Datasets:

NCube

/

papyrus

like 0

Inclure les personnes concernées dans la production du savoir sur les personnes LGBTQ+ migrantes à travers la recherche communautaire : limites structurelles, défis méthodologiques et pistes de réflexion

Bien qu’il y ait un intérêt grandissant dans la recherche en sciences sociales sur la réalité des personnes migrantes marginalisées, telle que celles appartenant à la population LGBTQ+, on dispose de très peu d’études dans la littérature québécoise sur les meilleures stratégies d’implication des personnes concernées dans la construction des savoirs. Cet article vise à contribuer à la diffusion de la connaissance empirique et autoréflexive sur l’inclusion des personnes LGBTQ+ migrantes dans les espaces de délibération et de co-construction des savoirs. Pour ce faire, plusieurs pistes sont proposées pour dépasser les limites systémiques ainsi que résoudre les défis méthodologiques et éthiques liés à l’inclusion des personnes LGBTQ+ migrantes au sein des espaces de réflexion et de construction des connaissances autour des enjeux qui les concernent directement. D’un point de vue empirique, notre démarche s’appuie sur l’autoreflexivité de différents acteurs et actrices concernés (membres soutenus, membres du conseil d’administration, membres de l’équipe de soutien et employés) dans une recherche communautaire menée en collaboration avec l’organisme communautaire AGIR (Action LGBTQ avec les immigrant.e.s et les réfugié.e.s).

fr

The impact of outdoor walking surfaces on lower-limb coordination and variability during gait in healthy adults

Background Inter-joint coordination and variability during gait provide insight into control and adaptability of the neuromuscular system. To date, coordination research has been restricted to laboratory settings, and it is unclear how these findings translate to real-world, outdoor walking environments. Research Question Compared to flat walking, to what extent do outdoor surfaces impact lower-limb inter-joint coordination and variability during gait, in healthy adults? Methods Data from inertial measurement units placed on the lower-back, thigh, and shank were extracted from thirty healthy young adults (15 females, 23.5 ± 4.2 years) during outdoor walking on flat (paved sidewalk); irregular (cobblestone, grass); sloped (slope-up, slope-down); and banked (banked-right, banked-left) surfaces. Sagittal joint angles for the right knee and hip were computed and partitioned by gait phase (stance and swing). Continuous Relative Phase analysis determined inter-joint coordination and variability for the knee-hip joint pair using Mean Absolute Relative Phase (MARP) and Deviation Phase (DP), respectively. One-way repeated measures ANOVAs tested surface effects. Post-hoc Bonferroni adjusted surface comparisons were assessed. Results Significant knee-hip surface effects were seen during all gait phases for MARP (p < 0.001) and DP (p ≤ 0.001). Compared to flat walking, grass prompted more in-phase coordination (smaller MARP) during stance and swing phase (p ≤ 0.003). Slope-up caused more in-phase coordination during stance (p < 0.001), while slope-down caused more out-of-phase coordination during stance and swing (p ≤ 0.003), compared to the flat surface. Sloped surfaces prompted more variable (larger DP) knee-hip coordination (p ≤ 0.001), compared to flat walking during stance and swing phase. Significance Compared to flat walking, changes in knee-hip coordination and variability were greatest on slope-up/slope-down surfaces. This could reflect greater changes in lower-limb kinematics on sloped surfaces and/or a neuromuscular response to the demands of a more challenging task.

en

Le fait numérique comme « conjonctures médiatrices »

Après avoir défini la notion de conjonctures médiatrices en explicitant ses relations avec d'autres concepts issus de la tradition intermédiale (médiation, média, séries culturelles), je montrerai les enjeux ontologiques liés à cette idée. Je vais me pencher en particulier sur le cas du fait numérique en essayant de proposer une ontologie paradoxale, une ontologie sans essence, qui saisisse les spécificités d'un phénomène médiatique sans pour autant l'essentialiser en un « média ».

fr

Des délits et des hommes : portrait des auteurs d’actions indécentes du Québec et caractéristiques associées à la récidive et à la commission de crimes sexuels avec contacts

Le crime d’action indécente a longtemps été défini par la communauté scientifique et administré par la justice davantage comme une nuisance qu’un crime sexuel. Cette situation peut s’expliquer du fait que ce type de délit n’implique pas de contacts sexuels physiques avec la victime et que les conséquences négatives associées à l’agression sur la victime sont souvent minimisées. Ainsi, cette étude s’inscrit dans le cadre d’un stage à la Division des crimes contre la personne de la Sûreté du Québec. Cette recherche a comme application concrète de soutenir le processus de ciblage des récidivistes potentiels en matière d’actions indécentes dans le cadre de dossiers d’enquêtes. Le but est donc de décrire un portrait rétrospectif de la carrière criminelle des 3 572 auteurs présumés ou avérés d’actions indécentes dénoncés au Québec entre 2011 et 2018 Des analyses univariées, bivariées et multivariées ainsi qu’une courbe ROC ont été effectuées sur la population à l’étude. Les résultats de l’étude suggèrent que près de 22% des infracteurs sont récidivistes en matière d’action indécente et que 18% de la population à l’étude ont commis un crime sexuel avec contacts sur une victime. Les deux groupes se sont également avérés être en grande majorité des hommes, plus jeunes en termes d’âge, plus prolifiques et plus diversifiés en termes de variété de catégories de crimes que ceux qui n’ont jamais récidivé ou commis de crime sexuel avec contact. Finalement, les meilleurs prédicteurs se sont avérés être le sexe des infracteurs, la présence d’antécédents de crimes sexuels, de crimes violents et de crimes de la catégorie « Autres infractions criminelles » pouvant être associés à des bris d’ordonnances ou des omissions de se conformer à des engagements de la Cour. Ces individus demeurent toutefois marginaux puisque la grande majorité de la population d’auteurs d’actions indécentes n’a pas commis de récidive ou encore de crime sexuel avec contact sur une victime. The crime of indecent act has long been defined by the scientific community and administered by justice more as a nuisance than a sexual crime. This can be explained by the fact that this type of crime does not involve physical sexual contact with the victim and that the negative consequences associated with the assault on the victim are often minimized. Thus, this study is part of an internship at the Crimes Against the Person Division of the Sûreté du Québec. The concrete application of this research is to support the process of targeting potential recidivists for indecent acts in investigation files. The goal is therefore to describe a retrospective portrait of the criminal careers of the 3,572 alleged or proven perpetrators of indecent acts reported in Quebec between 2011 and 2018. Univariate, bivariate and multivariate analyses and a ROC analysis were performed on the study population. The results of the study suggest that nearly 22% of the offenders are repeat offenders in indecent acts and that 18% of the study population have committed a sexual crime with contact with a victim. Both groups were also found to be overwhelmingly male, younger in terms of age, more prolific, and more diverse in terms of the variety of crime categories than those who had never re-offended or committed a contact sexual crime. Finally, the best predictors were found to be the gender of the offenders, the presence of a history of sexual crimes, violent crimes, and crimes in the "Other Criminal Offences" category that may be associated with breaches of orders or failures to comply with court undertakings. However, these individuals remain marginal since the vast majority of the indecent act offender population has not committed a recidivism or a sexual crime involving contact with a victim.

fr , en

Les émotions et les compétences socioémotionnelles mobilisées par un enseignant d’éducation physique débutant lors de la gestion de classe

La gestion des situations difficiles par les enseignants en classe est l'un des grands défis de l'enseignement. Les situations de conflit peuvent mobiliser des émotions fortes chez eux. Par conséquent, ils sont susceptibles de développer des maladies physiques ou mentales (Carlotto, 2010; Lineback, McCarthy et Reiser, 2015). Certains en viennent à abandonner la profession. En raison du manque d’expérience des enseignants débutants, ils sont plus facilement sujets à l’épuisement professionnel, car leurs premières années d’expériences sont marquées par une phase de choc de la réalité, d’insécurité et de surcharges émotionnelles (Huberman, 1989; Pelletier, 2015). Certains chercheurs ont étudié cette situation en quête de solutions pour aider les enseignants à gérer leurs émotions : les compétences socioémotionnelles (Collaborative for academic social and emotional learning, 2003; Yoder, 2014). Néanmoins, la majorité de ces recherches concernent les enseignants en salle de classe (Corcoran et Tormey, 2012; Zinsser, Deham, Curby et Shewark, 2015) et très peu présentent la situation des enseignants d'éducation physique débutants. Cette étude s’est penchée sur les émotions et les compétences socioémotionnelles d’un enseignant d’éducation physique débutant lors de la gestion de classe où il était interpellé par une situation difficile. Dans le cadre de notre recherche, nous avons choisi l'étude de cas. Cette recherche vise à cerner et décrire les émotions et identifier et comprendre les compétences socioémotionnelles mobilisées par le participant. Notre recherche est donc basée sur le paradigme interprétatif, car elle nous incite à comprendre la perspective du participant (Godoy, 1995). Nous avons constaté qu’il est possible d’acquérir ces compétences, malgré le manque de connaissances théoriques de l’enseignant à ce sujet. En fait, le participant a mobilisé toutes les cinq compétences socioémotionnelles à l’aide de cinq différentes ressources, qui sont : des expériences précédentes, des disciplines universitaires, des formations continues, des échanges avec les collègues de profession et, surtout de la psychothérapie personnelle. The management of difficult situations by teachers in the classroom is one of the greatest challenges in teaching. Conflict situations can mobilize strong emotions for teachers. As a result, they are likely to develop physical or mental illnesses (Carlotto, 2010; Lineback, McCarthy and Reiser, 2015). Some of them may eventually leave the profession. Due to the lack of experience of beginning teachers, they are more easily subject to professional burnout, as their first years of experience are marked by a phase of reality shock, insecurity and emotional overloads (Huberman, 1989; Pelletier, 2015). Some researchers have studied it in search of solutions to help teachers manage their emotions: socioemotional skills (Collaborative for academic social and emotional learning, 2003; Yoder, 2014). However, the majority of this research concerns classroom teachers (Corcoran and Tormey, 2012; Zinsser, Deham, Curby and Shewark, 2015) and very little of this research has focused on beginning teachers in physical education. This study looked at the emotions and socio-emotional skills of a beginning teacher in physical education when managing a classroom in which he was confronted with a difficult situation. For the purposes of our research, we chose the case study. This research aimed to identify and describe the emotions and understand the participant’s mobilized socio-emotional skills. Our research is therefore based on the interpretive paradigm, as it encourages us to understand the participant's perspective (Godoy, 1995). We found that it is possible to acquire these skills, despite the teacher's lack of theoretical knowledge on this subject. In fact, the participant mobilized all five socio-emotional skills using five different resources, which are: previous experiences, academic disciplines, continuing education, exchanges with professional colleagues and, above all, personal psychotherapy.

fr , en

Academic, socioeconomic and interpersonal consequences of cannabis use : a narrative review

This article reviews the literature on the association between cannabis use (CU) and psychosocial functioning, operationalized here as academic achievement, economic prospects, social relationships and quality of life. So far, study results have been inconsistent. To clarify whether CU has an impact on psychosocial functioning, this article mainly reviewed prospective and longitudinal studies published since 2000 and examined whether studies controlled for confounding factors (e.g. socio-demographics, other substance use, psychopathology, social environment). The review suggested that when confounding variables are controlled for, the association between CU and psychosocial outcomes is generally small or non-significant. When significant associations remain, they are for chronic, dependent or early onset CU specifically, suggesting that the frequency of use and age of onset may be necessary elements to detect persistent, however small, psychosocial consequences. These results illustrate the importance of controlling for intra- and inter-individual differences to examine the link between CU and later psychosocial functioning. Results also suggest that policy and prevention efforts should consider targeting the individual and environmental factors (e.g. early academic and cognitive functioning, social disadvantage, family functioning, personality, smoking) that account for much of the association between CU and later psychosocial problems, rather than, or in addition to, CU itself.

en

Factors influencing clinicians’ referral or admission decisions for post-acute stroke or traumatic brain injury rehabilitation : a scoping review

Demand for post-acute stroke and traumatic brain injury (TBI) rehabilitation outweighs resource availability. Every day, clinicians face the challenging task of deciding which patient will benefit or not from rehabilitation. The objectives of this scoping review were to map and compare factors reported by clinicians as influencing referral or admission decisions to post-acute rehabilitation for stroke and TBI patients, to identify most frequently reported factors and those perceived as most influential. We searched four major databases for articles published between 1946 and January 2021. Articles were included if they reported clinicians' perceptions, investigated referral or admission decisions to post-acute rehabilitation, and focused on patients with stroke or TBI. Twenty articles met inclusion criteria. The International Classification of Functioning, Disability and Health framework was used to guide data extraction and summarizing. Patient-related factors most frequently reported by clinicians were age, mental status prior to stroke or TBI, and family support. The two latter were ranked among the most influential by clinicians working with stroke patients, whereas age was ranked of low importance. Organizational factors were reported to influence decisions (particularly the availability of post-acute care services) as well as clinicians' characteristics (eg, knowledge). Moreover, clinicians' prediction of patient outcome ranked among the most important driver of referral or admission decisions by clinicians working with stroke patients. Findings highlight the complex nature of decision-making regarding patient selection for rehabilitation and provide insight on important factors that frontline clinicians need to consider when having to make rapid decisions in high-pressured acute care environments.

en

The Plan S Rights Retention Strategy is an administrative and legal burden, not a sustainable open access solution

The Plan S Rights Retention Strategy (RRS) requires authors who are submitting to subscription journals to inform publishers that the author accepted manuscript (AAM) will be made available under a Creative Commons Attribution (CC BY) licence. The laudable stated aim of the RRS is to achieve immediate open access to research outputs, while preserving journal choice for authors. However, proponents of the RRS overlook the significant administrative and legal burdens that the RRS places on authors and readers. Even though compliance with existing green open access (self-archiving) policies is poor at best, the RRS is likely to rely on authors to successfully execute the CC licensing of their work in the face of publisher resistance. The complexity of copyright law and CC licensing gives many reasons to doubt the legal validity of an RRS licence grant, which creates legal risk for authors and their institutions. The complexity of RRS CC BY licensing also creates legal risk for readers, who may not be able to fully rely on the reuse rights of a CC BY licence on the AAM. However, cOAlition S has released no legal advice that explains why the RRS is valid and legally binding. Publishers of legacy subscription journals have already begun implementing strategies that ensure they can protect their revenue streams. These actions may leave authors having to choose between paying publication fees and complying with their funding agreements. The result is that the RRS increases the complexity of the copyright and licensing landscape in academic publishing, creates legal risk and may not avoid author fees. Unless increased complexity and conflict between authors and publishers drives open access, the RRS is not fit for its stated purpose as an open access strategy.

en

De "skid" à hacker compétent : l’apprentissage social chez les pirates informatiques

La criminalité informatique n’est plus un nouveau phénomène. Toutefois, plusieurs auteurs s’entendent pour dire que le concept de pirate informatique est en constante transformation, ce qui contribue sans doute à la crainte et la fascination que ces derniers continuent de susciter, tant dans la culture populaire, mais aussi chez les chercheurs. En effet, à travers les années, de nombreux chercheurs ont tenté de les comprendre et les étudier, et la validité de la théorie de l’apprentissage sociale a été démontrée à de maintes reprises en lien avec la cyberdéviance. Par contre, aucune de ces études ne s’est basée sur des contacts directs avec pirates informatiques actifs. En fait, aucune ne s’est appuyée sur des entretiens avec des pirates informatiques. Il existe donc une lacune importante dans la littérature scientifique sur ce sujet. Par conséquent, l'objectif de cette étude sera de comprendre comment les pirates informatiques apprennent les compétences essentielles à leurs activités au contact des autres, l’influence de leur entourage dans le monde réel et le monde virtuel, ainsi que le rôle de l’imitation dans ces apprentissages. Pour ce faire, des entretiens semi-dirigés ont été menés avec 17 pirates informatiques encore actifs, recrutés sur des forums de discussion dédiés aux activités de piratage informatique. L’analyse de ces entretiens a permis de dégager de grandes tendances en ce qui a trait au rôle joué par les pairs au sein de communautés de pirates informatiques, au niveau du partage de connaissances, à la façon dont ces connaissances sont transmises, l'importance de se retrouver en communauté, ainsi que le rôle des mentors dans leur processus d’apprentissage. La théorie de l'apprentissage social d’Akers a servi de cadre théorique pour la réalisation de cette étude. Computer crime is no longer a new phenomenon. However, several authors agree to say that the concept of hacker is in constant transformation, which undoubtedly contributes to the fear and the fascination that they continue to exert, both in popular culture, but also among researchers. Indeed, over the years many researchers have attempted to understand and study them, and the validity of social learning theory has been demonstrated time and time again in connection with cyberdeviance. However, none of these studies were not based on direct contact with active hackers. As a matter of fact, none were based on interviews with hackers. Therefore, there is an important gap in the scientific literature on this subject. Hence, the objective of this study will be to understand how hackers learn the skills essential to their activities in contact with others, the influence of those around them in the real and virtual world, as well as the role of imitation in these learnings. To do this, semi-structured interviews were conducted with 17 active hackers, recruited on discussion forums dedicated to hacking activities. The analysis of these interviews made it possible to identify major trends in terms of the role played by peers within hacker communities, in terms of knowledge sharing, the way in which this knowledge is transmitted, the importance of the community, as well as the role of mentors in their learning process. Akers’s social learning theory served as the theoretical framework for this study.

fr , en

Mécanismes d'entraide en ligne des victimes de fraude amoureuse

Le développement de nouvelles technologies de communication se conjugue avec l’essor des crimes facilités au moyen d’Internet. Partie intégrante des sociétés occidentales, le cybermonde simplifie la vie et le travail des particuliers et des entreprises. Toutefois, cet outil comporte un lot de risques, particulièrement en matière de fraudes et d’arnaques. La présente recherche fait part de cet oxymore en s’intéressant à la façon dont les victimes d’escroqueries sentimentales utilisent le cybermonde afin de s’entraider à la suite d’une expérience frauduleuse commise dans le monde virtuel. Pour ce faire, nous avons analysé trois forums de discussion en ligne destinés aux victimes de fraude amoureuse afin d’établir les mécanismes d’entraide utilisés par ces dernières pour faire suite à leur expérience. En outre, nous avons extrait une portion d’informations identifiantes disponibles à travers ces forums de façon à révéler ce qu’elles comportent en termes de traces numériques. Les résultats indiquent entre autres qu’une importante proportion de victimes utilisent ces forums pour raconter leur récit, trouver du soutien et recevoir des conseils, mais aussi pour accompagner d’autres victimes potentielles ayant un doute sur la relation qu’elles entretiennent en ligne. De plus, ces plateformes servent de moyen de lutte afin d’exposer et de lutter contre les cybercriminels, puisqu’elles sont en partie destinées au partage d’informations identifiantes, de photographies et de modes opératoires liés aux arnaqueurs sentimentaux. Les victimes se servent également des forums de discussion afin de sensibiliser et d’informer les internautes généraux quant aux stratagèmes utilisés par les fraudeurs et de fournir les noms des institutions et organismes à contacter s’ils sont un jour ou l’autre confrontés à une possible arnaque amoureuse. Cette étude met en exergue la pertinence de combiner la criminalistique et la criminologie afin d’aborder des phénomènes cybercriminels et l’importance de s’attarder au caractère transfrontalier des fraudes amoureuses afin de mieux les prévenir et de mieux les contrer. The development of new communication technologies is combined with the rise of crime facilitated by the Internet. As an integral part of Western societies, the cyberworld simplifies the life and work of individuals and businesses. However, this tool carries a lot of risks, especially in terms of frauds and scams. This research addresses this oxymoron by looking at how victims of sentimental scams use the cyberworld to help each other after a fraudulent experience has been committed in the virtual space. To this end, we analyzed three online discussion forums intended for victims of romance fraud in order to establish the self-help mechanisms used by the latter to follow up on their experience. In addition, we extracted a portion of the identifying information available through these forums in order to reveal what they contain in terms of digital traces. The results show, among other things, that a significant proportion of victims use these forums to tell their story, to find support and advice, and to accompany other potential victims who are unsure about their online relationship. In addition, these platforms serve as a means to expose and combat cybercriminals, as they are partly intended for sharing identifying information, photographs and modus operandi related to romance scammers. Victims also use chat rooms to educate and inform general Internet users about the schemes used by fraudsters, and the institutions and organizations to contact if they are ever confronted with a possible romance scam. This study highlights the relevance of combining forensic sciences and criminology in order to address cybercriminal phenomena as well as the importance of focusing on the cross-border nature of romance frauds in order to better prevent and counter them.

fr , en

Connected speech markers of amyloid burden in primary progressive aphasia

INTRODUCTION Positron emission tomography (PET) amyloid imaging has become an important part of the diagnostic workup for patients with primary progressive aphasia (PPA) and uncertain underlying pathology. Here, we employ a semi-automated analysis of connected speech (CS) with a twofold objective. First, to determine if quantitative CS features can help select primary progressive aphasia (PPA) patients with a higher probability of a positive PET amyloid imaging result. Second, to examine the relevant group differences from a clinical perspective. METHODS 117 CS samples from a well-characterised cohort of PPA patients who underwent PET amyloid imaging were collected. Expert consensus established PET amyloid status for each patient, and 40% of the sample was amyloid positive. RESULTS Leave-one-out cross-validation yields 77% classification accuracy (sensitivity: 74%, specificity: 79%). DISCUSSION Our results confirm the potential of CS analysis as a screening tool. Discriminant CS features from lexical, syntactic, pragmatic, and semantic domains are discussed.

en

The role of point-of-care ultrasound monitoring in cardiac surgical patients with acute kidney injury

The approach to the patient with acute kidney injury (AKI) after cardiac surgery involves multiple aspects. These include the rapid recognition of reversible causes, the accurate identification of patients who will progress to severe stages of AKI and the subsequent management of complications resulting from severe renal dysfunction. Unfortunately, the inherent limitations of physical examination and laboratory parameters results are often responsible for a sub-optimal clinical management. In this review article, we explore how Point-Of-Care ultrasound, including renal and extra-renal ultrasound, can be used to complement all aspects of the care of cardiac surgery patients with AKI, from the initial approach of early AKI to fluid balance management during renal replacement therapy. The current evidence is reviewed including knowledge gaps and future areas of research.

en

High postoperative portal venous flow pulsatility indicates right ventricular dysfunction and predicts complications in cardiac surgery patients

Background Right ventricular failure after cardiac surgery is associated with morbidity and mortality. Right ventricular dysfunction results in hepatic venous congestion, which impacts the portal circulation. We aimed to determine whether an increased portal flow pulsatility fraction was associated with right ventricular dysfunction in cardiac surgery patients. We also aimed to describe the haemodynamic factors and postoperative complications associated with an increased portal pulsatility in this setting. Methods We conducted a prospective single-centre cohort study, recruiting adults undergoing cardiac surgery. Portal flow was assessed before, during, and after surgery by Doppler ultrasound. A detailed haemodynamic and echocardiographic assessment was performed at the same time points. Results A total of 115 patients were included. Both systolic and diastolic right ventricular dysfunction were associated with a higher portal pulsatility fraction (P=0.008 and <0.001, respectively). A positive association was present between portal pulsatility fraction and measurements representative of venous pressure (central venous pressure, inferior vena cava diameter). A post-procedural portal pulsatility fraction ≥50% measured in the operating room was present in 21 (18.3%) patients and was associated with an increased risk of major complications (odds ratio=5.83, confidence interval, 2.04–16.68, P=0.001). The addition of portal flow assessment to a predictive model including EuroSCORE II and systolic right ventricular dysfunction improved prediction of postoperative complications. Conclusions High portal flow pulsatility fraction is associated with right ventricular dysfunction, signs of venous congestion and decreased perfusion, and an increased risk of major complications. Portal vein Doppler ultrasound appears to be promising for risk assessment in the perioperative period.

en

Les Chambres extraordinaires au sein des tribunaux cambodgiens : réussites, défis et limites

Les Chambres extraordinaires au sein des tribunaux cambodgiens (CETC) ont été mises en oeuvre en 2005, environ 30 ans après la fin du régime Khmer Rouge. Ce tribunal hybride fut le résultat de longues négociations entre le Gouvernement cambodgien et l’ONU. Les tribunaux hybrides ont récemment pris de l’importance comme l’un des développements politiques les plus importants en matière de justice transitionnelle. Cependant, l’impact de ces tribunaux sur les sociétés qui ont subits des violences de masse n’est pas tout à fait clair et peu de textes actuels ont été publiés sur le sujet. Par conséquent, notre étude de cas vise à accroître les connaissances sur le fonctionnement des CETC, sur les défis que le tribunal a rencontrés, sur ses avantages, ainsi que ses limites. Pour ce faire, des entretiens semi-dirigés avec des acteurs des CETC et de DC- Cam ont été réalisés. En explorant la perception des participants concernant l’atteinte des objectifs du tribunal, il a été possible d’analyser la portée du rôle du tribunal. La présente étude s’est concentrée sur les difficultés liées à l’ingérence politique, qui s’avère être une des causes des blocages judiciaires dans les dossiers 003 et 004. Il est également ressorti des entretiens que l’équilibre entre la paix et la justice est un enjeu important. Juger davantage d’anciens soldats khmers rouges pourrait avoir comme conséquence d’engendrer de nouveaux conflits sociaux. Par ailleurs, ne pas mener à terme les dossiers 003 et 004 pourrait, selon certains de nos interviewés, nuire à l’héritage du tribunal pour le renforcement de l’État de droit. De plus, l’objectif de réconciliation nationale, qui passe par la recherche de la vérité et un travail de mémoire est une limite importante des CETC. Heureusement, des mécanismes de justice transitionnelle tels que les projets d’éducation et de mémoire réalisés par DC-Cam permettent de combler cette limite. Finalement, cette étude démontre que l’influence du tribunal sur les cours nationales pour le renforcement d’une justice équitable est freinée par le manque d’intérêt de la part du gouvernement d’apporter une réelle réforme judiciaire.

fr

Electronic absorption spectroscopy

Absorption spectroscopy in the ultraviolet, visible and near-infrared (UV-VIS-NIR) wavelength ranges is one of the oldest and most often used characterization methods in coordination chemistry. This overview illustrates examples ranging from four-coordinate and six-coordinate complexes of d-block elements to modern lanthanide complexes.

en

Resiniferatoxin hampers the nocifensive response of Caenorhabditis elegans to noxious heat, and pathway analysis revealed that the Wnt signaling pathway is involved

Resiniferatoxin (RTX) is a metabolite extracted from Euphorbia resinifera. RTX is a potent capsaicin analog with specific biological activities resulting from its agonist activity with the transient receptor potential channel vanilloid subfamily member 1 (TRPV1). RTX has been examined as a pain reliever, and more recently, investigated for its ability to desensitize cardiac sensory fibers expressing TRPV1 to improve chronic heart failure (CHF) outcomes using validated animal models. Caenorhabditis elegans (C. elegans) expresses orthologs of vanilloid receptors activated by capsaicin, producing antinociceptive effects. Thus, we used C. elegans to characterize the antinociceptive properties and performed proteomic profiling to uncover specific signaling networks. After exposure to RTX, wild-type (N2) and mutant C. elegans were placed on petri dishes divided into quadrants for heat stimulation. The thermal avoidance index was used to phenotype each tested C. elegans experimental group. The data revealed for the first time that RTX can hamper the nocifensive response of C. elegans to noxious heat (32 – 35 °C). The effect was reversed 6 h after RTX exposure. Additionally, we identified the RTX target, the C. elegans transient receptor potential channel OCR-3. The proteomics and pathway enrichment analysis results suggest that Wnt signaling is triggered by the agonistic effects of RTX on C. elegans vanilloid receptors.

en

Informatisation incrémentale ou de rupture? : le cas du dossier patient hospitalier

Au niveau international, l’informatisation de la production des soins hospitaliers ne se développe que lentement. Un terme souvent utilisé dans la littérature pour expliquer ce phénomène est celui des "facteurs organisationnels", mais sans, la plupart du temps, que ce terme soit précisé. L’article, à partir d’une recherche observationnelle multi-sites, analyse sur le cas français les évolutions organisationnelles des unités cliniques consécutives à l’implantation d’un Dossier Patient Informatisé (DPI). Il montre que le système en place n’a subi que peu de transformations, au prix d’accommodements avec l’outil informatique. Une telle situation peut paraitre satisfaisante aux yeux des tutelles qui promeuvent l’innovation technologique, mais pose la question de la création de valeur organisationnelle, c’est-à-dire la possibilité pour les professionnels de soins de se saisir de l’outil dans une optique de transformation et d’amélioration à terme des différentes composantes de la performance. At the international level, the computerization of hospital care production develops only slowly. Past research has often used the term "organizational factors" to explain this phenomenon, but without specification so far. This article builds on results from an empirical research led in multiple French hospitals to investigate the organizational evolutions of clinical units due to the implementation of an Electronic Patient Record. It shows that the extant organizational system underwent only few transformations, thanks to local adjustments with the IT tool. Such a situation may be satisfactory for the eyes of the supervising structures which promote the technological innovation, but raises the issue of true organizational value creation.

fr , en

Improving reproducibility in machine learning research : a report from the NeurIPS 2019 reproducibility program

One of the challenges in machine learning research is to ensure that presented and published results are sound and reliable. Reproducibility, that is obtaining similar results as presented in a paper or talk, using the same code and data (when available), is a necessary step to verify the reliability of research findings. Reproducibility is also an important step to promote open and accessible research, thereby allowing the scientific community to quickly integrate new findings and convert ideas to practice. Reproducibility also promotes the use of robust experimental workflows, which potentially reduce unintentional errors. In 2019, the Neural Information Processing Systems (NeurIPS) conference, the premier international conference for research in machine learning, introduced a reproducibility program, designed to improve the standards across the community for how we conduct, communicate, and evaluate machine learning research. The program contained three components: a code submission policy, a community-wide reproducibility challenge, and the inclusion of the Machine Learning Reproducibility checklist as part of the paper submission process. In this paper, we describe each of these components, how it was deployed, as well as what we were able to learn from this initiative.

en

Mapping the biomedical sciences using Medical Subject Headings : a comparison between MeSH coassignments and MeSH citation pairs

Objective: This study compares two maps of biomedical sciences using Medical Subject Headings (MeSH) term coassignments versus MeSH terms of citing/cited articles and reveals similarities and differences between the two approaches. Methods: MeSH terms assigned to 397,475 journal articles published in 2015, as well as their 4,632,992 cited references, were retrieved from Web of Science and MEDLINE databases, respectively, which formed over 7 million MeSH co-assignments and nearly 18 million direct citation pairs. We generated six network visualizations of biomedical science at three levels using Gephi software based on these MeSH co-assignments and citation pairs. Results: The MeSH co-assignment map contained more nodes and edges, as MeSH co-assignments cover all medical topics discussed in articles. By contrast, the MeSH citation map contained fewer but larger nodes and wider edges, as citation links indicate connections to two similar medical topics. Conclusion: These two types of maps emphasize different aspects of biomedical sciences, with MeSH co-assignment maps focusing on the relationship between topics in different categories and MeSH direct citation maps providing insights into relationships between topics in the same or similar category.

en

Investigating the division of scientific labor using the Contributor Roles Taxonomy (CRediT)

Contributorship statements were introduced by scholarly journals in the late 1990s to provide more details on the specific contributions made by authors to research papers. After more than a decade of idiosyncratic taxonomies by journals, a partnership between medical journals and standards organizations has led to the establishment, in 2015, of the Contributor Roles Taxonomy (CRediT), which provides a standardized set of 14 research contributions. Using the data from Public Library of Science (PLOS) journals over the 2017–2018 period (N = 30,054 papers), this paper analyzes how research contributions are divided across research teams, focusing on the association between division of labor and number of authors, and authors’ position and specific contributions. It also assesses whether some contributions are more likely to be performed in conjunction with others and examines how the new taxonomy provides greater insight into the gendered nature of labor division. The paper concludes with a discussion of results with respect to current issues in research evaluation, science policy, and responsible research practices.

en

Textual analysis of artificial intelligence manuscripts reveals features associated with peer review outcome

We analyzed a data set of scientific manuscripts that were submitted to various conferences in artificial intelligence. We performed a combination of semantic, lexical, and psycholinguistic analyses of the full text of the manuscripts and compared them with the outcome of the peer review process. We found that accepted manuscripts scored lower than rejected manuscripts on two indicators of readability, and that they also used more scientific and artificial intelligence jargon. We also found that accepted manuscripts were written with words that are less frequent, that are acquired at an older age, and that are more abstract than rejected manuscripts. The analysis of references included in the manuscripts revealed that the subset of accepted submissions were more likely to cite the same publications. This finding was echoed by pairwise comparisons of the word content of the manuscripts (i.e., an indicator of semantic similarity), which were more similar in the subset of accepted manuscripts. Finally, we predicted the peer review outcome of manuscripts with their word content, with words related to machine learning and neural networks positively related to acceptance, whereas words related to logic, symbolic processing, and knowledge-based systems negatively related to acceptance.

en

Researchers’ perceptions of ethical authorship distribution in collaborative research teams

Authorship is commonly used as the basis for the measurement of research productivity. It influences career progression and rewards, making it a valued commodity in a competitive scientific environment. To better understand authorship practices amongst collaborative teams, this study surveyed authors on collaborative journal articles published between 2011 and 2015. Of the 8364 respondents, 1408 responded to the final open-ended question, which solicited additional comments or remarks regarding the fair distribution of authorship in research teams. This paper presents the analysis of these comments, categorized into four main themes: (1) disagreements, (2) questionable behavior, (3) external influences regarding authorship, and (4) values promoted by researchers. Results suggest that some respondents find ways to effectively manage disagreements in a collegial fashion. Conversely, others explain how distribution of authorship can become a "blood sport" or a "horror story" which can negatively affect researchers' wellbeing, scientific productivity and integrity. Researchers fear authorship discussions and often try to avoid openly discussing the situation which can strain team interactions. Unethical conduct is more likely to result from deceit, favoritism, and questionable mentorship and may become more egregious when there is constant bullying and discrimination. Although values of collegiality, transparency and fairness were promoted by researchers, rank and need for success often overpowered ethical decision-making. This research provides new insight into contextual specificities related to fair authorship distribution that can be instrumental in developing applicable training tools to identify, prevent, and mitigate authorship disagreement.

