Datasets:

siddharthtumre

/

JNLPBA-Processed

like 0

[ "Restoration", "of", "the", "Epstein", "-", "Barr", "virus", "ZEBRA", "protein", "'", "s", "capacity", "to", "disrupt", "latency", "by", "the", "addition", "of", "heterologous", "activation", "regions", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "The", "ZEBRA", "protein", "has", "a", "unique", "biological", "function", "among", "herpesviral", "proteins", "." ]

[ "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "It", "is", "responsible", "for", "the", "disruption", "of", "Epstein", "-", "Barr", "virus", "(", "EBV", ")", "latency", "and", "the", "induction", "of", "the", "lytic", "cycle", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "employed", "the", "ZEBRA", "/", "EBV", "biological", "system", "to", "test", "whether", "a", "heterologous", "activation", "domain", "can", "substitute", "for", "another", "activation", "domain", "(", "the", "ZEBRA", "domain", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O" ]

[ "The", "ZEBRA", "activation", "region", "was", "replaced", "with", "the", "potent", "acid", "activation", "region", "from", "the", "herpes", "simplex", "virus", "VP16", "protein", "or", "with", "the", "activation", "region", "of", "the", "EBV", "R", "protein", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "Activation", "was", "not", "target", "-", "or", "cell", "-", "type", "dependent", ",", "nor", "was", "it", "dependent", "on", "the", "presence", "of", "virus", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "studies", "suggest", "that", "the", "specificities", "of", "some", "of", "the", "known", "biological", "functions", "of", "ZEBRA", "are", "not", "dependent", "upon", "the", "nature", "of", "the", "activation", "domain", "present", "within", "ZEBRA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O" ]

[ "Interleukin", "4", "activates", "a", "signal", "transducer", "and", "activator", "of", "transcription", "(", "Stat", ")", "protein", "which", "interacts", "with", "an", "interferon", "-", "gamma", "activation", "site", "-", "like", "sequence", "upstream", "of", "the", "I", "epsilon", "exon", "in", "a", "human", "B", "cell", "line", "." ]

[ "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Evidence", "for", "the", "involvement", "of", "Janus", "kinase", "3", "and", "interleukin", "-", "4", "Stat", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Germ", "line", "C", "transcripts", "can", "be", "induced", "by", "IL", "-", "4", "in", "the", "human", "B", "cell", "line", ",", "BL", "-", "2", "." ]

[ "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Utilizing", "a", "IFN", "-", "gamma", "activation", "site", "-", "like", "DNA", "sequence", "element", "located", "upstream", "of", "the", "I", "epsilon", "exon", ",", "we", "demonstrated", "by", "gel", "mobility", "shift", "assays", "that", "IL", "-", "4", "induced", "a", "binding", "activity", "in", "the", "cytosol", "and", "nucleus", "of", "BL", "-", "2", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "factor", "was", "designated", "IL", "-", "4", "NAF", "(", "IL", "-", "4", "-", "induced", "nuclear", "-", "activating", "factors", ")", "and", "was", "identified", "as", "a", "tyrosine", "phosphoprotein", ",", "which", "translocates", "from", "the", "cytosol", "to", "the", "nucleus", "upon", "IL", "-", "4", "treatment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

[ "Congruous", "with", "the", "involvement", "of", "a", "Stat", "protein", ",", "IL", "-", "4", "induced", "robust", "Janus", "kinase", "3", "(", "JAK3", ")", "activity", "in", "BL", "-", "2", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cotransfection", "of", "JAK3", "with", "IL", "-", "4", "Stat", "into", "COS", "-", "7", "cells", "produced", "an", "intracellular", "activity", "which", "bound", "the", "same", "IFN", "-", "gamma", "activation", "site", "-", "like", "sequence", "and", "comigrated", "with", "IL", "-", "4", "NAF", "in", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assay", "." ]

[ "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "show", "that", "IL", "-", "4", "NAF", "is", "IL", "-", "4", "Stat", ",", "which", "is", "activated", "by", "JAK3", "in", "response", "to", "IL", "-", "4", "receptor", "engagement", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O" ]

