Datasets:

---

rania-refaat

/

NCBI_BC5CDR-Combined-deduplicated

like 0

[ "The", "greatest", "sharing", "was", "at", "D18S37", "64", "%", "in", "bipolar", "and", "recurrent", "unipolar", "(", "RUP", ")", "sib", "pairs", "(", "P", "=", ".", "0006", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "addition", ",", "excess", "sharing", "of", "the", "paternally", ",", "but", "not", "maternally", ",", "transmitted", "alleles", "was", "observed", "at", "three", "markers", "on", "18q", "at", "D18S41", ",", "51", "bipolar", "and", "RUP", "sib", "pairs", "were", "concordant", "for", "paternally", "transmitted", "alleles", ",", "and", "21", "pairs", "were", "discordant", "(", "P", "=", "0004", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "evidence", "for", "linkage", "to", "loci", "on", "both", "18p", "and", "18q", "was", "strongest", "in", "the", "11", "paternal", "pedigrees", ",", "i", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "e", "e", ".", ",", "those", "in", "which", "the", "father", "or", "one", "of", "the", "fathers", "sibs", "is", "affected", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "these", "pedigrees", ",", "the", "greatest", "allele", "sharing", "(", "81", "%", ";", "P", "=", ".", "00002", ")", "and", "the", "highest", "LOD", "score", "(", "3", ".", "51", ";", "phi", "=", "0", ".", "0", ")", "were", "observed", "at", "D18S41", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Our", "results", "provide", "further", "support", "for", "linkage", "of", "BPAD", "to", "chromosome", "18", "and", "the", "first", "molecular", "evidence", "for", "a", "parent", "-", "of", "-", "origin", "effect", "operating", "in", "this", "disorder", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "number", "of", "loci", "involved", ",", "and", "their", "precise", "location", ",", "require", "further", "study" ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "prevalent", "mutation", "for", "galactosemia", "among", "black", "Americans", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0 ]

[ "OBJECTIVE", "To", "define", "the", "mutation", "causing", "galactosemia", "in", "patients", "of", "black", "American", "origin", "who", "have", "no", "galactose", "-", "1", "-", "phosphate", "uridyltransferase", "(", "GALT", ")", "activity", "in", "erythrocytes", "but", "good", "clinical", "outcome", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "METHODS", "We", "discovered", "a", "mutation", "caused", "by", "a", "C", "-", "-", ">", "T", "transition", "at", "base", "-", "pair", "1158", "of", "the", "GALT", "gene", "that", "results", "in", "a", "serine", "-", "to", "-", "leucine", "substitution", "at", "codon", "135", "(", "S135L", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "developed", "a", "method", "with", "which", "to", "screen", "populations", "for", "its", "prevalence", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "compared", "galactose", "-", "1", "-", "phosphate", "uridyltransferase", "among", "erythrocytes", ",", "leukocytes", ",", "and", "transformed", "lymphoblasts", ",", "as", "well", "as", "total", "body", "oxidation", "of", "D", "-", "(", "13C", ")", "-", "galactose", "to", "13CO2", "among", "three", "genotypes", "for", "GALT", "(", "S135L", "/", "S135L", ",", "Q188R", "/", "Q188R", ",", "and", "Normal", "/", "Normal", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "RESULTS", "We", "found", "a", "48", "%", "prevalence", "of", "the", "S135L", "mutation", "among", "17", "black", "American", "patients", "with", "classic", "galactosemia", "and", "a", "1", "%", "prevalence", "in", "a", "population", "of", "50", "black", "Americans", "without", "galactosemia", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0 ]

[ "The", "S135L", "mutation", "was", "not", "found", "in", "84", "white", "patients", "with", "G", "/", "G", "galactosemia", "nor", "in", "87", "white", "control", "subjects", "without", "galactosemia", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0 ]

[ "We", "found", "normal", "whole", "body", "oxidation", "of", "D", "-", "(", "13C", ")", "-", "galactose", "by", "the", "patient", "homozygous", "for", "S135L", "and", "various", "degrees", "of", "enzyme", "impairment", "among", "different", "tissues", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "CONCLUSIONS", "The", "S135L", "mutation", "in", "the", "GALT", "gene", "is", "a", "prevalent", "cause", "of", "galactosemia", "among", "black", "patients", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Because", "GALT", "activity", "varies", "in", "different", "tissues", "of", "patients", "homozygous", "for", "S135L", ",", "they", "may", "have", "a", "better", "clinical", "outcome", "than", "patients", "who", "are", "homozygous", "for", "Q188R", "when", "both", "are", "treated", "from", "infancy", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "high", "incidence", "of", "BRCA1", "mutations", "in", "20", "breast", "-", "ovarian", "cancer", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0 ]

