OncoGAN-syntheticVCFs / CNS-PiloAstro /CNS-PiloAstro_sim52.vcf
anderdnavarro's picture
Upload folder using huggingface_hub
817e9cb verified
##fileformat=VCFv4.2
#CHROM POS ID REF ALT VAF MUT
1 34122820 sim52 TT T 0.17 DEL
1 93175904 sim52 C T 0.38 SBS1
1 94859345 sim52 A G 0.42 SBS5
1 95337522 sim52 G A 0.1 SBS1
1 105854670 sim52 T C 0.31 SBS5
1 114197612 sim52 T C 0.28 SBS5
1 119858911 sim52 G A 0.2 SBS5
1 186144261 sim52 T C 0.26 SBS5
1 190487902 sim52 C T 0.14 SBS5
1 221651826 sim52 C G 0.24 SBS5
2 42244492 sim52 C T 0.07 SBS1
2 77513670 sim52 A C 0.25 SBS5
2 121842445 sim52 G A 0.17 SBS1
2 146207861 sim52 T C 0.25 SBS5
2 158159619 sim52 G T 0.09 SBS5
2 176069692 sim52 G A 0.23 SBS5
2 177240426 sim52 ATAT A 0.1 DEL
2 183030373 sim52 C T 0.2 SBS5
2 187988975 sim52 A T 0.09 SBS5
2 194458174 sim52 C T 0.1 SBS1
2 198026041 sim52 C T 0.15 SBS1
2 218559992 sim52 G T 0.13 SBS5
3 30887116 sim52 A C 0.33 SBS5
3 43090716 sim52 T G 0.36 SBS5
3 63106950 sim52 A G 0.23 SBS5
3 67815825 sim52 G A 0.13 SBS5
3 74909649 sim52 C T 0.1 SBS5
3 80439284 sim52 C T 0.24 SBS5
3 95965714 sim52 T G 0.46 SBS5
3 96303302 sim52 G C 0.11 SBS5
3 103684863 sim52 C T 0.39 SBS1
3 144456043 sim52 G C 0.12 SBS5
3 149759338 sim52 G C 0.34 SBS5
3 163348221 sim52 C T 0.29 SBS5
3 167282912 sim52 GA G 0.31 DEL
3 177069151 sim52 T A 0.01 SBS5
3 178910773 sim52 A C 0.4 SBS5
3 189413867 sim52 G C 0.41 SBS5
3 193271259 sim52 AAG A 0.22 DEL
3 193378972 sim52 T C 0.13 SBS5
4 45384554 sim52 T A 0.26 SBS5
4 46857258 sim52 G T 0.08 SBS5
4 59532957 sim52 G C 0.11 SBS5
4 94062984 sim52 A G 0.05 SBS5
4 97343374 sim52 C CCATTATCAG 0.34 INS
4 117543008 sim52 C T 0.31 SBS1
4 128784955 sim52 T A 0.07 SBS5
4 129484912 sim52 C T 0.08 SBS1
4 134653516 sim52 G A 0.09 SBS5
4 143197082 sim52 T C 0.32 SBS5
4 162146278 sim52 A G 0.09 SBS5
4 173805826 sim52 G C 0.44 SBS5
5 5650433 sim52 G A 0.32 SBS1
5 12873666 sim52 G A 0.2 SBS1
5 28413717 sim52 G T 0.34 SBS5
5 54960153 sim52 A G 0.31 SBS5
5 55397116 sim52 A AA 0.33 INS
5 67537280 sim52 TTA T 0.6 DEL
5 67684505 sim52 A C 0.41 SBS5
5 88558093 sim52 C T 0.11 SBS5
5 105121351 sim52 C G 0.1 SBS5
5 147340085 sim52 C T 0.09 SBS1
5 151269205 sim52 G A 0.25 SBS1
5 164001367 sim52 G A 0.46 SBS1
6 11086571 sim52 T TA 0.09 INS
6 47787010 sim52 G A 0.1 SBS5
6 57490525 sim52 T C 0.1 SBS1
6 66481418 sim52 TCCA T 0.07 DEL
6 79028607 sim52 G A 0.12 SBS5
6 121976710 sim52 G T 0.28 SBS5
6 131346936 sim52 AA A 0.16 DEL
6 139374488 sim52 G A 0.11 SBS5
6 145458022 sim52 C T 0.12 SBS5
6 146346169 sim52 G T 0.06 SBS5
6 156264850 sim52 A G 0.3 SBS5
6 158156413 sim52 G A 0.34 SBS5
7 21891960 sim52 C T 0.18 SBS1
7 38298186 sim52 A G 0.08 SBS5
7 62616614 sim52 GT G 0.21 DEL
7 63705369 sim52 T C 0.25 SBS5
7 77707289 sim52 G A 0.33 SBS1
7 85528250 sim52 A G 0.54 SBS5
7 92754076 sim52 C T 0.42 SBS5
7 96835455 sim52 C T 0.08 SBS5
