الجزء الـ slide هذا بعد ما اتكلمنا كيف الـ DNA
شكله وكيف تتم عملية انقسام الخلايا، أو نوعين
الانقسام بهدف إبقاء عدد الخلايا كما هما، اللي هو
الـ Mitosis، عشان يظل عدد الخلايا زي ما هما، والـ
Meiosis، اللي هو موضوع لما يكون اللي هو الانخسام
المنصف، حيث أنه يطلع عند الـ Gametes، وبالـ Males و
الـ Females، بتتبع خطوات قريبة من بعض على مرحلتين،
المرحلة الأولى بتبدأ الخلية 2N بتصير 4N، وبعدين
بتنقسم إلى الخلايا التابعة لها، اللي هو سواءً الـ Sperms
أو الـ Egg، اللي بتطلع. الآن الموضوع الثاني راح نبدأ
اليوم إحنا بعد ما بدأنا نحكي إنه الـ DNA هو المصدر
اللي بيحدد كيف راح يكون ترتيب البروتين، أو الـ
Primary Structure تبع البروتين، اللي هو ترتيب الـ
ترتيب الـ Amino Acids، اللي هو الـ Primary
Structure للبروتين، ويكون ترتيب الـ Amino Acids
طبعاً لازم تكونوا عارفين من الـ Biochemistry أنه في
عندنا عشرين أو واحد وعشرين Amino Acids حسب مرات يبقى
هيك، ولي هيك. فأحد هذه الطرق اللي هو حاطينها تحت
اللي هي هنا Abbreviations for Amino Acids، فعندنا
الألانين والأرجينين والأسباراجين بالشكل هذا، في
ثلاث أنظمة لكتابة أسماء الـ Amino Acids في الـ
... أنا والله خلّيني أشوف الكاميرا الـ ... إيه، قاعد
المشاركة؟ المشكلة زي الـ «زوم»، ما كنت أنا أدخل من
قبل، مش راضي ... إيش اسمه؟ stop recording, share
screen, start video
ناخذ التطبيق PowerPoint
وأقول له start my video. هذا الجهاز مش جهازي، ما هو
اسمه؟ مش جهازي؟ فمش عارف 100%. طيب، بالنسبة لهناك
ثلاثة أنظمة للتعريف، الـ «among us»، بالعشرين اللي
هما، يأخذ ثلاثة أحرف، مثل الألانين، أو حرف الـ A، أو بالرمز
الكامل ألانين. هذه أسماء الـ Amino Acids، وكثير من
الظواهر الحيوية والظواهر في حياة الإنسان نعتمد
على الـ Amino Acids، يعني مثلاً فينيل كيتونوريا، مرض نتيجة الفينيل ألانين Metabolism
Problem، أو مثلًا في عندنا Serine Protease، أو عندنا
كذا. فنستخدم كثير مصطلحات اللي دخلت بالـ Amino Acids
فالآن حتى نفهم القطع اللي فوق اللي هي الـ Genetic
Code، هذه طريقة ترميز الـ Amino Acids من خلال أحرف و
الـ Bases، أو الـ Nitrogenous Bases التابعة للـ
Nucleotides. فمن تركيب الـ DNA بنحوله لتركيب أو
ترتيب الـ Amino Acids. فلو كان اللي اكتشفوه العلماء
أنه لو كان الأمر بيكون من خلال Single Nucleotide
كان نقدر نعمل شفرة لـ 4 Amino acids، لو كان عندي
Two Nucleotides، بيؤثروا هم اللي بيعملوا الـ
الـ Coding أو التشفير أنه Two Amino Acids. فالأول
أربعة، فينا واحد من أربع احتمالات، والثاني أربع
احتمالات ثانية. ففي الحالة دي راح يكون ستة عشر
Amino Acids، نقدر نرمز إليها. فثبت إنه
لأ، هم ثلاثة، كل ثلاثة بنقرأهم مع بعض، وكل ثلاثة مع
بعض، برمزوا لـ Amino Acid واحد. فعشان هيك بنسميهم
Codon، أو Triplet، أو كذا، عبارة عن ثلاثة من الـ
Nucleotides، حتى يرمزوا لواحد من الـ Amino Acid
طبعاً أربعة بأربعة بأربعة بتصير أربعة وستين
فالأربعة والستون زيادة عن العشرين Amino Acid، بس
بتغطيهم، وراح نشوف كيف الأمور تتطور
الجدول هذا أمامكم، حاطين بالأول ما هي الـ First
Base، مرات بتكون U, C, A أو G. طبعاً الـ U لأنها حلت
