_id
stringlengths 4
9
| text
stringlengths 190
10.2k
|
|---|---|
14050257 | Uzun protein kodlamayan RNA'ların (lncRNA'lar), fare ve insan transkriptomlarındaki en büyük transkript sınıfı olduğu öne sürülmektedir. İki önemli soru, tüm lncRNA'ların işlevsel olup olmadığı ve nasıl bir işlev gösterebilecekleridir. Çeşitli lncRNA'ların ürünleri aracılığıyla işlev gördüğü gösterilmiştir, ancak olası tek etki şekli bu değildir. Bu derlemede, lncRNA ürününden bağımsız olarak cis'te protein kodlayan gen aktivitesinin düzenlenmesinde lncRNA transkripsiyon sürecinin rolüne odaklanıyoruz. LncRNA transkripsiyonunun gen susturulmasına veya aktivasyonuna yol açtığı örnekleri tartışıyoruz ve lncRNA ürününün veya bunun transkripsiyonunun düzenleyici etkiye neden olup olmadığını belirlemeye yönelik stratejileri açıklıyoruz. |
14060030 | Miyosit mitozunun fetal, neonatal, yetişkin ve hipertrofik kalpte meydana geldiğinin ve miyokardda ilkel, farklılaşmamış hücrelerden oluşan bir havuzun mevcut olduğunun anlaşılması, kalbin biyolojisi hakkında farklı bir görüş ortaya çıkarmıştır. Yeni paradigma, miyosit oluşumunun doğum sonrası yaşamda, yetişkinlikte veya yaşlılıkta korunduğunu öne sürüyor ve bu da organizmanın yaşamı boyunca kalbin dikkate değer bir büyüme rezervine işaret ediyor. Bu makale, memeli kalbinin parankimal hücrelerini sürekli olarak yenileyebilme yeteneğine sahip olduğu ve bu beklenmedik özelliğin miyokardiyal kalp hastalığının anlaşılmasında önemli çıkarımlara sahip olduğu fikri lehine son yirmi yılda elde edilen çok sayıda yeni bilgiyi gözden geçirmektedir. Homeostaz, kalp yaşlanması ve doku onarımı. Kalbin, parankimal hücreleri yenileme yeteneği olmayan postmitotik bir organ olduğu paradigması 1970'lerde ortaya atıldı ve bu dogma, son 30 yıldır kardiyolojideki temel ve klinik araştırmaları derinden şekillendirdi. Bu paradigmaya dayanarak, kardiyomiyositler hücresel hipertrofiye1,2 maruz kalır, ancak terminal olarak farklılaşmamış miyositlerin bir alt popülasyonunun hücre döngüsüne girmesiyle veya miyosit soyuna bağlı hale gelen ilkel hücre havuzunun aktivasyonuyla değiştirilemez. Kardiyomiyositlerin strese karşı tek tepkisi hipertrofi ve/veya ölümdür. Bu nedenle miyosit hipertrofisinin moleküler mekanizmalarını ve bunların genetik kontrolünü belirlemek için büyük çaba sarf edildi. Çeşitli sinyal yolaklarına ilişkin gelişmiş bir bilgi birikimi elde edildi ve hipertrofik miyosit büyümesinin biyolojisine ilişkin anlayışımız önemli ölçüde ilerledi.3 Sorular, yaklaşımlar ve yorumlama açısından bilimsel bir devrime yol açan bir dizi yeni teknoloji tanıtıldı. deneysel sonuçlar. Hipertrofinin temel mekanizmalarını anlamamızdaki bu muazzam ilerlemeye rağmen, çok az şey... |
14075252 | Paraneoplastik trombositoz birçok katı tümörle ilişkilidir ve sıklıkla hayatta kalma oranının azalmasıyla ilişkilidir. Son çalışmalar, tümör büyümesi/metastaz ve trombositoz/trombosit aktivasyonu arasındaki karşılıklı etkileşimlerle, trombositler ve tümör hücreleri arasında patojenik bir geri besleme döngüsünün etkin olabileceğini düşündürmektedir. Tümörlerin trombosit üretimini ve aktivasyonunu uyarabildiği spesifik moleküler yollar tanımlanmıştır; aktive edilmiş trombositler, tümör büyümesini ve metastazı teşvik edebilir. Birlikte ele alındığında, bu bulgular terapötik müdahale için heyecan verici yeni potansiyel hedefler sunmaktadır. |
14079881 | AMAÇ Algılanan yaşın hayatta kalma ve yaşa bağlı önemli fenotiplerle ilişkili olup olmadığını belirlemek. TASARIM İkizlerin hayatta kaldıklarının Ocak 2008'e kadar belirlendiği ve bu tarihte 675'inin (%37) öldüğü takip çalışması. AYAR Danimarka'da nüfusa dayalı ikiz kohort. KATILIMCILAR 20 hemşire, 10 genç erkek ve 11 yaşlı kadın (değerlendirici); 1826 ikiz > veya=70 yaşında. ANA SONUÇ ÖLÇÜMLERİ Değerlendiriciler: fotoğraflardan ikizlerin algılanan yaşı. İkizler: fiziksel ve bilişsel testler ve yaşlanmanın moleküler biyobelirteçleri (lökosit telomer uzunluğu). SONUÇLAR Her üç değerlendirici grubu için algılanan yaş, kronolojik yaş, cinsiyet ve yetiştirme ortamına göre düzeltmeler yapıldıktan sonra bile hayatta kalma ile önemli ölçüde ilişkiliydi. Algılanan yaş, fiziksel ve bilişsel işlevsellik için daha fazla ayarlama yapıldıktan sonra da hayatta kalma ile anlamlı düzeyde ilişkiliydi. Çiftin daha yaşlı görünen ikizinin ilk önce ölme olasılığı, ikiz çifti içinde algılanan yaş arasındaki uyumsuzluk arttıkça arttı; yani, çiftin içinde algılanan yaş farkı ne kadar büyükse, daha yaşlı görünen ikizin ilk önce ölme olasılığı da o kadar yüksekti. İkiz analizleri, ortak genetik faktörlerin hem algılanan yaşı hem de hayatta kalmayı etkilediğini ileri sürdü. Kronolojik yaş ve cinsiyete göre kontrol edilen algılanan yaş, lökosit telomer uzunluğunun yanı sıra fiziksel ve bilişsel işlevlerle de önemli ölçüde ilişkiliydi. SONUÇ Klinisyenler tarafından hastanın sağlığının genel bir göstergesi olarak yaygın şekilde kullanılan algılanan yaş, 70 yaş üstü veya 70 yaş üstü kişiler arasında hayatta kalmayı öngören ve önemli fonksiyonel ve moleküler yaşlanma fenotipleriyle ilişkili olan güçlü bir yaşlanma biyobelirtecidir. |
14082855 | AMAÇ Bir hayvan modelinde ağların biyouyumluluk belirleyicileri olarak yabancı cisim reaksiyonunun ultra kısa vadeli ve uzun vadeli belirleyicilerini araştırmak ve ilişkilendirmek. MALZEMELER VE YÖNTEMLER Koyunlara üç farklı ağ (TVT, UltraPro ve PVDF) implante edildi. Doğal ve plazma kaplı ağlar iki taraflı olarak yerleştirildi: (a) interaperitoneal olarak, (b) fasya kaplaması olarak ve (c) kas kaplaması (fasya alt katmanı) olarak. 5. dakikada, 20. dakikada, 60. dakikada ve 120. dakikada ağlar çıkarıldı ve inflamatuar sızıntı, makrofaj infiltrasyonu, damar oluşumu, miyofibroblast istilası ve bağ dokusu birikimi açısından histokimyasal olarak araştırıldı. Sonuçlar 24 ay boyunca uzun vadeli değerlerle ilişkiliydi. BULGULAR Makrofaj istilası kısa vadede %60'a varan oranlarla en yüksek boyutlara ulaştı ve 24 ay içerisinde %30 civarına geriledi. İnflamatuvar infiltrasyon ilk 2 saatte arttı, ulaşılan seviyeler ve araştırılan meshler arasındaki farklı kapsam ve sıralamalar uzun dönem takipte sabit kaldı. Miyofibroblastlar, bağ dokusu ve CD31+ hücreleri için ilk 120 dakika boyunca herhangi bir aktivite tespit edilmedi. SONUÇ Lokal inflamatuar reaksiyon, meş implantasyonundan sonra erken ve duyarlı bir olaydır. Önceki plazma kaplamasından etkilenemez ve implantasyonun lokalizasyonuna bağlı değildir. |
14083283 | Gerçek zamanlı faz bazlı hareket büyütme için kullanılabilecek yeni bir kompakt görüntü piramidi temsili olan Riesz piramidini sunuyoruz. Yeni temsilimiz, en küçük iki yönelimli, oktav bant genişliği karmaşık, yönlendirilebilir piramitten bile daha az eksiksizdir ve uzaysal alanda kompakt, verimli doğrusal filtreler kullanılarak uygulanabilir. Bu yeni gösterimle üretilen hareketle büyütülmüş videolar, karmaşık yönlendirilebilir piramitle üretilenlerle karşılaştırılabilir kalitededir. Faz bazlı video büyütme ile kullanıldığında, Riesz piramidi, karmaşık yönlendirilebilir piramit gibi her yönelim yerine yalnızca baskın yönelim boyunca görüntüyü öne çıkarır. |
14092737 | α-sinüklein düzensizliği Parkinson hastalığı patolojisinin kritik bir yönüdür. Son zamanlarda yapılan çalışmalarda α-sinüklein agregatlarının kültürdeki hücrelere sitotoksik olduğu ve bu toksisitenin hücreler arasında yayılabileceği gözlemlenmiştir. Ancak bu sitotoksisiteyi ve yayılmayı yöneten moleküler mekanizmalar yeterince tanımlanmamıştır. Hücre içi vezikülleri parçalayarak sitoplazmik girişlerini sağlayan virüsler ve bakteriler üzerinde yapılan son araştırmalar, bu organizmalar tarafından vezikül yırtılmasını ölçmek için bir araç olarak galektin proteinlerinin yeniden dağılımını kullanmıştır. Bu yaklaşımı kullanarak, a-sinüklein agregatlarının, nöronal hücre hatlarında endositozlarının ardından lizozomların yırtılmasına neden olabileceğini gösterdik. Bu kopma, a-sinüklein agregatlarının doğrudan hücrelere eklenmesiyle ve ayrıca a-sinükleinin hücreden hücreye aktarımıyla indüklenebilir. Ayrıca a-sinüklein tarafından lizozomal yırtılmanın, hedef hücrelerde reaktif oksijen türlerinde (ROS) katepsin B'ye bağlı bir artışa neden olduğunu gözlemledik. Son olarak, a-sinüklein agregatlarının THP-1 hücrelerinde inflamatuar aktivasyonu indükleyebildiğini gözlemledik. Lizozomal rüptürün, her ikisi de Parkinson hastalığının iyi bilinen yönleri olan mitokondriyal fonksiyon bozukluğunu ve inflamasyonu indüklediği bilinmektedir, dolayısıyla Parkinson hastalığının bu yönlerini hücrelerde a-sinüklein patolojisinin yayılmasına bağlamaktadır. |
14103509 | İnsan kemiğindeki kırığın mekanik olarak anlaşılması, yaş ve hastalıkla ilişkili kırık riskinin tahmin edilmesi açısından kritik öneme sahiptir. Kapsamlı çalışmalara rağmen, mikro yapının kemik başarısızlığını nasıl etkilediğini açıklayan mekanik bir çerçeve eksiktir. Metalik ve seramik malzemeler için yerel hasar kriterlerini içeren mikromekanik modeller geliştirilmiş olmasına rağmen, biyolojik malzemeler için bu tür modellerin sayısı çok azdır. Aslında, örneğin metalik malzemelerdeki sünek kırılma için gösterildiği gibi, kemikteki kırılmanın lokal olarak gerilim kontrollü olduğu yönündeki yaygın inancı destekleyecek hiçbir kanıt yoktur. Bu çalışmada, kemikteki kritik başarısızlık olaylarının doğasına ışık tutmak için tasarlanmış, çift çentikli bükülme geometrisini içeren yeni bir dizi deney aracılığıyla bu tür kanıtları sağlıyoruz. Kırığın mekanik olarak anlaşılmasını sağlamak ve özelliklerin oryantasyona göre nasıl değiştiğini tanımlamak için yayılan çatlağın kemik mikro yapısıyla nasıl etkileşime girdiğini inceliyoruz. İnsan kortikal kemiğindeki kırılmanın gerilim kontrollü başarısızlıkla tutarlı olduğu ve mikro yapının etkisinin çeşitli sertleşme mekanizmaları açısından tanımlanabileceği bulunmuştur. Çatlaksız bağ köprüsü gibi bu mekanizmaların göreceli önemine ilişkin tahminler sunuyoruz. |