[ "We", "have", "analyzed", "20", "breast", "-", "ovarian", "cancer", "families", ",", "the", "majority", "of", "which", "show", "positive", "evidence", "of", "linkage", "to", "chromosome", "17q12", "for", "germ", "-", "line", "mutations", "in", "the", "BRCA1", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "BRCA1", "mutations", "cosegregating", "with", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "susceptibility", "were", "identified", "in", "16", "families", ",", "including", "1", "family", "with", "a", "case", "of", "male", "breast", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0 ]

[ "Nine", "of", "these", "mutations", "have", "not", "been", "reported", "previously", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "majority", "of", "mutations", "were", "found", "to", "generate", "a", "premature", "stop", "codon", "leading", "to", "the", "formation", "of", "a", "truncated", "BRCA1", "protein", "of", "2", "%", "-", "88", "%", "of", "the", "expected", "normal", "length", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Two", "mutations", "altered", "the", "RING", "finger", "domain", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Sequencing", "of", "genomic", "DNA", "led", "to", "the", "identification", "of", "a", "mutation", "in", "the", "coding", "region", "of", "BRCA1", "in", "12", "families", ",", "and", "cDNA", "analysis", "revealed", "an", "abnormal", "or", "missing", "BRCA1", "transcript", "in", "4", "of", "the", "8", "remaining", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "total", "of", "eight", "mutations", "were", "associated", "with", "a", "reduced", "quantity", "of", "BRCA1", "transcript", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "were", "unable", "to", "detect", "BRCA1", "mutations", "in", "4", "of", "the", "20", "families", ",", "but", "only", "1", "of", "these", "was", "clearly", "linked", "to", "BRCA1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "It", "is", "expected", "that", "the", "majority", "of", "clear", "examples", "of", "the", "breast", "-", "ovarian", "syndrome", "will", "be", "associated", "with", "germ", "-", "line", "mutations", "in", "the", "coding", "region", "of", "BRCA1", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Brca1", "deficiency", "results", "in", "early", "embryonic", "lethality", "characterized", "by", "neuroepithelial", "abnormalities", "." ]

[ 1, 2, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 1, 2, 0 ]

[ "The", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "susceptibility", "gene", ",", "BRCA1", ",", "has", "been", "cloned", "and", "shown", "to", "encode", "a", "zinc", "-", "finger", "protein", "of", "unknown", "function", "." ]

[ 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Mutations", "in", "BRCA1", "account", "for", "at", "least", "80", "%", "of", "families", "with", "both", "breast", "and", "ovarian", "cancer", ",", "as", "well", "as", "some", "non", "-", "familial", "sporadic", "ovarian", "cancers", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]

[ "The", "loss", "of", "wild", "-", "type", "BRCA1", "in", "tumours", "of", "individuals", "carrying", "one", "nonfunctional", "BRCA1", "allele", "suggests", "that", "BRCA1", "encodes", "a", "tumour", "suppressor", "that", "may", "inhibit", "the", "proliferation", "of", "mammary", "epithelial", "cells", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "To", "examine", "the", "role", "of", "BRCA1", "in", "normal", "tissue", "growth", "and", "differentiation", ",", "and", "to", "generate", "a", "potential", "model", "for", "the", "cancer", "susceptibility", "associated", "with", "loss", "of", "BRCA1", "function", ",", "we", "have", "created", "a", "mouse", "line", "carrying", "a", "mutation", "in", "one", "Brca1", "allele", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Analysis", "of", "mice", "homozygous", "for", "the", "mutant", "allele", "indicate", "that", "Brca1", "is", "critical", "for", "normal", "development", ",", "as", "these", "mice", "died", "in", "utero", "between", "10", "and", "13", "days", "of", "gestation", "(", "E10", "-", "E13", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Abnormalities", "in", "Brca1", "-", "deficient", "embryos", "were", "most", "evident", "in", "the", "neural", "tube", ",", "with", "40", "%", "of", "the", "embryos", "presenting", "with", "varying", "degrees", "of", "spina", "bifida", "and", "anencephaly", "." ]

[ 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0 ]

