tokens
sequence | folded_tokens
sequence | labels
sequence |
---|---|---|
[
"Using",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"analysis",
"we",
"demonstrated",
"that",
"the",
"promoter",
"region",
"spanning",
"base",
"pairs",
"-1",
"to",
"-275",
",",
"which",
"contains",
"several",
"putative",
"binding",
"sites",
"for",
"transcription",
"factors",
",",
"is",
"bound",
"by",
"nuclear",
"factors",
"Sp1",
"and",
"IRBP",
"but",
"not",
"by",
"C/EBPs",
"."
] | [
"using",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"analysis",
"we",
"demonstrated",
"that",
"the",
"promoter",
"region",
"spanning",
"base",
"pairs",
"-1",
"to",
"-275",
",",
"which",
"contains",
"several",
"putative",
"binding",
"sites",
"for",
"transcription",
"factors",
",",
"is",
"bound",
"by",
"nuclear",
"factors",
"sp1",
"and",
"irbp",
"but",
"not",
"by",
"c/ebps",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Taken",
"together",
"these",
"data",
"indicate",
"that",
"carboxylesterase",
"gene",
"transcription",
"in",
"THP-1",
"cells",
"starts",
"at",
"multiple",
"initiation",
"sites",
"and",
"that",
"Sp1",
"and",
"IRBP",
"may",
"be",
"critical",
"factors",
"for",
"modulating",
"the",
"differentiation-dependent",
"transcription",
"of",
"this",
"human",
"carboxylesterase",
"gene",
"."
] | [
"taken",
"together",
"these",
"data",
"indicate",
"that",
"carboxylesterase",
"gene",
"transcription",
"in",
"thp-1",
"cells",
"starts",
"at",
"multiple",
"initiation",
"sites",
"and",
"that",
"sp1",
"and",
"irbp",
"may",
"be",
"critical",
"factors",
"for",
"modulating",
"the",
"differentiation-dependent",
"transcription",
"of",
"this",
"human",
"carboxylesterase",
"gene",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Negative",
"transcriptional",
"regulation",
"of",
"human",
"interleukin",
"2",
"(",
"IL-2",
")",
"gene",
"by",
"glucocorticoids",
"through",
"interference",
"with",
"nuclear",
"transcription",
"factors",
"AP-1",
"and",
"NF-AT",
"."
] | [
"negative",
"transcriptional",
"regulation",
"of",
"human",
"interleukin",
"2",
"(",
"il-2",
")",
"gene",
"by",
"glucocorticoids",
"through",
"interference",
"with",
"nuclear",
"transcription",
"factors",
"ap-1",
"and",
"nf-at",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"IL-2",
"gene",
"transcription",
"is",
"affected",
"by",
"several",
"nuclear",
"proteins",
"."
] | [
"il-2",
"gene",
"transcription",
"is",
"affected",
"by",
"several",
"nuclear",
"proteins",
"."
] | [
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"We",
"asked",
"whether",
"dexamethasone",
"(",
"Dex",
")",
"and",
"cyclosporin",
"A",
"(",
"CsA",
")",
"inhibit",
"IL-2",
"gene",
"transcription",
"by",
"interfering",
"with",
"the",
"activity",
"of",
"nuclear",
"proteins",
"that",
"bind",
"to",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"."
] | [
"we",
"asked",
"whether",
"dexamethasone",
"(",
"dex",
")",
"and",
"cyclosporin",
"a",
"(",
"csa",
")",
"inhibit",
"il-2",
"gene",
"transcription",
"by",
"interfering",
"with",
"the",
"activity",
"of",
"nuclear",
"proteins",
"that",
"bind",
"to",
"the",
"il-2",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Nuclear",
"extracts",
"from",
"primary",
"human",
"T",
"lymphocytes",
"were",
"analyzed",
"by",
"electrophoretic",
"DNA",
"mobility",
"shift",
"assays",
"."
] | [
"nuclear",
"extracts",
"from",
"primary",
"human",
"t",
"lymphocytes",
"were",
"analyzed",
"by",
"electrophoretic",
"dna",
"mobility",
"shift",
"assays",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Both",
"Dex",
"and",
"CsA",
"inhibited",
"the",
"binding",
"of",
"transcription",
"factors",
"AP-1",
"and",
"NF-AT",
",",
"but",
"not",
"of",
"NF-kB",
"and",
"OCT-1/OAF",
",",
"to",
"their",
"corresponding",
"sites",
"on",
"the",
"IL-2",
"gene",
"promoter",
"."
] | [
"both",
"dex",
"and",
"csa",
"inhibited",
"the",
"binding",
"of",
"transcription",
"factors",
"ap-1",
"and",
"nf-at",
",",
"but",
"not",
"of",
"nf-kb",
"and",
"oct-1/oaf",
",",
"to",
"their",
"corresponding",
"sites",
"on",
"the",
"il-2",
"gene",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"To",
"correlate",
"changes",
"in",
"nuclear",
"factor",
"binding",
"in",
"vitro",
"with",
"transcriptional",
"activity",
"in",
"vivo",
"and",
"define",
"the",
"structural",
"requirements",
"for",
"IL-2",
"promoter",
"repression",
",",
"we",
"used",
"transient",
"DNA",
"transfections",
"."
] | [
"to",
"correlate",
"changes",
"in",
"nuclear",
"factor",
"binding",
"in",
"vitro",
"with",
"transcriptional",
"activity",
"in",
"vivo",
"and",
"define",
"the",
"structural",
"requirements",
"for",
"il-2",
"promoter",
"repression",
",",
"we",
"used",
"transient",
"dna",
"transfections",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Jurkat",
"cells",
"were",
"transfected",
"with",
"plasmids",
"containing",
"either",
"the",
"intact",
"IL-2",
"promoter",
"or",
"its",
"AP-1",
",",
"NF-AT",
",",
"and",
"NF-kB",
"motifs",
"."
] | [
"jurkat",
"cells",
"were",
"transfected",
"with",
"plasmids",
"containing",
"either",
"the",
"intact",
"il-2",
"promoter",
"or",
"its",
"ap-1",
",",
"nf-at",
",",
"and",
"nf-kb",
"motifs",
"."
] | [
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Dex",
"inhibited",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"and",
"the",
"AP-1",
",",
"but",
"not",
"the",
"NF-AT",
"and",
"NF-kB",
"plasmids",
"."
] | [
"dex",
"inhibited",
"the",
"il-2",
"promoter",
"and",
"the",
"ap-1",
",",
"but",
"not",
"the",
"nf-at",
"and",
"nf-kb",
"plasmids",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"CsA",
"inhibited",
"the",
"IL-2",
"promoter",
"and",
"the",
"NF-AT",
",",
"but",
"not",
"the",
"AP-1",
"and",
"NF-kB",
"plasmids",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"csa",
"inhibited",
"the",
"il-2",
"promoter",
"and",
"the",
"nf-at",
",",
"but",
"not",
"the",
"ap-1",
"and",
"nf-kb",
"plasmids",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"in",
"human",
"T",
"lymphocytes",
"both",
"Dex",
"and",
"CsA",
"inhibited",
"IL-2",
"gene",
"transcription",
"through",
"interference",
"with",
"transcription",
"factors",
"AP-1",
"and",
"NF-AT",
"."
] | [
"these",
"results",
"suggest",
"that",
"in",
"human",
"t",
"lymphocytes",
"both",
"dex",
"and",
"csa",
"inhibited",
"il-2",
"gene",
"transcription",
"through",
"interference",
"with",
"transcription",
"factors",
"ap-1",
"and",
"nf-at",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"We",
"propose",
"that",
",",
"while",
"maximum",
"inhibition",
"may",
"involve",
"interaction",
"with",
"both",
"transcription",
"factors",
",",
"AP-1",
"is",
"the",
"primary",
"target",
"of",
"Dex",
"."
] | [
"we",
"propose",
"that",
",",
"while",
"maximum",
"inhibition",
"may",
"involve",
"interaction",
"with",
"both",
"transcription",
"factors",
",",
"ap-1",
"is",
"the",
"primary",
"target",
"of",
"dex",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O"
] |
[
"A",
"novel",
"T-cell",
"protein",
"which",
"recognizes",
"a",
"palindromic",
"sequence",
"in",
"the",
"negative",
"regulatory",
"element",
"of",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"long",
"terminal",
"repeat",
"."