14105446 | Bu deneyde, uzuv rejenerasyonu sırasında yara epidermisinin alttaki dokular üzerindeki etkisini araştırmak için aktinomisin D kullanıldı. Axolotl'un ön ayaklarındaki deri dirsekten omuza kadar çıkarıldı. Sağ uzuvların derisi üç saat boyunca aktinomisin D'ye (5.0 veya 10.0 μg/ml %0.6 NaCl) batırıldı. Kontroller için sol uzuvlardan alınan deri aynı süre boyunca %0,6 NaCl'ye batırıldı. Her bir deri parçası ortotopik olarak yeniden yerleştirildi ve her iki uzuv da tedavi edilen deri yoluyla dirseğin proksimalinden kesildi. Başlangıç iyileşme döneminden sonra kontrol uzuvları normal şekilde yenilendi. Hafifçe daha soluk bir renk dışında, aktinomisin ile tedavi edilen cildi taşıyan uzuvlar, amputasyondan sonraki ilk hafta boyunca hem kaba hem de histolojik olarak kontrollerden ayırt edilemezdi. Kontrol uzuvları erken blastemalar oluştururken, deney uzuvlarında büyük ölçüde gözle görülür bir yenilenme kanıtı görülmedi, ancak histolojik olarak bir miktar farklılaşma meydana geldi. Normalde deney uzuvlarında blastemler ortaya çıkmadan önce kontrol rejenerasyonlarında üç ila dört basamak görüldü. 35-40. güne gelindiğinde deneysel uzuvların çoğunda blastemler ortaya çıktı. Bunlar çok hızlı bir şekilde gelişti ve kısa bir süre içinde birçoğu kontrollere yakın gelişme seviyelerine ulaştı. Aktinomisin D, apikal epidermal başlığın oluşumunu ve ardından farklılaşmamış hücrelerin bir blastema halinde toplanmasını geçici olarak baskılar. Etki ortadan kalktığında, apikal bir başlık oluşur ve farklılaşmamış hücreler hızla bir blastema halinde organize olur ve farklılaşmaya başlar. |
14116046 | Retinoik asitle ilişkili yetim reseptörler RORa ve RORγ, lipit/glikoz homeostazisinde ve çeşitli bağışıklık fonksiyonlarında düzenleyici bir rol oynar ve metabolik sendrom ve çeşitli inflamatuar hastalıklarda rol oynar. RORa eksikliği olan fareler yaşa ve diyete bağlı obeziteye, hepatosteatoza ve insülin direncine karşı korunur. RORa eksikliği olan farelerde hepatosteatoza karşı direnç, lipit sentezini, taşınmasını ve depolanmasını düzenleyen çeşitli genlerin azalmış ekspresyonuyla ilişkilidir. İnsülin direncinin gelişiminde kritik bir rol oynayan yağ dokusuyla ilişkili inflamasyon, M1 makrofajların infiltrasyonunun azalması ve birçok proinflamatuar genin ekspresyonunun azalmasıyla gösterildiği gibi, RORa eksikliği olan farelerde önemli ölçüde azalmıştır. RORγ eksikliği aynı zamanda RORα eksikliğinden farklı görünen bir mekanizma yoluyla diyete bağlı insülin direncine karşı da koruma sağlar. Son çalışmalar, ROR'ların sirkadiyen saat mekanizması ile metabolik genlerin ve metabolik sendromun düzenlenmesi arasında önemli bir bağlantı sağladığını göstermiştir. Ligand bağımlı transkripsiyon faktörleri olarak ROR'lar, obezitenin ve hepatosteatoz, yağ dokusuyla ilişkili inflamasyon ve insülin direnci dahil olmak üzere ilişkili metabolik hastalıkların tedavisinde yeni terapötik hedefler sağlayabilir. |
14118484 | Avrupa Solunum Derneği (ERS) ve Avrupa Göğüs Cerrahisi Derneği (ESTS) tarafından, akciğer kanseri hastalarının fonksiyonel değerlendirilmesi konusunda multidisipliner uzmanların işbirliği, öneriler hazırlamak ve klinisyenlere net, güncel bilgiler sağlamak amacıyla kolaylaştırılmıştır. -Cerrahi ve kemo-radyoterapiye uygunluk konusunda güncel kılavuzlar. Konu farklı konulara bölünerek en az iki uzmanın görüşüne sunuldu. Yazarlar, merkezi bir literatür taraması yapılmadan, literatürü kendi stratejilerine göre araştırdılar. Uzmanların her konuya ilişkin yazdığı taslak raporlar tüm uzman heyeti tarafından incelendi, tartışıldı ve oylandı. Her öneriyi destekleyen kanıtlar özetlendi ve İskoç Üniversitelerarası Kılavuzlar Ağı Derecelendirme İnceleme Grubu tarafından tanımlandığı şekilde derecelendirildi. Akciğer rezeksiyonu adaylarının risk sınıflandırmasına yönelik, kardiyolojik değerlendirmeyi, 1 saniyedeki zorlu ekspiratuar hacmi, sistematik karbon monoksit akciğer difüzyon kapasitesini ve egzersiz testini vurgulayan fonksiyonel bir algoritmayla klinik uygulama kılavuzları oluşturuldu ve sonuçlandırıldı. Bilimsel kanıtların daha sağlam olduğu akciğer rezeksiyonunun aksine, veri eksikliği nedeniyle kemoradyoterapi öncesi herhangi bir spesifik test, eşik değer veya algoritma öneremedik. Akciğer kanseri hastalarının uzmanlaşmış ortamlarda multidisipliner ekipler tarafından yönetilmesini öneriyoruz. |
14119470 | Ran, fazlar arası sırasında nükleer taşınmada açık bir role sahip, ancak mitotik düzenlemedeki rolleri daha az anlaşılan, bol miktarda bulunan bir nükleer GTPazdır. Ran'ın nükleotid bağlanma durumu, bir GTPaz aktive edici protein olan RanGAP1 ve bir guanin nükleotid değişim faktörü olan RCC1 tarafından düzenlenir. Ran ayrıca bir guanin nükleotid ayrışma inhibitörü olan RanBP1 ile etkileşime girer. RanBP1, GTP'ye bağlı Ran için yüksek bir afiniteye sahiptir ve RanGAP1 için bir kofaktör görevi görerek Ran üzerinde GAP aracılı GTP hidroliz oranını yaklaşık on kat artırır. RanBP1 seviyeleri hücre döngüsü sırasında salınır [4] ve artan RanBP1 konsantrasyonları, memeli hücrelerinde ve Xenopus yumurta ekstraktlarında mitozu uzatır (yayınlanmamış gözlemlerimiz). Artan RanBP1 konsantrasyonlarının mitozu nasıl bozduğunu araştırdık. M fazı Xenopus yumurta ekstraktlarına eksojen RanBP1 eklendiğinde iş mili düzeneğinin önemli ölçüde bozulduğunu bulduk. Ran'ın iş mili düzeneğindeki rolünün nükleer taşımadan bağımsız olduğuna ve muhtemelen mikrotübül dinamiklerindeki değişikliklere aracılık ettiğine dair kanıtlar sunuyoruz. |
14121786 | ARKA PLAN Kan basıncına (KB) ilişkin aile verilerinin epidemiyolojik analizi sıklıkla antihipertansif ilaçların etkileri nedeniyle tehlikeye girer. Kan basıncını düşüren ilaçların etkilerini araştıran çok sayıda klinik çalışmanın incelemesi burada özetlenmiştir. YÖNTEMLER Tek ilaç tedavileri ile 137 klinik çalışma ve toplam 11.739 katılımcıyla kombinasyon ilaç tedavileri ile ilgili 28 klinik çalışma dahil olmak üzere yayınlanmış klinik çalışmalar PubMed'den gözden geçirildi. Antihipertansif ilaçların altı ana sınıfı/grubu etnik kökene göre kategorize edildi; bunlar arasında anjiyotensin dönüştürücü enzim (ACE) inhibitörleri, alfa1 blokerler, kardiyoselektif beta blokerler (beta1 blokerler), kalsiyum kanal blokerleri, tiazid ve tiyazid benzeri diüretikler ve loop diüretikler. SONUÇLAR Etnik gruplar için otururken veya yatar pozisyonda KB kullanıldığında, ACE inhibitörleriyle tekli ilaç tedavisi sistolik ve diyastolik KB'yi 12,5/9,5 mm Hg kadar düşürme yönünde ağırlıklı ortalama bir etki gösterdi; alfa1 blokerleri 15,5/11,7 mm Hg; beta1 blokerler 14,8/12,2 mm Hg'ye kadar; kalsiyum kanal blokerleri 15,3/10,5 mm Hg; tiyazid diüretikleri 15,3/9,8 mm Hg; ve döngü diüretikleri 15,8/8,2 mm Hg arttı. Bununla birlikte, ACE inhibitörleri, alfa1 blokerler ve beta1 blokerler Afrikalı Amerikalılarda Afrikalı olmayanlara göre daha az etkiliyken, kalsiyum kanal blokerleri, tiazid diüretikler ve loop diüretikler Afrikalı Amerikalılarda Afrikalı olmayanlara göre daha etkiliydi. Etnik grupların bir arada kullanıldığı iki ilaçlı kombinasyon tedavisinde, ikinci ilacın kan basıncını düşürücü etkisi, tek ilaç tedavisiyle karşılaştırıldığında sistolik ve diyastolik kan basıncı için sırasıyla %84 ve %65 idi. SONUÇLAR Burada bildirilen KB düşürücü etkiler, tedavi öncesi KB seviyelerini belirlemek için kullanılabilir; bu, bilgi içeriğini ve dolayısıyla antihipertansif ilaç kullanımının KB ölçümlerinde kafa karıştırıcı bir faktör olduğu çalışmalarda epidemiyolojik analizin gücünü artırabilir. |
14128314 | Pluripotent kök hücre dizilerinin yeniden programlanmış yetişkin somatik hücreler de dahil olmak üzere bir dizi farklı kaynaktan yakın zamanda türetilmesi, bu farklı pluripotent durumların gelişimsel eşdeğerliği sorununu gündeme getirmektedir. Blastosistteki epiblast progenitörlerini ve daha sonraki gastrulasyonlu embriyonun pluripotent progenitörlerini temsil eden en az iki farklı durum tanınmıştır. Farklı pluripotent çizgilerin başlangıçtaki gelişimsel durumunun anlaşılması, terapötik açıdan ilgili hücre tiplerine doğru farklılaşmaya yönelik başlangıç koşullarının tanımlanması açısından kritik öneme sahiptir. |
14131683 | Prostat kanserinde androjen reseptörüne (AR) yönelik tedaviye karşı giderek daha fazla tanınan bir direnç mekanizması, tümör hücrelerinin düşük veya hiç AR ekspresyonu gösterdiği ve sıklıkla nöroendokrin özelliklere sahip olduğu epitelyal plastisiteyi içerir. Bu 'alternatif' tedaviye dirençli hücre durumunun etiyolojisi ve moleküler temeli tam olarak anlaşılamamıştır. Burada, hastalardan alınan metastatik biyopsilerin tam ekzom dizileme verilerini analiz ederek, histolojik olarak prostat adenokarsinomları (CRPC-Adeno) ve nöroendokrin prostat kanseri (CRPC-NE) olarak karakterize edilen kastrasyona dirençli tümörler arasında önemli genomik örtüşme gözlemledik; Aynı bireylerden alınan biyopsi örneklerinin zaman içinde analizi, farklı klonal evrimle en tutarlı modele işaret etmektedir. Genom çapında DNA metilasyon analizi, CRPC-NE tümörleri ve CRPC-Adeno arasında belirgin epigenetik farklılıklar ortaya çıkardı ve ayrıca CRPC-NE olarak AR bağımsızlığının klinik özelliklerine sahip CRPC-Adeno örneklerini belirledi; bu, epigenetik değiştiricilerin indüksiyonda rol oynayabileceğini öne sürdü ve/veya bu tedaviye dirençli durumun sürdürülmesi. Bu çalışma, ilerlemiş prostat kanserinde tedavi direncinin bir mekanizması olarak farklı klonal evrim yoluyla alternatif bir 'AR-kayıtsız' hücre durumunun ortaya çıkmasını desteklemektedir. |