en

Who are the acknowledgees? An analysis of gender and academic status

Acknowledgements found in scholarly papers allow for credit attribution of nonauthor contributors. As such, they are associated with a different kind of recognition than authorship. While several studies have shown that social factors affect authorship and citation practices, few analyses have been performed on acknowledgements. Based on 878,250 acknowledgees mentioned in 291,167 papers published between 2015 and 2017, this study analyzes the gender and academic status of individuals named in the acknowledgements of scientific papers. Our results show that gender disparities generally found in authorship can be extended to acknowledgements, and that women are even more underrepresented in acknowledgements section than in authors’ lists. Our findings also show that women acknowledge proportionally more women than men do. Regarding academic status, our results show that acknowledgees who have already published tend to have a higher position in the academic hierarchy compared with all Web of Science (WoS) authors. Taken together, these findings suggest that acknowledgement practices might be associated with academic status and gender.

en

Misconduct and misbehavior related to authorship disagreements in collaborative science

Scientific authorship serves to identify and acknowledge individuals who “contribute significantly” to published research. However, specific authorship norms and practices often differ within and across disciplines, labs, and cultures. As a consequence, authorship disagreements are commonplace in team research. This study aims to better understand the prevalence of authorship disagreements, those factors that may lead to disagreements, as well as the extent and nature of resulting misbehavior. Methods include an international online survey of researchers who had published from 2011 to 2015 (8364 respondents). Of the 6673 who completed the main questions pertaining to authorship disagreement and misbehavior, nearly half (46.6%) reported disagreements regarding authorship naming; and discipline, rank, and gender had significant effects on disagreement rates. Paradoxically, researchers in multidisciplinary teams that typically reflect a range of norms and values, were less likely to have faced disagreements regarding authorship. Respondents reported having witnessed a wide range of misbehavior including: instances of hostility (24.6%), undermining of a colleague’s work during meetings/talks (16.4%), cutting corners on research (8.3%), sabotaging a colleague’s research (6.4%), or producing fraudulent work to be more competitive (3.3%). These findings suggest that authorship disputes may contribute to an unhealthy competitive dynamic that can undermine researchers’ wellbeing, team cohesion, and scientific integrity.

en

Implantation d’un modèle de soins d’accès adapté avec un physiothérapeute en pratique avancée pour la clientèle musculosquelettique au GMF-Universitaire des Faubourgs

L’accès en physiothérapie dans le système public québécois actuel est très restreint, avec un temps d’attente moyen de près de 4 mois et demi. Pour améliorer l’accès des patients atteints d’un trouble musculosquelettique, un nouveau modèle de soins comprenant un physiothérapeute en pratique avancée est proposé pour favoriser l’accès adapté en physiothérapie en première ligne. Ce dernier permet à ces patients de rencontrer rapidement, en moins de 48 heures, un physiothérapeute pour les outiller sur leur condition et débuter des exercices dans le but de prévenir la détérioration et promouvoir la récupération de ceux-ci, et ce sans avoir à consulter un médecin préalablement. L’objectif de ce projet d’amélioration continue de la qualité des soins est de démontrer la faisabilité et la pertinence d’implanter un tel modèle de soins d’accès adapté en physiothérapie avec un physiothérapeute en pratique avancée au sans rendez-vous du Groupe de médecine de famille universitaire des Faubourgs afin de diminuer les délais de consultation pour les troubles musculosquelettiques. Toutes les étapes de l’implantation sont décrites à l’aide du cadre conceptuel PEPPA « Participatory, Evidence-Based, Patient-Focused Process for Advanced Practice Nursing », suivies de quelques recommandations pour améliorer le projet. L’implantation s’est avérée être une réussite, se reflétant entre autres par une satisfaction élevée auprès de l’entièreté des patients. De plus, malgré les défis soulevés quant à la clarification du rôle et des responsabilités de toutes les parties prenantes, une très forte collaboration interprofessionnelle avec les médecins, résidents et infirmiers a été rapportée comme l’un des plus grands avantages de ce projet. De plus, un ajustement selon l’offre et la demande des rendez-vous devra être pris en considération pour s’assurer de la pérennité du projet. Le succès de ce projet prouve qu’il est possible de développer et d’implanter, dans un délai restreint, de nouveaux modèles de soins en accès adapté via un physiothérapeute en pratique avancée sans ajout de ressources supplémentaires, et ce, même en période de crise pandémique.

fr

Game studies and decoloniality : a review of Video games and the global South

Book review : Video Games and the Global South, by Phillip Penix-Tadsen (Ed.).

en

Problematic caregiving activities among family carers of older adults with disabilities

Family carers of older adults with disability often both experience stress that may affect their ability to provide care, and find some caregiving activities differentially challenging. The objectives of this research are to identify the caregiving activities that are most problematic to carers and to explore the reasons why carers found these activities challenging. Participants were past or current carers aged 19 years and older. Using an explanatory sequential mixed-methods approach, data were collected through a survey and open-ended interviews. Thematic analysis revealed that an activity was likely to be more problematic if it had to be coordinated with other caregiving needs or where a care recipient’s disability was severe.

en

Instruments to evaluate mobility capacity of older adults during hospitalization : a systematic review

Independent mobility is a key factor in predicting morbidity and determining hospital discharge readiness for older patients. The main objective was identify and appraise relevant instruments for the measurement of mobility of hospitalized geriatric patients. A systematic review was performed in two consecutive steps. Based on the definition of mobility of the International Classification of Functioning (ICF). Step 1 identified mobility measurement instruments used to assess patients 60 years of age and over hospitalized in acute care or intensive geriatric rehabilitation unit. Aim of the instrument, coverage of mobility construct, applicability (format, training required, administration time and use of assistive devices) were extracted. For each included instrument, Step 2 identified and appraised articles reporting about their measurement properties. Consensus-based Standards for the selection of health status Measurement INstruments (COSMIN) was used by two independent reviewers to critically appraise and compare the measurement properties. Step 1 resulted in 6350 articles, of which 28 articles reported about 17 different instruments. Step 2 retained 11 instruments with 70 articles reporting about their measurement properties in various settings. Judgement-based instruments (n = 5) covered the ICF mobility construct more broadly than performance-based measures (n = 6). Our results showed that 3 instruments (DEMMI, SPPB and Tinetti scale) had the most extensive and robust measurement properties, and from those, SPPB and DEMMI covered the mobility construct more broadly but SPPB had the longest administration (10–15 min). Conclusion SPPB presents the best balance between mobility coverage, measurement properties and applicability to acute care or intensive geriatric rehabilitation unit.

en

Evaluating the acceptance of ambient assisted living technology (AALT) in rehabilitation : a scoping review

Objectives Ambient assisted living technologies (AALTs) are being used to help community-dwelling older adults (OAs) age in place. Although many AALT are available, their acceptance (perceived usefulness, ease of use, intention to use and actual usage) is needed to improve their design and impact. This study aims to 1) identify AALTs that underwent an acceptance evaluation in rehabilitation contexts, 2) identify methodological tools and approaches to measure acceptance in ambient assisted living (AAL) in rehabilitation research, and 3) summarize AALT acceptance results in existing rehabilitation literature with a focus on peer-reviewed scientific articles. Methods A scoping review was conducted in the following databases: Medline, Embase, Cinahl, and PsycInfo, following the Arksey and O’Malley framework (2009). Four acceptance attributes were extracted: ‘user acceptance’, ‘perceived usefulness’, ‘ease of use’, and ‘intention to use’. Data regarding AALT, participants, acceptance evaluation methods and results were extracted. Results A total of 21 articles were included among 634 studies retrieved from the literature. We identified 51 AALTs dedicated to various rehabilitation contexts, most of which focused on monitoring OAs’ activities and environmental changes. Acceptance of AALT was evaluated using interviews, questionnaires, focus groups, informal feedback, observation, card sort tasks, and surveys. Although OAs intend to use – or can perceive the usefulness of – AALTs, they are hesitant to accept the technology and have concerns about its adoption. Discussion and conclusions The assessment of AALT acceptance in contexts of rehabilitation requires more comprehensive and standardized methodologies. The use of mixed-methods research is encouraged to cover the needs of particular studies. The timing of acceptance assessment should be considered throughout technology development phases to maximize AALT implementation.

en

Sonic hedgehog accelerates DNA replication to cause replication stress promoting cancer initiation in medulloblastoma

The mechanisms generating cancer-initiating mutations are not well understood. Sonic hedgehog (SHH) pathway activation is frequent in medulloblastoma (MB), with PTCH1 mutations being a common initiating event. Here we investigated the role of the developmental mitogen SHH in initiating carcinogenesis in the cells of origin: granule cell progenitors (GCPs). We delineate a molecular mechanism for tumor initiation in MB. Exposure of GCPs to Shh causes a distinct form of DNA replication stress, increasing both origin firing and fork velocity. Shh promotes DNA helicase loading and activation, with increased Cdc7-dependent origin firing. The S-phase duration is reduced and hyper-recombination occurs, causing copy number neutral loss of heterozygosity—a frequent event at the PTCH1/ptch1 locus. Moreover, Cdc7 inhibition to attenuate origin firing reduces recombination and preneoplastic tumor formation in mice. Therefore, tissue-specific replication stress induced by Shh promotes loss of heterozygosity, which in tumor-prone Ptch1+/− GCPs results in loss of this tumor suppressor—an early cancer-initiating event.

en

Paid worker and unfamiliar partner communication training : a scoping review

Background Communication partner training could be employed to train people working in the community to facilitate interaction with individuals who live with a variety of communication disorders. However, current evidence syntheses are limited to a single disorder (e.g., aphasia) and focus on a variety of familiar and unfamiliar communication partners. An understanding of the scope of literature across the evidence-base of acquired neurological populations may provide a better basis to develop interventions and future research tailored for community workers. Aims To explore the scope of literature on paid worker and unfamiliar partner communication training for acquired neurogenic communication disorders with a focus on describing: 1) the types of communication disorders addressed by interventions; 2) the types of learners who received the interventions; 3) the nature of the interventions; and 4) the reported effects on trainees and people with a communication disorder. Methods & procedures A scoping review was conducted. Studies were selected by a systematic keyword search, undertaken through four databases. Eligibility criteria included studies that: (i) reported an intervention directed at paid workers or unfamiliar partners where the primary goal was to improve communication with people with acquired neurogenic communication disorders, (ii) reported original results, (iii) contained quantitative or qualitative data on the effects of the intervention, (iv) were written in English or French and (v) were published in a peer-reviewed journal. The PRISMA-ScR was used to guide design and reporting of the scoping review. Results Seventy publications met the inclusion criteria. Interventions were mostly disorder-specific and addressed communication with people with dementia, aphasia or traumatic brain injury. 15/70 studies examined training programs that were not restructured to a specific population (e.g., aphasia). Learners were mostly working or studying in the healthcare field and only 2/70 studies included community workers without primarily health training. Sixty different interventions were reported and were mostly delivered by speech-language pathologists. Training varied in terms of duration (a few minutes to 46 h) and content, but many shared training methods (e.g., presentation of theory on communication disorders). Nearly all studies demonstrated positive results, 23/26 studies suggested that paid worker and unfamiliar partner communication training may increase the knowledge of trainees, 24/26 studies suggested that it could improve their confidence when interacting with people with a communication disorder and 44/46 studies suggested that it could improve the trainees’ communication abilities. Conclusion A small developing evidence-base exists for communication training programs for paid and unfamiliar communications partners that focuses beyond a single diagnosis or disorder. However, there is very limited knowledge on interventions for community workers from non-health professions. Future research should focus on the evaluation of existing programs tailored to, or explicitly designed for this context with the aim of identifying active ingredients that lead to improved and sustainable outcomes.

en

Critiques scientifiques de la relation entre l’intelligence émotionnelle (IÉ) et le leadership transformationnel ainsi que du rôle de la formation dans la modification de l’IÉ des gestionnaires

L’intelligence émotionnelle (IÉ) est un thème en pleine croissance dans le secteur de la psychologie du travail et des organisations. Dans la foulée de l’analyse des retombées de l’IÉ sur les différents styles de leadership, il est pertinent d’approfondir l’exploration du lien entre l’IÉ et le leadership transformationnel (LT). En effet, selon certains auteurs, le LT exige des compétences émotionnelles et interpersonnelles appréciables telles que le pouvoir d’influence positive auprès des employés, la communication, l’empathie, la collaboration ou la gestion des émotions parmi les subordonnés. Le premier objectif de l’essai doctoral vise donc à mettre à jour les connaissances sur la relation entre l’IÉ et le LT à l’aide d’une revue critique de la littérature. Plus particulièrement, la portée des différents courants théoriques de l’IÉ ainsi que de leurs enjeux méthodologiques sont analysés. L’analyse révèle que l’apport de l’IÉ dans la manifestation du LT est faible à la lumière des limites conceptuelles et méthodologiques des études sur l’IÉ. Le second objectif de l’essai doctoral vise à vérifier, à l’aide d’une revue critique de la littérature, dans quelle mesure la formation des gestionnaires permet de développer solidement les compétences émotionnelles associées à l’IÉ. L’analyse révèle que l’on peut améliorer les scores d’IÉ grâce à la formation, et ce, peu importe l’approche d’IÉ employée. L’essai recommande aux praticiens d’utiliser essentiellement les mesures l’IÉ dans un contexte d’introspection et de développement professionnel des leaders plutôt qu’en sélection.

fr

The associations between child-care services during the preschool years and high school graduation : a 20-year longitudinal population-based study

Objective: Together with family factors, early care and education (ECE) services were shown to improve school readiness in kindergarten. However, it is not clear whether better school readiness at age 6 years translates into higher rates of high school graduation years later. Our objective was therefore to investigate the long-term associations between the use of ECE and high school graduation while considering the sex of the child and the socioeconomic status of the parents as moderators. Methods: Participants were children from the Quebec Longitudinal Study on Child Development (QLSCD) born in 1997 to 1998 (N = 2001). Intensity and type of ECE exposure were measured from age 5 months to 5 years. Administrative records were used to determine whether students had obtained a high school diploma by age 20 years. Factors explaining differences in the profiles of ECE users were controlled using propensity score weights. Results: Twenty-two percent of students did not have a high school diploma by age 20 years. Compared with children never exposed to center-based care, those exposed early (i.e., before toddlerhood) had better odds of graduating from high school (odds ratio = 1.49) after controlling for confounding factors. Late exposure to center-based care was not related to high school graduation rates. Conclusion: Exposure to regulated and center-based ECE on a regular basis from toddlerhood to school entry was associated with higher rates of high school graduation. Regulated center-based ECE at the population level may improve rates of high school graduation.

en

A repeated cross-sectional analysis assessing mental health conditions of adults as per student status during key periods of the COVID-19 epidemic in France

Previous studies have shown the negative impact of the COVID-19 epidemic on students’ mental health. It is, however, uncertain whether students are really at higher risk of mental health disturbances than non-students and if they are differentially impacted by lockdown periods over time. The objective of our study was to compare the frequency of depressive symptoms, anxiety, and suicidal thoughts in students and non-students enrolled in the same study in France and during the same key periods of the COVID-19 epidemic. Using a repeated cross-sectional design, we collected data from a sample of 3783 participants in the CONFINS study during three recruitment waves between March 2020 and January 2021. Multivariate logistic regression models, adjusted for potential confounding factors, showed that students were more likely to have high scores of depressive symptoms and anxiety more frequently than non-students. These differences were particularly strong during the first (depressive symptoms: adjusted odds ratio aOR 1.59, 95% CI 1.22–2.08; anxiety: aOR 1.63, 95% CI 1.22–2.18) and second lockdowns (depressive symptoms: aOR 1.80, 95% CI 1.04–3.12; anxiety: aOR 2.25, 95% CI 1.24–4.10). These findings suggest that the restrictive measures—lockdown and curfew—have an alarmingly stronger negative impact on students than on non-students and underline the frailty of students’ mental health and the need to pay greater attention to this population in this epidemic-related context.

en

Who profits from the Canadian nanotechnology reward system? Implications for gender-responsible innovation

Gender equality is one of the primary dimensions of responsible research and innovation. Based on bibliometric and survey data of nanotechnology researchers in Canada, this paper analyzes the reward system of science in terms of gender and gender-related institutional cultures. This study reveals that the scientific culture of nanotechnology was perceived as more masculine by women than by men. The findings show that gender productivity gaps remain a challenge in the field and that these gaps are reinforced by the fact that the most productive researchers are less likely to collaborate with women. The results also show the amount of extra effort that women must devote to their research to retain their top status in academia, and the extent that their recognition when in top positions is fragile compared to men. This study confirms the cumulative advantage of creating a gender-inclusive culture that enables women to improve their scientific productivity and impact: such cultures tend to privilege first-author publications over patenting and thus prioritize a type of output where women have had more success. Finally, this paper concludes with policy recommendations for improving the number of women in research and the institutions where they work.

en

Three public goods and lexicographic preferences : replacement principle

We study the problem of locating multiple public goods for a group of agents with single-peaked preferences over an interval. An alternative specifies for each public good a location. In Miyagawa (1998) each agent consumes only his most preferred public good without rivalry. We extend preferences lexicographically and characterize the class of rules satisfying Pareto-optimality and replacementdomination. We show that for three public goods, this results in a very similar characterization to Miyagawa (2001a): only the two rules which either always chooses the left-most Pareto-optimal alternative or always chooses the rightmost Pareto-optimal alternative satisfy these properties. This is in contrast to Ehlers (2002) who showed that for two goods the corresponding characterization is substantially different to Miyagawa (2001a).

en

A Bayesian meta-analysis on the effects of mTBI on attention in an adult population

Contexte. Les traumatismes craniocérébraux légers (TCCl) constituent un problème important en raison de leur coût humain et financier exorbitant. Au cours des trois premiers mois post accident, les patients souffrent généralement de symptômes somatiques, affectifs et cognitifs. Parmi ces derniers, les difficultés d'attention sont souvent rapportées. Si certaines publications mettent en évidence de tels déficits, d'autres ne vont pas dans ce sens. Par conséquent, l'objectif principal de ce projet est d'aborder les résultats contradictoires de la littérature en déterminant si le fonctionnement attentionnel des adultes, dans les trois premiers mois à la suite du TCCl, est réellement affecté et si oui, déterminer quel processus attentionnel est le plus touché. Méthode. Une revue systématique a identifié 13 études répondant aux critères de sélection. Le premier ensemble de données était composé de sept études ayant rapporté des mesures d'attention sélective et le second contenait les cinq autres études rapportant un score composite d'attention. Une méta-analyse bayésienne robuste a été réalisée. Résultats. Des preuves extrêmes en faveur d'un effet sur l'attention sélective ont été trouvées, ainsi que des preuves faibles pour soutenir l'absence d'hétérogénéité et la présence d'un biais de publication. La taille moyenne de l'effet et les intervalles de crédibilité sont d = .369, IC 95% [.208, .522]. Pour le score d'attention composite, des preuves faibles ont été trouvées pour l'effet, l'hétérogénéité et le biais de publication. La taille moyenne de l'effet et les intervalles de crédibilité sont d = .248, IC 95% [.039, .485]. Conclusions. Nos résultats offrent des preuves claires de déficits d'attention sélective dans une population d'adultes ayant subi un TCCl dans les trois mois suivant leur blessure. Quant à l'utilisation d'un score composite de l'attention, les données sont inconcluantes. Des recommandations sont émises pour les futures recherches dans le domaine. Mild traumatic brain injuries (mTBI) are a serious issue given their exorbitant human and financial cost. Within the first three months, patients often report somatic, affective, and cognitive symptoms. Of the latter, attentional difficulties are often reported. While some literature points to evidence for such deficits, others disagree. With the many varying methods in assessing attention present in the literature, many clinicians remain unsure of the best course of action when faced with limited tools and time. Therefore, the goal of this project is to determine if attentional functioning is altered in adults within the first three months following mTBI, and if so, to document which attentional processes are more likely to be impacted. A second is to provide better data for clinicians and recommendations for future studies in this field. Method. A systematic review identified 13 studies that met the selection criteria. The first data set was comprised of seven studies that reported selective attention measures and the second contained the remaining five studies reporting a composite score of attention. A robust Bayesian meta-analysis was conducted. Results. Evidence in favor of an effect on selective attention was found, along with weak evidence to support the absence of heterogeneity and the presence of publication bias. The posterior mean effect size and credible intervals came to d = .369, 95% CI [.208, .522]. As for the composite score of attention, weak evidence was found for the effect, the heterogeneity, and the publication bias favor of an effect for the composite score was found. The posterior mean effect size and credible intervals came to d = .248, 95% CI [.039, .485]. Conclusions. Findings support for the hypothesis of a selective attention deficits in an adult mTBI population within three months of their injury. The evidence based on a composite score of attention is inconclusive. Recommendations for future research methodology are also offered.

fr , en

Le rôle modérateur de la congruence au travail dans le lien entre les difficultés de régulation émotionnelle et l’épuisement professionnel

La présente étude vise à examiner si la congruence Soi-Travail (CT) modifie l’association entre les difficultés de régulation émotionnelle (DÉ) et l’épuisement émotionnel (ÉÉ) dans une cohorte d’intervenants en protection de la jeunesse des CIUSSS – programme Jeunesse. Il s’agit d’une population particulièrement vulnérable à l’épuisement professionnel chez qui les capacités à gérer les émotions, des compétences cruciales sinon critiques au rôle des intervenants, varient d’un individu à l’autre. Dans cette étude, nous nous sommes intéressés en premier lieu à la relation entre les difficultés de régulation émotionnelle et l’épuisement émotionnel chez les intervenants. Dans un deuxième temps, nous avons examiné la congruence entre le concept de soi et le rôle au travail (congruence Soi-Travail) pour vérifier si cette variable agit comme modérateur dans le lien entre les capacités de régulation émotionnelle et l’épuisement professionnel. Pour répondre à ces objectifs, nous avons utilisé un modèle de modération simple analysant les données collectées depuis 2016 auprès de plus de 400 intervenants œuvrant en protection de la jeunesse. Ainsi, à travers une série d’analyses de régression hiérarchique, notre étude démontre que la perception de congruence Soi-Travail agit comme modérateur dans le lien entre les difficultés de régulation émotionnelle et l’épuisement professionnel, et ce, uniquement chez les femmes. Chez les hommes, nous observons la contribution unique des difficultés de régulation émotionnelle, sans contribution de la congruence Soi-Travail et sans interaction entre ces deux variables. Notre étude ouvre la voie à de nouvelles recherches dans le domaine en mettant en lumière l’importance d’éléments comme le concept de soi, la régulation émotionnelle, les différences de sexes et la congruence Soi-Travail.

fr

On the importance of noncrystalline phases in semicrystalline electrospun nanofibers

Tailoring the properties of electrospun fibers requires a detailed understanding and control of their microstructure. We investigate the structure/property relationships in fabrics of randomly aligned fibers of polylactide, a prevalent biopolymer, either as-spun or after annealing and solvent-induced crystallization. In-depth characterization by field-emission scanning electron microscope (FESEM), wide-angle X-ray diffraction (WAXD), attenuated total reflection Fourier transform infrared (ATR-FTIR), and modulated temperature differential scanning calorimetry (MT-DSC) reveals that the as-spun fibers comprise crystalline and mesomorphic phases, as well as oriented but mobile amorphous chain segments. These chains are mostly responsible for the low-temperature cold crystallization and for the recovery endotherm around the glass transition, while the mesophase transforms into crystals with nearly zero enthalpy. Such behaviors are attributed to high molecular orientation, which is further evidenced by unveiling a fibrillar superstructure in nanofibers. The thermodynamics and structural evolution under different conditions are described from an energy landscape perspective. Finally, we propose a micromechanism, based on a modified supramolecular model, which helps to elucidate the fibers’ molecular dynamics.

en

Probing interfacial interactions and dynamics of polymers enclosed in boron nitride nanotubes

Understanding interfacial interactions in polymer systems is crucial for their applicability for instance in adhesives and coatings. Enclosing polymers in a cylindrical volume provides a system for studying interactions dictated by a continuous interfacial layer and a bulk-like volume in the middle of the cylinders. Here, we describe a simple method for enclosing polymers into boron nitride nanotubes (BNNTs) and establishing the effect of the interfacial interactions on the glass transition temperature (Tg) of the polymers by infrared spectroscopy. The volume of the inner channel is large in comparison to the volume of the loaded polymer coils, allowing the polymer to expand along the inner channel, resulting in the effect of interfacial interactions on polymer dynamics dominating over confinement effects. As examples, we loaded poly(4-vinyl pyridine), poly(methyl methacrylate), poly(vinyl pyrrolidone), and poly(disperse red 1 acrylate) in BNNTs. The strongest interaction between the studied polymer and BNNTs was observed for poly(4-vinyl pyridine), which also caused a significant increase of Tg. In addition to characterizing the effect of interfacial interactions on the thermal transitions of the polymers, this method, which is generalizable to most soluble polymer materials, can be used for studying photoinduced transitions in photoactive polymers thanks to the transparency of the BNNTs at visible wavelengths.

en

Engagement scolaire en milieu défavorisé : le cas de classes du primaire où sont utilisées les technologies à l’école.

Cette recherche vise à mesurer et à comparer l’évolution de l’engagement scolaire d’élèves issus de milieux défavorisés dans des classes où les technologies de l’information et de la communication sont utilisées par la validation de construit d’un instrument traduit de l’anglais. À l’aide d’une version validée en français du MacArthur Engagement School Survey (Fredricks, Blumenfeld, Friedel et Paris, 2005), il a été possible de dresser un portrait relativement positif de l’engagement scolaire de 230élèves du 3e cycle du primaire. Pour ce faire, des analyses multiniveaux furent entreprises. Les résultats montrent qu’en six mois, la qualité de l’engagement scolaire en ces milieux évolue diféremment selon le degré de défavorisation de leurs écoles. This research had for objectives to evaluate and compare the evolution of pupil engagement in underprivileged schools where ICTs were used in the classrooms by the construct validation of an English survey. From a translated and validated version in French of the MacArthur Engagement School Survey, it was possible to describe relatively positively the school engagement level of 230 ffth- and sixthgraders participating in that study. For that purpose, we used hierarchical linear modeling analysis. Over the course of six months, the results show that the quality of pupils’ engagement vary according to the socioeconomic level of their school.

fr , en

Différences régionales à travers le monde des étudiants inscrits dans un MOOC francophone : portrait d’un cas issu de l’initiative EDUlib

Le présent article examine les différences régionales des points de vue de la participation au cours, des profils sociodémographiques, des comportements et des résultats en lien avec la participation à un cours en ligne ouvert et massif (« MOOC »). Nous avons suivi les étudiants d’un cours proposé par l’École des hautes études commerciales (HEC) de Montréal dans leur initiative de MOOC appelée EDUlib. L’analyse a été réalisée à partir des traces laissées sur la plateforme (ressources consultées, nombre de visites, activité dans l’environnement) et des réponses à un questionnaire autorapporté. Nous constatons des différences entre les régions, qui semblent liées aux caractéristiques socioéconomiques de celles-ci. Les résultats laissent suggérer une certaine difficulté à rejoindre ces étudiants. Les participants de ces régions qui s’inscrivent afin de favoriser leur développement continu semblent peiner à réussir le cours. This article examines regional differences based on students’ participation, sociodemographic profiles, behaviors and learning outcomes. To do this, students were followed in a course offered by “École des hautes études commerciales” (HEC) of Montreal in their MOOC initiative called EDUlib. The analysis was performed using the platform traces (accessed resources, number of visits, activities in the environment) and responses to self-report questionnaire. Regionals differences were observed, which seem related to the country’s development index. The results suggest some difficulty in reaching these students, despite the fact that participants who register in order to promote their development seem to struggle to pass the course.

fr , en

Les relations entre attentes, valeur, buts, engagement cognitif et engagement comportemental dans un MOOC

Dans le présent article, nous nous intéressons aux relations entre attentes, valeur, buts et engagement dans un MOOC universitaire de l’initiative Edulib. À partir d’une perspective théorique globale fondée sur l’autorégulation et en utilisant un modèle de motivation sociocognitif des attentes et de la valeur (Pintrich, 2003), nous analysons les liens entre motivation et engagement. Pour ce faire, nous utilisons les données de 531 répondants à un questionnaire distribué aux participants d’un MOOC de l’initiative Edulib (HEC Montréal) portant sur l’introduction au marketing, offert à l’automne 2014. Une analyse par correspondances multiples sur les activités rapportées nous a permis de concevoir un score composite d’engagement comportemental. Par la suite, nous utilisons une approche d’équations structurelles pour tester le modèle théorique, après avoir opérationnalisé tous les liens anticipés entre les différentes variables. Nos résultats suggèrent un modèle acceptable qui confirme plusieurs des prévisions théoriques. Ainsi, la valeur est liée aussi bien aux buts extrinsèques qu’aux buts intrinsèques, mais les buts intrinsèques sont beaucoup plus fortement liés à l’engagement cognitif que les buts extrinsèques. Toutefois, aucune relation significative n’est observée entre l’engagement cognitif et l’engagement comportemental, ce qui soulève des questions de mesure, mais aussi des questions de nature théorique pour une clientèle d’adultes participant à un MOOC. In this article, we focus on the diverse relationships between expectations, values, goals and engagement in a French-language MOOC in Québec. Using a theoretical perspective based on self-regulation and an expectancy-value model of socio-cognitive motivation (Pintrich, 2003), we analyze the relationship between motivation and engagement by comparing observed relationships to the predictions of our theoretical model. To do this, we use data from 531 responses to a questionnaire distributed to the participants of a MOOC in the HEC Montréal Edulib initiative, Introduction to Marketing, offered in fall 2014. A multiple correspondence analysis on the reported activities allowed us to design a composite score for behavioral engagement. Subsequently, we used a structural equation approach to test our theoretical model, after operationalizing the anticipated relationships between the variables. Our results point to an acceptable model that confirms several of our theoretical predictions. The perceived value is linked to both extrinsic and intrinsic goals, but intrinsic goals are much more strongly related to cognitive engagement than extrinsic goals. No significant relationship was observed between cognitive engagement and behavioral commitment, however, raising questions of measurement, as well as theoretical questions for an adult clientele participating in a MOOC.

fr , en

Analyse de qualité d’un MOOC: le point de vue des étudiants

L’engouement qui faisait déclarer au New York Times que 2012 était l’« année du MOOC » semble désormais faire place au regard plus critique que porte la recherche sur le phénomène. En ce sens, le défi de la qualité est aussi important dans les MOOC que dans le domaine de la FAD. La présente recherche a pour objectif d’examiner l’appréciation que 631 apprenants font de leur expérience de deux MOOC du HEC Montréal, à partir de leurs perceptions et d’une approche inductive non préalablement fondée sur des a priori théoriques, à l’aide de trois questions ouvertes. Il émerge des résultats des critères d’évaluation se rapprochant de ceux utilisés dans les cadres de qualité en FAD, mais opérationnalisés d’une manière très spécifique. Ainsi, une attention toute particulière devrait être accordée au contenu (liens théorie-pratique, accessibilité des contenus), aux prestations enseignantes et à la clarté des tests. New York Times headlines in 2012 was the «year of the MOOC», putting the spotlight on a new trend, but since then, research stance on this phenomenon is more critical. Hence, the pursuit of quality may be as important in MOOCs in distance education? This research aims to examine the experience of 631 learners in two MOOC of HEC Montreal, based on their perceptions, by applying a qualitative inductive approach without any theoretical a priori, from three open questions. Results highlight criteria that are very close to some of the ones used in distance education quality frameworks, but that are operationalized differently: a special attention to content relations between theory and practice, accessibility of contents, teachers’ performances and clarity of tests and quizzes.

fr , en

Étude comparative des logiciels d’aide à l’analyse de données qualitatives : de l’approche automatique à l’approche manuelle

L’objectif de cet article vise à effectuer un survol descriptif des plus récentes versions de douze logiciels d’aide à l’analyse de données qualitatives (LAADQ). La recension est organisée autour d’une typologie divisée en trois axes, soit les logiciels qui privilégient l’une ou l’autre des approches automatique, semi-automatique ou manuelle. Ces axes ne s’excluent pas mutuellement puisque de plus en plus de concepteurs combinent plusieurs modules dans un même logiciel, permettant de varier les analyses. Néanmoins, chaque logiciel propose habituellement une finalité prévalente, sur laquelle nous insistons lors de l’analyse comparative. Nous décrivons d’abord les caractéristiques principales des logiciels, puis nous présentons leurs forces et leurs limites. Un tableau synthèse comparatif à la fin de l’article permet une consultation rapide des différents outils disponibles sur le marché. Nous espérons ainsi pouvoir orienter les différents choix s’offrant aux chercheurs et faciliter leur décision.