] | [
"a",
"novel",
"t-cell",
"protein",
"which",
"recognizes",
"a",
"palindromic",
"sequence",
"in",
"the",
"negative",
"regulatory",
"element",
"of",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"long",
"terminal",
"repeat",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Two",
"major",
"protein-binding",
"sites",
"within",
"the",
"negative",
"regulatory",
"element",
"of",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"long",
"terminal",
"repeat",
"have",
"been",
"identified",
"."
] | [
"two",
"major",
"protein-binding",
"sites",
"within",
"the",
"negative",
"regulatory",
"element",
"of",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"long",
"terminal",
"repeat",
"have",
"been",
"identified",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"One",
"(",
"site",
"B",
")",
"contained",
"a",
"palindromic",
"sequence",
"with",
"homology",
"to",
"steroid/thyroid",
"hormone",
"response",
"elements",
"but",
"was",
"distinct",
"from",
"previously",
"described",
"binding",
"sites",
"of",
"this",
"class",
"."
] | [
"one",
"(",
"site",
"b",
")",
"contained",
"a",
"palindromic",
"sequence",
"with",
"homology",
"to",
"steroid/thyroid",
"hormone",
"response",
"elements",
"but",
"was",
"distinct",
"from",
"previously",
"described",
"binding",
"sites",
"of",
"this",
"class",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"novel",
"T-cell",
"protein",
"recognized",
"the",
"palindromic",
"sequence",
"within",
"site",
"B",
"and",
"also",
"bound",
"estrogen-",
"or",
"thyroid",
"hormone-",
"response",
"elements",
"with",
"lower",
"affinity",
"."
] | [
"a",
"novel",
"t-cell",
"protein",
"recognized",
"the",
"palindromic",
"sequence",
"within",
"site",
"b",
"and",
"also",
"bound",
"estrogen-",
"or",
"thyroid",
"hormone-",
"response",
"elements",
"with",
"lower",
"affinity",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"7-base-pair",
"mutation",
"in",
"the",
"site",
"B",
"palindrome",
",",
"which",
"destroyed",
"protein",
"binding",
",",
"resulted",
"in",
"increased",
"expression",
"from",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"long",
"terminal",
"repeat",
"in",
"T",
"cells",
"."
] | [
"a",
"7-base-pair",
"mutation",
"in",
"the",
"site",
"b",
"palindrome",
",",
"which",
"destroyed",
"protein",
"binding",
",",
"resulted",
"in",
"increased",
"expression",
"from",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"long",
"terminal",
"repeat",
"in",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Bacterial",
"peptidoglycan",
"induces",
"CD14",
"-dependent",
"activation",
"of",
"transcription",
"factors",
"CREB/ATF",
"and",
"AP-1",
"."
] | [
"bacterial",
"peptidoglycan",
"induces",
"cd14",
"-dependent",
"activation",
"of",
"transcription",
"factors",
"creb/atf",
"and",
"ap-1",
"."
] | [
"B-carbohydrate",
"I-carbohydrate",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Peptidoglycan",
"(",
"PGN",
")",
",",
"the",
"major",
"cell",
"wall",
"component",
"of",
"Gram-positive",
"bacteria",
",",
"induces",
"secretion",
"of",
"cytokines",
"in",
"macrophages",
"through",
"CD14",
",",
"the",
"pattern",
"recognition",
"receptor",
"that",
"binds",
"lipopolysaccharide",
"and",
"other",
"microbial",
"products",
"."
] | [
"peptidoglycan",
"(",
"pgn",
")",
",",
"the",
"major",
"cell",
"wall",
"component",
"of",
"gram-positive",
"bacteria",
",",
"induces",
"secretion",
"of",
"cytokines",
"in",
"macrophages",
"through",
"cd14",
",",
"the",
"pattern",
"recognition",
"receptor",
"that",
"binds",
"lipopolysaccharide",
"and",
"other",
"microbial",
"products",
"."
] | [
"B-carbohydrate",
"O",
"B-carbohydrate",
"O",
"O",
"O",
"B-carbohydrate",
"I-carbohydrate",
"I-carbohydrate",
"I-carbohydrate",
"O",
"B-mono_cell",
"I-mono_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"To",
"begin",
"to",
"elucidate",
"the",
"mechanisms",
"that",
"regulate",
"the",
"transcription",
"of",
"cytokine",
"genes",
",",
"we",
"wanted",
"to",
"determine",
"which",
"transcription",
"factors",
"are",
"activated",
"by",
"PGN",
"in",
"mouse",
"RAW264",
".",
"7",
"and",
"human",
"THP-1",
"macrophage",
"cells",
"."
] | [
"to",
"begin",
"to",
"elucidate",
"the",
"mechanisms",
"that",
"regulate",
"the",
"transcription",
"of",
"cytokine",
"genes",
",",
"we",
"wanted",
"to",
"determine",
"which",
"transcription",
"factors",
"are",
"activated",
"by",
"pgn",
"in",
"mouse",
"raw264",
".",
"7",
"and",
"human",
"thp-1",
"macrophage",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-carbohydrate",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"demonstrated",
"that",
":",
"(",
"i",
")",
"PGN",
"induced",
"phosphorylation",
"of",
"the",
"transcription",
"factors",
"ATF-1",
"and",
"CREB",
";",
"(",
"ii",
")",
"ATF-1",
"and",
"CREB",
"bound",
"DNA",
"as",
"a",
"dimer",
"and",
"induced",
"transcriptional",
"activation",
"of",
"a",
"CRE",
"reporter",
"plasmid",
",",
"which",
"was",
"inhibited",
"by",
"dominant",
"negative",
"CREB",
"and",
"ATF-1",
";",
"(",
"iii",
")",
"PGN",
"induced",
"phosphorylation",
"of",
"c-Jun",
",",
"protein",
"synthesis",
"of",
"JunB",
"and",
"c-Fos",
",",
"and",
"transcriptional",
"activation",
"of",
"the",
"AP-1",
"reporter",
"plasmid",
",",
"which",
"was",
"inhibited",
"by",
"dominant",
"negative",
"c-Fos",
";",
"and",
"(",
"iv",
")",
"PGN",
"-induced",
"activation",
"of",
"CREB",
"/ATF",
"and",
"AP-1",
"was",
"mediated",
"through",
"CD14",
"."
] | [
"our",
"results",
"demonstrated",
"that",
":",
"(",
"i",
")",
"pgn",
"induced",
"phosphorylation",
"of",
"the",
"transcription",
"factors",
"atf-1",
"and",
"creb",
";",
"(",
"ii",
")",
"atf-1",
"and",
"creb",
"bound",
"dna",
"as",
"a",
"dimer",
"and",
"induced",
"transcriptional",
"activation",
"of",
"a",
"cre",
"reporter",
"plasmid",
",",
"which",
"was",
"inhibited",
"by",
"dominant",
"negative",
"creb",
"and",
"atf-1",
";",
"(",
"iii",
")",
"pgn",
"induced",
"phosphorylation",
"of",
"c-jun",
",",
"protein",
"synthesis",
"of",
"junb",
"and",
"c-fos",
",",
"and",
"transcriptional",
"activation",
"of",
"the",
"ap-1",
"reporter",
"plasmid",
",",
"which",
"was",
"inhibited",
"by",
"dominant",
"negative",
"c-fos",
";",
"and",
"(",
"iv",
")",
"pgn",
"-induced",
"activation",
"of",
"creb",
"/atf",
"and",
"ap-1",
"was",
"mediated",
"through",
"cd14",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-carbohydrate",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_N/A",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-carbohydrate",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-carbohydrate",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"This",
"is",
"the",
"first",
"study",
"to",
"demonstrate",
"activation",
"of",
"CREB",
"/ATF",
"and",
"AP-1",
"transcription",
"factors",
"by",
"PGN",
"or",
"by",
"any",
"other",
"component",
"of",
"Gram-positive",
"bacteria",
"."
