OncoGAN-syntheticVCFs / CNS-PiloAstro /CNS-PiloAstro_sim2.vcf
anderdnavarro's picture
Upload folder using huggingface_hub
817e9cb verified
##fileformat=VCFv4.2
#CHROM POS ID REF ALT VAF MUT
1 29702003 sim2 G A 0.41 SBS1
1 38485425 sim2 G T 0.14 SBS5
1 43661527 sim2 A T 0.44 SBS5
1 45364896 sim2 G C 0.15 SBS5
1 46047114 sim2 C T 0.72 SBS1
1 46891432 sim2 G A 0.44 SBS5
1 49662442 sim2 A T 0.33 SBS1
1 73042068 sim2 T A 0.3 SBS5
1 75256918 sim2 G A 0.12 SBS5
1 78943175 sim2 C T 0.21 SBS5
1 85732252 sim2 T C 0.15 SBS5
1 91478161 sim2 C T 0.55 SBS5
1 146068471 sim2 G A 0.08 SBS1
1 156267614 sim2 A C 0.09 SBS5
1 168699040 sim2 C A 0.17 SBS5
1 173769163 sim2 AATTAT A 0.21 DEL
1 188117307 sim2 C T 0.13 SBS5
1 198238573 sim2 T G 0.38 SBS5
1 230592140 sim2 T C 0.15 SBS5
1 247369516 sim2 C T 0.23 SBS5
2 12086635 sim2 A G 0.73 SBS5
2 17896895 sim2 T G 0.18 SBS1
2 20050805 sim2 A G 0.39 SBS5
2 34798116 sim2 TT T 0.34 DEL
2 39788235 sim2 T G 0.07 SBS5
2 44384916 sim2 C A 0.59 SBS5
2 59364233 sim2 A T 0.1 SBS5
2 59453768 sim2 C T 0.81 SBS5
2 60387532 sim2 C A 0.26 SBS5
2 64516260 sim2 G A 0.14 SBS1
2 81292992 sim2 T A 0.13 SBS5
2 82212238 sim2 G A 0.1 SBS5
2 101781553 sim2 C T 0.43 SBS5
2 105951690 sim2 A G 0.35 SBS1
2 116542187 sim2 G A 0.1 SBS5
2 119715944 sim2 A T 0.08 SBS5
2 125915806 sim2 C A 0.37 SBS5
2 141897005 sim2 T C 0.24 SBS5
2 145219631 sim2 G A 0.4 SBS5
2 145550175 sim2 C T 0.14 SBS5
2 147387471 sim2 GG G 0.41 DEL
2 154122484 sim2 G A 0.12 SBS1
2 155677952 sim2 CC C 0.35 DEL
2 159036891 sim2 G A 0.08 SBS5
2 162949754 sim2 C A 0.14 SBS5
2 170662771 sim2 A T 0.11 SBS5
2 173907306 sim2 G A 0.08 SBS1
2 179912572 sim2 T C 0.12 SBS5
2 194072139 sim2 G T 0.1 SBS5
2 219807272 sim2 C CT 0.16 INS
2 221145978 sim2 A C 0.36 SBS5
2 225527847 sim2 C T 0.35 SBS5
2 226225075 sim2 C T 0.45 SBS5
2 234668385 sim2 C T 0.29 SBS5
3 4822091 sim2 G A 0.42 SBS5
3 14158420 sim2 G A 0.08 SBS5
3 23025266 sim2 T A 0.3 SBS5
3 38818987 sim2 G A 0.18 SBS1
3 42400837 sim2 C T 0.22 SBS1
3 56283399 sim2 G A 0.08 SBS5
3 60719869 sim2 G A 0.11 SBS1
3 75014689 sim2 C A 0.18 SBS5
3 84079984 sim2 C T 0.81 SBS5
3 88405179 sim2 A T 0.14 SBS5
3 96052969 sim2 A G 0.22 SBS5
3 96568301 sim2 C T 0.54 SBS1
3 97107116 sim2 C T 0.37 SBS5
3 98933508 sim2 C G 0.38 SBS5
3 109194442 sim2 C T 0.08 SBS5
3 109686148 sim2 A C 0.08 SBS1
3 111889280 sim2 A G 0.42 SBS5
