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Datasets:
zhangtaolab
/
plant-multi-species-histone-modifications

Tasks:
Text Classification
Modalities:
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Formats:
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Size:
100K - 1M
Tags:
plant
genomics
Libraries:
Datasets
Dask
License:
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soybean
TCTAAGTTCACTTCTTAGAGTGATATTCTTCATCATTTTGATGTCTATGTTGTAGCTTCCTTCTAAGGTTGATAGCTCCTTTGTAGCCTTTGATAAATCTTCTATGTAAGGCCTTGTTATTGTCTAGTACTTTGACAAGATCAAGTTCTCAGAGGAAATCACAAATCTTCATCATGTTGATAGGCTTCAAATAGTCTTATGAGGTTTTTACTCTTGACAACAATTCTGAGATAACATTCTAAGCTTGTTCTAAGCACCTCAGAATGCATGCACATATGTGTTTTTCATAAATGTTTTAACACTAAAACACTTAAGAAAACAATTCATTCATTACATAATTTCCCTCATCCTTATAATTTGCATTGCTAATGGTTTGCCATAATTAAAACATGGGATGTGGATTGATGCATAAAAATAGTGCTCACACAAGGGCAAGTGTACTCTATGCAGTAGTAATAGTAGACTAAAAGCCCGATTATCAAACCTTAAAGACCAATTGTATTCCCAAATAGTCAAAATTATTAAACTAAACATTTGAGACAATTTAAAAGAAGGTTGAATTAAGGATTAACTAATTTATCAGAGTTACCTAAACAATCATGATCAAAGCAAAACTAGAAAACCTATAAGAAATTAACATAGACATGCCACAAAGGGAGAACGATGATCACAATCCATCCTTATGATGTTACCCACGCTTCAAAACTCTTAAAACCCCTCAAATTGCTCTCAAATTCGTAAATTTGATAAAAGATAAAAAGATATAGAAAACTACCCCTATTTATAGCTTCTTAAAGATATCAGTAAAAAAGACACACTATGGCCATGGTGAACTCCACTATGACCATGGTCAAAAACTTGTGACGTTGAAGCTTTAGGGCCTTGTGGAA
0
potato
GTTCAATGAATTTGTGCAATTTCTTAGATGCCCCTTTAAGGGAATATAATACCCCTTAGATAGGCATAAGTTATGGTTTAGGGTAGAGTAGCCTCCAAGATCCTAACTAGAATCAAACACGTTTTATAGGGTCTCACAAAATTTCAATGCCTATAGTATGTAAATGTAATTTTCTTGTAAGTGAGCCTTGATCCTTCTTCTTCACCATTACCAATAATGATTATGTAACAAAAGTTAGTAGTGCTGCAACTTGCAAAGTTTTCATGCTATATTCAACTTTTCTATCTTTGTACCTCACCTAAACTTGTTTTATTTTTCTCCT
1
ath
GGTGGATGTGATAATACCGTGAAAGTGTGGAAGCTCGCTAACGGGTCATGGAAGATGGATTGCTTTCCAGCTCTTCAAAAGCACACTGATTGGGTCCGTGATGTGGCTTGGGCACCAAACTTGGGTCTCCCCAAGTCCACCATAGCCAGTGGTTCCCAAGATGGGAAAGTTATCATATGGACAGTGGGAAAAGAAGGTGAGCAATGGGAAGGTAAGGTTCTCAAGGACTTTATGACTCCTGTGTGGCGGGTCTCGTGGTCGTTGACCGGTAACTTATTGGCCGTATCCGATGGGAACAACAACGTGACTGTGTGGAAAGAGGCTGTTGATGGAGAGTGGGAACAAGTTACTGCTGTTGAGCCTTAGGTTTTTGATGCTTTGCTATCTCTCTGCTCTTCCTTTAAGGAACTGAATCAAACATTTTTTCTTTACTCTTTTCTTAGTCCGGTTTGGTGGTCTTTTTCAGGGAATGTTGAATTGGTTTTCTTAAAGACTTTTGGATTATTTTTTTTCTTATTCTTTTCATAGACACCATTTTAAAATTCTAAAAACCAAGATCTTCATGATATATAGTTTGTCTCTTCATTTGATTTTCTTTTTTCTATATGGTAAAGAGTTTAATTTGAAGGAATTTTGAGTTTTGACCTTCTTCCATAAAATTAGATACGTGTTGTCTGTATTTTGAACCAATTGGTTCTACAAAAAAAGAAGC
0
maize
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1
soybean