] | [
"this",
"is",
"the",
"first",
"study",
"to",
"demonstrate",
"activation",
"of",
"creb",
"/atf",
"and",
"ap-1",
"transcription",
"factors",
"by",
"pgn",
"or",
"by",
"any",
"other",
"component",
"of",
"gram-positive",
"bacteria",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-carbohydrate",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-mono_cell",
"I-mono_cell",
"O"
] |
[
"Constitutive",
"nuclear",
"NF-kappa",
"B",
"in",
"cells",
"of",
"the",
"monocyte",
"lineage",
"."
] | [
"constitutive",
"nuclear",
"nf-kappa",
"b",
"in",
"cells",
"of",
"the",
"monocyte",
"lineage",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"monocytes",
",",
"the",
"nuclear",
"factor",
"NF-kappa",
"B",
"has",
"been",
"invoked",
"as",
"an",
"important",
"transcription",
"factor",
"in",
"the",
"expression",
"of",
"cytokine",
"genes",
",",
"of",
"cell-surface",
"receptors",
"and",
"in",
"the",
"expression",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"."
] | [
"in",
"monocytes",
",",
"the",
"nuclear",
"factor",
"nf-kappa",
"b",
"has",
"been",
"invoked",
"as",
"an",
"important",
"transcription",
"factor",
"in",
"the",
"expression",
"of",
"cytokine",
"genes",
",",
"of",
"cell-surface",
"receptors",
"and",
"in",
"the",
"expression",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"."
] | [
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O"
] |
[
"In",
"such",
"cells",
",",
"DNA",
"binding",
"activity",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"can",
"be",
"detected",
"without",
"intentional",
"stimulation",
"."
] | [
"in",
"such",
"cells",
",",
"dna",
"binding",
"activity",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"can",
"be",
"detected",
"without",
"intentional",
"stimulation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"our",
"studies",
",",
"cells",
"of",
"the",
"human",
"monocytic",
"line",
"Mono",
"Mac",
"6",
",",
"cultured",
"in",
"medium",
"containing",
"fetal-calf",
"serum",
"and",
"low",
"levels",
"of",
"lipopolysaccharide",
"(",
"LPS",
")",
",",
"also",
"exhibit",
"such",
"'constitutive'",
"NF-kappa",
"B",
",",
"as",
"demonstrated",
"by",
"mobility-shift",
"analysis",
"of",
"nuclear",
"extracts",
"."
] | [
"in",
"our",
"studies",
",",
"cells",
"of",
"the",
"human",
"monocytic",
"line",
"mono",
"mac",
"6",
",",
"cultured",
"in",
"medium",
"containing",
"fetal-calf",
"serum",
"and",
"low",
"levels",
"of",
"lipopolysaccharide",
"(",
"lps",
")",
",",
"also",
"exhibit",
"such",
"'constitutive'",
"nf-kappa",
"b",
",",
"as",
"demonstrated",
"by",
"mobility-shift",
"analysis",
"of",
"nuclear",
"extracts",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"O"
] |
[
"This",
"nuclear",
"NF-kappa",
"B",
"was",
"still",
"present",
"when",
"contaminant",
"LPS",
"was",
"removed",
"by",
"ultrafiltration",
"and",
"when",
"serum",
"was",
"omitted",
"."
] | [
"this",
"nuclear",
"nf-kappa",
"b",
"was",
"still",
"present",
"when",
"contaminant",
"lps",
"was",
"removed",
"by",
"ultrafiltration",
"and",
"when",
"serum",
"was",
"omitted",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-tissue",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Protein-DNA",
"complexes",
"of",
"constitutive",
"NF-kappa",
"B",
"are",
"similar",
"in",
"mobility",
"to",
"the",
"LPS",
"-induced",
"NF-kappa",
"B",
"and",
"both",
"are",
"recognized",
"by",
"an",
"antibody",
"specific",
"to",
"the",
"p50",
"subunit",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"."
] | [
"protein-dna",
"complexes",
"of",
"constitutive",
"nf-kappa",
"b",
"are",
"similar",
"in",
"mobility",
"to",
"the",
"lps",
"-induced",
"nf-kappa",
"b",
"and",
"both",
"are",
"recognized",
"by",
"an",
"antibody",
"specific",
"to",
"the",
"p50",
"subunit",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_subunit",
"I-protein_subunit",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"By",
"contrast",
",",
"treatment",
"of",
"cells",
"with",
"pyrrolidine",
"dithiocarbamate",
"(",
"PDTC",
")",
"will",
"only",
"block",
"LPS",
"-induced",
"NF-kappa",
"B",
",",
"but",
"not",
"the",
"constitutive",
"binding",
"protein",
"."
] | [
"by",
"contrast",
",",
"treatment",
"of",
"cells",
"with",
"pyrrolidine",
"dithiocarbamate",
"(",
"pdtc",
")",
"will",
"only",
"block",
"lps",
"-induced",
"nf-kappa",
"b",
",",
"but",
"not",
"the",
"constitutive",
"binding",
"protein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Using",
"LPS-free",
"and",
"serum-free",
"conditions",
",",
"constitutive",
"NF-kappa",
"B",
"can",
"be",
"detected",
"in",
"different",
"cell",
"lines",
"of",
"the",
"monocytic",
"lineage",
"(",
"HL60",
",",
"U937",
",",
"THP-1",
",",
"Mono",
"Mac",
"1",
"and",
"Mono",
"Mac",
"6",
")",
",",
"but",
"not",
"in",
"Molt",
"4",
"T",
"cells",
"or",
"K562",
"stem",
"cells",
"."
] | [
"using",
"lps-free",
"and",
"serum-free",
"conditions",
",",
"constitutive",
"nf-kappa",
"b",
"can",
"be",
"detected",
"in",
"different",
"cell",
"lines",
"of",
"the",
"monocytic",
"lineage",
"(",
"hl60",
",",
"u937",
",",
"thp-1",
",",
"mono",
"mac",
"1",
"and",
"mono",
"mac",
"6",
")",
",",
"but",
"not",
"in",
"molt",
"4",
"t",
"cells",
"or",
"k562",
"stem",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"When",
"ordered",
"according",
"to",
"stage",
"of",
"maturation",
",",
"the",
"amount",
"of",
"constitutive",
"NF-kappa",
"B",
"was",
"not",
"increased",
"in",
"more",
"mature",
"cell",
"lines",
"."
] | [
"when",
"ordered",
"according",
"to",
"stage",
"of",
"maturation",
",",
"the",
"amount",
"of",
"constitutive",
"nf-kappa",
"b",
"was",
"not",
"increased",
"in",
"more",
"mature",
"cell",
"lines",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"when",
"inducing",
"differentiation",
"in",
"Mono",
"Mac",
"6",
"cells",
",",
"with",
"vitamin",
"D3",
",",
"no",
"change",
"in",
"constitutive",
"or",
"inducible",
"NF-kappa",
"B",
"can",
"be",
"detected",
"."
] | [
"furthermore",
",",
"when",
"inducing",
"differentiation",
"in",
"mono",
"mac",
"6",
"cells",
",",
"with",
"vitamin",
"d3",
",",
"no",
"change",
"in",
"constitutive",
"or",
"inducible",
"nf-kappa",
"b",
"can",
"be",
"detected",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Analysis",
"of",
"primary",
"cells",
"revealed",
"substantial",
"constitutive",
"NF-kappa",
"B",
"-binding",
"activity",
"in",
"blood",
"monocytes",
",",
"pleural",
"macrophages",
"and",
"alveolar",
"macrophages",
"."
] | [
"analysis",
"of",
"primary",
"cells",
"revealed",
"substantial",
"constitutive",
"nf-kappa",
"b",
"-binding",
"activity",
"in",
"blood",
"monocytes",
",",
"pleural",
"macrophages",
"and",
"alveolar",
"macrophages",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"constitutive",
"NF-kappa",
"B",
"appears",
"to",
"be",
"functionally",
"active",
",",
"since",
"a",
"low",
"level",
"of",
"tumour",
"necrosis",
"factor",
"(",
"TNF",
")",
"transcript",
"is",
"detectable",
"in",
"monocytes",
",",
"and",
"this",
"level",
"can",
"be",
"increased",
"by",
"blocking",
"transcript",
"degradation",
"using",
"cycloheximide",
"."