في الـ RNA، مش الـ DNA. الـ RNA حلت بدل الـ T، الـ
Second Base، هذا اللي هو ترتيبهم U, C, A, G، وبعدين
هنا الـ Third Base، حاطينها بالترتيب. شوفوا عندنا
فبنلاحظ إذا كان عندنا ترتيب، مثلًا كودون ثلاثي UUU
هذا فلع الألانين. UUC فلع الألانين كمان. UUA لـ C
UUG لـ C. CCU, UCC, UCA, UCG الـ PUA, Lucy، يعني
إنها أربعة وستين، بده رمز للعشرين
فيهم، فبيصير عنده تكرارات، بعض الـ Amino Acids يمكن
مالهاش غير، مثلًا زي الميثيونين، الـ AUG هذا
الترتيب تبعها، فالـ
الآن الترتيبات هذه، زي ما أنتم شايفين، عشان يكون الـ
... نرمز لـ 20 Amino Acids من خلال ثلاثيات من الـ
Nucleotides، ثلاثيات من الـ Nitrogen Bases بحيث أنه
يعطينا إياها. بس بدنا نلاحظ كمان شغل ثاني، إذا
بتنتبهوا للجدول، UAA وUAG وUGA، هدول stop codons
انتبهوا، هدول الثلاثة حاطينهم إنه يعني، عشان
القراءة تبدأ من محل معين، وتنتهي في محل معين. بالأول
لازم يكون عندي، أنا بدور على الـ start codon، هي لازم
يكون start codon، كده، مش
شايفين؟ أين برولين وكده، وفيه الـ stop codon، الـ stop codon عشان
يوقف قراءة الـ RNA في محل معين. هنا الـ start codon ما نش
شايفينه، بس
لازم يكون في محل بيخلي النظام
في قراءة الـ Messenger RNA. ويعني في عملية الـ
Transcription للـ DNA لـ Messenger RNA، بدي يقول له
ابدأ من هذه المكانة. فالمحل البداية لازم يكون ترتيب
معين، بيقول له ابدأ من هنا، وفي نفس الوقت في شيء
بيقول له انتهي هنا. فهذه النقطة اللي بدنا إياها، وهيك
النظام اللي بتتم من خلاله ترميز الـ Amino Acids
اللي بتدخل في ترتيب البروتين الناتج عن هذا الجين
فالجين هو اللي في الـ DNA هو اللي راح يعطينا الـ
Messenger RNA، هو اللي راح يعطينا إياه. فأظن هنا الـ
ATG، وطبعاً يعني الفكرة أنه إحنا بنقرأ الـ
Transcription
كل ثلاثة مع بعض، كل ثلاثة مع بعض، كل ثلاثة مع بعض
فالـ Transcription أعطانا الـ Messenger RNA، والـ
Translation راح تعطينا الـ Amino Acids. حاطين هنا
الأسماء اللي هي المفروض بالأحرف لـ Amino
Acids اللي بتدخل في تركيب البروتين هذا. فهذه اسمها
كلمات مهمة كثيرة، اللي هي أنه في عندي start codon، Start
codon، وبعدين ببدأ عملية Transcription، وعطينا
الـ Messenger RNA. الـ Messenger RNA، كل ثلاثة بدخل
فيه اللي هو Transfer RNA، بتتركب على الـ ribosome
اللي فيه Ribosomal RNA، على الـ Messenger RNA، بحيث
يقرأ الـ الـ الـ الـ البروتينات الموجودة، بحيث
يعطينا في النهاية البروتين. ماشي؟ فالـ translational
reading frame is determined by the AUG initiator
codon، اللي حفظنا عليه، والـ Subsequent Codewords
Specifying the Amino Acids are indicated in
blue. The two other potential frames are not
used. فالـ هنا الـ AUG هو البداية، يعني هذا
أجا Messenger RNA، عشان يكون خربط أو لا، إش لحظة
بيصير الـ Ribosome يبدأ يلف ويشبك عليه، وينتبه لحد
ما يشوف هدول، في ثلاثة، بعدين بيصير يقرأ فيهم. فهيك
الظاهرة اللي بتتم في عملية
بناء البروتين من الـ Messenger RNA من الـ DNA
وبتكون هي هيك موجودة. إن شاء الله الأمور واضحة
على الـ WhatsApp، احكولي إذا... أنا آسف جداً، اليوم غريب
يعني، إن شاء الله المرة الجاية بتكون أحسن، وأنا ما ني
