##fileformat=VCFv4.2 #CHROM POS ID REF ALT VAF MUT 1 34122820 sim52 TT T 0.17 DEL 1 93175904 sim52 C T 0.38 SBS1 1 94859345 sim52 A G 0.42 SBS5 1 95337522 sim52 G A 0.1 SBS1 1 105854670 sim52 T C 0.31 SBS5 1 114197612 sim52 T C 0.28 SBS5 1 119858911 sim52 G A 0.2 SBS5 1 186144261 sim52 T C 0.26 SBS5 1 190487902 sim52 C T 0.14 SBS5 1 221651826 sim52 C G 0.24 SBS5 2 42244492 sim52 C T 0.07 SBS1 2 77513670 sim52 A C 0.25 SBS5 2 121842445 sim52 G A 0.17 SBS1 2 146207861 sim52 T C 0.25 SBS5 2 158159619 sim52 G T 0.09 SBS5 2 176069692 sim52 G A 0.23 SBS5 2 177240426 sim52 ATAT A 0.1 DEL 2 183030373 sim52 C T 0.2 SBS5 2 187988975 sim52 A T 0.09 SBS5 2 194458174 sim52 C T 0.1 SBS1 2 198026041 sim52 C T 0.15 SBS1 2 218559992 sim52 G T 0.13 SBS5 3 30887116 sim52 A C 0.33 SBS5 3 43090716 sim52 T G 0.36 SBS5 3 63106950 sim52 A G 0.23 SBS5 3 67815825 sim52 G A 0.13 SBS5 3 74909649 sim52 C T 0.1 SBS5 3 80439284 sim52 C T 0.24 SBS5 3 95965714 sim52 T G 0.46 SBS5 3 96303302 sim52 G C 0.11 SBS5 3 103684863 sim52 C T 0.39 SBS1 3 144456043 sim52 G C 0.12 SBS5 3 149759338 sim52 G C 0.34 SBS5 3 163348221 sim52 C T 0.29 SBS5 3 167282912 sim52 GA G 0.31 DEL 3 177069151 sim52 T A 0.01 SBS5 3 178910773 sim52 A C 0.4 SBS5 3 189413867 sim52 G C 0.41 SBS5 3 193271259 sim52 AAG A 0.22 DEL 3 193378972 sim52 T C 0.13 SBS5 4 45384554 sim52 T A 0.26 SBS5 4 46857258 sim52 G T 0.08 SBS5 4 59532957 sim52 G C 0.11 SBS5 4 94062984 sim52 A G 0.05 SBS5 4 97343374 sim52 C CCATTATCAG 0.34 INS 4 117543008 sim52 C T 0.31 SBS1 4 128784955 sim52 T A 0.07 SBS5 4 129484912 sim52 C T 0.08 SBS1 4 134653516 sim52 G A 0.09 SBS5 4 143197082 sim52 T C 0.32 SBS5 4 162146278 sim52 A G 0.09 SBS5 4 173805826 sim52 G C 0.44 SBS5 5 5650433 sim52 G A 0.32 SBS1 5 12873666 sim52 G A 0.2 SBS1 5 28413717 sim52 G T 0.34 SBS5 5 54960153 sim52 A G 0.31 SBS5 5 55397116 sim52 A AA 0.33 INS 5 67537280 sim52 TTA T 0.6 DEL 5 67684505 sim52 A C 0.41 SBS5 5 88558093 sim52 C T 0.11 SBS5 5 105121351 sim52 C G 0.1 SBS5 5 147340085 sim52 C T 0.09 SBS1 5 151269205 sim52 G A 0.25 SBS1 5 164001367 sim52 G A 0.46 SBS1 6 11086571 sim52 T TA 0.09 INS 6 47787010 sim52 G A 0.1 SBS5 6 57490525 sim52 T C 0.1 SBS1 6 66481418 sim52 TCCA T 0.07 DEL 6 79028607 sim52 G A 0.12 SBS5 6 121976710 sim52 G T 0.28 SBS5 6 131346936 sim52 AA A 0.16 DEL 6 139374488 sim52 G A 0.11 SBS5 6 145458022 sim52 C T 0.12 SBS5 6 146346169 sim52 G T 0.06 SBS5 6 156264850 sim52 A G 0.3 SBS5 6 158156413 sim52 G A 0.34 SBS5 7 21891960 sim52 C T 0.18 SBS1 7 38298186 sim52 A G 0.08 SBS5 7 62616614 sim52 GT G 0.21 DEL 7 63705369 sim52 T C 0.25 SBS5 7 77707289 sim52 G A 0.33 SBS1 7 85528250 sim52 A G 0.54 SBS5 7 92754076 sim52 C T 0.42 SBS5 7 96835455 sim52 C T 0.08 SBS5 7 121674596 sim52 A G 0.31 SBS5 7 126023144 sim52 G A 0.47 SBS1 7 131838208 sim52 