fr

Olfactory-induced locomotion in lampreys

The olfactory system allows animals to navigate in their environment to feed, mate, and escape predators. It is well established that odorant exposure or electrical stimulation of the olfactory system induces stereotyped motor responses in fishes. However, the neural circuitry responsible for the olfactomotor transformations is only beginning to be unraveled. A neural substrate eliciting motor responses to olfactory inputs was identified in the lamprey, a basal vertebrate used extensively to examine the neural mechanisms underlying sensorimotor transformations. Two pathways were discovered from the olfactory organ in the periphery to the brainstem motor nuclei responsible for controlling swimming. The first pathway originates from sensory neurons located in the accessory olfactory organ and reaches a single population of projection neurons in the medial olfactory bulb, which, in turn, transmit the olfactory signals to the posterior tuberculum and then to downstream brainstem locomotor centers. A second pathway originates from the main olfactory epithelium and reaches the main olfactory bulb, the neurons of which project to the pallium/cortex. The olfactory signals are then conveyed to the posterior tuberculum and then to brainstem locomotor centers. Olfactomotor behavior can adapt, and studies were aimed at defining the underlying neural mechanisms. Modulation of bulbar neural activity by GABAergic, dopaminergic, and serotoninergic inputs is likely to provide strong control over the hardwired circuits to produce appropriate motor behavior in response to olfactory cues. This review summarizes current knowledge relative to the neural circuitry producing olfactomotor behavior in lampreys and their modulatory mechanisms.

en

La dualité ethnographe-physicienne : étude réflexive sur les négociations identitaires en physique

Étant physicienne, j’ai navigué dans un milieu où les femmes sont sous-représentées, tout comme plusieurs groupes historiquement marginalisés. Selon des principes de justice sociale, tout le monde devrait pouvoir contribuer à la construction des savoirs scientifiques : il est donc impératif de comprendre les mécanismes qui freinent la participation aux sciences de certains groupes. Alors que la notion de sous-représentation s’attarde au nombre d’individus dans une catégorie ou une autre, parler en termes de diversité et d’inclusion permet de s’éloigner du cloisonnement des individus. Ainsi, je pars du constat que les aspects, causes et conséquences associées au manque de diversité et d’inclusion dans la communauté scientifique sont complexes et se manifestent dans la communication et dans le vécu des individus. J’utilise le concept de travail identitaire pour analyser l’interpénétration des facteurs personnels, institutionnels et communicationnels qui freinent la diversité et l’inclusion dans mon organisation -- un département universitaire de physique -- et pour réfléchir sur les enjeux systémiques qui dépassent ses frontières. Profitant de mon point de vue de l’intérieur, j’ai effectué une ethnographie « chez soi ». J'y décris le travail identitaire ressenti et observé au Département de physique de l’Université de Montréal. J’ai ciblé trois éléments phares de la vie départementale, à laquelle participent autant la communauté étudiante que le corps professoral et qui peuvent déclencher un travail identitaire : les conférences, les projets de recherche et les comités départementaux. Je présente des processus de travail identitaire situés à l’intérieur même d’individus qui contribuent aux savoirs scientifiques, plus précisément, à travers des facettes identitaires historiquement peu mises de l’avant. De plus, j’explicite comment, dans un environnement donné, la confiance en ses habiletés de recherche peut s’effondrer puis se reconstruire. Porteur d’espoir, mon récit ethnographique souligne, d’une part, l’importance des comités de réflexion sur la diversité et l’inclusion à même les unités départementales et les groupes de recherches et, d’autre part, offre des pistes et des outils aux scientifiques qui voudront intégrer des réflexions sur des enjeux sociaux à même leur recherche. Enfin, il s’agit à ma connaissance de la seule ethnographie de milieu scientifique effectuée par une physicienne. Being a female physicist, I have acted and interacted in an environment where women, like many other historically marginalized groups, are under-represented. According to social justice principles, everyone should be able to contribute to the construction of scientific knowledge. Therefore, it is necessary to understand the social mechanisms that limit the participation of certain groups. While the notion of under-representation has often been used to address the relative presence or absence of individuals in certain categories, I prefer to speak about diversity and inclusion which decompartmentalise individuals. My starting point is the observation that various aspects, causes, and consequences related to the lack of diversity and inclusion in the scientific community are complex and manifest themselves in communication and lived experience. I use the concept of identity work to analyze the interpenetration of personal, institutional, and communicational elements that restrict diversity and inclusion in my organization (a university physics department) and to reflect on systemic issues that go beyond organizational boundaries. Building on my insider’s point of view, I conducted an “at-home” ethnography in which I describe identity work at the physics department of Université de Montréal as I experienced and observed it. Specifically, I target three elements that are central to daily life in Department, that engage both students and professors, and that trigger identity work: seminars, research projects and departmental committees. Throughout this ethnographic tale with confessional tones, I link my internal identity processes as an individual contributing to scientific knowledge throughout identity facets historically marginalized. In addition, I show how, for a given environment, confidence in one’s research skills can be rebuilt after collapsing. Giving hope, my ethnographic tale highlights the importance of discussion groups on diversity and inclusion in departmental units and research groups and, furthermore, offers avenues and tools to scientists that want to engage with social issues in their research. Finally, as far as I know, this is the first at-home ethnography of a scientific community produced by a female physicist.

fr , en

Vie privée des mineurs en ligne : protection des données personnelles. Étude comparée entre le droit canadien, américain et celui de l’Union européenne

Cette recherche s’intéresse à un sujet d’actualité portant sur la vie privée des mineurs en ligne, plus particulièrement sur la protection des données personnelles. Depuis l’avènement des nouvelles technologies de l’information et des communications (NTIC) et la venue du web 2.0, la protection des données personnelles demeure question d’actualité en plus d’être fort complexe. Cette question demeure encore plus criante lorsqu’il s’agit de mineurs. La présente recherche s’intéresse d’abord à l’utilisation d’Internet par les mineurs, à la notion de vulnérabilité du mineur et de l’insuffisance des règles actuelles. Elle s’intéresse également à la distinction conceptuelle entre « mineur » et « enfant » avant de s’arrêter plus longuement aux principales formes d’infractions qui portent atteinte à la vie privée et à l’intégrité des mineurs. Plus loin dans ce mémoire, on s’intéresse aux dispositions législatives et réglementaires au Canada, aux États-Unis et au sein de l’Union européenne. Dans la dernière partie on montre les différences significatives entre le Canada, les États-Unis et l’Union européenne. Dans la conclusion de ce mémoire, nous revenons sur les faits saillants de cette recherche comparative en insistant sur le fait qu’il est complexe de protéger les données personnelles des mineurs et qu’il existe des différences importantes dans les législations et les règlements en vigueur sur le plan national et international. This research study addresses a current concern regarding the privacy of minors online, more specifically the protection of personal data. Since the emergence of new information and communication technologies (NICT) and the introduction of Web 2.0, the protection of personal data remains a relevant and very complex issue. This issue is even more critical when it comes to minors. This research study first looks at Internet use by minors, the notion of a minor person’s vulnerability and the limitations of the current rules. It also examines the conceptual distinction between "minor" and "child" before focusing on the main aspect of violation of a minor's privacy and integrity. Later in this master’s thesis, the legislative and regulatory provisions in Canada, the United States and the European Union are examined. The final section highlights the significant differences between Canada, the United States and the European Union. In the conclusion for this dissertation, we will look back at the highlights of this comparative study, emphasizing that the task of protecting the personal data of minors is complex and that there are significant disparities in the laws and regulations in force at the national and international levels.

fr , en

Concurrent validity of open-ended functional assessment interviews with functional analysis

Open-Ended Functional Assessment Interviews have limited empirical support for their concurrent validity with functional analysis. To address this issue, we conducted a study wherein 176 independent behavior analysts relied on data collected using Open-Ended Functional Assessment Interviews to identify the function of challenging behavior in four children with autism. Then, we compared the results of their analyses with those of a traditional functional analysis. Our results showed that the conclusions drawn by behavior analysts using the Open-Ended Functional Assessment Interviews corresponded with the outcomes of functional analyses in 74% of cases. These findings suggest that the Open-Ended Functional Assessment Interview may inform functional analyses to develop initial hypotheses.

en

Co-occurrence of violence on the severity of abuse in intimate relationships

Several empirical studies have shown that women who experience violence in intimate personal relationships (IPV) commonly experience more than one form of violence. While it is recognized that individual trajectories of IPV vary over time, little is known about the temporal dynamics of this co-occurrence or its consequences. This study describes the different forms of violence experienced by women and looks at whether it is possible to predict when severe violence (physical and sexual) is most likely to occur. Data in the study comes from interviews with 70 women who had been victims of intimate partner violence. The life history calendar method was used to facilitate identifying kinds and levels of violence and the month in which violence took place. Individual victimization trajectories were found to be heterogenous and likely to change in the short term. The women in our sample experienced more than one form of intimate partner violence and co-occurrence of different forms of violence was common in individual trajectories. The characteristics of the kind of violence experienced were important in understanding the temporal aspects of acts of severe violence. The increased knowledge about patterns of violence provided by these results should help to develop better ways to intervene to prevent such events.

en

Changes in autistic symptoms and adaptive functioning of children receiving early behavioral intervention in a community setting : a latent growth curve analysis

Despite showing effects in well-controlled studies, the extent to which early intensive behavioral intervention (EBI) produces positive changes in community-based settings remains uncertain. Thus, our study examined changes in autistic symptoms and adaptive functioning in 233 children with autism receiving EBI in a community setting. The results revealed nonlinear changes in adaptive functioning characterized by significant improvements during the intervention and a small linear decrease in autistic symptoms from baseline to follow-up. The intensity of intervention, initial age, IQ and autistic symptoms were associated either with progress during the intervention or maintenance during the follow-up. The next step to extend this line of research involves collecting detailed data about intervention strategies and implementation fidelity to produce concrete recommendations for practitioners.

en

Por uma teoria da editorialização = Towards a theory of editorialisation = Por una teoría de la editorialización

O “fato digital” tem sido objeto de muitas interpretações em diferentes disciplinas: dos estudos midiáticos às ciências da informação e da comunicação, sociologia, psicologia, ciências políticas, e assim por diante. Este artigo parte do conceito de editorialização para propor uma teoria filosófica do mundo na era digital. The “digital turn” has been the object of many disciplinary interpretations: from media studies to the information and communication sciences, sociology, psychology, political sciences, and so on. This paper starts from the concept of editorialisation to propose a philosophical theory of the world in the digital age. El “giro digital” ha sido objeto de muchas interpretaciones en diferentes disciplinas: desde los estudios de los medios de comunicación hasta las ciencias de la información y la comunicación, pasando por la sociología, la psicología y la ciencia política. Este artículo parte del concepto de editorialización para proponer una teoría filosófica del mundo en la era digital.

pt , en , es

Clinical reasoning underlying acute care occupational therapists' assessment of rehabilitation potential after stroke or brain injury : a constructivist grounded theory study

Introduction In acute care hospitals, clinicians are expected to rapidly provide recommendations regarding patients' rehabilitation potential and candidacy for postacute rehabilitation. Some studies have investigated factors influencing referral to rehabilitation, but few have examined clinical reasoning underlying referral decisions. This study aimed to investigate what occupational therapists were thinking about (factors influencing reasoning), how they reasoned (thought processes) when evaluating stroke or traumatic brain injury patients' rehabilitation potential, and how they decided on referral to postacute rehabilitation. Methods Using a constructivist grounded theory approach, the clinical reasoning of 10 acute care occupational therapists working in a large Canadian city was examined. Participant recruitment, data collection, and analysis were performed simultaneously following theoretical sampling procedures. Therapists' thoughts on patients' rehabilitation potential were collected twice (during chart consultation and initial patient assessment) using think-aloud protocols and semi-structured interviews. Constant comparison, memoing, and diagramming methods were employed during coding to help categorisation and conceptualisation. Findings Numerous patient, clinician, and organisation-related factors were found to influence clinical reasoning. Occupational therapists interpreted these factors in an attempt to (1) predict recovery, (2) estimate rehabilitation potential, and (3) determine rehabilitation candidacy. They used two types of thought processes: (1) building a representation of patients' rehabilitation potential (involving eight steps including gathering and interpreting factors); (2) activating bottom-up and top-down scripts (comparing the expected impact of impairments on activity performance to behaviours observed during activity performance). Furthermore, an algorithm was developed describing how occupational therapists decide on referral to postacute rehabilitation. Conclusion Findings can be used to teach students and novice occupational therapists how to identify and interpret key factors in the assessment of stroke or traumatic brain injury patients' rehabilitation potential. Results also provide insight on cognitive processes that can be taught for efficient assessment of rehabilitation potential and decision-making regarding referral to postacute rehabilitation.

en

A qualitative study of health care providers’ uptake of the Project Extension for Community Health Outcomes (ECHO) for chronic pain

Introduction: There is an enormous need for pain education among all health care professions before and after licensure. The study goal was to explore generic and chronic pain–specific factors that influenced uptake of a continuous education program for chronic pain, the Project Extension for Community Health Outcomes (ECHO) CHUM Douleur chronique. Methods: The study team conducted 20 semistructured virtual interviews among participants of the program. Interviews were transcribed verbatim, and two analysts used a reflexive thematic analysis approach to generate study themes. Results: Five aspects facilitating engagement, continued participation, and uptake of the Project ECHO were identified: rapid access to reliable information, appraising one’s knowledge, cultivating meaningful relationships, breaking the silos of learning and practice, and exponential possibilities of treatment orchestrations for a complex condition with no cure. Although participants’ experiences of the program was positive overall, some obstacles to engagement and continued participation were identified: heterogeneity of participants’ profiles, feelings of powerlessness and discouragement in the face of complex incurable pain conditions, challenges in applying recommendations, medical hierarchy, and missed opportunity for advocacy. Discussion: Many disease-specific and contextual factors contributed to an increased motivation to participate in the ECHO program. Some elements, such as the complexity of diagnosis and treatment, and the multidisciplinary requirements to manage cases were identified as elements motivating one’s participation in the program but also acting as a barrier to knowledge uptake. These must be understood in the broader systemic challenges of the current health care system and lack of resources to access allied health care.

en

The Stressful characteristics of pain that drive you N.U.T.S. : a qualitative exploration of a stress model to understand the chronic pain experience

Objective: Despite decades of research on the identification of specific characteristics of situations that trigger a physiological stress response (novelty, unpredictability, threat to the ego, and sense of low control [NUTS]), no integrative research has examined the validity of this framework applied to pain experiences. This study aimed to 1) explore the stressful characteristics of pain among individuals living with chronic pain and 2) examine whether the NUTS framework comprehensively captures the stressful nature of pain. Subjects: Participants were 41 adult participants living with chronic pain. Methods: Interviews in six focus groups were conducted in French using a semistructured interview guide. Participants first discussed how pain is stressful. Then, they were introduced to the NUTS framework and commented on the extent to which it captured their experience. The verbatim transcriptions of interviews were reviewed using reflexive thematic analysis. Analyses were conducted in French; quotes and themes were translated into English by a professional translator. Results: The pain-NUTS framework adequately captured participants' experiences. Multiple aspects of pain (pain intensity fluctuations, pain flare-up duration, pain quality and location, functional limitations, diagnosis and treatment) were associated with one or more stress-inducing characteristics. In addition, a second layer of meaning emerged in the context of chronic pain that provided contextual information regarding when, how, and why pain became more or less stressful. Conclusions: The NUTS characteristics seem to offer a comprehensive framework to understand how pain and its context of chronicity can be a source of stress. This study provides preliminary support for the pain-NUTS framework to allow the formal integration of pain and stress research

en

Predictors of long-term opioid effectiveness in chronic non-cancer pain patients attending multidisciplinary pain treatment clinics : a Quebec pain registry study

Objective: This study aimed at identifying characteristics of individuals who are most likely to benefit from long-term opioid therapy in terms of reduction in pain severity and improved mental health-related quality of life (mQoL) without considering potential risks. Methods: This was a retrospective cohort study of 116 patients (age=51.3 ±12.5 years, male=42.2%) enrolled in the Quebec Pain Registry between 2008 and 2011 and who initiated opioid therapy after their first appointment in a multidisciplinary pain clinic and persisted with this treatment for at least 12 months. Clinically significant improvement was defined as a 2-point decrease on the PEG 0-10 Scale of pain severity at 12-month follow-up and a 10-point increase on the SF-12v2 Mental Health-Related Quality of Life Summary Scale which corresponds to one standard deviation of the mean in the general population (Mean = 50, SD = 10). Results: Clinically significant reduction in pain severity was observed in 26.7% of patients while improvement in mQoL was reported by 20.2% of patients on long-term opioid therapy. Older age (OR=1.04 (95% CI: 1.0 – 1.08), p=0.032) and alcohol or drug problems (OR=0.26 (95% CI: 0.07 – 0.96), p=0.044) were weakly associated with pain severity at 12-month follow-up. Baseline higher pain severity (OR=0.62 (95% CI: 0.43 – 0.91), p=0.014) and baseline higher mQoL (OR=0.89 (95% CI: 0.83 – 0.95), p=0.001) were associated with non-improvement in mQoL. Conclusion: The analysis failed to identify clinically meaningful predictors of opioid therapy effectiveness making it difficult to inform clinicians about which CNCP patients are most likely to benefit from long-term opioid therapy.

en

Remembering the pain of surgery 1 year later : a longitudinal examination of anxiety in children's pain memory development

Children who develop greater negatively-biased recall of pain (ie, recalled pain is higher than the initial pain report) following surgery are at risk for developing chronic pain; therefore, identifying risk factors for the development of biased pain memories is important. Higher anxiety has been implicated in the development of greater negatively-biased recall of pain; however, studies have not examined anxiety at multiple time points before and after a surgery and its relationship to children's postsurgical pain memories after 1 year. This prospective study examined a cohort of 237 children and adolescents undergoing major surgery. Anxiety sensitivity, pain catastrophizing, and pain anxiety were assessed at baseline, 48 to 72 hours after surgery, and at 6- and 12-month follow-ups. Pain intensity at rest, movement-evoked pain intensity, and pain unpleasantness were assessed daily in hospital. Memories for pain were elicited via telephone 1-year post surgery. Findings revealed that children who had higher levels of anxiety at baseline and 48 to 72 hours after surgery developed greater negatively-biased recall of pain intensity 12 months after surgery. Specifically, higher anxiety sensitivity at baseline and greater tendencies to catastrophize about pain at baseline and in the immediate acute recovery phase were most strongly linked to greater negatively-biased recall of pain. Greater negatively-biased recall of pain was related to higher pain intensity at 6 and 12 months post surgery. Findings support conceptual models of anxiety and pain memory biases and can inform intervention efforts to reduce anxiety in the pre- and post-op periods to minimize negative biases in pain memories.

en

Examination of the course of low back pain intensity based on baseline predictors and health care utilization among patients treated in multidisciplinary pain clinics : a Quebec Pain Registry study

Objectives The study objectives were to identify baseline predictors of low back pain severity changes over a one-year period among patients attending multidisciplinary tertiary clinics and determine whether health care utilization impacts this outcome. Methods This is a retrospective cohort study using the Quebec Pain Registry (QPR). A total of 686 low back pain (LBP) patients (55.8% females, mean age = 56.51 ± 14.5 years) from the QPR were selected for this study. Patients completed self-report questionnaires and nurse-administered questionnaires before their first appointment at a multidisciplinary pain treatment center. Analysis was conducted using a linear growth model. Results There was a modest (10%) improvement in pain severity scores over a 12-month period. Pain catastrophizing and depressive symptoms predicted higher baseline levels of pain severity (P < 0.001). Having used self-management approaches over the past six months was associated with higher levels of pain severity at 12 months (P < 0.001). Discussion Results from this study showed no clear pattern of association between the use of different treatment disciplines and pain severiy over the first year after multidisciplinary treatment intervention. These results raise an important question as to the best way of utilizing scarce multidisciplinary resources to optimize cost-effectiveness and improve outcomes among complex, chronic LBP patients.

en

Self-reported weight loss attempts and weight-related stress in childhood : heightening the risk of obesity in early adolescence

Objective Weight loss attempts occur as early as childhood. The impacts of weight loss attempts and weight-related stress on the occurrence of obesity during childhood remain unknown. We aimed to: (a) assess the prevalence of self-reported weight loss attempts and weight-related stress in 8–10 year-old children and (b) determine associations with adiposity 2 years later. Method Data were collected from a cohort study of 564 Canadian children aged 8–10 years, having one or both biological parents with obesity (Quebec Adipose and Lifestyle Investigation in Youth cohort). Self-reported weight loss attempts and weight-related stress were assessed at baseline in the child's questionnaire. Adiposity was measured at baseline and 2 years later using body mass index z-scores (zBMI), waist-to-height ratio (WHtR), and percentage of body fat (%BF) obtained from dual-energy x-ray absorptiometry. Linear and logistic regression analyses were used while adjusting for potential confounders. Results Forty-eight percent of children reported previous weight loss attempts and 20% reported weight-related stress. Self-reported weight loss attempts and weight-related stress were associated with higher zBMI, WHtR, and %BF 2 years later in adjusted models, although estimates were attenuated when including baseline adiposity measures. Self-reported weight loss attempts, but not weight-related stress, increased the risk of becoming overweight among children who were normal weight at baseline. Discussion Weight loss attempts are prevalent in children with parental obesity. Children reporting weight loss attempts and weight-related stress tend to have higher adiposity 2 years later and are more likely to become overweight.

en

Assurer la pérennité d’immeubles locatifs des années 1960 à Montréal

Les années 1960 ont marqué la ville de Montréal et ont participé considérablement à l’ancrage de son identité. La quantité impressionnante d’habitations locatives construites à cette époque pour répondre à l’insalubrité des quartiers populaires nous laisse un parc immobilier important peu reconnu et négligé. Ces habitations sont intéressantes aux niveaux social et culturel, tout d’abord parce que les loyers sont abordables et parce qu’elles ont une identité singulière représentative du courant moderne propre à Montréal. Dans ce contexte, la présente recherche porte sur l’approche à prioriser pour assurer la pérennité et augmenter la reconnaissance de cette typologie. Les objectifs principaux sont de démocratiser l’accès aux enjeux patrimoniaux, de déstigmatiser les locataires et l’architecture de ces habitations en plus de faire avancer les connaissances méthodologiques de la mise en valeur du cadre bâti. Dans le but de mieux comprendre le concept de pérennité en architecture et la qualité sociale de la typologie, le cadre théorique est basé sur les notions patrimoniales et la notion complexe de l’habiter. La gestion du patrimoine par les valeurs et la place identitaire du patrimoine dans les sociétés contemporaines théorisées par le Getty Conservation Institute, Françoise Choay et France Vanlaethem confirment la pertinence du sujet de recherche. Les écrits de Perla Serfaty-Garzon et de Thierry Paquot sur l’expérience d’habiter et l’importance de l’attachement au chez-soi dans le développement personnel de l’habitant appuient la qualité fonctionnelle des habitations. Les entretiens semi-dirigés avec les professionnels et l’affichage thématique démontrent que chaque méthode est pertinente à différents niveaux en fonction du résultat souhaité. Ainsi, la pérennité des habitations dans la mémoire collective est possible par un travail de sensibilisation et de verbalisation ainsi que par la réalisation d’un inventaire. Une approche communicative, centrée sur le partage d’expériences, d’avis et de différents points de vue, favorise une approche dynamique de la mise en valeur du cadre bâti. Cette approche communicative rend également accessible à un plus grand public une compréhension des enjeux architecturaux contemporains. Au terme de l’étude, il semble possible de réduire les préjugés auxquels font face les habitations et leurs locataires. Pour ce faire, il faut un travail considérable de sensibilisation aux qualités architecturales des bâtiments, leur place dans l’identité caractéristique de Montréal et de partager les propos des locataires sur leur attachement au logement et leur appropriation du lieu. Finalement, la recherche démontre qu’il est pertinent de conserver certaines habitations locatives des années 1960 emblématiques en s’appuyant sur les valeurs patrimoniales, dont la valeur sociale, culturelle et architecturale. The Sixties made a mark on the City of Montreal and significantly contributed to the definition of its identity. The considerable amount of rental housing developed in that time as a response to decrepitude issues which paralyzed working-class neighborhoods leaves us with many neglected and undervalued buildings. Those buildings are of interest for both their social and cultural contexts; first, because the apartments are affordable and second, because they are representative of the modern movement for which Montreal is globally recognized. In this context, the research project aims to better understand which approach would be suitable in order to ensure the sustainability and increase in recognition of this type of building. The main goals are to democratize the access to building heritage issues, to destigmatize the tenants and the architecture of those buildings and to advance the methodological knowledge on how to raise awareness and appreciation towards the built environment. In order to better understand the core concepts of sustainability in architecture and the social quality of the buildings, the theoretical framework is based upon building heritage notions and the complex notion of dweling. The built heritage fundamentals, by the analysis of the work of Aylin Orbasli and Françoise Choay; who tackle the approach of value-based management of the built heritage and the core place of heritage in the definition of the identity of contemporary societies; confirms the relevance of the research subject. Publications by Perla Serfaty-Garzon and Thierry Paquot on the experience of dweling and the importance of home attachment in the personal development of the inhabitant confirms the functional quality of the housing buildings. The semi-structured interviews with professionals and the thematic display of the research demonstrates that every method used is relevant at different levels, depending on the expected outcome. Thus, it is likely that the sustainability of some housing buildings from the Sixties is feasible by a sensibilization and verbalization campaign and by developing an extensive inventory. A communicative approach centered on the sharing of experiences, opinions and points of views promotes a dynamic approach to build heritage and the built environment. This approach also facilitates access to contemporary architectural issues to a wider audience. In retrospect, it seems possible to reduce the stigma toward tenants and the buildings themselves. To achieve this, considerable work is needed to raise awareness of the architectural qualities of the buildings, their place in the identity of Montreal and promote the tenants’ point of view of their attachment and approval of the apartments. Finally, the research shows that it is relevant to preserve some iconic housing buildings from the Sixties based on heritage values, including social, cultural, and architectural values.

fr , en

Video game design for empathy : a better understanding of game mechanics and player interactions

La recherche scientifique sur les jeux vidéo s'est longtemps concentrée sur l'impact de ceux-ci sur le niveau d'agressivité des joueurs, avec un accent mis sur le contenu des jeux. Initialement perçus comme ayant une influence négative par le public et même un certain nombre de chercheurs, des résultats plus récents montrent que les jeux vidéo provoquent une expérience cathartique plutôt que directement stimulante. La motivation principale derrière la recherche ici présente est la possibilité d'employer des jeux vidéo pour développer l'empathie et autres comportements pro-sociaux. En effet, des études récentes montrent que les mécanismes d'interactions entre les joueurs (plutôt que le contenu du jeu en question) ont un impact certain sur leur comportement futur. Or, ces mécanismes sont généralement un sous-produit du mode de jeu visé, ils sont régis par une interaction émergente. On propose que, en appliquant des principes de design qui sont déjà appliqués dans d'autres objets ludiques (i.e. les jeux de société thérapeutiques), à la conception de jeux vidéo, un effet positif et durable pourrait être obtenu au sujet des comportements pro-sociaux des joueurs. Ainsi, en joignant des éléments narratifs et visuels à un mode de jeu qui promeut l'empathie, on pourrait transformer l'expérience traditionnelle du jeu en un outil psycho-pédagogique important. Une analyse d'un jeu vidéo commercial à travers la lentille du cadre théorique développé ici donne un aperçu de ce qui se fait actuellement dans l'industrie et de ce qui peut être fait pour améliorer davantage la conception de jeux vidéo. Research regarding video games has long focused on the effects they have on the aggression levels of the players, with an emphasis on the content of games. These effects have generally been regarded as negative by early researchers and the general public, even though more recent findings have shown that they have a cathartic effect rather than pure arousal on the player’s emotions. The main motivation behind this work is the potential positive effects video games may have on empathy and other prosocial behaviours. Recent studies on video games have shown that the interactions between players and other social components present while playing have a greater influence on the players future behaviour than the content of the game. These interactions are often a by-product of the intended play patterns such as cooperative gameplay and are very few times elicited intentionally by the designers. It is proposed that by applying design principles that are currently present in other ludic artefacts, such as therapeutic board games, to the design of video game mechanics, a positive and lasting effect on the players prosocial behaviours can be achieved. Game mechanics that compel players to interact in positive ways in coordination with narrative and visual components have the potential to transform the ludo-narrative experience of video games into powerful psycho-educational tools to improve the development of empathy and other prosocial behaviours in children. An analysis of a commercially available video game through the lens of the theoretical framework developed here provides insight into what is currently done in the industry and what can be done to improve video game design further.

fr , en

L’ethnographie au service du design de jeux : observation et analyse du programme d’études supérieures en design de jeux

Le design de jeux est une discipline en plein essor, dont les progrès technologiques et théoriques ne cessent de se perfectionner. L’évolution rapide de la sphère ludique oblige une constante adaptation de la part de cette discipline, autant au niveau professionnel que académique. Il est important de se questionner quant aux impacts de cette évolution sur les programmes de formation en design de jeux. Les programmes se spécialisant dans ce domaine doivent s’adapter en temps réel afin de former des praticiens plus près des attentes et des pratiques retrouvées sur le marché du travail contemporain. En s’appuyant sur le modèle de la recherche ethnographique et phénoménologique en design, l’objectif de l’étude est d’apporter un nouvel éclairage sur la pratique de l’enseignement du design de jeux. Nous observons plus attentivement les apprenants du D.E.S.S. en design de jeux de l’Université de Montréal lors de la réalisation de leur projet de fin d’études, dont l’objectif est la création d’un prototype vidéoludique fonctionnel. Notre approche est de nature qualitative, d’inspiration phénoménologique: nous avons recueilli l’expérience pédagogique de sept étudiants designers ainsi que de deux enseignants. Par l’intermédiaire de l’observation non participante, de carnets de bords, d’entretiens semi-dirigés et de groupes de discussion, il a été possible d’analyser l’expérience en action des participants. Une attention significative est portée à l’égard des différents phénomènes rencontrés par les étudiants lors du processus de conception, de création et de production du projet de fin d’études. Nos résultats tentent de dépeindre, le plus fidèlement possible, l’expérience pédagogique des participants de la cohorte 2019-2020. L’analyse met en perspective les forces ainsi que les insuffisances du contexte pédagogique. L’interprétation a permis l’identification de plusieurs phénomènes et thématiques récurrentes tout au long de l’étude. La conclusion de la recherche mène vers des pistes recommandations prospectives qui concernent le contexte socioculturel, la motivation, le travail d’équipe ainsi que l’encadrement en situation de projet. The field of video game design is constantly evolving seeing rapid change both in game design theory and technology as the video game industry matures as a whole. This rapid progress requires game design professionals to constantly evolve and adapt to remain pertinent on the market. Thus, it is important to consider the impact of such rapid growth on the academic platform that seeks to support it by providing the industry with qualified graduates ready to meet the ever-growing expectations of employers. Using the ethnographic and phenomenological research models, the objective of the present study is to bring new understanding of the teaching practices of game design by following students through their final project. Consisting in designing and developing a functioning video game prototype, the final project offers the author of this study a unique perspective into the design processes and strategies adopted by the students over the course of the production. Based on the qualitative approach of the phenomenological research model, this study compiled the experiences of seven design students and two teachers through non-participatory observation, logbooks, semi-structured interviews and focus groups. Through the observations gathered on the field, this study aims to faithfully portray the academic experiences of the students of class 2019-2020. The analysis of the data collected highlights the strengths of the educational experience as well as underlines its inadequacies and shortcomings which, in turn, lead to reflexive recommendations concerning the sociocultural context, motivation, teamwork, training and pedagogy within a project-based context.

fr , en

Palaeoepidemiological analysis of a historical urban population from Montréal : exploring the interactions between vitamin D deficiency and various palaeopathological skeletal manifestations

La vitamine D occupe de nombreuses fonctions dans la régulation de divers systèmes affectant le corps entier. Une déficience de cette hormone peut donc affecter plusieurs systèmes essentiels (ex. squelettique, dentaire, immunitaire) et peut laisser des lésions repérables sur le squelette et les dents. Au cours de la Révolution industrielle, plusieurs facteurs environnementaux ont probablement contribué à l’augmentation des cas de déficience en vitamine D. Ainsi, la majorité des études portant sur la déficience en vitamine D se sont concentrées sur des populations européennes du XIXe siècle. Au Canada, pour la même époque, la fréquence de ce type de maladie métabolique n’a pas été explorée en profondeur. De plus, les possibles interactions entre déficience en vitamine D et autres maladies ont été peu explorées jusqu’à maintenant. Afin de pallier cette lacune, la présente étude se concentre sur une population euroquébécoise (cimetière St-Antoine, Montréal (1799-1854)), explorant la fréquence et prévalence de diverses lésions et conditions pathologiques, en plus d’évaluer leur influence sur les catégories d’âge et de sexe. Plus précisément, cette recherche investigue le possible lien entre la présence de cas de déficience vitamine D durant l’enfance et la détérioration de l’état de santé plus tard au cours de la vie, en plus de l’évolution temporelle des cas au sein du cimetière St-Antoine en lien avec le phénomène d’industrialisation. Au total, 52 individus (8 non adultes, 44 adultes) issus du cimetière urbain St- Antoine à Montréal ont été étudiés. Les données collectées sont de nature empirique et ont été acquises selon les trois phases suivantes : i) l’inventaire squelettique de base (sexe, âge au décès), ii) les observations macroscopiques et radiographiques des lésions pathologiques pour chaque squelette; iii) et l’analyse histologique de tissus dentaires sélectionnés afin d’explorer la présence ou l’absence de dentine interglobulaire (DIG). Les résultats indiquent une proportion élevée de DIG durant l’enfance indiquant une déficience en vitamine D, c’est-à-dire 44% (23/52) à 75% (39/52), excluant et incluant le degré 1 de DIG, respectivement. La majorité de ces épisodes de déficience se sont produits à ou à partir de la naissance, allant jusqu’à trois ans (63%, n=33/52), et 12% des individus (n=6/52) présentent des épisodes prénataux de DIG, ce qui soulève la question de la déficience maternelle et de l’influence des facteurs culturels. La présence de DIG durant l’enfance n’est corrélée ni aux paramètres démographiques ni à une détérioration de l’état de santé plus tard au cours de la vie de l’individu. Un possible lien a été soulevé entre les degrés plus sévères de DIG et l’hypoplasie dentaire. Le nombre d’épisodes de DIG durant l’enfance semble diminuer avec le temps, contrairement à ce qui pourrait être attendu d’une population en voie d’industrialisation. Toutefois, ce résultat doit être considéré avec prudence en raison de la faible portion de l’échantillon provenant des aires plus récentes du cimetière. Vitamin D has many functions in the regulation of various systems affecting the whole body. A deficiency of this hormone thus affects many essential systems (e.g. skeletal, dental, immune) and can leave visible lesions on the skeleton and teeth. During the Industrial Revolution, various environmental factors probably contributed to an increase in vitamin D deficiency. Therefore, most studies on vitamin D deficiency have been conducted on European skeletal samples dated to the 19th century. However, the frequency of this type of metabolic disease has not been explored extensively in Canada for the same period. Furthermore, in palaeopathology, the possible interactions between vitamin D deficiency and other diseases have only been poorly explored. To fill this gap, the present study focuses on an historic Euro-Quebecois population (St. Antoine cemetery, Montréal (1799-1854), exploring the frequency and prevalence of pathological lesions and conditions as well as their possible influence on the age and sex categories. More precisely, are investigated the possible link between the occurrence of vitamin D deficiency cases during infancy and health deterioration later in life, as well as the temporal evolution of the cases within the St. Antoine cemetery in relation to the industrialization process. In total, 52 individuals (8 nonadults, 44 adults) from the St. Antoine urban cemetery were used for the study. The data collected during the research is of an empiric nature and was acquired following three steps: i) the basic skeletal inventory (sex, age-at-death); ii) the macroscopic and radiographic observations of the pathological lesions on the skeletons; iii) and the histological examination of selected dental tissues to assess the presence of interglobular dentin (IGD). The results indicate a high prevalence of IGD during infancy indicative of vitamin D deficiency, i.e. 44% (23/52) to 75% (39/52), excluding and including the degree 1 of IGD, respectively. The majority of these episodes occurred at or from birth to up to three years-old (63%, n=33/52) and 12% of the individuals (n=6/52) presented prenatal IGD episodes, raising questions about maternal deficiencies and cultural influences. The presence of IGD during infancy was not correlated with demographic parameters, nor with health status deterioration later in life. A possible link was recorded between the presence of more severe degrees of IGD and LEH. The number of IGD cases during infancy seems to decrease with time, contrary to what might be expected of an industrializing population. However, this result must be taken with caution because of the small portion of the sample coming from the more recent parts of the cemetery.