عارف شو اللي صار يعني، بدا يمكن أعد فرمتة الـ hard
disk. إذا في أسئلة ابعتولي إياها على الـ WhatsApp
أنا أفتح الاثنين أثناء اللي نيجي نتطلع على بعض الـ
الآن هناك ترتيب مطلوب حتى يلف السلك تبع الـ DNA
على حاله. فيه إيش اسمه، الـ nucleosomes، وإيش اسمه
الـ histones، والاثنين مطلوبين حتى الـ DNA يلف على
حاله، بحيث يصير عملية برضه بالشكل المطلوب لعملية
الـ meiosis والـ mitosis. الـ ... الآن اتكلمت هيك
بشكل ... حتى يعني نفهم جانب آخر، وشو ضرورة الواحد
يكون فاهم هيك بشكل مبدأي، Concept، هيك الـ ... الـ ... الـ
... ليش الـ Nucleosomes والـ Histones؟ غير قضية
حاجة نقلها في عملية ... في عملية انقسام الخلية
اللي هي ظاهرة التحكم. إنه أحياناً كثيرة بتتم التحكم
بالـ DNA عن طريق آليات، Mechanisms، تستلزم أنه عدد
كبير من الجينات يتم تشغيلها في مكان معين، أو
توقيفها في مجال آخر. هذه إليها دخل أحياناً، أو إليها
دخل مهم في اللي بنسميهم الـ Polygenic Diseases
يعني الأمراض اللي فيها عدد كبير من الجينات
مشتركة بتسبب المرض. هذه بتكون إنه عدد كبير، مش جين واحد
يعني إحنا راح ناخد بعد شوية إنه بنقسم الأمراض
لثلاث أنواع، ورافعاً فيه كروموزومال، يعني كروموزوم كامل
زيادة، نقصان، كده، وفيه Mendelian يعني One-gene، اللي
هو اللي عامل المشكلة. ودول أمراض بشكل عام نادرة
الأمراض، غالبية العظمى زي السكري، الضغط، الربو،
كده. هذه أشياء بتلاقي أن مجموعة كبيرة من الجينات
بتؤثر
عليها. طريقة كيف إنه عدد كبير من الجينات، سواء تشتغل
كثير أو تشتغل قليل، أو كيف تختلط بطريقة معينة، أو
أخرى، بيعتمد على ما يسمى الـ Epigenetic Mechanisms
فالـ Epigenetic Mechanisms، أشهرها، من
غير اللي بيسموه Micro RNA، بتصير عملية الـ DNA
Methylation، يعني الـ Methyl Group بتيجي وتشبك على
قطعة معينة، أو على نيوكليوتايد معين في الـ DNA، لما
تصير عندي الـ DNA methylation، بتغير وظيفة الجين
هذا، وطريقة ثانية اللي هي الـ Modification لـ
Histone Tail، الـ Histone، والـ Nucleosomes، والـ
Histones، بيصير فيهم برضه عمليات «methylation»، وهدول
يعني بيغيروا
في شكل وظيفة الـ DNA، بس ما بيغيروا في ترتيب الـ
Nucleotides، ولا بيغيروا، يعني ما بنقدر نعتبرهم
طفرات. ما بنقدر نعتبرهم زي بقية الأمراض، لما ناخد
عليها الـ coding. فـ Epigenetic، يعني بيسموه علم
اللاجينوم، بيكون إنه فيه اختلالات في وظيفة الـ DNA على
مستوى عدد كبير من الجينات مع بعض، بكون نتيجة ظواهر
زي عملية الـ methylation للـ DNA، أو تغيير على الـ
histones، أو الـ nucleosomes، اللي مطلوبة حتى لف الـ
DNA بالشكل اللي بنشوفه فوق، حتى يعطينا كروموزوم شكل
مضغوط، يعرف يفصل عن بعضه. فيه آليات أخرى للـ
Epigenetics، نحكي عنها بعدين، بس يعني هي ظواهر
موجودة، وأشياء مهمة. هنا الفرق الكيميائي لـ Cytosine
مع الـ 5-Methylcytosine، وممكن 5
-Hydroxymethylcytosine، كيف إنه بتصير تغييرات للـ
DNA، على مستوى الـ DNA، لطبيعة الـ methylation، وهي
حسب درجتها وكمياتها، بتأثر على وظيفة الـ DNA. اليوم
والآن، نتيجة ظروفنا يعني يمكن راح يكون صعب أن أسمع
منكم، بس إذا فيها أي أسئلة، إن شاء الله بالـ group
أو بكذا، بنعملها مرة ثانية
