OncoGAN-syntheticVCFs / CNS-PiloAstro /CNS-PiloAstro_sim4.vcf
anderdnavarro's picture
Upload folder using huggingface_hub
817e9cb verified
##fileformat=VCFv4.2
#CHROM POS ID REF ALT VAF MUT
1 48640690 sim4 T G 0.11 SBS5
1 61044692 sim4 CT C 0.26 DEL
1 74151493 sim4 T G 0.35 SBS5
1 77251368 sim4 G A 0.19 SBS5
1 79565976 sim4 G A 0.58 SBS1
1 117177508 sim4 C T 0.31 SBS1
1 150217710 sim4 C A 0.16 SBS5
1 156162554 sim4 C T 0.42 SBS1
1 188820530 sim4 G A 0.26 SBS1
1 190083832 sim4 G A 0.09 SBS1
1 200465157 sim4 C T 0.37 SBS5
1 212507855 sim4 C G 0.18 SBS5
1 220708762 sim4 A T 0.09 SBS5
1 220735032 sim4 A T 0.17 SBS5
2 25430471 sim4 A G 0.08 SBS5
2 34534283 sim4 G A 0.19 SBS5
2 54349974 sim4 G A 0.09 SBS5
2 82947740 sim4 A G 0.11 SBS5
2 99236775 sim4 A T 0.15 SBS1
2 142085291 sim4 T A 0.21 SBS5
2 183903154 sim4 C T 0.11 SBS1
3 1844194 sim4 G A 0.1 SBS1
3 7315962 sim4 T C 0.09 SBS1
3 13134382 sim4 G A 0.17 SBS1
3 79707831 sim4 G T 0.19 SBS5
3 80704487 sim4 C T 0.41 SBS5
3 88171027 sim4 G A 0.54 SBS1
3 89268882 sim4 G A 0.48 SBS1
3 103911988 sim4 G A 0.14 SBS1
3 106354828 sim4 C T 0.22 SBS1
3 127235778 sim4 G A 0.54 SBS1
3 128321503 sim4 T G 0.36 SBS5
3 165079118 sim4 A C 0.11 SBS5
3 192476702 sim4 C T 0.08 SBS1
4 22567510 sim4 G T 0.51 SBS5
4 43616654 sim4 G T 0.35 SBS5
4 67040759 sim4 A G 0.09 SBS1
4 68215881 sim4 A T 0.23 SBS5
4 70026652 sim4 A T 0.1 SBS1
4 73694234 sim4 C T 0.35 SBS1
4 103235937 sim4 T A 0.2 SBS1
4 108616532 sim4 T G 0.44 SBS5
4 137414804 sim4 C CT 0.48 INS
4 146914848 sim4 A G 0.35 SBS5
4 156385887 sim4 C T 0.35 SBS1
4 160981882 sim4 G A 0.08 SBS5
4 163296505 sim4 T A 0.46 SBS5
4 163826964 sim4 G A 0.17 SBS5
4 181856493 sim4 C A 0.1 SBS5
4 186242101 sim4 G C 0.46 SBS5
5 12314777 sim4 A G 0.3 SBS5
5 21288510 sim4 G A 0.06 SBS5
5 23824505 sim4 C T 0.54 SBS1
5 38433089 sim4 G T 0.26 SBS5
5 43485617 sim4 C T 0.41 SBS1
5 52902120 sim4 G A 0.34 SBS1
5 70923207 sim4 T A 0.09 SBS5
5 102225396 sim4 T C 0.34 SBS5
5 154668012 sim4 A T 0.21 SBS5
5 159852212 sim4 C T 0.39 SBS1
5 163369162 sim4 T C 0.63 SBS1
5 165942715 sim4 C T 0.33 SBS1
6 10954922 sim4 C T 0.18 SBS1
6 24783242 sim4 G A 0.33 SBS1
6 41221271 sim4 C T 0.42 SBS5
6 42516720 sim4 A T 0.37 SBS5
6 48559984 sim4 G A 0.45 SBS5
6 62269582 sim4 G A 0.12 SBS5
6 63509189 sim4 T A 0.31 SBS1
6 66297805 sim4 G A 0.79 SBS1
6 74421458 sim4 C T 0.31 SBS5
6 76373610 sim4 C T 0.13 SBS5
6 121369649 sim4 C T 0.1 SBS1
6 122661633 sim4 G A 0.46 SBS1
6 124510132 sim4 T C 0.05 SBS5
6 129042945 sim4 T C 0.06 SBS5