14145440 | ARKA PLAN DNA replikasyonu ve mitoz, her biri bir siklin ve sikline bağımlı kinazdan (Cdk) oluşan kinaz komplekslerinin aktivasyonu ile tetiklenir. Cdk'lerin farklı siklin sınıflarıyla ilişkisinin, S fazının mı (replikasyon) yoksa M fazının mı (mitoz) meydana geleceğini belirlemesi mümkün görünüyordu. Bireysel B-tipi siklinlerin (CLB1-CLB6 genleri tarafından kodlanan) tomurcuklanan maya Saccharomyces cerevisiae'de her iki süreçte de fonksiyona sahip olabileceğine dair son bulgu, bu düşünceye şüphe düşürmektedir. SONUÇLAR C1b1-C1b4 içermeyen S. cerevisiae suşları bir kez DNA replikasyonuna uğramakta ancak mitoza girmemektedir. İki gende, SIM1 ve SIM2'de (SIM2, SEC72 ile aynıdır) izole edilmiş mutasyonlara sahibiz; bu mutasyonlar, bu tür hücrelerin, mitoz olmadan ekstra bir DNA replikasyonu turu geçirmesine olanak tanır. S fazını destekleyen Clb5 kinaz, ebeveyn suşun hücrelerinin G2 fazının durdurulması sırasında aktif kalır, ancak sim mutantlarında aktivitesi hızla azalır. CLB5 geninin artan ekspresyonu, yeniden replikasyonu önler. Dolayısıyla, G1 fazlı hücrelerde DNA replikasyonunu destekleyen bir siklin B-kinaz, G2 fazlı hücrelerde yeniden replikasyonu önleyebilir. Spesifik C1b-Cdk1 inhibitörü p40SIC1'in ekspresyonu yoluyla C1b kinazların etkisizleştirilmesi, G2/M fazında nocodazol tarafından bloke edilen hücrelerde replikasyon kökenlerinde bir preplikatif durumu indüklemek için yeterlidir. C1b-Cdk1 kinazların yeniden aktivasyonu, ikinci bir DNA replikasyonu turuna neden olur. SONUÇLAR S fazını teşvik eden siklin B-Cdk komplekslerinin, replikasyon orijinlerinin replikasyon öncesi duruma geçişini engelleyerek S, G2 ve M fazları sırasında yeniden replikasyonu önlediğini öneriyoruz. Bu model, hem kökenlerin neden S fazı başına yalnızca bir kez 'ateşlendiğini' hem de S fazının neden önceki M fazının tamamlanmasına bağlı olduğunu açıklayabilir. |
14149065 | E-kadherin, tümör büyümesinin baskılanması ve kültürde hücre çoğalmasının engellenmesi ile ilişkilendirilmiştir. Normal sıçan böbreği-52E (NRK-52E) veya MCF-10A epitel hücrelerinin tohumlama yoğunluğunun birleşim noktasından kademeli olarak azaltılmasının, aslında hücreleri büyüme durmasından kurtardığını gözlemledik. Beklenmedik bir şekilde, hücrelerin komşu hücrelerden izole edilmesini sağlayacak şekilde tohumlama yoğunluğunun daha da azalması, çoğalmayı azalttı. Mikro-mühendislik ürünü substratlar kullanan deneyler, E-cadherin etkileşiminin orta tohumlama yoğunluklarında proliferasyondaki zirveyi uyardığını ve yüksek yoğunluklardaki proliferasyonun durdurulmasının E-cadherin içermediğini, bunun yerine altta yatan hücre yayılmasında kalabalıklaşmaya bağlı bir azalmadan kaynaklandığını gösterdi. substrat. Özellikle orta tohumlama yoğunluklarında E-kadherin katılımıyla indüklenen Rac1 aktivitesi, kaderinle uyarılan proliferasyon için gerekliydi ve Rac1 aktivasyonunun E-cadherin tarafından kontrolüne p120-katenin aracılık ediyordu. Birlikte, bu bulgular E-kadherinin proliferatif düzenlemede uyarıcı bir rol oynadığını ortaya koyuyor ve hücre-hücre temasının farklı ortamlarda epitelyal hücre proliferasyonunu tetikleyebileceği veya inhibe edebileceği basit bir mekanizmayı tanımlıyor. |
14155726 | Nükleer aktinle ilişkili proteinler (Arps), çeşitli kromatin yeniden modelleyicilerinin alt birimleridir, ancak bu kompleksler içindeki moleküler işlevleri belirsizdir. INO80 kompleksi alt birimi Arp8'in kristal yapısını ATP'ye bağlı formunda rapor ediyoruz. İnsan Arp8'in korunmuş aktin kıvrımında polimerize olma yeteneğini açıklayan çeşitli eklemeler vardır. En dikkat çekici olanı, bir eklemenin aktif bölge yarığını sarması ve etki alanı mimarisini sağlamlaştırıyor gibi görünmesi, aktin ile paylaşılan aktif bölge özelliklerinin ise allosterik olarak kontrol edilen bir ATPaz aktivitesini akla getirmesidir. Nükleozomlar ve histon kompleksleri ile yapılan kantitatif bağlanma çalışmaları, Arp8 ve INO80'in Arp8-Arp4-aktin-HSA alt kompleksinin, H2A-H2B dimerlerine göre nükleozomları ve H3-H4 tetramerleri güçlü bir şekilde tercih ettiğini ortaya koyuyor; bu da Arp8'in bir nükleozom tanıma modülü olarak işlev gördüğünü öne sürüyor. Buna karşılık Arp4, nükleozomlara göre serbest (H3-H4)(2)'yi tercih eder ve yeniden modelleme reaksiyonunda (dis)montaj ara maddelerine bağlanarak yeniden modelleyicilere hizmet edebilir. |
14171859 | beta-adrenerjik reseptörler (beta-AR'ler), prototipik G-protein-bağlı reseptörler (GPCR'ler), çok sayıda fizyolojik sürecin düzenlenmesinde kritik bir rol oynar. GPCR kinazları (GRK'lar), G-protein sinyalini azaltır ve içselleştirme için reseptörleri hedef alır. Nitrik oksit (NO) ve/veya S-nitrozotioller (SNO'lar), in vivo beta-AR sinyallemesinin kaybını önleyebilir, ancak moleküler ayrıntılar bilinmemektedir. Burada farelerde SNO'ların beta-AR ekspresyonunu arttırdığını ve agonistle uyarılan reseptör aşağı regülasyonunu önlediğini gösterdik; ve hücrelerde SNO'lar, GRK2 aracılı beta-AR fosforilasyonunu ve ardından beta-arrestinin reseptöre alımını azaltır, bu da reseptör duyarsızlaşmasının ve içselleştirilmesinin zayıflamasına neden olur. Hem hücrelerde hem de dokularda, GRK2, SNO'ların yanı sıra NO sentazları tarafından S-nitrosillenir ve GRK2 S-nitrosilasyonu, birden fazla GPCR'nin agonistlerle uyarılmasının ardından artar. GRK2'nin Cys340'ı, S-nitrosilasyon yoluyla ana inhibisyon odağı olarak tanımlanır. Dolayısıyla çalışmalarımız GPCR sinyallemesinin düzenlendiği merkezi bir moleküler mekanizmayı ortaya koyuyor. |
14174055 | CRISPR/Cas9 sisteminin yakın zamanda kullanılması, mutant fareler üretmek için gereken süreyi önemli ölçüde azalttı, ancak zaman alıcı bir mikroenjeksiyon adımının dahil olması, bunun yüksek verimli genetik analiz için uygulanmasını hala engellemektedir. Burada, CRISPR/Cas9 sistemi için RNA'ların mikroenjekte edilmek yerine zigotlara elektroporasyona tabi tutulduğu basit, yüksek verimli ve büyük ölçekli bir genom düzenleme yöntemi geliştirdik. Bu yöntemi, fare embriyolarında tek sarmallı oligodeoksinükleotid (ssODN) aracılı nakavt gerçekleştirmek için kullandık. Bu yöntem farede büyük ölçekli genetik analizi kolaylaştırır. |
14178995 | Hutchinson-Gilford progeria sendromu (HGPS) ve restriktif dermopati (RD) genetik hastalıkları, lamin A olgunlaşma yolundaki kusurlar nedeniyle farnesillenmiş prelamin A'nın birikmesinden kaynaklanır. Bu hastalıkların her ikisi de hızlandırılmış yaşlanma olarak görülebilecek semptomlar sergiler. Farnesillenmiş prelamin A birikiminin bu hızlandırılmış yaşlanma fenotiplerine yol açtığı mekanizma anlaşılmamıştır. Burada, HGPS ve RD fibroblastlarında, genomik bütünlüğün bozulması nedeniyle DNA hasarı kontrol noktalarının sürekli olarak etkinleştirildiğine dair kanıtlar sunuyoruz. Bu hasta hücrelerinde Ataksi-telanjiektazi mutasyonlu (ATM) ve ATR (ATM ve Rad3 ile ilişkili) kontrol noktası kinazlarının etkisizleştirilmesi, erken replikasyon duraklamalarının kısmen üstesinden gelebilir. Hasta hücrelerinin bir protein farnesiltransferaz inhibitörü (FTI) ile tedavisi, DNA çift sarmal kırılmalarında ve hasar kontrol noktası sinyallerinde azalma ile sonuçlanmadı, ancak tedavi, çekirdeklerin anormal şeklini önemli ölçüde tersine çevirdi. Bu, DNA hasarı birikiminin ve anormal nükleer morfolojinin, bu progeroid sendromlarında prelamin A birikiminden kaynaklanan bağımsız fenotipler olduğunu göstermektedir. DNA hasarı birikimi HGPS semptomlarına önemli bir katkıda bulunduğundan, sonuçlarımız HGPS'nin yalnızca FTI'lerle tedavi edilmesi olasılığını sorgulamaktadır. |
14180217 | Deneysel elektron yoğunluğu haritalarında protein zincirlerinin otomatik olarak izlenmesine yönelik yeni bir teknik anlatılmaktadır. Teknik, olası C(alfa) konumlarını belirlemek için yönlendirilmiş elektron yoğunluğu olasılık hedef fonksiyonunun tekrar tekrar uygulanmasına dayanır. Bu fonksiyon, hem haritadaki birkaç gelecek vaat eden "tohum" pozisyonun lokasyonuna hem de bu başlangıç C(alfa) pozisyonlarını uzatılmış zincir parçalarına dönüştürmek için uygulanır. Zincir parçalarını bir başlangıç zincir izine birleştirme teknikleri tartışılmaktadır. |
14180565 | Gliomanın en agresif ve malign formu olan glioblastomanın çeşitli kemoterapötik ajanlara dirençli olduğu görülmektedir. Bu nedenle, glioblastoma gelişimi ve ilerlemesinde rol oynayan spesifik moleküler yolları hedeflemek için yaklaşımlar yoğun bir şekilde araştırılmıştır. Aloe emodinin kanser hücrelerinde çeşitli genlerin ekspresyonunu modüle ettiğine inanılmaktadır. Mikrodizi teknolojisini kullanarak Aloe emodinin insan U87 glioblastoma hücre hattındaki gen ekspresyon profilleri üzerindeki terapötik etkisinin altında yatan moleküler mekanizmaları anlamayı amaçladık. Gen ekspresyonu analizi, 24 saat boyunca 58.6 μg/ml ile tedavi sonrasında 28.869 genden toplam 8.226 gen değişikliğinin tespit edildiğini ortaya çıkardı. Bu toplamın içinden 34 gen, 1,07 ila 1,87 kat arasında değişen istatistiksel olarak anlamlı değişiklik (p<0,05) gösterdi. Sonuçlar, Aloe emodin tedavisine yanıt olarak 22 genin yukarı regüle edildiğini ve 12 genin ise aşağı regüle edildiğini ortaya çıkardı. Bu genler daha sonra biyolojik fonksiyonlarına dayalı olarak birkaç küme halinde gruplandırıldı; bu, U87 hücrelerinde apoptoz (programlanmış hücre ölümü) ve doku yeniden yapılanmasında rol oynayan genlerin ekspresyonunun indüklendiğini ortaya çıkardı (p<0.01). İfade seviyesinde önemli değişikliklere sahip çeşitli genler; Apoptotik kümeden SHARPIN, BCAP31, FIS1, RAC1 ve TGM2, kantitatif gerçek zamanlı PCR (qRT-PCR) ile doğrulandı. Bu sonuçlar, Aloe emodin tedavisine dayalı kanser tedavisi için moleküler hedeflerin keşfedilmesine yönelik ileriki çalışmalara yol gösterici olabilir. |