[ "Does", "activation", "of", "the", "TAL1", "gene", "occur", "in", "a", "majority", "of", "patients", "with", "T", "-", "cell", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", "?", "A", "pediatric", "oncology", "group", "study", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Almost", "25", "%", "of", "patients", "with", "T", "-", "cell", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", "(", "T", "-", "ALL", ")", "have", "tumor", "-", "specific", "rearrangements", "of", "the", "TAL1", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "Although", "TAL1", "expression", "has", "not", "been", "observed", "in", "normal", "lymphocytes", ",", "TAL1", "gene", "products", "are", "readily", "detected", "in", "leukemic", "cells", "that", "harbor", "a", "rearranged", "TAL1", "allele", "." ]

[ "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "Hence", ",", "it", "has", "been", "proposed", "that", "ectopic", "expression", "of", "TAL1", "promotes", "the", "development", "of", "T", "-", "ALL", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "report", ",", "we", "show", "that", "TAL1", "is", "expressed", "in", "the", "leukemic", "cells", "of", "most", "patients", "with", "T", "-", "ALL", ",", "including", "many", "that", "do", "not", "display", "an", "apparent", "TAL1", "gene", "alteration", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O" ]

[ "A", "polymorphic", "dinucleotide", "repeat", "in", "the", "transcribed", "sequences", "of", "TAL1", "was", "used", "to", "determine", "the", "allele", "specificity", "of", "TAL1", "transcription", "in", "primary", "T", "-", "ALL", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "TAL1", "activation", "in", "these", "patients", "may", "result", "from", "subtle", "alterations", "in", "cis", "-", "acting", "regulatory", "sequences", "(", "affecting", "expression", "of", "a", "single", "TAL1", "allele", ")", "or", "changes", "in", "trans", "-", "acting", "factors", "that", "control", "TAL1", "transcription", "(", "affecting", "expression", "of", "both", "TAL1", "alleles", ")", "." ]

[ "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O" ]

[ "To", "clarify", "properties", "of", "the", "blast", "cells", "in", "M7", "and", "TMD", "cases", ",", "we", "examined", "erythroid", "markers", "expression", "in", "blasts", "from", "six", "cases", "with", "M7", "and", "seven", "cases", "with", "TMD", "in", "this", "study", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "also", "found", "that", "mRNAs", "encoding", "GATA", "-", "1", "and", "GATA", "-", "2", "are", "expressed", "in", "all", "these", "cases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Expression", "of", "Ah", "receptor", "(", "TCDD", "receptor", ")", "during", "human", "monocytic", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "previously", "found", "a", "high", "expression", "of", "human", "Ah", "receptor", "(", "TCDD", "receptor", ")", "mRNA", "in", "peripheral", "blood", "cells", "of", "individuals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Then", "the", "expression", "levels", "of", "AhR", "mRNA", "in", "various", "hematopoietic", "cell", "lines", "were", "examined", "together", "with", "those", "of", "Arnt", "and", "P450IA1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "O" ]

[ "AhR", "was", "expressed", "at", "high", "levels", "in", "monocytoid", "U937", ",", "THP1", ",", "and", "HEL", "/", "S", "cells", ",", "and", "at", "moderate", "levels", "in", "promyelocytic", "HL60", "cells", "and", "erythroblastic", "HEL", "cells", "." ]

[ "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "it", "was", "not", "detected", "in", "lymphoid", "cells", "MOLT4", "(", "T", "cell", ")", "and", "BALL1", "(", "B", "cell", ")", ",", "nor", "in", "K562", "erythroblasts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "a", "specific", "induction", "of", "AhR", "during", "monocytic", "differentiation", "was", "investigated", "in", "HL60", "and", "HEL", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "HL60", "cells", "were", "induced", "to", "differentiate", "toward", "monocytes", "-", "macrophages", "by", "incubation", "with", "phorbol", "ester", ",", "showing", "a", "5", "-", "to", "2", "-", "fold", "increase", "of", "AhR", "mRNA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "The", "HEL", "cells", "also", "exhibited", "a", "similar", "elevation", "of", "AhR", "mRNA", "level", ",", "when", "they", "had", "differentiated", "toward", "monocyte", "-", "macrophage", "cells", "by", "these", "combined", "inducers", ",", "but", "little", "change", "in", "the", "mRNA", "level", "was", "observed", "when", "the", "cells", "were", "induced", "to", "differentiate", "into", "other", "cell", "types", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Treatment", "of", "the", "differentiated", "HL60", "cells", "with", "3", "-", "methylcholanthrene", ",", "a", "ligand", "of", "AhR", ",", "induced", "the", "expression", "of", "the", "P450IA1", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]