TAGCTCGAGTACAAGTAACTTTGCTGAGAAAAATGTGAAATGTTTAAGTGTTTAAGACTTTTGTCCAGAGAAAATCTTTAGAGCAAAATATTGTATTTCTGCTCATTCCTTCTTCAGTCTTCTCCCTTAGTACTATGTCTCGATATTTGTTTTGATTTTGATTAGAGGTTGTACTTATACTTATAATTTCCCACTTTTCAAAAAATGTTGAAGTTCAAAATATTATAGCACAATTGAAAACACCAAGAATTTTAGTCTAAGGTTTATGCGATGAAGAATGCTAAAGCATATAAAGGAGCACTTATGTTTAACACAAGGTAAAGTGACCATTTCATGTGACAATTGGTATTTTGTTACCTTGTTATCATGTGATACCTCTAAATTTTTTCTAGAGTTTTAAATCAAAAATGACTTAATTTACAAAGATTAAAAACATGTTTGTTCATTATTAATTTTGTTTATTATATGTTAAAATATCTTCCATGTAGACAAGTTTAGTTCTACCCCTCTGAGTACAAATGTGTTGTTTGCATCTTGCATATATTAGGGATGTGGTACGCTGCCTATTGTAGTCATCACATTCTAAAAATTTTAGAGTATACATACATGATAGTACTAGACCCGTCTAGAACCCTCCTAAGAGTCATGTTGTGCTCGATCAATATAGTCGATCAATGTTATGTGTGTCTATGGTCTACTCTATAAAGATGAATGGGATATTGTAGATTATTCATTGAGTGGAGATCAGTCCTTGAGGGGTATAATTGGTTGAATGGTTCA
0
wheat
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1
ath
AACTTTCTAAAATCTCTCTTATCTCTCTTCTTCTCGACCTTAAAGGTGCAATACTTCTCTCCCTCCATTTCTTTCTGTTCTTTTCATATCAGGGCTTATCAGTTGCTTTCGCCGGAGGTAGCCATCAAAGTAGTCGGAATCTGAGTTTGATTTTGTCATTGAAAGGCAAGCTCCATCTTCTCCATGTCGAGAACAAGAGAGCTCGGTGGGGAAAGGAGGAGACGATGGCTGACGGGGAAAAATTCGTATGTTCGCCGGAGGTCGTTGGAGTCTGGCAGTGGTGTTGGTTTCACGATATGAGAAAGAGATGACGTTGGTTGTCGGAGA
1
ath
CGAGGGCATAATTAATCAAACTGGCTGCAAGAGACTTATAAACCCTGAACAGTTGCTAATATCGCATGGAGGACATTGTTGCTAGCTCAACTGGGTCTCAGATGATGTCTGTTTCAGTAAAAAGTAACACATAACTGCATTTTATCAATGGCCATAACACACAACTTTAACAAAGCATAGAGAACAAGACCATAAAAACATAAATTACATCAAAGAACAAGAACAGAAATCTAAAAACAAAGCAAGAAGGAGCGATCACACTTCAAATAAACCAATGAGGTAGTGGACAAAGCCCTCACCTAATTCCAGATCAAACCGGCGGAGATGACGGGTGAGGGGAAGTCAGCGCAGGATAAACATGGGAGGGAGA
1
maize
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0
maize
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potato
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1
soybean
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0
maize
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tomato
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wheat
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1
tomato
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1
tomato
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1
tomato
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potato
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0
potato
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wheat
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rice
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1
maize
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1
wheat
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maize
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1
tomato
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ath
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ath
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maize
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ath
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1
soybean
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1
cotton
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0
rice
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1
cotton
