Datasets:

kngrg
/

rus-scifact

Error code:   DatasetGenerationError
Exception:    ArrowNotImplementedError
Message:      Cannot write struct type 'metadata' with no child field to Parquet. Consider adding a dummy child field.
Traceback:    Traceback (most recent call last):
                File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/builder.py", line 2011, in _prepare_split_single
                  writer.write_table(table)
                File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/arrow_writer.py", line 583, in write_table
                  self._build_writer(inferred_schema=pa_table.schema)
                File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/arrow_writer.py", line 404, in _build_writer
                  self.pa_writer = self._WRITER_CLASS(self.stream, schema)
                File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/pyarrow/parquet/core.py", line 1010, in __init__
                  self.writer = _parquet.ParquetWriter(
                File "pyarrow/_parquet.pyx", line 2157, in pyarrow._parquet.ParquetWriter.__cinit__
                File "pyarrow/error.pxi", line 154, in pyarrow.lib.pyarrow_internal_check_status
                File "pyarrow/error.pxi", line 91, in pyarrow.lib.check_status
              pyarrow.lib.ArrowNotImplementedError: Cannot write struct type 'metadata' with no child field to Parquet. Consider adding a dummy child field.
              
              During handling of the above exception, another exception occurred:
              
              Traceback (most recent call last):
                File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/builder.py", line 2027, in _prepare_split_single
                  num_examples, num_bytes = writer.finalize()
                File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/arrow_writer.py", line 602, in finalize
                  self._build_writer(self.schema)
                File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/arrow_writer.py", line 404, in _build_writer
                  self.pa_writer = self._WRITER_CLASS(self.stream, schema)
                File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/pyarrow/parquet/core.py", line 1010, in __init__
                  self.writer = _parquet.ParquetWriter(
                File "pyarrow/_parquet.pyx", line 2157, in pyarrow._parquet.ParquetWriter.__cinit__
                File "pyarrow/error.pxi", line 154, in pyarrow.lib.pyarrow_internal_check_status
                File "pyarrow/error.pxi", line 91, in pyarrow.lib.check_status
              pyarrow.lib.ArrowNotImplementedError: Cannot write struct type 'metadata' with no child field to Parquet. Consider adding a dummy child field.
              
              The above exception was the direct cause of the following exception:
              
              Traceback (most recent call last):
                File "/src/services/worker/src/worker/job_runners/config/parquet_and_info.py", line 1529, in compute_config_parquet_and_info_response
                  parquet_operations = convert_to_parquet(builder)
                File "/src/services/worker/src/worker/job_runners/config/parquet_and_info.py", line 1154, in convert_to_parquet
                  builder.download_and_prepare(
                File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/builder.py", line 1027, in download_and_prepare
                  self._download_and_prepare(
                File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/builder.py", line 1122, in _download_and_prepare
                  self._prepare_split(split_generator, **prepare_split_kwargs)
                File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/builder.py", line 1882, in _prepare_split
                  for job_id, done, content in self._prepare_split_single(
                File "/src/services/worker/.venv/lib/python3.9/site-packages/datasets/builder.py", line 2038, in _prepare_split_single
                  raise DatasetGenerationError("An error occurred while generating the dataset") from e
              datasets.exceptions.DatasetGenerationError: An error occurred while generating the dataset

Need help to make the dataset viewer work? Make sure to review how to configure the dataset viewer, and open a discussion for direct support.