fr , en

La programmation informatique à l’école primaire : pratiques effectives de programmation et mobilisation d’habiletés de résolution collaborative de problèmes (RCP)

L’objectif de cette recherche doctorale est de décrire et comprendre les effets de la programmation informatique sur l’apprentissage et la mobilisation de compétences d’élèves du primaire. Notre intérêt pour ce phénomène se justifie sous deux considérations : d’abord, la programmation est une activité qui a connu une démocratisation au cours des dernières années, notamment dans le milieu scolaire. Puis, en ce qui concerne la résolution collaborative de problèmes (RCP), il s’agit de compétences appartenant à ce que certains appellent les compétences du 21e siècle (voir notamment Chalkiadaki, 2018; van Laar et al., 2017), et que d’autres appellent les compétences du futur (Conseil des compétences futures, 2020; Gouvernement du Canada, 2020). Les recherches empiriques menées en contextes authentiques de classe sont très peu nombreuses dans la littérature (Lye et Koh, 2014), ce qui atteste pour nous la nécessité de porter un regard contemporain et imprégné des nouvelles tendances technopédagogiques sur ce phénomène d’envergure internationale. Les principaux référents conceptuels sont associés au champ de l’apprentissage collaboratif à l’aide de l’ordinateur (en anglais le Computer-supported collaborative learning, CSCL), un champ dont nous citons plusieurs travaux réalisés dans les années 1990 (Koschmann et al., 1996; Scardamalia et Bereiter, 1994). Il nous a permis d’aborder les aspects techniques (programmation, ordinateur), sociaux (interactions, médiatisation) et pédagogiques (apprentissage, développement de compétences) du phénomène que nous souhaitions étudier. À l’aide d’un devis qualitatif et interprétatif de type étude de cas multiples, nous avons mis en place un scénario pédagogique dans trois écoles primaires au Québec. Amenant les élèves à découvrir graduellement les concepts fondamentaux de la programmation informatique, le scénario Deviens un maître NAO mise sur la programmation visuelle et tangible pour mobiliser, voire développer, un ensemble d’habiletés et de compétences, tant transversales que disciplinaires. Une série de 20 niveaux sont proposés aux élèves, qui doivent réaliser des programmes ayant pour but d’animer un robot humanoïde nommé NAO. Le premier cas a été observé dans une école alternative de Montréal. Les élèves (n=29) ont été séparés en équipes multiniveau, ce qui a amené la collaboration d’élèves d’âges et de niveaux scolaires différents. Les cas 2 à 5 ont été étudiés dans une école de Montréal et présentent des élèves de quatrième, cinquième et sixième année (n=70). Enfin, le dernier cas se situait dans une classe de cinquième année de la grande région de Québec (n=10). Plusieurs de ces élèves ont des difficultés d’apprentissage ou sont en situation de handicap. Nous avons observé les pratiques effectives de programmation ainsi que la mobilisation des compétences de RCP à l’aide d’un appareillage méthodologique considérable : (a) une caméra filmant l’activité des élèves dans leur environnement immédiat, (b) la caméra intégrée de l’ordinateur qui filmait le visage des élèves et leurs interactions verbales, et (c) l’enregistrement de l’écran d’ordinateur que les élèves utilisaient pour faire la programmation visuelle et tangible du robot NAO. Nous avons ensuite utilisé ce corpus de données vidéos pour déterminer une typologie des pratiques effectives de programmation d’élèves du primaire, pour créer une grille d’observation de la RCP à partir d’observations empiriques et authentiques et pour comprendre le processus de RCP dans le cadre d’une activité de programmation au primaire. Parmi les principaux résultats, nous proposons une typologie des pratiques de programmation visuelle fortement basée sur nos observations empiriques, ce qui l’ancre fortement dans la réalité du terrain de recherche. Puis, nous avons également été en mesure de concevoir une grille d’observation de la RCP en nous appuyant sur les travaux scientifiques antérieurs et, surtout, sur nos observations empiriques. Cette grille, présentant 3 dimensions et 15 indicateurs, permet d’observer les processus et habiletés mis en œuvre par les élèves de façon collaborative. Enfin, l’utilisation de cette grille a mené à l’analyse systématique et compréhensive de la façon dont les élèves parvenaient à compléter les activités de programmation de façon collaborative. Nous soulignons d’une part la prépondérance de certaines habiletés (échanges à propos du problème, attribution explicite ou implicite des rôles, vérification des solutions, etc.), et d’autre part la faible mobilisation d’habiletés comme l’adaptation des interventions, l’identification des forces et des faiblesses et la vérification des actions. The objective of this doctoral research is to describe and understand the effects of computer programming on the learning and mobilization of skills of elementary school students. Our interest in this phenomenon is justified by two considerations: first, programming is an activity that has been democratized in recent years, especially in the school environment. Second, with respect to collaborative problem solving (CPS), these are skills that belong to what some call 21st century skills (see, for example, Chalkiadaki, 2018; van Laar et al., 2017), and others call future skills (Future Skills Council, 2020; Government of Canada, 2020). Empirical research conducted in authentic classroom contexts is very scarce in the literature (Lye and Koh, 2014), which attests to the need for us to take a contemporary look at this international phenomenon, infused with new techno-pedagogical trends. The main conceptual referents are associated with the field of Computer-supported collaborative learning (CSCL), a field from which we cite several studies conducted in the 1990s (Koschmann et al., 1996; Scardamalia and Bereiter, 1994). It allowed us to address the technical (programming, computer), social (interactions, mediatization) and pedagogical (learning, skill development) aspects of the phenomenon we wanted to study. Using a qualitative and interpretative multiple case study design, we implemented a pedagogical scenario in three elementary schools in Quebec. By gradually introducing students to the fundamental concepts of computer programming, the Become a NAO Master scenario relies on visual and tangible programming to mobilize and even develop a set of skills and competencies, both transversal and disciplinary. A series of 20 levels are offered to students, who must create programs to animate a humanoid robot named NAO. The first case was observed in an alternative school in Montreal. The students (n=29) were separated into multi-level teams, which led to the collaboration of students of different ages and grade levels. Cases 2-5 were studied in a Montreal school and featured students in grades 4, 5, and 6 (n=70). Finally, the last case was in a fifth grade class in the greater Quebec City area (n=10). Many of these students have learning difficulties or disabilities. We observed the effective programming practices as well as the mobilization of CPR skills using a considerable methodological apparatus. Indeed, for each team in each class, we had: (a) a camera filming students' activity in their immediate environment, (b) the computer's built-in camera that filmed students' faces and verbal interactions, and (c) the recording of the computer screen that students used to do the visual and tangible programming of the NAO robot. We then used this video data set to determine a typology of elementary students' effective programming practices, to create a CPS observation grid based on empirical and authentic observations, and to understand, using the created grid, the process of CPS in an elementary programming activity. Among the main results, we propose a typology of visual programming practices strongly based on our empirical observations, which anchors it strongly in the reality of the research field. Then, we were also able to design a CPS observation grid based on previous scientific works and, above all, on our empirical observations. This grid, presenting 3 dimensions and 15 indicators, allows us to observe the processes and skills implemented by the students in a collaborative manner. Finally, the use of this grid led to a systematic and comprehensive analysis of the way in which students managed to complete programming activities in a collaborative manner. On the one hand, we note the preponderance of certain skills (exchanges about the problem, explicit or implicit assignment of roles, verification of solutions, etc.), and on the other hand, the weak mobilization of skills such as adapting interventions, identifying strengths and weaknesses, and verifying actions.

fr , en

Deciphering the role of Ankle2 during mitotic exit

La progression mitotique est principalement régulée par la phosphorylation et la déphosphorylation des protéines. La kinase dépendante des cyclines liée à la cycline B (Cdk1 - cycline B) et d'autres kinases phosphorylent une myriade de protéines pour promouvoir l’entrée à la mitose. Ces phosphorylations sont réversées par les phosphatases lors de la sortie mitotique. La protéine phosphatase 2A avec sa sous-unité régulatrice B55 (PP2A-B55) est une des principales phosphatases neutralisant les phosphorylations par Cdk1. Dans ce projet, nous avons vu que Ankle2 participe à la sortie de la mitose. En utilisant D. melanogaster comme modèle puissant, nous avons observé que Ankle2 est important pour le recrutement des protéines BAF et Lamin associées à l'enveloppe nucléaire (NE) à la télophase, assurant la formation d'un seul noyau. In vivo, nos résultats indiquent que Ankle2 est crucial pour le développement de l'embryon de drosophile, car les embryons ARNi Ankle2 sont arrêtés lors de la première mitose. Pour amorcer l’étude des mécanismes moléculaires par lesquels Ankle2 remplit ces foncions, nous avons identifié ses partenaires d’interactions. Nous avons constaté que Ankle2 est associé à une forme active de PP2A, suggérant Ankle2 comme une sous-unité régulatrice potentielle de PP2A. De plus, Ankle2 forme un complexe avec la cycline B et les Cdks mitotiques, et nos résultats génétiques suggèrent que les deux protéines peuvent avoir des rôles opposés. Nous avons également découvert que Ankle2 interagit avec la protéine du réticulum endoplasmique (ER) Vap33 à travers son motif FFAT. Dans ce projet, nous avons constaté que Ankle2 est une protéine associée au ER chez la drosophile qui est cruciale pour la complétion de la mitose, et que pourrait réguler l'activité des kinases et phosphatases mitotiques. Cette étude servira de base pour déchiffrer les mécanismes moléculaires précis par lesquels Ankle2 favorise la sortie de la mitose. Protein phosphorylation and dephosphorylation is one of the mechanisms that regulates mitotic progression. Cyclin dependent kinase 1 bound to cyclin B (Cdk1 – cyclin B) and other kinases phosphorylate a myriad of proteins to promote early mitotic events. These phosphorylations are reversed by phosphatases during mitotic exit. The Protein Phosphatase 2A with its regulatory subunit B55 (PP2A-B55) is the major phosphatase counteracting Cdk1 phosphorylations. In this project, we have found that Ankle2 participates in mitotic exit. Using D. melanogaster as a model, we have found that Ankle2 is important for the Nuclear Envelope (NE)-associated proteins BAF and Lamin recruitment at telophase, ensuring the formation of a single nucleus. In vivo, we have found that Ankle2 is crucial for Drosophila embryo development, as RNAi Ankle2 embryos are arrested in the first mitosis. To study the molecular mechanisms by which Ankle2 promotes mitotic exit, we identified its interacting partners. We found that Ankle2 is associated with an active form of PP2A, suggesting Ankle2 as a potential regulatory subunit of PP2A. Moreover, Ankle2 engages in a complex with cyclin B and mitotic Cdks, and our genetic results suggest that Ankle2 and mitotic cyclin – Cdk complex may have opposite roles. We have also found that Ankle2 interacts with the Endoplasmic-Reticulum (ER) protein Vap33 through its FFAT motif. In this project, we have found that Ankle2 is an ER-associated protein in Drosophila that is crucial for completion of mitosis, probably regulating the activity of mitotic kinases and phosphatases. This study will serve as a basis to decipher the precise molecular mechanisms by which Ankle2 promotes mitotic exit.

fr , en

Links between abnormal lipid metabolism and inflammation in Alzheimer’s disease

La recherche sur la maladie d’Alzheimer (MA) est concentrée, en grande partie, sur l’étude de ses principales caractéristiques histologiques, les plaques β-amyloïdes (Aβ) et les enchevêtrements neurofibrillaires. Cependant, les thérapies ciblant directement ces caractéristiques n’empêchent pas la progression de la MA. En plus de ces caractéristiques, la génétique a mis en évidence l’implication du métabolisme des lipides et de la réponse immunitaire dans la MA. Les perturbations du métabolisme lipidique est le prédicteur génétique le plus puissant du développement de la MA, mais ses mécanismes restent un mystère. Des travaux récents dans notre laboratoire ont montré que les triglycérides s’accumulent dans le cerveau des patients atteints de MA et des souris 3xTg, un modèle murin de la MA. Chez les souris 3xTg, ces triglycérides sont enrichis en acide oléique (AO), un acide gras monoinsaturé, et l’inhibition de l’enzyme de synthèse de l’AO, le stéaryle-CoA désaturase (SCD), réduit leur accumulation et contrecarre la perte précoce de la neurogenèse hippocampique et les troubles de mémoire. Nous avons donc testé si l’inhibition de la SCD peut inverser les changements dans le transcriptome et rétablir la fonction de l’hippocampe chez les souris 3xTg symptomatiques. En comparant aux souris contrôles, l’hippocampe de souris 3xTg possède des altérations transcriptomiques impliquées dans les processus reconnus pour être perturbés dans la MA. Leur hippocampe a également montré une baisse significative des épines dendritiques. De manière remarquable, les données de séquençage de l’ARN montrent que le traitement des souris 3xTg pendant un mois avec un inhibiteur de la SCD a sauvé des gènes liés à l’immunité et aux synapses. Les analyses tissulaires ont révélé que ce traitement a conduit à des améliorations de la densité des épines dendritiques. Nous avons également établi un modèle de microglie en culture et nos données préliminaires suggèrent que les oligomères Aβ pourrait être responsable de perturbations du métabolisme des lipides chez les microglies. En somme, ces études soulignent le potentiel d’un nouveau médicament ciblant SCD pour le traitement de la MA. Alzheimer’s disease (AD) research has mainly focused on studying its main histological hallmarks, β-amyloid (Aβ) plaques, and neurofibrillary tangles. However, therapies directly targeting these hallmarks do not prevent AD progression. In addition to these hallmarks, genetics have highlighted the implication of lipid metabolism and immunity in AD. Disturbances in lipid metabolism are the single strongest genetic predictor of developing AD, but the underlying mechanisms remain poorly understood. Recent work in our laboratory showed that triglycerides accumulate in the brains of both AD patients and 3xTg mice, a mouse model of AD. In 3xTg mice, these triglycerides are enriched with monounsaturated fatty acid oleic acid (OA), and the inhibition of the OAsynthesizing enzyme stearoyl-CoA desaturase (SCD) reduced their accumulation and counteracts the early loss of hippocampal neurogenesis and memory deficits. Here, we tested whether SCD inhibition can reverse changes in the transcriptome and rescue hippocampal function in symptomatic 3xTg mice. Compared to their strain controls, the hippocampus of middle-aged, preplaque 3xTg mice showed transcriptomic alterations involved in processes recognized to be disrupted in AD. Their hippocampus also displayed significant reduction in dendritic spines. Remarkably, RNA sequencing data show that treatment of middle-aged 3xTg mice for one month with an SCD inhibitor rescued genes related to immunity and synapses. Tissue analyses revealed that this treatment led to improvements in dendritic spine density. We also established a model of microglia in culture and our preliminary data suggest that Aβ oligomers may be responsible for disruptions in microglial lipid metabolism. Together, these studies shed light on the potential of a novel drug target SCD for the treatment of AD.

fr , en

Regulation of the RNA/DNA helicase Sen1 by proteasome-mediated degradation

Sen1 est une hélicase ARN/ADN impliquée dans la protection du génome de la levure en résolvant les hybrides ARN/ADN et dans la terminaison de la transcription de courts ARN non codants. Malgré la demande cellulaire généralisée pour l'action Sen1, son abondance cellulaire est très faible, ce qui suggère que des mécanismes régulent les niveaux de protéine Sen1 dans la cellule. Nous avons confirmé que Sen1 est dégradé via une voie dépendante du protéasome. Ce mécanisme dépend de l’activité catalytique de Glc7, une protéine phosphatase dont il a été précédemment démontré qu’elle déphosphoryle Sen1 in vitro et qu’elle interagit avec Sen1 via un motif RVxF selon des expériences à deux hybrides. Notre hypothèse de travail est que Glc7 contrôle les niveaux de protéine Sen1 via la déphosphorylation d'un phospho-dégron. Fait intéressant, un site potentiel dans la région N-terminale de Sen1 (sérine 863) qui peut fonctionner comme un phospho-dégron a été identifié dans une analyse à l'échelle du protéome de la co-occurrence de phosphorylation et d'ubiquitylation. Afin d'identifier les sites de phosphorylation Sen1 qui sont enrichis en l'absence de Glc7, nous avons réalisé une immunoprécipitation de Sen1 suivie d'une spectrométrie de masse. Cette analyse a identifié un site de phosphorylation dans Sen1 à la sérine 1505 qui pourrait agir comme un site de dégron potentiel. A noter que ce site, a également été signalé dans les études antérieures phosphoprotéomiques sur la levure. De plus, l'interaction entre Sen1 et Glc7 et l’importance du motif RVxF (par la mutation du résidu F2003) pour cette interaction ont été confirmée par co-immunoprécipitation. De manière surprenante, la prévention de cette interaction n'affecte pas la stabilité de Sen1 ou la croissance cellulaire. Dans l'ensemble, nous avons identifié un petit groupe de sites de phosphorylation Sen1 avec une pertinence biologique potentielle. Nos résultats confirment également que la mutation du motif RVxF de Sen1 altère l'interaction avec Glc7 in vivo. Ces données approfondissent notre compréhension de la régulation de la protéine Sen1 par Glc7 dans les cellules de levure qui peuvent fournir des indices sur le rôle de la sénataxine, orthologue humaine, dans les troubles neurodégénératifs. Sen1 is an RNA/DNA helicase involved in protecting the yeast genome by resolving RNA/DNA hybrids and in the transcription termination of short non-coding RNAs. Despite the widespread cellular demand for Sen1 action, its cellular abundance is very low, suggesting that mechanisms regulate Sen1 protein levels in the cell. We have confirmed that Sen1 is degraded via a proteasome-dependent pathway. This mechanism depends on the catalytic activity of Glc7, a protein phosphatase that was previously shown to dephosphorylate Sen1 in vitro, and to interact with Sen1 through an ‘RVxF’ motif. Our working hypothesis is that Glc7 controls Sen1 protein levels via dephosphorylation of a phospho-degron. Interestingly, a potential site in the N-terminal region of Sen1 (serine 863) that may work as a phospho-degron has been identified in a proteome-wide analysis of phosphorylation and ubiquitylation cross-talk. In order to identify Sen1 phosphorylation sites enriched in the absence of Glc7, we conducted immunoprecipitation of Sen1 followed by mass spectrometry. This analysis identified one phosphorylation site within Sen1 at serine 1505 that could act as a potential degron site. Note that this site has also been reported in previous phosphoproteomic studies on yeast. Furthermore, the interaction between Sen1 and Glc7 and the importance of the RVxF motif (by mutation of residue F2003) for this interaction was confirmed by co-immunoprecipitation. Surprisingly, prevention of this interaction does not affect the stability of Sen1 or cell growth. Overall, we have identified a small group of Sen1 phosphorylation sites with potential biological relevance. Our findings also confirm that mutating the RVxF motif of Sen1 impairs the interaction with Glc7 in vivo. These data further our understanding of Sen1 protein regulation by Glc7 in yeast cells that may provide clues to the role of senataxin, human orthologue, in neurodegenerative disorders.

fr , en

Quantitative proteomics identifies substrates of SUMO E3 ligase PIAS proteins involved in cell growth and motility

Protein SUMOylation is a highly dynamic and reversible post-translational modification that targets lysine residues on a wide range of proteins involved in several essential cellular events, including protein translocation and degradation, mitotic chromosome segregation, DNA damage response, cell cycle progression, cell proliferation, and migration. Protein SUMOylation is an ATP-dependent enzymatic process that involves an E1 activating enzyme SAE1/2, a E2 conjugase UBC9, and usually facilitated by SUMO E3 ligases. The SP-RING family is the largest family of SUMO E3 ligases, encompassing seven mammalian protein inhibitor of activated STAT (PIAS) proteins. PIAS family was originally identified as specific inhibitors for signal transducer and activator of transcription (STAT), which involves gene transcriptional regulation. Recent studies showed that PIAS proteins also play important roles in the regulation of protein stability and signal transduction through the SUMOylation of target substrates. In addition, PIAS-mediated protein SUMOylation is also involved in several cellular processes, including DNA damage repair, immune response, cellular proliferation, and motility. Most notably, PIAS proteins are highly expressed in different cancer types and have been implicated in tumorigenesis. Several reports suggest that PIAS proteins could promote cancer cell growth and progression by regulating the SUMOylation of different substrates. To date, a number of substrates of PIAS ligases have been identified from several individual studies, and hundreds of specific SUMO E3 ligase substrates were identified from a human proteome microarray-based activity screen. However, how these substrates are selected, and which SUMOylation sites are targeted by these PIAS are still unknown. To answer these questions, I started my investigation with PIAS1, one of the most well studied SUMO E3 ligases. By changing the expression level of PIAS1 in HeLa cells using gene overexpression or CRISPR/Cas9 gene knockout, I found PIAS1 had a physiological impact on cell proliferation and migration. I took advantage of the previously developed SUMO proteomics workflow to quantitatively profile global SUMOylome changes upon PIAS1 overexpression in a site-specific manner. I identified 983 SUMO sites on 544 proteins, of which 62 proteins were assigned as putative PIAS1 substrates. In particular, Vimentin (VIM), a type III intermediate filament protein involved in cytoskeleton organization and cell motility, was identified as PIAS1 substrates. Two SUMOylation sites mediated by PIAS1 at Lys-439 and Lys-445 residues were further evaluated and found to be necessary for dynamic disassembly and assembly of vimentin intermediate filaments, which further regulates cell migration and motility. In the second study, I extended my investigation to all PIAS ligases and further found that all PIAS proteins impact cell proliferation and migration of breast cancer cell MDA-MB-231 after CRISPR/Cas9 gene knockout. I further optimized my SILAC-based quantitative SUMO proteomics approach and combined it with transcriptomics to gain a system-level understanding of the functional components involved in PIAS regulatory networks. A large subset of proteins/ genes involved in cell proliferation and migration were commonly regulated by all PIAS proteins, suggesting a redundancy of regulation within the PIAS family. In addition, each PIAS regulated a unique pool of substrates/genes involved in different cellular processes, such as DNA damage repair, chromatin remodeling, and SUMO chain formation, suggesting that each PIAS specifically regulates cellular functions. The trans-scale analyses between proteomics and transcriptomics shed light on the comprehensive pictures of the regulation networks by PIAS proteins beyond their direct enzymatic activity. Overall, the quantitative SUMO proteomics approach provided a robust method for identifying substrates of PIAS SUMO E3 ligases. The combination of proteomic and transcriptomic analyzes made it possible to draw up a global portrait of the regulatory mechanisms governed by the PIAS proteins. La SUMOylation des protéines est une modification post-traductionnelle se produisant sur des lysines d’un large éventail de protéines cellulaires. Cette modification est dynamique et régit plusieurs évènement cellulaires essentiels, dont la translocation et la dégradation des protéines, la ségrégation chromosomique mitotique, la réparation de l'ADN, la progression du cycle cellulaire, la prolifération cellulaire et la migration. La conjugaison de la protéine SUMO sur son substrat se produit grâce à une triade enzymatique regroupant l’enzyme d’activation E1 SAE 1/2, la conjugase E2 UBC9 et dans la plupart des cas une ligase SUMO E3. Cette cascade enzymatique nécessite une source d’ATP pour son initiation. Parmi la famille des ligases SUMO E3, on retrouve un domaine spécifique nommé SP-RING présent chez une sous population de celles-ci. Parmi ces ligases on retrouve 7 protéines inhibitrices des protéines STAT activées regroupees sous le nom de PIAS. Les ligases PIAS ont été identifiées à l'origine comme des inhibiteurs spécifiques des protéines STAT responsable du signal de transduction et de l’activation de la transcription génique. Des études récentes ont montré que les protéines PIAS jouent également un rôle important sur la stabilité de leurs substrats et la transduction de leur signal. De plus, les substrats SUMOylés par les PIAS sont impliqués dans plusieurs processus cellulaires, notamment la réparation des dommages à l'ADN, la réponse immunitaire, la prolifération et la motilité cellulaire. Ces divers processus cellulaires peuvent être déréglés et entrainer le développement du cancer. Il s’avère que les protéines PIAS sont fortement exprimées dans divers types de cancer et sont impliquées dans la tumorigenèse. Plusieurs rapports suggèrent que les protéines PIAS pourraient favoriser la croissance et la progression des cellules cancéreuses en régulant le niveau de SUMOylation de plusieurs substrats. Initialement, les substrats des ligases PIAS ont été identifiés à partir de plusieurs études individuelles et plus récemment, des centaines de substrats spécifiques de la SUMO E3 ligase ont été identifiés à partir de criblage de micropuces à protéines interrogeant le protéome humain. Cependant, la manière dont ces substrats sont sélectionnés et quels sont les sites de SUMOylation ciblés par ces PIAS demeurent encore méconnus. Afin d’aborder ces questions, j’ai commencé mon étude avec PIAS1, l'une des ligases SUMO E3 les plus étudiées. Pour ce faire, j’ai varié le niveau d'expression de PIAS1 dans des cellules iv HeLa selon l’approche CRISPR/Cas9. Ainsi, deux modèles ont été construit, soit via une surexpression du gène ou via un knockout du gène. Ces mutants ont permis de constater que PIAS1 avait un impact physiologique sur la prolifération et la migration des cellules. J’ai tiré avantage d’une méthode protéomique précédemment développé sur les peptides SUMO pour déterminer les changements de SUMOylation lors de la surexpression de PIAS1. J’ai identifié 983 sites SUMO sur 544 protéines, dont 62 protéines ont été identifiées comme substrats potentiels de PIAS1. Parmi celles-ci, la vimentine (VIM), une protéine de la famille des filaments intermédiaire de type III impliquée dans l'organisation du cytosquelette et la motilité cellulaire, a été reconnu comme un substrat de PIAS1. Afin de valider le rôle de la SUMOylation des lysines Lys-439 et Lys-445 de VIM j’ai effectué des études fonctionelles de motilité cellulaire avec les mutants où ces sites ont été substitués en arginine. Ces expériences m’ont permis de constater que la SUMOylation de VIM aux sites Lys-439 et Lys-445 est nécessaire à l’assemblage et désassemblage dynamique des filaments intermédiaires de VIM, lesquels regulent la migration et la motilité cellulaire. Dans la deuxième étude, j’ai élargi mon recherche sur toutes les ligases PIAS et avons découvert que ces dernières avaient toutes un impact sur la prolifération cellulaire et la migration des cellules du cancer du sein MDA-MB-231 suite à un knockout de ces gènes par CRISPR / Cas9. De plus, j’ai optimisé mon approche de protéomique quantitative SUMO via SILAC et l'avons complémenté d’une analyse transcriptomique. Cette combinaison a permis d’acquérir une compréhension des composants fonctionnels impliqués dans les réseaux de régulation PIAS. Il s’avère qu’un grand sous-ensemble de gènes / protéines impliqués dans la migration et la prolifération des cellules sont régulés par tous les membres de la famille PIAS, et suggère une certaine redondance fonctionnelle parmi ces ligases. De plus, chaque PIAS régule un ensemble unique de substrats / gènes impliqués dans plusieurs processus cellulaires différents, tels que la réparation des dommages de l'ADN, le remodelage de la chromatine et la formation de la chaîne SUMO. Ces résultats suggèrent que chacune des PIASs régule de façon spécifique les fonctions cellulaires. La combinaison des analyses protéomiques et transcriptomiques ont permi de dresser un portrait global des mécanismes de régulation régit par les protéines PIAS et ce au-delà de leur activité enzymatique directe.

en , fr

Rôle du complexe NF45-NF90 dans la régulation post-transcriptionnelle du cycle cellulaire

Le cycle cellulaire eucaryote se divise en une série de phases ordonnées qui ont pour finalité la division cellulaire. Ce processus est primordial dans la prolifération des cellules normales et le développement, mais il est aussi très fortement dérégulé dans les cellules cancéreuses. Les phases de cycle cellulaire sont différenciées par les tâches effectuées au cours de celles-ci et requièrent l’expression de gènes spécifiques à chacune des phases. Chez l’humain, il existe environ 1000 gènes dont l’expression est dépendante de la phase du cycle cellulaire. Les mécanismes impliqués dans le contrôle de l’expression périodique de ces gènes ont principalement été étudié aux niveaux transcriptionnels et post-traductionnels. Cependant, la régulation post-transcriptionnelle demeure encore peu étudiée dans le contexte du cycle cellulaire, malgré son importance dans le contrôle de l’expression génique. Afin d’identifier des régulateurs post-transcriptionnels du cycle cellulaire, nous avons analysé la corrélation existante entre l’expression des gènes périodiques du cycle cellulaire et celle de 687 protéines liant l’ARN (RNA-binding protein; RBP) sur plus de 1000 spécimens de cancer du sein. Cette analyse nous a permis d’identifier 39 RBP dont les protéines Nuclear Factor 45 (NF45) et Nuclear Factor 90 (NF90). NF45 et NF90 forment un hétérodimère qui lie des structures d’ARN double brin et qui contrôle l’expression génique à différents niveaux de l’épissage à la stabilisation des ARNm. La déplétion de NF45 ou NF90 inhibe la prolifération des cellules en induisant de nombreux défauts mitotiques qui résultent d’une baisse d’expression de plusieurs gènes essentiels à la mitose. D’autre part, à l’aide d’une méthode de protéomique nous avons réalisé l’interactome du complexe NF45-NF90 afin de déterminer à quels niveaux ce mécanisme de régulation prend place et avons identifié une interaction avec le complexe Staufen1/2-UPF1 responsable de la dégradation des ARNm. Ainsi, les niveaux d’expression de certains ARNm importants à la mitose sont conditionnés par une compétition entre NF45-NF90 et Staufen1/2 pour la liaison à ces ARNm. Dans une seconde étude, nous avons recherché les régulations potentielles sur NF45 et NF90 au cours du cycle cellulaire et avons i découvert des évènements de phosphorylation sur NF90 prenant place en phase G2/M. Nous avons montré que cette phosphorylation est médiée par CDK1, et l’activation de CDK1 provoque la translocation de NF90 du noyau vers le cytoplasme. Enfin, au vu de l’implication du complexe NF45-NF90 dans la prolifération des cellules cancéreuses, nous avons réalisé un essai de criblage à haut débit de 120 000 molécules sur l’interaction entre NF45 et NF90. Cet essai nous as permis d’identifier plus de plus 1000 molécules pouvant potentiellement interférer avec le complexe NF45-NF90. Parmi celles-ci, nous avons retrouvé 14 molécules de la famille des glycosides cardiaques, qui sont des composés antiarythmiques mais qui par ailleurs possèdent des effets anticancéreux décrits depuis plusieurs décennies. De façon intéressante, le traitement des cellules à ces composés mène à un phénotype mitotique très similaire à la déplétion de NF45 ou NF90, suggérant une implication du complexe NF45-NF90 dans les effets antimitotiques induits par les glycosides cardiaques. En conclusion, ces études nous ont permis d’éclairer le rôle du complexe NF45-NF90 dans la prolifération cellulaire, mais aussi d’approfondir la compréhension des différents mécanismes impliqués dans le contrôle du cycle cellulaire. The eukaryotic cell cycle is divided into a series of ordered phases leading to cell division. This process is essential in normal cell proliferation and development, but it is also largely deregulated in cancer cells. Cell cycle phases are differentiated by the different molecular processes performed and expression of specific genes at each phase is determinant. In humans, there are approximately 1000 genes that are periodically expressed throughout the cell cycle. Control of this periodic expression has been well characterized at the transcriptional and post-translational levels. However, post-transcriptional regulation remains little studied in the context of the cell cycle, despite its importance in the control of gene expression. In order to identify post-transcriptional cell cycle regulators, we have correlated the expression of cell cycle genes with the expression of 687 RNA-binding proteins (RBP) in more than 1000 breast cancer specimens. This analysis allowed us to identify 39 RBPs, including Nuclear Factor 45 (NF45) and Nuclear Factor 90 (NF90). NF45 and NF90 form a heterodimer that binds double-stranded RNA structures and controls gene expression at various levels, from splicing to stabilization of mRNAs. Depletion of NF45 or NF90 inhibits cell proliferation by inducing several mitotic defects resulting from decreased expression of many genes essential for mitosis. In order to determine at which levels this regulatory mechanism takes place, we performed a proteomic method to identifyNF45-NF90 proximal interactors and identified an interaction with the Staufen1/2-UPF1 complex responsible for the degradation of mRNAs. Thus, it appears that the expression of some mitotic mRNAs is controlled by a competition between NF45-NF90 and Staufen1/2 for binding to these mRNAs. In a second study, we looked for potential regulations on NF45 and NF90 during the cell cycle and found phosphorylation events on NF90 taking place in the G2/M phase of the cell cycle. We have shown that this phosphorylation is CDK1-dependent, and that CDK1 activation leads to the translocation of NF90 from the nucleus to the cytoplasm. Finally, based on the involvement of the NF45-NF90 complex in cancer cell proliferation, we carried out a high-throughput screening assay of 120,000 ii. Abstract ii molecules on the interaction between NF45 and NF90. This assay allowed us to identify more than 1000 molecules that could potentially interfere with the NF45-NF90 complex. Amongst them, we found 14 molecules belonging to the cardiac glycoside family, which are antiarrhythmic drugs that also display anticancer effects. Interestingly, treatment with cardiac glycosides leads to a mitotic phenotype very similar to the depletion of NF45 or NF90, suggesting an involvement of the NF45-NF90 complex in the antimitotic effects induced by cardiac glycosides. In conclusion, these studies have shed light on the role of the NF45-NF90 complex in cell proliferation, but also deepened our understanding of the different mechanisms involved in cell cycle control.