3 122653885 sim2 C T 0.38 SBS1
3 128106613 sim2 CC C 0.09 DEL
3 128801573 sim2 C A 0.1 SBS5
3 136773209 sim2 G A 0.4 SBS1
3 147259436 sim2 G A 0.3 SBS1
3 149751430 sim2 C T 0.25 SBS1
3 156513957 sim2 CA C 0.28 DEL
3 156902072 sim2 C A 0.43 SBS5
3 157197954 sim2 T G 0.11 SBS5
3 164064831 sim2 C T 0.41 SBS1
3 164469791 sim2 A G 0.34 SBS5
3 173653359 sim2 C T 0.19 SBS5
3 174785269 sim2 C T 0.08 SBS1
3 185755533 sim2 C A 0.16 SBS5
4 1958901 sim2 C A 0.25 SBS5
4 17942316 sim2 T C 0.17 SBS5
4 20775351 sim2 G A 0.36 SBS1
4 22567313 sim2 T A 0.16 SBS5
4 34910090 sim2 A G 0.53 SBS5
4 37886232 sim2 T C 0.3 SBS5
4 43087973 sim2 G A 0.26 SBS5
4 48715601 sim2 A T 0.3 SBS5
4 53566553 sim2 C A 0.03 SBS5
4 65497404 sim2 T C 0.15 SBS5
4 66589205 sim2 C G 0.26 SBS5
4 68739670 sim2 AAC A 0.42 DEL
4 69406538 sim2 G A 0.11 SBS1
4 70625531 sim2 A T 0.11 SBS5
4 73611800 sim2 AAT A 0.17 DEL
4 80720352 sim2 T C 0.04 SBS5
4 83081964 sim2 G A 0.06 SBS5
4 83447804 sim2 T G 0.13 SBS5
4 104724078 sim2 C A 0.1 SBS5
4 108453790 sim2 C T 0.61 SBS5
4 112448321 sim2 A G 0.28 SBS5
4 121680571 sim2 C T 0.11 SBS1
4 123777573 sim2 T C 0.18 SBS5
4 127004378 sim2 CTCTA C 0.17 DEL
4 131917947 sim2 AA A 0.36 DEL
4 154198349 sim2 G A 0.25 SBS1
4 162173947 sim2 C T 0.28 SBS1
4 162705508 sim2 A G 0.4 SBS5
4 163585179 sim2 A G 0.17 SBS5
4 172280754 sim2 G T 0.11 SBS5
4 175282248 sim2 C T 0.12 SBS5
4 176054678 sim2 G T 0.27 SBS5
5 1096980 sim2 G T 0.29 SBS5
5 3886216 sim2 C T 0.36 SBS1
5 8321504 sim2 G A 0.96 SBS1
5 11289073 sim2 G A 0.24 SBS1
5 11501386 sim2 C A 0.15 SBS5
5 14264065 sim2 C T 0.24 SBS1
5 16207594 sim2 A G 0.25 SBS5
5 27039884 sim2 G A 0.52 SBS5
5 28081912 sim2 G C 0.3 SBS5
5 33157297 sim2 T C 0.81 SBS5
5 45093621 sim2 A G 0.22 SBS5
5 51961889 sim2 C T 0.44 SBS5
5 61337398 sim2 A T 0.34 SBS5
5 61608676 sim2 G A 0.25 SBS5
5 65182967 sim2 T C 0.11 SBS5
5 85528457 sim2 TT T 0.22 DEL
5 87715413 sim2 T C 0.06 SBS5
5 91294388 sim2 T C 0.23 SBS5
5 97314453 sim2 T TCG 0.32 INS
5 110765299 sim2 G C 0.36 SBS5
5 120681020 sim2 G T 0.5 SBS5
5 121297735 sim2 AGC A 0.3 DEL
5 150635295 sim2 C T 0.13 SBS1
5 157136948 sim2 C A 0.44 SBS5
5 158409273 sim2 A G 0.44 SBS5
5 158531847 sim2 C T 0.28 SBS1
5 164304652 sim2 G A 0.09 SBS5
5 166086375 sim2 A G 0.05 SBS5
5 168970777 sim2 T A 0.17 SBS5
5 169354867 sim2 G A 0.06 SBS1