14185503 | ARKA PLAN Genlisea aurea (Lentibulariaceae), alışılmadık derecede küçük genom boyutuna (63.6 Mb) sahip, yüksek bitkiler arasında bilinen en küçüklerden biri olan etobur bir bitkidir. Genlisea'nın genom boyutları ve filogenisi hakkındaki veriler, bunun cins içinde türetilmiş bir durum olduğunu göstermektedir. Dolayısıyla G. aurea, genom kasılmasının evrimsel mekanizmalarını incelemek için mükemmel bir model organizmadır. SONUÇLAR Burada G. aurea genomunun dizilimini ve de novo taslak derlemesini rapor ediyoruz. Düzenek, toplam uzunluğu 43.4 Mb olan 10.687 bitişikten oluşur ve 17.755 tam ve kısmi protein kodlayan gen içerir. Yüksek çekirdekli Lamiales dalının bir başka temsilcisi olan Mimulus guttatus genomuyla karşılaştırılması, gen içeriği ve kodlamayan bölgelerin uzunluğundaki çarpıcı farklılıkları ortaya koyuyor. SONUÇLAR Genom kasılması, gen kaybını ve intronların ve genler arası bölgelerin uzunluklarının azalmasını içeren ancak intron kaybını içermeyen karmaşık bir süreçti. Multigenik ailelere ait genlerde gen kaybının daha sık olması, genetik fazlalığın genom boyutunun küçültülmesi için önemli bir ön koşul olduğunu göstermektedir. |
14188138 | In vitro çalışmalar, LIM kinaz ailesinin, kofilin fosforilasyonunun ve aktin dinamiğinin düzenlenmesinde bir rol oynadığını göstermektedir. Ek olarak, LIMK-1'in anormal ekspresyonu, görsel-uzaysal bilişte derin eksikliklere sahip bir zihinsel bozukluk olan Williams sendromuyla ilişkilidir. Ancak bu kinaz ailesinin in vivo fonksiyonu hala belirsizliğini koruyor. LIMK-1 nakavt fareleri kullanarak, LIMK-1'in in vivo olarak kofilin ve aktin hücre iskeletinin düzenlenmesinde önemli bir rol oynadığını gösterdik. Ayrıca, nakavt farelerin omurga morfolojisinde ve sinaptik fonksiyonda, hipokampal uzun vadeli güçlenmede artış da dahil olmak üzere önemli anormallikler sergilediğini gösterdik. Nakavt fareler ayrıca değişen korku tepkileri ve mekansal öğrenme gösterdi. Bu sonuçlar LIMK-1'in dendritik omurga morfogenezi ve beyin fonksiyonunda kritik bir rol oynadığını göstermektedir. |
14191255 | Embriyonik kök (ES) hücre transkripsiyonel ve kromatin değiştirici ağlar, kendini yenileme bakımı için kritik öneme sahiptir. Ancak bu ağların işlevsel olarak etkileşime girip girmediği ve eğer öyleyse hangi faktörlerin bu tür etkileşimlere aracılık ettiği belirsizliğini koruyor. Burada, memeli Trithorax (trxG) kompleksinin çekirdek bir üyesi olan WD tekrar alanı 5'in (Wdr5), farklılaşmamış durumla pozitif korelasyon gösterdiğini ve ES hücresinin kendi kendini yenilemesinin bir düzenleyicisi olduğunu gösteriyoruz. H3K4 metilasyonunun bir "efektörü" olan Wdr5'in pluripotens transkripsiyon faktörü Oct4 ile etkileşime girdiğini gösterdik. Genom çapında protein lokalizasyonu ve transkriptom analizleri, Oct4 ve Wdr5 arasında örtüşen gen düzenleyici fonksiyonları göstermektedir. Oct4-Sox2-Nanog devresi ve trxG, temel kendini yenileme düzenleyicilerinin transkripsiyonunu aktive etmede işbirliği yapar ve ayrıca indüklenmiş pluripotent kök (iPS) hücrelerin verimli oluşumu için Wdr5 ekspresyonu gereklidir. ES hücresinin kendini yenilemesinin ve somatik hücre yeniden programlamasının sürdürülmesi için seçilmiş trxG üyelerinin aracılık ettiği entegre bir transkripsiyonel ve epigenetik kontrol modeli öneriyoruz. |
14192687 | Nükleer transfer veya alternatif yeniden programlama yaklaşımlarının uzun vadeli hedefi, mevcut transplantasyon tıbbında önemli bir komplikasyon olan immünorejeksiyondan kaçınarak, transplantasyon tedavisi için hastaya özel donör hücreleri oluşturmaktır. Yakın zamanda dört transkripsiyon faktörünün Oct4, Sox2, Klf4 ve c-Myc'nin fare fibroblastlarında pluripotensiyi indüklediği gösterilmiştir. Bununla birlikte, uyarılmış pluripotent kök (iPS) hücrelerin nöral hücre replasman stratejileri için terapötik potansiyeli henüz keşfedilmemiştir. Burada, iPS hücrelerinin etkili bir şekilde nöral öncü hücrelere farklılaşabildiğini ve kültürde nöronal ve glial hücre tiplerinin ortaya çıktığını gösteriyoruz. Fetal fare beynine transplantasyon üzerine hücreler, çeşitli beyin bölgelerine göç eder ve glutamaterjik, GABAerjik ve katekolaminerjik alt tipler dahil olmak üzere glia ve nöronlara farklılaşır. Elektrofizyolojik kayıtlar ve morfolojik analiz, aşılanmış nöronların olgun nöronal aktiviteye sahip olduğunu ve konakçının beynine fonksiyonel olarak entegre olduğunu gösterdi. Ayrıca, iPS hücrelerinin orta beyin karakterindeki dopamin nöronlarına farklılaşması teşvik edildi ve yetişkin beynine transplantasyon üzerine Parkinson hastalığının bir sıçan modelinde davranışı iyileştirebildi. Floresansla aktifleşen hücre sınıflandırmasını kullanarak kirletici pluripotent hücreleri ve işlenmiş sinir hücrelerini ayırarak aşılanmış hücrelerden tümör oluşumu riskini en aza indirdik. Sonuçlarımız, hayvan modelinde nöronal hücre değişimi için doğrudan yeniden programlanmış fibroblastların terapötik potansiyelini göstermektedir. |
14195528 | Primat frontal korteksinin sesli iletişimdeki rolü ve dil evrimindeki önemi tartışmalı bir tarihe sahiptir. Kanıtlar seslendirme işleminin ventrolateral prefrontal korteks nöronlarında gerçekleştiğini gösterirken, vokal-motor aktivitesinin öncelikle subkortikal olduğu ve insanlardan belirgin şekilde farklı bir sinir mimarisine işaret ettiği varsayılmaktadır. Önceki çalışmalar sandalyeye bağlı hayvanlarda yapıldığından, doğal sesli iletişim sırasındaki sinirsel aktiviteye ilişkin doğrudan kanıt sınırlıdır. Burada, antifonal çağrı olarak bilinen doğal bir ses davranışı sergileyen ipek maymunları serbestçe hareket ederken, prefrontal ve premotor korteksin birçok bölgesindeki tek nöronların aktivitesini kaydettik. Amacımız, marmoset frontal korteksindeki nöronların aktif, doğal iletişim bağlamında vokal sinyal işleme ve/veya vokal motor üretimi sırasında tepkiler gösterip göstermediğini test etmekti. Ses üretimi sırasında tek nöron aktivitesinde motorla ilgili değişiklikler gözlemledik, ancak bu doğal davranış sırasında seslendirme işlemine yönelik nispeten zayıf duyusal tepkiler gözlemledik. Vokal-motor tepkileri, çağrı üretiminin hem öncesinde hem de sırasında meydana geldi ve tipik olarak her seslendirme darbesinin zamanlamasına bağlandı. Nispeten zayıf duyusal tepkilere rağmen, bir popülasyon sınıflandırıcısı, antifonal bir tepkiye yol açan seslendirme uyaranlarının sunumu sırasında meydana gelen sinirsel aktivite ile bunu yapmayanlar arasında ayrım yapabildi. Bu bulgular, insan dışı primat frontal korteks nöronlarının doğal iletişimde oynadığı rolü akla getiriyor ve ses davranışları sırasında bu neokortikal alanların işlevsel katkılarının daha açık testleri için önemli bir temel sağlıyor. |
14198646 | Obezite ve tip 2 diyabet, karaciğerde artan lipogenez ile ilişkilidir. Bu, Amerika Birleşik Devletleri'nde karaciğer fonksiyon bozukluğunun en yaygın nedeni olan alkolsüz yağlı karaciğer hastalığının (NAFLD) bir formu olan hepatik steatoz olarak bilinen bir durum olan hepatositlerde yağ birikmesine neden olur. Glikolitik ve lipojenik genlerin transkripsiyonel aktivatörü olan karbonhidrata duyarlı element bağlayıcı protein (ChREBP), farelerde hepatik steatoz gelişiminde önemli bir oyuncu olarak ortaya çıkmıştır. Bununla birlikte, transkripsiyonel aktivitesini artıran moleküler mekanizmalar büyük ölçüde bilinmemektedir. Bu çalışmada histon asetiltransferaz (HAT) koaktivatörü p300 ve serin/treonin kinaz tuzuyla indüklenebilir kinaz 2'yi (SIK2) ChREBP aktivitesinin ana yukarı akış düzenleyicileri olarak tanımladık. Kültürlenmiş fare hepatositlerinde, glikozla aktifleşen p300'ün Lys672 üzerinde ChREBP'yi asetillediğini ve hedef gen promotörlerine alımını artırarak transkripsiyonel aktivitesini arttırdığını gösterdik. SIK2, Ser89 üzerinde doğrudan fosforilasyon yoluyla p300 HAT aktivitesini inhibe etti; bu da hepatositlerde ve SIK2'yi aşırı eksprese eden farelerde ChREBP aracılı lipogenezi azalttı. Ayrıca, hem karaciğere özgü SIK2'nin yıkılması hem de p300'ün aşırı ekspresyonu, hepatik steatoz, insülin direnci ve inflamasyonla sonuçlandı; fenotipler, SIK2/p300'ün birlikte aşırı ekspresyonuyla tersine döndü. Son olarak, tip 2 diyabet ve obeziteye sahip fare modellerinde düşük SIK2 aktivitesi, artan p300 HAT aktivitesi, ChREBP hiperasetilasyonu ve hepatik steatoz ile ilişkilendirildi. Bulgularımız, hepatik p300 aktivitesinin inhibisyonunun, obezite ve tip 2 diyabette hepatik steatozun tedavisinde faydalı olabileceğini ve SIK2 aktivatörlerini ve spesifik p300 inhibitörlerini farmasötik müdahale için potansiyel hedefler olarak tanımladığını göstermektedir. |
