OncoGAN-syntheticVCFs / CNS-PiloAstro /CNS-PiloAstro_sim1.vcf
anderdnavarro's picture
Upload folder using huggingface_hub
817e9cb verified
##fileformat=VCFv4.2
#CHROM POS ID REF ALT VAF MUT
1 15722766 sim1 G T 0.1 SBS5
1 23853264 sim1 C A 0.09 SBS5
1 36975466 sim1 C T 0.19 SBS5
1 41244120 sim1 C T 0.11 SBS1
1 47715255 sim1 C T 0.31 SBS1
1 64026864 sim1 TTGGG T 0.05 DEL
1 72527217 sim1 C T 0.08 SBS5
1 84050111 sim1 G A 0.27 SBS5
1 102547172 sim1 A G 0.13 SBS5
1 103734614 sim1 A G 0.15 SBS5
1 104387821 sim1 A G 0.14 SBS5
1 147500162 sim1 A G 0.11 SBS5
1 157330951 sim1 C T 0.12 SBS1
1 168030877 sim1 A T 0.08 SBS5
1 173429365 sim1 A C 0.12 SBS5
1 174943862 sim1 G A 0.07 SBS5
1 187815395 sim1 T G 0.05 SBS5
1 194502146 sim1 G C 0.3 SBS5
1 222203005 sim1 C T 0.11 SBS5
1 222585846 sim1 C T 0.16 SBS5
1 228583786 sim1 TTG T 0.52 DEL
2 6351777 sim1 C T 0.05 SBS5
2 29688840 sim1 A G 0.18 SBS5
2 47458969 sim1 G A 0.3 SBS5
2 50579257 sim1 G A 0.14 SBS1
2 59982896 sim1 GG G 0.09 DEL
2 77404836 sim1 G A 0.16 SBS5
2 82434805 sim1 C T 0.29 SBS5
2 85812100 sim1 C T 0.52 SBS1
2 132770623 sim1 T C 0.12 SBS5
2 180910366 sim1 C T 0.28 SBS1
2 200731693 sim1 G A 0.62 SBS5
2 211019804 sim1 A C 0.6 SBS5
2 216727695 sim1 T C 0.15 SBS5
2 222291834 sim1 C A 0.12 SBS1
3 8929359 sim1 TT T 0.09 DEL
3 23298085 sim1 TT T 0.08 DEL
3 77052257 sim1 G A 0.13 SBS1
3 95403859 sim1 C T 0.09 SBS1
3 95470058 sim1 C G 0.06 SBS5
3 95584309 sim1 G A 0.9 SBS5
3 96230402 sim1 T G 0.09 SBS5
3 96374599 sim1 A G 0.22 SBS5
3 98144036 sim1 C A 0.28 SBS5
3 105488578 sim1 C A 0.13 SBS5
3 137507867 sim1 C T 0.15 SBS5
3 161827369 sim1 G A 0.04 SBS5
3 188957666 sim1 A T 0.1 SBS5
4 8884531 sim1 G T 0.3 SBS5
4 12000144 sim1 C G 0.89 SBS5
4 13547198 sim1 G A 0.17 SBS1
4 20851190 sim1 G A 0.1 SBS5
4 29487148 sim1 T C 0.25 SBS5
4 33771799 sim1 GACTA G 0.05 DEL
4 35126120 sim1 A T 0.9 SBS5
4 46145389 sim1 A T 0.6 SBS5
4 53947697 sim1 A G 0.09 SBS5
4 65473252 sim1 C T 0.36 SBS1
4 68184556 sim1 C T 0.44 SBS1
4 99872364 sim1 G C 0.12 SBS5
4 108418766 sim1 C T 0.15 SBS1
4 141739200 sim1 C T 0.17 SBS1
4 170367989 sim1 A T 0.15 SBS5
5 4127177 sim1 G C 0.1 SBS5
5 6474485 sim1 T C 0.55 SBS5
5 24376585 sim1 A G 0.14 SBS5
5 28622428 sim1 A C 0.11 SBS5
5 28816236 sim1 G A 0.2 SBS5
5 36763733 sim1 G A 0.36 SBS1
5 44705673 sim1 G A 0.22 SBS5
5 51744657 sim1 G A 0.06 SBS1
5 65892066 sim1 T C 0.19 SBS5
5 104551545 sim1 C T 0.29 SBS1
5 120962468 sim1 G T 0.15 SBS5
5 152297310 sim1 T C 0.17 SBS5
5 164199541 sim1 T C 0.14 SBS5
5 164239684 sim1 T A 0.13 SBS5
6 7682617 sim1 T C 0.49 SBS5
6 11437751 sim1 A T 0.28 SBS1
6 17689476 sim1 G A 0.14 SBS5
6 21979279 sim1 T A 0.88 SBS5
6 39805578 sim1 C A 0.2 SBS5
6 42628342 sim1 CTTCT C 0.08 DEL
6 54932565 sim1 G A 0.12 SBS1
6 62412153 sim1 C T 0.12 SBS1
6 65683614 sim1 AA A 0.12 DEL
6 77667811 sim1 C T 0.16 SBS5
6 95002207 sim1 G T 0.15 SBS5
6 101288132 sim1 G A 0.06 SBS5
6 118726955 sim1 C A 0.15 SBS5
6 139020181 sim1 C A 0.09 SBS5
7 50808300 sim1 C T 0.19 SBS1
7 52505401 sim1 TT T 0.2 DEL
7 57436606 sim1 C T 0.09 SBS5
7 76666166 sim1 G A 0.12 SBS5