5 175795061 sim2 C A 0.97 SBS5
6 10346990 sim2 G A 0.23 SBS1
6 11662237 sim2 T C 0.32 SBS5
6 27532058 sim2 A G 0.37 SBS5
6 28944195 sim2 T C 0.19 SBS5
6 32988214 sim2 A G 0.14 SBS5
6 33889505 sim2 G A 0.41 SBS5
6 48279236 sim2 G A 0.41 SBS5
6 50431661 sim2 C A 0.28 SBS5
6 54383595 sim2 C G 0.11 SBS5
6 63691609 sim2 G C 0.09 SBS5
6 69161754 sim2 T G 0.56 SBS5
6 77825301 sim2 A G 0.25 SBS5
6 80142855 sim2 A T 0.24 SBS5
6 95471029 sim2 G T 0.1 SBS5
6 100405374 sim2 C G 0.18 SBS1
6 104014249 sim2 C T 0.29 SBS5
6 104611398 sim2 A C 0.2 SBS5
6 119220871 sim2 C T 0.25 SBS1
6 123687136 sim2 G A 0.18 SBS5
6 130950443 sim2 T A 0.27 SBS5
6 147855501 sim2 A T 0.13 SBS5
6 165888857 sim2 T A 0.1 SBS5
6 167762087 sim2 G T 0.23 SBS5
6 169786817 sim2 G A 0.13 SBS1
7 15119704 sim2 A G 0.13 SBS5
7 32178970 sim2 T C 0.11 SBS1
7 33121626 sim2 C T 0.38 SBS5
7 48538467 sim2 A T 0.45 SBS5
7 51173331 sim2 C T 0.28 SBS5
7 51703177 sim2 C T 0.33 SBS1
7 62432596 sim2 T G 0.21 SBS5
7 63164799 sim2 A T 0.41 SBS5
7 64211034 sim2 C A 0.28 SBS1
7 75443075 sim2 C T 0.27 SBS5
7 82625350 sim2 C T 0.1 SBS1
7 100723112 sim2 C T 0.1 SBS1
7 111733971 sim2 C G 0.16 SBS5
7 118452602 sim2 A G 0.08 SBS5
7 124026025 sim2 C T 0.1 SBS1
7 133427181 sim2 C T 0.46 SBS1
7 136520647 sim2 C T 0.11 SBS5
7 140388159 sim2 T A 0.8 SBS5
7 141013911 sim2 C T 0.62 SBS5
7 141806788 sim2 A G 0.14 SBS5
7 150546700 sim2 C T 0.16 SBS1
8 13152437 sim2 T C 0.39 SBS5
8 16167263 sim2 C T 0.74 SBS1
8 20409374 sim2 T C 0.33 SBS5
8 21117693 sim2 G A 0.42 SBS5
8 22117740 sim2 G A 0.12 SBS1
8 31262700 sim2 A G 0.41 SBS5
8 33414168 sim2 T C 0.09 SBS5
8 34651909 sim2 C T 0.21 SBS5
8 47556149 sim2 T G 0.52 SBS5
8 72575067 sim2 A G 0.33 SBS5
8 73178508 sim2 C T 0.15 SBS5
8 75971956 sim2 C A 0.38 SBS5
8 77158259 sim2 A G 0.04 SBS5
8 85817249 sim2 A T 0.18 SBS5
8 89369932 sim2 T A 0.18 SBS5
8 93316605 sim2 C T 0.25 SBS5
8 105342558 sim2 G A 0.28 SBS1
8 115696376 sim2 T G 0.08 SBS5
8 118861156 sim2 C G 0.09 SBS5
8 120613336 sim2 C T 0.42 SBS1
8 120711915 sim2 C G 0.46 SBS5
8 124556099 sim2 T C 0.33 SBS5
8 138298441 sim2 G A 0.08 SBS1
8 144146196 sim2 A G 0.22 SBS5
9 1000367 sim2 C A 0.95 SBS5
9 1304973 sim2 A G 0.47 SBS5
9 1510570 sim2 T A 0.23 SBS5
9 10059158 sim2 A C 0.13 SBS5
9 10567951 sim2 A T 0.19 SBS5
9 13481095 sim2 C G 0.19 SBS5
9 17597263 sim2 T G 0.13 SBS5
9 22463018 sim2 G A 0.14 SBS5