14205246 | Mil aparatı, mitoz ve mayoz sırasında kromozomlara bağlanan ve onları ayıran mikrotübül (MT) bazlı bir makinedir. İş milinin kromatin etrafındaki kendi kendine organizasyonu, MT'lerin birleştirilmesini, kromozomlara bağlanmalarını ve bipolar bir dizi halinde organizasyonlarını içerir. İş milinin kendi kendini organize etmesinin düzenleyicilerinden biri RanGTP'dir. RanGTP, kromatinde üretilir ve TPX2, NuMA ve NuSAP gibi bir dizi çözünür, Ran tarafından düzenlenen iş mili faktörlerini etkinleştirir. İş mili faktörlerinin MT'leri kromozomlara nasıl yönlendirdiği ve bağladığı önemli açık sorulardır. Nükleer ve İş Mili ile İlişkili Protein (NuSAP), yakın zamanda iş milinin orta kısmında zenginleştirilmiş temel bir MT stabilize edici ve demetleyici protein olarak tanımlandı. Burada, biyokimyasal yeniden yapılanma yoluyla NuSAP'ın izole edilmiş kromatin ve DNA'yı etkili bir şekilde adsorbe ettiğini ve kromatin veya DNA'nın hemen yakınında yüksek konsantrasyonlarda MT'leri doğrudan üretip tutabildiğini gösteriyoruz. Ayrıca verilerimiz NuSAP-kromatin etkileşiminin Ran düzenlemesine tabi olduğunu ve Importin alfa (Impalpha) ve Imp7 tarafından bastırılabileceğini ortaya koymaktadır. Doğrudan kromatin üzerinde immobilize edilebilen NuSAP gibi MT bağlama ajanlarının varlığının, iş milinin kendi kendine organizasyonu sırasında MT üretimini omurgalı kromozomlarına hedeflemek için kritik olduğunu öneriyoruz. |
14225271 | Farklılaşan somatik hücreler, birey oluşumu sırasında giderek özel işlevlerle sınırlandırılır, ancak bunlar, tam embriyonik potansiyele sahip olanlar da dahil olmak üzere diğer hücre türlerini oluşturmak üzere deneysel olarak yönlendirilebilir. Somatik hücre nükleer transferi (SCNT) ve hücre füzyonu gibi erken nükleer yeniden programlama yöntemleri, hücre kimliğini yöneten düzenleyici programların hassas bir şekilde incelenmesinde önemli teknik engeller oluşturdu. Bununla birlikte, doğrudan yeniden programlama olarak bilinen, tanımlanmış bir dizi transkripsiyon faktörünün ektopik ekspresyonu yoluyla yeniden programlamanın keşfi, hücresel spesifikasyon ve farklılaşmanın, hücre tipi stabilitenin ve pluripotensin moleküler özelliklerini ortaya çıkarmak için izlenebilir bir platform sağladı. Transkripsiyonel ve epigenetik düzenlemeye vurgu yaparak doğrudan yeniden programlama kullanılarak incelendiği için gelişimsel geçişler sırasında hücresel kimliğin kontrolünü ve korunmasını tartışıyoruz. |
14240343 | Sirkadiyen saatler, günlük çevresel değişikliklere yanıt olarak temel fizyolojik ve davranışsal süreçlerin 24 saatlik salınımlarını düzenler. Bu saatler sabit koşullar altında son derece hassastır ancak sıfırlama sinyallerine karşı oldukça duyarlıdır. Çekirdek osilatörün moleküler bileşiminin büyük ölçüde belirlenmesiyle birlikte, son araştırmalar giderek saat değiştirici mekanizmalara/moleküllere odaklandı. Özellikle, içsel veya dışsal küçük molekül değiştiriciler, temel saat biyolojisini anlamak ve saatle ilişkili hastalıklar için varsayılan terapötik ajanlar geliştirmek için güçlü araçlar olarak ortaya çıkmaktadır. Bu derlemede, özellikle memeli saatine vurgu yaparak sirkadiyen saatlerin periyodunu, fazını veya genliğini değiştirebilen sentetik bileşiklere odaklanacağız. Bu küçük molekül değiştiricilerin hem temel hem de translasyonel araştırmalarda kullanılma potansiyelini tartışacağız. |
14241418 | Fosfatidilinositol-3-kinaz (PI3K) yolu deregülasyonu, kromozom 10'dan silinen tümör baskılayıcı fosfataz ve tensin homologunun etkisizleştirilmesi veya p110-alfa mutasyonlarının aktive edilmesi yoluyla insan kanserinde yaygın bir olaydır. Bu sıcak nokta mutasyonları, enzimin onkogenik aktivitesine neden olur ve anti-HER2 antikoru trastuzumab'a karşı terapötik dirence katkıda bulunur. Bu nedenle PI3K yolu kanser tedavisi için çekici bir hedeftir. PI3K'nın ikili bir inhibitörü ve rapamisinin (mTOR) aşağı yöndeki memeli hedefi olan NVP-BEZ235'i inceledik. NVP-BEZ235, meme kanseri hücrelerinde aşağı akış efektörleri Akt, S6 ribozomal protein ve 4EBP1'in aktivasyonunu inhibe etti. NVP-BEZ235'in antiproliferatif aktivitesi, farklı köken ve mutasyon durumuna sahip 21 kanser hücre hattından oluşan bir panelde allosterik seçici mTOR kompleksi inhibitörü everolimustan üstündü. MTOR inhibisyonuna bağlı olarak açıklanan Akt aktivasyonu, daha yüksek NVP-BEZ235 dozları ile önlendi. NVP-BEZ235, p110-alfa, E545K ve H1047R'nin onkogenik mutasyonlarının neden olduğu PI3K/mTOR yolunun hiperaktivasyonunu tersine çevirdi ve onları trastuzumab'a dirençli hale getiren bu mutasyonları ekzojen olarak eksprese eden HER2 ile güçlendirilmiş BT474 hücrelerinin proliferasyonunu inhibe etti. Trastuzumab'a dirençli BT474 H1047R meme kanseri ksenograftlarında NVP-BEZ235, PI3K sinyalini inhibe etti ve güçlü antitümör aktivitesine sahipti. Tedavi edilen hayvanlarda, farmakolojik olarak aktif dozlarda deride PI3K sinyalinin tamamen inhibisyonu vardı; bu durum, derinin farmakodinamik çalışmalar için yedek doku görevi görebileceğini düşündürmektedir. Özetle, NVP-BEZ235, PI3K/mTOR eksenini inhibe eder ve hem vahşi tipte hem de mutasyona uğramış p110-alfaya sahip kanser hücrelerinde antiproliferatif ve antitümöral aktiviteyle sonuçlanır. |
14252892 | Osteonekroz, akut lenfoblastik lösemi tedavisinin glukokortikoid kaynaklı ciddi bir komplikasyonudur. Semptomlardan bağımsız olarak çocukları (n = 364) kalça ve dizlerinin manyetik rezonans görüntülemesiyle prospektif olarak taradık; herhangi bir (derece 1-4) ve semptomatik (derece 2-4) osteonekrozun kümülatif insidansı sırasıyla %71,8'e karşı %17,6 idi. Yaş, ırk, cinsiyet, akut lenfoblastik lösemi tedavi kolu, vücut kütlesi, serum lipitleri, albümin ve kortizol düzeyleri, deksametazon farmakokinetiği ve genom çapında germ hattı genetik polimorfizmlerinin semptomatik osteonekroz ile ilişkili olup olmadığını araştırdık. Yaşın 10 yıldan fazla olması (olasılık oranı = 4,85; %95 güven aralığı, 2,5-9,2; P = 0,00001) ve daha yoğun tedavi (olasılık oranı = 2,5; %95 güven aralığı, 1,2-4,9; P = 0,011) risk faktörleriydi ve tüm analizlere ortak değişkenler olarak dahil edildi. Semptomatik osteonekroz ile ilişkili düşük albümin (P = 0,05) ve yüksek kolesterol (P = 0,02) ve şiddetli (derece 3 veya 4) osteonekroz, zayıf deksametazon klerensi (P = 0,0005) ile bağlantılıydı. Klinik özelliklere göre ayarlama yapıldığında, lipit seviyelerini ve osteoblast farklılaşmasını düzenleyen ACP1 polimorfizmleri (örn., rs12714403, P = 1,9 x 10(-6), olasılık oranı = 5,6; %95 güven aralığı, 2,7-11,3) riskle ilişkilendirildi Osteonekrozun yanı sıra daha düşük albümin ve daha yüksek kolesterol ile. Genel olarak ileri yaş, düşük albümin, yüksek lipit seviyeleri ve deksametazon maruziyeti osteonekroz ile ilişkiliydi ve kalıtsal genomik varyasyonla bağlantılı olabilir. |
14260013 | ARKA PLAN Etkili bir aşının yokluğunda HIV küresel olarak yayılmaya devam ediyor ve bu da bulaşmasını sınırlamak için yeni stratejilere duyulan ihtiyacı vurguluyor. Antiretroviral ilaçlarla maruz kalma öncesi profilaksi (PrEP), yüksek düzeyde etkili ve uygun maliyetli PrEP yöntemlerinin belirlenmesi durumunda etkili bir müdahale stratejisi olabilir. İnsana bulaşmaya çok benzeyen bir makak modelinde antiviral aktiviteyi artıran günlük ve aralıklı PrEP rejimlerini değerlendirdik. YÖNTEMLER VE BULGULAR 14 haftalık rektal virüs mücadelesi ile tekrarlanan bir makak modeli kullandık. Her biri altı al yanaklı makaktan oluşan farklı bir gruba günde bir kez üç ilaç tedavisi verildi. Grup 1'e deri altından insana eşdeğer dozda emtrisitabin (FTC) uygulandı; grup 2'ye oral olarak hem FTC hem de tenofovir-disoproksil fumaratın (TDF) insana eşdeğer dozu verildi ve grup 3'e benzer dozda FTC uygulandı ve daha yüksek tenofovir dozu. Altı al yanaklı makaktan oluşan dördüncü bir grup (grup 4), her haftalık virüs tehdidinden yalnızca 2 saat önce ve 24 saat sonra aralıklı olarak grup 3'e benzer bir PrEP rejimi aldı. Sonuçlar, herhangi bir ilaç tedavisi almayan 18 kontrol makağıyla karşılaştırıldı. Grup 1 ve 2'de tedavi edilen makaklarda enfeksiyon riski, tedavi edilmeyen makaklara göre 3,8 ve 7,8 kat daha düşüktü (sırasıyla p = 0,02 ve p = 0,008). Grup 3'teki altı makağın tamamı koruma altına alındı. Çığır açan enfeksiyonlar akut viremileri köreltmişti; Altı hayvandan ikisinde ilaca direnç görüldü. Aralıklı PrEP alan grup 4'teki altı hayvanın tamamı korundu. SONUÇLAR Bu model, günlük PrEP için tek ilacın koruyucu olabileceğini ancak koruma düzeyini arttırmak için antiretroviral ilaçların bir kombinasyonunun gerekli olabileceğini öne sürmektedir. Kısa ama güçlü aralıklı PrEP, bu SHIV/makak modelinde günlük PrEP ile karşılaştırılabilir koruma sağlayabilir. Bu bulgular insanlarda HIV'in önlenmesine yönelik PrEP denemelerini desteklemekte ve umut verici PrEP yöntemlerini belirlemektedir. |
14275671 | Homolog proteinlerin üç boyutlu yapılarındaki benzerlik, dizi değişkenliği üzerinde güçlü kısıtlamalar getirir. Farklı dizi pozisyonlarındaki amino asit bileşimleri arasında ortaya çıkan korelasyonların, üçüncül protein yapısı içindeki uzaysal temasları ortaya çıkarmak için kullanılabileceği uzun süredir öne sürülmüştür. Bu çıkarım için çok önemli olan, yakın zamanda tanıtılan Doğrudan Bağlantı Analizi (DCA) (Weigt ve diğerleri (2009) Proc Natl Acad Sci 106:67) tarafından gerçekleştirilen doğrudan ve dolaylı korelasyonları çözme yeteneğidir. Burada, yalnızca dizi bilgisine dayalı olarak çok sayıda protein alanı için DCA tarafından yapılan temas tahmininin doğruluğunu değerlendirmemize olanak tanıyan, DCA'nın hesaplama açısından verimli bir uygulamasını geliştiriyoruz. DCA'nın, incelenen protein alanlarının çoğunluğu için temas haritasının genel yapısını özetleyerek çok sayıda doğru tahmin edilen temas sağladığı gösterilmiştir. Ayrıca analizimiz, örneğin alternatif protein konformasyonlarından, ligand aracılı kalıntı eşleşmelerinden ve protein oligomerlerindeki alanlar arası etkileşimlerden kaynaklanan, alan içi kalıntı temaslarının ötesinde net sinyaller yakalar. Bulgularımız, DCA tarafından tahmin edilen temasların, alternatif protein konformasyonlarının, protein kompleksi oluşumunun ve hatta protein alan yapılarının de novo tahminlerinin hesaplamalı tahminlerini kolaylaştırmak için güvenilir bir kılavuz olarak kullanılabileceğini göstermektedir. genom dizilimindeki ilerlemeler nedeniyle hızla kullanıma sunulmaktadır. |
