيد الذي يحتوي على
amino group وليس amino group ما يحتويش على مجموعة
بنسميها amino group بإنما بنسميها amino group أو
secondary amino group بنسميها، ليش؟ لأنه بتكون فيه
مجموعة الأمين مرتبطة في الكربون المركزية ومرتبطة
مع الـR، مع الـside chain، مع مجموعة الـside chain
اللي بتكون موجودة، فهي بنسميها amino group مش
amino group
بنجي لتصنيف الأحماض الأمنية بناء على الـ polarity
كيف بدي أحدد الـ polarity القطبية للأحماض الأمنية؟
من خلال النظر إلى الـ sided chain إلى الـ R group
هذه مجموعة الـ R إيش أجي مكانها؟ أول شيء تصنيف
الأحماض الأمينية بناء على الـ polarity تُقسم إلى
قسمين في منها polar قطبية في منها non polar non
polar يعني غير قطبية يعني هي الأحماض الأمينية
تحتوي على C و H في الـ side chain فقط النانبولان هي
الـ amino acid that contains C و H in their side
chain لما أجى أطلع على الاري جروب هاي إيش فيها
بلاقي فيها بس يا ذرات كربون يا هيدروجين أو كربون
وهيدروجين الألاجي في الـ side-chain كربون وهيدروجين
فقط، لا تحتوي أي مجموعة قطبية أخرى، وهي غير قادرة
على تكوين روابط أيونية ولا هيدروجينية ولا قادرة
على كسب أو فقد الإلكترونات، هي الـ non-polar amino
acid تكون تحتوي في الـ sided chain على كاربون
وهيدروجين فقط غير قادر على تكوين روابط هيدروجينية
ولا أيونية ولا قادر على فقد وكسب الإلكترونات الجزء
الثاني من الأحماض الأمينية هي الـ polar القطبية
القطبية مقسمة لقسمين في منها بتكون قطبية مشحونة
وفي قطبية غير مشحونة يعني في منها polar charged
وفي polar uncharged الـ Polar سواء كانت charged أو
uncharged الـ side chain بيكون يحتوي على مجموعة
قطبية لو جيتي على الـ R على الـ side chain تطلع
عليه بتلاقي يحتوي على مجموعة قطبية إيش هي
المجموعات القطبية؟ ممكن تكون OH اللي هي Hydroxyl
group هي مجموعة قطبية OH Hydroxyl group معناها C
double bond O اللي هي الكربونيل الـ group CWO هي
الكربونيل جروب فهي عندنا الـ sulfhydryl جروب
الـ sulfhydryl جروب اللي هي الـSH في عندنا
الأمين جروب اللي هي الـH2 أمين جروب هدولة كلهم
مجموعات قطبية لو شوفتهم في الـ sided chain بعرف إنه
هذا بولا طب هل هو charged ولا uncharged? uncharged
يعني ماعلهوش شحنة لا عليه positive ولا عليه
negative فيه مجموعة قطبية لكن لا هي positive ولا
هي negative طب ليه charged؟ charged معناه إنه
يحتوي على مجموعة قطبية بشحنة إما بتكون الشحنة
positive لـ charged إذا كانت positive يعني باسأو
negative charge يعني أسال إذا الأحماض الأمنية تقسم
حسب الـ polarity إلى polar أو non-polar، non-polar
لا يحتوي على مجموعة قطبية وإنما يحتوي على بس كربون
وهيدروجين في الـ sided chain طب الـ polar يحتوي على
مجموعة قطبية إما حكينا هيدروكسيل أو كربونيل أو
sulfhydride أو أمين جروب هدول المجموعات القطبية
إما تكون uncharged أو charged عليها شحنة أو معلهاش
شحنة
لو جينا نتفرج على الصور الموجودة هنا أو على الـ
structure الأحماض الأمنية الموجودة هنا هذه الصور
مقسمة لأحماض الأمنية لـ polar و non-polar في منها
charged و في منها uncharged، تمام؟ هلجيت؟ لو جينا
على الصورة من فوق لليسار، في عندنا مجموعة، هلجيت؟
أنا كيف بتعرف polar ولا non-polar، حاجة هنا؟ نتطلع
على الـside chain، على القعر اللي بتكون في الأسفل،
هي الملونة لجيت أول حمض أمين لو جينا تطلعنا بنلاقي
الـR هي عبارة عن أتش عن هيدروجين حكينا اللي بيكون
عنده الـR الـR group عبارة عن هيدروجين أو كربونا
أو الاثنين مع بعض بيكون non-polar فهذه المجموعة
كلها الجزء اللي فار من اليسار هي non-polar amino
acid لأن الـR group تحتوي على كربون وهيدروجين فقط،
تمام؟ الجتلة تحت منها على اليسار للأسفل لو طلعنا
على الـR group اللي تحت بنلاقيها تحتوي على مجموعة
قطبية تحتوي على مجموعة قطبية في منها بتحتوي على
هيدروكسيل جروب في منها بتحتوي على أمين جروب في
منها بتحتوي على صلفهيدرال جروب S-H المهم كلهم في
الـR group يحتوي على واحدة من المجموعات القطبية
يعني الأول يحتوي OH، الثاني OH، الثالث الستين
يحتوي على SH، self-hydraulic group يعني فيه إنه
مجموعات قطبية، يبقى هو polar طب هل عليه شحنة؟ لأ
فيش شحنات ولا موجب ولا سالب، إذا هو polar
uncharged R group Polar Uncharged Amino Acid لو 177 00:13:57,400 -->
مع الـside chain عشان هيك سميناها amino group أو
secondary amino group مش primary amino group فهو
الحمض الأميني الشاد
لما نشتغل العمل إن شاء الله راح نسير نكتب تقرير
نكتب report تقرير عن المعمل اللي احنا اشتغلناه ده
نكتب فيه اسم الفحص، الهدف منه، المبدأ العام، خطوات
إجراء التجربة، نكتب النتيجة ونكتب تعليق عليها كمًّا