_id string	title string	text string	metadata dict	processed_text string
4983	Микроструктурное развитие белого вещества головного мозга новорожденного человека оценивается in vivo с помощью диффузионно-тензорной магнитно-резонансной томографии.	Изменения архитектуры белого вещества головного мозга в развивающемся человеческом мозге могут повлиять на развитие коры головного мозга и привести к функциональным нарушениям. Последовательность диффузионно-взвешенной магнитно-резонансной томографии (МРТ) линейного сканирования с анализом тензора диффузии применялась для измерения кажущегося коэффициента диффузии, расчета относительной анизотропии и определения трехмерной архитектуры волокон в белом веществе головного мозга у недоношенных детей (n = 17). и доношенные дети (n = 7). Для оценки влияния недоношенности на развитие белого вещества головного мозга недоношенных детей раннего срока беременности (n = 10) исследовали во второй раз в срок. В центральном белом веществе средний видимый коэффициент диффузии на 28 неделе беременности был высоким — 1,8 микром2/мс и снижался к сроку беременности до 1,2 микром2/мс. В заднем лимбе внутренней капсулы средние кажущиеся коэффициенты диффузии в оба раза были одинаковыми (1,2 против 1,1 микром2/мс). Относительная анизотропия была выше, чем ближе был срок рождения, с более высокими абсолютными значениями во внутренней капсуле, чем в центральном белом веществе. У недоношенных детей в доношенном возрасте наблюдались более высокие средние коэффициенты диффузии в центральном белом веществе (1,4 +/- 0,24 против 1,15 +/- 0,09 микром2/мс, p = 0,016) и более низкая относительная анизотропия в обеих областях по сравнению с доношенными детьми (белое вещество , 10,9+/-0,6 против 22,9+/-3,0%, р=0,001; внутренняя капсула, 24,0+/-4,44 против 33,1+/-0,6% р=0,006). Немиелинизированные волокна мозолистого тела были видны с помощью диффузионно-тензорной МРТ уже на 28 неделе; У доношенных и недоношенных детей в срок наблюдались заметные различия в организации волокон белого вещества. Полученные данные показывают, что количественная оценка диффузии воды с помощью МРТ с тензором диффузии дает представление о развитии микроструктуры в белом веществе головного мозга у живых детей.	{}	изменение архитектура белый вещество головной мозг развивающийся человеческий мозг мочь повлиять развитие кора головной мозг привести функциональный нарушение последовательность диффузионный взвесить магнитный резонансный томография мрт линейный сканирование анализ тензор диффузия применяться измерение кажущийся коэффициент диффузия расчёт относительный анизотропия определение трёхмерный архитектура волокно белый вещество головной мозг недоношенный ребёнок n 17 доносить ребёнок n 7 оценка влияние недоношенность развитие белый вещество головной мозг недоношенный ребёнок ранний срок беременность n 10 исследовать второй срок центральный белый вещество средний видимый коэффициент диффузия 28 неделя беременность высокий 1 8 микром2 мс снижаться срок беременность 1 2 микром2 мс задний лимб внутренний капсула средний кажущийся коэффициент диффузия оба одинаковый 1 2 против 1 1 микром2 мс относительный анизотропия выше близкий срок рождение высокий абсолютный значение внутренний капсула центральный белый вещество недоношенный ребёнок доносить возраст наблюдаться высокий средний коэффициент диффузия центральный белый вещество 1 4 0 24 против 1 15 0 09 микром2 мс p 0 016 низкий относительный анизотропия оба область сравнение доносить ребёнок белый вещество 10 9 0 6 против 22 9 3 0 р 0 001 внутренний капсула 24 0 4 44 против 33 1 0 6 р 0 006 немиелинизированный волокно мозолистый тело видный помощь диффузионный тензорный мрт 28 неделя доносить недоношенный ребёнок срок наблюдаться заметный различие организация волокно белый вещество получить дать показывать количественный оценка диффузия вода помощь мрт тензор диффузия давать представление развитие микроструктура белый вещество головной мозг живой ребёнок
5836	Индукция миелодисплазии миелоидными супрессорными клетками.	Миелодиспластические синдромы (МДС) представляют собой возрастные злокачественные новообразования стволовых клеток, которые имеют общие биологические особенности активированного адаптивного иммунного ответа и неэффективного кроветворения. Здесь мы сообщаем, что миелоидные супрессорные клетки (MDSC), которые классически связаны с иммуносупрессией, воспалением и раком, заметно размножаются в костном мозге пациентов с МДС и играют патогенетическую роль в развитии неэффективного кроветворения. Эти клонально различные MDSC сверхпродуцируют гематопоэтические супрессивные цитокины и действуют как мощные апоптотические эффекторы, нацеленные на аутологичные гемопоэтические предшественники. Используя модели нескольких трансфицированных клеток, мы обнаружили, что экспансия MDSC обусловлена взаимодействием провоспалительной молекулы S100A9 с CD33. Эти два белка образовывали функциональную пару лиганд/рецептор, которая рекрутировала компоненты в мотив ингибирования иммунорецептора тирозина CD33 (ITIM), индуцируя секрецию супрессивных цитокинов IL-10 и TGF-β незрелыми миелоидными клетками. У трансгенных мышей S100A9 наблюдалось накопление MDSC в костном мозге, сопровождающееся развитием прогрессирующей многолинейной цитопении и цитологической дисплазии. Важно отметить, что раннее принудительное созревание MDSC либо с помощью лечения полностью транс-ретиноевой кислотой, либо с помощью адаптерного белка, несущего мотив активации иммунорецептора на основе тирозина (ITAM-несущий) (DAP12), прерывание передачи сигналов CD33 спасло гематологический фенотип. Эти данные указывают на то, что первичное расширение MDSC в костном мозге, вызванное путем S100A9/CD33, нарушает гемопоэз и способствует развитию МДС.	{}	миелодиспластический синдром мдс представлять возрастной злокачественный новообразование стволовой клетка иметь общий биологический особенность активированный адаптивный иммунный ответ неэффективный кроветворение сообщать миелоидный супрессорный клетка mdsc классически связать иммуносупрессия воспаление рак заметно размножаться костный мозг пациент мдс играть патогенетический роль развитие неэффективный кроветворение клонально различный mdsc сверхпродуцировать гематопоэтический супрессивный цитокина действовать мощный апоптотический эффектор нацелить аутологичный гемопоэтический предшественник использовать модель несколько трансфицировать клетка обнаружить экспансия mdsc обусловить взаимодействие провоспалительный молекула s100a9 cd33 белок образовывать функциональный пара лиганд рецептор рекрутировать компонент мотив ингибирование иммунорецептор тирозин cd33 itim индуцировать секреция супрессивный цитокин il 10 tgf β незрелый миелоидный клетка трансгенный мышь s100a9 наблюдаться накопление mdsc костный мозг сопровождаться развитие прогрессировать многолинейный цитопение цитологический дисплазия важно отметить ранний принудительный созревание mdsc либо помощь лечение полностью транс ретиноев кислота либо помощь адаптерный белок несущий мотив активация иммунорецептор основа тирозин itam несущий dap12 прерывание передача сигнал cd33 спасти гематологический фенотип дать указывать первичный расширение mdsc костный мозг вызвать путём s100a9 cd33 нарушать гемопоэз способствовать развитие мдс
7912	РНК BC1, транскрипт главного гена для амплификации ID-элемента, способен инициировать собственную обратную транскрипцию.	Элементы ID представляют собой короткие вкрапленные элементы (SINE), обнаруженные в большом количестве копий во многих геномах грызунов. BC1 РНК, связанный с ID транскрипт, получен из единственной копии гена BC1 РНК. Было показано, что ген BC1 РНК является главным геном для амплификации элемента ID в геномах грызунов. Элементы ID распространяются посредством процесса, называемого ретропозицией. Процесс ретропозиции включает ряд потенциальных регуляторных шагов. Эти регуляторные шаги могут включать транскрипцию в соответствующей ткани, стабильность транскрипта, праймирование транскрипта РНК для обратной транскрипции и интеграцию. Это исследование фокусируется на праймировании транскрипта РНК для обратной транскрипции. Показано, что транскрипты гена BC1 РНК способны праймировать свою собственную обратную транскрипцию эффективным внутримолекулярным и сайт-специфическим образом. Эта способность к самопраймированию является следствием вторичной структуры уникальной 3'-области. Наблюдение, что ген, активно амплифицирующийся в ходе эволюции грызунов, делает РНК способной к эффективной самопраймируемой обратной транскрипции, убедительно свидетельствует о том, что самопраймирование является по крайней мере одной из особенностей, делающих ген РНК BC1 главным геном для амплификации элементов ID.	{}	элемент id представлять короткий вкрапить элемент sine обнаружить большой количество копия многий геном грызун bc1 рнк связанный id транскрипта получить единственный копия ген bc1 рнк показать ген bc1 рнк являться главный геном амплификация элемент id геном грызун элемент id распространяться посредством процесс называть ретропозиция процесс ретропозиция включать ряд потенциальный регуляторный шаг регуляторный шаг мочь включать транскрипция соответствовать ткань стабильность транскрипта праймирование транскрипта рнк обратный транскрипция интеграция это исследование фокусироваться праймирования транскрипта рнк обратный транскрипция показать транскрипта ген bc1 рнк способный праймировать свой собственный обратный транскрипция эффективный внутримолекулярный сайт специфический образ способность самопраймирования являться следствие вторичный структура уникальный 3 область наблюдение ген активно амплифицирующийся ход эволюция грызун делать рнк способный эффективный самопраймировать обратный транскрипция убедительно свидетельствовать самопраймирование являться крайний мера особенность делать ген рнк bc1 главный геном амплификация элемент id
18670	ДНК-метилом мононуклеарных клеток периферической крови человека	Метилирование ДНК играет важную роль в биологических процессах, связанных со здоровьем и болезнями человека. Последние технологические достижения позволяют проводить объективный анализ метилирования (метилома) ДНК всего генома на клетках человека. Используя полногеномное бисульфитное секвенирование с 24,7-кратным охватом (12,3-кратное покрытие на цепь), мы сообщаем о комплексном (92,62%) метиломе и анализе уникальных последовательностей в мононуклеарных клетках периферической крови человека (РВМС) того же азиатского человека, геном которого был расшифрован в проекте YH. РВМС являются важным источником клинических анализов крови во всем мире. Мы обнаружили, что 68,4% сайтов CpG и <0,2% сайтов, не являющихся CpG, были метилированы, демонстрируя, что метилирование цитозина, не относящееся к CpG, является незначительным в РВМС человека. Анализ метилома PBMC выявил богатый эпигеномный ландшафт для 20 различных геномных особенностей, включая регуляторные, кодирующие белок, некодирующие, РНК-кодирующие и повторяющиеся последовательности. Интеграция наших данных о метиломе с последовательностью генома YH позволила провести первую комплексную оценку аллель-специфического метилирования (ASM) между двумя гаплоидными метиломами любого человека и идентифицировать 599 гаплоидных дифференциально метилированных областей (hDMR), охватывающих 287 генов. Из них 76 генов имели hDMR в пределах 2 т.п.н. от сайтов начала транскрипции, из которых >80% демонстрировали аллель-специфическую экспрессию (ASE). Эти данные показывают, что АСМ является рецидивирующим явлением и тесно коррелирует с ASE в РВМС человека. Вместе с недавно опубликованными аналогичными исследованиями наше исследование предоставляет комплексный ресурс для будущих эпигеномных исследований и подтверждает, что новая технология секвенирования является парадигмой для крупномасштабных эпигеномных исследований.	{}	метилирование днк играть важный роль биологический процесс связанный здоровье болезнь человек последний технологический достижение позволять проводить объективный анализ метилирование метилом днк весь геном клетка человек использовать полногеномный бисульфитный секвенирование 24 7 кратное охват 12 3 кратное покрытие цепь сообщать комплексный 92 62 метилом анализ уникальный последовательность мононуклеарный клетка периферический кровь человек рвмс азиатский человек геном расшифровать проект yh рвмс являться важный источник клинический анализ кровь весь мир обнаружить 68 4 сайт cpg 0 2 сайт являться cpg метилировать демонстрировать метилирование цитозин относиться cpg являться незначительный рвмс человек анализ метилом pbmc выявить богатый эпигеномный ландшафт 20 различный геномный особенность включая регуляторный кодировать белок некодировать рнк кодировать повторяться последовательность интеграция наш данные метилом последовательность геном yh позволить провести первый комплексный оценка аллель специфический метилирование asm гаплоидный метиломами любой человек идентифицировать 599 гаплоидный дифференциальный метилировать область hdmr охватывать 287 ген 76 ген иметь hdmr предел 2 п н сайт начало транскрипция 80 демонстрировать аллель специфический экспрессия ase дать показывать асм являться рецидивировать явление тесно коррелировать ase рвмс человек вместе недавно опубликовать аналогичный исследование наш исследование предоставлять комплексный ресурс будущий эпигеномный исследование подтверждать новый технология секвенирование являться парадигма крупномасштабный эпигеномный исследование
19238	Ген основного белка миелина человека включен в транскрипционную единицу длиной 179 килобаз: экспрессия в иммунной и центральной нервной системах.	Две человеческие кДНК Golli (ген, экспрессируемый в линии олигодендроцитов)-MBP (основной белок миелина) были выделены из линии клеток олигодендроглиомы человека. Анализ этих кДНК позволил нам определить полную структуру человеческого гена Golli-MBP. Ген Golli-MBP, который охватывает транскрипционную единицу MBP, имеет длину приблизительно 179 кб и состоит из 10 экзонов, семь из которых составляют ген MBP. Человеческий ген Golli-MBP содержит два сайта начала транскрипции, каждый из которых дает начало семейству альтернативно сплайсированных транскриптов. По крайней мере два транскрипта Golli-MBP, содержащие первые три экзона гена и один или несколько экзонов MBP, производятся из первого сайта начала транскрипции. Второе семейство транскриптов содержит только экзоны MBP и производит хорошо известные MBP. У людей анализ РНК-блоттинга показал, что транскрипты Golli-MBP были выражены в тимусе плода, селезенке и клеточных линиях В-клеток и макрофагов человека, а также в спинном мозге плода. Эти результаты четко связывают экспрессию экзонов, кодирующих аутоиммуноген/энцефалитоген MBP в центральной нервной системе, с клетками и тканями иммунной системы посредством нормальной экспрессии гена Golli-MBP. Они также устанавливают, что этот генетический локус, включающий ген MBP, сохраняется среди видов, что предоставляет дополнительные доказательства того, что транскрипционная единица MBP является неотъемлемой частью транскрипционной единицы Golli, и предполагает, что эта структурная организация важна для генетической функции и/или регуляции этих генов.	{}	человеческий кднк golli ген экспрессировать линия олигодендроцит mbp основной белок миелин выделить линия клетка олигодендроглиома человек анализ кднк позволить определить полный структура человеческий ген golli mbp ген golli mbp охватывать транскрипционный единица mbp иметь длина приблизительно 179 кб состоять 10 экзон семь составлять ген mbp человеческий ген golli mbp содержать сайт начало транскрипция каждый давать начало семейство альтернативный сплайсировать транскрипт крайний мера транскрипта golli mbp содержать первый экзон ген несколько экзон mbp производиться первый сайт начало транскрипция второе семейство транскрипт содержать экзон mbp производить известный mbp человек анализ рнк блоттинг показать транскрипта golli mbp выразить тимус плод селезёнка клеточный линия клетка макрофаг человек также спинной мозг плод результат чётко связывать экспрессия экзон кодировать аутоиммуноген энцефалитоген mbp центральный нервный система клетка ткань иммунный система посредством нормальный экспрессия ген golli mbp также устанавливать генетический локус включать ген mbp сохраняться среди вид предоставлять дополнительный доказательство транскрипционный единица mbp являться неотъемлемый часть транскрипционный единица golli предполагать структурный организация важный генетический функция регуляция ген