A C 0.11 SBS5 7 140668106 sim52 AA A 0.17 DEL 7 142772740 sim52 A T 0.32 SBS5 7 154542550 sim52 G A 0.33 SBS5 8 19965645 sim52 G A 0.14 SBS5 8 27593976 sim52 G T 0.23 SBS5 8 41825758 sim52 A G 0.22 SBS5 8 52237868 sim52 A G 0.28 SBS5 8 55798736 sim52 C T 0.36 SBS1 8 71456358 sim52 A G 0.1 SBS5 8 72550216 sim52 A T 0.04 SBS5 8 93017699 sim52 C T 0.37 SBS1 9 5718705 sim52 A G 0.1 SBS5 9 23482006 sim52 G A 0.13 SBS1 9 24422003 sim52 G A 0.31 SBS1 9 26315386 sim52 C T 0.48 SBS5 9 77279177 sim52 C T 0.06 SBS5 9 81217346 sim52 T G 0.17 SBS5 9 85013463 sim52 A G 0.13 SBS5 9 105147976 sim52 G A 0.07 SBS1 9 119331824 sim52 G A 0.06 SBS5 9 135515376 sim52 C G 0.12 SBS5 10 3465827 sim52 G GA 0.45 INS 10 3990087 sim52 C T 0.22 SBS1 10 16493635 sim52 C T 0.35 SBS1 10 117191417 sim52 A G 0.52 SBS5 10 121478448 sim52 T C 0.36 SBS1 11 5026978 sim52 ATGGTAGGTTTTGTTATAAGGTAGTGTGA A 0.26 DEL 11 37609467 sim52 G A 0.33 SBS1 11 45074542 sim52 C T 0.32 SBS1 11 55261898 sim52 C T 0.21 SBS1 11 70986340 sim52 C T 0.11 SBS1 11 84933481 sim52 C T 0.36 SBS5 11 91197787 sim52 T G 0.07 SBS5 11 100029408 sim52 C T 0.45 SBS1 11 125450706 sim52 C T 0.37 SBS5 11 128063432 sim52 T G 0.55 SBS5 12 11700151 sim52 G A 0.6 SBS1 12 21255683 sim52 C T 0.07 SBS1 12 45588768 sim52 A G 0.47 SBS5 12 62460157 sim52 C T 0.33 SBS1 12 64269533 sim52 C T 0.07 SBS5 12 83851396 sim52 C T 0.26 SBS5 12 133814898 sim52 G A 0.05 SBS1 13 69901719 sim52 C T 0.16 SBS1 13 81081380 sim52 T A 0.15 SBS5 14 28844938 sim52 G A 0.29 SBS5 14 46976204 sim52 C T 0.31 SBS1 14 63956712 sim52 A G 0.08 SBS5 14 74443259 sim52 G A 0.11 SBS5 15 26114300 sim52 C T 0.04 SBS1 15 34633271 sim52 C T 0.47 SBS1 15 47836767 sim52 G A 0.12 SBS5 15 67684620 sim52 G A 0.31 SBS1 15 68446126 sim52 T C 0.12 SBS5 15 72253817 sim52 A C 0.06 SBS5 15 83536783 sim52 C T 0.37 SBS5 15 92686900 sim52 AA A 0.1 DEL 16 5840395 sim52 G A 0.09 SBS1 16 25742552 sim52 C A 0.38 SBS5 16 28293983 sim52 C A 0.07 SBS5 16 53517405 sim52 G A 0.39 SBS1 16 84170041 sim52 T C 0.15 SBS5 16 86249996 sim52 C T 0.26 SBS1 17 8213211 sim52 G A 0.82 SBS1 17 45232954 sim52 T C 0.1 SBS5 17 58852905 sim52 T C 0.1 SBS5 17 74141708 sim52 C T 0.19 SBS1 18 68151552 sim52 C T 0.09 SBS1 19 2244821 sim52 C T 0.1 SBS1 19 15631251 sim52 TTT T 0.05 DEL 19 41496455 sim52 G A 0.18 SBS1 19 55053251 sim52 G T 0.08 SBS5 21 20673989 sim52 A G 0.32 SBS5 21 29361408 sim52 G A 0.2 SBS5 X 5224347 sim52 T C 0.2 SBS5 X 8415683 sim52 TT T 0.37 DEL X 71964224 sim52 A G 0.34 SBS5 X 95989670 sim52 G C 0.17 SBS5 X 109855153 sim52 C T 0.11 SBS5 X 115979383 sim52 AATGTTCCTGAGATACTAA A 0.16 DEL X 126977469 sim52 G A 0.14 SBS5 X 138926020 sim52 C A 0.12 SBS5 X 144240081 sim52 T C 0.09 SBS5 Y 16536070 sim52 C T 0.27 SBS5 Y 18672192 sim52 G A 0.12 SBS5 Y 19438309 sim52 C T 0.23 SBS1