[ "In", "addition", ",", "the", "neuroepithelium", "in", "Brca1", "-", "deficient", "embryos", "appeared", "disorganized", ",", "with", "signs", "of", "both", "rapid", "proliferation", "and", "excessive", "cell", "death", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Identification", "of", "mutations", "in", "the", "ALD", "-", "gene", "of", "20", "families", "with", "adrenoleukodystrophy", "/", "adrenomyeloneuropathy", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0 ]

[ "Adrenoleukodystrophy", "(", "ALD", ")", ",", "an", "X", "-", "linked", "inherited", "metabolic", "disorder", ",", "is", "the", "most", "frequent", "inborn", "peroxisomal", "disease", "." ]

[ 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0 ]

[ "It", "leads", "to", "demyelination", "in", "the", "central", "and", "peripheral", "nervous", "system", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0 ]

[ "Defective", "beta", "-", "oxidation", "of", "saturated", "very", "long", "chain", "fatty", "acids", "(", "VLCFAs", ";", "C22", "0", "-", "C26", "0", ")", "in", "peroxisomes", "has", "been", "shown", "to", "lead", "to", "an", "accumulation", "of", "VLCFAs", "in", "leukoid", "areas", "of", "the", "central", "nervous", "system", ",", "peripheral", "nerves", ",", "adrenal", "gland", ",", "and", "blood", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "ALD", "gene", "has", "been", "recently", "identified", "and", "encodes", "a", "745", "-", "amino", "-", "acid", "protein", "." ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "screened", "patients", "with", "adrenoleukodystrophy", "/", "adrenomyeloneuropathy", "(", "ALD", "/", "AMN", ")", "from", "20", "kindreds", "for", "mutations", "in", "the", "ALD", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0 ]

[ "Eleven", "missense", "and", "two", "nonsense", "mutations", ",", "five", "deletions", ",", "and", "one", "insertion", "were", "detected", "by", "direct", "sequencing", "of", "eight", "reverse", "transcribed", "fragments", "of", "the", "ALD", "-", "gene", "mRNA", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Four", "mutations", "could", "be", "shown", "to", "be", "de", "novo", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "All", "mutations", "could", "be", "confirmed", "in", "carriers", "by", "sequencing", "genomic", "DNA", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "No", "correlation", "between", "the", "type", "of", "mutation", "and", "the", "severity", "of", "the", "phenotype", "could", "be", "observed", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "mutations", "were", "not", "detected", "in", "the", "ALD", "gene", "of", "30", "healthy", "persons", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "murine", "homolog", "of", "the", "human", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "susceptibility", "gene", "Brca1", "maps", "to", "mouse", "chromosome", "11D", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "recently", "cloned", "human", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "susceptibility", "gene", ",", "BRCA1", ",", "is", "located", "on", "human", "chromosome", "17q21", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "have", "isolated", "murine", "genomic", "clones", "containing", "Brca1", "as", "a", "first", "step", "in", "generating", "a", "mouse", "model", "for", "the", "loss", "of", "BRCA1", "function", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "mouse", "genomic", "library", "was", "screened", "using", "probes", "corresponding", "to", "exon", "11", "of", "the", "human", "BRCA1", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Two", "overlapping", "mouse", "clones", "were", "identified", "that", "hybridized", "to", "human", "BRCA1", "exons", "9", "-", "12", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Sequence", "analysis", "of", "1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "4", "kb", "of", "the", "region", "of", "these", "clones", "corresponding", "to", "part", "of", "human", "exon", "11", "revealed", "72", "%", "nucleic", "acid", "identity", "but", "only", "50", "%", "amino", "acid", "identity", "with", "the", "human", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "longest", "of", "the", "mouse", "Brca1", "genomic", "clones", "maps", "to", "chromosome", "11D", ",", "as", "determined", "by", "two", "-", "color", "fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "synteny", "to", "human", "chromosome", "17", "was", "confirmed", "by", "cohybridization", "with", "the", "mouse", "probe", "for", "the", "NF1", "-", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "This", "comparative", "study", "confirms", "that", "the", "relative", "location", "of", "the", "BRCA1", "gene", "has", "been", "conserved", "between", "mice", "and", "humans", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Atelosteogenesis", "type", "II", "is", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "diastrophic", "dysplasia", "sulfate", "-", "transporter", "gene", "(", "DTDST", ")", ":", "evidence", "for", "a", "phenotypic", "series", "involving", "three", "chondrodysplasias", "." ]

[ 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0 ]