14290854 | AMAÇ Avrupa'daki farklı ortamlarda akut öksürük için antibiyotik reçetelenmesindeki farklılıkları ve iyileşme üzerindeki etkisini tanımlamak. TASARIM 13 Avrupa ülkesindeki 14 birinci basamak araştırma ağından klinisyenlerle, sunum ve yönetimle ilgili semptomları kaydeden kesitsel gözlemsel çalışma. Hastalar 28 gün boyunca hasta günlükleri ile takip edildi. AYAR Birincil bakım. KATILIMCILAR Yeni veya kötüleşen öksürüğü olan veya alt solunum yolu enfeksiyonunu düşündüren klinik görünümü olan yetişkinler. ANA SONUÇ ÖLÇÜMLERİ Klinisyenler tarafından antibiyotik reçetelenmesi ve zaman içindeki toplam semptom şiddeti skorları. SONUÇLAR 3402 hasta çalışmaya alındı (klinisyenler katılımcıların %99'u (3368) için bir vaka raporu formu doldurdu ve %80'i (2714) bir semptom günlüğü geri verdi). Sunum sırasındaki ortalama semptom şiddet skorları, İspanya ve İtalya merkezli ağlarda 19 (ölçek aralığı 0 ila 100) ile İsveç merkezli ağda 38 arasında değişmektedir. Ağlar tarafından antibiyotik reçetesi yazma oranı %20 ila neredeyse %90 (toplamda %53) arasında değişiyordu ve reçete edilen antibiyotik sınıfları da geniş çeşitlilik gösteriyordu. Amoksisilin genel olarak reçete edilen en yaygın antibiyotikti, ancak bu oran Norveç ağında reçete edilen antibiyotiklerin %3'ü ile İngiliz ağında %83 arasında değişiyordu. Florokinolonlar üç ağda hiç reçete edilmezken, Milano ağında %18 oranında reçete edildi. Klinik görünüm ve demografik özelliklere göre düzeltmeler yapıldıktan sonra, genel ortalamayla (reçete edilen oran: 0,53) karşılaştırıldığında, Norveç'ten (olasılık oranı 0,18, %95 güven aralığı 0,11 ila 0,30) Slovakya'ya (11,2, 6,20 ila 20,27) kadar değişen antibiyotik reçetelemesinde önemli farklılıklar kaldı. ). Klinik tablo dikkate alındığında iyileşme oranı, antibiyotik reçete edilen ve edilmeyen hastalar için benzerdi (katsayı -0.01, P<0.01). SONUÇLAR Klinik görünümdeki değişkenlik, Avrupa'da akut öksürük için antibiyotik reçetelenmesindeki önemli değişkenliği açıklamamaktadır. Antibiyotik reçetelemesindeki değişiklik, iyileşmede klinik açıdan önemli farklılıklarla ilişkili değildir. DENEME KAYDI Clinicaltrials.gov NCT00353951. |
14296612 | ARKA PLAN Vücuttaki tüm doku tiplerini oluşturma kapasitesine sahip olan pluripotent embriyonik kök (ES) hücreler, rejeneratif tedavi için çok yönlü bir hücre kaynağı olarak büyük umut vaat etmektedir. Bununla birlikte, pluripotent kök hücrelerin soy spesifikasyonunun temel mekanizmaları büyük ölçüde bilinmemektedir ve yeterli miktarda istenen hücre tipinin üretilmesi zorlu bir zorluk olmaya devam etmektedir. Küçük moleküller, özellikle de kemik morfogenetik proteini (BMP) sinyalleme kademesi gibi temel gelişimsel yolları modüle edenler, in vitro soy spesifikasyonunu incelemek ve kök hücrelerin farklılaşmasını belirli hücre tiplerine yönlendirmek için araçlar olarak umut vaat ediyor. METODOLOJİ/ TEMEL BULGULAR Fare ES hücrelerinde miyokardiyal farklılaşmayı indüklemek için BMP sinyallemesinin seçici küçük moleküllü bir inhibitörü olan dorsomorfinin kullanımını açıklıyoruz. Kardiyak indüksiyon çok sağlamdır ve kendiliğinden atan kardiyomiyositlerin verimini en az 20 kat artırır. Dorsomorfin, endojen BMP antagonisti Noggin'den farklı olarak, tedavi ES hücre farklılaşmasının ilk 24 saati ile sınırlı olduğunda kardiyomiyogenezi güçlü bir şekilde indükler. Farklılaşan ES hücrelerinin kantitatif PCR analizleri, erken kritik aşama sırasında BMP sinyallemesinin farmakolojik inhibisyonunun, kardiyomiyosit soyunun gelişimini desteklediğini, ancak endotelyal, düz kas ve hematopoietik hücrelerin farklılaşmasını azalttığını göstermektedir. SONUÇLAR / ÖNEM ES hücre farklılaşmasının ilk aşamaları sırasında seçici bir küçük moleküllü BMP inhibitörünün uygulanması, görünüşe göre diğer mezodermal soyların pahasına, ilkel pluripotent hücrelerin kardiyomiyositik soylara doğru farklılaşmasını büyük ölçüde teşvik eder. Dorsomorfin gibi gelişimsel yolların küçük molekül modülatörleri, kök hücre araştırmaları ve rejeneratif tıp için çok yönlü farmakolojik araçlar haline gelebilir. |
14300799 | Konuşmanın önemli bir özelliği basmakalıp 5 Hz ritmidir. Bir teori, bu ritmin ata primatlardaki ritmik yüz hareketlerinin modifikasyonu yoluyla geliştiğini öne sürüyor. Eğer hipotezin herhangi bir geçerliliği varsa, o zaman karşılaştırmalı bir yaklaşım biraz ışık tutabilir. Bu fikri, çiğnemeye karşı dudak şapırdatma (ritmik bir yüz ifadesi) sırasında makak maymunu ses yolunun iç dinamiklerini karakterize etmek ve ölçmek için sineradyografi (X-ışını filmleri) kullanarak test ettik. İnsanlar üzerinde yapılan önceki çalışmalar, konuşma hareketlerinin çiğneme hareketlerinden daha hızlı olduğunu ve ses yolu yapıları arasındaki işlevsel koordinasyonun iki davranış arasında farklı olduğunu göstermişti. Eğer ritmik konuşma atalardan kalma ritmik bir yüz hareketi yoluyla evrimleştiyse, o zaman bir hipotez, maymunun dudak şapırdatmasının çiğnemeye karşı da bu farklılıkları göstermesi gerektiğidir. Dudak şapırdatma sırasında dudakların, dilin ve hyoidin konuşmaya benzer 5 Hz'lik bir ritimle hareket ettiğini ancak çiğneme sırasında böyle bir hareket yapmadığını bulduk. En önemlisi, bu yapılar arasındaki işlevsel koordinasyon her davranış için farklıydı. Bu veriler, insan konuşma ritminin ata primatların ritmik yüz ifadelerinden evrimleştiği fikrine ampirik destek sağlıyor. |
14308244 | Neuregulin-1 (NRG1) ve reseptörü ErbB4, nörogelişimin çeşitli süreçlerini etkiler, ancak olgun beyinde bu sinyallemeyi düzenleyen mekanizmalar iyi bilinmemektedir. DISC1, birçok hücresel sürece aracılık eden çok işlevli bir iskele proteinidir. Burada olgun kortikal internöronlarda DISC1 ve NRG1-ErbB4 sinyalleşmesi arasında fonksiyonel bir ilişki sunuyoruz. Mutant DISC1 fare modeli de dahil olmak üzere in vitro ve in vivo hücre tipine özgü gen modülasyonuyla, DISC1'in NRG1'in indüklediği ErbB4 aktivasyonunu ve sinyalini inhibe ettiğini gösterdik. Bu etkiye muhtemelen ErbB4'ün PSD95'e bağlanmasının rekabetçi inhibisyonu aracılık etmektedir. Son olarak, nöronlar arası DISC1'in hızlı yükselen internöron-piramidal nöron devresindeki NRG1-ErbB4 aracılı fenotipleri etkilediğini gösterdik. Ölüm sonrası beyin analizleri ve bazı genetik çalışmalar şizofrenide sırasıyla nöronlar arası eksiklikler ve DISC1, NRG1 ve ErbB4 genlerinin rol oynadığını bildirmiştir. Sonuçlarımız, DISC1 ve NRG1-ErbB4 sinyalleri arasındaki çapraz konuşmanın bu açıklara katkıda bulunabileceği bir mekanizmayı önermektedir. |
14311986 | CD4+ T yardımcı 1 (Th1) ve T yardımcı 2 (Th2) alt gruplarının ayırt edici sitokin ekspresyonunun moleküler temeli hala belirsizliğini koruyor. Burada, temel bir bölge/lösin fermuar transkripsiyon faktörü olan proto-onkogen c-maf'ın, IL-4'ün dokuya spesifik ekspresyonunu kontrol ettiğini rapor ediyoruz. c-Maf, Th2'de eksprese edilir ancak Th1 klonlarında eksprese edilmez ve Th2 soyunda normal öncü hücre farklılaşması sırasında uyarılır ancak Th1 soyunda uyarılmaz. c-Maf, Th1 klonlarından değil, Th2'den elde edilen ekstreler tarafından kaplanan bir bölgeye bitişik proksimal IL-4 promoterindeki bir c-Maf yanıt elemanına (MARE) bağlanır. c-Maf'ın ektopik ekspresyonu, MARE ve Th2'ye özgü ayak izini haritalayan bir fonksiyon olan Th1 hücrelerinde, B hücrelerinde ve lenfoid olmayan hücrelerde IL-4 promotörünü işlemden geçirir. Ayrıca c-Maf, B hücreleri tarafından endojen IL-4 üretimini başlatmak üzere aktive edilmiş T hücrelerinin nükleer faktörü (NF-ATp) ile sinerji içinde hareket eder. C-Maf'ın manipülasyonu insan hastalıklarında Th alt grup oranlarını değiştirebilir. |
14315749 | Bu çalışmada, sirkadiyen gen ailesinin çekirdeğinde yer alan insan Saati (hClock) geninin kolorektal karsinomlarda (KRK) ekspresyonundaki değişiklikleri araştırmayı ve olası etkilerini tartışmayı amaçladık. Önceki çalışmalar, sirkadiyen ritimlerin bozulmasının, CRC'lerin başlatılmasına ve gelişmesine katkıda bulunan endojen faktörlerden biri olduğunu ortaya çıkarmıştır. Bununla birlikte, CRC'lerle ilişkili sirkadiyen genlerde altta yatan moleküler değişiklikler henüz araştırılmamıştır. HCLOCK proteininin ve gen ekspresyonunun immünofloresan ve kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (qPCR) analizi, 30 CRC vakasında gerçekleştirildi. hCLOCK proteini, 30 CRC hastasından elde edilen tüm numunelerde eksprese edildi. Eşleştirilmiş kanserli olmayan dokularla karşılaştırıldığında insan CRC dokularında daha yüksek hCLOCK ekspresyonu seviyeleri gözlendi. hCLOCK ekspresyonu, az farklılaşmış veya geç evre Dukes dereceli tümörlerde ve lenf nodu metastazı olan tümör vakalarının %64,3'ünde anlamlı derecede yüksekti. hClock geni tüm örneklerde eksprese edildi. Eşleştirilmiş kanserli olmayan dokularla karşılaştırıldığında insan CRC vakalarında önemli ölçüde daha yüksek bir hClock ekspresyonu bulundu. İnsan CRC'lerinde hClock gen ekspresyonu ile protein ekspresyonu arasında güçlü bir pozitif doğrusal korelasyon vardı. İnsan CRC'lerinde hClock gen ekspresyonu ile ARNT, HIF-1a ve VEGF ekspresyonu arasında da güçlü bir pozitif doğrusal korelasyon bulundu. hClock ile Bak, Bax, Bid, tümör nekroz faktör reseptörü I (TNFR I) ve TNFR II arasında anlamlı bir korelasyon yoktu. Sirkadiyen gen hClock, insan kolorektal mukozasında stabil bir şekilde eksprese edildi ve aşağı yönde saat kontrollü genlerin ekspresyonunun düzenlenmesinde önemliydi. hCLOCK, HIF-1a/ARNT ile etkileşime girebilir ve tümör anjiyogenezini ve metastazı uyarmak için VEGF'yi aktive edebilir. |