[ "These", "results", "indicated", "that", "expression", "of", "AhR", "mRNA", "was", "significantly", "induced", "during", "monocytic", "differentiation", "and", "that", "the", "differentiated", "cells", "were", "responsive", "to", "xenobiotics", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "suggest", "that", "AhR", "may", "play", "an", "important", "role", "in", "the", "function", "of", "monocytes", "and", "also", "in", "the", "eventual", "activation", "of", "environmental", "carcinogens", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Neutrophils", "and", "monocytes", "express", "high", "levels", "of", "PU", ".", "1", "(", "Spi", "-", "1", ")", "but", "not", "Spi", "-", "B", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "PU", ".", "1", "(", "the", "Spi", "-", "1", "oncogene", ")", "and", "Spi", "-", "B", "are", "closely", "related", "members", "of", "the", "ets", "transcription", "factor", "family", ",", "sharing", "similar", "DNA", "binding", "specificities", "mediated", "by", "similar", "DNA", "binding", "domains", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "PU", ".", "1", "and", "Spi", "-", "B", "have", "been", "previously", "described", "as", "being", "predominantly", "expressed", "coordinately", "in", "macrophages", "and", "B", "cells", ",", "but", "their", "expression", "in", "early", "hematopoietic", "stages", "and", "during", "the", "course", "of", "myeloid", "differentiation", "to", "monocytes", "and", "macrophages", "or", "to", "neutrophils", "has", "not", "been", "extensively", "investigated", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "report", "that", "PU", ".", "1", "mRNA", "is", "upregulated", "during", "myeloid", "differentiation", "of", "human", "purified", "CD34", "+", "cells", "and", "murine", "multipotential", "FDCP", "-", "mix", "A4", "cells", ",", "suggesting", "that", "PU", ".", "1", "is", "upregulated", "as", "an", "early", "event", "during", "differentiation", "of", "multipotential", "progenitor", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PU", ".", "1", "expression", "is", "maintained", "at", "stable", "levels", "during", "differentiation", "of", "myeloid", "cell", "lines", "U937", "and", "HL", "-", "60", "to", "monocytic", "and", "neutrophilic", "cells", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PU", ".", "1", "is", "expressed", "at", "highest", "levels", "in", "mature", "human", "monocytes", "and", "human", "peripheral", "blood", "neutrophils", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", "to", "PU", ".", "1", ",", "significant", "levels", "of", "Spi", "-", "B", "mRNA", "and", "protein", "are", "found", "only", "in", "some", "B", "-", "cell", "lines", "and", "spleen", "but", "are", "not", "found", "in", "myeloid", "cell", "lines", ",", "neutrophils", ",", "or", "macrophages", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "although", "PU", ".", "1", "and", "Spi", "-", "B", "may", "bind", "to", "similar", "DNA", "control", "elements", "and", "have", "redundancy", "of", "transactivation", "function", "in", "vitro", ",", "the", "lack", "of", "significant", "levels", "of", "Spi", "-", "B", "in", "myeloid", "cells", "makes", "it", "unlikely", "that", "Spi", "-", "B", "plays", "a", "significant", "role", "in", "myeloid", "lineage", "development", "and", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Identification", "of", "a", "major", "positive", "regulatory", "element", "located", "5", "'", "to", "the", "human", "zeta", "-", "globin", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "The", "function", "of", "the", "zeta", "-", "globin", "promoter", "was", "studied", "using", "a", "series", "of", "zeta", "-", "globin", "promoter", "deletion", "constructs", "to", "drive", "luciferase", "expression", "in", "transiently", "transfected", "human", "erythroleukemia", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "the", "constructs", "were", "transfected", "into", "OCIM1", "cells", ",", "which", "do", "not", "express", "zeta", "-", "globin", ",", "the", "zeta", "-", "globin", "promoters", "were", "at", "best", "20", "%", "as", "active", "as", "the", "alpha", "-", "globin", "promoters", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "When", "sequences", "from", "-", "417", "to", "-", "207", "5", "'", "to", "the", "zeta", "-", "globin", "mRNA", "cap", "site", "were", "deleted", ",", "up", "to", "95", "%", "of", "the", "zeta", "-", "globin", "promoter", "activity", "was", "lost", "in", "K562", "cells", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Reinsertion", "of", "these", "sequences", "into", "zeta", "-", "luciferase", "constructs", "missing", "the", "-", "417", "to", "-", "207", "region", "showed", "that", "the", "sequences", "lack", "classical", "enhancer", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Point", "mutation", "of", "a", "GATA", "-", "1", "site", "at", "-", "230", "reduced", "promoter", "activity", "by", "37", "%", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Point", "mutation", "of", "a", "CCACC", "site", "at", "-", "240", "had", "no", "effect", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "indicated", "that", "the", "-", "230", "GATA", "-", "1", "site", "has", "a", "relatively", "low", "affinity", "for", "GATA", "-", "1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]