بتشوفوهم مثلاً قاعدين حوالي مئة عازف فالمئة مثلاً في
لحظة معينة بدك كلهم أو ربعهم أو جزء معين أو نوعي
معين يتنشطوا، الجزء بدك إياهم يتطبطبوا، فهذه كلها
واردة، يعني فهي ظاهرة بتحدث وهي ظاهرة تشارك في
التحكم في وظيفة الـ DNA، وبالتالي قد تكون لها يعني
دوراً في، حكينا الأمراض اللي بنعتبرها polygenic يعني
الأمراض اللي فيها ليس جين واحد، مش مندالية، راح
تكون الأمراض اللي هي زي الضغط والسكري والربو، أشياء
وراثية، أشياء تكثر في عائلات معينة، بس جزء منها
وراثي صحيح، ولكن مش مندالية، مش جين واحد هو المسبب
للمرض.
فأحياناً اللي بدنا
ننتبه له من الظواهر الأخرى اللي بتعمل، واحنا بنحاول
نُصفّ شو بيصير في جسم الإنسان أنه مثلاً
أنا لأني متأكد 100% من هذا الكلام، وفي جانب درسته
بشكل كبير بالنسبة للـ Protein تبع الـ
Immunoglobulin تبع اللي موجود بيشتغل في الـ B
-Lymphocyte، ماشي، الـ Immunoglobulin أنا عندي Two
copies of the DNA، واحد من أبوي واحد من أمي، أثنانهم
عليهم جزء من الـ DNA للـ Heavy Chain للـ Heavy
Chain، وفيه للـ Light Chain، أربع copies يعني اثنتين
اثنتين، والـ Heavy Chain واحد بواحد، ففيه Syntax بس في
أي خلية من الـ B-Lymphocyte لوحدها بتكون فقط نسخة
واحدة من الـ Heavy Chain ونسخة واحدة من الـ Light
Chain، هم اللي شغالين، بالنسبة للـ Heavy Chain كان
عندي خيارين، طلع لي خيار واحد، أو بس واحد هو الفعال،
الثاني بيبقى ساكن لأنه لا تتم عملية الـ
Transcription و Translation له، بالنسبة للـ Light
Chain، مع أن عندي أربع احتمالات، بس في أي خلية بيكون
واحد فقط هو اللي شغال، فاللي بدنا نذكره هنا أنه هذه
بدنا نسميه "mono-allelic expression"، يعني في هذه
الخلية، الـ DNA، الـ RNA، أو الناتج اللي هو نتيجة الـ
DNA بيكون من كوبي واحدة، فمثلاً هنا في عندي بنسميه
"mono-allelic expression"، وهنا "balanced
expression"، يعني الاثنين بيشتركوا أنه يصير عملية
الـ Transcription وبعدين Translation في اللوم، وفي
أحياناً بيكون عندي ظواهر اللي يسمونه "allelic
imbalance"، يعني هنا الغالبية العظمى جاي من هنا بس
هذاك موجود بس كمية قليلة، فالـ SNPs اللي موجودة في
الـ RNA، مش عارف ليش حطوا هاي الـ SNP بالذات اللي
هي Single Nucleotide Polymorphism، يعني الـ SNP
هدول هم القلائل اللي استخدمناهم عشان نعرف أن هاي
أجت من هذا، وهنا أجن بالنص من هنا وهنا، يعني الـ SNP
هو Single Nucleotide Polymorphism، راح نحكي عنه بعد
شوية، فمن خلاله بقدر أعرف أن نسخة الـ DNA اللي تم
الـ Transcription تبعها، بحيث أنه أعطاني الـ
RNA هذا، فالفكرة
هنا أنه صحيح أنا عندي جينين أو نسختين من الـ
Chromosomes ونسختين من الجينات وكذا، بس مش دائماً
أنه اثنين لازم اثنين يشتغلوا، أحياناً الاثنين
بيشتغلوا زي بعض تماماً وبكونوا موجودين، يعني مثلاً
الـ Hemoglobin في Alpha و Beta Chain، راح ناخذها،
الـ Beta Chain فيها نسخة واحدة، ونسختين شغالة، الـ
Alpha Chain فيه أربعة، لأنه فيه على كل كروموزوم Two
Alpha Chain Gene، فبيصير عندي أربعة مصادر ممكن أنا
آخذ أي واحدة منها، ممكن الأربعة كلهم يشتغلوا، ممكن بس
واحد اللي يشتغل، ممكن اثنين يشتغلوا، ممكن ثلاثة
يشتغلوا، ممكن الأربعة.
