##fileformat=VCFv4.2 #CHROM POS ID REF ALT VAF MUT 1 29702003 sim2 G A 0.41 SBS1 1 38485425 sim2 G T 0.14 SBS5 1 43661527 sim2 A T 0.44 SBS5 1 45364896 sim2 G C 0.15 SBS5 1 46047114 sim2 C T 0.72 SBS1 1 46891432 sim2 G A 0.44 SBS5 1 49662442 sim2 A T 0.33 SBS1 1 73042068 sim2 T A 0.3 SBS5 1 75256918 sim2 G A 0.12 SBS5 1 78943175 sim2 C T 0.21 SBS5 1 85732252 sim2 T C 0.15 SBS5 1 91478161 sim2 C T 0.55 SBS5 1 146068471 sim2 G A 0.08 SBS1 1 156267614 sim2 A C 0.09 SBS5 1 168699040 sim2 C A 0.17 SBS5 1 173769163 sim2 AATTAT A 0.21 DEL 1 188117307 sim2 C T 0.13 SBS5 1 198238573 sim2 T G 0.38 SBS5 1 230592140 sim2 T C 0.15 SBS5 1 247369516 sim2 C T 0.23 SBS5 2 12086635 sim2 A G 0.73 SBS5 2 17896895 sim2 T G 0.18 SBS1 2 20050805 sim2 A G 0.39 SBS5 2 34798116 sim2 TT T 0.34 DEL 2 39788235 sim2 T G 0.07 SBS5 2 44384916 sim2 C A 0.59 SBS5 2 59364233 sim2 A T 0.1 SBS5 2 59453768 sim2 C T 0.81 SBS5 2 60387532 sim2 C A 0.26 SBS5 2 64516260 sim2 G A 0.14 SBS1 2 81292992 sim2 T A 0.13 SBS5 2 82212238 sim2 G A 0.1 SBS5 2 101781553 sim2 C T 0.43 SBS5 2 105951690 sim2 A G 0.35 SBS1 2 116542187 sim2 G A 0.1 SBS5 2 119715944 sim2 A T 0.08 SBS5 2 125915806 sim2 C A 0.37 SBS5 2 141897005 sim2 T C 0.24 SBS5 2 145219631 sim2 G A 0.4 SBS5 2 145550175 sim2 C T 0.14 SBS5 2 147387471 sim2 GG G 0.41 DEL 2 154122484 sim2 G A 0.12 SBS1 2 155677952 sim2 CC C 0.35 DEL 2 159036891 sim2 G A 0.08 SBS5 2 162949754 sim2 C A 0.14 SBS5 2 170662771 sim2 A T 0.11 SBS5 2 173907306 sim2 G A 0.08 SBS1 2 179912572 sim2 T C 0.12 SBS5 2 194072139 sim2 G T 0.1 SBS5 2 219807272 sim2 C CT 0.16 INS 2 221145978 sim2 A C 0.36 SBS5 2 225527847 sim2 C T 0.35 SBS5 2 226225075 sim2 C T 0.45 SBS5 2 234668385 sim2 C T 0.29 SBS5 3 4822091 sim2 G A 0.42 SBS5 3 14158420 sim2 G A 0.08 SBS5 3 23025266 sim2 T A 0.3 SBS5 3 38818987 sim2 G A 0.18 SBS1 3 42400837 sim2 C T 0.22 SBS1 3 56283399 sim2 G A 0.08 SBS5 3 60719869 sim2 G A 0.11 SBS1 3 75014689 sim2 C A 0.18 SBS5 3 84079984 sim2 C T 0.81 SBS5 3 88405179 sim2 A T 0.14 SBS5 3 96052969 sim2 A G 0.22 SBS5 3 96568301 sim2 C T 0.54 SBS1 3 97107116 sim2 C T 0.37 SBS5 3 98933508 sim2 C G 0.38 SBS5 3 109194442 sim2 C T 0.08 SBS5 3 109686148 sim2 A C 0.08 SBS1 3 111889280 sim2 A G 0.42 SBS5 3 122653885 sim2 C T 0.38 SBS1 3 128106613 sim2 CC C 0.09 DEL 3 128801573 sim2 C A 0.1 SBS5 3 136773209 