] | [
"the",
"constitutive",
"nf-kappa",
"b",
"appears",
"to",
"be",
"functionally",
"active",
",",
"since",
"a",
"low",
"level",
"of",
"tumour",
"necrosis",
"factor",
"(",
"tnf",
")",
"transcript",
"is",
"detectable",
"in",
"monocytes",
",",
"and",
"this",
"level",
"can",
"be",
"increased",
"by",
"blocking",
"transcript",
"degradation",
"using",
"cycloheximide",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"The",
"level",
"of",
"constitutive",
"NF-kappa",
"B",
"in",
"these",
"cells",
"is",
"variable",
"and",
"is",
"frequently",
"found",
"to",
"be",
"lower",
"in",
"the",
"more",
"mature",
"macrophages",
"."
] | [
"the",
"level",
"of",
"constitutive",
"nf-kappa",
"b",
"in",
"these",
"cells",
"is",
"variable",
"and",
"is",
"frequently",
"found",
"to",
"be",
"lower",
"in",
"the",
"more",
"mature",
"macrophages",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Constitutive",
"NF-kappa",
"B",
"was",
"not",
"maintained",
"by",
"autocrine",
"action",
"of",
"cytokines",
"TNF",
",",
"interleukin",
"6",
",",
"interleukin",
"10",
",",
"granulocyte-macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"or",
"macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
",",
"since",
"neutralizing",
"antibodies",
"did",
"not",
"reduce",
"constitutive",
"DNA-binding",
"activity",
"."
] | [
"constitutive",
"nf-kappa",
"b",
"was",
"not",
"maintained",
"by",
"autocrine",
"action",
"of",
"cytokines",
"tnf",
",",
"interleukin",
"6",
",",
"interleukin",
"10",
",",
"granulocyte-macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"or",
"macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
",",
"since",
"neutralizing",
"antibodies",
"did",
"not",
"reduce",
"constitutive",
"dna-binding",
"activity",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"blockade",
"of",
"prostaglandin",
"or",
"leukotriene",
"biosynthesis",
"did",
"not",
"affect",
"constitutive",
"NF-kappa",
"B",
"."
] | [
"furthermore",
",",
"blockade",
"of",
"prostaglandin",
"or",
"leukotriene",
"biosynthesis",
"did",
"not",
"affect",
"constitutive",
"nf-kappa",
"b",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"(",
"ABSTRACT",
"TRUNCATED",
"AT",
"400",
"WORDS",
")"
] | [
"(",
"abstract",
"truncated",
"at",
"400",
"words",
")"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"IL-4",
"-dependent",
"regulation",
"of",
"TGF-alpha",
"and",
"TGF-beta1",
"expression",
"in",
"human",
"eosinophils",
"."
] | [
"il-4",
"-dependent",
"regulation",
"of",
"tgf-alpha",
"and",
"tgf-beta1",
"expression",
"in",
"human",
"eosinophils",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"TGFs",
"play",
"important",
"roles",
"in",
"wound",
"healing",
"and",
"carcinogenesis",
"."
] | [
"tgfs",
"play",
"important",
"roles",
"in",
"wound",
"healing",
"and",
"carcinogenesis",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"previously",
"demonstrated",
"that",
"eosinophils",
"infiltrating",
"into",
"different",
"pathologic",
"processes",
"elaborate",
"TGF-alpha",
"and",
"TGF-beta1",
"."
] | [
"we",
"have",
"previously",
"demonstrated",
"that",
"eosinophils",
"infiltrating",
"into",
"different",
"pathologic",
"processes",
"elaborate",
"tgf-alpha",
"and",
"tgf-beta1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Eosinophils",
"infiltrating",
"hamster",
"cutaneous",
"wounds",
"were",
"found",
"to",
"express",
"TGFs",
"sequentially",
"."
] | [
"eosinophils",
"infiltrating",
"hamster",
"cutaneous",
"wounds",
"were",
"found",
"to",
"express",
"tgfs",
"sequentially",
"."
] | [
"B-cell_type",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
",",
"we",
"examined",
"the",
"biologic",
"mediators",
"that",
"may",
"regulate",
"the",
"expression",
"of",
"TGF",
"-alpha",
"and",
"-beta1",
"by",
"eosinophils",
"."
] | [
"in",
"this",
"study",
",",
"we",
"examined",
"the",
"biologic",
"mediators",
"that",
"may",
"regulate",
"the",
"expression",
"of",
"tgf",
"-alpha",
"and",
"-beta1",
"by",
"eosinophils",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"Eosinophils",
"were",
"isolated",
"from",
"the",
"peripheral",
"blood",
"of",
"healthy",
"donors",
"and",
"cultured",
"in",
"the",
"absence",
"or",
"presence",
"of",
"IL-3",
",",
"IL-4",
",",
"and",
"IL-5",
"."
] | [
"eosinophils",
"were",
"isolated",
"from",
"the",
"peripheral",
"blood",
"of",
"healthy",
"donors",
"and",
"cultured",
"in",
"the",
"absence",
"or",
"presence",
"of",
"il-3",
",",
"il-4",
",",
"and",
"il-5",
"."
] | [
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Cells",
"were",
"analyzed",
"by",
"in",
"situ",
"hybridization",
"and",
"immunohistochemistry",
"."
] | [
"cells",
"were",
"analyzed",
"by",
"in",
"situ",
"hybridization",
"and",
"immunohistochemistry",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Supernatants",
"from",
"these",
"cultures",
"were",
"assayed",
"for",
"secreted",
"TGF-alpha",
"and",
"TGF-beta1",
"using",
"TGF",
"-specific",
"ELISAs",
"."
] | [
"supernatants",
"from",
"these",
"cultures",
"were",
"assayed",
"for",
"secreted",
"tgf-alpha",
"and",
"tgf-beta1",
"using",
"tgf",
"-specific",
"elisas",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"IL-3",
",",
"IL-4",
",",
"and",
"IL-5",
"independently",
"up-regulated",
"TGF-beta1",
"mRNA",
"and",
"product",
"expression",
"by",
"eosinophils",
"in",
"all",
"donors",
"."
] | [
"il-3",
",",
"il-4",
",",
"and",
"il-5",
"independently",
"up-regulated",
"tgf-beta1",
"mrna",
"and",
"product",
"expression",
"by",
"eosinophils",
"in",
"all",
"donors",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Interestingly",
",",
"TGF-alpha",
"production",
"by",
"eosinophils",
"was",
"up-regulated",
"by",
"IL-3",
"and",
"IL-5",
"but",
"was",
"down-regulated",
"by",
"IL-4",
"."
] | [
"interestingly",
",",
"tgf-alpha",
"production",
"by",
"eosinophils",
"was",
"up-regulated",
"by",
"il-3",
"and",
"il-5",
"but",
"was",
"down-regulated",
"by",
"il-4",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Consistent",
"with",
"the",
"ability",
"of",
"IL-4",
"to",
"regulate",
"eosinophil",
"responses",
",",
"IL-4",
"signaling",
"molecules",
"are",
"present",
"in",
"human",
"eosinophils",
"."
] | [
"consistent",
"with",
"the",
"ability",
"of",
"il-4",
"to",
"regulate",
"eosinophil",
"responses",
",",
"il-4",
"signaling",
"molecules",
"are",
"present",
"in",
"human",
"eosinophils",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"observation",
"that",
"IL-4",
"can",
"differentially",
"regulate",
"the",
"expression",
"of",
"TGF-alpha",
"and",
"TGF-beta1",
"suggests",
"that",
"IL-4",
"may",
"serve",
"as",
"a",
"physiologic",
"molecular",
"switch",
"of",
"TGF",
"expression",
"by",
"the",
"infiltrating",
"eosinophils",
"in",
"wound",
"healing",
"and",
"carcinogenesis",
"."
] | [
"the",
"observation",
"that",
"il-4",
"can",
"differentially",
"regulate",
"the",
"expression",
"of",
"tgf-alpha",
"and",
"tgf-beta1",
"suggests",
"that",
"il-4",
"may",
"serve",
"as",
"a",
"physiologic",
"molecular",
"switch",
"of",
"tgf",
"expression",
"by",
"the",
"infiltrating",
"eosinophils",
"in",
"wound",
"healing",
"and",
"carcinogenesis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Anaphylatoxins",
"C5a",
"and",
"C3a",
"induce",
"nuclear",
"factor",
"kappaB",
"activation",
"in",
"human",
"peripheral",
"blood",
"monocytes",
"."