9 31919663 sim2 A G 0.09 SBS5
9 32818281 sim2 A G 0.06 SBS5
9 37981043 sim2 A G 0.25 SBS5
9 76942215 sim2 C T 0.1 SBS5
9 77912448 sim2 A G 0.36 SBS5
9 79728005 sim2 A G 0.37 SBS5
9 94458307 sim2 A G 0.28 SBS5
9 100389128 sim2 C T 0.15 SBS5
9 103495621 sim2 G A 0.24 SBS5
9 105036202 sim2 C G 0.42 SBS5
9 105953178 sim2 G A 0.3 SBS1
9 106423797 sim2 T C 0.48 SBS5
9 110929070 sim2 G T 0.71 SBS5
9 112885506 sim2 A G 0.12 SBS5
9 114312772 sim2 C T 0.45 SBS5
9 123889909 sim2 T C 0.17 SBS5
9 131297930 sim2 T C 0.11 SBS1
10 481077 sim2 G A 0.13 SBS1
10 4871370 sim2 C T 0.39 SBS5
10 5333714 sim2 A G 0.33 SBS5
10 5933652 sim2 A G 0.08 SBS5
10 11848821 sim2 G A 0.14 SBS1
10 17339056 sim2 T C 0.19 SBS5
10 20696556 sim2 C A 0.33 SBS5
10 20937101 sim2 T C 0.21 SBS5
10 51970986 sim2 G T 0.4 SBS5
10 58318528 sim2 G C 0.38 SBS5
10 72839082 sim2 C T 0.44 SBS1
10 80988828 sim2 G A 0.32 SBS5
10 84923085 sim2 A T 0.33 SBS5
10 94864714 sim2 G A 0.16 SBS5
10 94878085 sim2 C A 0.13 SBS5
10 100037804 sim2 G A 0.22 SBS5
10 102116660 sim2 G C 0.11 SBS5
10 135343969 sim2 C A 0.25 SBS5
11 2550737 sim2 A G 0.06 SBS5
11 20421104 sim2 G T 0.4 SBS5
11 31299430 sim2 G A 0.54 SBS5
11 35093680 sim2 C A 0.38 SBS5
11 36681016 sim2 C T 0.2 SBS5
11 37143830 sim2 T A 0.38 SBS5
11 54912432 sim2 G T 0.03 SBS5
11 55763653 sim2 G A 0.08 SBS5
11 59120052 sim2 C T 0.27 SBS5
11 64789809 sim2 C T 0.11 SBS1
11 70948760 sim2 T C 0.11 SBS5
11 75663909 sim2 C T 0.19 SBS1
11 80332751 sim2 G A 0.16 SBS5
11 95896796 sim2 GT G 0.45 DEL
11 98798119 sim2 T G 0.24 SBS5
11 104559080 sim2 C A 0.46 SBS5
11 106452152 sim2 G C 0.19 SBS5
11 108949946 sim2 C A 0.21 SBS5
11 112851944 sim2 C T 0.21 SBS1
11 115337074 sim2 G A 0.13 SBS1
11 123732013 sim2 G A 0.18 SBS1
11 125949946 sim2 C T 0.23 SBS5
11 128445979 sim2 T C 0.46 SBS5
12 651589 sim2 G T 0.26 SBS5
12 7715413 sim2 C T 0.3 SBS5
12 7881570 sim2 G A 0.33 SBS1
12 9166989 sim2 C A 0.06 SBS5
12 9325970 sim2 A C 0.14 SBS5
12 18962332 sim2 G A 0.15 SBS5
12 32631042 sim2 G A 0.37 SBS5
12 54345925 sim2 A G 0.18 SBS5
12 72893404 sim2 G A 0.52 SBS1
12 79246651 sim2 G T 0.12 SBS5
12 79692514 sim2 G A 0.18 SBS5
12 84112061 sim2 C G 0.18 SBS5
12 84136427 sim2 C T 0.4 SBS1
12 85187390 sim2 C A 0.1 SBS5
12 85831474 sim2 A G 0.22 SBS5
12 87499925 sim2 A T 0.08 SBS5
12 88722127 sim2 AA A 0.27 DEL