sim2 G A 0.4 SBS1 3 147259436 sim2 G A 0.3 SBS1 3 149751430 sim2 C T 0.25 SBS1 3 156513957 sim2 CA C 0.28 DEL 3 156902072 sim2 C A 0.43 SBS5 3 157197954 sim2 T G 0.11 SBS5 3 164064831 sim2 C T 0.41 SBS1 3 164469791 sim2 A G 0.34 SBS5 3 173653359 sim2 C T 0.19 SBS5 3 174785269 sim2 C T 0.08 SBS1 3 185755533 sim2 C A 0.16 SBS5 4 1958901 sim2 C A 0.25 SBS5 4 17942316 sim2 T C 0.17 SBS5 4 20775351 sim2 G A 0.36 SBS1 4 22567313 sim2 T A 0.16 SBS5 4 34910090 sim2 A G 0.53 SBS5 4 37886232 sim2 T C 0.3 SBS5 4 43087973 sim2 G A 0.26 SBS5 4 48715601 sim2 A T 0.3 SBS5 4 53566553 sim2 C A 0.03 SBS5 4 65497404 sim2 T C 0.15 SBS5 4 66589205 sim2 C G 0.26 SBS5 4 68739670 sim2 AAC A 0.42 DEL 4 69406538 sim2 G A 0.11 SBS1 4 70625531 sim2 A T 0.11 SBS5 4 73611800 sim2 AAT A 0.17 DEL 4 80720352 sim2 T C 0.04 SBS5 4 83081964 sim2 G A 0.06 SBS5 4 83447804 sim2 T G 0.13 SBS5 4 104724078 sim2 C A 0.1 SBS5 4 108453790 sim2 C T 0.61 SBS5 4 112448321 sim2 A G 0.28 SBS5 4 121680571 sim2 C T 0.11 SBS1 4 123777573 sim2 T C 0.18 SBS5 4 127004378 sim2 CTCTA C 0.17 DEL 4 131917947 sim2 AA A 0.36 DEL 4 154198349 sim2 G A 0.25 SBS1 4 162173947 sim2 C T 0.28 SBS1 4 162705508 sim2 A G 0.4 SBS5 4 163585179 sim2 A G 0.17 SBS5 4 172280754 sim2 G T 0.11 SBS5 4 175282248 sim2 C T 0.12 SBS5 4 176054678 sim2 G T 0.27 SBS5 5 1096980 sim2 G T 0.29 SBS5 5 3886216 sim2 C T 0.36 SBS1 5 8321504 sim2 G A 0.96 SBS1 5 11289073 sim2 G A 0.24 SBS1 5 11501386 sim2 C A 0.15 SBS5 5 14264065 sim2 C T 0.24 SBS1 5 16207594 sim2 A G 0.25 SBS5 5 27039884 sim2 G A 0.52 SBS5 5 28081912 sim2 G C 0.3 SBS5 5 33157297 sim2 T C 0.81 SBS5 5 45093621 sim2 A G 0.22 SBS5 5 51961889 sim2 C T 0.44 SBS5 5 61337398 sim2 A T 0.34 SBS5 5 61608676 sim2 G A 0.25 SBS5 5 65182967 sim2 T C 0.11 SBS5 5 85528457 sim2 TT T 0.22 DEL 5 87715413 sim2 T C 0.06 SBS5 5 91294388 sim2 T C 0.23 SBS5 5 97314453 sim2 T TCG 0.32 INS 5 110765299 sim2 G C 0.36 SBS5 5 120681020 sim2 G T 0.5 SBS5 5 121297735 sim2 AGC A 0.3 DEL 5 150635295 sim2 C T 0.13 SBS1 5 157136948 sim2 C A 0.44 SBS5 5 158409273 sim2 A G 0.44 SBS5 5 158531847 sim2 C T 0.28 SBS1 5 164304652 sim2 G A 0.09 SBS5 5 166086375 sim2 A G 0.05 SBS5 5 168970777 sim2 T A 0.17 SBS5 5 169354867 sim2 G A 0.06 SBS1 5 175795061 sim2 C A 0.97 SBS5 6 10346990 sim2 G A 0.23 SBS1 6 11662237 sim2 T C 0.32 SBS5 6 27532058 