33370	Нацеливание на A20 снижает выживаемость стволовых клеток глиомы и рост опухоли	Глиобластомы — это смертельные виды рака, которые демонстрируют функциональную клеточную иерархию, поддерживаемую самообновляющимися стволовыми клетками глиобластомы (GSC). GSCs регулируются молекулярными путями, отличными от основной опухоли, которые могут быть полезными терапевтическими мишенями. Мы определили, что A20 (TNFAIP3), регулятор выживания клеток и путь NF-kappaB, сверхэкспрессируется в GSC по сравнению с нестволовыми клетками глиобластомы как на уровне мРНК, так и на уровне белка. Чтобы определить функциональное значение A20 в GSCs, мы нацелились на экспрессию A20 с помощью лентивирусно-опосредованной доставки короткой шпилечной РНК (shRNA). Ингибирование экспрессии A20 снижает рост и выживаемость GSC за счет механизмов, связанных с замедлением прогрессирования клеточного цикла и снижением фосфорилирования p65/RelA. Повышенные уровни A20 в GSCs способствуют апоптотической устойчивости: GSCs были менее восприимчивы к гибели клеток, индуцированной TNF-альфа, чем соответствующие клетки нестволовой глиомы, но нокдаун A20 повышал чувствительность GSC к TNF-альфа-опосредованному апоптозу. Снижение выживаемости GSCs после нокдауна A20 способствовало снижению способности этих клеток к самообновлению в анализах формирования первичной и вторичной нейросферы. Туморогенный потенциал GSCs снижался при нацеливании на A20, что приводило к увеличению выживаемости мышей, несущих ксенотрансплантаты глиомы человека. Анализ in silico геномной базы данных пациентов с глиомой показывает, что сверхэкспрессия и амплификация A20 обратно коррелируют с выживаемостью. В совокупности эти данные показывают, что А20 способствует поддержанию глиомы посредством воздействия на субпопуляцию стволовых клеток глиомы. Хотя инактивирующие мутации А20 при лимфоме позволяют предположить, что А20 может действовать как супрессор опухоли, подобные точечные мутации не были идентифицированы с помощью геномного секвенирования глиомы: фактически, наши данные показывают, что А20 может действовать как усилитель опухоли при глиоме, способствуя выживанию ГСК. Поэтому к противораковой терапии А20 следует относиться с осторожностью, поскольку эффекты, вероятно, будут различаться в зависимости от типа опухоли.	{}	глиобластома это смертельный вид рак демонстрировать функциональный клеточный иерархия поддерживать самообновляться стволовой клетка глиобластома gsc gscs регулироваться молекулярный путь отличный основной опухоль мочь полезный терапевтический мишень определить a20 tnfaip3 регулятор выживание клетка путь nf kappab сверхэкспрессироваться gsc сравнение нестволовой клетка глиобластома уровень мрнк уровень белок определить функциональный значение a20 gscs нацелиться экспрессия a20 помощь лентивирусный опосредовать доставка короткий шпилечный рнк shrna ингибирование экспрессия a20 снижать рост выживаемость gsc счёт механизм связанный замедление прогрессирование клеточный цикл снижение фосфорилирование p65 rela повышенный уровень a20 gscs способствовать апоптотический устойчивость gscs менее восприимчивый гибель клетка индуцировать tnf альфа соответствующий клетка нестволовой глиома нокдаун a20 повышать чувствительность gsc tnf альфа опосредовать апоптоз снижение выживаемость gscs нокдаун a20 способствовать снижение способность клетка самообновление анализ формирование первичный вторичный нейросфера туморогенный потенциал gscs снижаться нацеливание a20 приводить увеличение выживаемость мышь несущий ксенотрансплантат глиома человек анализ in silico геномный база данные пациент глиома показывать сверхэкспрессия амплификация a20 обратно коррелировать выживаемость совокупность дать показывать а20 способствовать поддержание глиома посредством воздействие субпопуляция стволовой клетка глиома хотя инактивировать мутация а20 лимфома позволять предположить а20 мочь действовать супрессора опухоль подобный точечный мутация идентифицировать помощь геномный секвенирование глиома фактически наш дать показывать а20 мочь действовать усилитель опухоль глиома способствовать выживание гск поэтому противораковый терапия а20 следовать относиться осторожность поскольку эффект вероятно различаться зависимость тип опухоль
36474	Эффективное нацеливание на экспрессируемые и молчащие гены в человеческих эмбриональных стволовых клетках и иПСК с использованием нуклеаз с цинковыми пальцами	Реализация полного потенциала эмбриональных стволовых клеток человека (чЭСК) и индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (хиПСК) требует эффективных методов генетической модификации. Однако методы создания репортеров клонов, специфичных для конкретного типа клеток, а также надежные инструменты для разрушения, восстановления или сверхэкспрессии генов путем нацеливания на гены в лучшем случае неэффективны и поэтому не используются регулярно. Здесь мы сообщаем о высокоэффективном нацеливании на три гена в плюрипотентных клетках человека с использованием редактирования генома, опосредованного нуклеазой цинковых пальцев (ZFN). Сначала, используя ZFN, специфичные для локуса OCT4 (POU5F1), мы создали репортерные клетки OCT4-eGFP для мониторинга плюрипотентного состояния hESC. Во-вторых, мы вставили трансген в локус AAVS1, чтобы создать надежную систему сверхэкспрессии, индуцируемую лекарственными средствами, в ЭСК. Наконец, мы нацелились на ген PITX3, продемонстрировав, что ZFN можно использовать для создания репортерных клеток путем воздействия на неэкспрессируемые гены в hESC и hiPSC.	{}	реализация полный потенциал эмбриональный стволовой клетка человек чэск индуцировать плюрипотентный стволовой клетка хипск требовать эффективный метод генетический модификация однако метод создание репортёр клон специфичный конкретный тип клетка также надёжный инструмент разрушение восстановление сверхэкспрессия ген путём нацеливание ген хороший случай неэффективный поэтому использоваться регулярно сообщать высокоэффективный нацеливание ген плюрипотентный клетка человек использование редактирование геном опосредовать нуклеаза цинковый палец zfn сначала использовать zfn специфичный локус oct4 pou5f1 создать репортерный клетка oct4 egfp мониторинг плюрипотентный состояние hesc второй вставить трансген локус aavs1 создать надёжный система сверхэкспрессия индуцировать лекарственный средство эск нацелиться ген pitx3 продемонстрировать zfn использовать создание репортерный клетка путём воздействие неэкспрессировать ген hesc hipsc
54440	Эмпирические байесовские модели для анализа микрочипов молекулярного серотипирования	ПРЕДПОСЫЛКИ ИЗОБРЕТЕНИЯ Микрочипы обладают большим потенциалом в качестве платформы для молекулярной диагностики, тестирования клинических образцов на наличие многочисленных биомаркеров в высокомультиплексированных анализах. В этом исследовании, применимом к инфекционным заболеваниям, были использованы данные микрочипа, предназначенного для молекулярного серотипирования Streptococcus pneumoniae, определяющего наличие любого из 91 известного пневмококкового серотипа из экстрактов ДНК. Этот микрочип включал олигонуклеотидные зонды для всех известных генов синтеза капсульных полисахаридов и требовал статистического анализа данных интенсивности микрочипа, чтобы определить, какой серотип или комбинация серотипов присутствовали в образце на основе комбинации обнаруженных генов. РЕЗУЛЬТАТЫ Мы предлагаем эмпирическую байесовскую модель для расчета вероятностей комбинаций серотипов по данным микрочипов. Модель учитывает зависимости между серотипами, индуцированные общими для них генами, а также гомологичными генами, которые хотя и не идентичны, но сходны друг с другом по последовательности. Для серотипов, которые очень похожи по составу капсульных генов, в микроматрицу включаются дополнительные зонды, предоставляющие дополнительную информацию, которая интегрируется в байесовскую модель. Для каждой комбинации серотипов с высокой вероятностью применяется вторая модель, модель байесовских случайных эффектов, для определения относительной распространенности каждого серотипа. ВЫВОДЫ. Чтобы оценить точность предложенного анализа, мы применили наши методы к экспериментальным данным из образцов, содержащих отдельные серотипы, и образцов, содержащих комбинации серотипов с известными уровнями численности. Все известные серотипы S. pneumoniae, кроме двух, которые были протестированы в виде отдельных образцов, могли быть однозначно определены с помощью байесовской модели. Модель также позволила определить наличие комбинаций серотипов в образцах. В комбинации серотипов могут быть обнаружены серотипы с очень низкой распространенностью (до 2% в этом исследовании). Помимо обнаружения присутствия комбинаций серотипов можно получить приблизительную оценку процентной распространенности серотипов в комбинации.	{}	предпосылка изобретение микрочип обладать больший потенциал качество платформа молекулярный диагностика тестирование клинический образец наличие многочисленный биомаркер высокомультиплексировать анализ это исследование применимый инфекционный заболевание использовать дать микрочип предназначить молекулярный серотипирование streptococcus pneumoniae определять наличие любой 91 известный пневмококковый серотип экстракт днк микрочип включать олигонуклеотидный зонд весь известный ген синтез капсульный полисахарид требовать статистический анализ данные интенсивность микрочип определить серотип комбинация серотип присутствовать образец основа комбинация обнаружить ген результат предлагать эмпирический байесовский модель расчёт вероятность комбинация серотип данные микрочип модель учитывать зависимость серотип индуцировать общий ген также гомологичный ген хотя идентичный сходный друг друг последовательность серотип очень похожий состав капсульный ген микроматрица включаться дополнительный зонд предоставлять дополнительный информация интегрироваться байесовский модель каждый комбинация серотип высокий вероятность применяться второй модель модель байесовский случайный эффект определение относительный распространённость каждый серотип вывод оценить точность предложить анализ применить наш метод экспериментальный данные образец содержать отдельный серотип образец содержать комбинация серотип известный уровень численность всё известный серотип s pneumoniae кроме протестировать вид отдельный образец мочь однозначно определить помощь байесовский модель модель также позволить определить наличие комбинация серотип образец комбинация серотип мочь обнаружить серотип очень низкий распространённость 2 это исследование помимо обнаружение присутствие комбинация серотип получить приблизительный оценка процентный распространённость серотип комбинация
70115	Байесовские меры сложности и соответствия модели	Резюме. Мы рассматриваем проблему сравнения сложных иерархических моделей, в которых число параметров четко не определено. Используя аргумент теории информации, мы выводим меру pD для эффективного числа параметров в модели как разницу между апостериорным средним отклонением и отклонением при апостериорных средних интересующих параметров. В общем случае pD приблизительно соответствует следу произведения информации Фишера и апостериорной ковариации, которая в нормальных моделях является следом матрицы «шляпы», проецирующей наблюдения на подобранные значения. Исследуются ее свойства в экспоненциальных семействах. Апостериорное среднее отклонение предлагается как байесовская мера соответствия или адекватности, а вклады отдельных наблюдений в соответствие и сложность могут привести к диагностическому графику остатков отклонения в зависимости от рычагов. Добавление pD к апостериорному среднему отклонению дает критерий информации об отклонении для сравнения моделей, который связан с другими информационными критериями и имеет приблизительное теоретическое обоснование решения. Процедура проиллюстрирована на нескольких примерах, и проведены сравнения с альтернативными байесовскими и классическими предложениями. На протяжении всего подчеркивается, что требуемые величины тривиальны для вычисления в анализе Монте-Карло цепи Маркова.	{}	резюме рассматривать проблема сравнение сложный иерархический модель число параметр чётко определить использовать аргумент теория информация выводить мера pd эффективный число параметр модель разница апостериорный средний отклонение отклонение апостериорный средний интересовать параметр общий случай pd приблизительно соответствовать след произведение информация фишер апостериорный ковариация нормальный модель являться следом матрица шляпа проецировать наблюдение подобрать значение исследуться свойство экспоненциальный семейство апостериорный средний отклонение предлагаться байесовский мера соответствие адекватность вклад отдельный наблюдение соответствие сложность мочь привести диагностический график остаток отклонение зависимость рычаг добавление pd апостериорный средний отклонение давать критерий информация отклонение сравнение модель связать информационный критерий иметь приблизительный теоретический обоснование решение процедура проиллюстрировать несколько пример провести сравнение альтернативный байесовский классический предложение протяжение весь подчёркиваться требовать величина тривиальный вычисление анализ монт карло цепь марков
70490	Упрощение отношений правдоподобия	Отношения правдоподобия являются одним из лучших показателей диагностической точности, хотя они используются редко, поскольку для их интерпретации требуется калькулятор для преобразования между «вероятностью» и «шансами» заболевания. В этой статье описывается более простой метод интерпретации отношений правдоподобия, который позволяет избежать использования калькуляторов, номограмм и преобразований в «шансы» заболевания. Несколько примеров иллюстрируют, как врач может использовать этот метод для уточнения диагностических решений у постели больного.	{}	отношение правдоподобие являться хороший показатель диагностический точность хотя использоваться редко поскольку интерпретация требоваться калькулятор преобразование вероятность шанс заболевание статья описываться простой метод интерпретация отношение правдоподобие позволять избежать использование калькулятор номограмма преобразование шанс заболевание несколько пример иллюстрировать врач мочь использовать метод уточнение диагностический решение постель больной