14319754 | ARKA PLAN Gelişmekte olan ülkelerde yüksek düzeyde aktif antiretroviral tedavi (HAART) yaygınlaştırılmaktadır. Düşük gelirli ve yüksek gelirli ortamlardaki HIV-1 ile enfekte hastalar arasında HAART'ın ilk yılındaki temel özellikleri ve sonuçları karşılaştırdık. YÖNTEMLER Afrika, Asya ve Güney Amerika'daki (düşük gelirli ortamlar) 18 HAART programı ve Avrupa ve Kuzey Amerika'daki (yüksek gelirli ortamlar) 12 HIV kohort çalışması, HAART'a başlayan, daha önce tedavi görmemiş yetişkin hastalar için sırasıyla 4810 ve 22.217 veri sağladı. . Yüksek gelirli ortamlardan tüm hastalar ve düşük gelirli ortamlardan 2725 (%57) hasta aktif olarak takip edildi ve hayatta kalma analizlerine dahil edildi. BULGULAR Yüksek gelirli ülkelerle karşılaştırıldığında, düşük gelirli ortamlarda HAART'a başlayan hastaların CD4 hücre sayıları daha düşüktü (muL başına ortalama 108 hücreye karşı muL başına 234 hücre), kadın olma olasılıkları daha yüksekti (%51'e karşı %25) ve daha fazlaydı. nükleosid olmayan bir ters transkriptaz inhibitörü (NNRTI) ile tedaviye başlama olasılığı yüksektir (%70'e karşı %23). 6 ayda, kazanılan ortalama CD4 hücresi sayısı (muL başına 106 hücreye karşı muL başına 103 hücre) ve 500 kopya/mL'nin altında HIV-1 RNA seviyelerine ulaşan hastaların yüzdesi (%76'ya karşı %77) benzerdi. Düşük gelirli ortamlarda mortalite (2236 kişi-yıllık takip sırasında 124 ölüm), yüksek gelirli ortamlara (20.532 kişi-yılı boyunca 414 ölüm) göre daha yüksekti. Düşük gelirli ortamlarla yüksek gelirli ortamları karşılaştıran düzeltilmiş mortalite tehlike oranı (HR), ilk ayda 4,3'ten (%95 GA 1,6-11,8) 7-12 aylarda 1,5'e (0,7-3,0) düştü. Düşük gelirli ortamlarda tedavinin ücretsiz sağlanması daha düşük ölüm oranıyla ilişkilendirildi (düzeltilmiş HR 0,23; %95 GA 0,08-0,61). YORUM Kaynakların kısıtlı olduğu ortamlarda HAART'a başlayan hastalarda, gelişmiş ülkelerdekilerle karşılaştırıldığında tedavinin ilk aylarındaki ölüm oranlarında artış görülmüştür. Zamanında teşhis ve tedavi uygunluğunun değerlendirilmesi, HAART'ın ücretsiz sağlanmasıyla birleştiğinde bu fazla mortaliteyi azaltabilir. |
14328288 | ARKA PLAN Memeli fosfoinositid 3-kinazları (PI 3-kinazları), reseptör aracılı sinyal transdüksiyonunda rol oynar ve hücresel fosfatidilinositol (3,4,5)-trisfosfatın yükseltilmesindeki rolleri aracılığıyla transformasyon ve mitogenez gibi süreçlerde rol oynar. Ek olarak, fosfatidilinositol 3-fosfat üreten bir PI 3-kinaz aktivitesinin, mayada protein ticareti için gerekli olduğu gösterilmiştir. SONUÇLAR PI 3-kinazların korunmuş katalitik alanına karşılık gelen bir bölgeyi çoğaltmak için polimeraz zincir reaksiyonuna dayalı bir yaklaşım kullanarak Drosophila'da üç farklı PI 3-kinazdan oluşan bir aile belirledik. Bu aile üyelerinden biri olan PI3K_92D, prototip PI 3-kinaz p110 alfa ile yakından ilişkilidir; PI3K_59F, Vps34p'ye homologdur, oysa üçüncüsü olan PI3K_68D, Drosophila yaşam döngüsü boyunca geniş çapta eksprese edilen yeni bir PI 3-kinazdır. PI3K_68D cDNA, 210 kDa'lık bir proteini kodlar; bu protein, p110 PI 3-kinazların p85 adaptör proteinlerine bağlanmasında rol oynayan dizilerden yoksundur, ancak SH3 alanlarına bağlanabilen bir amino terminali prolin açısından zengin dizi ve bir karboksi terminali C2 içerir. ihtisas. Biyokimyasal analizler, PI3K_68D'nin in vitro yeni bir substrat spesifikliğine sahip olduğunu, fosfatidilinositol ve fosfatidilinositol 4-fosfatla sınırlı olduğunu ve p110 için in vivo substrat olarak ima edilen fosfatidilinositol (4,5)-bisfosfatı fosforile edemediğini göstermektedir. SONUÇLAR Drosophila'da PI3K_68D tarafından temsil edilen yeni bir sınıf da dahil olmak üzere bir PI 3-kinaz ailesi anlatılmıştır. PI3K_68D, SH3 alanlarını içeren sinyal moleküllerine bağlanma potansiyeline sahiptir, p85-adaptör bağlama dizilerinden yoksundur, Ca(2+)'dan bağımsız bir fosfolipit bağlama alanına sahiptir ve sınırlı bir in vitro substrat spesifikliği sergiler, dolayısıyla yeni bir sinyal tanımlayabilir iletim yolu. |
14332945 | İnsan kanserleri, onkogen kaynaklı DNA replikasyon stresinin (DRS) varlığıyla karakterize edilir ve bu da onları hasarlı DNA replikasyon çatalları için kırılma kaynaklı replikasyon (BIR) gibi onarım yollarına bağımlı hale getirir. BIR'ı daha iyi anlamak için, onkogenik siklin E aşırı eksprese edildiğinde tükenmesi G1'den S fazına ilerlemeyi inhibe eden genler için hedefli bir siRNA taraması gerçekleştirdik. Farelerde normal gelişim için vazgeçilmez bir gen olan RAD52, en çok arananlar arasındaydı. Çatal çökmesinin onkogenler veya kimyasallar tarafından indüklendiği hücrelerde Rad52 proteini, DRS odaklarına lokalize oldu. Rad52'nin siRNA tarafından tükenmesi veya genin CRISPR/Cas9 tarafından nakavt edilmesi, çöken çatalların yeniden başlatılmasını tehlikeye attı ve DRS yaşayan hücrelerde DNA hasarına yol açtı. Ayrıca kansere yatkın, heterozigot APC mutant farelerde, Rad52 geninin homozigot silinmesi, tümör büyümesini bastırdı ve ömrünü uzattı. Bu nedenle memeli RAD52'nin, kanser hücrelerinde çökmüş DNA replikasyon çatallarının onarımını kolaylaştırdığını öneriyoruz. |
14333540 | Nöral krest (NC) hücreleri dorsal nöral tüpte (NT) ortaya çıkar ve birçok farklı hücre tipine dönüşmek üzere embriyoya göç eder. Çözülmemiş önemli bir soru, NC hücrelerinin kaderinin ne zaman ve nasıl belirleneceğidir. Kaderleri göç sırasında veya sonrasında belirlenen çok potansiyelli NC hücrelerine dair yaygın kanıtlar vardır. Ayrıca NC'nin halihazırda NT içindeki farklı öncüllerin alt popülasyonlarına bölünmüş olduğuna dair bazı kanıtlar da vardır. Bu soruyu fare embriyosunda araştırdık. NT'nin en dorsomedial yönündeki hücrelerin bir alt popülasyonunun, reseptör tirozin kinaz Kitini (daha önce c-kit olarak biliniyordu) eksprese ettiğini, yalnızca gelişmekte olan dermise göç ettiğini ve ardından melanosit soyunun kesin belirteçlerini eksprese ettiğini bulduk. Dolayısıyla bunlar melanosit progenitör hücreleridir. Ağırlıklı olarak orta beyin-arka beyin kavşağında ve servikal gövdede üretilirler, ayrıca önemli sayıda alt gövdede de üretilirler. Dorsal NT içindeki diğer hücreler Kit-'dir, ventral olarak göç eder ve embriyonik 9.5. günden itibaren nörotrofin reseptörü p75'i eksprese eder. Bu hücreler büyük olasılıkla yalnızca nöronlar ve glia gibi ventral NC türevlerine yol açar. p75+ hücreleri NT'de bu iki hücre tipinin bulunduğu bölgelerde Kit+ hücrelerinin ventrolateralinde bulunur. Bu veriler, fare nöral tüpü içindeki NC soy ayrımı için doğrudan in vivo kanıt sağlar. |
14337960 | Sıtmanın bir ülkenin tamamından veya bir kısmından ortadan kaldırılmasına yönelik kararlar, bir dizi karmaşık faktörü içerir ve bu karmaşıklık, başta "kontrol" ve "ortadan kaldırma" olmak üzere bazı temel terminolojiyi çevreleyen belirsizlikle daha da artar. Kaynak ve operasyonel tahminde bulunmak imkansızdır. Son noktalar net bir şekilde tanımlanmamış olsa bile, Küresel Sıtmayı Azaltma Programı sırasında bile, "yok etme"nin kesin tanımı üzerinde tartışmalar alevlendi. "Eleme" ve "kontrol"ün anlamına ilişkin benzer tartışmalar, bu terimlere rağmen bugün temelde mevcut değildir. Program planlamasının temel önemi. Bu konularla ilgili çağdaş tartışmayı ilerletmek için bu makale, bu kavramların mevcut anlayışını bağlamsallaştırmaya yardımcı olmak amacıyla kontrol, eleme ve ortadan kaldırma dahil olmak üzere yaygın olarak kullanılan terimlerin tarihsel bir incelemesini sunmaktadır. İnceleme, ithalatın ardından sıtma vakalarının çoğalmasını tanımlayan basit dallanma süreci modelleri aracılığıyla, bu tanımların dayandığı temel matematiksel kavramların analizi ile desteklenmiştir. Bu analiz aracılığıyla, sıtma kontrolü ve eliminasyon programlarına pratik bir dizi stratejik kilometre taşı sağlamak için yararlı olan pragmatik tanımların önemi vurgulanmakta ve özellikle mevcut eleme anlayışlarının bu gereklilikleri karşılamada başarısız olduğu ileri sürülmektedir. Tüm ülkelere kesin hedefler sağlamak amacıyla, eski "kontrol" (burada tam olarak "kontrollü düşük endemik sıtma" olarak adlandırılmaktadır) ve "ortadan kaldırma" hedeflerini daha net bir şekilde tanımlayan yeni kavramsal tanımlar önerilmektedir. "Kontrollü endemik olmayan sıtma" olarak adlandırılan durum, endemik bulaşmanın kesintiye uğradığı epidemiyolojik durumu tanımlamak için gereklidir, ancak ithal enfeksiyonlardan ileri bulaşmadan kaynaklanan sıtma, eliminasyonun sağlanamadığı yeterince yüksek bir seviyede meydana gelmeye devam etmektedir. Son olarak, bu kavramları belirli bir ortam için ilgili, ölçülebilir ve ulaşılabilir kılmak için gerekli olacak ayrı operasyonel tanımları ve ölçümleri türetmeye yönelik kılavuzlar tartışılmaktadır. |
14338915 | CENP-A'nın sentromerlere spesifik olarak dahil edilmesini sağlayan mekanizmalar yeterince anlaşılmamıştır. Mis16 ve Mis18, sentromerlerdeki CENP-A lokalizasyonu için gereklidir ve fisyon mayasından insana kadar korunan bir kompleks oluşturur. Kinetochore alan susturmayı hafifleten fisyon mayası sim1 mutantları, tomurcuklanan maya Scm3(Sc)'nin ortologu olan Scm3(Sp)'de kusurludur. Scm3(Sp), sentromer lokalizasyonu için Mis16/18'e bağlıdır ve onlar gibi geç anafazda sentromerlere alınır. Önemli olarak, Scm3(Sp) ortak afinitesi CENP-A(Cnp1) ile saflaştırılır ve in vitro CENP-A(Cnp1) ile birleşir, ancak sağlam CENP-A(Cnp1) kromatinden bağımsız olarak lokalize olur ve kromatinden farklı şekilde salınır. Scm3(Sc)'nin, tomurcuklanan maya noktası sentromerlerinde CENP-A(Cse4) ve histon H4 ile benzersiz bir heksamerik nükleozom oluşturması önerilmiş olsa da, Scm3(Sp)'nin CENP-A(Cnp1) reseptörü olarak görev yaptığı bir modeli tercih ediyoruz. /assembly faktörü, Mis16 ve Mis18 ile işbirliği yaparak Sim3 eskortundan CENP-A'yı (Cnp1) alır ve CENP-A'nın (Cnp1) subkinetokor kromatine toplanmasına aracılık eder. |