fr , en

La responsabilité criminelle a-t-elle un avenir? : enquête sur les fondements philosophiques, juridiques et psychologiques de l’imputabilité pénale à l’ère des neurosciences

La présente thèse a une vocation à la fois descriptive et prospective. Descriptive, d’une part, en ce qu’elle entend mettre au jour les fondements juridiques actuels de la responsabilité criminelle tout en déterminant l’étendue des rapports qu’ils entretiennent avec la notion philosophique de libre arbitre. Prospective, d’autre part, en ce qu’elle entend évaluer les chances de survie de ces fondements à la lumière de la nouvelle vision de l’homme qui se dégage des avancées récentes en neurosciences. Nous aurons pour ce faire à soupeser la vraisemblance de deux grandes prophéties concernant l’avenir de la responsabilité criminelle : l’une, que nous qualifierons de « scientiste », prétend que le concept juridique actuel de responsabilité criminelle est voué à tomber en désuétude en raison de son incompatibilité avec notre connaissance du cerveau. L’autre, que nous qualifierons de « légitimiste », prétend que c’est plutôt en modifiant les intuitions populaires en matière de responsabilité que les neurosciences bouleverseront l’édifice pénal. Dans les deux cas, nous découvrirons qu’une erreur de diagnostic quant au fonctionnement juridique et psychologique des jugements de responsabilité conduit à une erreur de pronostic. This doctoral dissertation is both descriptive and prospective. Descriptive, on the one hand, by seeking to identify the current legal foundations of criminal responsibility and by trying to determinate the extent of their relationship with the philosophical notion of free will. Prospective, on the other hand, by seeking to evaluate the chances of survival of these foundations in the light of the new vision of man that emanates from advances in neuroscience. To this end, two great prophecies concerning the future of criminal responsibility will have to be weighed: one, which we will call ‘‘scientist’’, claims that the current legal concept of criminal responsibility is incompatible with what neuroscience teaches us and is, therefore, destined to fall into disuse. The other, which we will call ‘‘legitimist’’, claims that it is rather by altering the popular intuitions about responsibility that neuroscience will threat the penal edifice. In both cases, we will discover that a misdiagnosis concerning the legal and psychological functioning of the judgments of responsibility leads to an error of prognosis.

fr , en

Caractérisation du virome entérique porcin et évaluation de son implication dans la diarrhée néonatale

Le Canada est l’un des plus grands pays exportateurs de porc du monde et le Québec à lui seul compte pour 6% de ce commerce mondial. Pour conserver sa compétitivité et l’excellence de ses produits, une connaissance approfondie des agents infectieux circulant au sein des troupeaux est primordiale. Plusieurs pathogènes sont peu étudiés et pourtant retrouvés chez les porcs à travers la planète. Cette étude avait pour but l’évaluation de la prévalence des astrovirus porcins, calicivirus, kobuvirus porcin, rotavirus, torque teno sus virus ainsi que le virus de l’hépatite E lors du suivi de porcelets dans un réseau de production porcine, de la maternité jusqu’en fin d’engraissement. Nous voulions brosser un portrait de l’excrétion de ces virus à travers les différentes étapes de production des animaux. L’échantillonnage de porcelets sains et en diarrhée en pré-sevrage a permis de déterminer lesquelles de ces infections virales constituaient des facteurs de risque pour la diarrhée à ce stade de production. Le virome intestinal, la partie virale du microbiome, a également été caractérisé permettant de connaître la diversité des virus entériques porcins aux différentes étapes de production, ainsi qu’entre les porcelets sains et en diarrhée. De plus, la dissémination du virus de l’hépatite E dans l’environnement ainsi que les sources probables de contamination ont été décrites à l’aide d’échantillons provenant des environnements intérieurs et extérieurs de fermes d’engraissement, de la cour d’un abattoir et de transporteurs d’animaux. Les résultats obtenus ont permis de décrire les dynamiques temporelles d’excrétion de ces virus entériques porcins en fonction des stades de production des porcs, démontrant une différence dans l’excrétion de ces virus en fonction de l’âge. Les calicivirus, ainsi que les astrovirus porcins groupes 3 et 5 étaient des facteurs de risque de diarrhée en maternité. Pour la première fois au Canada, la détection et la caractérisation des souches du kobuvirus porcin ont été réalisées, permettant de mieux comprendre leur diversité et leur persistance à travers les stades de production. La diversité du virome entérique porcin a été analysée avec la plateforme de séquençage MiSeq et cette diversité était différente entre les porcelets sains et en diarrhée, ainsi qu’entre les stades de production. Cependant, les traitements enzymatiques utilisés pour le prétraitement des échantillons fécaux ne permettaient pas le séquençage de certains virus à ARN simple-brin. Des souches similaires du virus de l’hépatite E étaient présentes dans l’environnement des fermes, ainsi qu’aux endroits communs à forte circulation des intervenants du réseau. Les activités dans la cour de l’abattoir pourraient donc être impliquées dans la dissémination de ce virus. Cette étude a permis de mieux connaitre la prévalence et la distribution des virus entériques infectant les porcs. De plus, certains des virus entériques étudiés ont été reconnus comme facteurs de risque de la diarrhée en co-infections et devront être étudiés en détail pour comprendre leurs mécanismes en relation avec la diarrhée néonatale. Des interventions plus spécifiques lors d’éclosion de diarrhées porcines, dont l’étiologie est inconnue, pourront donc être réalisées, ainsi que l’élaboration de mesures de biosécurité plus adaptées en fonction du stade de production des porcs. Canada is a major pork exporter around the world and the province of Quebec alone accounts for 6% of this trade. To maintain the province’s competitiveness and the excellence of its products, a comprehensive understanding of the infectious agents circulating in herds is essential. Several pathogens have been intensively studied, while others have yet to be investigated even though they have been reported in pigs all around the world. This study evaluated the prevalence of porcine astroviruses, calicivirus, porcine kobuvirus, rotavirus, torque teno sus virus and hepatitis E virus, monitored in a pig production network, from the nursing farms to the end of the fattening farms to portray the excretion patterns of these viruses through the different life stages of pigs. The sampling of healthy piglets alongside piglets with diarrhea in the nursing farms allowed to determine which viruses, or co-infections of viruses were factors of diarrhea at this life stage. The intestinal virome, the viral part of the microbiome, was characterized and viral diversity of porcine enteric viruses at different life stages, as well as between healthy and diarrheic piglets were evaluated. Moreover, the dissemination of the hepatitis E virus in the farm environment, as well as the possible sources of contamination were described, from the indoor and outdoor environment of fattening farms, the slaughterhouse yard and animal transporters. The results obtained in this study described the temporal excretion dynamics of these porcine enteric viruses according to the life stages of the pigs, demonstrating the difference in the excretion of the studied viruses according to the life stage. The calicivirus, as well as the porcine astrovirus groups 3 and 5 were found to be risk factors for diarrhea in the nursing farms. For the first time in Canada, the detection and characterization of porcine kobuvirus strains were evaluated and provided a better understanding of their diversity and the persistence of these strains in the network. The porcine enteric virome diversity was analyzed on a MiSeq sequencing platform and this diversity was different between healthy and diarrheic piglets, as well as between the different life stages. However, the different enzymatic treatments used as pretreatments for fecal samples altered the ability to detect certain single-stranded RNA viruses. Similar strains of the hepatitis E virus were present in the indoor and outdoor environment of the fattening farms, as well as in common places of high circulation from the various stakeholders in the pig production network. The activities in the slaughterhouse yard could therefore be involved in the spread of this virus. This study shed light on enteric viruses infecting pigs. In addition, some of the infections from enteric viruses studied were risk factors for diarrhea in co-infections and will need to be studied in more details to understand their mechanisms, in relation to neonatal diarrhea. More specific interventions during outbreaks of porcine diarrhea of unknown etiology could be carried out, as well as the development of more adapted biosecurity measures according to the life stage of the pigs.

fr , en

Characterization of feedstuff-drug interactions in swine

Les interactions aliment-médicaments nuisant aux processus de libération et/ou à la stabilité de leurs principes actifs doivent être caractérisées en raison de leurs conséquences adverses sur la biodisponibilité orale, l’efficacité thérapeutique et, dans le cas des agents anti infectieux, la sélection d’organismes résistants. Notre étude a évalué la relation entre l'efficacité de la libération in vitro de la chlortétracycline (CTC) et de la lincomycine (LIN) dans le liquide gastrique simulé de porc (LGSP) et la capacité de rétention d'eau (CRE) d’ingrédients couramment utilisés dans l’alimentation des porcs (tourteau de soja (TS), drèche de distillerie sèche avec solubles (DDS) et farine de viande et d'os (FVO), maïs, blé, et seigle), que l’on a fortifié avec 880 ppm de CTC ou 440 ppm de LIN. La CRE des ingrédients différait significativement (p <0,0001) et était maximale avec le TS, aussi bien dans l'eau que le LGSP. Le FVO avait une CRE significativement plus basse dans le LGSP que dans l'eau (p <.0001). Les effets du temps de trempage sur la CRE étaient négligeables pour tous les ingrédients (p> 0,50). La CRE diminue avec l'augmentation de la taille des particules pour tous les aliments, mais leurs relations différaient significativement (p<0.0001). Tous les ingrédients alimentaires testés ont diminué la vitesse et l'étendue de la dissolution des prémélanges de CTC et de LIN. Le CRE était le principal facteur qui a empêché la dissolution des deux médicaments (p <0,0001), tandis que le temps et la teneur en cendres des ingredients favorisaient significativement leur dissolution (p ≤ 0,008). En comparaison des prémélanges dissouts seuls, le DDS et le seigle ont libéré 80% de ces antibiotiques, tandis que le TS, le blé et le maïs en ont libéré entre 40 et 50%. La neutralisation du LGSP au pH intestinal porcin a diminué les proportions dissoutes d’antibiotiques, mais pas significativement (p>0.69). La CRE des ingrédients utilisés dans la fabrication d'aliments médicamenteux serait donc un indicateur prometteur des interactions aliment-prémélange médicamenteux de LIN et de CTC. Afin d'augmenter leur libération et leur potentiel thérapeutique, la formulation des aliments médicamenteux pourrait être améliorée en utilisant des ingrédients alternatifs, dont la CRE est moindre. Food-drug interactions adversely affecting the release process and the stability of their active ingredients must be characterized because of their adverse consequences on oral bioavailability, therapeutic efficacy and, in the case of antibiotics, selection resistant organisms. Our study evaluated the relationship between the efficiency of the in vitro release of chlortetracycline (CTC) and lincomycin (LIN) in simulated pig gastric fluid (SPGF) and the water-holding capacity (WHC) of feedstuffs commonly used in pig feed (soybean meal (SBM), dry distillers' grain with solubles (DDGS) and meat and bone meal (MBM), corn (gC), wheat (gW), and rye (gR), which it was fortified with 880 ppm CTC or 440 ppm LIN. The WHC of ingredients differed significantly (p <0.0001) among feedstuffs with the highest value for SBM both in water and SPGF and lowest value for MBM. The MBM had a significantly lower WHC in SPGF than in water (p <.0001). The effects of soaking time on WHC were negligible for all feedstuffs (p> 0.50). The WHC decreased with increasing particle size for all feedstuffs, but their relationships differed significantly (p <0.0001). All the tested feedstuffs decreased the rate and extent of dissolution of the CTC and LIN premixes. WHC was the main factor that hindered the dissolution of both drugs (p <0.0001), while the time and ash content of the ingredients significantly favored their dissolution (p ≤ 0.008). Compared to the dissolved premixes alone, DDGS and gR released 80% of these antibiotics, while SBM, gW and gC released between 40% and 50%. Neutralization of SPGF at swine intestinal pH decreased the dissolved proportions of antibiotics, but not significantly (p> 0.69). The WHC of the used feedstuffs in the manufacture of medicated feed would therefore be a promising indicator of the feed-drug interactions of LIN and CTC. To increase their release and therapeutic potential, the formulation of medicated feeds could be improved by using alternative ingredients, with less WHC.

fr , en

Development of a tissue engineering platform using bovine species as a model : placental scaffolds seeded with bovine adipose-derived cells

La technologie des cellules souches et les sciences de biomatériaux ont obtenu des grands progrès au cours des dernières décennies et sont devenues plus populaires dans le monde. Les chercheurs cherchent à étudier et à évaluer les différentes sources de cellules et de biomatériaux qui, en combinaison, peuvent fournir une plateforme d’ingénierie tissulaire produite à grande échelle et à bas prix, pour être utilisée aux tests de médicaments, aux thérapies cellulaires et transplantations, dans le but de fournir un soutien thérapeutique aux blessures et à la régénération des tissus endommagés. En général, les trois constituants les plus importants de l’ingénierie tissulaire sont : le choix du type cellulaire, la source du biomatérial (charpente), la création et le maintien d’un lieu favorable à la formation des tissus. Lorsque ces trois constituants sont gérés avec succès, le microenvironnement cellulaire in vitro est plus similaire à ce que la cellule est exposée in vivo, en permettant que la croissance et la différenciation cellulaire survient de façon plus fiable et efficace. Le placenta bovin décellularisé a démontré avoir une riche matrice extracellulaire, des vaisseaux bien développés, étant un biomatérial à haute disponibilité et à bas prix. Mais, on ne sait pas si les charpentes placentaires ont le potentiel d’être repeuplés avec des cellules souches mésenchymateuses (MSC) dérivées du tissu adipeux, et ce processus s’appelle recelularisation. Encore, on ne sait pas si les charpentes placentaires ont la capacité d’offrir, après recelularisation, un ambient approprié pour différencier ces cellules en différentes lignées. Ainsi, afin de fournir des informations sur la capacité du complexe MSC – charpente placentaire à être utilisé avec succès dans l’ingénierie tissulaire, les objectifs de cette thèse ont été : étudier le potentiel des charpentes placentaires bovins en offrir un soutien à la recelularisation par des cellules dérivées du tissu adipeux bovin, et aussi bien qu’évaluer la capacité de différenciation cellulaire en lignées ostéogéniques et chondrogéniques. Le premier article de cette thèse c’est une revue de la littérature qui aborde la nature des cellules souches mésenchymateuses, leurs applications en médicine régénérative, l’importance de la technologie des cellules souches dans l’industrie de l’élevage et l’utilisation de l’espèce bovine en médicine translationnelle. Le deuxième article aborde l’évaluation de la recelularisation et la différenciation cellulaire. Les placentas bovins ont été décellularisés par perfusion de SDS du vaisseau ombilical et les lignées cellulaires établies après la digestion enzymatique du tissu adipeux de six vaches et la sélection par adhésion rapide à la plaque de culture. Ensuite, les cellules ont été cultivées avec les charpentes dans un système d’agitation 2D pendant 21 jours en milieu de différenciation ou de maintenance. Lorsqu’elles sont cultivées sur la plaque de culture, les cellules isolées ont présenté morphologie similaire au fibroblaste, l’expression de CD90, CD73 et CD105, tandis qu’elles n’ont pas exprimé les marqueurs CD34 et CD45. Par ailleurs, les cellules ont été capables de se différencier en lignées chondrogéniques et ostéogeniques, en fournant des preuves de leur nature mésenchymateuse. Ensuite, quand elles ont été cultivées avec les charpentes, les cellules y ont adhéré par des projections cellulaires, établies une communication cellule-charpente et se sont proliférées, fait mis en évidence par l’analyse histologique et microscopie électronique à balayage (MEB). Après, le potentiel des cellules à se différencier en lignées ostéogéniques a été exploré, lorsqu’elles ont été cultivées avec charpente. Au cours d’une période de culture de 21 jours en milieu ostéogénique, les cellules ont proliféré et se sont différenciées de façon dépendante du temps, c’est-à-dire, à chaque semaine, la plus grande abudance de cellules a été observée, fait en évidence par la coloration des noyaux cellulaires et l’augmentation de l’intensité de la coloration pour COLLAGEN 1 (COL1), qui a aussi été exprimée par réaction quantitative en chaîne de la polymérase en temps réel (qRT-PCR). Le standard a été observé par l’analyse histologique, les accumulations généralisées de calcium a aussi été plus abondantes dans les charpentes au cours de la troisième semaine de culture, demontré par la coloration de Von Kossa. L’analyse MEB a montré que les cellules ont sécrété des structures globulaires lorsqu’elles ont été cultivées sur conditions d’induction ostéogénique, cohérentes avec la sécrétion observée par l’analyse histologique. Sur la différenciation chondrogénique, les colorants Safranine et Vert Solide ont démontré succès à la différenciation, grâce à la coloration des protéoglycanes, des cellules similaires aux chondrocytes et aux collagène type II. L’analyse MEB a montré que les cellules ont changé leur morphologie de fibroblastes en globulaires quand elles ont été cultivées avec milieu d’induction chondrogène pendant 21 jours. De plus, les complexes de cellules-charpentes ont exprimé un marqueur de la lignée cartilagineuse, COLLAGEN 2 (COL2), qui est cohérent avec les observations histologiques et MEB. Face aux résultats obtenus, cette étude a démontré que les charpentes placentaires cultivés avec des cellules dérivées du tissu adipeux ont le potentiel d’être utilisés dans l’ingénierie de tissus osseux et cartilagineux. A tecnologia de células-tronco e as ciências de biomateriais obtiveram um grande avanço nas últimas décadas e se tornaram mais populares em todo o mundo. Pesquisadores buscam investigar e avaliar diferentes fontes de células e de biomateriais que, em combinação, possam fornecer uma plataforma de engenharia tecidual de baixo custo e produzida em larga escala, para serem utilizadas em testes de drogas, terapias celulares e transplantes, com objetivo de fornecer suporte terapêutico à lesões e regeneração de tecidos danificados. Em geral, os três componentes mais importantes da engenharia de tecidos são: a escolha do tipo de célula, a fonte do biomaterial (scaffold), criação e manutenção de um ambiente propício à formação tecidual. Quando esses três componentes são gerenciados com sucesso, o microambiente celular in vitro é mais semelhante ao que a célula está exposta in vivo, permitindo que o crescimento e diferenciação celular ocorra de maneira mais fidedigna e eficiente. A placenta bovina descelularizada demonstrou ter uma rica matriz extracelular, vasos bem desenvolvidos, sendo um biomaterial com alta disponibilidade e baixo custo. No entanto, não há informação sobre o potencial dos scaffolds placentários em serem repovoados com células-tronco mesenquimais (MSC) derivadas do tecido adiposo, processo chamado recelularização. Ainda, também não há informação sobre a capacidade dos scaffolds placentários, de após recelularização, oferecer um ambiente adequado para diferenciação dessas células em diferentes linhagens. Assim, a fim de fornecer informações sobre a capacidade do complexo MSC - scaffold placentário em ser usado com sucesso na engenharia tecidual, os objetivos desta tese foram: estudar o potencial dos scaffolds placentários bovinos em oferecer suporte para recelularização por células-tronco derivadas do tecido adiposo bovino, bem como avaliar a capacidade de diferenciação celular em linhagens osteogênica e condrogênica. O primeiro artigo desta tese trata-se de uma revisão de literatura, que discute a natureza das células-tronco mesenquimais, suas aplicações na medicina regenerativa, a importância da tecnologia com células- tronco na indústria pecuária e o uso da espécie bovina na medicina translacional. O segundo artigo consiste na avaliação da recelularização e da diferenciação celular. As placentas bovinas foram decelularizadas por perfusão de SDS do vaso umbilical e as linhas celulares estabelecidas após digestão enzimática do tecido adiposo de seis vacas e seleção por adesão rápida à placa de cultivo. Em seguida, as células foram cultivadas com os scaffolds em um sistema de agitação 2D por 21 dias em meio de diferenciação ou manutenção. Quando cultivadas na placa de cultivo, as células isoladas exibiram morfologia semelhante ao fibroblasto, expressão de CD90, CD73 e CD105, enquanto não expressaram os marcadores CD34 e CD45. Além disso, as células foram capazes de se diferenciar em linhagens condrogênicas e osteogênicas, fornecendo evidências de sua natureza mesenquimal. Posteriormente, quando cultivadas com os scaffolds, as células aderiram-se aos mesmos por projeções celulares, estabeleceram comunicação célula-scaffold e se proliferaram, fato evidenciado por análise histológica e microscopia eletrônica de varredura (SEM). Em seguida, o potencial das células em se diferenciarem em linhagem osteogênica quando cultivadas com scaffold foi avaliado. Durante um período de cultivo de 21 dias no meio osteogênico, as células se proliferaram e diferenciaram de maneira dependente do tempo, ou seja, a cada semana pode ser observado maior abundância de células, evidenciada pela coloração dos núcleos celulares e aumento da intensidade da coloração para COLAGENO 1 (COL1), que também foi expresso por reação quantitativa em cadeia da polimerase em tempo real (qRT-PCR). O mesmo padrão foi observado pela análise histológica; acúmulos generalizados de cálcio também foram mais abundantes nos scaffolds na terceira semana de cultivo, evidenciado pela coloração de Von Kossa. A análise SEM revelou que as células secretaram estruturas globulares quando cultivadas sob condições de indução osteogênica, condizente com a secreção observada pela análise histológica. Em relação à diferenciação condrogênica, os corantes Safranina e Fast Green revelaram sucesso na diferenciação, através da coloração de proteoglicanos, células semelhantes aos condrócitos e colágeno tipo II. A análise SEM mostrou que as células mudaram sua morfologia de fibroblastos para globulares quando cultivadas com meio de indução condrogênica por 21 dias. Além disso, os complexos células-scaffold expressaram um marcador de linhagem cartilaginosa, COLAGENO 2 (COL2), condizente com as observações histológicas e SEM. Considerando os resultados, este estudo demonstrou que os scaffolds placentários bovinos cultivados com células-tronco derivadas de tecido adiposo bovino possuem potencial para serem utilizados na engenharia de tecidos ósseos e cartilaginosos. Stem cell technologies and biomaterial sciences have advanced and grown more popular all over the world. The researchers aim to investigate and evaluate different sources of cells and biomaterials that, in combination, could provide a low cost, highly scalable tissue engineering platform that could be used in drug tests, cell therapies and cell transplantation. The three most important components of tissue engineering systems in general are cell source, biomaterial source (scaffolding system), and the creation and maintenance of an environment that is conducive to tissue formation. When these three components are successfully managed, the tissue engineering treatment achieves a faithful imitation of the in vivo environment, allowing for the differentiation of cells into the desirable cell types. Decellularized bovine placenta has been demonstrated to be rich in extracellular matrix (ECM) and to have well-developed vasculature, representing a highly available, low cost, practically scalable biomaterial. However, it is not known if placental scaffolds have the potential to support recellularization with adipose-derived cells and their subsequent differentiation into different lineages. Thus, in order to provide information on the ability of the mesenchymal stem cell (MSC) - placental scaffold complex to be used in tissue engineering approaches, the objectives of this thesis were: to study the potential of bovine placental scaffolds to support adipose-derived cell recellularization and their differentiation into osteogenic and chondrogenic lineages. The first article of this thesis is a literature review that discusses the nature of mesenchymal stem cells, their applications in regenerative medicine, the importance of stem cell technologies to the livestock industry and the use of bovine species for translational medicine. The second article consists of an evaluation of scaffold recellularization and the differentiation of cells on the scaffolds. The bovine placentae were decellularized by umbilical vessel sodium dodecyl sulfate (SDS) perfusion and cell lines were established after the enzymatic digestion of adipose tissue from six cows and cell selection by rapid adherence to the culture plate. Then, cells were seeded onto the scaffolds and cultured in a 2D rocker system for 21 days in either differentiation or maintenance medium. The isolated cells, when cultured in the plastic dish, exhibited fibroblast-like morphology, CD90, CD73 and CD105 expression, and lacked CD34 and CD45 expression. Moreover, the cells were able to undergo differentiation into chondrogenic and osteogenic lineages, providing evidence of their mesenchymal nature. 8 Subsequently, the cells adhered to the scaffolds by cell projections, established cell-scaffold communication, and proliferated while maintaining cell-cell communication, which was evidenced by histological and scanning electron microscopy (SEM) assays. Throughout a 21- day culture period in the osteogenic medium, the cells exhibited proliferation and differentiation in a time-dependent manner, which can be observed by the greater abundance of cells in later periods, evidenced by cell nuclei staining (4′,6-diamidino-2- phenylindole - DAPI) and increased intensity of staining for COLLAGEN 1 (COL1) in the immunohistochemical assay, and by its expression as measured by real time polymerase chain reaction (qRT-PCR). This same pattern was observed by histological analysis. Widespread calcium accumulations were also more abundant on the scaffolds as time progressed, as evidenced by Von Kossa staining. The SEM analysis revealed that cells secreted globular/round structures when seeded under osteogenic induction conditions, in accordance with histological findings. Regarding chondrogenic differentiation, Safranin O and Fast Green staining revealed successful differentiation through staining of proteoglycans, chondrocyte-like cells and type II collagen on the scaffold. The SEM analysis showed that the cells changed morphology from fibroblast-like to globular when cultured with chondrogenic induction medium for 21 days. Additionally, cell-scaffold complexes expressed a cartilage marker, COLLAGEN 2 (COL2), which is conducive to the histological and SEM observations. Considering the results as a whole, this study demonstrated that placental scaffolds seeded with adipose-derived cells have the potential to be used in bone and cartilage tissue- engineering applications

fr , pt , en

Un bilan rétrospectif des accords de libre-échange entre le Canada et les États-Unis : une approche juridique, historique et économique pour mieux envisager les relations commerciales futures

Les accords de libre-échange sont généralement étudiés indépendamment les uns des autres; ou, quand ils le sont conjointement, le détail des dispositions n'est pas présenté. L'objet ici est de fournir un tracé des différents accords de libre-échange entre le Canada et les États-Unis, aussi loin qu'il est possible de remonter. Nous couvrons: le traité de réciprocité de 1854; l'accord rejeté de 1911; les deux accords issus de la vision de Hull de 1935 et 1938; l'accord avorté de 1947; le Pacte de l'automobile de 1965; et les trois accords les plus récents, soit l'ALÉ, l'ALÉNA et l'ACÉUM. Le survol proposé est prépondéramment juridique. Il s'agit d'abord et avant tout de la comparaison des dispositions des différents accords. En outre, nous nous concentrons sur le commerce de biens, car c'est le seul fil conducteur qui permette des parallèles remontant jusqu'au XIX e siècle. Ensuite, cette analyse est baignée dans un contexte historique, dans la mesure où celui-ci aide à bien mieux cerner les enjeux soulevés par les dispositions spécifiques. Enfin, nous ajoutons à ce corps de l'étude des observations de nature économique. De ce fait, nous proposons une approche multidisciplinaire: le détail de la méthodologie suivie est exposé en détail. À présent, de manière plus précise, la problématique soulevée est la suivante: à l'étude de toutes les ententes commerciales entre le Canada et les États-Unis, quelle est la forme, l'approche, qui est la plus susceptible de faciliter efficacement le commerce entre les deux pays dans l'avenir? La conclusion est fort simple: les accords de libre-échange à spectre large—c'est-à-dire comprenant plusieurs secteurs producteurs de biens—ont en général été plus faillibles que les accords sectoriels, qui se concentrent sur des questions plus modestes, mais plus précises. En effet, les trois derniers accords de libre-échange entre le Canada et les États-Unis sont, derrière des apparences d'ententes englobantes, en dernière analyse, des amalgames d'accords sectoriels agencés dans une charpente à aspirations globales. C'est là la conclusion principale des présents efforts. Nous tirons en outre plusieurs points de synthèse, qui aident à illustrer les points fixes caractérisant les relations commerciales entre le Canada et les États-Unis au fil des décennies. When free trade agreements are studied, they are usually considered independently of each other or, when they are examined jointly, the details of the provisions are not presented. The aim here is to provide an overview of the various free trade agreements between Canada and the United States, going as far back as is feasible. We do cover: the reciprocity treaty of 1854; the rejected agreement of 1911; the two agreements based on Hull's views of 1935 and 1938; the aborted agreement of 1947; the auto pact of 1965; and the three most recent agreements, FTA, NAFTA and the USMCA. The proposed survey is predominantly juridical in nature. It is first and foremost a comparison of the provisions of the various agreements. In particular, we focus on trade in goods, as this is the only thread that allows for parallels going back to the 19th century. Next, this analysis is framed in historical contexts, as these help us better understand the issues raised by the various provisions. Finally, economic comments are added to this core of the research. We thus propose a multidisciplinary perspective: the finer points of the followed methodology are set out in detail. Now, more specifically, the main question raised is spelled out as follows: after considering all of the trade agreements between Canada and the United States, what is the format, the approach, that is most likely to be the most effective in facilitating trade between the two countries in the future? The conclusion is quite simple: broad-spectrum free trade agreements—that is, agreements that cover several goods-producing sectors—have generally been more fallible than sectoral agreements, which focus on smaller, but more specific issues. Indeed, the last three free trade deals between Canada and the United States are, behind the appearances of all-encompassing agreements, essentially amalgamations of sectoral agreements arranged in a framework of global aspirations. This is the main conclusion of our research. We also make several other synthetical points, which illustrate some of the unwavering issues that have characterized the Canada-U.S. trade relationship over the years.

fr , en

L’encadrement juridique de l’exploitation des mégadonnées dans le secteur privé au Québec

Les mégadonnées font partie de ces sujets dont on entend parler sans trop savoir ce qu’ils signifient précisément. Souvent associés au domaine de l’intelligence artificielle, ces volumineux ensembles de données sont à la base d’un nombre croissant de modèles d’affaires axés sur la valorisation des données numériques que nous générons au quotidien. Le présent mémoire cherche à démontrer que cette exploitation des mégadonnées par les entreprises ne s’effectue pas dans un vide juridique. Les mégadonnées ne peuvent être considérées comme un objet de droit en l’absence d’une définition formelle. Une revue de la littérature multidisciplinaire à leur sujet, invite à les concevoir comme un actif informationnel doté de cinq caractéristiques principales, soit leur volume, leur vélocité, leur variété, leur valeur et leur véracité. L’analyse de ces caractéristiques permet au juriste d’atteindre une compréhension suffisante de ce phénomène afin de l’aborder sous le prisme du droit positif. Suivant un exercice de qualification juridique, les mégadonnées émergent à la fois comme un bien meuble incorporel et comme un ensemble de documents technologiques portant divers renseignements dont certains peuvent être qualifiés de renseignements personnels. Le cadre juridique applicable à l’exploitation des mégadonnées s’articule donc autour de la protection législative de la vie privée informationnelle qui s’incarne à travers les lois en matière de protection des renseignements personnels. Cet encadrement est complété par certaines règles relatives à la gestion documentaire et au droit à l’égalité. Une manière efficace de présenter cet encadrement juridique est selon le cycle de vie des renseignements personnels au sein des mégadonnées. Ainsi, il appert que les principes issus de l’approche personnaliste et minimaliste du droit québécois à la protection des renseignements personnels s’appliquent tant bien que mal à la collecte des données numériques ainsi qu’à leur traitement par les entreprises. Big data is one of those topics we keep hearing about without knowing exactly what it means. Often associated with the field of artificial intelligence, these large datasets are the backbone of a growing number of business models that focus on leveraging the digital data we generate on a daily basis. This Master’s thesis seeks to demonstrate that this exploitation of big data by businesses is not happening in a legal vacuum. Big data cannot be considered as an object of rights in the absence of a formal definition. A review of the multidisciplinary literature on the subject invites us to conceive them as an information asset with five main characteristics: volume, velocity, variety, value and veracity. The study of these characteristics allows the jurist to reach a sufficient understanding of the phenomenon in order to approach it through the lens of positive law. Following a legal qualification exercise, big data emerges both as intangible movable property and as a set of technological documents carrying various types of information, some of which can be qualified as personal information. The legal framework governing the exploitation of big data is therefore built around the legislative protection of informational privacy, which is embodied in privacy laws. This framework is complemented by certain rules relating to document management and the right to equality. An effective way to present this legal framework is according to the life cycle of personal information within big data. Thus, it appears that the principles stemming from the personalist and minimalist approach of Quebec's data protection law apply, albeit not without struggle, to the collection of digital data as well as their processing by businesses.

fr , en

Les considérations de « race » ou couleur dans le processus de jumelage en adoption Banque mixte : analyse d’un cas de discrimination raciale systémique à l’aube de la théorie critique raciale, de l’intersectionnalité et de l’internormativité

Dans le cadre du jumelage d’une famille d’accueil Banque mixte et d’un enfant en situation de compromission, cette famille peut exprimer certaines restrictions, notamment quant aux facteurs ayant une incidence sur l’intensité de la prise en charge (déficiences physiques, mentales, troubles graves du comportement, etc.). Cependant, elle peut aussi émettre une réserve sur la « race » ou couleur de l’enfant, caractéristique sans implication fonctionnelle. Les enfants de couleur sont de ce fait considérés « plus difficiles à placer ». Mon mémoire questionne cette pratique où l’État – en avalisant les restrictions de « race » ou couleur posées par les familles d’accueil Banque mixte qu’il rémunère – crée, dans l’allocation des ressources de santé et de services sociaux, une disparité préjudiciable aux enfants racisés, et ce, sur la base, précisément, de leur « race » ou couleur. As part of the current pairing process for a foster (potentially adoptive) family and a vulnerable child from the “Banque mixte”, whose security and development are on the line – this foster family may set certain restrictions, notably in relation to factors influencing the intensity of care (physical or mental limitations, behavioural disorders, etc.). However, the adoptive parent(s) can also restrict the offering of their service to « Whites only », limiting their potential care to children who fit their racial requirements, a criterion without any functional impact. Children of colour are therefore considered « more difficult to place ». Our master thesis questions this practice in which the State – by endorsing the racial restrictions issued by the Banque mixte foster family through placement and remuneration – creates in the resource allocation of health and social services a detrimental disparity on the mere basis of “race”.

fr , en

La pollution sonore des océans et la règlementation du bruit sous-marin : un enjeu international qui prend tout son ampleur dans l’Arctique canadien

Les océans sont remplis de sons naturels et sont aujourd’hui de plus en plus envahis par des bruits d'origine humaine (bruits anthropiques). Ce mémoire étaye l’état actuel des connaissances sur les différentes sources de bruits sous-marins et leurs effets négatifs pour les espèces marines, les écosytèmes et les populations côtieres. Bien que le bruit soit un facteur de stress environnemental similaire à d'autres formes de pollution, la gestion du bruit anthropique a été négligée par les États et par le droit international. Cette étude met en lumière les difficultés pour le droit international et les États d’adopter des instruments spécialisés pour contrer le bruit anthropique alors que planent plusieurs incertitudes scientifiques. Le mémoire identifie et analyse les instruments contraignants et de soft law actuellement en vigueur, à l’international et au Canada, pour découvrir s’ils peuvent être mobilisés dans la lutte contre la pollution sonore dans les eaux arctiques canadiennes. L’adoption d’instruments juridiques ciblant spécifiquement les bruits anthropiques sous-marins est prônée mais avec la mise en garde que ce processus nécessitera une coopération inter et intra sectorielle concertée aux niveaux national, régional et international entre les milieux législatifs, scientifiques et décisionnels. The world oceans are filled with natural sounds, which are being increasingly encroached upon by human sourced noises (anthropogenic noise). This thesis provides an overview of the current state of knowledge on the different sources of underwater noise and their negative effects on marine species, ecosystems and coastal populations. While anthropogenic noise is an environmental stressor similar to other forms of pollution, the management of anthropogenic noise has been neglected by States and by international law. This study highlights how scientific uncertainties and gaps complicate the process of crafting specialized international and domestic instruments to mitigate the impacts of underwater anthropogenic noise. The thesis identifies and analyzes binding and soft law instruments currently in force, internationally and in Canada, to discover whether they can be used to reduce noise pollution in Canadian Arctic waters. The adoption of legal instruments specifically applicable to anthropogenic underwater noise is advocated but with the caveat that it will require concerted inter and intra sectoral cooperation at the national, regional and international levels between legislative, scientific and decision-making circles.

fr , en

Association entre les déterminants du style de vie, l'ostéoporose et la lipodystrophie chez les personnes vivant avec le VIH : une analyse transversale de la Cohorte canadienne VIH et vieillissement.