جاية من الـ Beta
-Gene الأصلي، والـ Beta-Gene موجودة في نسختين عندي،
واحدة من أبوي واحدة من أمي، فلما
نكون ندرس هذا الموضوع بشكل تفصيلي، من خلال دراسة
الفروق الدقيقة، حتكون على مستوى Single Nucleotide
Substitution، ليش SNP؟ ليش Single Nucleotide
Polymorphism؟ لما أستخدم هذه التقنية أني أنا أدرس
الجين هذا من وين أجا البروتين؟ هل هو من الكروموزوم
اللي أجا من أبوي ولا الكروموزوم اللي أجا من
أمي؟ بقدر أنا أدرس هذا الموضوع، فلما أجي أدرس هذا
الموضوع ما شاء الله، بلاقي إن أنا عندي أكثر من احتمال في
حالات، بتلاقي هذا الـ chromosome مثلاً، نفترض هذا الـ
chromosome اللي ورثته من أبوي، وكان في الجانب
الفلاني، يعني مثلاً ناخذ نفترض مثلاً افتراض اللي هو
مثلاً الـ ABO blood group، راح تلاقي إن هنا الموقع
تبع الـ ABO blood group، وهذا الـ "جينات" الـ "جين"
المسؤول عن هذه الخاصية أو هذه الـ Blood Group،
فاللي راح ألاقيه بالأخير هو أن أنا شايف الـ
Protein، الـ Protein من وين بده يجي؟ بده يجي من
الـ RNA، وبعدين بيعطيني الـ Protein.
لو أنا هنا في الفتحة هذه بالضبط، أنا بدرس على مستوى
شو صار للـ RNA، يعني لسه ما كملت أني أشوف شو هو الـ
Protein، وقفت التفاعل ووقفت الوضع، المرحلة المعينة،
ففي حالة الـ ABO System، ماشي، إذا واحد مثلاً أخذ
كروموزوم وعليه موقع TA من أبوه، وأخذ B من أمه، شو
اللي راح يصير في جسمه؟ راح تلاقي في الغالب Balanced
Expression، حتلاقي الـ A والـ B موجودة، ويعني اثنين هم
شغالين، واثنين موجودين بنفس الطريقة، بنفس الكمية، في
أوقات، أو في جينات أخرى بيكون، فعلاً عندي جينين طبعاً
خاصة، نسختين من نفس الجين، وأحياناً يعني مثلاً الـ
Alpha Chain تبعت الـ Hemoglobin فيها Two copies،
يعني Total يصير عندي أربعة، Two copies على One
chromosome، و Two copies على الـ chromosome الثاني،
فعندي أربعة، ولكن برغم وجود الأربعة، مش الأربعة كلهم
شغالين، لأ، بيكون عندي واحد بس شغال، فيه ظاهرة هي
بتحدث، وهي في المناعة بندرسها ونعرفها ونفهمها،
حتى بيسموها إن الواحد هذا لما ينجح ويشتغل ويكون هو
الناجح، بيسكر على الثانية، بيسموها Allelic Exclusion،
يعني إنه بمنع النسخ
الأخرى من الجينات إنها تشتغل، فاحنا بنقول ما بين
هدول الـ …
يعني ما بين هدول الـ Two Extremes أو الأشياء
المتطرفة، كثير إنه 100% قد بعض، اثنين، أو 100% بس واحد
والثاني صفر، يعني ما بين خمسين وخمسين وصفر ومئة، في
مرات حالات بتكون Unbalanced، يعني الـ gene بيشتغل
ثمانين، والـ gene بيشتغل عشرين، يعني هيك كلمة
Genomic Imprinting، لا والله ما فاهمها، مش هي اللي
مقصودة هنا، يعني القصد في الموضوع هذا إنه فيه آليات
للتحكم في الـ Transcription، بحيث إنه ممكن في ظواهر
تكون اثنين تماماً شغالين، واثنين على أقصى سرعة
شغالين، وأحياناً بيكون واحد بيشغل 100% والثاني صفر،
فهذه موجودة، وهدول يعني بدنا نفهمهم كظواهر، إما
بيكون عندي Balanced Expression، يا إما Unbalanced
Expression، يا إما Monoallelic Expression، والـ