CTTTCTTGGAAAGCTTATCTATAAAAAACCTTACCACTCAAAATCATGAAAATCAAACCAAGGTTGAGCCGACCAGATAACCCTCGATCGCCACGTTAACCTTAGTCACATCTACTTAACACCAAGCGGCGCACCTATCTTTCACTACTTGAACAGACCAAACTACGATAGAAGAGAGAATACAAGCAGATTAGATTTGCGAAAAGAGAAATTAGGCCCCCAAGGATTTTGTAGAAGAAAGTTAAGTCAGTTTAGCTCTCAAGGAGAGAAAGCTTCTAGAAAGAAGTGACAATAACAAGAAGAACGTATTGTCAATTTAGGAAACATGGGAATAAGTT
1
tomato
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1
tomato
AAGACCTTGTCTATGCATACGGTTGGCCATCACGGATTGTCCGGGCCATTTGGAGGGTCAAACGAGCCCCGAAGCGAGCATACGCCTCATTTCGACGATTTTCGTGTGCTATAGCACACCATTTTTTGGGTGATCCGGATTCCGACGTCAAAAATGCCAAATTTTTTCGTGGACGTCCGTCAAGACCTTGTCTATGCATACGGTTGGCCATCACGGATTG
1
potato
AATTCACACACACACACATAGCTAAGTGCTTGTTCAAAATTGGGCATCAAGTTTTGTCCTATATACACGATATATGTTCTCATGAACAATTGATGTACTTTGTCATTATGTTTCCTCACTTTATTTTTACTTATTCATTTGAACTTGAAAATAAAATAGCTAAATTTTATAATTTGTTTTTTTATATTTAATAAGTACGTAAAAAATATATTATTTTAAAAATACATATATATAATTTAACAAATATTATAGATGTAAAGGTGGAGACGTGGGTAGAGTAAGAGTGGAGCGTGGGGATATGAAGGAGACAATTAATATAAAATGCTATTAATAAAACTCGTTTTCCTTATTTCAACAAGAGAAACTATTTTCTAATTTAAGAAATTTGTTTTCCAAAAAAATTCAAACCAAATGGCTCTCTTGCATGGGGCATTAGGAGTATAATTTTGGACTCAAAGTGCCTTTGAAAGGCTCTAAAGTTTCAATACAAACTCAATTTCCTTTGCCTTCAAGAACCCAAAGTGAAGGTAGGAAAGATAAACAATTACATGAGAAATCTGAATTTGCAAGGTTGCTATACAATATTAACAACAAGATCTGATTATTTTGGAGTAATGATTTTGTGGCCAATGTGTTATTAAAGGCATTGAAGTTTGTTGTTAATATTAGGCCATGAGGTTAAGCCTATAAACTCCGCTCTGCATCCATCACTCACTTCAGAGACATTCATTTCTCCAATCTTTAAATAAGTGTATCTGCTTAATTTGCAGCCACTAATTTCCACAAATGTCGAAGAATTATTAACAATAAACGGACAGTTGAACATGAATAAAATTATGATTTATTCAATATATTTAGATTTAGATGAGCTAATGACTTGTTTTATTATTACCTCGATTTGTTTTAATTCGATTGATTTAACTCATTGAAAAAATGAGTTGATATATATAATTCAAATTCATCCATAAGAAACTGTCTAAATAATTTTAAAAAAGAGTTTTTTTTGTTTGATATGTTATATATAACTATAATAAAGGAAAAAAATTTCTTAGGTTTACTTAAACAAATTATGAGAAACCAAATAAAAAATTTAAAACTTAGTAAGAATTGAACGTGTTGGGTTCGACTAAGTTAGTAGTGTCAAATAAGGCTGCATGCCTCACATGGGGAGACCAGAGAGTTGATGGCGGGTGAGAAGCACTCTGAAGTGGAGGGGTTATAATATGATTTTTAGTTCATTTTAGCCCAAATAACTTTTCACACATTTATTCAATCAATCTGTTTTATCCCACTTCAGTCCAATCCGCGCCATTTGATATCCCTAGATTGTTTATCTATTTGGATGTCAATAGAATTTCAACAGTGAGCTCCATCAGAAAAAGAGAAAAGAAAAAAACTTGGTTTGTAGTATACCTTTCGTTCACTTGTACTTGTCCATTATACTAAAAATATATTTTTACTTTTACTTAGCTTGTCGCGTAAATTTAACATATCAAGAGAAAAACATATATTCTTTTCATATTTTATTATTAACATCAAATTAATTATTTTTAAAAATCTAAAATTAAATATCAATTAATATAAGTATTATGATAAAATTCTCATATCAATCATTATT
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potato
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0
potato
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ath
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rice
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tomato
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0
cotton
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tomato
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wheat
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soybean
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0
tomato
