zhangtaolab/plant-dnabert-BPE-promoter_strength_protoplast
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AT5G08185_At | GTGTGTAATCTAGGGTATATGTTTTTGTCCATTTGGTTTCATAAGGCAATAAAGATCCAGCTATTTACTACTTGTGGTATAGATTTTGACTGTTGAATTTTCAGATCTGATGTGTTTCGTTTGATCCGATTCGGAAAATTTATGTTTCGTTGACATTTTGGAGTTTAGTT | 0.668479 |
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AT1G06903_At | CTATATTGATCATATTTAGCTTCATCCAATGCTTTTGTGATTAAAAACCCACGTGAAAAAAGGCAATGAGTCCCACATCGGATGCGAAAGCAAGAAAAAATGAAAGTTTGGCTATAAATAGTTAAACATACCGAGTGTTGAACATATATATTTTTCTCATGCTTTGGTTG | 3.569417 |
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AT4G05415_At | CTCTAGATATAACTGCGTAGAATTAACGTATTATTCATTGTGTTCACAGTACACAACTCCATTAATTCATCACTAACTTGCCTCACAATCTATAGTAAGCCCATGTTTAGGGGAACCTTTGGATATTATTATCCATGATTCTTGAGTTCCTGATGTTGGAATTTTTTTGA | 2.504494 |
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AT5G04275_At | GATTAGATCTATTTTGTGTAGCAAGAAATTATCATTTTCGTTTCTTCATTCATATATTGTTCTATTATGTTGTACAATAATAGATACTCGATCTCTTGTGCGTGCGTAAATTTTATACAAGTTGTCGGCGGATCCATGGAAGAAAGCTCATCTGTCGTTGTTTGTAGGCG | 0.423566 |
AT1G62035_At | GAACCGTGTTTTCTAAACTGGTTTAACGGTAAGTACCTGTCTCTAGTAACTTACCTATCAATTTGTTCCAATCATTTACTTGCTTTGACTTATTTGGTTTCCTTTTGTTTTGTTTTTCTTTAATATGTGGATGGAGTTTGGTGTAATAAGCAACTGAAGAGTCGATGAGC | 1.219005 |
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ENSRNA049996800_Sb | AGATGAACTGCAACTAGACCAATGTTGCTACTGTTAGTTAACCATAACAATCCATTGAATATGACTTACAGCAAGCTACTCCCTCCATTCCAAATAATAAGTCACTCTGGCTTTTCTAGGTACAAAGCTTTTGCTATGCATCTAGATATACACTATGTCTAGATAGTAGA | 0.737476 |
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ENSRNA049997061_Sb | TTTGCTTTCCTTTTTGTGCTGTTCAATCTTTCACTGATGCTAGTACATTATTACTAATAGAAAACAGCCGGTACACCACAATTCCACATGGAAATCTATACCATTCCCCTTCTTTTTGAACTCCCTCTGCTCTGTTCCAAATGTAGATCGTTTTAGTTTTATCCTAAGTC | 1.513178 |
ENSRNA049472522_Zm | TGTTACTAGGAGTTCCCTACAAGCACGTCTCGATACCTTGGCTTAATAAAGGGTATAATTGTGAAGTGTTTGGGGGAGAACTCTTGGTATCACGAAGCATTTAGTTATATTATAATATATGATGGCCACATGGATACCATGTGATACAATTTTGAACAATGTCTGATGTT | 0.930516 |
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AT4G03445_At | GGAGTTGATCTGTTCAATTCACCTGCCATTGGATGCTTTTTTTATATATACTTCACTGTTCAATTTCAGATGCTTTAGAAGGTTTGCGGAGTAGCTAGAGAATCTGGTATCTTCAGTTCTTCAATTTCAGCTACTTGGTATCAGCTTCGTCATTGTATATCAACACATTC | 1.593912 |
This is the fine-tune dataset for predicting promoter strength in two validation systems (tobacco leaves and maize protoplasts) in plants.