7 79985846 sim1 G T 0.1 SBS5
7 81219557 sim1 AA A 0.27 DEL
7 82384341 sim1 C T 0.19 SBS5
7 85622063 sim1 C T 0.35 SBS5
7 91340941 sim1 A G 0.89 SBS5
7 93325085 sim1 C T 0.14 SBS5
7 99090966 sim1 G A 0.48 SBS1
7 100532543 sim1 G A 0.16 SBS1
7 110848492 sim1 C A 0.22 SBS5
7 113009026 sim1 T C 0.36 SBS5
7 120671059 sim1 G A 0.18 SBS5
7 125623014 sim1 G C 0.18 SBS5
7 140489186 sim1 G C 0.27 driver_BRAF_Intron
7 140896348 sim1 A T 0.11 SBS5
7 142173165 sim1 G T 0.37 SBS5
7 155800897 sim1 C T 0.14 SBS5
8 86979439 sim1 G A 0.08 SBS1
8 105744535 sim1 C T 0.12 SBS1
8 126377280 sim1 G A 0.14 SBS5
8 128203873 sim1 G A 0.14 SBS1
8 137251187 sim1 A T 0.2 SBS5
9 8121699 sim1 G A 0.07 SBS1
9 18306106 sim1 CT C 0.05 DEL
9 25836076 sim1 C T 0.15 SBS5
9 29280699 sim1 AAAAGT A 0.09 DEL
9 32898101 sim1 T C 0.22 SBS5
9 70331763 sim1 A G 0.11 SBS5
9 75764062 sim1 G T 0.16 SBS5
9 77826110 sim1 G A 0.18 SBS1
9 85117916 sim1 GC G 0.17 DEL
9 103379317 sim1 T C 0.24 SBS5
9 106445700 sim1 G A 0.15 SBS5
9 132717507 sim1 T C 0.12 SBS5
10 4905604 sim1 C T 0.09 SBS5
10 10115989 sim1 C T 0.46 SBS1
10 16540297 sim1 C T 0.08 SBS1
10 35872445 sim1 G T 0.19 SBS5
10 37438043 sim1 A T 0.25 SBS5
10 93777370 sim1 C T 0.11 SBS1
10 94202543 sim1 G T 0.26 SBS5
10 105454692 sim1 A G 0.54 SBS5
10 117644310 sim1 AGG A 0.27 DEL
11 6316052 sim1 T A 0.28 SBS5
11 34354547 sim1 T A 0.21 SBS5
11 57023357 sim1 C G 0.14 SBS5
12 32463398 sim1 T G 0.1 SBS5
12 55390073 sim1 G A 0.28 SBS5
12 98308499 sim1 T C 0.3 SBS5
13 28099003 sim1 A G 0.07 SBS5
13 33348912 sim1 G A 0.17 SBS5
13 49826372 sim1 A T 0.33 SBS5
13 83125197 sim1 A C 0.13 SBS5
13 89579635 sim1 C T 0.13 SBS1
13 89657471 sim1 A G 0.12 SBS5
13 100188642 sim1 G A 0.15 SBS1
13 103815038 sim1 A G 0.11 SBS5
13 112069861 sim1 C T 0.17 SBS5
14 23518338 sim1 C A 0.29 SBS5
14 43887863 sim1 G C 0.36 SBS5
14 44364603 sim1 T C 0.15 SBS5
14 49342560 sim1 T C 0.12 SBS5
14 60665668 sim1 G C 0.16 SBS5
14 75123459 sim1 G A 0.08 SBS1
14 98454335 sim1 C T 0.17 SBS1
14 101899997 sim1 A G 0.09 SBS5
15 52850656 sim1 AAAACAA A 0.1 DEL
15 59060005 sim1 G C 0.12 SBS5
15 91261801 sim1 A G 0.17 SBS5
16 23721655 sim1 A T 0.1 SBS5
16 55081053 sim1 C T 0.13 SBS5
16 57669967 sim1 C T 0.28 SBS1
16 60051749 sim1 G A 0.08 SBS5
16 63703588 sim1 C A 0.18 SBS1
17 29560044 sim1 AA A 0.4 driver_NF1_Coding
17 30015132 sim1 G T 0.18 SBS5
17 48153663 sim1 C T 0.89 SBS1
17 53088930 sim1 A G 0.2 SBS5
17 79925235 sim1 G A 0.11 SBS1
18 27748258 sim1 C CGTAG 0.16 INS
18 35500741 sim1 C T 0.09 SBS1
18 49650005 sim1 C T 0.19 SBS1
18 65024135 sim1 G GG 0.09 INS
18 69818464 sim1 T A 0.12 SBS5
19 7478783 sim1 G A 0.14 SBS1
19 16120104 sim1 G T 0.06 SBS5
19 57701431 sim1 G T 0.05 SBS5
20 35956560 sim1 T A 0.23 SBS5
20 51587038 sim1 T C 0.1 SBS5
21 20874857 sim1 C T 0.19 SBS5
X 6070966 sim1 C T 0.17 SBS5
X 16487486 sim1 G A 0.22 SBS1
X 66721697 sim1 A T 0.28 SBS1
X 103545223 sim1 A T 0.09 SBS5
X 129975543 sim1 G T 0.2 SBS5
X 143212859 sim1 CT C 0.28 DEL
X 153163965 sim1 CTT C 0.1 DEL
Y 9407914 sim1 CC C 0.25 DEL
Y 13579835 sim1 C T 0.16 SBS5