72159	индукция ранних IFN-индуцируемых генов при отсутствии типа	При распознавании вируса гриппа (Flu) TLR7 плазмацитоидные дендритные клетки (pDC) продуцируют IFN типа I в значительных количествах. Синтетические лиганды TLR7 индуцируют созревание пДК, о чем свидетельствует экспрессия костимулирующих молекул и продукция провоспалительных цитокинов; однако они вызывают лишь небольшое производство ИФН-альфа. Чтобы проанализировать передачу сигналов TLR7 в pDC и то, как индуцируются эти различные профили, мы изучили влияние двух лигандов TLR7 (Flu и CL097) на активацию выделенных из крови pDC и клеточной линии pDC человека GEN2.2. Продукция IFN типа I pDC коррелирует с дифференциальной транслокацией фактора регуляции интерферона 7 (IRF7) в ядро, индуцированной двумя лигандами TLR7. Удивительно, но с обоими активаторами мы, тем не менее, наблюдали быструю экспрессию IFN-индуцируемых генов mxa, cxcl10 и Trail в течение 4 часов после стимуляции. Эта экспрессия, контролируемая фосфорилированием STAT1, не зависела от IFN типа I. Было обнаружено, что активация STAT1 строго зависит от пути PI3K-p38MAPK, демонстрируя новый сигнальный путь, ведущий к быстрой экспрессии генов, индуцируемых IFN, после запуска TLR7. Таким образом, пДК благодаря этой необычной передаче сигналов TLR7 обладают способностью быстро реагировать на вирусную инфекцию на ранних стадиях врожденного иммунного ответа.	{}	распознавание вирус грипп flu tlr7 плазмацитоидный дендритный клетка pdc продуцировать ifn тип i значительный количество синтетический лиганд tlr7 индуцировать созревание пдк свидетельствовать экспрессия костимулировать молекула продукция провоспалительный цитокин однако вызывать лишь небольшой производство ифн альфа проанализировать передача сигнал tlr7 pdc индуцироваться различный профиль изучить влияние лиганд tlr7 flu cl097 активация выделить кровь pdc клеточный линия pdc человек gen2 2 продукция ifn тип i pdc коррелировать дифференциальный транслокация фактор регуляция интерферон 7 irf7 ядро индуцировать лиганд tlr7 удивительно оба активатор менее наблюдать быстрый экспрессия ifn индуцировать ген mxa cxcl10 trail течение 4 час стимуляция экспрессия контролировать фосфорилирование stat1 зависеть ifn тип i обнаружить активация stat1 строго зависеть путь pi3k p38mapk демонстрировать новый сигнальный путь ведущий быстрый экспрессия ген индуцировать ifn запуск tlr7 образ пдк благодаря необычный передача сигнал tlr7 обладать способность быстро реагировать вирусный инфекция ранний стадия врождённый иммунный ответ
79447	При ожирении у человека нарушается функция артериол в висцеральной жировой ткани.	ЦЕЛЬ Целью данного исследования было охарактеризовать взаимосвязь между фенотипом жировой ткани и депо-специфической микрососудистой функцией в жире. МЕТОДЫ И РЕЗУЛЬТАТЫ У 30 пациентов с ожирением (возраст 42±11 лет, индекс массы тела 46±11 кг/м(2)), перенесших бариатрическую операцию, мы интраоперационно собрали висцеральную и подкожную жировую ткань и охарактеризовали депо-специфические фенотипы жировой ткани. Вазомоторную функцию микроциркуляторного русла жировой ткани мы оценивали с помощью видеомикроскопии мелких артериол (75–250 мкм), выделенных из различных жировых отложений. Эндотелий-зависимая, ацетилхолин-опосредованная вазодилатация была серьезно нарушена в висцеральных артериолах по сравнению с подкожным депо (P<0,001 по ANOVA). Неэндотелийзависимые реакции на папаверин и нитропруссид были сходными. Ингибирование эндотелиальной синтазы оксида азота метиловым эфиром N(ω)-нитро-l-аргинина уменьшало подкожную вазодилатацию, но не влияло на сильное притупление реакции висцеральных артериол. Висцеральный жир демонстрировал большую экспрессию провоспалительных, связанных с окислительным стрессом, гипоксией и проангиогенных генов; увеличение популяции активированных макрофагов; и имел более высокую способность к продукции цитокинов ex vivo. ВЫВОДЫ Наши результаты предоставляют клинические доказательства того, что висцеральная микросреда может быть по своей природе токсичной для здоровья артерий, обеспечивая потенциальный механизм, с помощью которого бремя висцерального ожирения связано с атеросклеротическими сосудистыми заболеваниями. Наши результаты также подтверждают развивающуюся концепцию о том, что качество и количество жировой ткани могут играть важную роль в формировании сердечно-сосудистых фенотипов при ожирении у человека.	{}	цель цель данный исследование охарактеризовать взаимосвязь фенотип жировой ткань депо специфический микрососудистый функция жир метод результат 30 пациент ожирение возраст 42 11 год индекс масса тело 46 11 кг м 2 перенести бариатрический операция интраоперационный собрать висцеральный подкожный жировой ткань охарактеризовать депо специфический фенотип жировой ткань вазомоторный функция микроциркуляторный русло жировой ткань оценивать помощь видеомикроскопия мелкий артериол 75 250 мкм выделить различный жировой отложение эндотелий зависимый ацетилхолин опосредовать вазодилатация серьёзно нарушить висцеральный артериол сравнение подкожный депо p 0 001 anova неэндотелийзависимый реакция папаверин нитропруссид сходный ингибирование эндотелиальна синтаз оксид азот метиловый эфир n ω нитро l аргинин уменьшать подкожный вазодилатация влиять сильный притупление реакция висцеральный артериол висцеральный жир демонстрировать больший экспрессия провоспалительный связанный окислительный стресс гипоксия проангиогенный ген увеличение популяция активированный макрофаг иметь высокий способность продукция цитокин ex vivo вывод наш результат предоставлять клинический доказательство висцеральный микросреда мочь свой природа токсичный здоровье артерия обеспечивать потенциальный механизм помощь бремя висцеральный ожирение связать атеросклеротический сосудистый заболевание наш результат также подтверждать развивающийся концепция качество количество жировой ткань мочь играть важный роль формирование сердечно сосудистый фенотип ожирение человек
87758	Толщина общей интимы сонной артерии и индекс лодыжечно-плечевого давления коррелируют с локальной, но не глобальной нагрузкой атеромы: поперечное исследование с использованием магнитно-резонансной ангиографии всего тела	Уровень техники Общая толщина интимы сонной артерии (CIMT) и индекс лодыжечно-плечевого давления (ABPI) используются в качестве суррогатного маркера атеросклероза и, как было показано, коррелируют с жесткостью артерий, однако их корреляция с глобальной атеросклеротической нагрузкой ранее не оценивалась. Мы сравниваем CIMT и ABPI с нагрузкой атеромы, измеренной с помощью магнитно-резонансной ангиографии всего тела (WB-MRA). МЕТОДЫ В исследование были включены 50 пациентов с симптоматическим заболеванием периферических артерий. CIMT измеряли с помощью ультразвука во время выполнения ABPI в состоянии покоя и при нагрузке. WB-MRA выполняли на МРТ-сканере с усилием 1,5 Т с использованием 4 объемных измерений с разделенной дозой внутривенного введения гадотерата гадолиния меглюмина (Dotarem, Guerbet, FR). Данные WB-MRA были разделены на 31 анатомический сегмент артерии, каждый из которых оценивался в соответствии со степенью сужения просвета: 0 = нормально, 1 = <50%, 2 = 50–70%, 3 = 70–99%, 4 = окклюзия сосуда. . Оценки сегментов суммировали и на основании этого рассчитывали стандартизированную оценку атеромы. РЕЗУЛЬТАТЫ Атеросклеротическая нагрузка была высокой, стандартизированный показатель атеромы составлял 39,5±11. Общий CIMT показал положительную корреляцию с оценкой атеромы всего тела (β 0,32, p = 0,045), однако это было связано с его сильной корреляцией с сегментами шеи и грудной клетки (β 0,42 p = 0,01) без корреляции с остальными показателями. тело. ABPI коррелировало с оценкой атеромы всего тела (β -0,39, p = 0,012), что было обусловлено сильной корреляцией с подвздошно-бедренными сосудами при отсутствии корреляции с сосудами грудной клетки или шеи. При множественной линейной регрессии корреляция между CIMT и общим бременем атером не наблюдалась (β 0,13 p = 0,45), в то время как корреляция между ABPI и бременем атером сохранялась (β -0,45 p = 0,005). ЗАКЛЮЧЕНИЕ ABPI, но не CIMT, коррелирует с общим бременем атером, измеренным с помощью магнитно-резонансной ангиографии с контрастированием всего тела в популяции с симптоматическим заболеванием периферических артерий. Однако это в первую очередь связано с сильной корреляцией с тяжестью подвздошно-бедренных атером.	{}	уровень техника общий толщина интим сонный артерия cimt индекс лодыжечный плечевой давление abpi использоваться качество суррогатный маркер атеросклероз показать коррелировать жёсткость артерия однако корреляция глобальный атеросклеротический нагрузка ранее оцениваться сравнивать cimt abpi нагрузка атерома измерить помощь магнитный резонансный ангиография весь тело wb mra метод исследование включить 50 пациент симптоматический заболевание периферический артерия cimt измерять помощь ультразвук время выполнение abpi состояние покой нагрузка wb mra выполнять мрт сканер усилие 1 5 использование 4 объёмный измерение разделить доза внутривенный введение гадотерат гадолиний меглюмина dotarem guerbet fr дать wb mra разделить 31 анатомический сегмент артерия каждый оцениваться соответствие степень сужение просвет 0 нормально 1 50 2 50 70 3 70 99 4 окклюзия сосуд оценка сегмент суммировать основание это рассчитывать стандартизировать оценка атерома результат атеросклеротический нагрузка высокий стандартизировать показатель атерома составлять 39 5 11 общий cimt показать положительный корреляция оценка атерома весь тело β 0 32 p 0 045 однако это связать сильный корреляция сегмент шея грудной клетка β 0 42 p 0 01 корреляция остальной показатель тело abpi коррелировать оценка атерома весь тело β 0 39 p 0 012 обусловить сильный корреляция подвздошный бедренный сосуд отсутствие корреляция сосуд грудной клетка шея множественный линейный регрессия корреляция cimt общий бремя атерома наблюдаться β 0 13 p 0 45 время корреляция abpi бремя атерома сохраняться β 0 45 p 0 005 заключение abpi cimt коррелировать общий бремя атерома измерить помощь магнитный резонансный ангиография контрастирование весь тело популяция симптоматический заболевание периферический артерия однако это первый очередь связать сильный корреляция тяжесть подвздошный бедренный атерома
92308	Утрата ускользающих мутаций во время персистирующей инфекции ВГС во время беременности усиливает репликацию вирусов, передающихся вертикально.	Во всем мире около 1% беременных женщин постоянно инфицированы вирусом гепатита С (ВГС). Передача ВГС от матери ребенку происходит в 3–5% случаев беременности и является причиной большинства новых детских инфекций. Специфичные для ВГС цитотоксические Т-лимфоциты CD8(+) (ЦТЛ) жизненно важны для устранения острых инфекций ВГС, но в 60–80% случаев сохраняющихся инфекций эти клетки функционально истощаются или выбирают мутантные вирусы, которые избегают распознавания Т-клетками. Повышенная репликация ВГС во время беременности предполагает, что механизмы иммунной толерантности матери и плода могут дополнительно ослабить специфические для ВГС ЦТЛ, ограничивая их селективное давление на устойчивые вирусы. Чтобы оценить эту возможность, мы охарактеризовали циркулирующие вирусные квазивиды во время и после последовательных беременностей у двух женщин. Это выявило потерю некоторых мутаций избегания в эпитопах HLA класса I во время беременности, что было связано с появлением более подходящих вирусов. Избирательное давление CTL было восстановлено после родов, и в этот момент мутации побега в этих эпитопах снова стали преобладать в квазивидах, а вирусная нагрузка резко упала. Важно отметить, что вирусы, переданные перинатально, имели повышенную приспособленность из-за реверсии мутаций побега. Наши результаты показывают, что иммунорегуляторные изменения беременности снижают селективное давление CTL на эпитопы класса I HCV, тем самым способствуя вертикальной передаче вирусов с оптимизированной репликативной приспособленностью.	{}	весь мир около 1 беременная женщина постоянно инфицировать вирус гепатит вгс передача вгс мать ребёнок происходить 3 5 случай беременность являться причина большинство новый детский инфекция специфичный вгс цитотоксический лимфоцит cd8 цтл жизненно важный устранение острый инфекция вгс 60 80 случай сохраняться инфекция клетка функционально истощаться выбирать мутантный вирус избегать распознавание клетка повышенный репликация вгс время беременность предполагать механизм иммунный толерантность мать плод мочь дополнительно ослабить специфический вгс цтл ограничивать селективный давление устойчивый вирус оценить возможность охарактеризовать циркулировать вирусный квазивид время последовательный беременность женщина это выявить потеря некоторый мутация избегание эпитоп hla класс i время беременность связать появление подходящий вирус избирательный давление ctl восстановить роды момент мутация побег эпитоп снова стать преобладать квазивид вирусный нагрузка резко упасть важно отметить вирус передать перинатальный иметь повышенный приспособленность реверсия мутация побег наш результат показывать иммунорегуляторный изменение беременность снижать селективный давление ctl эпитоп класс i hcv самый способствовать вертикальный передача вирус оптимизировать репликативный приспособленность
92499	Путь разработки гемопоэтических стволовых клеток.	Гематопоэтические стволовые клетки (ГСК) развиваются во время эмбриогенеза в ходе сложного процесса, который затрагивает множество анатомических участков. Как только предшественники HSC выделены из мезодермы, они должны созреть в функциональные HSC и подвергнуться самообновляющимся делениям для создания пула HSC. Во время этого процесса развивающиеся ЗКП мигрируют через различные эмбриональные ниши, что обеспечивает сигналы для их установления и сохранения их способности к самообновлению. Эти процессы необходимо повторить для создания ЗКП из эмбриональных стволовых клеток. Выяснение взаимодействия между развивающимися HSC и их нишами должно способствовать созданию и распространению HSC in vitro для использования их клинического потенциала.	{}	гематопоэтический стволовой клетка гск развиваться время эмбриогенез ход сложный процесс затрагивать множество анатомический участок предшественник hsc выделить мезодерма должный созреть функциональный hsc подвергнуться самообновляться деление создание пул hsc время это процесс развивающийся зкп мигрировать различный эмбриональный ниша обеспечивать сигнал установление сохранение способность самообновление процесс необходимо повторить создание зкп эмбриональный стволовой клетка выяснение взаимодействие развивающийся hsc ниша должный способствовать создание распространение hsc in vitro использование клинический потенциал