sim2 A G 0.37 SBS5 6 28944195 sim2 T C 0.19 SBS5 6 32988214 sim2 A G 0.14 SBS5 6 33889505 sim2 G A 0.41 SBS5 6 48279236 sim2 G A 0.41 SBS5 6 50431661 sim2 C A 0.28 SBS5 6 54383595 sim2 C G 0.11 SBS5 6 63691609 sim2 G C 0.09 SBS5 6 69161754 sim2 T G 0.56 SBS5 6 77825301 sim2 A G 0.25 SBS5 6 80142855 sim2 A T 0.24 SBS5 6 95471029 sim2 G T 0.1 SBS5 6 100405374 sim2 C G 0.18 SBS1 6 104014249 sim2 C T 0.29 SBS5 6 104611398 sim2 A C 0.2 SBS5 6 119220871 sim2 C T 0.25 SBS1 6 123687136 sim2 G A 0.18 SBS5 6 130950443 sim2 T A 0.27 SBS5 6 147855501 sim2 A T 0.13 SBS5 6 165888857 sim2 T A 0.1 SBS5 6 167762087 sim2 G T 0.23 SBS5 6 169786817 sim2 G A 0.13 SBS1 7 15119704 sim2 A G 0.13 SBS5 7 32178970 sim2 T C 0.11 SBS1 7 33121626 sim2 C T 0.38 SBS5 7 48538467 sim2 A T 0.45 SBS5 7 51173331 sim2 C T 0.28 SBS5 7 51703177 sim2 C T 0.33 SBS1 7 62432596 sim2 T G 0.21 SBS5 7 63164799 sim2 A T 0.41 SBS5 7 64211034 sim2 C A 0.28 SBS1 7 75443075 sim2 C T 0.27 SBS5 7 82625350 sim2 C T 0.1 SBS1 7 100723112 sim2 C T 0.1 SBS1 7 111733971 sim2 C G 0.16 SBS5 7 118452602 sim2 A G 0.08 SBS5 7 124026025 sim2 C T 0.1 SBS1 7 133427181 sim2 C T 0.46 SBS1 7 136520647 sim2 C T 0.11 SBS5 7 140388159 sim2 T A 0.8 SBS5 7 141013911 sim2 C T 0.62 SBS5 7 141806788 sim2 A G 0.14 SBS5 7 150546700 sim2 C T 0.16 SBS1 8 13152437 sim2 T C 0.39 SBS5 8 16167263 sim2 C T 0.74 SBS1 8 20409374 sim2 T C 0.33 SBS5 8 21117693 sim2 G A 0.42 SBS5 8 22117740 sim2 G A 0.12 SBS1 8 31262700 sim2 A G 0.41 SBS5 8 33414168 sim2 T C 0.09 SBS5 8 34651909 sim2 C T 0.21 SBS5 8 47556149 sim2 T G 0.52 SBS5 8 72575067 sim2 A G 0.33 SBS5 8 73178508 sim2 C T 0.15 SBS5 8 75971956 sim2 C A 0.38 SBS5 8 77158259 sim2 A G 0.04 SBS5 8 85817249 sim2 A T 0.18 SBS5 8 89369932 sim2 T A 0.18 SBS5 8 93316605 sim2 C T 0.25 SBS5 8 105342558 sim2 G A 0.28 SBS1 8 115696376 sim2 T G 0.08 SBS5 8 118861156 sim2 C G 0.09 SBS5 8 120613336 sim2 C T 0.42 SBS1 8 120711915 sim2 C G 0.46 SBS5 8 124556099 sim2 T C 0.33 SBS5 8 138298441 sim2 G A 0.08 SBS1 8 144146196 sim2 A G 0.22 SBS5 9 1000367 sim2 C A 0.95 SBS5 9 1304973 sim2 A G 0.47 SBS5 9 1510570 sim2 T A 0.23 SBS5 9 10059158 sim2 A C 0.13 SBS5 9 10567951 sim2 A T 0.19 SBS5 9 13481095 sim2 C G 0.19 SBS5 9 17597263 sim2 T G 0.13 SBS5 9 22463018 sim2 G A 0.14 SBS5 9 31919663 sim2 A G 0.09 SBS5 9 32818281 sim2 A G 0.06 