] | [
"anaphylatoxins",
"c5a",
"and",
"c3a",
"induce",
"nuclear",
"factor",
"kappab",
"activation",
"in",
"human",
"peripheral",
"blood",
"monocytes",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"anaphylatoxins",
"C5a",
"and",
"C3a",
"are",
"involved",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"cytokine",
"production",
"."
] | [
"the",
"anaphylatoxins",
"c5a",
"and",
"c3a",
"are",
"involved",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"cytokine",
"production",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
"the",
"capability",
"of",
"C5a",
"and",
"C3a",
"to",
"induce",
"transcription",
"factor",
"activation",
"was",
"examined",
"."
] | [
"in",
"this",
"study",
"the",
"capability",
"of",
"c5a",
"and",
"c3a",
"to",
"induce",
"transcription",
"factor",
"activation",
"was",
"examined",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"C5a",
"and",
"C3a",
"stimulation",
"of",
"human",
"peripheral",
"blood",
"monocytes",
"resulted",
"in",
"nuclear",
"expression",
"of",
"a",
"DNA",
"binding",
"activity",
"with",
"specificity",
"to",
"the",
"kappaB",
"sequence",
"."
] | [
"c5a",
"and",
"c3a",
"stimulation",
"of",
"human",
"peripheral",
"blood",
"monocytes",
"resulted",
"in",
"nuclear",
"expression",
"of",
"a",
"dna",
"binding",
"activity",
"with",
"specificity",
"to",
"the",
"kappab",
"sequence",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"The",
"p50",
"and",
"p65",
"proteins",
",",
"constituents",
"of",
"the",
"prototypic",
"nuclear",
"factor",
"kappaB",
",",
"were",
"identified",
"as",
"components",
"of",
"the",
"DNA-protein",
"complexes",
"by",
"anti-peptide",
"antibodies",
"in",
"gel",
"supershift",
"assays",
"."
] | [
"the",
"p50",
"and",
"p65",
"proteins",
",",
"constituents",
"of",
"the",
"prototypic",
"nuclear",
"factor",
"kappab",
",",
"were",
"identified",
"as",
"components",
"of",
"the",
"dna-protein",
"complexes",
"by",
"anti-peptide",
"antibodies",
"in",
"gel",
"supershift",
"assays",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"C5a",
"induced",
"kappaB",
"binding",
"activity",
"was",
"detected",
"15",
"min",
"after",
"agonist",
"stimulation",
",",
"peaked",
"at",
"30-40",
"min",
",",
"and",
"remained",
"detectable",
"at",
"2",
"h",
"."
] | [
"c5a",
"induced",
"kappab",
"binding",
"activity",
"was",
"detected",
"15",
"min",
"after",
"agonist",
"stimulation",
",",
"peaked",
"at",
"30-40",
"min",
",",
"and",
"remained",
"detectable",
"at",
"2",
"h",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Binding",
"to",
"kappaB",
"sequence",
"was",
"accompanied",
"by",
"an",
"initial",
"decrease",
"and",
"subsequent",
"increase",
"in",
"the",
"cytoplasmic",
"IkappaBalpha",
"levels",
",",
"as",
"detected",
"by",
"Western",
"blotting",
"using",
"an",
"anti-",
"IkappaBalpha",
"antibody",
"."
] | [
"binding",
"to",
"kappab",
"sequence",
"was",
"accompanied",
"by",
"an",
"initial",
"decrease",
"and",
"subsequent",
"increase",
"in",
"the",
"cytoplasmic",
"ikappabalpha",
"levels",
",",
"as",
"detected",
"by",
"western",
"blotting",
"using",
"an",
"anti-",
"ikappabalpha",
"antibody",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Pertussis",
"toxin",
"treatment",
"markedly",
"decreased",
"kappaB",
"binding",
"activities",
"induced",
"by",
"both",
"C5a",
"and",
"C3a",
",",
"whereas",
"cholera",
"toxin",
"displayed",
"no",
"inhibitory",
"effect",
"."
] | [
"pertussis",
"toxin",
"treatment",
"markedly",
"decreased",
"kappab",
"binding",
"activities",
"induced",
"by",
"both",
"c5a",
"and",
"c3a",
",",
"whereas",
"cholera",
"toxin",
"displayed",
"no",
"inhibitory",
"effect",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Neither",
"of",
"the",
"two",
"toxins",
"affected",
"kappaB",
"binding",
"activity",
"induced",
"by",
"TNFalpha",
"in",
"the",
"same",
"cells",
"."
] | [
"neither",
"of",
"the",
"two",
"toxins",
"affected",
"kappab",
"binding",
"activity",
"induced",
"by",
"tnfalpha",
"in",
"the",
"same",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"imply",
"a",
"potential",
"role",
"of",
"the",
"anaphylatoxins",
"C5a",
"and",
"C3a",
"in",
"regulating",
"leukocytes",
"gene",
"expression",
"through",
"G",
"protein-coupled",
"transcription",
"factor",
"activation",
"."
] | [
"these",
"results",
"imply",
"a",
"potential",
"role",
"of",
"the",
"anaphylatoxins",
"c5a",
"and",
"c3a",
"in",
"regulating",
"leukocytes",
"gene",
"expression",
"through",
"g",
"protein-coupled",
"transcription",
"factor",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Hematopoietic",
"lineage",
"commitment",
":",
"role",
"of",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"hematopoietic",
"lineage",
"commitment",
":",
"role",
"of",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"This",
"review",
"focuses",
"on",
"the",
"roles",
"of",
"transcription",
"factors",
"in",
"hematopoietic",
"lineage",
"commitment",
"."
] | [
"this",
"review",
"focuses",
"on",
"the",
"roles",
"of",
"transcription",
"factors",
"in",
"hematopoietic",
"lineage",
"commitment",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"A",
"brief",
"introduction",
"to",
"lineage",
"commitment",
"and",
"asymmetric",
"cell",
"division",
"is",
"followed",
"by",
"a",
"discussion",
"of",
"several",
"methods",
"used",
"to",
"identify",
"transcription",
"factors",
"important",
"in",
"specifying",
"hematopoietic",
"cell",
"types",
"."
] | [
"a",
"brief",
"introduction",
"to",
"lineage",
"commitment",
"and",
"asymmetric",
"cell",
"division",
"is",
"followed",
"by",
"a",
"discussion",
"of",
"several",
"methods",
"used",
"to",
"identify",
"transcription",
"factors",
"important",
"in",
"specifying",
"hematopoietic",
"cell",
"types",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Next",
"is",
"presented",
"a",
"discussion",
"of",
"the",
"use",
"of",
"embryonic",
"stem",
"cells",
"in",
"the",
"analysis",
"of",
"hematopoietic",
"gene",
"expression",
"and",
"the",
"use",
"of",
"targeted",
"gene",
"disruption",
"to",
"analyze",
"the",
"role",
"of",
"transcription",
"factors",
"in",
"hematopoiesis",
"."
] | [
"next",
"is",
"presented",
"a",
"discussion",
"of",
"the",
"use",
"of",
"embryonic",
"stem",
"cells",
"in",
"the",
"analysis",
"of",
"hematopoietic",
"gene",
"expression",
"and",
"the",
"use",
"of",
"targeted",
"gene",
"disruption",
"to",
"analyze",
"the",
"role",
"of",
"transcription",
"factors",
"in",
"hematopoiesis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"Finally",
",",
"the",
"status",
"of",
"our",
"current",
"knowledge",
"concerning",
"the",
"roles",
"of",
"transcription",
"factors",
"in",
"the",
"commitment",
"to",
"erythroid",
",",
"myeloid",
"and",
"lymphoid",
"cell",
"types",
"is",
"summarized",
"."
] | [
"finally",
",",
"the",
"status",
"of",
"our",
"current",
"knowledge",
"concerning",
"the",
"roles",
"of",
"transcription",
"factors",
"in",
"the",
"commitment",
"to",
"erythroid",
",",
"myeloid",
"and",
"lymphoid",
"cell",
"types",
"is",
"summarized",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mechanism",
"of",
"antiandrogen",
"action",
":",
"conformational",
"changes",
"of",
"the",
"receptor",
"."