97884	Крестцово-подвздошный сустав при спондилоартропатиях.	Термин спондилоартропатия (СпА) описывает и определяет группу родственных воспалительных заболеваний суставов, которые имеют общие характерные клинические особенности и уникальную связь с молекулой HLA-B27 класса I главного комплекса гистосовместимости. Можно выделить пять подгрупп: анкилозирующий спондилит, реактивный артрит, псориатический артрит, артрит, связанный с воспалительным заболеванием кишечника, и недифференцированный СпА. Крестцово-подвздошные суставы вовлекаются в центральное место в СпА, что наиболее явно и патогномонично при анкилозирующем спондилите, при котором большинство пациентов поражаются на ранних стадиях заболевания. Показано, что, преодолевая некоторые трудности диагностики раннего сакроилеита, динамическая магнитно-резонансная томография позволяет визуализировать как острые, так и хронические изменения крестцово-подвздошных суставов. Недавно более подробно изучено воспаление в крестцово-подвздошных суставах у больных СпА; С помощью иммуногистологии и гибридизации in situ в инфильтратах были обнаружены Т-клетки, макрофаги и различные цитокины. Образцы биопсии были получены под контролем компьютерной томографии, и в том же исследовании было успешно проведено внутрисуставное лечение кортикостероидами. Дальнейшее исследование таких биоптатов показало отсутствие ДНК реактивных бактерий, ассоциированных с артритом. Патогенез СпА и причина тропизма крестцово-подвздошных суставов до сих пор неясны. Природа связи генетического фона СпА с первоначальными запускающими бактериальными инфекциями еще предстоит установить. При хронических заболеваниях аутоиммунные механизмы могут быть более важными.	{}	термин спондилоартропатия спа описывать определять группа родственный воспалительный заболевание сустав иметь общий характерный клинический особенность уникальный связь молекула hla b27 класс i главное комплекс гистосовместимость выделить пять подгруппа анкилозировать спондилит реактивный артрит псориатический артрит артрит связанный воспалительный заболевание кишечник недифференцированный спа крестцовый подвздошный сустав вовлекаться центральный место спа наиболее явно патогномоничный анкилозировать спондилит большинство пациент поражаться ранний стадия заболевание показать преодолевать некоторый трудность диагностика ранний сакроилеит динамический магнитный резонансный томография позволять визуализировать острый хронический изменение крестцовый подвздошный сустав недавно подробно изучить воспаление крестцовый подвздошный сустав больной спа помощь иммуногистология гибридизация in situ инфильтрат обнаружить клетка макрофаг различный цитокина образец биопсия получить контроль компьютерный томография исследование успешно провести внутрисуставный лечение кортикостероид дальнейший исследование биоптат показать отсутствие днк реактивный бактерия ассоциированный артрит патогенез спа причина тропизм крестцовый подвздошный сустав сей пора неясный природа связь генетический фон спа первоначальный запускать бактериальный инфекция ещё предстоять установить хронический заболевание аутоиммунный механизм мочь важный
102662	Быстрый метод выделения геномной ДНК хлопчатника (Gossypium spp.), подходящий для ПДРФ или ПЦР-анализа.	Извлечение высококачественной геномной ДНК из видов Gossypium (хлопчатника) затруднено из-за высокого содержания полисахаридов, окисляемых хинонов и других мешающих веществ. Мы описываем процедуру, которая последовательно позволяет изолировать геномную ДНК хлопка удовлетворительного размера и качества для анализа ПДРФ и ПЦР, а также для большинства рутинных приложений клонирования. На протяжении всей процедуры используются несколько антиоксидантов, фенолсвязывающие реагенты и ингибиторы фенолоксидазы, а большинство полисахаридов удаляются на ранних стадиях процедуры путем выделения ядер.	{}	извлечение высококачественный геномный днк вид gossypium хлопчатник затруднить высокий содержание полисахарид окислять хинон мешать вещество описывать процедура последовательно позволять изолировать геномный днк хлопок удовлетворительный размер качество анализ пдрф пцр также большинство рутинный приложение клонирование протяжение весь процедура использоваться несколько антиоксидант фенолсвязывать реагент ингибитор фенолоксидаза большинство полисахарид удаляться ранний стадия процедура путём выделение ядро
103007	Базовые кривые поперечного роста и веса для Великобритании, 1990 г.	Текущие эталонные кривые роста и веса для Великобритании были впервые опубликованы в 1966 году и с тех пор используются, несмотря на растущую обеспокоенность тем, что они могут неадекватно описывать рост современных британских детей. Используя текущие данные из семи источников, в 1990 году были рассчитаны новые эталонные кривые для детей в возрасте от рождения до 20 лет. Подавляющее большинство данных являются репрезентативными на национальном уровне. В анализе использовался метод Коула LMS, он позволил получить эффективные оценки обычных центилей и хорошо согласуется с данными. Эти кривые отличаются от используемых в настоящее время кривых для ключевых возрастов как по росту, так и по весу. Ввиду обеспокоенности, выраженной по поводу текущих кривых и различий между ними и новыми кривыми, предлагается принять представленные здесь кривые в качестве новых эталонных кривых Великобритании.	{}	текущий эталонный кривая рост вес великобритания впервые опубликовать 1966 год пора использоваться несмотря расти обеспокоенность мочь неадекватно описывать рост современный британский ребёнок использовать текущий дать семь источник 1990 год рассчитать новый эталонный кривая ребёнок возраст рождение 20 год подавлять большинство данные являться репрезентативный национальный уровень анализ использоваться метод коул lms позволить получить эффективный оценка обычный центилей согласоваться данные кривая отличаться использовать настоящий время кривая ключевой возраст рост вес ввиду обеспокоенность выраженный повод текущий кривая различие новый кривая предлагаться принять представить кривая качество новый эталонный кривая великобритания
104130	Шов обеспечивает нишу для мезенхимальных стволовых клеток черепно-лицевых костей.	Костная ткань подвергается постоянному обновлению, поддерживаемому стволовыми клетками. Недавние исследования показали, что периваскулярные мезенхимальные стволовые клетки (МСК) способствуют обновлению длинных костей. Черепно-лицевые кости — это плоские кости, полученные из эмбрионального происхождения, отличного от длинных костей. Идентичность и регулирующая ниша МСК черепно-лицевой кости остаются неизвестными. Здесь мы идентифицируем клетки Gli1+ в шовной мезенхиме как основную популяцию МСК черепно-лицевых костей. Они не связаны с сосудистой сетью, дают начало всем черепно-лицевым костям у взрослых и активируются во время восстановления травм. Клетки Gli1+ являются типичными МСК in vitro. Удаление клеток Gli1+ приводит к краниосиностозу и остановке роста черепа, что указывает на то, что эти клетки являются незаменимой популяцией стволовых клеток. У мышей Twist1(+/-) с краниосиностозом наблюдается снижение количества Gli1+ MSC в швах, что позволяет предположить, что краниосиностоз может быть результатом уменьшения количества стволовых клеток шовного материала. Наше исследование показывает, что черепно-лицевые швы обеспечивают уникальную нишу для МСК для гомеостаза и восстановления черепно-лицевых костей.	{}	костный ткань подвергаться постоянный обновление поддерживать стволовой клетка недавний исследование показать периваскулярный мезенхимальный стволовой клетка мск способствовать обновление длинный кость черепный лицевой кость это плоский кость получить эмбриональный происхождение отличный длинный кость идентичность регулировать ниша мск черепный лицевой кость оставаться неизвестный идентифицировать клетка gli1 шовный мезенхима основный популяция мск черепный лицевой кость связать сосудистый сеть давать начало весь черепный лицевой кость взрослый активироваться время восстановление травма клетка gli1 являться типичный мск in vitro удаление клетка gli1 приводить краниосиностоз остановка рост череп указывать клетка являться незаменимый популяция стволовой клетка мышь twist1 краниосиностоз наблюдаться снижение количество gli1 msc швах позволять предположить краниосиностоз мочь результат уменьшение количество стволовой клетка шовный материал наш исследование показывать черепный лицевой шов обеспечивать уникальный ниша мск гомеостаз восстановление черепный лицевой кость
106301	Клетки нервного гребня сердца способствуют формированию спящих мультипотентных стволовых клеток в сердце млекопитающих.	Фракция клеток популяции сердечной стороны грызунов образовывала клональные сфероиды в бессывороточной среде, которые экспрессировали нестин, Musashi-1 и ген-транспортер множественной лекарственной устойчивости 1, маркеры недифференцированных нейральных клеток-предшественников. Эти маркеры были потеряны после дифференцировки и были заменены экспрессией белков, специфичных для нейронов, глии, гладкомышечных клеток или кардиомиоцитов. Клетки, полученные из кардиосферы, трансплантированные куриным эмбрионам, мигрировали в артериальный ствол и выносящий тракт сердца и вносили вклад в ганглии дорсальных корешков, спинномозговые нервы и гладкомышечные клетки аорты. Исследования линий с использованием двойных трансгенных мышей, кодирующих белок 0-Cre/Floxed-EGFP, выявили недифференцированные и дифференцированные клетки, происходящие из нервного гребня, в миокарде плода. Недифференцированные клетки экспрессировали GATA-связывающий белок 4 и нестин, но не актинин, тогда как дифференцированные клетки были идентифицированы как кардиомиоциты. Эти результаты позволяют предположить, что клетки, происходящие из нервного гребня сердца, мигрируют в сердце, остаются там в виде спящих мультипотентных стволовых клеток и при правильных условиях дифференцируются в кардиомиоциты и типичные клетки, происходящие из нервного гребня, включая нейроны, глию и гладкие мышцы.	{}	фракция клетка популяция сердечный сторона грызун образовывать клональный сфероид бессывороточный среда экспрессировать нестина musashi 1 ген транспортёр множественный лекарственный устойчивость 1 маркер недифференцированный нейральный клетка предшественник маркер потерять дифференцировка заменить экспрессия белок специфичный нейрон глия гладкомышечный клетка кардиомиоцит клетка получить кардиосфера трансплантировать куриный эмбрион мигрировать артериальный ствол выносить тракт сердце вносить вклад ганглий дорсальный корешковый спинномозговой нерв гладкомышечный клетка аорта исследование линия использование двойной трансгенный мышь кодировать белок 0 cre floxed egfp выявить недифференцированный дифференцированный клетка происходить нервный гребень миокард плод недифференцированный клетка экспрессировать gata связывать белок 4 нестина актинина дифференцированный клетка идентифицировать кардиомиоцит результат позволять предположить клетка происходить нервный гребень сердце мигрировать сердце оставаться вид спать мультипотентный стволовой клетка правильный условие дифференцироваться кардиомиоцит типичный клетка происходить нервный гребень включая нейрон глия гладкий мышца
116792	Мишень сигнального пути рапамицина у млекопитающих опосредует эпилептогенез в модели височной эпилепсии.	Понимание молекулярных механизмов, опосредующих эпилептогенез, имеет решающее значение для разработки более эффективных методов лечения эпилепсии. Недавно мы обнаружили, что мишень сигнального пути рапамицина (mTOR) у млекопитающих участвует в эпилептогенезе, а ингибиторы mTOR предотвращают эпилепсию на мышиной модели комплекса туберозного склероза. Здесь мы исследовали потенциальную роль mTOR в крысиной модели височной эпилепсии, инициированной эпилептическим статусом. Острые судороги, вызванные каинатом, приводили к двухфазной активации пути mTOR, о чем свидетельствует увеличение экспрессии фосфо-S6 (P-S6). Первоначальное повышение экспрессии P-S6 началось примерно через 1 час после начала приступа, достигло максимума через 3-6 часов и вернулось к исходному уровню через 24 часа как в гиппокампе, так и в неокортексе, что отражает широко распространенную стимуляцию передачи сигналов mTOR острой судорожной активностью. После разрешения эпилептического статуса второе повышение P-S6 наблюдалось только в гиппокампе, которое начиналось на 3-й день, достигало пика на 5-10-й день и сохранялось в течение нескольких недель после инъекции каината, что коррелирует с развитием хронического эпилептогенеза в гиппокампе. Ингибитор mTOR рапамицин, введенный перед каинатом, блокировал как острую, так и хроническую фазы вызванной судорогами активации mTOR и уменьшал каинат-индуцированную гибель нейронов, нейрогенез, прорастание мшистых волокон и развитие спонтанной эпилепсии. Позднее лечение рапамицином, после прекращения эпилептического статуса, блокировало хроническую фазу активации mTOR и уменьшало прорастание мшистых волокон и эпилепсию, но не нейрогенез или гибель нейронов. Эти данные указывают на то, что передача сигналов mTOR опосредует механизмы эпилептогенеза в модели каинатных крыс и что ингибиторы mTOR обладают потенциальными антиэпилептогенными эффектами в этой модели.	{}	понимание молекулярный механизм опосредовать эпилептогенез иметь решающий значение разработка эффективный метод лечение эпилепсия недавно обнаружить мишень сигнальный путь рапамицин mtor млекопитающее участвовать эпилептогенез ингибитор mtor предотвращать эпилепсия мышиный модель комплекс туберозный склероз исследовать потенциальный роль mtor крысиный модель височный эпилепсия инициировать эпилептический статус острый судорога вызвать каинатом приводить двухфазный активация путь mtor свидетельствовать увеличение экспрессия фосфо s6 p s6 первоначальный повышение экспрессия p s6 начаться примерно 1 час начало приступ достигнуть максимум 3 6 час вернуться исходный уровень 24 час гиппокамп неокортекс отражать широко распространить стимуляция передача сигнал mtor острый судорожный активность разрешение эпилептический статус второе повышение p s6 наблюдаться гиппокамп начинаться 3 й день достигать пик 5 10 й день сохраняться течение несколько неделя инъекция каината коррелировать развитие хронический эпилептогенез гиппокамп ингибитор mtor рапамицин ввести каинатом блокировать острый хронический фаза вызвать судорога активация mtor уменьшать каинат индуцировать гибель нейрон нейрогенез прорастание мшистый волокно развитие спонтанный эпилепсия поздний лечение рапамицин прекращение эпилептический статус блокировать хронический фаза активация mtor уменьшать прорастание мшистый волокно эпилепсия нейрогенез гибель нейрон дать указывать передача сигнал mtor опосредовать механизм эпилептогенез модель каинатный крыса ингибитор mtor обладать потенциальный антиэпилептогенный эффект модель