Introduction: Les personnes vivant avec le VIH (PVVIH) présentent des risques accrus d’ostéoporose et de lipodystrophie. Peu d’études se sont penchées sur l’association entre les déterminants du style de vie, le risque d’ostéoporose et le risque de lipodystrophie chez les PVVIH. Objectifs: L’objectif primaire était d’évaluer l’association entre l’ostéoporose, la lipodystrophie ainsi que différents déterminants du style de vie chez les PVVIH. Méthodologie: Tous les participants de la Cohorte canadienne VIH et vieillissement (CCVV) avec des données sur la densité minérale osseuse (DMO), mesurée par absortiométrie biphotonique à rayons X (DXA), ont été inclus dans cette étude transversale. Les déterminants du style de vie d’intérêt étaient : le revenu annuel, le niveau d’éducation, l’exercice physique ainsi que les consommations d’alcool, de tabac et de drogues illicites. Les covariables mesurées incluaient l’historique complet de la médication antirétrovirale, les comorbidités, les co-infections, la charge virale, le compte de CD4+ au recrutement et le compte de CD4+ nadir. L’ostéoporose a été définie par un score T de -2.5 ou moins. La lipodystrophie, évaluée par la composition corporelle via DXA, a été définie par un fat mass ratio (rapport des pourcentages de gras entre le tronc et les membres inférieurs) supérieur à 1.33 pour les femmes et 1.96 pour les hommes. Les rapports des cotes et les intervalles de confiance à 95% (IC95%) au recrutement ont été estimés en utilisant des régressions logistiques multivariées. Résultats: Nous avons inclus 547 PVVIH (âge médian 55 ans, 88% d’hommes) et 97 contrôles séronégatifs au VIH (âge médian 54 ans, 54% d’hommes). L’ostéoporose était présente chez 13% des PVVIH et 6% des contrôles (OR 2.21, IC 95% [0.96 – 6.06]). La lipodystrophie était présente chez 138 (28.3%, IC 95% 24.3 – 32.3%) des 487 PVVIH avec des données sur la disposition du gras corporel. Aucun des déterminants du style de vie était associé à l’ostéoporose ou à la lipodystrophie. Par contre, les covariables associées à un risque accru d’ostéoporose étaient l’âge avancé, un indice de masse corporelle (IMC) réduit et la co-infection à l’hépatite C. Les covariables associées au risque accru de lipodystrophie étaient l’âge avancé, l’hypertension, l’exposition prolongée aux antirétroviraux, ainsi que les expositions prolongées aux inhibiteurs nucléosidiques de la transcriptase inverse (INTI) et aux inhibiteurs de l’intégrase (INI). Conclusion: Aucune association n’a été décelée entre les déterminants du style de vie étudiés et l’ostéoporose ou la lipodystrophie. Background: As a consequence of ART, people living with HIV (PLWH) are at higher risk for osteoporosis and lipodystrophy. However, the risk may also be influenced by lifestyle factors, but few studies have explored the association between modifiable lifestyle factors and the risk of osteoporosis or lipodystrophy in the PLWH population. Objectives: Our primary objective was to evaluate the lifestyle factors in relation to the risks of osteoporosis and lipodystrophy in a PLWH-based cohort. Methods: We conducted a cross-sectional analysis of data from the Canadian HIV and Aging Cohort Study (CHACS). We included all participants with available bone mineral density T-scores, which were measured by dual-energy X-ray absorptiometry (DXA) scans. Lifestyle risk factors of interest included annual income, education level, alcohol intake, tobacco use, illicit drug use and physical exercise. Other covariates considered were full antiretroviral medication history, medical comorbidities, coinfections, viral load, nadir CD4+ and current CD4+ count. Osteoporosis was defined by a T-score of -2.5 or lower at any of the measured sites. Lipodystrophy was assessed on whole body DXA and defined as a fat mass ratio (the ratio between trunk and lower limbs fat mass) greater than 1.33 for women and 1.96 for men. Baseline prevalence odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (95% CIs) were estimated by multivariate logistic regressions. Results: We included 547 PLWH (median age 55 years, 88% males) and 97 HIV-uninfected controls (median age 57 years, 64% males). Osteoporosis was present in 13.0% of PLWH (95% CI 10.2 – 15.8%) and 6% of controls (95% CI 1.4 – 11.0%); the OR of osteoporosis for HIV seropositivity was 2.21 (95% CI [0.96 – 6.06]). Lipodystrophy was found in 138 (28.3%, 95% CI 24.3 – 32.3%) of the 487 PLWH for which a fat mass ratio (FMR) was available. None of the lifestyle factors of interest were associated with osteoporosis or lipodystrophy. However, covariates associated with an increased risk of osteoporosis were increasing age, lower body mass index (BMI) and hepatitis C coinfection. Covariates associated with an increased risk of lipodystrophy were older age, hypertension, longer antiretroviral duration, and longer exposure to nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NRTIs) and integrase strand inhibitors (INSTIs). Conclusion: No association was found between any of the lifestyle factors of interest and osteoporosis or lipodystrophy.

fr , en

Predictors of HSIL Treatment Failure

Objectif : Les traitements répétés des lésions précancéreuses du col utérin (HSIL), nécessaires en cas d’échecs de traitement, sont associés à des issues obstétriques négatives, telle qu’une augmentation de la mortalité néonatale. Nous avons investigué l’association entre un grand nombre de facteurs de risque potentiels pour l’échec de traitement des HSIL dans le but d’identifier des prédicteurs potentiellement modifiables de l’échec de traitement. Méthodes : La population source était constituée de 1 548 femmes canadiennes qui ont subi un premier traitement pour HSIL. L’échec de traitement a été défini comme étant un diagnostic histologique de HSIL ou cancer au cours des deux années suivant le traitement. Nous avons mené une étude cas-témoins nichée incluant les 101 cas d’échec de traitement ainsi que les témoins appariés 1 :1 par centre de traitement et par date d’échec. Nous avons calculé des rapports de cotes (OR) et intervalles de confiance (CI) à 95% à l’aide de régressions logistiques conditionnelles, pour les associations entre l’échec de traitement et l’âge, le nombre d’accouchements, le statut tabagique, le nombre de partenaires sexuels, l’utilisation du condom, la méthode de contraception, les marges, le nombre de passages, le diagnostic sur le spécimen de traitement, le génotype du VPH, et le nombre de types. Nous avons aussi estimé l’association entre la charge virale et les variants du VPH16 et du VPH18 et l’échec de traitement. Résultats : Les marges positives vs négatives (OR ajusté=4.05, 95% CI 1.57-10.48), la positivité pour le VPH16/18 vs autres types (OR ajusté=2.69, 95% CI 1.32-5.49), et avoir un variant similaire au prototype du VPH16 vs le prototype (OR ajusté=2.49, 95% CI 1.07-5.83) étaient des prédicteurs de l’échec de traitement des HSIL. Être plus âgé, avoir des lésions plus sévères, avoir une infection monotype, et avoir une variation à la position 7521 chez celles avec le VPH16 pourraient augmenter le risque d’échec de traitement, mais les associations n’étaient pas statistiquement significatives. Les estimations pour les autres facteurs étaient proches de la valeur nulle. Nous n’avons pas observé de modification d’effet du génotype sur le risque de l’échec de traitement par le tabagisme, ni par les marges. Conclusion : Seules les marges positives, la positivité pour le VPH16/18 et avoir un variant similaire au prototype étaient des prédicteurs d’un échec de traitement au cours des deux années suivant le traitement. Malgré l’aspect non-modifiable des prédicteurs identifiés, ils sont informatifs et pourront éclairer la prise en charge et le suivi clinique. Objective: Repeated treatments for high-grade squamous intraepithelial lesions (HSIL), which are necessary in the case of treatment failure, are associated with negative obstetric outcomes, such as an increased risk of neonatal death. We investigated the association between a large number of potential risk factors and HSIL treatment failure in an effort to identify potentially modifiable predictors of treatment failure. Methods: The source population included 1,548 Canadian women who received a first treatment for HSIL. Treatment failure was defined as the histological diagnosis of HSIL or cancer within the two years following treatment. We conducted a nested case-control study that included all 101 cases of treatment failure and controls that were matched 1:1 on treatment center and date of failure. We used conditional logistic regression to calculate the odds ratios (OR) and 95% confidence intervals (CI) between treatment failure and age, parity, smoking status, number of sexual partners, condom use, method of contraception, margins, number of passes, diagnosis on the treatment specimen, HPV genotype and number of types. We also estimated the association between HPV16 and HPV18 viral loads and variants and HSIL treatment failure. Results: Having positive vs. negative margins (adjusted OR=4.05, 95% CI 1.57-10.48), being positive for HPV16 and/or HPV18 vs. any other type (adjusted OR=2.69, 95% CI 1.32-5.49), and having a prototype-like variant of HPV16 vs. the prototype (adjusted OR=2.49, 95% CI 1.07-5.83) were predictors of HSIL treatment failure. Older age, more severe lesions, single-type infections and a variation at the 7521 position of the HPV16 genetic sequence may lead to a higher risk of treatment failure but were not statistically significant. Estimates for all other factors were near the null value. The effect of genotype on the risk of treatment failure was not modified by smoking status, nor by margin status. Conclusion: Only positive margins, HPV16/18 positivity, and having a prototype-like variant of HPV16 were predictors for HSIL treatment failure within two years of treatment. Despite being non-modifiable, the identified predictors are clinically significant in regards to management and follow-up of patients.

fr , en

Redefining the anthology : forms and affordances in digital culture

Alors que le modèle économique de la télévision américaine, longtemps dominant, a été mis au défi de diverses manières par les changements industriels et technologiques de ces dernières années, des formes narratives de plus en plus hétérogènes sont apparues, qui se sont ajoutées aux structures sérielles originaires. La diversité des formes télévisuelles est devenue particulièrement évidente depuis que les paysages télévisuels nationaux et locaux ont commencé à s’ouvrir aux marchés étrangers situés en dehors des États-Unis, pour finalement adopter une perspective transnationale et globale. La transition vers la télévision distribuée sur Internet a joué un rôle central dans cette fragmentation formelle et la nouvelle dynamique de la diffusion en ligne a ouvert une different perspective pour comprendre le flux mondial de contenus télévisuels, qui reflète aujourd'hui un environnement multimédia et numérique hautement interconnecté et mis en réseau. En effet, la multiplication des services de vidéo à la demande oblige la sérialité à s’adapter au paysage médiatique contemporain, donnant naissance à des produits audiovisuels pouvant être transférés en ligne et présentant des spécificités de production, de distribution et de réception. L’un des résultats de tels changements dans les séries télévisées américaines à l’aube du XXIe siècle est la série anthologique divisée en différentes saisons avec des histoires distinctes, et pourtant liées par le ton et le style. Ma recherche se situe dans un tel contexte technologique, industriel et culturel, où le contenu télévisuel est de plus en plus fragmenté. Compte tenu de cette fragmentation des contenus, cette thèse examine la manière dont les contenus télévisuels contemporains sont distribués, dans l'interaction entre les processus de recommandation basés sur des algorithmes et les pratiques éditoriales plus traditionnelles. L’objectif de ce projet est donc d’étudier la manière dont certaines structures narratives typiques de la forme de l’anthologie apparaissent dans le contexte de la sérialité de la télévision nord-américaine, à partir de conditions spécifiques de production, de distribution et de consommation dans l’industrie des médias. En se concentrant sur l'évolution (dimension temporelle et historique) et sur la circulation numérique (dimension spatiale, géographique) des séries d'anthologies américaines, et en observant les particularités de leur production et de leur style, ainsi que leurs réseaux de distribution et les modes de consommation qu'elles favorisent, cette thèse s’inscrit finalement dans une conversation plus vaste sur les études culturelles et numériques. L’objectif final est d’étudier la relation entre les formes anthologiques, les plateformes de distribution et les modèles de consommation, en proposant une approche comparative de l’anthologie qui soit à la fois cross-culturelle, crosshistorique, cross-genre et qui prenne en consideration les pratiques pre- et post-numériques pour l’organisation de contenus culturels. As the longtime dominant U.S. television business model has been challenged in various ways by industrial and technological changes in recent years, more heterogeneous narrative forms have emerged in addition to original serial structures. The diversity of televisual forms became particularly evident since national, local television landscapes started opening up to foreign markets outside of the U.S., finally embracing a transnational, global perspective and tracing alternative value-chains. The transition to internet-distributed television played a pivotal role in this formal fragmentation and new dynamics of online streaming opened up another path for understanding the flow of television content, which today reflects a highly interconnected, networked media and digital environment. Indeed, the proliferation of video-on-demand services is forcing seriality to adapt to the contemporary mediascape, giving rise to audiovisual products that can be transferred online and present specificities in production, distribution and reception. One of the outcomes of such changes in U.S. television series at the dawn of the twenty-first century is the anthology series divided in different seasons with separate stories, yet linked by tone and style. My research positions itself in such a technological, industrial and cultural context, where television content is increasingly fragmented. Given such a fragmentation, this thesis considers the ways contemporary television content is distributed in the interaction between algorithmic-driven recommendation processes and more traditional editorial practices. The aim of the project is to investigate the way certain narrative structures typical of the anthology form emerge in the context of U.S. television seriality, starting from specific conditions of production, distribution and consumption in the media industry. By focusing on the evolution (temporal, historical dimension) and on the digital circulation (spatial, geographic dimension) of U.S. anthology series, and observing the peculiarities in their production and style, as well as their distributional networks and the consumption patterns they foster, this thesis ultimately insert itself into a larger conversation on digital-cultural studies. The final purpose is to examine the relation between anthological forms, distribution platforms and consumption models, by proposing a comparative approach to the anthology that is at the same time cross-cultural, cross-historical, cross-genre and accounting for both pre- and post-digital practices for cultural content organization.

fr , en

L'arithmétique de Boèce : le transfert de savoir mathématique grec

Auteur romain du 6ème siècle connu pour ses traductions en latin des textes en grec d’Aristote, Boèce a aussi rédigé une traduction-adaptation d’un texte de Nicomaque de Gérase sur l’arithmétique. La première partie de ce mémoire de maîtrise est consacrée à l’étude de Boèce en tant que passeur de savoir. Sa relation avec son père adoptif est mise en valeur afin de soutenir l’hypothèse selon laquelle Boèce aurait acquis sa connaissance du grec et son éducation tout en restant à Rome, sans avoir séjourné dans les écoles athéniennes ou alexandriennes. La deuxième partie porte sur le contenu mathématique du De institutione arithmetica. Après avoir montré comment le De arithmetica était relié à l’oeuvre de traduction par Boèce des philosophes grecs, le choix de l’Introduction à l’Arithmétique de Nicomaque comme point de départ du traité d’arithmétique de Boèce est étudié. Un catalogue raisonné des concepts mathématiques présentés est ensuite proposé, organisé autour des notions de quantité en soi et quantité relative qui conservent l’opposition entre le Même et l’Autre et rappellent l’opposition fondamentale entre Limité et Illimité, si chère aux pythagoriciens. Ce mémoire se termine par une analyse de la transmission du De institutione arithmetica et de son influence sur les mathématiques et l’enseignement du quadrivium au Moyen-Âge. Roman author of the 6th century known for his Latin translations of Aristotle’s Greek texts, Boethius has also composed a translation-adaptation of a treatise on arithmetics written by Nicomachus of Gerasa. The first section of this master’s thesis focuses on characterizing Boethius as a intermediary, transferring Greek knowledge to the Latin West. His relationship with Symmachus is highlighted in order to argue that Boethius had been able to learn Greek and reach such a high level of learning in Rome, without the need to study in the Athenian or Alexandrian schools of his time. The mathematical content of the De institutione arithmetica is the main topic of the second section. After showing how the De arithmetica is related to Boethius’ magnum opus – the Latin translation of the Greek philosophers – the choice of Nicomachus of Gerasa’ Introduction to Arithmetics as the source of Boethius’ treaty on arithmetics is studied. Then, a catalogue raisonné of the mathematical concepts showcased is provided, organized around the notions of quantity constant of itself and relative quantity which retain the opposition between the Same and the Other and stems from the pythagoricians’ fondamental opposition between the Limited and the Unlimited. This masters’ thesis ends with an analysis of the medieval transmission of the De institutione arithmetica and of its influence on medieval mathematics and education through the quadrivium.

fr , en

Les représentations de la controverse Roman Polanski dans la presse française (2002-2020)

Roman Polanski est un cinéaste franco-polonais considéré comme fugitif par Interpol depuis 1978. En 1977, lors d’un procès pour viol, le réalisateur de 44 ans plaide coupable pour relations sexuelles illégales avec une fille de 13 ans. À sa sortie de prison, par crainte que le juge ne revienne sur sa décision de remise en liberté, Roman Polanski fuit les États-Unis pour se réfugier en France. Le réalisateur poursuivra une carrière à succès dans l’univers du septième art. À ce jour, douze femmes l’accusent de violences à caractère sexuel. Ce mémoire de maîtrise est une analyse qualitative réalisée à partir de la méthode de cadrage sur le déploiement des discours de la controverse associée à Roman Polanski dans la presse française. Les cadres relevés sont les suivants : la culture du viol (1), l’artiste et son œuvre (2), la Justice (3) et la complaisance (4). Nous avons rassemblé un échantillon de 100 articles de presse publiés entre 2002 et 2020 dans trois quotidiens: Libération, Le Monde et Le Figaro. L’analyse est réalisée à partir d’un cadre théorique issu des études féministes, plus particulièrement selon les perspectives du féminisme radical et matérialiste. L’objectif de la recherche est d’illustrer et de comprendre comment s’articulent les discours associés à la controverse Roman Polanski dans la presse en France, et à plus grande échelle dans la société française. Roman Polanski is a French-Polish filmmaker who has been considered a fugitive by Interpol since 1978. In 1977, during a trial for rape, the 44-year-old director plead guilty to illegal sexual relations with a 13-year-old girl. Upon his release from prison, fearing that the judge would reverse his decision to release him, Roman Polanski fled the United States to take refuge in France. The director would go on to pursue a successful career in the world of cinema. To date, twelve women have accused him of committing acts of sexual violence. This dissertation is a qualitative analysis carried out using the framing method on the deployment of the discourses of the controversy associated with Roman Polanski in the French press. The analytical frames identified are: rape culture (1), the artist and his work (2), Justice (3) and complacency (4). We collected a sample of 100 press articles published between 2002 and 2020 in three daily French newspapers: Libération, Le Monde and Le Figaro. The analysis is carried out from a theoretical framework derived from feminist studies, more specifically from the perspectives of radical and materialist feminism. The objective of this research is to illustrate and to understand how the rhetoric associated with the Roman Polanski controversy are articulated in the media in France, as well as on a larger scale in French society.

fr , en

Écophysiologie de l'épinette noire des pessières à mousses et à lichens nordiques

Les changements climatiques sont susceptibles d’affecter la croissance, le développement et la régénération des pessières noires de la forêt boréale. Les échecs de régénération dans les pessières à mousses (PM) de l’ouest du Québec causent des trouées dans la mosaïque forestière dense et augmentent la proportion de pessières à lichens (PL) dans le paysage. Les objectifs de l’étude sont de déterminer si les caractéristiques contrastantes des PM et des PL engendrent différents taux de photosynthèse maximale (Amax) chez les épinettes noires sur un gradient latitudinal ou saisonnier. Ensuite, l’étude tentera de déterminer si le Amax des individus reflète leurs capacités physiologiques par leur taux de carboxylation maximal (Vcmax) et de transport des électrons maximal (Jmax) extraits de courbes de réponse au CO2. Les taux de Vcmax et Jmax sont différents entre les PM et les PL car l’acquisition de ces nutriments semble différente. La latitude influence les valeurs de Vcmax et Jmax, mais l’effet serait causé par les caractéristiques floristiques et la composition du sol des placettes plutôt que par la latitude. Les capacités physiologiques ne se reflètent pas dans les valeurs de Amax, autant pour le type de peuplement que la latitude, car Amax serait limité par la concentration en CO2 qui ne permet pas la saturation de l’enzyme rubisco. Malgré l’absence de différence entre le Amax des PM et des PL, l’augmentation de la concentration en CO2 et de la température risque de créer un écart de Amax entre les types de peuplement, considérant leurs capacités physiologiques différentes. Climate change is likely to affect the growth, development and regeneration of black spruce stands across the boreal forest. Regeneration failures cause gaps in the dense black spruce-feathermoss (BSFM) mosaic increasing the landscape proportion of open lichen-woodland (LW). The aims of the study are to determine whether the contrasting characteristics of BSFM and LW induce different light-saturated maximum photosynthesis (Amax) in black spruce trees across a latitudinal or seasonal gradient. Then the study will attempt to determine if Amax is likely to reflect their physiological capacities based on their maximum carboxylation rate (Vcmax) and maximum electron transport rate (Jmax) derived from CO2 response curves. Vcmax and Jmax are different between BSFM and LW mainly because nutrient acquisition seems different between stand types. Latitude affects values of Vcmax and Jmax, but the effect could be explained by soil and vegetation composition between experimental plots rather than by latitude. Physiological capacities do not match Amax values for stand type and latitude because Amax would be limited by CO2 concentration which does not allow saturation of rubisco. Despite the lack of difference between the Amax of BSFM and LW stands, future increase in CO2 concentration and temperature could induce a gap between their respective photosynthesis rates because of their different physiological capacities.

fr , en

Le débat sur la Bible en langue vulgaire, 1540-1562. Deux traités de Pierre Viret publiés anonymement

Le droit pour tous les fidèles d’accéder directement aux textes fondateurs du christianisme dans leur idiome maternel fut au nombre des principales réclamations des réformateurs. La Réforme française ne fait exception à ce chapitre. Henri Estienne, dans son Apologie pour Hérodote, signale l’existence de toute une littérature de complainte publiée au début des années 1540. Ces écrits, précise-t-il, parurent «sans le nom des auteurs». C’est en dressant une liste aussi complète que possible de ces opuscules que notre attention fut attirée par deux petits écrits très rares et pratiquement ignorés des bibliographes. Il s’agit des titres suivants : 1) TRAICTE AUQUEL / est deduict s’il est loisible de / lire la saincte Escriture en / langue Vulgaire, & / du fruict qui en peult sortir. (s.l.n.d. , 8⁰, italique, 94 p., signé a-f8, marginales, titres courants, 2 initiales ornées (a 2r⁰; 3v⁰). 2) TRAITE, / QU’IL EST NECESSAIRE / QUE TOUTES GENS DE QUEL- / que qualité, sexe, ou aage, qu’ils / soient, lisent les Saintes Escri- / tures : Et du moyen qu’on / y peut tenir. (s.l., s.n., 1561, avec une marque aux palmes du martyr couronnées), 8o, italique, 36 ff., signé A-D8, E4, marginales, titres courants, 1 initiale (Aii ro). Ces deux livrets sont de sensibilité nettement réformée. Les nombreuses citations bibliques, littéraires et patristiques, surtout dans le traité de 1561, montrent que ces textes émanent de la plume de maîtres et non de disciples. Plusieurs candidatures à la paternité ont été considérées. De tous les réformateurs, les écrits de Pierre Viret sont ceux qui offrent le plus de ressemblances avec ces deux opuscules. Les observations accumulées jusqu’ici nous ont convaincu que le premier traité, publié en 1544 et signalé pour la première fois dans l’Index prohibitif de l’Université de Paris en 1549 avec la date 1543, constitue l’édition princeps d’un écrit inédit de Pierre Viret, qui sera réédité fort vraisemblablement à Paris sous une forme profondément remaniée avec nouveau titre en 1561. Cette attribution sera prouvée à l’aide de citations, de rapprochement textuels et d’autres arguments fondés sur la critique interne et externe des sources. Nous résumons ici les grandes lignes de notre démonstration. L’analyse du premier traité (le T1) révèle une étroite parenté de style et d’idées avec les œuvres de Pierre Viret publiées entre 1542 et 1545. Les parallèles et les correspondances se constatent jusque dans le détail. Parmi les textes évoqués, il faut signaler plusieurs emprunts à De la difference qui est entre les superstitions et idolatries des anciens gentilz et payens … (Genève, 1542), un ouvrage important que Viret a souvent réutilisé dans ses écrits postérieurs. Nous avons également retrouvé un bref extrait du T1 dans les Dialogues du desordre qui est a present au monde (Genève, 1545) et dans la Métamorphose chrestienne (1561), ce qui prouve un usage ultérieur de cette source par Viret. Une lecture attentive du T1 révèle aussi un emprunt important à Marie Dentière (Epistre tresutile, 1539) et à Calvin (Epistre monstrant comment Christ est la fin de la loi, 1543). Nos observations nous ont également permis d’avancer des hypothèses plausibles et instructives qu’il restera à valider sur les circonstances de composition du premier traité. On notera un point important : le T1 paraît au moment où la Bible, le Psautier et le Nouveau Testament commencent à être imprimés régulièrement et largement à Genève et à Lyon, deux centres d’édition biblique où s’affirment des discours éristiques très similaires à travers lesquels se discernent, toutefois, une polarisation des enjeux théologiques en matière d’ecclésiologie. Nos recherches sur le T1 connurent un prolongement avec la découverte du traité de 1561 (le T2). La collation des deux opuscules suggère que le T2 est une réédition profondément remaniée du T1. Ce rapprochement est signalé ici pour la première fois. Les habitudes de travail de Viret, surtout depuis le milieu des années 1550, s’accordent avec cette hypothèse. Il nous fallait toutefois entreprendre un travail minutieux de comparaison entre le T2 et les publications contemporaines de Pierre Viret avant de pouvoir tirer des conclusions sur la paternité du deuxième livret. Les résultats se sont avérés éloquents : le T2 se recoupe avec la plupart de ses écrits publiés entre 1559 et 1565 (parenté très étroite d’idées et de style, reprises textuelles, paraphrases). Le T2 reprend notamment un passage de De la difference qui est entre les supersitions (1542), un ouvrage dont nous avons souligné, à la suite d’autres historiens, l’importance dans le répertoire bibliographique virétien. Nos observations peuvent donc se résumer de la manière suivante : le T1 emprunte à Viret, Viret emprunte au T1 et au T2, et le T2 emprunte au T1 et à Viret. Viret a sans doute composé le T2 après son départ de Genève (fin septembre 1561) pour la France. Nîmes est le lieu le plus probable de rédaction. Des indications internes, auxquelles s’ajoutent des témoignages externes donnent à penser que Viret a rédigé ce court traité dans le but de rallier le roi de Navarre et sa cour à la cause réformée à un moment où les Huguenots devenaient toujours plus nombreux dans le royaume, en particulier dans le Midi où les familles de haute naissance et les milieux intellectuels adhéraient avec enthousiasme aux thèses réformées. C’est ainsi qu’au début des années 1560, les réformés constituaient une véritable force politique capable d’infléchir la destinée du royaume dans son centre le plus névralgique : la monarchie. Le T2 est plus précisément contemporain du colloque de Poissy, un événement de grande importance qui se tint à Paris entre le 9 septembre et le 14 octobre 1561. Il y a tout lieu de croire que ce deuxième traité de Viret fut diffusé largement dans la capitale au cours de cette période, puisque le matériel typographique du T2 correspond à celui employé par Nicolas Edoard et Charles Pesnot, deux éditeurs protestants actifs au moment du colloque. À la différence du T1, le T2 paraît donc à un moment où la confessionnalisation des discours religieux a mis en évidence, depuis des années, deux ecclésiologies conflictuelles et irréconciliables. Le T2 paraît également à un moment où s’amorce très nettement la politisation des controverses religieuses dans le contexte gravissime du déclin des Valois et de la montée des Bourbons. Par son immense production littéraire, à laquelle notre thèse ajoute deux nouvelles sources (qu’on pourra lire ici intégralement avec une annotation scientifique), et par son intense activité sur le terrain - tant dans le milieu genevois-romand qu’en France, depuis le début des années 1560 et jusqu’à sa mort en 1571, juste avant le massacre de la Saint-Barthélemy - Pierre Viret aura non seulement été le témoin, mais également un acteur essentiel du débat entourant la démocratisation de la Bible en langue vulgaire et de l’évolution théologique qui a accompagné cette controverse de premier plan au siècle des Réformes. A direct access to the foundational texts of the Christian faith in vernacular languages was part of the basic demands of the Protestant Reformation in the 16th century. The French linguistic domaine was no exception in this regard. Henri Estienne, in his Apologie pour Hérodote, alludes to a specific anonymous literature dedicated to this question in response to biblical censorship in the 1540’s. Our investigations in these primary sources lead our attention on two pamphlets which have remained almost unknown to most bibliographers: 1) TRAICTE AUQUEL / est deduict s’il est loisible de / lire la saincte Escriture en / langue Vulgaire, & / du fruict qui en peult sortir. (s.l.n.d. , 80, italique, 94 p., signé a-f8, marginales, titres courants, 2 initiales ornées (a 2r0; 3v0). 2) TRAITE, / QU’IL EST NECESSAIRE / QUE TOUTES GENS DE QUEL- / que qualité, sexe, ou aage, qu’ils / soient, lisent les Saintes Escri- / tures : Et du moyen qu’on / y peut tenir. (s.l., s.n., 1561, avec une marque aux palmes du martyr couronnées), 80, italique, 36 ff., signé A-D8, E4, marginales, titres courants, 1 initiale (Aii ro). These two treatises clearly disclose a protestant and reformed content. Moreover, the numerous biblical, literary and patristic quotations they contain, more specificaly the 1561 edition, show that they where penned by master’s and not by disciples. Many candidates to their authorship have been considered and among these it is the religious work of Pierre Viret that offers the most ressemblances with the two pamphlets. The observations summed up to this day have convinced us that the first booklet, published in 1544 and mentioned for the first time in 1549 in the Parisian catalogue of prohibited books (Index de Paris, with the notice 1543) forms the editio princeps of an unprecedented work of the Swiss Reformer. It is part of our thesis that this booklet was later completely rewritten by Pierre Viret and published in Paris in 1561 under a new title. The Viretian paternity of these two tracts will be proven in the present research with the help of quotations, textual connections and other arguments based on the internal and external criticism of primary sources. Here follows a brief summary of our demonstration. The analysis of the first booklet (henceforth: T1) reveals a tight relationship with the style and ideas of Pierre Viret as can be seen in his works printed between 1542 and 1555. Among the reminiscent passages, one must point out many borrowings from De la difference qui est entre les superstitions et idolatries des anciens gentilz et payens… (Geneva, 1542), an important work which Viret has often reused in his subsequent writings. We also found a brief extract of T1 in the Dialogues du desordre qui est a present au monde (Geneva, 1545) and in the Métamorphose chrestienne (1561), which prove a later reuse of this source by Viret. A carefull reading of T1 also reveals an import from Marie Dentière’s Epistre tresutile (1539) and Calvin’s Epistre monstrant comment Christ est la fin de la loi (1543). Our findings have also allowed us to put forward plausible and instructive suggestions, which still need to be validated, regarding the immediate editorial context of T1. On this matter, one will note that T1 was released when editions of the Bible, the Psalter and the New Testament were regularly and largely printed both in Geneva and Lyon. These geographical area were two biblical publishing centers following very similar patterns of eristic and religious discourses. Several issues were parts of confessional polarization on both sides. Our research on T1 was extended with the discovery of the 1561 treatise mentioned earlier (henceforth: T2). A carefull comparison of the two treatises suggests that latter is a profoundly reviewed reedition of the former. We are the first to have made this connexion. Viret’s well known literary habits, specially since the mid 1550’s, confirm this hypothesis. However a meticulous comparative study between T2 and Viret’s contemporary writings had to be undertaken before drawing any conclusion. The results of the inquiry are eloquent: T2 overlaps with most of his books published between 1559 and 1565 (strict textual kinship of ideas and style, verbatim recoveries, paraphrases). T2 even picks up a short extract from an important work De la difference qui est entre les supersitions (1542), a book we have underscored, with other historians, the value in Viret's bibliographical and literary repertoire. In short, our findings can be summarized as follows: T1 borrows from Viret, Viret borrows from T1 and T2, and the latter draws from T1 and Viret. Viret probably composed T2 shortly after he left Geneva for France (at the end of September 1561). Nîmes is the most likely location where he wrote this tract. Internal indications, to which external testimonies can be added, lead us to think that Viret wrote this short pamphlet with the intention of rallying the King of Navarre, his court and the nobility to the Reformed faith that is at a key moment when the Huguenots where largely increasing in numbers accross the kingdom, especially in the Southern cities where highly ranked families and many intellectuals enthousiastically clinged to the protestant theses. Hence, in the beginning of the 1560’s, Hugenots where forming a genuine political strength capable to inflect the Kingdom’s destiny in its most sensitive center: the monarchy. T2's context falls in line with the colloque de Poissy, an important event that took place in Paris between September 9 and October 14, 1561. There are reasons to believe that Viret's second treatise was largely disseminated in the French capital city since the printed typographical characters match those used by Nicolas Edoard and Charles Pesnot, namely two protestant printers active at the time of the Poissy colloquium. Differing on this particular point from T1, T2 was thus produced at a time when the process of "confession-building" of religious discourses was making it all the more evident that two conflictual and irreconcilable ecclesiologies were at stake within the same kingdom. In short, the religious debates where now deploying under a political spin. Hence, T2 appeared at a very critical moment when religious debates revolved around the political implications of the decline of the Catholic Valois and the rise of the Protestant Bourbons. Less than a year after the publishing of T2, on 2 April 1562, Condé and his Protestant followers seized the city of Orléans. Their example was soon followed by Protestant groups across the realm. The same year saw the outbreak of the first of the eight religious wars that would plague the kingdom during the rest of the century. By his immense literary input, to which our thesis now adds two new primary sources (which the reader will find herein with scientific annotations), and by his intensive fieldwork as a reformer – both in the Genevan-Swiss milieu and in France since the early 1560’s up until his death in 1571 (one year before the St. Bartholomew's Day massacre) – Pierre Viret will have not only been an important witness but a leading protagonist of the debate over the democratization of the Bible in the vernacular and the theological evolution surrounding this major controversy of the Reformation and post-Reformation era.