Monoallelic Expression هي الـ Parental Germline
Genomic Imprinting، هذه حاطين Epigenetic Silencing،
Ovaries in Imprinted Region، أنا الـ Imprinting ما
بفهمهاش، يعني بيكون تسكير عليهم، الـ Monoallelic
Expression في الـ T-cells والـ B-cells هو بتمّ
خلال، بعدها قضية Somatic Rearrangement اللي هي قطع
ولصق في الـ DNA، بس هاي يعني فقط في الـ T-cells،
مرة ثانية، لما نقول "mono
expression" أو "balanced expression" أو
"imbalanced expression"، التفكير الأول هيك أنه
الأصل أننا جينين، نسختين، منهم الأصل أنه اثنتين
يشتغلوا، وهي أحياناً بتحدث، فبتكون أنه في اثنتين
شغالين، بس أحياناً أخرى بيكون، على مستوى إنه بس نسخة واحدة
هي اللي تشتغل، يعني هنا فقط الأزرق هو الشغال، الجين
الثاني اللي موجود على الـ Chromosome الأحمر ما له
أي دور أو فعالية في الجسم، في خلايا معينة، في جينات
محددة، في حالات معينة بتلاقي هذا الظاهر اللي بتصير
أنه كلها بس جين واحد، نسخة واحدة هي اللي شغالة،
الثاني مش شغالة، وأحياناً اثنين شغالين قد بعض،
وأحياناً واحدة أكثر من الثانية، ما أظن أنها مش صعبة،
يعني ماشي، الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ
الـ الـ الـ الـ
الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ
الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ الـ وأي
إنسان عنده Two، قليل من الممكن، يعني مثلاً الـ ABO
System فيه ثلاثة، قليل يا A يا B يا O، وبالتالي لما
يكون عند إنسان AB، اثنين شغالين، ماشي، لما يكون عنده
AO، الـ A شغال، الـ O مش شغال أصلاً ما فيه إشي،
يعني ما فيه شيء ناتج منه، هذا بدنا نسميه Unbalanced
Expression، الأول اللي هو الـ Mono، أقل لك إذا كان
AB، إذا كان AO، أما إن، إذا الأصل AB، اثنين Co
-dominant، اثنين زي بعض بيشتغلوا، فبيبين الـ A
وبيبين الـ B، ماشي، للـ X-Chromosome، أنا اللي كنت
ناوي، يعني كنت قاعد بحكي اللي هو بالنسبة للـ X
-Chromosome بالذات، بتلاقي أحياناً الـ Infant الـ
Female اللي هي XX، الأصل أنه يكون، حتى لو عندها
Disease، جين نسخة واحدة و Recessive، الأصل أنها ما
يظهر عليها شيء، لأنها Carrier، لأن عندها ثاني شغال، بس
حقيقة، برغم أنه لو الـ disease X-linked Recessive،
بالرغم من أنه Recessive ويعني
الأصل، بما أن أنا عندها نسخة ثانية شغالة طبيعية،
كويسة، بتلاقيها، بعض النساء عندهم ظواهر للمرض، يعني
المتنحي اشتغل، السبب أنه بيصير عندي Random X
-Chromosome Inactivation، هذه ظاهرة بتحدث، أنه
بطريقة عشوائية، الخلية بتقرر إن واحد من هالـ X
-Chromosomes بدنا ما نستخدمه، خلاص نستخدم واحد
معين، طبعاً بتستخدمه لكل شيء، فبقول لما نستخدمه لكل
شيء، وكون هو المرض فيه كـ Recessive gene، Recessive
trait، ظاهرة متنحية، بتلاقيها تظهر، فهي بتفسر ليش
أحياناً بعض الأمراض اللي، حتى لو كان المرض متنحي،
والـ Female Carrier، الأصل أنه ما يظهر عليها شيء،
بيكون عند بعض مظاهر المرض، وهي تحدث في الـ Area of