118568	Острое введение рекомбинантного ангиопоэтина-1 облегчает синдром полиорганной дисфункции и улучшает выживаемость при сепсисе мышей.	ВВЕДЕНИЕ Эндотелиальная активация, приводящая к разрушению сосудистого барьера, играет важную роль в патофизиологии синдрома полиорганной недостаточности (СПОН) при сепсисе. Все больше данных свидетельствуют о том, что функция сосудистого защитного фактора ангиопоэтина-1 (Ang-1), лиганда эндотелиально-специфического рецептора Tie2, ингибируется его антагонистом ангиопоэтином-2 (Ang-2) во время сепсиса. Чтобы обратить вспять эффекты вызванного сепсисом подавления Ang-1 и повышения Ang-2, мы стремились исследовать, защищает ли внутривенная инъекция рекомбинантного человеческого (rh) Ang-1 от СПОН при сепсисе у мышей. МЕТОДЫ Полимикробный абдоминальный сепсис был вызван перевязкой и пункцией слепой кишки (CLP). Мышам вводили либо 1 мкг внутривенного rhAng-1, либо контрольный буфер сразу после индукции CLP и каждые 8 ч после этого. Ложнооперированные животные служили в качестве соответствующего по времени контроля. РЕЗУЛЬТАТЫ По сравнению с контрольной группой, получавшей буфер, септические мыши, получавшие rhAng-1, показали значительные улучшения в нескольких гематологических и биохимических показателях MODS. Более того, rhAng-1 стабилизировал функцию эндотелиального барьера, о чем свидетельствует ингибирование утечки белка из капилляров легких в альвеолярный отсек. Гистологический анализ показал, что лечение rhAng-1 ослабило инфильтрацию лейкоцитов в легких и почках септических мышей, вероятно, из-за снижения экспрессии молекул адгезии эндотелия у мышей, получавших rhAng-1. Наконец, защитные эффекты лечения rhAng-1 были отражены в улучшении времени выживания в летальной модели CLP. ВЫВОДЫ В клинически значимой модели сепсиса у мышей внутривенное лечение rhAng-1 само по себе достаточно для значительного улучшения различных дисфункций органов, связанных с сепсисом, и времени выживания, скорее всего, за счет сохранения функции эндотелиального барьера. Необходимы дальнейшие исследования, чтобы проложить путь для клинического применения этой концепции терапии.	{}	введение эндотелиальный активация приводить разрушение сосудистый барьер играть важный роль патофизиология синдром полиорганный недостаточность спон сепсис всё большой данные свидетельствовать функция сосудистый защитный фактор ангиопоэтина 1 ang 1 лиганд эндотелиальный специфический рецептор tie2 ингибироваться антагонист ангиопоэтин 2 ang 2 время сепсис обратить вспять эффект вызвать сепсис подавление ang 1 повышение ang 2 стремиться исследовать защищать внутривенный инъекция рекомбинантный человеческий rh ang 1 спон сепсис мышь метод полимикробный абдоминальный сепсис вызвать перевязка пункция слепой кишка clp мышь вводить либо 1 мкг внутривенный rhang 1 либо контрольный буфер сразу индукция clp каждый 8 ч это ложнооперировать животное служить качество соответствующий время контроль результат сравнение контрольный группа получать буфер септический мышь получать rhang 1 показать значительный улучшение несколько гематологический биохимический показатель mods rhang 1 стабилизировать функция эндотелиальный барьер свидетельствовать ингибирование утечка белок капилляр лёгкий альвеолярный отсек гистологический анализ показать лечение rhang 1 ослабить инфильтрация лейкоцит лёгкий почка септический мышь вероятно снижение экспрессия молекула адгезия эндотелий мышь получать rhang 1 защитный эффект лечение rhang 1 отразить улучшение время выживание летальный модель clp вывод клинически значимый модель сепсис мышь внутривенный лечение rhang 1 достаточно значительный улучшение различный дисфункция орган связанный сепсис время выживание скорее весь счёт сохранение функция эндотелиальный барьер необходимый дальнейший исследование проложить путь клинический применение концепция терапия
120626	Механизмы, связывающие ожирение с резистентностью к инсулину и диабетом 2 типа	Ожирение связано с повышенным риском развития инсулинорезистентности и диабета 2 типа. У людей с ожирением жировая ткань высвобождает повышенное количество неэтерифицированных жирных кислот, глицерина, гормонов, провоспалительных цитокинов и других факторов, которые участвуют в развитии резистентности к инсулину. Когда резистентность к инсулину сопровождается дисфункцией β-клеток островков поджелудочной железы — клеток, которые выделяют инсулин, — это приводит к неспособности контролировать уровень глюкозы в крови. Таким образом, нарушения функции β-клеток имеют решающее значение для определения риска и развития диабета 2 типа. Эти знания способствуют изучению молекулярной и генетической основы заболевания и новых подходов к его лечению и профилактике.	{}	ожирение связать повышенный риск развитие инсулинорезистентность диабет 2 тип человек ожирение жировой ткань высвобождать повышенный количество неэтерифицировать жирный кислота глицерин гормон провоспалительный цитокин фактор участвовать развитие резистентность инсулин резистентность инсулин сопровождаться дисфункция β клетка островок поджелудочный железа клетка выделять инсулин это приводить неспособность контролировать уровень глюкоза кровь образ нарушение функция β клетка иметь решающий значение определение риск развитие диабет 2 тип знание способствовать изучение молекулярный генетический основа заболевание новый подход лечение профилактика
123859	Отслеживание судьбы гломерулярных эпителиальных клеток in vivo с использованием серийной многофотонной визуализации на новых моделях мышей с флуоресцентными метками линий.	Подоциты имеют решающее значение для поддержания здоровья клубочкового фильтра; однако их было трудно изучить на интактной почке из-за технических ограничений. Здесь мы сообщаем о разработке серийной многофотонной микроскопии (МПМ) одних и тех же клубочков в течение нескольких дней для визуализации подвижности подоцитов и париетальных эпителиальных клеток (ПЭК) in vivo. У мышей Podocin-GFP подоциты образовывали спорадические многоклеточные кластеры после одностороннего перевязки мочеточника и мигрировали в париетальную капсулу Боумена. Отслеживание одиночных клеток у мышей подоцин-конфетти с клеточно-специфической экспрессией CFP, GFP, YFP или RFP выявило одновременную миграцию множественных подоцитов. У мышей с фосфоенолпируваткарбоксикиназой (PEPCK)-GFP серийный MPM обнаружил миграцию PEC-подоцитов и соединения нанотрубочек. Наши данные подтверждают скорее динамичный, чем статический характер клубочковой среды и клеточного состава. Будущее применение этого нового подхода должно улучшить наше понимание механизмов повреждения и регенерации клубочков.	{}	подоцит иметь решающий значение поддержание здоровье клубочковый фильтр однако трудно изучить интактный почка технический ограничение сообщать разработка серийный многофотонный микроскопия мпм клубочек течение несколько день визуализация подвижность подоцит париетальный эпителиальный клетка пэк in vivo мышь podocin gfp подоцит образовывать спорадический многоклеточный кластер односторонний перевязка мочеточник мигрировать париетальный капсула боумена отслеживание одиночный клетка мышь подоцин конфетти клеточный специфический экспрессия cfp gfp yfp rfp выявить одновременный миграция множественный подоцит мышь фосфоенолпируваткарбоксикиназа pepck gfp серийный mpm обнаружить миграция pec подоцит соединение нанотрубочка наш дать подтверждать скорее динамичный статический характер клубочковый среда клеточный состав будущее применение это новый подход должный улучшить наш понимание механизм повреждение регенерация клубочек
140874	Связывание CTCF в контрольной области импринтинга H19 опосредует наследуемую по материнской линии конформацию хроматина более высокого порядка, ограничивая доступ энхансера к Igf2.	Считается, что область контроля импринтинга H19 (ICR) управляет молчанием унаследованного от матери аллеля Igf2 через CTCF-зависимый изолятор хроматина. Было показано, что ICR физически взаимодействует с сайленсером в Igf2, дифференциально-метилированной областью (DMR)1, но роль CTCF в этой петле хроматина и ограничивает ли он физический доступ дистальных энхансеров к Igf2 неизвестна. Мы провели систематический анализ конформационного захвата хромосом в области Igf2/H19 на протяжении >160 т.п.н., идентифицируя последовательности, которые физически взаимодействуют с дистальными энхансерами и ICR. Мы обнаружили, что на отцовской хромосоме энхансеры взаимодействуют с промоторами Igf2, но на материнской аллели этому препятствует связывание CTCF внутри ICR H19. Связывание CTCF в материнском ICR регулирует его взаимодействие с областью прикрепления матрикса (MAR)3 и DMR1 на Igf2, таким образом образуя плотную петлю вокруг локуса материнского Igf2, что может способствовать его молчанию. Мутация сайтов связывания CTCF в ICR H19 приводит к потере связывания CTCF и метилированию de novo целевого сайта CTCF в DMR1 Igf2, показывая, что CTCF может координировать региональные эпигенетические метки. Этот систематический анализ конформации хромосом импринтингового кластера показывает, что CTCF играет критическую роль в эпигенетической регуляции структуры хроматина более высокого порядка и молчании генов на значительных расстояниях в геноме.	{}	считаться область контроль импринтинг h19 icr управлять молчание унаследовать мать аллёля igf2 ctcf зависимый изолятор хроматин показать icr физически взаимодействовать сайленсер igf2 дифференциальный метилировать область dmr 1 роль ctcf петля хроматин ограничивать физический доступ дистальный энхансер igf2 неизвестный провести систематический анализ конформационный захват хромосома область igf2 h19 протяжение 160 п н идентифицировать последовательность физически взаимодействовать дистальный энхансер icr обнаружить отцовский хромосома энхансер взаимодействовать промотор igf2 материнский аллель препятствовать связывание ctcf внутри icr h19 связывание ctcf материнский icr регулировать взаимодействие область прикрепление матрикс mar 3 dmr1 igf2 образ образовать плотный петля вокруг локус материнский igf2 мочь способствовать молчание мутация сайт связывание ctcf icr h19 приводить потеря связывание ctcf метилирование de novo целевой сайт ctcf dmr1 igf2 показывать ctcf мочь координировать региональный эпигенетический метка систематический анализ конформация хромосома импринтинговый кластер показывать ctcf играть критический роль эпигенетический регуляция структура хроматин высокий порядок молчание ген значительный расстояние геном
143251	Сборка de novo ядерного субкомпартмента PML происходит несколькими путями и индуцирует удлинение теломер.	Теломераза-отрицательные опухолевые клетки используют альтернативный путь удлинения теломер (ALT), который включает рекомбинацию и восстановление ДНК для поддержания их пролиферативного потенциала. Цитологическим признаком этого процесса является накопление ядерного белка промиелоцитарного лейкоза (PML) на теломерной ДНК для формирования тел PML, ассоциированных с ALT (APB). Здесь было исследовано образование de novo теломерного ядерного субкомпартмента PML путем привлечения компонентов белка APB. Мы показываем, что функционально различные белки были способны инициировать образование настоящих APB с высокой эффективностью в самоорганизующейся и самораспространяющейся манере. Они включали: (1) PML и Sp100 как составляющие компоненты ядерных телец PML, (2) факторы связывания теломерных повторов 1 и 2 (TRF1 и TRF2 соответственно), (3) белок репарации ДНК NBS1 и (4) лигаза SUMO E3 MMS21, а также изолированный домен SUMO1 через взаимодействующий домен другого белкового фактора. Напротив, факторы репарации Rad9, Rad17 и Rad51 были менее эффективны в зарождении APB, но были привлечены к предварительно собранным APB. Искусственно созданные APB индуцировали теломерное удлинение через механизм репарации ДНК, как следует из их колокализации с сайтами нерепликативного синтеза ДНК и фосфорилирования гистона H2A.X, а также увеличения длины теломерного повтора. Эти активности отсутствовали после привлечения факторов APB в перицентрический локус и устанавливают APB как функциональные промежуточные звенья пути ALT.	{}	теломераза отрицательный опухолевый клетка использовать альтернативный путь удлинение теломера alt включать рекомбинация восстановление днк поддержание пролиферативный потенциал цитологический признак это процесс являться накопление ядерный белок промиелоцитарный лейкоз pml теломерный днк формирование тело pml ассоциированный alt apb исследовать образование de novo теломерный ядерный субкомпартмент pml путём привлечение компонент белок apb показывать функционально различный белка способный инициировать образование настоящий apb высокий эффективность самоорганизоваться самораспространяться манера включать 1 pml sp100 составлять компонент ядерный телец pml 2 фактор связывание теломерный повтор 1 2 trf1 trf2 соответственно 3 белок репарация днк nbs1 4 лигаза sumo e3 mms21 также изолировать домен sumo1 взаимодействовать домен белковый фактор напротив фактор репарация rad9 rad17 rad51 менее эффективный зарождение apb привлечь предварительно собранный apb искусственно создать apb индуцировать теломерный удлинение механизм репарация днк следовать колокализация сайт нерепликативный синтез днк фосфорилирование гистон h2a x также увеличение длина теломерный повтор активность отсутствовать привлечение фактор apb перицентрический локус устанавливать apb функциональный промежуточный звено путь alt
152245	Влияние терминационного кодона опала, предшествующего последовательности гена nsP4 в геноме вируса О'Ньонг-Ньонг, на инфекционность Anopheles gambiae.	Геномная РНК альфавируса кодирует четыре различных неструктурных белка: nsP1, nsP2, nsP3 и nsP4. Полипротеин P123 образуется, когда трансляция заканчивается на опаловом кодоне терминации между nsP3 и nsP4. Полипротеин P1234 образуется, когда происходит трансляционное считывание или когда терминирующий кодон опала заменяется смысловым кодоном в геноме альфавируса. Эволюционное давление, по-видимому, сохранило геномные последовательности, кодирующие как стоп-кодон (опал), так и открытую рамку считывания (аргинин), как общую особенность генома вируса О'Нён-Нён (ONNV), что указывает на то, что в какой-то момент оба необходимы. Альтернативная репликация ONNV как у позвоночных, так и у беспозвоночных-хозяев может определять преобладание определенного кодона в этом локусе у квазивидов вируса. Однако ни одно систематическое исследование ранее не проверяло эту гипотезу на целых животных. Здесь мы сообщаем о результатах первого исследования по изучению на естественном комаре-хозяине функционального значения опалового стоп-кодона в геноме альфавируса. Мы использовали полноразмерный клон кДНК ONNV для создания серии мутантов, в которых аргинин между nsP3 и nsP4 был заменен опаловым, охристым или янтарным стоп-кодоном. Наличие опалового стоп-кодона перед nsP4 почти вдвое (75,5%) увеличивало инфекционность ONNV по сравнению с вирусом, имеющим кодон аминокислоты аргинин в соответствующем положении (39,8%). Хотя частота распространения вируса опала из средней кишки комара существенно не отличалась от частоты распространения вируса аргинина на 8-й и 10-й дни, у комаров, инфицированных вирусом опала, распространение началось раньше. Хотя явное преимущество в приспособленности дает ONNV наличие опалового кодона между nsP3 и nsP4 у Anopheles gambiae, анализ последовательности РНК ONNV, выделенной из тел и голов комаров, показал, что использование кодона в этом положении соответствует использованию вируса, введенного в кровяная мука. Эти результаты позволяют предположить, что, хотя происходит отбор вариантов ONNV, мутация de novo в положении между nsP3 и nsP4 у комаров не возникает легко. В совокупности эти результаты позволяют предположить, что основное преимущество приспособленности, обеспечиваемое ONNV за счет присутствия опалового кодона между nsP3 и nsP4, связано с инфекционностью комаров.	{}	геномный рнк альфавирус кодировать четыре различный неструктурный белок nsp1 nsp2 nsp3 nsp4 полипротеин p123 образоваться трансляция заканчиваться опаловый кодон терминация nsp3 nsp4 полипротеин p1234 образоваться происходить трансляционный считывание терминировать кодон опасть заменяться смысловой кодон геном альфавирус эволюционный давление видимый сохранить геномный последовательность кодировать стоп кодон опасть открытый рамка считывание аргинин общий особенность геном вирус нён нён onnv указывать момент оба необходимый альтернативный репликация onnv позвоночный беспозвоночный хозяин мочь определять преобладание определённый кодон это локус квазивид вирус однако систематический исследование ранее проверять гипотеза целый животное сообщать результат первый исследование изучение естественный комар хозяин функциональный значение опаловый стоп кодон геном альфавирус использовать полноразмерный клон кднк onnv создание серия мутант аргинин nsp3 nsp4 заменить опаловый охристый янтарный стоп кодон наличие опаловый стоп кодон nsp4 вдвое 75 5 увеличивать инфекционность onnv сравнение вирус иметь кодон аминокислота аргинин соответствовать положение 39 8 хотя частота распространение вирус опасть средний кишка комар существенно отличаться частота распространение вирус аргинин 8 й 10 й день комар инфицировать вирус опасть распространение начаться ранний хотя явный преимущество приспособленность давать onnv наличие опаловый кодон nsp3 nsp4 anopheles gambiae анализ последовательность рнк onnv выделить тело гол комар показать использование кодон это положение соответствовать использование вирус ввести кровяной мука результат позволять предположить хотя происходить отбор вариант onnv мутация de novo положение nsp3 nsp4 комар возникать легко совокупность результат позволять предположить основный преимущество приспособленность обеспечивать onnv счёт присутствие опаловый кодон nsp3 nsp4 связать инфекционность комар