] | [
"mechanism",
"of",
"antiandrogen",
"action",
":",
"conformational",
"changes",
"of",
"the",
"receptor",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Androgen",
"receptor",
"mRNA",
"was",
"translated",
"in",
"vitro",
",",
"and",
"androgen-",
"and",
"antiandrogen-",
"bound",
"receptor",
"complexes",
"were",
"studied",
"using",
"limited",
"proteolytic",
"digestion",
"by",
"trypsin",
"."
] | [
"androgen",
"receptor",
"mrna",
"was",
"translated",
"in",
"vitro",
",",
"and",
"androgen-",
"and",
"antiandrogen-",
"bound",
"receptor",
"complexes",
"were",
"studied",
"using",
"limited",
"proteolytic",
"digestion",
"by",
"trypsin",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Partial",
"proteolysis",
"of",
"androgen",
"-bound",
"receptor",
"protein",
"resulted",
"in",
"a",
"29-kDa",
"proteolysis-resisting",
"fragment",
",",
"whereas",
"antiandrogen",
"binding",
"stabilised",
"a",
"35-kDa",
"fragment",
"."
] | [
"partial",
"proteolysis",
"of",
"androgen",
"-bound",
"receptor",
"protein",
"resulted",
"in",
"a",
"29-kda",
"proteolysis-resisting",
"fragment",
",",
"whereas",
"antiandrogen",
"binding",
"stabilised",
"a",
"35-kda",
"fragment",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Both",
"fragments",
"contain",
"the",
"entire",
"ligand",
"binding",
"domain",
",",
"and",
"the",
"35-kDa",
"fragment",
"extended",
"into",
"the",
"hinge",
"region",
"of",
"the",
"receptor",
"."
] | [
"both",
"fragments",
"contain",
"the",
"entire",
"ligand",
"binding",
"domain",
",",
"and",
"the",
"35-kda",
"fragment",
"extended",
"into",
"the",
"hinge",
"region",
"of",
"the",
"receptor",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Several",
"antiandrogens",
"show",
"agonistic",
"properties",
"for",
"a",
"mutated",
"androgen",
"receptor",
"(",
"LNCaP",
"cell",
"variant",
")",
";",
"trypsin",
"digestion",
"of",
"antiandrogen",
"-bound",
"mutated",
"receptor",
"also",
"resulted",
"in",
"a",
"29-kDa",
"fragment",
"."
] | [
"several",
"antiandrogens",
"show",
"agonistic",
"properties",
"for",
"a",
"mutated",
"androgen",
"receptor",
"(",
"lncap",
"cell",
"variant",
")",
";",
"trypsin",
"digestion",
"of",
"antiandrogen",
"-bound",
"mutated",
"receptor",
"also",
"resulted",
"in",
"a",
"29-kda",
"fragment",
"."
] | [
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"point",
"to",
"an",
"important",
"difference",
"between",
"antiandrogens",
"and",
"antagonists",
"of",
"other",
"steroid",
"hormone",
"receptors",
"."
] | [
"our",
"results",
"point",
"to",
"an",
"important",
"difference",
"between",
"antiandrogens",
"and",
"antagonists",
"of",
"other",
"steroid",
"hormone",
"receptors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Antiandrogens",
"result",
"in",
"protection",
"of",
"both",
"the",
"hinge",
"region",
"and",
"C-terminus",
"of",
"the",
"androgen",
"receptor",
"agonist",
"proteolytic",
"attack",
",",
"whereas",
"other",
"studies",
"showed",
"that",
"antiestrogens",
"and",
"antiprogestagens",
"expose",
"the",
"C-terminal",
"end",
"of",
"the",
"ligand",
"binding",
"domain",
"of",
"their",
"respective",
"receptors",
"to",
"protease",
"."
] | [
"antiandrogens",
"result",
"in",
"protection",
"of",
"both",
"the",
"hinge",
"region",
"and",
"c-terminus",
"of",
"the",
"androgen",
"receptor",
"agonist",
"proteolytic",
"attack",
",",
"whereas",
"other",
"studies",
"showed",
"that",
"antiestrogens",
"and",
"antiprogestagens",
"expose",
"the",
"c-terminal",
"end",
"of",
"the",
"ligand",
"binding",
"domain",
"of",
"their",
"respective",
"receptors",
"to",
"protease",
"."
] | [
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Differences",
"in",
"conformation",
"of",
"the",
"hinge",
"region",
"distinguish",
"androgen",
"-bound",
"from",
"antiandrogen",
"-bound",
"receptor",
"complexes",
",",
"which",
"represents",
"an",
"important",
"feature",
"of",
"antiandrogen",
"action",
"."
] | [
"differences",
"in",
"conformation",
"of",
"the",
"hinge",
"region",
"distinguish",
"androgen",
"-bound",
"from",
"antiandrogen",
"-bound",
"receptor",
"complexes",
",",
"which",
"represents",
"an",
"important",
"feature",
"of",
"antiandrogen",
"action",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"In",
"vivo",
"and",
"in",
"vitro",
"effects",
"of",
"glucocorticoids",
"on",
"lymphocyte",
"proliferation",
"in",
"man",
":",
"relationship",
"to",
"glucocorticoid",
"receptors",
"."
] | [
"in",
"vivo",
"and",
"in",
"vitro",
"effects",
"of",
"glucocorticoids",
"on",
"lymphocyte",
"proliferation",
"in",
"man",
":",
"relationship",
"to",
"glucocorticoid",
"receptors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Interrelations",
"between",
"the",
"hypothalamic-pituitary-adrenal",
"system",
"(",
"HPA",
")",
"and",
"the",
"immune",
"system",
"represent",
"a",
"well-documented",
"biological",
"phenomenon",
"."
] | [
"interrelations",
"between",
"the",
"hypothalamic-pituitary-adrenal",
"system",
"(",
"hpa",
")",
"and",
"the",
"immune",
"system",
"represent",
"a",
"well-documented",
"biological",
"phenomenon",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"O",
"B-body_part",
"O",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"While",
"in",
"vitro",
"administration",
"of",
"glucocorticoids",
"may",
"inhibit",
"concanavalin",
"A",
"(",
"Con",
"A",
")",
"-",
"and",
"phytohemagglutinin",
"(",
"PHA",
")",
"-",
"induced",
"T-cell",
"proliferation",
",",
"pokeweed",
"mitogen",
"(",
"PWM",
")",
"-driven",
"B-cell",
"mitogenesis",
"is",
"relatively",
"resistant",
"to",
"glucocorticoids",
"."
] | [
"while",
"in",
"vitro",
"administration",
"of",
"glucocorticoids",
"may",
"inhibit",
"concanavalin",
"a",
"(",
"con",
"a",
")",
"-",
"and",
"phytohemagglutinin",
"(",
"pha",
")",
"-",
"induced",
"t-cell",
"proliferation",
",",
"pokeweed",
"mitogen",
"(",
"pwm",
")",
"-driven",
"b-cell",
"mitogenesis",
"is",
"relatively",
"resistant",
"to",
"glucocorticoids",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O"
] |
[
"To",
"further",
"explore",
"the",
"link",
"between",
"the",
"HPA",
"and",
"the",
"immune",
"system",
"in",
"relation",
"to",
"glucocorticoid",
"receptor",
"function",
",",
"dose-response",
"curves",
"were",
"obtained",
"for",
"Con",
"A",
"-and",
"PHA",
"-induced",
"T-cell",
"mitogenesis",
",",
"PWM",
"-generated",
"B-cell",
"mitogenesis",
"and",
"spontaneous",
"lymphocyte",
"proliferation",
"in",
"13",
"healthy",
"controls",
"."