fr , en

L'action furtive : une étude de ses situations de diffusion

L’art furtif est un procédé artistique qui consiste à intégrer l’art de manière anonyme dans l’espace urbain, et ce, sans qu’une signalétique explicite en désigne le statut artistique. Créées sous l’anonymat, en secret et sans public, les actions furtives intègrent le champ artistique à travers la documentation que les artistes produisent pour les enregistrer. Cette documentation sera ensuite présentée dans plusieurs situations de diffusion. Cela va de l’exposition d’art jusqu’à son catalogue d’exposition, en passant par toutes formes de communications promotionnelles de l’exposition et dans lesquelles une documentation d’œuvre est susceptible d’apparaître : pamphlets, affiches, dossier de presse, site internet mis en place pour l’occasion, pages événementielles sur les réseaux sociaux, etc. Au-delà de ces situations de diffusion qui se rattachent à un événement précis, il y en a d’autres qui sont plus indépendantes : présentations, conférences, articles de revue, publications. Notre travail s’attache à démontrer plus concrètement, à travers le travail artistique de Diane Borsato, karen elaine spencer et Steve Giasson, comment des documents photographiques faisant l’objet de différents modes de diffusion ont permis à des gestes, des interventions ou des performances qui semblent n’avoir rien de particulier — à part la volonté de passer inaperçus — de devenir des œuvres d’art connues. Nous cherchons à saisir les médiations ayant permis l’intégration des actions furtives dans le champ artistique. Il s’agit de mieux comprendre d’une part, leur nature, et d’autre part leur mécanisme de fonctionnement, soit tous les acteurs, les situations et les actions ayant participé à leur développement. L’étude des médiations permettra en retour d’identifier la fonction d’une documentation d’œuvre au sein d’une situation de diffusion — de même que la fonction de cette dernière — ce qui, tout bien considéré, permettra une meilleure compréhension de l’action furtive et de sa réception. Art furtif is an artistic process that consists of integrating art anonymously into urban space, without any explicit signage designating its artistic status. Produced anonymously, in secret and without an audience; furtive actions are integrated into the artistic field through documents of all kinds. These documents are then transmitted through a variety of media. These range from art exhibitions to exhibition catalogues and all of its forms of promotional communications in which the documentation of an artwork is likely to appear: pamphlets, posters, press kit, website set up for the occasion, event pages on social networks, etc. Beyond these modes of transmission, which are linked to a specific event, there are others more independent media such as presentations, conferences, journal articles and publications. Our task is to demonstrate, through the work of Diane Borsato, karen elaine spencer and Steve Giasson, how photographs have made it possible for gestures, interventions, or performances, which seem to have nothing in particular—apart from their desire to go unnoticed—to become known works of art. Our goal is to understand the mediations that have allowed the integration of furtive actions into the artistic field. This study gives a better understanding of their nature and underlying mechanism. Studying mediations will in turn make it possible to identify the function of an artwork documentation within a given medium — as well as the function of the latter — which, all things considered, will provide a better understanding of furtive action and its reception.

fr , en

IIRC : Incremental Implicitly-Refined Classification

Nous introduisons la configuration de la "Classification Incrémentale Implicitement Raffinée / Incremental Implicitly-Refined Classification (IIRC)", une extension de la configuration de l'apprentissage incrémental des classes où les lots de classes entrants possèdent deux niveaux de granularité, c'est-à-dire que chaque échantillon peut avoir une étiquette (label) de haut niveau (brute), comme "ours”, et une étiquette de bas niveau (plus fine), comme "ours polaire". Une seule étiquette (label) est fournie à la fois, et le modèle doit trouver l’autre étiquette s’il l’a déjà apprise. Cette configuration est plus conforme aux scénarios de la vie réelle, où un apprenant aura tendance à interagir avec la même famille d’entités plusieurs fois, découvrant ainsi encore plus de granularité à leur sujet, tout en essayant de ne pas oublier les connaissances acquises précédemment. De plus, cette configuration permet d’évaluer les modèles pour certains défis importants liés à l’apprentissage tout au long de la vie (lifelong learning) qui ne peuvent pas être facilement abordés dans les configurations existantes. Ces défis peuvent être motivés par l’exemple suivant: “si un modèle a été entraîné sur la classe ours dans une tâche et sur ours polaire dans une autre tâche; oubliera-t-il le concept d’ours, déduira-t-il à juste titre qu’un ours polaire est également un ours ? et associera-t-il à tort l’étiquette d’ours polaire à d’autres races d’ours ?” Nous développons un benchmark qui permet d’évaluer les modèles sur la configuration de l’IIRC. Nous évaluons plusieurs algorithmes d’apprentissage ”tout au long de la vie” (lifelong learning) de l’état de l’art. Par exemple, les méthodes basées sur la distillation sont relativement performantes mais ont tendance à prédire de manière incorrecte un trop grand nombre d’étiquettes par image. Nous espérons que la configuration proposée, ainsi que le benchmark, fourniront un cadre de problème significatif aux praticiens. We introduce the "Incremental Implicitly-Refined Classification (IIRC)" setup, an extension to the class incremental learning setup where the incoming batches of classes have two granularity levels. i.e., each sample could have a high-level (coarse) label like "bear" and a low-level (fine) label like "polar bear". Only one label is provided at a time, and the model has to figure out the other label if it has already learned it. This setup is more aligned with real-life scenarios, where a learner usually interacts with the same family of entities multiple times, discovers more granularity about them, while still trying not to forget previous knowledge. Moreover, this setup enables evaluating models for some important lifelong learning challenges that cannot be easily addressed under the existing setups. These challenges can be motivated by the example "if a model was trained on the class bear in one task and on polar bear in another task, will it forget the concept of bear, will it rightfully infer that a polar bear is still a bear? and will it wrongfully associate the label of polar bear to other breeds of bear?". We develop a standardized benchmark that enables evaluating models on the IIRC setup. We evaluate several state-of-the-art lifelong learning algorithms and highlight their strengths and limitations. For example, distillation-based methods perform relatively well but are prone to incorrectly predicting too many labels per image. We hope that the proposed setup, along with the benchmark, would provide a meaningful problem setting to the practitioners.

fr , en

Nurses’ judgments of patient risk of deterioration at change-of-shift handoff : agreement between nurses and comparison with early warning scores

Background Nurses begin forming judgments regarding patients’ clinical stability during change-of-shift handoffs. Objectives To examine the agreement between incoming and outgoing nurses’ judgments of deterioration risk following handoff and compare these judgments to commonly used early warning scores (MEWS, NEWS, ViEWS). Methods Following handoffs on three medical/surgical units, nurses completed the Patient Acuity Rating. Nurse ratings were compared with computed early warning scores based on clinical data. In follow-up interviews, nurses were invited to describe their experiences of using the rating scale. Results Sixty-two nurses carried out 444 handoffs for 158 patients. While the agreement between incoming and outgoing nurses was fair, correlations with early warning scores were low. Nurses struggled with predicting risk and used their impressions of differential risk across all the patients to whom they had been assigned to arrive at their ratings. Conclusion Nurses shared information that influenced their clinical judgments at handoff; not all of these cues may necessarily be captured in early warning scores.

en

Revue systématique sur les valeurs estimées de paramètres influençant la détection de la tuberculose bovine chez les cervidés d’élevage

La tuberculose bovine est une maladie zoonotique se transmettant principalement par inhalation. C’est une maladie qui peut avoir des répercussions économiques (ex : saisie d’un animal infecté à l’abattoir) et sur les échanges commerciaux, car les pays peuvent bannir l’importation des animaux provenant des pays touchés par cette maladie. Au Canada, le contrôle de cette maladie a commencé en 1923 chez les bovins et a ensuite été appliqué chez les cervidés depuis 1989. Ce programme est composé par la surveillance, la réponse aux éclosions, ainsi que le contrôle des mouvements des cervidés. La capacité de détecter cette maladie lors des activités de surveillance est influencée par la performance des méthodes diagnostiques utilisées à chaque étape de la surveillance. À l’abattoir, la surveillance est effectuée par l’inspection visuelle post-mortem et par différentes procédures diagnostiques réalisées sur des prélèvements de tissus anormaux (histopathologie, réaction de polymérisation en chaîne (PCR) ou culture bactérienne). Chez le cervidé vivant, la surveillance est plutôt réalisée par des tests cutanés ou sérologiques. L’objectif principal de ce projet était de fournir, à travers une revue systématique de littérature, les estimés des valeurs des principaux paramètres pouvant influencer la probabilité de détection de la tuberculose bovine dans un contexte de surveillance de cette maladie à l’abattoir chez les cervidés d’élevage et chez les cervidés vivants. Les études qui ont estimé la probabilité de présence des lésions macroscopiques ont trouvé qu’elle variait de 20% à 100% alors que la probabilité de détection des lésions tuberculeuses était supérieure ou égale à 90%. L’estimé de la sensibilité des tests diagnostiques pouvant être utilisés pour la détection de la tuberculose bovine à l’abattoir (histopathologie, PCR et culture) variait de 63.6% à 98.6%. Chez les animaux vivants, les tests sérologiques et sanguins avaient une sensibilité qui variait de faible à élevée (1.4% à 100.0%) alors que les tests cutanés avaient une sensibilité qui variait de 65.0% à 100.0%. Comme le stade de la maladie (temps depuis l’infection) influence la sensibilité de la majorité des tests diagnostiques et que ce facteur n’a généralement pas été rapporté par les études, la performance de ces tests peut difficilement être comparée. La prévalence de la tuberculose estimée lors des études transversales ou de contrôle de la maladie était faible (prévalence au niveau animal au sein d’un troupeau). Une étude effectuée au Canada sur les facteurs de risque de la tuberculose bovine chez les cervidés d’élevage a constaté que l’augmentation de la taille du troupeau était associée à une augmentation du risque de positivité (du troupeau) à la tuberculose bovine. Ces informations sur la performance et les limites des méthodes diagnostiques sont essentielles pour orienter le choix du test diagnostique et pour permettre l’évaluation de la sensibilité des activités de surveillance Bovine tuberculosis is a zoonotic disease mostly transmitted by inhalation of contaminated material. This disease leads to the economic losses (e.g. condemnation of meat from infected animals at the abattoir) and impede trade since countries can stop importing live cervids from tuberculosis endemic countries. In Canada, the control of bovine tuberculosis started in 1923 in cattle and then was implemented in farmed cervids in 1989. This program is composed of surveillance, response to the outbreaks and movement control of cervids. The capacity of detecting this disease during the surveillance activities depends on the performance of diagnostic methods used at each step of the component of the surveillance system. At the abattoir, the inspection is carried out by visual inspection of organs and carcass and diagnostic tests carried on abnormal tissues by using histopathology, PCR or culture. In live cervids, the detection is carried out through skin or serological testing. The main objective of this project was to provide, through a systematic literature review, the estimates of main parameters that can influence the probability of detecting bovine tuberculosis in the context of surveillance activities in farmed cervids at the abattoir and in live cervids. The probability of presence of macroscopic lesions estimated by studies ranged from 20% to 100% while the estimate of probability of detection of lesions was greater than or equal to 90%. The estimate of sensitivity of diagnostic tests used during bovine tuberculosis surveillance at the abattoir (histopathology, PCR and culture) ranged from 63.6% to 98.6%. In live cervids, studies that investigated the performance of serological tests reported an estimate of sensitivity ranging from low to high (1.4% to 100.0%) while skin tests were reported to have a sensitivity ranging from 65.0% à 100.0%. Given that the stage of the disease affects the performance of most diagnostic test while that variable was not reported by studies, it was difficult to compare the performance of the various tests. Bovine tuberculosis prevalence estimated by studies using a cross-sectional or disease control design reported a low prevalence (prevalence at the animal level within a herd). One study carried out in Canada evaluated the risk factors for bovine tuberculosis infection and found that the increase of herd size was associated with an increase of risk of herd positivity to bovine tuberculosis. This information on the performance and limits of bovine tuberculosis diagnostic tests is critical for orienting the choice of appropriate diagnostic method and for a valid evaluation of the surveillance activities

fr , en

Caractérisation de la douleur neuropathique canine : évaluation des scores de douleur, des profils somatosensoriels et des concentrations en cytokines inflammatoires chez les patients traités avec du gabapentin seul ou en combinaison avec le méloxicam

Selon l’Association Internationale pour l’Étude de la Douleur, la douleur neuropathique est causée par « une lésion ou une maladie du système somatosensoriel ». Actuellement, il n’existe pas de test permettant de la diagnostiquer avec certitude. En médecine humaine, les suspicions cliniques reposent essentiellement sur les caractéristiques de la douleur perçue par le patient. En effet, le mélange de douleurs lancinantes et fulgurantes souvent de très forte intensité, et les termes utilisés pour les décrire, permettent de poser un diagnostic présomptif. En revanche, chez les personnes non-communicantes ainsi que chez nos patients en médecine vétérinaire, la douleur neuropathique devient extrêmement difficile à déceler. Elle pose aussi un problème éthique puisque ces douleurs sont souvent qualifiées d’insoutenables et sont notoirement réfractaires aux traitements analgésiques conventionnels. Faute de données spécifiques, le Conseil sur la douleur de l’Association internationale des vétérinaires pour les animaux de compagnie (WSAVA Global Pain Council) base ses recommandations thérapeutiques sur des succès anecdotiques relevés dans des rapports de cas ou des données tirées de la médecine humaine. Notre étude s’articulait autour de trois objectifs principaux : 1) Évaluer la fiabilité et la faisabilité des tests proposés pour explorer les profils somatosensoriels chez des chiens de propriétaires, incluant une nouvelle méthode dynamique permettant d’évaluer le système endogène de modulation de la douleur ; 2) Identifier une population de chiens de propriétaires présentant de la douleur neurologique chronique à composante neuropathique d’apparition spontanée, en se basant sur les recommandations données en médecine humaine, et caractériser la douleur neuropathique dans ce groupe, en comparant les profils somatosensoriels et les concentrations en cytokines inflammatoires de ces chiens avec ceux d’un groupe contrôle ; 3) Suivre l’évolution des profils somatosensoriels, des concentrations en cytokines inflammatoires et des scores de douleur/qualité de vie des chiens neuropathiques enrôlés dans un essai clinique croisé prospectif, partiellement masqué et randomisé, afin d’évaluer les effets du placebo, du gabapentin seul ou administré en combinaison avec le méloxicam sur ces paramètres. Nos hypothèses étaient que la méthodologie proposée serait fiable et faisable pour évaluer les profils somatosensoriels chez les chiens de propriétaires, et que la population de chiens souffrant de douleur neuropathique diffèrerait du groupe contrôle par leurs concentrations en cytokines inflammatoires, leurs seuils nociceptifs et leur capacité à moduler la douleur après application d’un stimulus conditionnant. Enfin, il était attendu que les traitements actifs (gabapentin et gabapentin-méloxicam) altèreraient les profils somatosensoriels, les scores de douleur/qualité de vie et les concentrations en cytokines inflammatoires des patients neuropathiques. Les tests quantitatifs sensoriels retenus pour évaluer la population de chiens neuropathiques dans la seconde partie du projet (stimulations mécanique et électrique) étaient fiables, faciles à réaliser et bien tolérés. L’évaluation du système inhibiteur descendant induit par les stimulations nociceptives (système endogène de modulation de la douleur; DNIC) a permis de mettre en évidence une dysfonction de la capacité de modulation de la douleur chez les chiens neuropathiques. L’administration de gabapentin combiné ou non avec le méloxicam a eu pour effet de « normaliser » les profils somatosensoriels dynamiques (augmentation du nombre de chiens présentant une inhibition après l’application d’un stimulus conditionnant). Les scores de douleur/qualité de vie ont évolué en faveur d’une amélioration avec l’administration de gabapentin seul ou en combinaison avec le méloxicam. Les concentrations en cytokines inflammatoires et les profils somatosensoriels statiques (les seuils nociceptifs), quant à eux, n’étaient pas différents entre les groupes et n’ont pas significativement varié avec les traitements étudiés. À travers ces études, nous avons présenté de nouvelles techniques de QST fiables et faisable chez le chien. Nous avons également montré que l’évaluation du DNIC est possible dans l’espèce canine, et que les chiens présentant une douleur chronique à composante neuropathique ont un DNIC déficient. L’évaluation des profils somatosensoriels dynamiques et des scores de douleur/qualité de vie supportent l’utilisation du gabapentin seul ou en combinaison avec le méloxicam pour le traitement médical de la douleur neuropathique chez le chien, tel que recommandé par les spécialistes du WSAVA. According to the International Association for the Study of Pain, neuropathic pain is caused by "a lesion or a disease of the somatosensory system". Currently, there is no definitive test available to diagnose neuropathic pain. In humans, the presumptive diagnosis is essentially based on the characteristics of the pain perceived by the patient. In non-communicative individuals, on the other hand, just like in our patients in veterinary medicine, the diagnosis of neuropathic pain is difficult and poses an ethical problem because this type of pain is often qualified as unbearable and known to be refractory to conventional therapies. In the absence of specific data, the Global Pain Council of World Small Animal Veterinary Association (WSAVA) based its treatment recommendations of neuropathic pain on anecdotal veterinary reports, case reports or data from human medicine. This PhD program had three main objectives: 1) To assess the reliability and feasibility of the tests proposed to explore the somatosensory profiles in client-owned dogs, including a method to assess the descending noxious inhibitory controls; 2) To identify a population of client-owned dogs with naturally-occurring neuropathic pain, based on the recommendations from human medicine ; and to characterize neuropathic pain in this group, by comparing the somatosensory profiles and the serum levels of inflammatory cytokines of these dogs with those of a control group; 3) To determine the effects of placebo, gabapentin alone or in combination with meloxicam on the somatosensory profiles, concentrations of inflammatory cytokines and pain scores of dogs with naturally-occurring neuropathic pain managed medically, in a prospective, partially masked and randomized crossover clinical trial. Our hypotheses were that the proposed methodology would be feasible and reliable, allowing to assess somatosensory profiles of client-owned dogs, and that dogs with neuropathic pain would differ from the control group in their serum concentrations of inflammatory cytokines, their nociceptive thresholds and their ability to modulate pain after the application of a conditioning stimulus. Gabapentin and gabapentin-meloxicam would change somatosensory profiles, pain scores and serum concentrations of inflammatory cytokines of dogs with neuropathic pain. 7 The quantitative sensory tests (electrical and mechanical stimulations) were easy to perform, well tolerated and reliable. The evaluation of the diffuse noxious inhibitory control (endogenous pain modulation system; DNIC) revealed a dysfunction of the pain modulation capacity in neuropathic dogs. Administration of gabapentin with or without meloxicam had a "normalizing" effect on the dynamic somatosensory profiles (increase in the number of dogs showing inhibition after application of a conditioning stimulus). Pain / quality of life scores improved after gabapentin alone or in combination with meloxicam. On the other hand, serum concentrations of inflammatory cytokines and static somatosensory profiles (nociceptive thresholds) were not different between groups and did not vary significantly with treatments. Through these studies, we have presented new reliable and feasible QST techniques in dogs. We have also shown that the evaluation of the DNIC is possible in the canine species, and that dogs with chronic pain with a neuropathic component have a deficient DNIC. The assessment of the dynamic somatosensory profiles and pain / quality of life scores support the use of gabapentin alone or in combination with meloxicam for the medical management of neuropathic pain in dogs, as recommended by WSAVA specialists.

fr , en

Un nouveau rôle de la voie Hippo dans la synthèse des gonadotrophines

L’hypophyse est une glande endocrine responsable de la régulation de nombreux processus physiologiques, notamment la reproduction, par la sécrétion des gonadotrophines, la FSH et la LH. Ces hormones sont des glycoprotéines dimériques composées d'une sous-unité α commune (CGA) et de sous-unités β uniques (LHβ et FSHβ), qui confèrent une spécificité biologique. La synthèse de la FSH et la LH au niveau des cellules gonadotropes dépend entre autres de l’expression génique de gènes clés tels que Fshb et Lhb, dont la transcription est régulée par différents facteurs. La GnRH, produite par l’hypothalamus, en est la principale régulatrice, mais d’autres facteurs tels que les activines, qui signalent via des protéines nommées SMAD, participent à cette régulation. L'activité de la voie SMAD peut être modifiée par des interactions avec la voie Hippo dans plusieurs tissus et types de cellules, mais l’implication de la voie Hippo dans la régulation de la synthèse des gonadotrophines n'a jamais été investiguée. La voie de signalisation Hippo est une cascade de kinases qui contrôle l'activité des corégulateurs transcriptionnels fonctionnellement redondants YAP et TAZ. Afin d’élucider les rôles de YAP/TAZ dans la synthèse et la sécrétion de gonadotrophines, nous avons utilisé une approche de ciblage génique conditionnel (cKO) afin de causer la délétion de Yap/Taz spécifiquement dans les cellules gonadotropes. Nous avons constaté que cette délétion entraînait une augmentation de la sécrétion de la FSH et la LH chez les souris mâles, ainsi qu'une légère augmentation de la densité des spermatozoïdes. Les souris femelles cKO avaient des taux plus élevés de la LH sérique (mais pas de la FSH), qui étaient associés à un phénotype d'hyperfertilité caractérisé par des taux d'ovulation plus élevés et des portées plus nombreuses. Étonnamment, la perte de YAP/TAZ dans les gonadotropes n'a pas semblé affecter les gènes clés liés à la synthèse des gonadotrophines, mais la sécrétion de la LH basale et induite par la GnRH a augmenté dans les cellules hypophysaires de souris cKO cultivées in vitro. Les mêmes résultats ont été obtenus dans la lignée LβT2, une lignée de cellules gonadotropes immortalisées lorsque l’action de YAP/TAZ fut inhibée pharmacologiquement. Ensemble, ces résultats indiquent que YAP/TAZ suppriment la sécrétion des gonadotrophines (en particulier de la LH) dans les cellules gonadotropes et révèlent donc un tout nouveau rôle de la voie Hippo dans la reproduction chez mammifères. The pituitary gland is responsible for regulating many physiological processes. Through the secretion of gonadotropins FSH and LH, the pituitary is considered a major regulator of reproduction. These hormones are dimeric glycoproteins composed of a common α subunit (CGA) and unique β subunits (LHβ and FSHβ), which confer biological specificity. The synthesis of FSH and LH at pituitary gonadotrope cells depends mostly on the expression of key genes as Fshb and Lhb. GnRH, produced by the hypothalamus, is the primary regulator, but other factors such as activins, which signal through proteins called SMADs, participate in this regulation. The activity of the SMAD pathway can be altered by crosstalk with the Hippo pathway in several tissues and cell types, but whether the Hippo pathway is involved in regulating gonadotropin synthesis has not been determined. The core Hippo signaling pathway consists of a kinase cascade that regulates the activity of the functionally redundant transcriptional co-regulators YAP and TAZ. To elucidate the roles of YAP/TAZ in gonadotropin synthesis and secretion, we decided to use a conditional gene targeting approach (cKO), which allowed us to promote the depletion of Yap/Taz specifically in the gonadotrope cells. Such conditional deletion resulted in increased circulating levels of FSH and LH in male mice, along with a slight sperm density increase. cKO female mice had augmented circulating LH (but not FSH) levels, which were associated with a hyperfertility phenotype characterized by higher ovulation rates and larger litter sizes. Surprisingly, the loss of YAP/TAZ in gonadotropes did not appear to affect key gonadotropin synthesis-related genes, but both basal and GnRH-induced LH secretion was increased in pituitary cells from cKO mice cultured in vitro. Similar results were obtained using pharmacological inhibition of YAP/TAZ in LβT2 gonadotrope-like cells in vitro. Together, these results indicate that YAP/TAZ suppress gonadotropin release (particularly LH) in gonadotrope cells and reveal a completely novel role of the Hippo pathway in mammalian reproduction.

fr , en

Optimisation de l’anesthésie du lapin (Oryctolagus cuniculus) par l’application des principes du Enhanced Recovery After Surgery (ERAS)

L’adaptation des principes ERAS à l’anesthésie du lapin pourrait améliorer leur taux de mortalité périopératoire élevé. Le développement d’un protocole IM réversible pourrait raccourcir le réveil et diminuer les complications. Les objectifs de ce mémoire sont 1) d’investiguer la relation entre l’administration d’oxygène et la ventilation et 2) de définir les paramètres PK-PD du midazolam IV midazolam et son antagoniste flumazénil chez le lapin. Dans une étude prospective, randomisée, à l’aveugle, 25 lapins de Nouvelle-Zélande (4 mâles, 21 femelles ; 3,1–5,9 kg ; 1 an) ont été anesthésiés avec l’alfaxalone (4 mg/kg), dexmédétomidine (0,1 mg/kg) et midazolam (0,2 mg/kg) IM et randomisés à attendre 5 (n = 8) ou 10 (n = 17) minutes entre l’injection anesthésique et l’administration d’oxygène (100%) ou air médical (masque,1 L/minute). Avant (PREoxy/air5/10) et 2 minutes après l’oxygène ou l’air médical (POSToxy/air5/10), la fréquence respiratoire (fR), pH, PaCO2, PaO2 ont été investigués. L’hypoxémie (PaO2 < 88 mmHg) était présente à tous les temps PRE : PREoxy5 [71 (61–81) mmHg] ; PREoxy10 [58 (36–80) mmHg] et PREair10 [48 (32–64) mmHg]. L’hypoxémie a persisté avec l’air médical : POSTair10 [49 (33–66) mmHg]. L’administration d’oxygène a corrigé l’hypoxémie, mais était associée avec une diminution de fR (> 70% ; p = 0,016, deux groupes) et de l’hypercapnie (p = 0,016, deux groupes). fR restait inchangé avec l’air médical (p = 0,5). PaCO2 était plus élevé avec l’oxygène que l’air (p < 0,001). L’administration d’oxygène précoce a résolu l’hypoxémie reliée à l’anesthésie, mais a empiré l’hypoventilation démontrant que la stimulation respiratoire hypoxique est un facteur important contribuant à la ventilation lorsque ce protocole anesthésique est utilisé. Dans une étude prospective, randomisée, à l’aveugle et croisé, 15 lapins de Nouvelle-Zélande (7 mâles, 8 femelles; 2,73 – 4,65 kg ; 1 an) ont reçu midazolam IV (1,2 mg/kg) à T0 suivi de flumazénil IV (FLU ; 0,05 mg/kg) ou saline (SAL ; même volume) pour renverser la perte du réflexe de redressement (LORR). Le traitement (FLU/SAL) était injecté 30 secondes après LORR. L’échantillonnage sanguin artériel était analysé avec la technique de chromatographie liquide/spectrométrie de masse. Le temps pour le retour du réflexe de redressement (ReRR) était analysé. Demi-vie, clairance plasmatique and volume de distribution du FLU étaient 26,3 min [95%CI : 23,3–29,3], 18,74 mL/min/kg [16,47–21,00] et 0,63 L/kg [0,55–0,71], respectivement. ReRR était 25 fois plus rapide pour FLU (23 [8–44] secondes) versus SAL (576 [130–1141] secondes ; p<0.001, 95%CI [425–914 secondes]). Le retour de la sédation (LORR) était présent dans les deux groupes (4/13 FLU ; 7/13 SAL) à 1540 [858–2328] secondes. Le flumazénil a rapidement antagonisé la sédation du midazolam. Cependant, le potentiel de resédation après l’utilisation du flumazénil nécessite une surveillance accrue durant la période de réveil. Adapting ERAS guideline principles to rabbit anesthesia could improve their risk of perioperative mortality which remains elevated. The development of a reversible IM protocol could hasten recovery and decrease complications. The objectives of this thesis were 1) to investigate the relationship between oxygen administration and ventilation, 2) to define PK-PD parameters of IV midazolam and its antagonist flumazenil in rabbits. In a prospective, randomized, blinded study, 25 New Zealand White rabbits (4 males, 21 females; 3.1–5.9 kg; 1 year old) were anesthetized with IM alfaxalone (4 mg/kg), dexmedetomidine (0.1 mg/kg) and midazolam (0.2 mg/kg) and randomized to a 5 (n = 8) or 10 (n = 17) minutes waiting period between drug injection and oxygen (100%) or medical air administration (facemask, 1 L/minute). Immediately before (PREoxy/air5/10) and 2 minutes after oxygen or medical air (POSToxy/air5/10), respiratory rate (fR), pH, PaCO2, PaO2 were investigated. Hypoxemia (PaO2 < 88 mmHg) was observed at all PRE times. PREoxy5 [71 (61–81) mmHg]; PREoxy10 [58 (36–80) mmHg] and PREair10 [48 (32–64) mmHg]. Hypoxemia persisted when breathing air: POSTair10 [49 (33–66) mmHg]. Oxygen administration corrected hypoxemia but was associated with decreased fR (> 70%; p = 0.016, both groups) and hypercapnia (p = 0.016, both groups). fR was unchanged breathing air (p = 0.5). PaCO2 was higher when breathing oxygen than air (p < 0.001). Early oxygen administration resolved anesthesia-induced hypoxemia, but worsened hypoventilation indicating that hypoxic respiratory drive is an important contributor to ventilation using the studied drug combination. In a prospective, randomized, blinded, crossover study, 15 New Zealand White rabbits (7 males, 8 females; 2.73 – 4.65 kg, 1 year old) received IV midazolam (1.2 mg/kg) followed by IV flumazenil (FLU; 0.05 mg/kg) or saline control (SAL; equal volume) to reverse loss of righting reflex (LORR). Midazolam was injected (T0). Treatment (FLU/SAL) injected 30 seconds after LORR. Arterial blood samples were collected and analyzed using liquid chromatography/mass spectrometry. Time to return of righting reflex (ReRR) compared between groups. FLU terminal half-life, plasma clearance and volume of distribution were 26.3 min [95%CI: 23.3–29.3], 18.74 mL/min/kg [16.47–21.00] and 0.63 L/kg [0.55–0.71], respectively. ReRR was 25 times faster in FLU (23 [8–44] seconds) versus SAL (576 [130–1141] seconds; p<0.001, 95%CI [425–914 seconds]). Return of sedation (LORR) occurred in both groups (4/13 in FLU; 7/13 in SAL) at 1540 [858–2328] seconds. Flumazenil quickly and reliably reversed sedation from midazolam injection. However, the potential resedation after flumazenil administration warrants careful monitoring in the recovery period.