[ "These", "experiments", "show", "the", "presence", "of", "a", "strong", "positive", "-", "acting", "element", ",", "located", "between", "-", "417", "and", "-", "207", "bp", "5", "'", "to", "the", "zeta", "-", "globin", "mRNA", "cap", "site", ",", "is", "necessary", "for", "high", "-", "level", "promoter", "activity", "in", "K562", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Analysis", "of", "the", "role", "of", "protein", "kinase", "C", "-", "alpha", ",", "-", "epsilon", ",", "and", "-", "zeta", "in", "T", "cell", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "T", "cells", "express", "multiple", "isotypes", "of", "protein", "kinase", "C", "(", "PKC", ")", "and", "although", "it", "is", "well", "accepted", "that", "PKCs", "have", "an", "important", "role", "in", "T", "cell", "activation", ",", "little", "is", "known", "about", "the", "function", "of", "individual", "PKC", "isotypes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "p21ras", "plays", "an", "essential", "role", "in", "T", "cell", "activation", "." ]

[ "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "data", "indicate", "that", "PKC", "-", "epsilon", "and", ",", "to", "a", "lesser", "extent", "PKC", "-", "alpha", "but", "not", "-", "zeta", ",", "can", "regulate", "the", "transcription", "factors", "AP", "-", "1", "and", "nuclear", "factor", "of", "activated", "T", "cells", "(", "NF", "-", "AT", "-", "1", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O" ]

[ "PKC", "-", "epsilon", ",", "but", "not", "PKC", "-", "alpha", "nor", "activated", "p21ras", ",", "was", "able", "to", "induce", "NF", "-", "KB", "activity", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

[ "Phorbol", "esters", "induce", "expression", "of", "CD69", "whereas", "none", "of", "the", "activated", "PKC", "isotypes", "tested", "were", "able", "to", "have", "this", "effect", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Activated", "Src", "and", "p21ras", "were", "able", "to", "induce", "CD69", "expression", "." ]

[ "O", "B", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O" ]

[ "Although", "glucocorticosteroids", "are", "a", "very", "effective", "treatment", "for", "asthma", "and", "other", "chronic", "inflammatory", "diseases", ",", "a", "small", "proportion", "of", "patients", "are", "resistant", "to", "their", "therapeutic", "effects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "molecular", "mechanism", "for", "this", "steroid", "resistance", "is", "unclear", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Steroid", "resistance", "can", "not", "be", "explained", "by", "pharmacokinetic", "mechanisms", ",", "by", "a", "defect", "in", "the", "binding", "of", "steroids", "to", "glucocorticoid", "receptors", ",", "nor", "by", "defective", "nuclear", "translocation", "of", "this", "receptor", ",", "thereby", "suggesting", "that", "the", "molecular", "abnormality", "lies", "distal", "to", "nuclear", "translocation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "binding", "of", "the", "glucocorticoid", "receptor", "to", "DNA", "in", "these", "patients", "was", "also", "studied", "using", "Scatchard", "analysis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Dexamethasone", "induced", "a", "significant", "rapid", "and", "sustained", "twofold", "increase", "in", "GRE", "binding", "in", "PBMCs", "from", "steroid", "-", "sensitive", "asthmatic", "patients", "and", "nonasthmatic", "individuals", ",", "but", "this", "was", "markedly", "reduced", "in", "steroid", "-", "resistant", "asthmatic", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggest", "that", "the", "ability", "of", "the", "glucocorticoid", "receptor", "to", "bind", "to", "GRE", "is", "impaired", "in", "steroid", "-", "resistant", "patients", "because", "of", "a", "reduced", "number", "of", "receptors", "available", "for", "binding", "to", "DNA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "At", "present", ",", "not", "much", "is", "known", "about", "the", "molecular", "mechanisms", "by", "which", "interleukin", "-", "5", "(", "IL", "-", "5", ")", "exerts", "its", "diverse", "biologic", "effects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Human", "eosinophils", "are", "one", "of", "the", "most", "important", "target", "cells", "for", "IL", "-", "5", "and", "were", "used", "here", "to", "study", "IL", "-", "5", "signaling", "in", "a", "primary", "human", "cell", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL", "-", "5", "induced", "rapid", "and", "transient", "tyrosine", "phosphorylation", "of", "JAK2", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O" ]