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maize
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maize
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soybean
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wheat
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tomato
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potato
GCTGCTTCACCAACAACAAACTTGCGCAGATCCAGCAAAATGCACCTCAAAACCAGCAAATACCCACTTCACAAATCTCTCAGTTAAGAAAGACAAGAGAATCAAATAAGTAGTATTGTTTCCCAAATGAGACAATAAATTTAGGTCAACTCCTCCAATTCCAATTCCAACTCACTAAATAAATACCCAGTTGTTCACTTCTGACCATAAGATTCCAACACTCAACTCCAACCAAAACGCTTAAACATCCATTAATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGAATTTAAGGCATGATGAAAATGTAAGAAAATCTCACCATTGC
1
potato
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TCTTGGAGCGGCGTTTTGCTCCGTAATTATGGCTGCAGATCGATCGGTCAAGGCGTACCGCGTACAGTATGTACTACTCGTATAGTCTACTGTAGAAGTAACATGCTGGTGGTTGGCGATGCCTTGTTAATCTTGGGGGCACGGTGGTTAGATCATGATTCGGAAATGGTAGTTGGGCTTGCAGAGGAGACAAAGCAATTACATGTGTAAAGGGGAGCGATTTTTTCTTGCAGGTACAGGAATGCCTTTTCAACTGGTGTAGTACGCATTAGTAGCTCGGTTGTTGCGTATTCTTTGGATTCCCCCTATTTATGTTCTGTATTGTGTTGCTCTCGACGCTGCTTGTTCTTTGGGCTTAGGATTCCCCTTAAGTATTTTATGTTTATCCTGTATTATTATTGCGGAGAAGCAAAGCTTGAAACTTCCTGGAAGGAGTACAAAAATCTAGAATTCGGCCTGCCTTGATGTGGCTGAGAACGTTGGCCCAACTTAGCCCAAACAAATTTAACTGGCTTTGGCCCATACAGGATTCAAGGTTTTTGGGTCCCACGGAAAACGAACTGAATGTATCTCTATCTCTGTCAAAGTTAAAAATATTTCTACCACAATTTTAGTACGTCATCCGTATTTGAGTTAGTTATAAATCCATACTTAAT
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wheat
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soybean
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0
potato
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1
wheat
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potato
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1
soybean
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1
wheat
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1
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tomato
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1
tomato
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rice
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soybean
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cotton
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cotton
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potato
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tomato
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potato
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rice
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maize
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This is the fine-tune dataset for predicting three types of histone modification (H3K27ac, H3K27me3 and H3K4me3) in plants.

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