SBS5 9 37981043 sim2 A G 0.25 SBS5 9 76942215 sim2 C T 0.1 SBS5 9 77912448 sim2 A G 0.36 SBS5 9 79728005 sim2 A G 0.37 SBS5 9 94458307 sim2 A G 0.28 SBS5 9 100389128 sim2 C T 0.15 SBS5 9 103495621 sim2 G A 0.24 SBS5 9 105036202 sim2 C G 0.42 SBS5 9 105953178 sim2 G A 0.3 SBS1 9 106423797 sim2 T C 0.48 SBS5 9 110929070 sim2 G T 0.71 SBS5 9 112885506 sim2 A G 0.12 SBS5 9 114312772 sim2 C T 0.45 SBS5 9 123889909 sim2 T C 0.17 SBS5 9 131297930 sim2 T C 0.11 SBS1 10 481077 sim2 G A 0.13 SBS1 10 4871370 sim2 C T 0.39 SBS5 10 5333714 sim2 A G 0.33 SBS5 10 5933652 sim2 A G 0.08 SBS5 10 11848821 sim2 G A 0.14 SBS1 10 17339056 sim2 T C 0.19 SBS5 10 20696556 sim2 C A 0.33 SBS5 10 20937101 sim2 T C 0.21 SBS5 10 51970986 sim2 G T 0.4 SBS5 10 58318528 sim2 G C 0.38 SBS5 10 72839082 sim2 C T 0.44 SBS1 10 80988828 sim2 G A 0.32 SBS5 10 84923085 sim2 A T 0.33 SBS5 10 94864714 sim2 G A 0.16 SBS5 10 94878085 sim2 C A 0.13 SBS5 10 100037804 sim2 G A 0.22 SBS5 10 102116660 sim2 G C 0.11 SBS5 10 135343969 sim2 C A 0.25 SBS5 11 2550737 sim2 A G 0.06 SBS5 11 20421104 sim2 G T 0.4 SBS5 11 31299430 sim2 G A 0.54 SBS5 11 35093680 sim2 C A 0.38 SBS5 11 36681016 sim2 C T 0.2 SBS5 11 37143830 sim2 T A 0.38 SBS5 11 54912432 sim2 G T 0.03 SBS5 11 55763653 sim2 G A 0.08 SBS5 11 59120052 sim2 C T 0.27 SBS5 11 64789809 sim2 C T 0.11 SBS1 11 70948760 sim2 T C 0.11 SBS5 11 75663909 sim2 C T 0.19 SBS1 11 80332751 sim2 G A 0.16 SBS5 11 95896796 sim2 GT G 0.45 DEL 11 98798119 sim2 T G 0.24 SBS5 11 104559080 sim2 C A 0.46 SBS5 11 106452152 sim2 G C 0.19 SBS5 11 108949946 sim2 C A 0.21 SBS5 11 112851944 sim2 C T 0.21 SBS1 11 115337074 sim2 G A 0.13 SBS1 11 123732013 sim2 G A 0.18 SBS1 11 125949946 sim2 C T 0.23 SBS5 11 128445979 sim2 T C 0.46 SBS5 12 651589 sim2 G T 0.26 SBS5 12 7715413 sim2 C T 0.3 SBS5 12 7881570 sim2 G A 0.33 SBS1 12 9166989 sim2 C A 0.06 SBS5 12 9325970 sim2 A C 0.14 SBS5 12 18962332 sim2 G A 0.15 SBS5 12 32631042 sim2 G A 0.37 SBS5 12 54345925 sim2 A G 0.18 SBS5 12 72893404 sim2 G A 0.52 SBS1 12 79246651 sim2 G T 0.12 SBS5 12 79692514 sim2 G A 0.18 SBS5 12 84112061 sim2 C G 0.18 SBS5 12 84136427 sim2 C T 0.4 SBS1 12 85187390 sim2 C A 0.1 SBS5 12 85831474 sim2 A G 0.22 SBS5 12 87499925 sim2 A T 0.08 SBS5 12 88722127 sim2 AA A 0.27 DEL 12 92495004 sim2 G A 0.09 SBS1 12 100404562 sim2 G A 0.2 SBS5 