[ "Atelosteogenesis", "type", "II", "(", "AO", "II", ")", "is", "a", "neonatally", "lethal", "chondrodysplasia", "whose", "clinical", "and", "histological", "characteristics", "resemble", "those", "of", "another", "chondrodysplasia", ",", "the", "much", "less", "severe", "diastrophic", "dysplasia", "(", "DTD", ")", "." ]

[ 1, 2, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0 ]

[ "The", "similarity", "suggests", "a", "shared", "pathogenesis", "involving", "lesions", "in", "the", "same", "biochemical", "pathway", "and", "perhaps", "the", "same", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "DTD", "is", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "recently", "identified", "diastrophic", "dysplasia", "sulfate", "-", "transporter", "gene", "(", "DTDST", ")", "." ]

[ 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Here", ",", "we", "report", "that", "AOII", "patients", "also", "have", "DTDST", "mutations", ",", "which", "lead", "to", "defective", "uptake", "of", "inorganic", "sulfate", "and", "insufficient", "sulfation", "of", "macromolecules", "by", "patient", "mesenchymal", "cells", "in", "vitro", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Together", "with", "our", "recent", "observation", "that", "a", "third", "even", "more", "severe", "chondrodysplasia", ",", "achondrogenesis", "type", "IB", ",", "is", "also", "caused", "by", "mutations", "in", "DTDST", ",", "these", "results", "demonstrate", "a", "phenotypic", "series", "of", "three", "chondrodysplasias", "of", "increasing", "severity", "caused", "by", "lesions", "in", "a", "single", "sulfate", "-", "transporter", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "severity", "of", "the", "phenotype", "appears", "to", "be", "correlated", "with", "the", "predicted", "effect", "of", "the", "mutations", "on", "the", "residual", "activity", "of", "the", "DTDST", "protein", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Haplotype", "and", "phenotype", "analysis", "of", "six", "recurrent", "BRCA1", "mutations", "in", "61", "families", ":", "results", "of", "an", "international", "study", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Several", "BRCA1", "mutations", "have", "now", "been", "found", "to", "occur", "in", "geographically", "diverse", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0 ]

[ "To", "investigate", "mutation", "origin", "and", "mutation", "-", "specific", "phenotypes", "due", "to", "BRCA1", ",", "we", "constructed", "a", "haplotype", "of", "nine", "polymorphic", "markers", "within", "or", "immediately", "flanking", "the", "BRCA1", "locus", "in", "a", "set", "of", "61", "breast", "/", "ovarian", "cancer", "families", "selected", "for", "having", "one", "of", "six", "recurrent", "BRCA1", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Tests", "of", "both", "mutations", "and", "family", "-", "specific", "differences", "in", "age", "at", "diagnosis", "were", "not", "significant", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "comparison", "of", "the", "six", "mutations", "in", "the", "relative", "proportions", "of", "cases", "of", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "was", "suggestive", "of", "an", "effect", "(", "P", "=", ".", "069", ")", ",", "with", "57", "%", "of", "women", "presumed", "affected", "because", "of", "the", "1294", "del", "40", "BRCA1", "mutation", "having", "ovarian", "cancer", ",", "compared", "with", "14", "%", "of", "affected", "women", "with", "the", "splice", "-", "site", "mutation", "in", "intron", "5", "of", "BRCA1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "For", "the", "BRCA1", "mutations", "studied", "here", ",", "the", "individual", "mutations", "are", "estimated", "to", "have", "arisen", "9", "-", "170", "generations", "ago", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "general", ",", "a", "high", "degree", "of", "haplotype", "conservation", "across", "the", "region", "was", "observed", ",", "with", "haplotype", "differences", "most", "often", "due", "to", "mutations", "in", "the", "short", "-", "tandem", "-", "repeat", "markers", ",", "although", "some", "likely", "instances", "of", "recombination", "also", "were", "observed", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "For", "several", "of", "the", "instances", ",", "there", "was", "evidence", "for", "multiple", ",", "independent", ",", "BRCA1", "mutational", "events", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Isolation", "of", "the", "mouse", "homologue", "of", "BRCA1", "and", "genetic", "mapping", "to", "mouse", "chromosome", "11", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "BRCA1", "gene", "is", "in", "large", "part", "responsible", "for", "hereditary", "human", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0 ]