6 133313071 sim4 G T 0.23 SBS5
6 137276155 sim4 A G 0.36 SBS5
7 49682978 sim4 A G 0.25 SBS5
7 50500523 sim4 G A 0.64 SBS5
7 55442138 sim4 A G 0.09 SBS5
7 57759300 sim4 C T 0.06 SBS1
7 103174210 sim4 C CG 0.32 INS
7 140499621 sim4 C T 0.26 driver_BRAF_Intron
8 9831162 sim4 C T 0.58 SBS1
8 36110245 sim4 C G 0.26 SBS5
8 38274849 sim4 G T 0.76 driver_FGFR1_Coding
8 42892366 sim4 G A 0.34 SBS1
8 49955961 sim4 C T 0.06 SBS1
8 50072249 sim4 T C 0.11 SBS5
8 57727540 sim4 C T 0.34 SBS5
8 82092299 sim4 T C 0.26 SBS1
8 137251151 sim4 C T 0.32 SBS1
9 73053394 sim4 C A 0.11 SBS5
9 106542627 sim4 A G 0.41 SBS5
9 129966700 sim4 G A 0.57 SBS5
9 139450297 sim4 C T 0.22 SBS5
10 2040319 sim4 T C 0.14 SBS5
10 19648868 sim4 T C 0.26 SBS5
10 57967045 sim4 A G 0.09 SBS5
10 68552867 sim4 T C 0.08 SBS5
10 84954993 sim4 G A 0.13 SBS1
10 92834819 sim4 T C 0.27 SBS5
10 112282279 sim4 G A 0.05 SBS1
10 121699793 sim4 G C 0.17 SBS1
10 130007655 sim4 T C 0.38 SBS5
11 12154358 sim4 G A 0.24 SBS5
11 34106507 sim4 G T 0.09 SBS1
11 41634089 sim4 C A 0.15 SBS5
11 84424404 sim4 A T 0.09 SBS5
11 85333321 sim4 G A 0.21 SBS1
11 125399425 sim4 C T 0.3 SBS1
11 134232074 sim4 C G 0.21 SBS5
12 25372998 sim4 G A 0.46 SBS1
12 27525913 sim4 A G 0.63 SBS5
12 53470162 sim4 A G 0.26 SBS5
12 59232150 sim4 T C 0.09 SBS5
12 112888211 sim4 A C 0.04 driver_PTPN11_Coding
13 62897196 sim4 T C 0.33 SBS5
13 80767401 sim4 C T 0.42 SBS5
13 94374806 sim4 G A 0.14 SBS1
14 24746035 sim4 G A 0.39 SBS5
14 42226455 sim4 C T 0.38 SBS1
14 43198852 sim4 C T 0.42 SBS5
14 74807593 sim4 C T 0.23 SBS1
14 93564312 sim4 G A 0.24 SBS1
14 99899500 sim4 G A 0.21 SBS5
15 26512215 sim4 C G 0.64 SBS5
15 82464845 sim4 G A 0.07 SBS1
15 94557710 sim4 C T 0.1 SBS5
15 97957968 sim4 C T 0.39 SBS1
16 2344894 sim4 G C 0.15 SBS5
16 68083410 sim4 G T 0.29 SBS5
16 68383713 sim4 G T 0.18 SBS5
17 26114431 sim4 T C 0.06 SBS5
17 43067673 sim4 C A 0.15 SBS1
17 55545651 sim4 G T 0.11 SBS5
17 56965962 sim4 A C 0.11 SBS5
17 67535241 sim4 G A 0.38 SBS5
18 2303546 sim4 C T 0.33 SBS1
18 13585450 sim4 C G 0.2 SBS5
18 54837804 sim4 C T 0.34 SBS1
18 55013313 sim4 C T 0.22 SBS1
19 6784983 sim4 T C 0.3 SBS5
20 7864606 sim4 T G 0.14 SBS5
21 17391506 sim4 G A 0.31 SBS5
21 19696042 sim4 C CC 0.63 INS
21 25255231 sim4 TT T 0.35 DEL
22 28099162 sim4 A T 0.16 SBS5
X 17124280 sim4 C A 0.33 SBS5
X 27474983 sim4 G A 0.4 SBS5
X 76762153 sim4 T C 0.04 SBS5
X 80052462 sim4 T C 0.13 SBS5
X 138864530 sim4 A G 0.1 SBS5
X 153570563 sim4 C T 0.06 SBS1
Y 22421975 sim4 A G 0.42 SBS1