[ "Moreover", ",", "IL", "-", "5", "induced", "at", "least", "two", "DNA", "-", "binding", "complexes", ",", "using", "nuclear", "extracts", "from", "normal", "human", "eosinophils", "and", "the", "IL", "-", "6", "/", "interferon", "-", "gamma", "response", "element", "of", "the", "ICAM", "-", "1", "promoter", "(", "ICAM", "-", "1", "pIRE", ")", "in", "an", "electromobility", "shift", "assay", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "DNA", "-", "binding", "complexes", "were", "inhibited", "by", "a", "phosphotyrosine", "antibody", "(", "4G10", ")", ",", "suggesting", "that", "tyrosine", "phosphorylation", "is", "required", "for", "complex", "formation", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL", "-", "3", "and", "granulocyte", "-", "macrophage", "colony", "-", "stimulating", "factor", "induced", ",", "similar", "to", "IL", "-", "5", ",", "two", "DNA", "-", "binding", "complexes", "in", "human", "eosinophils", ",", "including", "Stat1", "alpha", "." ]

[ "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "These", "data", "show", "for", "the", "first", "time", "that", "molecular", "mechanisms", "of", "IL", "-", "5", "signaling", "in", "human", "eosinophils", "involve", "members", "of", "the", "JAK", "kinase", "family", "as", "well", "as", "members", "of", "the", "Stat", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "Infection", "and", "replication", "of", "Tat", "-", "human", "immunodeficiency", "viruses", ":", "genetic", "analyses", "of", "LTR", "and", "tat", "mutations", "in", "primary", "and", "long", "-", "term", "human", "lymphoid", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Tat", "is", "an", "essential", "regulatory", "protein", "for", "the", "replication", "of", "human", "immunodeficiency", "virus", "(", "HIV", ")", "." ]

[ "B", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "in", "the", "tat", "gene", "have", "been", "shown", "to", "block", "HIV", "replication", "in", "human", "T", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Several", "studies", "have", "established", "that", "Tat", "releases", "an", "elongation", "block", "to", "the", "transcription", "of", "HIV", "long", "terminal", "repeat", "(", "LTR", ")", ";", "however", ",", "it", "is", "not", "known", "whether", "this", "mechanism", "alone", "is", "sufficient", "to", "explain", "the", "block", "to", "HIV", "replication", "in", "human", "T", "cells", "when", "Tat", "is", "absent", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "possible", "that", "Tat", "is", "also", "needed", "for", "other", "functions", "during", "HIV", "replication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "test", "these", "hypotheses", ",", "we", "studied", "several", "tat", "mutants", ",", "including", "two", "stop", "codon", "mutants", "and", "one", "deletion", "mutant", "using", "replication", "-", "competent", "HIV", "-", "1", "constructs", "carrying", "wild", "-", "type", "or", "mutant", "LTRs", "with", "modifications", "in", "the", "NF", "-", "kappa", "B", "and", "/", "or", "Sp1", "binding", "sites", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "I", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "show", "that", "Tat", "-", "HIV", "-", "1", "with", "wild", "-", "type", "LTRs", "can", "replicate", "in", "HeLa", "cells", ",", "and", "the", "virus", "produced", "from", "HeLa", "cells", "can", "infect", "primary", "peripheral", "blood", "lymphocytes", "and", "macrophages", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Large", "amounts", "of", "viral", "RNA", "and", "particles", "were", "synthesized", "in", "infections", "established", "using", "the", "tat", "mutants", "that", "contain", "modified", "LTRs", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "However", ",", "this", "efficient", "propagation", "of", "the", "LTR", "-", "modified", "tat", "mutants", "was", "restricted", "to", "some", "lymphoid", "cell", "lines", "that", "have", "been", "transformed", "with", "other", "viruses", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "despite", "its", "essential", "role", "for", "releasing", "an", "elongation", "block", ",", "Tat", "is", "not", "otherwise", "absolutely", "required", "for", "synthesis", "of", "full", "-", "length", "HIV", "transcripts", "and", "assembly", "of", "virus", "particles", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "B", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Direct", "sequencing", "of", "the", "viral", "genomes", "and", "reinfection", "kinetics", "showed", "no", "evidence", "of", "wild", "-", "type", "reversion", "even", "after", "prolonged", "infection", "with", "the", "Tat", "-", "virus", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O" ]