] | [
"to",
"further",
"explore",
"the",
"link",
"between",
"the",
"hpa",
"and",
"the",
"immune",
"system",
"in",
"relation",
"to",
"glucocorticoid",
"receptor",
"function",
",",
"dose-response",
"curves",
"were",
"obtained",
"for",
"con",
"a",
"-and",
"pha",
"-induced",
"t-cell",
"mitogenesis",
",",
"pwm",
"-generated",
"b-cell",
"mitogenesis",
"and",
"spontaneous",
"lymphocyte",
"proliferation",
"in",
"13",
"healthy",
"controls",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-body_part",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O"
] |
[
"Glucocorticoid",
"effects",
"were",
"assessed",
"in",
"vivo",
"by",
"depletion",
"of",
"endogenous",
"glucocorticoids",
"after",
"oral",
"administration",
"of",
"1",
".",
"5",
"g",
"metyrapone",
"(",
"MET",
")",
"and",
"subsequent",
"glucocorticoid",
"replacement",
",",
"and",
"in",
"vitro",
"by",
"incubation",
"of",
"the",
"cells",
"with",
"different",
"doses",
"of",
"dexamethasone",
"(",
"DEX",
")",
"."
] | [
"glucocorticoid",
"effects",
"were",
"assessed",
"in",
"vivo",
"by",
"depletion",
"of",
"endogenous",
"glucocorticoids",
"after",
"oral",
"administration",
"of",
"1",
".",
"5",
"g",
"metyrapone",
"(",
"met",
")",
"and",
"subsequent",
"glucocorticoid",
"replacement",
",",
"and",
"in",
"vitro",
"by",
"incubation",
"of",
"the",
"cells",
"with",
"different",
"doses",
"of",
"dexamethasone",
"(",
"dex",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"B-lipid",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O"
] |
[
"There",
"was",
"a",
"significant",
"decrease",
"in",
"PWM",
"-induced",
"B-cell",
"mitogenesis",
"and",
"a",
"more",
"pronounced",
"effect",
"of",
"DEX",
"administered",
"in",
"vitro",
"on",
"spontaneous",
"lymphocyte",
"proliferation",
"after",
"MET",
"treatment",
"when",
"compared",
"with",
"the",
"DEX",
"plus",
"MET",
"pretreated",
"condition",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"there",
"was",
"a",
"significant",
"decrease",
"in",
"pwm",
"-induced",
"b-cell",
"mitogenesis",
"and",
"a",
"more",
"pronounced",
"effect",
"of",
"dex",
"administered",
"in",
"vitro",
"on",
"spontaneous",
"lymphocyte",
"proliferation",
"after",
"met",
"treatment",
"when",
"compared",
"with",
"the",
"dex",
"plus",
"met",
"pretreated",
"condition",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"suggest",
"that",
"the",
"inhibition",
"of",
"spontaneous",
"lymphocyte",
"proliferation",
"by",
"glucocorticoids",
"in",
"vitro",
"is",
"related",
"to",
"glucocorticoid",
"receptor",
"function",
"."
] | [
"these",
"data",
"suggest",
"that",
"the",
"inhibition",
"of",
"spontaneous",
"lymphocyte",
"proliferation",
"by",
"glucocorticoids",
"in",
"vitro",
"is",
"related",
"to",
"glucocorticoid",
"receptor",
"function",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"decrease",
"in",
"PWM",
"-generated",
"B-cell",
"proliferation",
"following",
"cortisol",
"depletion",
"by",
"MET",
"may",
"be",
"seen",
"in",
"connection",
"with",
"impaired",
"glucocorticoid",
"-mediated",
"induction",
"of",
"interleukin-1",
"receptor",
"synthesis",
"."
] | [
"the",
"decrease",
"in",
"pwm",
"-generated",
"b-cell",
"proliferation",
"following",
"cortisol",
"depletion",
"by",
"met",
"may",
"be",
"seen",
"in",
"connection",
"with",
"impaired",
"glucocorticoid",
"-mediated",
"induction",
"of",
"interleukin-1",
"receptor",
"synthesis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"suppression",
"of",
"T",
"cell",
"function",
"and",
"NF",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"expression",
"by",
"serine",
"protease",
"inhibitors",
"is",
"blocked",
"by",
"N-acetylcysteine",
"."
] | [
"the",
"suppression",
"of",
"t",
"cell",
"function",
"and",
"nf",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"expression",
"by",
"serine",
"protease",
"inhibitors",
"is",
"blocked",
"by",
"n-acetylcysteine",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O"
] |
[
"Direct",
"evidence",
"that",
"N-acetylcysteine",
"(",
"NAC",
")",
"enhances",
"the",
"immune",
"response",
"of",
"peripheral",
"blood",
"T",
"cells",
"at",
"the",
"level",
"of",
"NF",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"is",
"presented",
"."
] | [
"direct",
"evidence",
"that",
"n-acetylcysteine",
"(",
"nac",
")",
"enhances",
"the",
"immune",
"response",
"of",
"peripheral",
"blood",
"t",
"cells",
"at",
"the",
"level",
"of",
"nf",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"is",
"presented",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"NAC",
"blocks",
"the",
"suppression",
"of",
"T",
"cell",
"mitogenesis",
"and",
"cytokine",
"production",
"by",
"protease",
"inhibitors",
"such",
"as",
"N-tosylphenylalanine",
"chloromethyl",
"ketone",
"(",
"TPCK",
")",
"."
] | [
"in",
"addition",
",",
"nac",
"blocks",
"the",
"suppression",
"of",
"t",
"cell",
"mitogenesis",
"and",
"cytokine",
"production",
"by",
"protease",
"inhibitors",
"such",
"as",
"n-tosylphenylalanine",
"chloromethyl",
"ketone",
"(",
"tpck",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"proliferative",
"responses",
"of",
"purified",
"CD4+",
"or",
"CD8+",
"T",
"cells",
"are",
"suppressed",
"more",
"strongly",
"by",
"TPCK",
"when",
"anti-CD28",
"rather",
"than",
"the",
"phorbol",
"ester",
"PMA",
"is",
"used",
"as",
"the",
"mitogenic",
"coactivator",
"."
] | [
"the",
"proliferative",
"responses",
"of",
"purified",
"cd4+",
"or",
"cd8+",
"t",
"cells",
"are",
"suppressed",
"more",
"strongly",
"by",
"tpck",
"when",
"anti-cd28",
"rather",
"than",
"the",
"phorbol",
"ester",
"pma",
"is",
"used",
"as",
"the",
"mitogenic",
"coactivator",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Cytokine",
"(",
"IL-2",
",",
"IL-6",
",",
"INF-gamma",
")",
"production",
"is",
"inhibited",
"95-100%",
"by",
"concentrations",
"of",
"TPCK",
"that",
"totally",
"suppress",
"the",
"mitogenesis",
"of",
"CD4+",
"or",
"CD8+",
"cells",
"."
] | [
"cytokine",
"(",
"il-2",
",",
"il-6",
",",
"inf-gamma",
")",
"production",
"is",
"inhibited",
"95-100%",
"by",
"concentrations",
"of",
"tpck",
"that",
"totally",
"suppress",
"the",
"mitogenesis",
"of",
"cd4+",
"or",
"cd8+",
"cells",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Using",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assays",
",",
"we",
"find",
"that",
"TPCK",
"virtually",
"abolishes",
"(",
"to",
"less",
"than",
"1%",
")",
"the",
"levels",
"of",
"NF",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"(",
"but",
"not",
"Oct-1",
")",
"found",
"in",
"nuclear",
"and",
"whole",
"cell",
"extracts",
"of",
"activated",
"T",
"cells",
"."
] | [
"using",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assays",
",",
"we",
"find",
"that",
"tpck",
"virtually",
"abolishes",
"(",
"to",
"less",
"than",
"1%",
")",
"the",
"levels",
"of",
"nf",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"(",
"but",
"not",
"oct-1",
")",
"found",
"in",
"nuclear",
"and",
"whole",
"cell",
"extracts",
"of",
"activated",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Strikingly",
",",
"the",
"immunosuppressive",
"effects",
"of",
"TPCK",
"are",
"blocked",
"when",
"T",
"cells",
"are",
"pretreated",
"for",
"15",
"min",
"with",
"5",
"mM",
"NAC",
"."
] | [
"strikingly",
",",
"the",
"immunosuppressive",
"effects",
"of",
"tpck",
"are",
"blocked",
"when",
"t",
"cells",
"are",
"pretreated",
"for",
"15",
"min",
"with",
"5",
"mm",
"nac",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O"
] |
[
"NAC",
"not",
"only",
"blocks",
"the",
"effect",
"of",
"TPCK",
"but",
"enhances",
"mitogenesis",
"and",
"cytokine",
"production",
"(",
">2",
".",
"5-fold",
"in",
"some",
"cases",
")",
"upon",
"activation",
"of",
"unsuppressed",
"T",
"cells",
"."