fr , en

Effets de la trazodone sur le comportement et le cortisol sérique du gnou bleu (Connochaetes taurinus)

La trazodone est une drogue antagoniste et agoniste dose-dépendante de la sérotonine utilisée en médecine humaine et vétérinaire pour le traitement de troubles reliés à l’anxiété. Le trauma a été identifié comme la cause primaire de morbidité et de mortalité chez plusieurs espèces de ruminants sauvages et peut être exacerbé par le stress. Dans une étude récente chez la chèvre domestique, la trazodone a réduit les niveaux d’activité sans effets secondaires. La trazodone a le potentiel de réduire le stress et de permettre des captures et manipulations plus sécuritaires chez ces espèces. Les objectifs de cette étude étaient d’identifier une dose de trazodone résultant en une diminution du niveau d’activité chez une espèce de ruminant sauvage, le gnou bleu (Connochaetes taurinus), d’évaluer la sécurité de cette dose et ses effets sur les concentrations de cortisol sérique suivant une procédure vétérinaire de routine. Une étude pilote effectuée à l’aide d’éthogrammes a permis d’identifier une dose orale de 15 mg/kg comme étant efficace pour réduire les niveaux d’activité. Cette dose a mené à une augmentation de 111% du temps passé à dormir/se reposer (P = 0.0003) et de 41% du temps à être couché (P = 0.0016) et une diminution 64% du temps passé à bouger (P = 0.005) et de 65% du temps passé à être vigilant (P = 0.026). La concentration systémique de trazodone mesurée 2 heures suivant l’administration était de 95 ± 48 µg/L. Les concentrations de cortisol sérique durant une procédure de prise sanguine n’ont pas été significativement modifiées par l’administration de trazodone (P > 0.05). Le seul effet adverse noté avec la dose de 15 mg/kg était la baisse d’appétit, ce qui n’était pas présent avec la dose de 12 mg/kg évaluée lors du projet pilote. La trazodone apparaît sécuritaire et prometteuse pour la diminution de l’activité chez le gnou bleu et ainsi pour avoir des effets positifs sur leur bien-être et la sécurité des ruminants sauvages lors de procédures vétérinaires. Trazodone is a dose-dependant serotonin antagonist and agonist used in human and veterinary medicine to treat anxiety-related conditions. Trauma has been identified as the leading cause of morbidity and mortality in several wild ruminant species and can be exacerbated by stress. In a recent study in domestic goats, trazodone reduced activity levels without adverse effects. Trazodone could allow for safer capture and handling in ruminant species. The objectives of the present study were to identify a dose of trazodone that decreases activity levels in captive blue wildebeest (Connochaetes taurinus), to evaluate its effects on serum cortisol levels following a routine veterinary procedure, and its safety. A pilot study using ethograms identified a 15 mg/kg oral dose of trazodone as effective to reduce activity levels. Over 6 hours, this dose resulted in a 111% increase in time spent sleeping/resting (P=0.0003), a 41% increase in time spent lying down (P=0.0016), a 64% reduction in time spent moving (P=0.005), and a 65% reduction in time spent being vigilant (P=0.026). Systemic absorption of trazodone was identified when plasma concentrations were measured after 2 hours (95 ± 48 µg/L). Serum cortisol levels during a routine venipuncture event were not significantly different following trazodone adminstration (P > 0.05). Mild hyporexia was the only adverse effect noted at 15 mg/kg and was absent at a 12 mg/kg dose. Trazodone appears safe and promising to decrease activity in the blue wildebeest and might thus have a positive effect on wild ruminant welfare and the safety of veterinary procedures.

fr , en

Découvertes de nouveaux mécanismes de résistance au Topotecan, un inhibiteur des topoisomérases, chez Leishmania infantum

Le protozoaire Leishmania est à l’origine d’une maladie tropicale négligée qui peut s’avérer mortelle si elle n’est pas traitée adéquatement. Dans les dernières années, l’efficacité des médicaments utilisés dans le combat de la leishmaniose a grandement diminué en raison de la résistance du parasite à ceux-ci. Bien que le Topotecan (TPT), présentement utilisé comme antitumoral, ait démontré une activité antileishmaniale puissante (EC50 de l’ordre des nanomolaires), son efficacité pourrait être compromise par l’émergence de la résistance du parasite d’autant plus que des résistances tumorales cliniques au TPT ont déjà été rapportées. Dans cette étude, les mécanismes de résistance au TPT par Leishmania infantum ont été caractérisés d’un point de vue moléculaire. Le génome complet des parasites sélectionnés résistants au TPT (16 x EC50) (TPT700.1, TPT700.2, TPT700.3) a été séquencé. Le rôle dans la résistance des différents éléments génétiques identifiés a été confirmé à l’aide d’une complémentation par nucléofection épisomale dans le parasite sauvage et a été étudié avec des simulations computationnelles. Aucune amplification ni délétion n’a été identifiée et seulement une variation mineure du nombre de chromosomes a été observée. Cependant, un polymorphisme d’un seul nucléotide non synonyme a été identifié dans le gène de la grande sous-unité de la topoisomérase IB (TOP IB), la cible du TPT, chez chacun des parasites mutants résistants conférant des niveaux de résistance variables (TPT700.1 F187Y > TPT700.3 W232R > TPT700.2 G191A > sauvage). De plus, des modélisations in sillico ont permis d’illustrer la proximité de ces substitutions d’acides aminés au site catalytique de TOP IB ainsi qu’au site de liaison du TPT. En conclusion, ces résultats suggèrent qu’une mutation ponctuelle dans la grande sous-unité TOP IB est suffisante pour engendrer des hauts niveaux de résistance (environ 24 x EC50) chez TPT700.1F187Y, TPT700.2G191A et TPT700.3 W232R. TPT pourrait être considéré comme un modèle pharmacologique pour l’étude de la résistance chez Leishmania. Leishmania, a protozoan parasite, causes a neglected tropical disease that is fatal if left untreated. In recent years, the effectiveness of the drugs used to tackle leishmaniasis has decreased dramatically due to the emergence of drug resistant parasites. Even though Topetecan (TPT), currently employed as an anti-tumoral drug, has shown strong anti-leishmanial activity (its EC50 being measured in nanomoles), its efficiency may be compromised by the resistance developped by the parasites, similarly to the resistance already recorded by tumoral cells to the drug. In this study, the mecanisms of resistance to TPT by Leishmania infantum were caracterised at the molecular level. The whole genome of parasites resistant to TPT (16 x EC50) (TPT700.1, TPT700.2, TPT700.3) was sequenced. The role of various genetic elements in the resistance mecanisms was confirmed via a complementation by episomal nucleofection in the wild type and was studied with the help of computational models. Neither amplications nor deletions were identified and only a minor variation in the chromosome number was observed. However, a non-synonymous single nucleotide polymorphism was identified in the gene coding the large subunit of topoisomerase IB, TPT’s target, within each of the resistant mutant parasites confering variable levels of resistance (TPT700.1 F187Y > TPT700.3 W232R > TPT700.2 G191A > wild type). Furthermore, in sillico models highlighted the proximity of these amino acid substitutions to the catalytic site of topoisomerase IB and also to the binding pockets of TPT. In conclusion, these results suggest that a point mutation in the large subunit of TOP IB is sufficient to confer high levels of resistance (about 24 x EC50) to TPT700.1F187Y, TPT700.2G191A and TPT700.3 W232R. Therefore, TPT can be considered a pharmacological tool to study resistance in Leishmania.

fr , en

Potentiel de systèmes de culture bactériologique à la ferme et validation de la cytologie pour le diagnostic de l’endométrite chez la vache laitière en période post-partum

L’endométrite est une maladie affectant les performances en reproduction chez la vache laitière. Elle est définie par la présence d’inflammation excessive au niveau de l’utérus durant la période post-partum. Le traitement antibiotique sous forme d’infusion intra-utérine est l’une des approches curatives les plus utilisées et améliore les performances de reproduction subséquentes. Considérant les enjeux modernes en lien avec l’antibiorésistance et la réduction de l’utilisation d’antibiotiques en productions animales, il est justifiable de remettre en question l’utilisation d’une méthode diagnostique de l’endométrite basée uniquement sur la présence d’inflammation en vue de déterminer si un traitement antibiotique doit être utilisé. En ce sens, l’objectif principal de ce projet de recherche était de valider l’exactitude des résultats de milieux de culture bactériologique utilisés à la ferme (Tri-plate et Petrifilm) en se basant sur ceux obtenus en laboratoire diagnostique. Un objectif secondaire était de vérifier la concordance entre les résultats bactériens de laboratoire et ceux cytologiques. Pour ce faire, une étude observationnelle transversale a été réalisée au sein de deux troupeaux laitiers commerciaux faisant partie de la clientèle de la Clinique ambulatoire bovine de la Faculté de médecine vétérinaire de l’Université de Montréal. Un total de 189 vaches en période post-partum (30 à 43 jours de lactation) ont été enrôlées de façon systématique afin de recueillir 2 échantillons utérins à partir de cytobrosses lors d’un même examen. La première cytobrosse était utilisée pour inoculer directement le milieu de culture Tri-plate et ensuite être envoyée au laboratoire du Service diagnostic de la FMV de l’Université de Montréal pour culture bactérienne aérobique. La seconde cytobrosse était utilisée pour l’analyse cytologique (proportion de cellules polymorphonucléaires; PMNL), puis était diluée dans 1 ml de solution saline pour inoculer le milieu Petrifilm. Après une période d’incubation de 24h, le décompte de colonies était fait pour chaque milieu de culture. À partir de ces données, les analyses statistiques ont été complétées dans le but d’optimiser la sommation de sensibilité et spécificité (Se+Sp) des deux milieux de culture en fonction des résultats du laboratoire de référence. Pour le milieu Tri-plate, le seuil de ˃ 90 colonies a permis d’obtenir la Se+Sp maximale, soit 167,7. Pour le milieu Petrifilm, le seuil de ˃100 colonies a donné la Se+Sp maximale, soit 129. En ce qui concerne la concordance entre le diagnostic cytologique et bactériologique, les résultats de notre projet montrent que 64,3% des vaches positives au niveau cytologique (˃6% PMNL) se sont avérées négatives à la culture bactérienne, démontrant un manque de concordance. En conclusion, les résultats de notre étude supportent la faisabilité et le potentiel de la culture bactérienne d’échantillons de l’endomètre à la ferme. Notre projet met également en évidence que l’utilisation d’un dépistage cytologique de l’endométrite afin d’utiliser un traitement antibiotique puisse causer un manque d’optimisation dans l’efficacité des traitements. Il semble donc pertinent que d’autres projets soient complétés afin d’approfondir le dépistage bactériologique de l’endométrite et d’analyser le potentiel diagnostique de celui-ci. Endometritis is a disease affecting reproductive performance in dairy cows. It is defined by the presence of excessive inflammation in the uterine body during the postpartum period. From a curative point of view, the use of antibiotic treatment in the form of intrauterine infusion is one of the most widely used methods which has a beneficial effect on subsequent reproductive performance in positive cases of endometritis. Considering the modern issues concerning the use of antibiotics in animal production, the use of a diagnostic method based on the presence of inflammation in order to administer antibiotic treatment is questionable. In that sense, the main objective of this research project was to validate the accuracy of the results of bacteriological culture medium used on the farm (Tri-plate and Petrifilm) based on the ones from diagnosis laboratory. A secondary objective was to verify the concordance between the bacterial and cytological results. To do this, a cross-sectional observational study was set up within two commercial dairy herds followed by the bovine outpatient clinic of the Faculty of Veterinary Medicine of the Université de Montréal. A total of 189 cows in the postpartum period (30 to 43 days in milk) were systematically enrolled in order to collect 2 uterine samples from cytobrush during the same examination. The first cytobrush was used to directly inoculate the Tri-plate medium and then be sent to the reference laboratory (Diagnostic service of the FVM of the Université de Montréal) for aerobic bacterial analysis. The second cytobrush was initially used to make a microscopic smear for cytological analysis (polymorphonuclear cell proportion (PMNL)) and subsequently diluted in 1 ml of saline to inoculate the Petrifilm medium. After an incubation period of 24 hours, the colony count was made for each culture medium. From these data, statistical analyses were completed in order to optimize the summation of sensitivity and specificity (Se + Sp) of the two culture medium according to the results of the reference laboratory. For the Tri-plate medium, the cutoff of ˃ 90 colonies resulted in the maximum Se + Sp, which was 167.7. For the Petrifilm medium, the threshold of ˃100 colonies gave the maximum Se + Sp, which was 129. Regarding the concordance between the cytological and bacterial diagnosis, the results of our project show that 64.3% of cows positive for cytological criteria (˃6% PMNL) were found to be negative from a bacterial point of view. In conclusion, this study shows that Tri-plate and Petrifilm medium used on-farms were best to reproduce the results obtained by laboratory analysis using 90 and 100 colony threshold respectively. Our results also support a lack of agreement between cytological and bacterial diagnosis. It therefore seems relevant that other projects are completed in order to deepen the bacterial screening for endometritis and to analyze its diagnostic potential.

fr , en

Évaluation de la stabilisation de la rupture du ligament croisé crânial canin par la suture latérale : une étude de cinématique 3D in-vitro

L’impact de la correction chirurgicale de la rupture du ligament croisé crânial (LCC) sur la cinématique 3D du grasset a peu été étudiée chez le chien. Plusieurs techniques tentent de restaurer la fonction normale du grasset suite à la rupture du LCC, mais les succès demeurent mitigés comme en témoignent le retour à une fonction suboptimale et la progression de l’arthrose. L’incapacité de ces techniques à restaurer la cinématique 3D pourrait être un élément clé expliquant ces succès suboptimaux. L’objectif de ce projet de recherche était d’évaluer l’impact d’une des techniques fréquemment utilisées, la stabilisation par suture latérale (SSL), sur la cinématique 3D du grasset. Dix membres pelviens provenant de grands chiens (25-40kg) ont été utilisés avec un montage préalablement validé simulant le trot. Trois situations ont été comparées : i) grasset sain, ii) grasset instable par transsection du LCC, et iii) grasset stabilisé par SSL. Pour chaque situation, la cinématique 3D était enregistrée durant 5 cycles dans le montage. Les courbes ont été analysées en utilisant un test statistique Wilcoxon signed rank test. La SSL a restauré la cinématique du grasset intact sain sur l’entièreté de la phase d’appui pour la translation crânio-caudale, médio-latérale, la flexion et l’abduction. Elle a restauré la translation proximo-distale sur 90% de la phase d’appui. La rotation interne a été limitée par la SSL, mais n’a pas été restaurée. Ces résultats montrent que cette technique chirurgicale reproduit une cinématique 3D globalement semblable à celle du grasset sain. La progression de l’arthrose rapportée suite à la stabilisation du grasset par SSL pourrait donc ne pas résulter d’une cinématique 3D anormale. The impact of surgical correction of cranial cruciate ligament rupture (CCLR) on 3D kinematics has not been thoroughly evaluated in dogs. The success of current techniques remains limited, as illustrated by suboptimal weightbearing and progression of osteoarthritis. The inability to restore the stifle’s 3D kinematics might be a key element in understanding these suboptimal outcomes. The objective of this study was to evaluate the impact of lateral suture stabilization (LSS) on the 3D kinematics of the canine stifle joint. We hypothesized that LSS would not restore 3D kinematics in our model. Ten pelvic limbs collected from euthanized large dogs (25-40 kg) were tested with a previously validated apparatus that simulates trot. Three experimental conditions were compared: (a) intact stifle; (b) unstable stifle following cranial cruciate ligament transection (CCLt) and (c) CCLt stabilized by LSS. Three-dimensional kinematics were collected through 5 gait cycles and curves were analyzed using a Wilcoxon signed-rank test. LSS restored baseline kinematics for the entire stance phase for cranial and lateromedial translation, sagittal flexion, and abduction. It restored distraction over 90% of the stance phase. Internal rotation was limited, but not restored. This in vitro study had limitations, as it used a simplified model of stifle motion and weight-bearing. The results of this study demonstrate that LSS can restore physiologic 3D kinematics largely comparable to those of healthy stifles. Suboptimal outcome in patients following CCLR stabilization by LSS may therefore result from causes other than immediate postoperative abnormal 3D kinematics.

fr , en

Efficacité des isoxazolines pour traiter le réservoir principal de l’agent de la maladie de Lyme, la souris Peromyscus leucopus

La maladie de Lyme est émergente au Canada; le risque engendré par cette maladie vient en partie de la ténacité de son vecteur et des méthodes limitées pour réduire son abondance dans l’environnement. Actuellement, peu de moyens de prévention visent de manière efficace et sécuritaire le réservoir principal de la bactérie responsable de la maladie, la souris à patte blanche Peromyscus leucopus. L’objectif de ce projet était d’évaluer l’efficacité des isoxazolines, une nouvelle classe d’antiparasitaire, lorsqu’administré sous forme d’appâts oraux aux micromammifères résidents d’un site endémique pour la maladie de Lyme. Les appâts furent distribués lors de l’été 2018 et 2019, sur les terrains choisis du parc national des Mille-Îles, en Ontario. La capture de micromammifères, en terrain traité et non traité, nous permit d’évaluer l’infestation (nombre de tiques par souris) du réservoir Peromyscus alors que l’effet du traitement sur la densité de tiques dans l’environnement fut estimé par la technique de flanelle. L’impact de la molécule d’isoxazoline employée (sarolaner versus fluralaner), de la biodiversité et du type d’environnement (caractéristiques de la forêt, température, humidité) fut également évalué. Des modèles linéaires mixtes binomiale négative furent composés pour déterminer l’impact de chacune des variables mesurées et du traitement sur les variables dépendantes, soit le nombre de tiques sur les souris capturées et la densité de nymphes dans l’environnement. Après deux étés de traitement, les souris capturées sur les microsites traités furent significativement moins infestées que les souris capturées sur les microsites contrôles pour 3 des 5 sites étudiés. Par contre, aucune diminution significative du nombre de nymphes dans l’environnement ne fut observée, probablement dû à la courte durée du devis d’étude. La densité de nymphes dans l’environnement variait toutefois en fonction de l’année d’échantillonnage et était positivement corrélée avec la biodiversité au niveau du microsite. Le nombre de tiques sur Peromyscus spp. était associé au sexe (les mâles étant plus infesté) et à la taille de l’animal, au mois et à l’année de la capture, à une forte densité de larves dans l’environnement et au traitement effectué sur le microsite de capture. Le fluralaner se montra plus efficace à réduire l’infestation moyenne des rongeurs. Cette étude fut la première à étudier l’utilisation de saronaler oral chez le réservoir principal de l’agent de la maladie de Lyme en milieu naturel. L’effet du traitement chez les micromammifères est prometteur, mais son efficacité pour réduire la densité de tiques dans l’environnement reste à confirmer. Lyme disease is the most common vector-borne disease in North America; the risk caused by the disease is partly due to its tick vector’s tenacity and limited number of approaches to reduce its abundance in the environment. Few existing methods efficiently and safely target the principal host for the bacteria, white-footed mice Peromyscus leucopus.The objective of this thesis was to evaluate the efficacy of a new family of antiparasitic drug, isoxazolines, when passively administered as an oral bait to micromammals in endemic site for Lyme disease. Oral baits were distributed during the summer of 2018 and 2019 on five selected sites in the Thousand Islands National Park. Density of ticks in the environment was estimated using drag sampling while small mammal trapping allowed biodiversity and infestation (number of ticks per mouse) to be assess. Impact of isoxazoline used (sarolaner or fluralaner), biodiversity and characteristics of environment (type of forests, temperature, humidity) were also evaluated. Linear mixed models were fitted to determine the impact of measured variables and treatment on infestation level and density of questing nymphs. Results show a significant reduction in tick load for mice captured on treatment plots compared to control plots for 3 out of 5 sites. However, we did not observe a significant reduction in the density of questing nymphs, probably due to the limited duration of the study. Density of nymphs followed interannual variation and was best explained by humidity levels at the time of sampling and plot-level host biodiversity. Peromyscus spp. infestation was linked to the sex (male being more infested) and body length of the mice, high density of questing larvae, year and month of capture and treatment applied to the microsite. Fluralaner showed to be more efficient at reducing mice average tick load. This study was the first to use oral sarolaner to treat the most important reservoir for the Lyme disease agent in the environment. Our protocol did not significantly reduce questing nymphs in the environment for the duration of this study but could potentially diminish Lyme disease human risk with long term use through reduced Peromyscus infestation.

fr , en

Recherche de biomarqueurs d’activité ostéoclastique pour prévenir les fractures de stress chez les chevaux de course

Chaque année, des chevaux de course décèdent de fractures complètes lors d’entrainement ou de course. A l’exercice, les charges supra-physiologiques cycliques entrainent des microfissures indiscernables par les techniques d’imagerie in vivo actuelles. Les ostéoclastes recrutés aux sites lésés induisent localement une lyse osseuse et une ostéopénie par résorption excessive, créant une concentration de contrainte à l’origine de fracture complète. Cependant, le rôle biologique des ostéoclastes dans les fractures de stress n’est à ce jour pas clairement identifié. Les objectifs de cette étude ont été d’établir des cultures in vitro d’ostéoclastes équins, corréler le nombre d’ostéoclastes avec l’isoforme 5b de l’enzyme phosphatase acide tartrate-résistante (TRACP 5b), corréler la résorption osseuse avec la TRACP-5b et le télopeptide C-terminal du collagène de type I (CTX-I) et étudier les effets de facteurs d’inflammation sur l’activité ostéoclastique. Après aspiration de moelle osseuse sternale, les cellules souches hématopoïétiques ont été isolées, conservées dans une banque cellulaire, décongelées, différenciées en ostéoclastes, avec ou sans os équin, et stimulées par des facteurs inflammatoires (IL-1β ou LPS). CTX-I et TRACP-5b ont été dosés par ELISA. Le nombre d’ostéoclastes colorés à la phosphatase acide tartrate-résistante et les aires de résorption osseuse colorées au bleu de toluidine ont été évalués. Dans les cultures d’ostéoclastes, la TRACP-5b augmentait (p < 0,0001) avec le temps et était corrélée (r = 0,63, p < 0.001) avec le nombre d’ostéoclastes. Dans les cultures d’ostéoclastes sur os, le CTX-I (p = 0,0018) et la TRACP-5b (p = 0,02) augmentaient avec le temps, étaient corrélés ensemble (r = 0,64, p < 0,002) et étaient tous deux corrélés avec la résorption osseuse (respectivement, r = 0,85, p < 0,001 et r = 0,82, p < 0,001). La stimulation inflammatoire n’a eu aucun effet significatif. Ostéoclastes équins et résorption osseuse ont été obtenus avec succès sur os équin à partir d’aspiration de moelle osseuse sternale. Pour la première fois, CTX-I et TRACP-5b ont été mesurés dans des cultures d’ostéoclastes équins. In vitro, CTX-I est un biomarqueur de résorption osseuse équine et TRACP-5b un biomarqueur du nombre d’ostéoclastes et de résorption osseuse équins. Des recherches ultérieures sont nécessaires afin d’évaluer si la TRACP 5b sérique permet la détection de toute résorption osseuse excessive chez les chevaux de course. Every year racehorses die from complete catastrophic fractures in training and racing. Supra-physiological cyclic loads during exercise cause bone microcracks not discernible with current imaging in vivo. Osteoclasts recruited to the sites of the damage induce focal bone lysis and osteopenia by excessive resorption, creating a stress riser area susceptible to complete fracture. However, the biological impact of osteoclasts in stress fractures is not entirely understood. Our objectives were to establish in vitro cultures of equine osteoclasts, to correlate osteoclast numbers with the tartrate-resistant acid phosphatase 5b isoform (TRACP-5b), to correlate bone resorption with the TRACP-5b and the C-terminal telopeptide of type I collagen (CTX-I), as well as to investigate the effects of inflammatory factors on osteoclast activity. Following equine sternal bone marrow aspirations, hematopoietic stem cells were isolated, stored in a cell bank, thawed, differentiated into osteoclasts, with or without equine bone slices, and they finally underwent inflammatory stimulation (IL-1β or LPS). CTX-I and TRACP 5b were assayed by ELISAs. Osteoclasts stained with tartrate resistant acid phosphatase were counted and bone resorption areas stained with toluidine blue were measured. In the osteoclast cultures, the TRACP 5b increased (p < 0.0001) with time and correlated (r = 0.63, p < 0.001) with osteoclast number. In the osteoclast-bone cultures, both CTX-I (p = 0.0018) and TRACP-5b (p = 0.02) increased with time, correlated with each other (r = 0.64, p < 0.002) and both correlated with bone resorption (r = 0.85, p < 0.001 and r = 0.82, p < 0.001, respectively). The inflammatory stimuli had no significant effects. Equine osteoclasts and bone resorption were successfully induced on equine bone from sternal bone marrow aspiration. For the first time CTX-I and TRACP-5b were measured in equine osteoclast cultures. In vitro, CTX-I is a biomarker of equine bone resorption and TRACP-5b a biomarker of equine osteoclast number and bone resorption. Further investigations are required to measure the serum TRACP-5b capacity to detect excessive skeletal resorption in racehorses.

fr , en

Dose-dependent pharmacokinetics of ropivacaine in anesthetized rabbits : absence of changes in protein binding

Objective: The primary objectives of this study were to investigate the in vivo pharmacokinetics and in vitro plasma protein binding of ropivacaine at the concentration range observed after intravenous administration of different doses in anesthetized rabbits. Study design: Prospective experimental study Animals: Thirteen New Zealand White rabbits Methods: Rabbits were anesthetized with isoflurane. Different doses (0.62 to 6.52 mg/kg) of 0.5 % plain ropivacaine hydrochloride were administered and arterial blood sampled at frequent intervals up to 10 hours. Ropivacaine plasma concentrations were determined by high performance liquid chromatography. Pharmacokinetic analysis of individual data sets was performed using non-compartmental approach to calculate area under the plasma concentration–time curve from time zero to infinity (AUC0–inf). In vivo pharmacokinetics linearity was verified using analyses of variance for between group comparisons of the effect of dose on the AUC0–inf normalized by the dose. A population pharmacokinetic model was developed to describe ropivacaine disposition after intravenous administration in the linear range of dose in anesthetized rabbits. Determination of protein binding was performed, under controlled temperature and pH conditions, in plasma samples spiked extemporaneously with 3 H-ropivacaine and unlabeled ropivacaine (2.5 and 3500 ng/ml) using an ultrafiltration method. Results: At intravenous doses higher than 3.67 mg/kg, dose-dependent changes in ropivacaine systemic clearance were observed. In contrast, protein binding was found to be concentration independent in the tested range. Conclusions and clinical relevance: In anesthetized rabbits, saturation of ropivacaine plasma protein binding is not the mechanism responsible for the pharmacokinetic nonlinearity of ropivacaine observed at intravenous doses higher than 3.67 mg/kg. Disposition parameters obtained in our study will enable accurate characterization of ropivacaine pharmacokinetics after a peripheral nerve block.

en

Méthodes de décomposition basées sur la relaxation lagrangienne : cas du problème de transport avec coûts fixes

Notre sujet de recherche porte sur la résolution du problème de transport avec coûts fixes (FCTP). Le problème de transport classique consiste à déterminer le schéma optimal de distribution dans un réseau. Le réseau est divisé en deux sous-ensembles de sommets : les origines caractérisées par une offre et les destinations caractérisées par une demande. À chaque arc reliant une origine et une destination, est associé un coût variable. L'objectif est de satisfaire toutes les demandes en minimisant la somme des coûts variables de transport. Dans le FCTP, il y a aussi des coûts fixes associés à tous les arcs, en supplément de tout ce qui décrit un problème de transport classique. Ainsi, à chaque arc, est associé un coût variable et un coût fixe qui est considéré si et seulement si l'arc est utilisé. L'objectif est désormais de minimiser la somme totale des coûts, variables et fixes. Le FCTP nous confronte donc à un modèle différent et plus complexe. La complexité de résolution est accrue pour les instances de grande taille. Dans ce mémoire, nous étudions et présentons une nouvelle méthode de résolution pour les instances de grande taille du FCTP. Il s'agit d'une méthode de décomposition lagrangienne qui utilise la relaxation lagrangienne et un algorithme de sous-gradient pour trouver une borne inférieure au problème global. Nous avons intégré à la méthode une heuristique lagrangienne, incluant une procédure de ``slope scaling'' afin d'améliorer notre algorithme de sous-gradient et le résultat final de la méthode. À l'issue de notre processus de résolution, nous trouvons, pour certaines instances de grande taille, un moyen d'améliorer la solution proposée par CPLEX pour le FCTP en donnant comme paramètre à CPLEX la solution finale de notre méthode. Our research topic focuses on solving the fixed charge transportation problem (FCTP). The classic transportation problem is to determine the optimal distribution pattern in a network. The network is divided into two subsets of vertices : the origins characterized by a supply and the destinations characterized by a demand. Each arc connecting an origin and a destination has a variable cost associated with it. The objective is to satisfy all demands while minimizing the sum of variable transportation costs. In FCTP, there are also fixed costs associated with all arcs, in addition to all others things that describe a typical transportation problem. So, each arc is associated a variable cost and a fixed cost which is considered if and only if the arc is used. The objective is now to minimize the total sum of costs, variable and fixed. The FCTP therefore confronts us with a different and more complex model. The resolution complexity is even increased for large instances. In this thesis, we study and present a new resolution method for large FCTP instances. This is a lagrangian decomposition method which uses lagrangian relaxation and a subgradient algorithm to find a lower bound to the global problem. We have integrated into the method a lagrangian heuristic, including a “slope scaling” procedure in order to improve our sub-gradient algorithm and the final result of the method. At the end of our resolution process, we find, for some large instances, a way to improve the solution proposed by CPLEX for the FCTP by giving as parameter to CPLEX the final solution of our method.

fr , en

Pattern-based refactoring in model-driven engineering

L’ingénierie dirigée par les modèles (IDM) est un paradigme du génie logiciel qui utilise les modèles comme concepts de premier ordre à partir desquels la validation, le code, les tests et la documentation sont dérivés. Ce paradigme met en jeu divers artefacts tels que les modèles, les méta-modèles ou les programmes de transformation des modèles. Dans un contexte industriel, ces artefacts sont de plus en plus complexes. En particulier, leur maintenance demande beaucoup de temps et de ressources. Afin de réduire la complexité des artefacts et le coût de leur maintenance, de nombreux chercheurs se sont intéressés au refactoring de ces artefacts pour améliorer leur qualité. Dans cette thèse, nous proposons d’étudier le refactoring dans l’IDM dans sa globalité, par son application à ces différents artefacts. Dans un premier temps, nous utilisons des patrons de conception spécifiques, comme une connaissance a priori, appliqués aux transformations de modèles comme un véhicule pour le refactoring. Nous procédons d’abord par une phase de détection des patrons de conception avec différentes formes et différents niveaux de complétude. Les occurrences détectées forment ainsi des opportunités de refactoring qui seront exploitées pour aboutir à des formes plus souhaitables et/ou plus complètes de ces patrons de conceptions. Dans le cas d’absence de connaissance a priori, comme les patrons de conception, nous proposons une approche basée sur la programmation génétique, pour apprendre des règles de transformations, capables de détecter des opportunités de refactoring et de les corriger. Comme alternative à la connaissance disponible a priori, l’approche utilise des exemples de paires d’artefacts d’avant et d’après le refactoring, pour ainsi apprendre les règles de refactoring. Nous illustrons cette approche sur le refactoring de modèles. Model-Driven Engineering (MDE) is a software engineering paradigm that uses models as first-class concepts from which validation, code, testing, and documentation are derived. This paradigm involves various artifacts such as models, meta-models, or model transformation programs. In an industrial context, these artifacts are increasingly complex. In particular, their maintenance is time and resources consuming. In order to reduce the complexity of artifacts and the cost of their maintenance, many researchers have been interested in refactoring these artifacts to improve their quality. In this thesis, we propose to study refactoring in MDE holistically, by its application to these different artifacts. First, we use specific design patterns, as an example of prior knowledge, applied to model transformations to enable refactoring. We first proceed with a detecting phase of design patterns, with different forms and levels of completeness. The detected occurrences thus form refactoring opportunities that will be exploited to implement more desirable and/or more complete forms of these design patterns. In the absence of prior knowledge, such as design patterns, we propose an approach based on genetic programming, to learn transformation rules, capable of detecting refactoring opportunities and correcting them. As an alternative to prior knowledge, our approach uses examples of pairs of artifacts before and after refactoring, in order to learn refactoring rules. We illustrate this approach on model refactoring.

fr , en