153744	Снижение уровня регуляции микроРНК хозяина с помощью некодирующей РНК Herpesvirus saimiri.	Т-клетки, трансформированные Herpesvirus saimiri, экспрессируют семь вирусных U-богатых некодирующих РНК неизвестной функции, называемых HSUR. Мы отметили, что консервативные последовательности в HSUR 1 и 2 представляют собой потенциальные сайты связывания для трех микроРНК клетки-хозяина (миРНК). Эксперименты по коиммунопреципитации подтвердили, что HSUR 1 и 2 взаимодействуют с предсказанными миРНК в трансформированных вирусом Т-клетках. Обилие одной из этих микроРНК, миР-27, резко снижается в трансформированных клетках, что приводит к соответствующему влиянию на экспрессию генов-мишеней миР-27. Временный нокдаун и эктопическая экспрессия HSUR 1 демонстрируют, что он управляет деградацией зрелой миР-27 последовательно-специфичным и зависимым от связывания образом. Эта вирусная стратегия иллюстрирует использование нкРНК для манипулирования экспрессией генов в клетке-хозяине через путь микроРНК.	{}	клетка трансформировать herpesvirus saimiri экспрессировать семь вирусный u богатый некодировать рнк неизвестный функция называть hsur отметить консервативный последовательность hsur 1 2 представлять потенциальный сайт связывание микрорнк клетка хозяин мирнк эксперимент коиммунопреципитация подтвердить hsur 1 2 взаимодействовать предсказать мирнк трансформировать вирус клетка обилие микрорнк мир 27 резко снижаться трансформировать клетка приводить соответствовать влияние экспрессия ген мишень мир 27 временный нокдаун эктопический экспрессия hsur 1 демонстрировать управлять деградация зрелый мир 27 последовательно специфичный зависимый связывание образ вирусный стратегия иллюстрировать использование нкрнк манипулирование экспрессия ген клетка хозяин путь микрорнк
159469	HTRF: технология, созданная для открытия лекарств – обзор теоретических аспектов и недавних применений	HTRF (гомогенная флуоресценция с временным разрешением) — это наиболее часто используемая универсальная технология анализа для измерения аналитов в гомогенном формате, которая является идеальной платформой, используемой для целевых исследований лекарственных средств при высокопроизводительном скрининге (HTS). Эта технология сочетает в себе технологию передачи энергии флуоресцентного резонанса (FRET) с измерением с временным разрешением (TR). В анализах TR-FRET сигнал генерируется посредством флуоресцентного резонансного переноса энергии между донором и молекулой-акцептором, когда они находятся в непосредственной близости друг от друга. Взаимодействие буфера и среды значительно снижается за счет обнаружения с двумя длинами волн, а конечный сигнал пропорционален степени образования продукта. Анализ HTRF обычно чувствителен и надежен, его можно миниатюризировать до форматов планшетов с 384 и 1536 лунками. Эта технология анализа применялась ко многим анализам на основе антител, включая передачу сигналов GPCR (цАМФ и IP-One), киназы, цитокины и биомаркеры, биопроцессы (выработка антител и белков), а также анализы белков-белков, белков-пептидов и Взаимодействие белок-ДНК/РНК. С момента своего появления в мире скрининга наркотиков более десяти лет назад исследователи использовали HTRF для ускорения изучения GPCR, киназ, новых биомаркеров, межбелковых взаимодействий и других объектов, представляющих интерес. HTRF также использовался в качестве альтернативного метода мониторинга биопроцессов. Технология HTRF первого поколения, которая использует криптат европия в качестве донора флуоресценции для мониторинга реакций между биомолекулами, была расширена в 2008 году за счет внедрения донора второго поколения, криптата тербия (Tb), улучшающего эффективность скрининга. Криптат тербия обладает другими фотофизическими свойствами по сравнению с европием, включая повышенный квантовый выход и более высокий молярный коэффициент экстинкции. Помимо совместимости с теми же акцепторными флуорофорами, что и европий, он может служить донорным флуорофором для флуорофоров, излучающих зеленый цвет, поскольку имеет несколько пиков эмиссии, включая один при 490 нм. Более того, все анализы Terbium HTRF можно считывать на тех же HTRF-совместимых приборах, что и анализы Europium HTRF. В целом, HTRF — это высокочувствительная и надежная технология обнаружения молекулярных взаимодействий in vitro, которая широко используется на этапах первичного и вторичного скрининга при разработке лекарств. В этом обзоре рассматриваются общие принципы HTRF и его текущие применения в разработке лекарств.	{}	htrf гомогенный флуоресценция временной разрешение это наиболее часто использовать универсальный технология анализ измерение аналит гомогенный формат являться идеальный платформа использовать целевой исследование лекарственный средство высокопроизводительный скрининг hts технология сочетать технология передача энергия флуоресцентный резонанс fret измерение временной разрешение tr анализ tr fret сигнал генерироваться посредством флуоресцентный резонансный перенос энергия донор молекула акцептор находиться непосредственный близость друг друг взаимодействие буфер среда значительно снижаться счёт обнаружение длина волна конечный сигнал пропорциональный степень образование продукт анализ htrf обычно чувствительный надёжный миниатюризировать формат планшет 384 1536 лунка технология анализ применяться многий анализ основа антитело включая передача сигнал gpcr цамфа ip one киназ цитокина биомаркер биопроцесс выработка антитело белок также анализ белок белок белок пептид взаимодействие белок днк рнк момент свой появление мир скрининг наркотик десять год назад исследователь использовать htrf ускорение изучение gpcr киназа новый биомаркер межбелков взаимодействие объект представлять интерес htrf также использоваться качество альтернативный метод мониторинг биопроцесс технология htrf первый поколение использовать криптат европий качество донор флуоресценция мониторинг реакция биомолекула расширить 2008 год счёт внедрение донор второй поколение криптат тербий tb улучшать эффективность скрининг криптат тербий обладать фотофизический свойство сравнение европий включая повышенный квантовый выход высокий молярный коэффициент экстинкция помимо совместимость акцепторный флуорофор европий мочь служить донорный флуорофор флуорофор излучающий зелёный цвет поскольку иметь несколько пик эмиссия включая 490 нм всё анализ terbium htrf считывать htrf совместимый прибор анализ europium htrf целое htrf это высокочувствительный надёжный технология обнаружение молекулярный взаимодействие in vitro широко использоваться этап первичный вторичный скрининг разработка лекарство это обзор рассматриваться общий принцип htrf текущий применение разработка лекарство
164189	Chk1 подавляет активацию репликационной фабрики, но допускает активацию спящего источника в существующих фабриках	Источники репликации лицензируются путем загрузки гексамеров MCM2-7 перед входом в S-фазу. Однако только ~10% лицензированных источников происхождения обычно используются в фазе S, а остальные остаются в неактивном состоянии. Когда развитие вилки ингибируется, поблизости возникают спящие источники, чтобы гарантировать, что вся ДНК в конечном итоге реплицируется. Напротив, репликативный стресс активирует атаксию-телеангиэктазию и киназы контрольных точек, связанные с рад-3 (ATR) и Chk1, которые ингибируют активацию источника. В этом исследовании мы показываем, что при низких уровнях репликационного стресса ATR/Chk1 преимущественно подавляет инициацию происхождения, ингибируя активацию новых фабрик репликации, тем самым уменьшая количество активных фабрик. В то же время ингибирование прогрессирования репликационной вилки позволяет инициировать дремлющие источники происхождения внутри существующих репликационных фабрик. Таким образом, ингибирование активации новой фабрики с помощью ATR/Chk1 перенаправляет репликацию к активным фабрикам, где вилки ингибируются, и подальше от регионов, которые еще не начали репликацию. Это сводит к минимуму вредные последствия остановки вилки и предотвращает возникновение подобных проблем в нереплицируемых областях генома.	{}	источник репликация лицензироваться путём загрузка гексамер mcm2 7 вход s фаза однако 10 лицензированный источник происхождение обычно использоваться фаза s остальной оставаться неактивный состояние развитие вилка ингибироваться поблизости возникать спать источник гарантировать весь днк конечный итог реплицироваться напротив репликативный стресс активировать атаксия телеангиэктазия киназ контрольный точка связанный рад 3 atr chk1 ингибировать активация источник это исследование показывать низкий уровень репликационный стресс atr chk1 преимущественно подавлять инициация происхождение ингибировать активация новый фабрика репликация самый уменьшать количество активный фабрика время ингибирование прогрессирование репликационный вилка позволять инициировать дремать источник происхождение внутри существующий репликационный фабрика образ ингибирование активация новый фабрика помощь atr chk1 перенаправлять репликация активный фабрика вилка ингибироваться далёкий регион ещё начать репликация это сводить минимум вредный последствие остановка вилка предотвращать возникновение подобный проблема нереплицировать область геном
164985	Протоонкоген Fra-1 регулирует экспрессию IL-6 в макрофагах и способствует образованию макрофагов M2d.	Микроокружение опухоли (ТМО) играет важную роль в росте опухолевых клеток. Макрофаги M2d, являясь основным воспалительным компонентом TME, обучаются TME так, что они принимают на себя иммуносупрессивную роль, которая способствует метастазированию и прогрессированию опухоли. Fra-1 образует гетеродимеры белка-активатора-1 с партнерами Jun и управляет транскрипцией генов. Считается, что Fra-1 резко индуцирует онкогенез и прогрессирование. Однако функциональная роль Fra-1 в генерации макрофагов M2d на сегодняшний день плохо изучена. Здесь мы демонстрируем, что клетки карциномы молочной железы 4T1 при совместном культивировании с макрофагами RAW264.7 искажают дифференцировку макрофагов RAW264.7 в макрофаги M2d. Клетки 4T1 стимулируют сверхэкспрессию Fra-1 de novo в клетках RAW264.7, а затем Fra-1 связывается с промотором интерлейкина 6 (IL-6), увеличивая выработку цитокина IL-6 в клетках RAW264.7. IL-6 действует аутокринным образом, искажая дифференцировку макрофагов RAW264.7 в макрофаги M2d. Эти результаты открывают новое понимание того, как обратить вспять иммунную толерантность, индуцированную макрофагами M2d, чтобы повысить эффективность иммунотерапевтических подходов.	{}	микроокружение опухоль тмо играть важный роль рост опухолевый клетка макрофаг m2d являться основный воспалительный компонент tme обучаться tme принимать иммуносупрессивный роль способствовать метастазирование прогрессирование опухоль fra 1 образовать гетеродимер белок активатор 1 партнёр jun управлять транскрипция ген считаться fra 1 резко индуцировать онкогенез прогрессирование однако функциональный роль fra 1 генерация макрофаг m2d сегодняшний день плохо изучить демонстрировать клетка карцинома молочный железа 4t1 совместный культивирование макрофаг raw264 7 искажать дифференцировка макрофаг raw264 7 макрофаг m2d клетка 4t1 стимулировать сверхэкспрессия fra 1 de novo клетка raw264 7 затем fra 1 связываться промотор интерлейкина 6 il 6 увеличивать выработка цитокина il 6 клетка raw264 7 il 6 действовать аутокринный образ искажать дифференцировка макрофаг raw264 7 макрофаг m2d результат открывать новый понимание обратить вспять иммунный толерантность индуцировать макрофаг m2d повысить эффективность иммунотерапевтический подход