12 101914938 sim2 G A 0.18 SBS5 12 103588082 sim2 C A 0.22 SBS5 12 130366813 sim2 C T 0.14 SBS1 12 131185406 sim2 G A 0.2 SBS5 13 21129189 sim2 G A 0.15 SBS1 13 24829768 sim2 G A 0.21 SBS5 13 28720621 sim2 A G 0.35 SBS5 13 30618108 sim2 T C 0.11 SBS5 13 44195192 sim2 T C 0.22 SBS5 13 56045706 sim2 C T 0.05 SBS5 13 79325669 sim2 G C 0.23 SBS5 13 80055708 sim2 G A 0.13 SBS1 13 80405259 sim2 G A 0.13 SBS5 13 82675485 sim2 AA A 0.33 DEL 13 84483756 sim2 C T 0.13 SBS5 13 84940388 sim2 CT C 0.25 DEL 13 88498234 sim2 C T 0.14 SBS1 13 89696342 sim2 G A 0.15 SBS5 13 105233496 sim2 C A 0.23 SBS5 14 32945709 sim2 A C 0.11 SBS5 14 41028575 sim2 A T 0.41 SBS5 14 41351993 sim2 C A 0.19 SBS5 14 47062401 sim2 G A 0.35 SBS1 14 58832988 sim2 A T 0.95 SBS5 14 71112436 sim2 C T 0.17 SBS1 14 71396363 sim2 A C 0.35 SBS5 14 71461814 sim2 T C 0.43 SBS5 14 73116108 sim2 T C 0.25 SBS5 14 87759005 sim2 G A 0.43 SBS5 14 96551352 sim2 C A 0.37 SBS5 14 100836165 sim2 G A 0.11 SBS5 15 24502965 sim2 A G 0.52 SBS5 15 29907650 sim2 G A 0.39 SBS1 15 46544763 sim2 G A 0.2 SBS1 15 52177098 sim2 T C 0.32 SBS5 15 54136052 sim2 C T 0.27 SBS5 15 61584675 sim2 C T 0.05 SBS1 15 98202018 sim2 T C 0.21 SBS5 15 99523665 sim2 ATCTAATGAAATGACTACAT A 0.21 DEL 16 4855588 sim2 C T 0.24 SBS1 16 20244669 sim2 G A 0.45 SBS5 16 24434493 sim2 G A 0.18 SBS1 16 27008456 sim2 G A 0.24 SBS5 16 33995380 sim2 A G 0.17 SBS5 16 34276062 sim2 T C 0.19 SBS5 16 62374224 sim2 C T 0.29 SBS1 16 69772580 sim2 G A 0.48 SBS1 16 84740183 sim2 G T 0.08 SBS5 16 86314352 sim2 G A 0.05 SBS1 16 89154457 sim2 C T 0.14 SBS5 17 8487922 sim2 T G 0.33 SBS5 17 8886671 sim2 C T 0.49 SBS5 17 12628245 sim2 T A 0.44 SBS5 17 27674583 sim2 A G 0.09 SBS5 17 42203063 sim2 C A 0.11 SBS5 17 53170099 sim2 A G 0.4 SBS5 17 65853558 sim2 G C 0.31 SBS5 17 79053213 sim2 G A 0.19 SBS1 18 22853703 sim2 T G 0.13 SBS5 18 25451065 sim2 C T 0.48 SBS1 18 35802440 sim2 G A 0.26 SBS1 18 36189423 sim2 G A 0.1 SBS5 18 36647116 sim2 A T 0.18 SBS5 18 40066457 sim2 C G 0.15 SBS5 18 45284114 sim2 C T 0.17 SBS1 18 46167292 sim2 C T 0.39 SBS1 18 46338990 sim2 T C 0.97 SBS5 18 54072538 sim2 A T 0.35 SBS5 18 62679479 sim2 C T 0.16 SBS5 18 66126665 sim2 G A 0.16 SBS1 19 6318395 sim2 G A 0.44 SBS1 19 19080652 sim2 G A 0.3 SBS1 19 19240780 sim2 G A 0.15 SBS5 19 21579130 sim2 A C 0.24 SBS5 19 