12 92495004 sim2 G A 0.09 SBS1
12 100404562 sim2 G A 0.2 SBS5
12 101914938 sim2 G A 0.18 SBS5
12 103588082 sim2 C A 0.22 SBS5
12 130366813 sim2 C T 0.14 SBS1
12 131185406 sim2 G A 0.2 SBS5
13 21129189 sim2 G A 0.15 SBS1
13 24829768 sim2 G A 0.21 SBS5
13 28720621 sim2 A G 0.35 SBS5
13 30618108 sim2 T C 0.11 SBS5
13 44195192 sim2 T C 0.22 SBS5
13 56045706 sim2 C T 0.05 SBS5
13 79325669 sim2 G C 0.23 SBS5
13 80055708 sim2 G A 0.13 SBS1
13 80405259 sim2 G A 0.13 SBS5
13 82675485 sim2 AA A 0.33 DEL
13 84483756 sim2 C T 0.13 SBS5
13 84940388 sim2 CT C 0.25 DEL
13 88498234 sim2 C T 0.14 SBS1
13 89696342 sim2 G A 0.15 SBS5
13 105233496 sim2 C A 0.23 SBS5
14 32945709 sim2 A C 0.11 SBS5
14 41028575 sim2 A T 0.41 SBS5
14 41351993 sim2 C A 0.19 SBS5
14 47062401 sim2 G A 0.35 SBS1
14 58832988 sim2 A T 0.95 SBS5
14 71112436 sim2 C T 0.17 SBS1
14 71396363 sim2 A C 0.35 SBS5
14 71461814 sim2 T C 0.43 SBS5
14 73116108 sim2 T C 0.25 SBS5
14 87759005 sim2 G A 0.43 SBS5
14 96551352 sim2 C A 0.37 SBS5
14 100836165 sim2 G A 0.11 SBS5
15 24502965 sim2 A G 0.52 SBS5
15 29907650 sim2 G A 0.39 SBS1
15 46544763 sim2 G A 0.2 SBS1
15 52177098 sim2 T C 0.32 SBS5
15 54136052 sim2 C T 0.27 SBS5
15 61584675 sim2 C T 0.05 SBS1
15 98202018 sim2 T C 0.21 SBS5
15 99523665 sim2 ATCTAATGAAATGACTACAT A 0.21 DEL
16 4855588 sim2 C T 0.24 SBS1
16 20244669 sim2 G A 0.45 SBS5
16 24434493 sim2 G A 0.18 SBS1
16 27008456 sim2 G A 0.24 SBS5
16 33995380 sim2 A G 0.17 SBS5
16 34276062 sim2 T C 0.19 SBS5
16 62374224 sim2 C T 0.29 SBS1
16 69772580 sim2 G A 0.48 SBS1
16 84740183 sim2 G T 0.08 SBS5
16 86314352 sim2 G A 0.05 SBS1
16 89154457 sim2 C T 0.14 SBS5
17 8487922 sim2 T G 0.33 SBS5
17 8886671 sim2 C T 0.49 SBS5
17 12628245 sim2 T A 0.44 SBS5
17 27674583 sim2 A G 0.09 SBS5
17 42203063 sim2 C A 0.11 SBS5
17 53170099 sim2 A G 0.4 SBS5
17 65853558 sim2 G C 0.31 SBS5
17 79053213 sim2 G A 0.19 SBS1
18 22853703 sim2 T G 0.13 SBS5
18 25451065 sim2 C T 0.48 SBS1
18 35802440 sim2 G A 0.26 SBS1
18 36189423 sim2 G A 0.1 SBS5
18 36647116 sim2 A T 0.18 SBS5
18 40066457 sim2 C G 0.15 SBS5
18 45284114 sim2 C T 0.17 SBS1
18 46167292 sim2 C T 0.39 SBS1
18 46338990 sim2 T C 0.97 SBS5
18 54072538 sim2 A T 0.35 SBS5
18 62679479 sim2 C T 0.16 SBS5
18 66126665 sim2 G A 0.16 SBS1
19 6318395 sim2 G A 0.44 SBS1
19 19080652 sim2 G A 0.3 SBS1
19 19240780 sim2 G A 0.15 SBS5