Embryogenesis، يعني هنا اللي بدي أكون أخرجه فيه أنه
صحيح عندي أنا كروموزومات و DNA، وبنتج عنه RNA، وبنتج
عنه بعدين بروتين، بس، بس فيه نقطة
الأخيرة، من قبل أنا، على الأقل في غالبية الجينات، قد 393 00:37:43,570
هذه النقاط
هذه بتكون من خلال إنك أنت اللي طلعته من الإنسان
هذا أو من المريض، هذا أو من العائلة المريضة، أقوم
وأشوف شو هي الـ References للقطع هذه، شو بيحكوا
الموجود في الـ Human Genome Project في الـ
Database بتاعة الـ SNPs اللي هو Single Nucleotide
Polymorphism اللي هو يعني أنه جزء من الموضوع/القضية
أنه اللي صرفوا عليه كثير من الأبحاث، بالذات اللي مش
بشكل تجاري، زي الحكومات أو الجامعات أو كده، بتلاقيهم
بيطلبوا أنه هذه المعلومة تكون مشاركة مع الجميع
يعني ما يكون هي ملك فقط للباحث بحيث يخبي عليها
وما يعطيها لحد تاني، فبيطلبوا أنه كل الناس تشارك في
أنه تحط الترتيب الـ Nucleotides اللي طلعتها، وترتيب
الـ Amino Acids والبروتين اللي طلعوا، والـ RNA اللي
طلعوا. فأهم مرجع للمصادر العلمية الآن، إذا واحد بده
يدرس أي موضوع، هو الـ PubMed، الـ PubMed
موقع في ولايات المتحدة الأمريكية، ومحطين فيه الـ
DNA والـ RNA والبروتين وكذا. ويعني نتذكر يعني من
سبب أنه في عندي 64 من الـ Nucleotide Sequence حتى
يعمل الـ 20 Amino Acids، لإنه فيه اشتراكات يعني
أحيانًا الـ SNPs هذه ما الهاش قيمة، ما هي بتساعدنا أن
نشوف من وين أجى هذا الـ DNA، من الأب، من الأم، هل
صار فيه تغير معين ولا لأ، أو أنه بس على مستوى الـ
Protein، قد لا يكون له قيمة يعني. فهنا مجموعة مراجع
حتى الواحد لو طلع إشي يشوف بشبه إيش، حد اكتشفه من
قبل، وأحيانًا هذه المراجع مش بس للـ Human Genetic
Diversity، في أول Whole-Genome Sequencing كان لذبابة
الفاكهة أو لحيوانات أخرى أو للفيروسات والبكتيريا
والنباتات وكذا. ففي قواعد بيانات، الـ Databases
بيكون فيها كل المعلومات الوراثية لكل المركبات
اللي نعرف عنها سواء Human و Non-Human، وبالتالي
إحنا لما نيجي نتعامل، أنه أنا والله عندي عائلة
مريضة، أخدت الـ DNA منهم، درست شو الترتيب الـ
Sequence بتاعتهم فوق الـ PCR، وعرفت الترتيب، ممكن
أقارنه بـ Database، يعني لما نقول Diversity
و Variation، بنبدأ أنه في أشياء شائعة منهم مثلًا
اللي هي SNP اللي هي Single Nucleotide Polymorphism
يعني أنه بس حرف واحد على مستوى الـ DNA، وكل ثلاث
أحرف بتعطينا Amino Acid واحد. فـ Single Nucleotide
و Polymorphism، تغيير بس واحد من الـ Base Pair، وهذا
عادةً ممكن ما يكونش له قيمة، بس ممكن يكون عندي ظاهرة
أكتر من الـ Base Pair، واحد لحد مية، نسميه Insertion
و Deletion. أحيانًا فيه Copy Number Variation، يعني
قضية، راح ناخد مثلًا بالهيموفيليا، عبارة عن إذا في
هيموفيليا، اللي أخد الثلاسيميا في Alpha و Beta
إذا تبعات الـ Alpha هي Copy Number Variation
فبتلاقي قطعة كبيرة، أكبر من يعني عشر آلاف Base، عشر
آلاف كيلو Base، أو مليون، One Mega Base، أو قضية أنه