37272649 sim2 T A 0.27 SBS1 19 37304273 sim2 G C 0.23 SBS5 19 37600204 sim2 C T 0.11 SBS1 19 43595791 sim2 A C 0.1 SBS5 19 45515729 sim2 C A 0.06 SBS1 19 55213446 sim2 C A 0.36 SBS5 19 55250004 sim2 C A 0.26 SBS5 20 14771252 sim2 G A 0.35 SBS5 20 35979349 sim2 G A 0.17 SBS5 20 38801197 sim2 G A 0.1 SBS1 20 46339258 sim2 C A 0.18 SBS5 20 54411485 sim2 G A 0.82 SBS5 20 57273915 sim2 G T 0.21 SBS5 21 19174397 sim2 T A 0.35 SBS5 21 19183634 sim2 G A 0.25 SBS5 21 20810928 sim2 T A 0.02 SBS5 21 21883964 sim2 C A 0.27 SBS5 21 24170518 sim2 G T 0.26 SBS5 21 29135454 sim2 TT T 0.31 DEL 21 33708765 sim2 G A 0.24 SBS5 21 46179988 sim2 G A 0.1 SBS5 22 18924126 sim2 G A 0.3 SBS5 22 25812384 sim2 T C 0.12 SBS5 22 30903803 sim2 A G 0.43 SBS5 22 31790952 sim2 G A 0.07 SBS1 22 32676065 sim2 C T 0.21 SBS1 22 34891182 sim2 C T 0.12 SBS5 22 35344571 sim2 C T 0.32 SBS1 X 1831621 sim2 G A 0.22 SBS5 X 2497525 sim2 C T 0.72 SBS5 X 4992395 sim2 TT T 0.13 DEL X 8724468 sim2 A G 0.13 SBS5 X 13685379 sim2 G C 0.06 SBS5 X 14379805 sim2 A G 0.19 SBS5 X 15753716 sim2 G T 0.42 SBS1 X 17182519 sim2 A G 0.15 SBS5 X 18666957 sim2 C G 0.34 SBS5 X 35703092 sim2 T G 0.29 SBS5 X 38020022 sim2 C T 0.08 SBS5 X 50411867 sim2 G T 0.09 SBS5 X 61694798 sim2 G A 0.06 SBS5 X 67239779 sim2 G T 0.16 SBS5 X 69962020 sim2 A C 0.21 SBS5 X 79599189 sim2 G A 0.37 SBS1 X 81799033 sim2 C G 0.1 SBS5 X 82322401 sim2 T C 0.35 SBS5 X 82415645 sim2 G T 0.38 SBS1 X 86231400 sim2 C T 0.22 SBS5 X 92886385 sim2 G A 0.14 SBS5 X 96201718 sim2 T C 0.3 SBS5 X 96678521 sim2 C A 0.16 SBS5 X 97479796 sim2 G A 0.21 SBS1 X 97969286 sim2 C T 0.33 SBS5 X 99414125 sim2 T C 0.14 SBS5 X 103624655 sim2 C T 0.37 SBS1 X 107508525 sim2 A G 0.24 SBS5 X 108509705 sim2 T A 0.01 SBS5 X 110958227 sim2 T C 0.14 SBS5 X 115130422 sim2 C T 0.16 SBS5 X 122764358 sim2 G C 0.18 SBS5 X 126856353 sim2 G T 0.06 SBS5 X 127390100 sim2 G A 0.12 SBS5 X 128114598 sim2 A G 0.16 SBS5 X 130447868 sim2 A G 0.21 SBS5 X 133431276 sim2 T C 0.38 SBS5 X 137451889 sim2 T G 0.09 SBS5 X 138686280 sim2 G A 0.38 SBS1 X 142880288 sim2 A G 0.27 SBS5 X 143160832 sim2 AT A 0.27 DEL X 144124017 sim2 C T 0.28 SBS5 X 149755142 sim2 T C 0.16 SBS5 X 150742591 sim2 G T 0.22 SBS5 X 151251582 sim2 C T 0.08 SBS1 X 151464918 sim2 A G 0.45 SBS5 Y 9536396 sim2 C T 0.09 SBS5 Y 15639608 sim2 C A 0.82 SBS5