7 121674596 sim52 A G 0.31 SBS5
7 126023144 sim52 G A 0.47 SBS1
7 131838208 sim52 A C 0.11 SBS5
7 140668106 sim52 AA A 0.17 DEL
7 142772740 sim52 A T 0.32 SBS5
7 154542550 sim52 G A 0.33 SBS5
8 19965645 sim52 G A 0.14 SBS5
8 27593976 sim52 G T 0.23 SBS5
8 41825758 sim52 A G 0.22 SBS5
8 52237868 sim52 A G 0.28 SBS5
8 55798736 sim52 C T 0.36 SBS1
8 71456358 sim52 A G 0.1 SBS5
8 72550216 sim52 A T 0.04 SBS5
8 93017699 sim52 C T 0.37 SBS1
9 5718705 sim52 A G 0.1 SBS5
9 23482006 sim52 G A 0.13 SBS1
9 24422003 sim52 G A 0.31 SBS1
9 26315386 sim52 C T 0.48 SBS5
9 77279177 sim52 C T 0.06 SBS5
9 81217346 sim52 T G 0.17 SBS5
9 85013463 sim52 A G 0.13 SBS5
9 105147976 sim52 G A 0.07 SBS1
9 119331824 sim52 G A 0.06 SBS5
9 135515376 sim52 C G 0.12 SBS5
10 3465827 sim52 G GA 0.45 INS
10 3990087 sim52 C T 0.22 SBS1
10 16493635 sim52 C T 0.35 SBS1
10 117191417 sim52 A G 0.52 SBS5
10 121478448 sim52 T C 0.36 SBS1
11 5026978 sim52 ATGGTAGGTTTTGTTATAAGGTAGTGTGA A 0.26 DEL
11 37609467 sim52 G A 0.33 SBS1
11 45074542 sim52 C T 0.32 SBS1
11 55261898 sim52 C T 0.21 SBS1
11 70986340 sim52 C T 0.11 SBS1
11 84933481 sim52 C T 0.36 SBS5
11 91197787 sim52 T G 0.07 SBS5
11 100029408 sim52 C T 0.45 SBS1
11 125450706 sim52 C T 0.37 SBS5
11 128063432 sim52 T G 0.55 SBS5
12 11700151 sim52 G A 0.6 SBS1
12 21255683 sim52 C T 0.07 SBS1
12 45588768 sim52 A G 0.47 SBS5
12 62460157 sim52 C T 0.33 SBS1
12 64269533 sim52 C T 0.07 SBS5
12 83851396 sim52 C T 0.26 SBS5
12 133814898 sim52 G A 0.05 SBS1
13 69901719 sim52 C T 0.16 SBS1
13 81081380 sim52 T A 0.15 SBS5
14 28844938 sim52 G A 0.29 SBS5
14 46976204 sim52 C T 0.31 SBS1
14 63956712 sim52 A G 0.08 SBS5
14 74443259 sim52 G A 0.11 SBS5
15 26114300 sim52 C T 0.04 SBS1
15 34633271 sim52 C T 0.47 SBS1
15 47836767 sim52 G A 0.12 SBS5
15 67684620 sim52 G A 0.31 SBS1
15 68446126 sim52 T C 0.12 SBS5
15 72253817 sim52 A C 0.06 SBS5
15 83536783 sim52 C T 0.37 SBS5
15 92686900 sim52 AA A 0.1 DEL
16 5840395 sim52 G A 0.09 SBS1
16 25742552 sim52 C A 0.38 SBS5
16 28293983 sim52 C A 0.07 SBS5
16 53517405 sim52 G A 0.39 SBS1
16 84170041 sim52 T C 0.15 SBS5
16 86249996 sim52 C T 0.26 SBS1
17 8213211 sim52 G A 0.82 SBS1
17 45232954 sim52 T C 0.1 SBS5
17 58852905 sim52 T C 0.1 SBS5
17 74141708 sim52 C T 0.19 SBS1
18 68151552 sim52 C T 0.09 SBS1
19 2244821 sim52 C T 0.1 SBS1
19 15631251 sim52 TTT T 0.05 DEL
19 41496455 sim52 G A 0.18 SBS1
19 55053251 sim52 G T 0.08 SBS5
21 20673989 sim52 A G 0.32 SBS5
21 29361408 sim52 G A 0.2 SBS5
X 5224347 sim52 T C 0.2 SBS5
X 8415683 sim52 TT T 0.37 DEL
X 71964224 sim52 A G 0.34 SBS5
X 95989670 sim52 G C 0.17 SBS5
X 109855153 sim52 C T 0.11 SBS5
X 115979383 sim52 AATGTTCCTGAGATACTAA A 0.16 DEL
X 126977469 sim52 G A 0.14 SBS5
X 138926020 sim52 C A 0.12 SBS5
X 144240081 sim52 T C 0.09 SBS5
Y 16536070 sim52 C T 0.27 SBS5
Y 18672192 sim52 G A 0.12 SBS5
Y 19438309 sim52 C T 0.23 SBS1