[ "Here", "we", "report", "the", "isolation", "of", "the", "murine", "Brca1", "homologue", "cDNA", "clones", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "addition", ",", "we", "identified", "genomic", "P1", "clones", "that", "contain", "most", ",", "if", "not", "all", ",", "of", "the", "mouse", "Brca1", "locus", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "DNA", "sequence", "analysis", "revealed", "that", "the", "mouse", "and", "human", "coding", "regions", "are", "75", "%", "identical", "at", "the", "nucleotide", "level", "while", "the", "predicted", "amino", "acid", "identity", "is", "only", "58", "%", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "DNA", "sequence", "variant", "in", "the", "Brca1", "locus", "was", "identified", "and", "used", "to", "map", "this", "gene", "on", "a", "(", "Mus", "m", ".", "musculus", "Czech", "II", "x", "C57BL", "/", "KsJ", ")", "F1", "x", "C57BL", "/", "KsJ", "intersubspecific", "backcross", "to", "distal", "mouse", "chromosome", "11", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "mapping", "of", "this", "gene", "to", "a", "region", "highly", "syntenic", "with", "human", "chromosome", "17", ",", "coupled", "with", "Southern", "and", "Northern", "analyses", ",", "confirms", "that", "we", "isolated", "the", "murine", "Brca1", "homologue", "rather", "than", "a", "related", "RING", "finger", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "isolation", "of", "the", "mouse", "Brca1", "homologue", "will", "facilitate", "the", "creation", "of", "mouse", "models", "for", "germline", "BRCA1", "defects", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0 ]

[ "Emerin", "deficiency", "at", "the", "nuclear", "membrane", "in", "patients", "with", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "." ]

[ 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0 ]

[ "Mutations", "in", "the", "STA", "gene", "at", "the", "Xq28", "locus", "have", "been", "found", "in", "patients", "with", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "(", "EDMD", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 1, 0, 0 ]

[ "This", "gene", "encodes", "a", "hitherto", "unknown", "protein", "named", "emerin", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "To", "elucidate", "the", "subcellular", "localization", "of", "emerin", ",", "we", "raised", "two", "antisera", "against", "synthetic", "peptide", "fragments", "predicted", "from", "emerin", "cDNA", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Using", "both", "antisera", ",", "we", "found", "positive", "nuclear", "membrane", "staining", "in", "skeletal", ",", "cardiac", "and", "smooth", "muscles", "in", "the", "normal", "controls", "and", "in", "patients", "with", "neuromuscular", "diseases", "other", "than", "EDMD", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 1, 0 ]

[ "In", "contrast", ",", "a", "deficiency", "in", "immunofluorescent", "staining", "of", "skeletal", "and", "cardiac", "muscle", "from", "EDMD", "patients", "was", "observed", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "34", "kD", "protein", "is", "immunoreactive", "with", "the", "antisera", "-", "-", "the", "protein", "is", "equivalent", "to", "that", "predicted", "for", "emerin", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Together", ",", "our", "findings", "suggest", "the", "specific", "deficiency", "of", "emerin", "in", "the", "nuclear", "membrane", "of", "muscle", "cells", "in", "patients", "with", "EDMD", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0 ]

[ "Growth", "retardation", "and", "tumour", "inhibition", "by", "BRCA1", "." ]

[ 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Inherited", "mutations", "in", "BRCA1", "predispose", "to", "breast", "and", "ovarian", "cancer", ",", "but", "the", "role", "of", "BRCA1", "in", "sporadic", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "has", "previously", "been", "elusive", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Here", ",", "we", "show", "that", "retroviral", "transfer", "of", "the", "wild", "-", "type", "BRCA1", "gene", "inhibits", "growth", "in", "vitro", "of", "all", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "cell", "lines", "tested", ",", "but", "not", "colon", "or", "lung", "cancer", "cells", "or", "fibroblasts", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Mutant", "BRCA1", "has", "no", "effect", "on", "growth", "of", "breast", "cancer", "cells", ";", "ovarian", "cancer", "cell", "growth", "is", "not", "affected", "by", "BRCA1", "mutations", "in", "the", "5", "portion", "of", "the", "gene", ",", "but", "is", "inhibited", "by", "3", "BRCA1", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Development", "of", "MCF", "-", "7", "tumours", "in", "nude", "mice", "is", "inhibited", "when", "MCF", "-", "7", "cells", "are", "transfected", "with", "wild", "-", "type", ",", "but", "not", "mutant", ",", "BRCA1", "." ]

[ 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Most", "importantly", ",", "among", "mice", "with", "established", "MCF", "-", "7", "tumours", ",", "peritoneal", "treatment", "with", "a", "retroviral", "vector", "expressing", "wild", "-", "type", "BRCA1", "significantly", "inhibits", "tumour", "growth", "and", "increased", "survival", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[]

[]