[ "The", "implications", "for", "in", "vivo", "HIV", "-", "1", "replication", "and", "potential", "application", "of", "this", "system", "to", "the", "study", "of", "alternative", "Tat", "function", "are", "discussed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Functional", "roles", "of", "the", "transcription", "factor", "Oct", "-", "2A", "and", "the", "high", "mobility", "group", "protein", "I", "/", "Y", "in", "HLA", "-", "DRA", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O" ]

[ "The", "class", "II", "major", "histocompatibility", "complex", "gene", "HLA", "-", "DRA", "is", "expressed", "in", "B", "cells", ",", "activated", "T", "lymphocytes", ",", "and", "in", "antigen", "-", "presenting", "cells", "." ]

[ "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "HLA", "-", "DRA", "gene", "expression", "is", "inducible", "in", "a", "variety", "of", "cell", "types", "by", "interferon", "-", "gamma", "(", "IFN", "-", "gamma", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O" ]

[ "Coexpression", "of", "HMG", "I", "/", "Y", "and", "Oct", "-", "2", "in", "cell", "lines", "lacking", "Oct", "-", "2", "results", "in", "high", "levels", "of", "HLA", "-", "DRA", "gene", "expression", ",", "and", "in", "vitro", "DNA", "-", "binding", "studies", "reveal", "that", "HMG", "I", "/", "Y", "stimulates", "Oct", "-", "2A", "binding", "to", "the", "HLA", "-", "DRA", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O" ]

[ "Thus", ",", "Oct", "-", "2A", "and", "HMG", "I", "/", "Y", "may", "synergize", "to", "activate", "HLA", "-", "DRA", "expression", "in", "B", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B", "I", "I", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "By", "contrast", ",", "Oct", "-", "2A", "is", "not", "involved", "in", "the", "IFN", "-", "gamma", "induction", "of", "the", "HLA", "-", "DRA", "gene", "in", "HeLa", "cells", ",", "but", "antisense", "HMG", "I", "/", "Y", "dramatically", "decreases", "the", "level", "of", "induction", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Heterogeneous", "expression", "of", "Epstein", "-", "Barr", "virus", "latent", "proteins", "in", "endemic", "Burkitt", "'", "s", "lymphoma", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "I", "I", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Epstein", "-", "Barr", "virus", "(", "EBV", ")", "-", "infected", "cells", "may", "sustain", "three", "distinct", "forms", "of", "virus", "latency", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "form", "of", "latency", ",", "termed", "latency", "III", ",", "is", "also", "encountered", "in", "some", "posttransplant", "lymphoproliferative", "disorders", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "studied", "the", "expression", "of", "EBV", "proteins", "in", "17", "cases", "of", "EBV", "-", "positive", "endemic", "BL", "by", "immunohistology", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "activation", "of", "the", "Jak", "-", "STAT", "1", "signaling", "pathway", "by", "IL", "-", "5", "in", "eosinophils", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O" ]

[ "The", "intracellular", "signal", "transduction", "of", "IL", "-", "5", "in", "eosinophils", "is", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "objective", "of", "this", "study", "was", "to", "investigate", "the", "involvement", "of", "the", "newly", "discovered", "Jak", "-", "STAT", "pathway", "in", "the", "IL", "-", "5", "signal", "transduction", "mechanism", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "B", "I", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "involvement", "of", "Jak", "2", "was", "investigated", "by", "immunoprecipitation", "followed", "by", "immunoblotting", "for", "tyrosine", "phosphorylation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "activation", "of", "Jak", "2", "was", "studied", "by", "autophosphorylation", "of", "the", "immunoprecipitated", "kinase", "." ]

[ "O", "O", "O", "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "O" ]

[ "Jak", "2", "was", "tyrosine", "phosphorylated", "within", "1", "to", "3", "min", "after", "stimulation", "of", "eosinophils", "with", "IL", "-", "5", "." ]

[ "B", "I", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B", "I", "I", "O" ]