يصير Inversion، يعني أنه نتيجة لفة الـ DNA، إن حطت
بطريقة مختلفة. هي أنواع الـ Variations اللي ممكن مرات
تحدث، هي تشبه من اللي حطيناها مرة من قبل، أنه هي
عندي Different Sequence في قطعة معينة بشتغل عليها
إذا كان زي هيك، هذا الإنسان عنده الأليل الأول
والثاني، الأليلين زي بعض، بس في واحد هذا عنده SNPs
هاي بدنا نسميها هنا اللي هي deletion أو insertion
هنا اللي بنلاحظه، شوفوا هدول، هذا الأليل الأول اللي
هو بيشبه الـ reference، اللي صار هنا صار عندي
insertion، يعني هاي أجت الزيادة، فالـ T كانت هنا
مفروض تجي ورا الـ G ثم A ثم A ثم C ثم T ثم كده
فهذا النوع بدنا نسميه Indel، صحيح A، بس هو حقيقة هو
insertion single nucleotide، طبعًا هذا بيخرب الدنيا
الـ SNP في الغالب ما راح يعمل أي شيء، لأنه يمكن مرات
كثيرة أنه بتكون نفس البروتين، بالتالي مش ضروري أن
يكون له تأثير، بس أحيانًا طبعًا بيأثر، هنا هذا
بيسموه، لما يكون insertion لواحد، راح يخرّب كل الـ
copy هذه، راح تكون، لأنه نقرأ ثلاث ثلاث ثلاث، لما تحط
واحد زيادة، راح تخرّب الثلاثيات، أما لو صار الـ
insertion لثلاثة، ممكن ما يكونش له أي تأثير كبير
لأنه بالأخير بيظل البروتين ممكن إنتاجه من هذا الـ
DNA، هنا صارت عملية deletion،
deletion لإثنين، لما يكون إثنين الـ deleted يعني
أنا هنا، هاي تمام زي البقية، هذول الـ T والـ T طال
الـ C صارت تشبك ورا الـ T، والبقية بنزل زي ما هو
فالأصل كان، يعني عملوا زي هنا الـ Rectare Deletion
حطوا هاي ورا هاي على طول، وجرّوا البقية. فهذه أنواع
من بعض الـ Polymorphisms اللي بنشوفها في الـ
غير
الـ SNP، حكينا
Single أو Limited، يا إما insertion أو deletion
أحيانًا هنا copy number variant، يعني أنا هنا FG
مرة واحدة، قطعة FG FG FG، طبعًا هنا يعني على مستوى
الجينات كلها، ناشي، يعني أنا بدل الأليل الأول، الـ H
هنا، وبعدين G F يعني A B C D E F
G، هذا على مستوى الجين كله. فأحيانًا في إنسان غير
إنسان ثاني، أنه هنا بيصير ثلاثي copy، بدل ما هي واحد
اللي كان لازم تكون. وفي inverse polymorphism، إذا
كان عندي مثلًا ترتيب الجينات A B C D E
F G H كده، صار قطع ولسف بطريقة غلط، بحيث أنه
صار AB بعدين EDC، هنا الله أعلم، يعني ما يكونش
تأثير كبير على الوظيفة، بقدر ما أنه على مستوى الـ
DNA فيه اختلافات، Polymorphism Micro-satellite
polymorphism هي تكرار
لمجموعات معينة، و Mobile element insertion
polymorphism بيغيّر تفتيح قراءات الـ DNA، وأشياء
مختلفة فيه
يعني هذه الظواهر، اليوم بنوقف لهاللحظة، أنا آسف
اليوم خربطة من عندي، بس إن شاء الله المرة اللي جاية
بنراجع الأشياء، وده فيه أسئلة، وجروب الـ WhatsApp
فاتح يعني
إذا حد عنده أسئلة ممكن نتناقش فيها، يعطيكم العافية
السلام عليكم، السلام ورحمة الله، يعطيك العافية، مش
عارف إذا دكتورة ده كنت سامعني لأ، لكن عمومًا يعطيك
العافية، يعطيكم العافية يا دكاترة، وإن شاء الله يعني
إلى لقاء قادم بإذن الله، السلام عليكم، يعطيكم
العافية