] | [
"nac",
"not",
"only",
"blocks",
"the",
"effect",
"of",
"tpck",
"but",
"enhances",
"mitogenesis",
"and",
"cytokine",
"production",
"(",
">2",
".",
"5-fold",
"in",
"some",
"cases",
")",
"upon",
"activation",
"of",
"unsuppressed",
"t",
"cells",
"."
] | [
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Our",
"data",
"support",
"the",
"notion",
"that",
"NF",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"and",
"I",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"proteases",
"play",
"obligate",
"roles",
"in",
"T",
"cell",
"activation",
"and",
"mitogenesis",
",",
"roles",
"that",
"are",
"enhanced",
"significantly",
"by",
"NAC",
"."
] | [
"our",
"data",
"support",
"the",
"notion",
"that",
"nf",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"and",
"i",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"proteases",
"play",
"obligate",
"roles",
"in",
"t",
"cell",
"activation",
"and",
"mitogenesis",
",",
"roles",
"that",
"are",
"enhanced",
"significantly",
"by",
"nac",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O"
] |
[
"Expression",
"of",
"either",
"the",
"TCL1",
"oncogene",
",",
"or",
"transcripts",
"from",
"its",
"homologue",
"MTCP1/c6",
".",
"1B",
",",
"in",
"leukaemic",
"and",
"non-leukaemic",
"T",
"cells",
"from",
"ataxia",
"telangiectasia",
"patients",
"."
] | [
"expression",
"of",
"either",
"the",
"tcl1",
"oncogene",
",",
"or",
"transcripts",
"from",
"its",
"homologue",
"mtcp1/c6",
".",
"1b",
",",
"in",
"leukaemic",
"and",
"non-leukaemic",
"t",
"cells",
"from",
"ataxia",
"telangiectasia",
"patients",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O"
] |
[
"Patients",
"with",
"the",
"recessively",
"inherited",
"disorder",
"ataxia",
"telangiectasia",
"(",
"A-T",
")",
"have",
"a",
"high",
"level",
"of",
"specific",
"chromosome",
"translocations",
"which",
"can",
"be",
"easily",
"observed",
"in",
"peripheral",
"T",
"cells",
"and",
"show",
"a",
"greatly",
"increased",
"predisposition",
"to",
"leukaemia/lymphoma",
",",
"mainly",
"of",
"T",
"cell",
"origin",
"."
] | [
"patients",
"with",
"the",
"recessively",
"inherited",
"disorder",
"ataxia",
"telangiectasia",
"(",
"a-t",
")",
"have",
"a",
"high",
"level",
"of",
"specific",
"chromosome",
"translocations",
"which",
"can",
"be",
"easily",
"observed",
"in",
"peripheral",
"t",
"cells",
"and",
"show",
"a",
"greatly",
"increased",
"predisposition",
"to",
"leukaemia/lymphoma",
",",
"mainly",
"of",
"t",
"cell",
"origin",
"."
] | [
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O"
] |
[
"Some",
"translocation",
"cells",
"proliferate",
"into",
"a",
"large",
"clone",
"and",
"may",
"develop",
"into",
"T",
"cell",
"prolymphocytic",
"leukaemia",
"(",
"T-PLL",
")",
"."
] | [
"some",
"translocation",
"cells",
"proliferate",
"into",
"a",
"large",
"clone",
"and",
"may",
"develop",
"into",
"t",
"cell",
"prolymphocytic",
"leukaemia",
"(",
"t-pll",
")",
"."
] | [
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"By",
"the",
"time",
"of",
"diagnosis",
"of",
"T-PLL",
",",
"the",
"clone",
"contains",
"many",
"more",
"genetic",
"changes",
"in",
"the",
"form",
"of",
"additional",
"translocations",
"."
] | [
"by",
"the",
"time",
"of",
"diagnosis",
"of",
"t-pll",
",",
"the",
"clone",
"contains",
"many",
"more",
"genetic",
"changes",
"in",
"the",
"form",
"of",
"additional",
"translocations",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"T-PLL",
"is",
"also",
"seen",
"in",
"non-",
"A-T",
"individuals",
"where",
"expression",
"of",
"either",
"TCL1",
"(",
"at",
"14q32",
")",
"or",
"the",
"c6",
".",
"1B/MTCP1",
"A1",
"transcript",
"(",
"at-Xq28",
")",
"has",
"been",
"demonstrated",
"in",
"just",
"a",
"few",
"instances",
"."
] | [
"t-pll",
"is",
"also",
"seen",
"in",
"non-",
"a-t",
"individuals",
"where",
"expression",
"of",
"either",
"tcl1",
"(",
"at",
"14q32",
")",
"or",
"the",
"c6",
".",
"1b/mtcp1",
"a1",
"transcript",
"(",
"at-xq28",
")",
"has",
"been",
"demonstrated",
"in",
"just",
"a",
"few",
"instances",
"."
] | [
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"show",
"here",
",",
"that",
"expression",
"of",
"TCL1",
"occurs",
"in",
"leukaemic",
"T",
"cells",
"from",
"A-T",
"patients",
"with",
"chromosome",
"14",
"rearrangements",
"."
] | [
"we",
"show",
"here",
",",
"that",
"expression",
"of",
"tcl1",
"occurs",
"in",
"leukaemic",
"t",
"cells",
"from",
"a-t",
"patients",
"with",
"chromosome",
"14",
"rearrangements",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Expression",
"of",
"TCL1",
"also",
"occurs",
"in",
"the",
"preleukaemic",
"clone",
"cells",
"of",
"A-T",
"patients",
"containing",
"the",
"primary",
"translocation",
"alone",
"."
] | [
"expression",
"of",
"tcl1",
"also",
"occurs",
"in",
"the",
"preleukaemic",
"clone",
"cells",
"of",
"a-t",
"patients",
"containing",
"the",
"primary",
"translocation",
"alone",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Some",
"expression",
"of",
"TCL1",
"could",
"also",
"be",
"detected",
"in",
"randomly",
"selected",
"A-T",
"patients",
"without",
"large",
"cytogenetic",
"clones",
"and",
"without",
"any",
"evidence",
"of",
"leukaemic",
"change",
"."
] | [
"some",
"expression",
"of",
"tcl1",
"could",
"also",
"be",
"detected",
"in",
"randomly",
"selected",
"a-t",
"patients",
"without",
"large",
"cytogenetic",
"clones",
"and",
"without",
"any",
"evidence",
"of",
"leukaemic",
"change",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"also",
"show",
"that",
"expression",
"of",
"the",
"B1",
"transcript",
"from",
"a",
"second",
"gene",
",",
"MTCP1",
",",
"occurred",
"at",
"a",
"relatively",
"high",
"level",
"only",
"in",
"two",
"T-PLL",
"tumours",
"from",
"A-T",
"patients",
"with",
"t",
"(",
"X",
";",
"14",
")",
"translocations",
"whereas",
"the",
"MTCP1",
"/A1",
"transcript",
"is",
"much",
"more",
"widely",
"expressed",
"in",
"both",
"tumour",
"and",
"non",
"tumour",
"cells",
"of",
"A-T",
"and",
"non-",
"A-T",
"individuals",
"."
] | [
"we",
"also",
"show",
"that",
"expression",
"of",
"the",
"b1",
"transcript",
"from",
"a",
"second",
"gene",
",",
"mtcp1",
",",
"occurred",
"at",
"a",
"relatively",
"high",
"level",
"only",
"in",
"two",
"t-pll",
"tumours",
"from",
"a-t",
"patients",
"with",
"t",
"(",
"x",
";",
"14",
")",
"translocations",
"whereas",
"the",
"mtcp1",
"/a1",
"transcript",
"is",
"much",
"more",
"widely",
"expressed",
"in",
"both",
"tumour",
"and",
"non",
"tumour",
"cells",
"of",
"a-t",
"and",
"non-",
"a-t",
"individuals",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-multi_cell",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |