diff --git "a/data/ChopChop/ChopChop_Nickase_NRG.csv" "b/data/ChopChop/ChopChop_Nickase_NRG.csv" new file mode 100755--- /dev/null +++ "b/data/ChopChop/ChopChop_Nickase_NRG.csv" @@ -0,0 +1,1249 @@ +snp_id Rank Target sequence Genomic location Cluster Off-target pairs Off-targets MM0 Off-targets MM1 Off-targets MM2 Off-targets MM3 Restriction sites Best ID +rs147288664 1 CTGACCATAGCTGGAAGACTGAC*GTGAGCTGGAGCCATGTTGGCCAGA*GCTTGATGCCTGCCCTGACGTAG chr1:152220423 3 1 1/0 1/1 12/1 15/16 EaeI:19;MscI:21;MwoI:18;BglI:18;NlaIV:11 1 +rs147288664 2 AGGCAGACTCATGCTGACCATAG*CTGGAAGACTGACGTGAGCTGGAG*CCATGTTGGCCAGAGCTTGATGC chr1:152220410 1 0 1/0 1/0 15/4 35/27 BmgBI:14;BbsI:12;MboII:17 2 +rs147288664 3 AGACTCATGCTGACCATAGCTGG*AAGACTGACGTGAGCTGGAG*CCATGTTGGCCAGAGCTTGATGC chr1:152220414 2 0 1/0 8/0 7/4 47/27 BmgBI:10 3 +rs12726330 1 CTAGGAAGGGGACTGACCGGGAC*ATGGAAGAGGTCTGGACCAG*GGTACTGGGAAGGCGCTCGGAGG chr1:155135649 1 0 0/0 0/0 0/1 15/18 Hpy188III:13;AvaII:15;MboII:17;Sau96I:15 1 +rs12726330 2 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