19 21579130 sim2 A C 0.24 SBS5
19 37272649 sim2 T A 0.27 SBS1
19 37304273 sim2 G C 0.23 SBS5
19 37600204 sim2 C T 0.11 SBS1
19 43595791 sim2 A C 0.1 SBS5
19 45515729 sim2 C A 0.06 SBS1
19 55213446 sim2 C A 0.36 SBS5
19 55250004 sim2 C A 0.26 SBS5
20 14771252 sim2 G A 0.35 SBS5
20 35979349 sim2 G A 0.17 SBS5
20 38801197 sim2 G A 0.1 SBS1
20 46339258 sim2 C A 0.18 SBS5
20 54411485 sim2 G A 0.82 SBS5
20 57273915 sim2 G T 0.21 SBS5
21 19174397 sim2 T A 0.35 SBS5
21 19183634 sim2 G A 0.25 SBS5
21 20810928 sim2 T A 0.02 SBS5
21 21883964 sim2 C A 0.27 SBS5
21 24170518 sim2 G T 0.26 SBS5
21 29135454 sim2 TT T 0.31 DEL
21 33708765 sim2 G A 0.24 SBS5
21 46179988 sim2 G A 0.1 SBS5
22 18924126 sim2 G A 0.3 SBS5
22 25812384 sim2 T C 0.12 SBS5
22 30903803 sim2 A G 0.43 SBS5
22 31790952 sim2 G A 0.07 SBS1
22 32676065 sim2 C T 0.21 SBS1
22 34891182 sim2 C T 0.12 SBS5
22 35344571 sim2 C T 0.32 SBS1
X 1831621 sim2 G A 0.22 SBS5
X 2497525 sim2 C T 0.72 SBS5
X 4992395 sim2 TT T 0.13 DEL
X 8724468 sim2 A G 0.13 SBS5
X 13685379 sim2 G C 0.06 SBS5
X 14379805 sim2 A G 0.19 SBS5
X 15753716 sim2 G T 0.42 SBS1
X 17182519 sim2 A G 0.15 SBS5
X 18666957 sim2 C G 0.34 SBS5
X 35703092 sim2 T G 0.29 SBS5
X 38020022 sim2 C T 0.08 SBS5
X 50411867 sim2 G T 0.09 SBS5
X 61694798 sim2 G A 0.06 SBS5
X 67239779 sim2 G T 0.16 SBS5
X 69962020 sim2 A C 0.21 SBS5
X 79599189 sim2 G A 0.37 SBS1
X 81799033 sim2 C G 0.1 SBS5
X 82322401 sim2 T C 0.35 SBS5
X 82415645 sim2 G T 0.38 SBS1
X 86231400 sim2 C T 0.22 SBS5
X 92886385 sim2 G A 0.14 SBS5
X 96201718 sim2 T C 0.3 SBS5
X 96678521 sim2 C A 0.16 SBS5
X 97479796 sim2 G A 0.21 SBS1
X 97969286 sim2 C T 0.33 SBS5
X 99414125 sim2 T C 0.14 SBS5
X 103624655 sim2 C T 0.37 SBS1
X 107508525 sim2 A G 0.24 SBS5
X 108509705 sim2 T A 0.01 SBS5
X 110958227 sim2 T C 0.14 SBS5
X 115130422 sim2 C T 0.16 SBS5
X 122764358 sim2 G C 0.18 SBS5
X 126856353 sim2 G T 0.06 SBS5
X 127390100 sim2 G A 0.12 SBS5
X 128114598 sim2 A G 0.16 SBS5
X 130447868 sim2 A G 0.21 SBS5
X 133431276 sim2 T C 0.38 SBS5
X 137451889 sim2 T G 0.09 SBS5
X 138686280 sim2 G A 0.38 SBS1
X 142880288 sim2 A G 0.27 SBS5
X 143160832 sim2 AT A 0.27 DEL
X 144124017 sim2 C T 0.28 SBS5
X 149755142 sim2 T C 0.16 SBS5
X 150742591 sim2 G T 0.22 SBS5
X 151251582 sim2 C T 0.08 SBS1
X 151464918 sim2 A G 0.45 SBS5
Y 9536396 sim2 C T 0.09 SBS5
Y 15639608 sim2 C A 0.82 SBS5