169264	Анализ белков, связывающих наночастицы SiO2, в гомогенате крови и головного мозга крыс	Множество наночастиц, таких как оксид титана (TiO2), оксид цинка, оксид алюминия, оксид золота, оксид серебра, оксид железа и оксид кремния, встречаются во многих химических, косметических, фармацевтических и электронных продуктах. Недавно на животных моделях было показано, что наночастицы SiO2 имеют инертный профиль токсичности и не связаны с необратимыми токсикологическими изменениями. Следовательно, воздействие наночастиц SiO2 увеличивается. Наночастицы SiO2 обычно используются во многих материалах: от упрочняющего наполнителя для бетона и других строительных композитов до нетоксичных платформ для биомедицинских применений, таких как доставка лекарств и терапевтика. С другой стороны, недавние эксперименты in vitro показали, что наночастицы SiO2 цитотоксичны. Поэтому мы исследовали эти наночастицы для выявления потенциально токсичных путей путем анализа короны адсорбированного белка на поверхности наночастиц SiO2 в крови и мозге крысы. Для исследования были выбраны четыре типа наночастиц SiO2, и белковая корона каждого типа была проанализирована с использованием технологии жидкостной хроматографии-тандемной масс-спектрометрии. В общей сложности 115 и 48 белков плазмы крысы были идентифицированы как связанные с отрицательно заряженными наночастицами SiO2 размером 20 и 100 нм соответственно, а 50 и 36 белков были обнаружены для покрытых аргинином наночастиц SiO2 размером 20 и 100 нм соответственно. На наночастицах SiO2 размером 20 нм было адсорбировано большее количество белков, чем на наночастицах размером 100 нм, независимо от заряда. Когда сравнивали белки с двумя зарядами, было обнаружено большее количество белков для покрытых аргинином положительно заряженных наночастиц SiO2, чем для отрицательно заряженных наночастиц. Белки, идентифицированные как связанные в короне из наночастиц SiO2, были дополнительно проанализированы с помощью ClueGO, плагина Cytoscape, используемого в онтологии белков и для определения путей биологического взаимодействия. Белки, связанные с поверхностью наночастиц, могут влиять на функциональные и конформационные свойства и распределение в сложных биологических процессах.	{}	множество наночастица оксид титан tio2 оксид цинк оксид алюминий оксид золото оксид серебро оксид железо оксид кремний встречаться многий химический косметический фармацевтический электронный продукт недавно животное модель показать наночастица sio2 иметь инертный профиль токсичность связать необратимый токсикологический изменение следовательно воздействие наночастица sio2 увеличиваться наночастица sio2 обычно использоваться многий материал упрочнять наполнитель бетон строительный композит нетоксичный платформа биомедицинский применение доставка лекарство терапевтика сторона недавний эксперимент in vitro показать наночастица sio2 цитотоксичный поэтому исследовать наночастица выявление потенциально токсичный путь путём анализ корона адсорбировать белок поверхность наночастица sio2 кровь мозг крыса исследование выбрать четыре тип наночастица sio2 белковый корона каждый тип проанализировать использование технология жидкостный хроматография тандемный масса спектрометрия общий сложность 115 48 белок плазма крыса идентифицировать связанный отрицательно зарядить наночастица sio2 размер 20 100 нм соответственно 50 36 белок обнаружить покрыть аргинин наночастица sio2 размер 20 100 нм соответственно наночастица sio2 размер 20 нм адсорбировать больший количество белок наночастица размер 100 нм независимо заряд сравнивать белка заряд обнаружить больший количество белок покрыть аргинин положительно зарядить наночастица sio2 отрицательно зарядить наночастица белка идентифицировать связанный корона наночастица sio2 дополнительно проанализировать помощь cluego плагин cytoscape использовать онтология белок определение путь биологический взаимодействие белка связанный поверхность наночастица мочь влиять функциональный конформационный свойство распределение сложный биологический процесс
175735	Определение положения нуклеосом с помощью аннотации их гистоновых меток на основе данных ChIP	МОТИВАЦИЯ Нуклеосома – это основная повторяющаяся единица хроматина. Он содержит по две копии каждого из четырех основных гистонов H2A, H2B, H3 и H4 и около 147 пар оснований ДНК. Остатки белков-гистонов подвергаются многочисленным посттрансляционным модификациям, таким как метилирование или ацетилирование. Иммунопреципитация хроматина с последующим секвенированием (ChIP-seq) представляет собой метод, который обеспечивает данные о занятости этих модифицированных белков-гистонов по всему геному и требует соответствующих вычислительных методов. РЕЗУЛЬТАТЫ Мы представляем NucHunter, алгоритм, который использует данные экспериментов ChIP-seq, направленных против многих модификаций гистонов, для определения позиционирования нуклеосом. NucHunter аннотирует каждую из этих нуклеосом интенсивностью модификаций гистонов. Мы демонстрируем, что эти аннотации можно использовать для вывода нуклеосомных состояний с четкими корреляциями с основными геномными особенностями и процессами, связанными с хроматином, такими как сайты начала транскрипции, энхансеры, элонгация с помощью РНК-полимеразы II и репрессия, опосредованная хроматином. Таким образом, NucHunter представляет собой универсальный инструмент, который можно использовать для прогнозирования позиционирования нуклеосом на основе панели экспериментов по модификации гистонов ChIP-seq и вывода различных паттернов модификации гистонов, связанных с различными состояниями хроматина. ДОСТУПНОСТЬ Программное обеспечение доступно по адресу http://epigen.molgen.mpg.de/nuchunter/.	{}	мотивация нуклеосома это основный повторяться единица хроматин содержать копия каждый четыре основный гистон h2a h2b h3 h4 около 147 пара основание днк остаток белок гистон подвергаться многочисленный посттрансляционный модификация метилирование ацетилирование иммунопреципитация хроматин последующий секвенирование chip seq представлять метод обеспечивать дать занятость модифицированный белок гистон весь геном требовать соответствующий вычислительный метод результат представлять nuchunter алгоритм использовать дать эксперимент chip seq направить против многий модификация гистон определение позиционирование нуклеосома nuchunter аннотировать каждый нуклеосома интенсивность модификация гистон демонстрировать аннотация использовать вывод нуклеосомный состояние чёткий корреляция основный геномный особенность процесс связанный хроматин сайт начало транскрипция энхансер элонгация помощь рнк полимераза ii репрессия опосредовать хроматин образ nuchunter представлять универсальный инструмент использовать прогнозирование позиционирование нуклеосома основа панель эксперимент модификация гистон chip seq вывод различный паттерн модификация гистон связанный различный состояние хроматин доступность программный обеспечение доступно адрес http epigen molgen mpg de nuchunter
188911	Получение большого количества дендритных клеток из культур костного мозга мышей, дополненных колониестимулирующим фактором гранулоцитов/макрофагов.	Известно, что дендритные клетки класса II, богатые антигенпрезентирующим комплексом гистосовместимости (MHC), возникают из костного мозга. Однако в костном мозге отсутствуют зрелые дендритные клетки, и значительное количество пролиферирующих менее зрелых клеток еще не идентифицировано. Методика стимуляции роста дендритных клеток, которая была недавно описана для мышиной крови, теперь была модифицирована для MHC класса II-негативных предшественников в костном мозге. Ключевым шагом является удаление большинства неприкрепившихся вновь образованных гранулоцитов путем осторожной промывки в течение первых 2-4 дней культуры. Это оставляет после себя пролиферирующие кластеры, которые слабо прикреплены к более прочно прикрепленной «строме». На 4-6 дни кластеры могут быть смещены, изолированы с помощью 1 г седиментации, а при повторном культивировании высвобождается большое количество дендритных клеток. Последние легко идентифицируются на основании различной формы клеток, ультраструктуры и репертуара антигенов, определяемых с помощью панели моноклональных антител. Дендритные клетки экспрессируют высокие уровни продуктов MHC класса II и действуют как мощные вспомогательные клетки, инициирующие смешанную лейкоцитарную реакцию. Ни кластеры, ни зрелые дендритные клетки не образуются, если применяется колониестимулирующий фактор макрофагов, а не гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (GM-CSF). Таким образом, GM-CSF генерирует все три линии миелоидных клеток (гранулоциты, макрофаги и дендритные клетки). Поскольку > 5 x 10(6) дендритных клеток развиваются за 1 неделю из предшественников в крупных костях задних конечностей одного животного, предшественники костного мозга могут действовать как основной источник дендритных клеток. Эта функция должна оказаться полезной для будущих молекулярных и клинических исследований этого типа клеток.	{}	известно дендритный клетка класс ii богатый антигенпрезентировать комплекс гистосовместимость mhc возникать костный мозг однако костный мозг отсутствовать зрелый дендритный клетка значительный количество пролиферировать менее зрелый клетка ещё идентифицировать методика стимуляция рост дендритный клетка недавно описать мышиный кровь модифицировать mhc класс ii негативный предшественник костный мозг ключевой шаг являться удаление большинство неприкрепиться вновь образовать гранулоцит путём осторожный промывка течение первый 2 4 день культура это оставлять пролиферировать кластер слабо прикрепить прочно прикрепить строма 4 6 день кластер мочь сместить изолировать помощь 1 г седиментация повторный культивирование высвобождаться большой количество дендритный клетка последний легко идентифицироваться основание различный форма клетка ультраструктура репертуар антиген определять помощь панель моноклональный антитело дендритный клетка экспрессировать высокий уровень продукт mhc класс ii действовать мощный вспомогательный клетка инициировать смешанный лейкоцитарный реакция кластер зрелый дендритный клетка образоваться применяться колониестимулировать фактор макрофаг гранулоцитарный макрофагальный колониестимулировать фактор gm csf образ gm csf генерировать всё линия миелоидный клетка гранулоцит макрофаг дендритный клетка поскольку 5 x 10 6 дендритный клетка развиваться 1 неделя предшественник крупный кость задний конечность животное предшественник костный мозг мочь действовать основной источник дендритный клетка функция должный оказаться полезный будущий молекулярный клинический исследование это тип клетка
195352	Действие и резистентность инсулина при ожирении и диабете 2 типа	Избыток питания является основным предвестником диабета 2 типа. Он усиливает секрецию инсулина, но ослабляет метаболическое действие инсулина в печени, скелетных мышцах и жировой ткани. Однако противоречивые данные указывают на недостаток знаний о времени этих событий во время развития ожирения и диабета, указывая на ключевой пробел в нашем понимании метаболических заболеваний. В этом обзоре рассматриваются альтернативные точки зрения и недавние результаты о временных и механистических связях между гиперинсулинемией, ожирением и резистентностью к инсулину. Хотя большое внимание уделяется ранним этапам сигнального каскада инсулина, резистентность к инсулину при ожирении, по-видимому, в значительной степени возникает после этих этапов. Новые результаты также связывают резистентность к инсулину с обширными метаболическими взаимодействиями между печенью, жировой тканью, поджелудочной железой и скелетными мышцами. Эти и другие достижения последних 5 лет открывают захватывающие возможности и ставят сложнейшие задачи для разработки новых терапевтических стратегий лечения диабета 2 типа.	{}	избыток питание являться основный предвестник диабет 2 тип усиливать секреция инсулин ослаблять метаболический действие инсулин печень скелетный мышца жировой ткань однако противоречивый дать указывать недостаток знание время событие время развитие ожирение диабет указывать ключевой пробел наш понимание метаболический заболевание это обзор рассматриваться альтернативный точка зрение недавний результат временной механистический связь гиперинсулинемия ожирение резистентность инсулин хотя большой внимание уделяться ранний этап сигнальный каскад инсулин резистентность инсулин ожирение видимый значительный степень возникать этап новый результат также связывать резистентность инсулин обширный метаболический взаимодействие печень жировой ткань поджелудочный железа скелетный мышца достижение последний 5 год открывать захватывать возможность ставить сложный задача разработка новый терапевтический стратегия лечение диабет 2 тип
202259	Влияние снижения артериального давления на сердечно-сосудистые события и смертность у пациентов, находящихся на диализе: систематический обзор и метаанализ рандомизированных контролируемых исследований	УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ Пациенты, находящиеся на диализе, имеют существенно повышенный риск сердечно-сосудистой смертности и заболеваемости. Хотя несколько исследований показали пользу снижения артериального давления для сердечно-сосудистой системы среди населения в целом, существует неопределенность в отношении эффективности и переносимости снижения артериального давления у пациентов, находящихся на диализе. Мы провели систематический обзор и метаанализ, чтобы оценить эффект снижения артериального давления у пациентов, находящихся на диализе. МЕТОДЫ Мы систематически искали в Medline, Embase и базе данных Кокрановской библиотеки исследования, о которых сообщалось в период с 1950 по ноябрь 2008 года, без языковых ограничений. Мы извлекли стандартизированный набор данных из рандомизированных контролируемых исследований по снижению артериального давления у пациентов, находящихся на диализе, в которых сообщалось о сердечно-сосудистых исходах. Метаанализ проводился с использованием модели случайных эффектов. РЕЗУЛЬТАТЫ Мы выявили восемь соответствующих исследований, в которых были представлены данные по 1679 пациентам и 495 сердечно-сосудистым событиям. Средневзвешенное систолическое артериальное давление было на 4,5 мм рт. ст. ниже, а диастолическое артериальное давление на 2,3 мм рт. ст. ниже у активно леченных пациентов, чем в контрольной группе. Лечение, снижающее артериальное давление, было связано с более низкими рисками сердечно-сосудистых событий (ОР 0,71, 95% ДИ 0,55–0,92; р=0,009), смертности от всех причин (ОР 0,80, 0,66–0,96; р=0,014) и сердечно-сосудистой смертности (ОР 0,71, 0,50-0,99; р=0,044), чем контрольные схемы. Эффекты, по-видимому, одинаковы для различных групп пациентов, включенных в исследования. ИНТЕРПРЕТАЦИЯ Лечение препаратами, снижающими кровяное давление, следует регулярно рассматривать для лиц, находящихся на диализе, чтобы снизить очень высокий уровень сердечно-сосудистой заболеваемости и смертности в этой группе населения.	{}	уровень техника пациент находиться диализ иметь существенно повышенный риск сердечно сосудистый смертность заболеваемость хотя несколько исследование показать польза снижение артериальный давление сердечно сосудистый система среди население целое существовать неопределённость отношение эффективность переносимость снижение артериальный давление пациент находиться диализ провести систематический обзор метаанализ оценить эффект снижение артериальный давление пациент находиться диализ метод систематически искать medline embase база данные кокрановский библиотека исследование сообщаться период 1950 ноябрь 2008 год языковой ограничение извлечь стандартизировать набор данные рандомизировать контролировать исследование снижение артериальный давление пациент находиться диализ сообщаться сердечно сосудистый исход метаанализ проводиться использование модель случайный эффект результат выявить восемь соответствующий исследование представить дать 1679 пациент 495 сердечно сосудистый событие средневзвешенный систолический артериальный давление 4 5 мм рт ст ниже диастолический артериальный давление 2 3 мм рт ст ниже активно лечить пациент контрольный группа лечение снижать артериальный давление связать низкий риск сердечно сосудистый событие ор 0 71 95 ди 0 55 0 92 р 0 009 смертность весь причина ор 0 80 0 66 0 96 р 0 014 сердечно сосудистый смертность ор 0 71 0 50 0 99 р 0 044 контрольный схема эффект видимый одинаковый различный группа пациент включить исследование интерпретация лечение препарат снижать кровяной давление следовать регулярно рассматривать лицо находиться диализ снизить очень высокий уровень сердечно сосудистый заболеваемость смертность группа население

End of preview.

README.md exists but content is empty. Use the Edit dataset card button to edit it.

Downloads last month: 116

Edit dataset card

Size of downloaded dataset files:

504 kB

Size of the auto-converted Parquet files:

1.08 MB

Number of rows:

1,109

Collection including kngrg/rus-scifact

rusBeIR

Collection

Collection of datasets for BeIR-based benchmark for Russian IR • 11 items • Updated Oct 6