14340571 | Arka Plan Çölyak hastalığı malabsorbsiyon, besin eksikliği ve çeşitli klinik belirtilerle karakterize, ince bağırsakta inflamatuar bir hastalıktır. Diyet glutenine karşı uygunsuz bir bağışıklık tepkisinden kaynaklanır ve glutensiz bir diyetle tedavi edilir. Son zamanlarda yapılan beslenme çalışmaları yulafın çölyak hastalığı hastaları için güvenli olduğunu göstermiştir ve yulaf artık sıklıkla çölyak hastalığı diyetine dahil edilmektedir. Bu çalışmanın amacı çölyak hastalığında yulaf intoleransının var olup olmadığını araştırmak ve bu intoleransın altında yatan hücreleri ve süreçleri karakterize etmektir. Yöntemler ve Bulgular Çalışma için yulaf maruziyeti öyküsü olan çölyak hastalığı olan dokuz yetişkini seçtik. Hastalardan dördünün yulaf içeren bir diyetle ilgili klinik semptomları vardı ve bu dört hastanın üçünde yulaf maruziyeti sırasında çölyak hastalığına özgü bağırsak iltihabı vardı. Bu üç hastadan ve ayrıca yulafı tolere ettiği görülen diğer iki hastadan yulaf avenin spesifik ve reaktif bağırsak T hücre çizgileri oluşturduk. Avenin reaktif T hücre çizgileri, HLA-DQ2 bağlamında avenin peptidlerini tanıdı. Bu peptitler, buğday glüteni epitoplarına çok benzeyen, prolin ve glutamin kalıntıları açısından zengin dizilere sahiptir. Avenin epitop oluşumunda doku transglutaminazının deamidasyonu (glutamin→glutamik asit dönüşümü) rol oynamıştır. Sonuçlar Bazı çölyak hastalığı hastalarının, mukozal enflamasyona neden olabilen avenin reaktif mukozal T hücrelerine sahip olduğu sonucuna vardık. Yulaf intoleransı, yulaf yiyen ancak bunun dışında sıkı bir glutensiz diyet uygulayan çölyak hastalığı olan hastalarda villöz atrofi ve inflamasyonun bir nedeni olabilir. Yulaf yiyen çölyak hastalarının klinik takibi önerilir. |
14361849 | Giriş Bu çalışmayı, kardiyojenik pulmoner ödemi olan hastalarda iki seviyeli pozitif hava yolu basıncı (BiPAP) noninvaziv ventilasyonla karşılaştırıldığında sürekli pozitif hava yolu basıncının (CPAP) potansiyel yararlı ve olumsuz etkilerini araştırmak için gerçekleştirdik. Yöntem Cochrane Kontrollü Çalışmalar Kaydı (2005 sayı 3) ve EMBASE ve MEDLINE veritabanlarından (1966 - 1 Aralık 2005) kardiyojenik akciğer ödemi olan hastalarda CPAP ve BiPAP tedavisini karşılaştıran, dil kısıtlaması olmayan randomize kontrollü çalışmaları dahil ettik. İki incelemeci çalışmaların kalitesini inceledi ve bağımsız olarak veri çıkarımı gerçekleştirdi. Sonuçlar Kardiyojenik akciğer ödemi olan toplam 290 hastayı içeren yedi randomize kontrollü çalışma değerlendirmeye alındı. Hastane mortalitesi (göreceli risk [RR] 0,76, %95 güven aralığı [CI] 0,32–1,78; P = 0,52; I2 = %0) ve invaziv ventilasyon gerektirme riski (RR 0,80, %95 CI 0,33–1,94; P = 0,62; I2 = %0, CPAP ile tedavi edilen hastalar ile BiPAP ile tedavi edilenler arasında anlamlı farklılık yoktu. BiPAP tedavisi sırasında sabit ya da titre edilmiş basınç kullanan ve hiperkapnisi olan ya da olmayan hastaları kapsayan çalışmalar, sonuçları değiştirmedi. Pulmoner ödem çözülene kadar gerekli noninvazif ventilasyon süresi (saat olarak ağırlıklı ortalama fark [WMD] = 3,65, %95 CI -12,12 ila +19,43; P = 0,65, I2 = %0) ve hastanede kalış süresi (gün olarak WMD) = -0,04, %95 GA -2,57 ila +2,48; P = 0,97, I2 = %0 da iki grup arasında anlamlı farklılık yoktu. Mevcut sınırlı verilere dayanarak, BiPAP ile tedavi edilen hastalarda yeni başlangıçlı akut miyokard enfarktüsünde artış yönünde önemsiz bir eğilim vardı (RR 2,10, %95 CI 0,91–4,84; P = 0,08; I2 = %25,3).SonuçBiPAP, Akut kardiyojenik akciğer ödemi olan hastalarda CPAP'a göre önemli klinik faydalar sağlar. Büyük bir randomize kontrollü çalışma, akut kardiyojenik pulmoner ödemi olan hastalarda BiPAP'ın CPAP'a karşı anlamlı klinik faydası ve maliyet etkinliğini gösterene kadar, yöntem seçimi esas olarak mevcut ekipmana bağlı olacaktır. |
14362678 | Mitokondriyal geçirgenlik geçiş gözeneği (mPTP), kronik β-adrenerjik reseptör (β-AR) uyarımı sırasında kalp fonksiyon bozukluğunda rol oynar. Kronik β-AR stimülasyonunun mPTP açıklıklarına yol açma mekanizması anlaşılması zor. Burada, kronik izoproterenol (ISO) uygulamasının mPTP açıklıklarının sıklığını sürekli olarak arttırdığını, ardından mitokondriyal hasar ve kalp fonksiyon bozukluğunu gösterdiğini gösteriyoruz. Mekanik olarak bu etkiye, mitokondriyal fisyon proteini, dinaminle ilişkili protein 1'in (Drp1) fosforilasyonu ve serin 616 (S616) bölgesinde Ca2+/kalmodulin bağımlı kinaz II (CaMKII) aracılık eder. Bu fosforilasyon bölgesinin mutasyona uğratılması veya Drp1 aktivitesinin inhibe edilmesi, CaMKII veya ISO kaynaklı mPTP açılmasını ve in vitro miyosit ölümünü bloke eder ve in vivo kalp hipertrofisini kurtarır. Arızalı insan kalplerinde S616'da Drp1 fosforilasyonu artar. Bu sonuçlar, CaMKII, Drp1 ve mPTP'yi kalpteki mitokondriyal fonksiyon bozukluğu ile sitozolik stres sinyali arasında köprü kurmak için bağlayan kronik β-AR stimülasyonunun aşağısındaki bir yolu ortaya çıkarır. |
14362780 | MikroRNA'ların (miRNA'lar) bulaşıcı hastalıklardaki rolü giderek daha belirgin hale geliyor ve miRNA'ların bir teşhis aracı olarak kullanımı ve bunların terapötik uygulamaları, araştırmanın ana odağı haline geldi. Bu çalışmanın amacı, gastroenterite neden olan, gıda kaynaklı bir patojen olan Arcobacter (A.) butzleri enfeksiyonuna yanıt olarak makrofajların immün sinyallemesinde yer alan miRNA'ları tanımlamaktı. Bu nedenle birincil insan makrofajları izole edildi ve enfekte edildi ve miRNA ekspresyonu, RNAseq aracılığıyla araştırıldı. Verilerin analizi, daha önce miR-155, miR-125 ve miR-212 gibi bakteriyel enfeksiyonlarla ilişkilendirilen çeşitli miRNA'ların ekspresyonunu ortaya çıkardı. Dengeli bir bağışıklık tepkisi oluşturmak için ince ayarlayıcılar olarak görev yaptıkları Toll benzeri reseptör sinyallemesinde önemli bir rol oynadıkları gösterildi. Ek olarak, miR-3613, miR-2116, miR-671, miR-30d ve miR-629 gibi bakteriyel enfeksiyonlar sırasında henüz tanımlanamayan miRNA'lar, A. butzleri ile enfekte olmuş hücrelerde farklı şekilde düzenlenmiştir. Bu miRNA'ların hedefleri, A. butzleri patogenezinde rol oynayabilecek apoptoz ve endositoz gibi yollarda birikmiştir. Çalışmamız, enfeksiyon sırasında makrofajlarda altta yatan düzenleyici mekanizmaların anlaşılmasına yardımcı olarak, A. butzleri'nin insandaki doğuştan gelen bağışıklık hücreleriyle etkileşimi hakkında yeni bulgulara katkıda bulunmaktadır. |
14367469 | İnsan Dönemi 2 (hPer2), saati sürdüren negatif geri besleme döngüsünün üretilmesinden sorumlu olan sirkadiyen saat mekanizmasının merkezinde yer alan bir transkripsiyonel düzenleyicidir. İnsan hastalıklarıyla olan ilişkisi, çok sayıda biyokimyasal ve fizyolojik süreci etkileyen işlevindeki değişikliklerle vurgulanmaktadır. Yokluğunda çeşitli kanserlerin gelişmesine ve hücrenin genotoksik strese duyarlılığının artmasına neden olur. Bu nedenle sirkadiyen bileşenlerin çevresel stres sinyallerini DNA hasarı tepkisine entegre ettiği henüz tanımlanmamış bir kontrol noktası düğümü tanımlamaya çalıştık. hPer2'nin insan p53'ün (hp53) C-terminal yarısına bağlandığını ve hp53'ün negatif regülatörü Mdm2 ile stabil bir trimerik kompleks oluşturduğunu bulduk. hPer2'nin hp53'e bağlanmasının, Mdm2'nin her yerde bulunmasını ve proteazom tarafından hp53'ü hedeflemesini önlediğini belirledik. hPer2 ekspresyonunun aşağı regülasyonu doğrudan hp53 seviyelerini etkilerken, aşırı ekspresyonu hem hp53 protein stabilitesini hem de hedeflenen genlerin transkripsiyonunu etkiler. Genel olarak bulgularımız, hızlı, hp53 aracılı, transkripsiyonel bir yanıta ihtiyaç duyulduğunda hücrenin ön koşullandırılması için bazal hp53 seviyelerinin mevcut olmasını sağlayarak hPer2'yi doğrudan hp53 aracılı yanıtın kalbine yerleştirir. |
14376683 | Zarfsız basiliform virüsler, dairesel çift sarmallı DNA'dan oluşan bir genoma sahip olduğu bilinen ikinci grup bitki virüsleridir. Viral transkripti karakterize ettik ve bu grubun bir üyesi olan Commelina yumuşak benekli virüsün (CoYMV) genomunun tam dizisini belirledik. Viral transkriptin analizi, virüsün tek bir terminal olarak yedekli genom uzunluğu artı 120 nükleotid transkripti kodladığını gösterir. Transkriptlerin bir kısmı poliadenile edilmiştir, ancak transkriptin çoğunluğu poliadenile edilmemiştir. Genom dizisinin analizi, genomun 7489 bp boyutunda olduğunu ve kopyalanan ipliğin 23, 15 ve 216 kd'lik proteinleri kodlayabilen üç açık okuma çerçevesi içerdiğini gösterir. 25 ve 15 kd proteinlerinin işlevi bilinmemektedir. 216 kd polipeptit ile karnabahar mozaik virüsü kat proteini ve proteaz/ters transkriptaz poliproteini arasındaki benzerlikler, 216 kd polipeptitin, viryon kılıf proteini, bir proteaz ve replikaz (ters transkriptaz ve ribonükleaz H) verecek şekilde proteolitik olarak işlenen bir poliprotein olduğunu gösterir. ). CoYMV genomunun her bir ipliği, bölgeye özgü süreksizlikler tarafından kesintiye uğrar. Bu süreksizliklerin 5'-uçlarının konumları ve CoYMV transkripti üzerinde sitozolik başlatıcı metiyonin tRNA'nın 3'-ucuyla tavlanma kapasitesine sahip bir bölgenin varlığı ve konumu, ters transkripsiyonla replikasyon ile tutarlıdır. 1.3 CoYMV genomu içeren bir yapının, Agrobacterium aracılı enfeksiyon kullanılarak CoYMV'nin konakçısı Commelina diffusa'ya dahil edildiğinde bulaşıcı olduğunu gösterdik. |
14380875 | Glukokortikoidler, interlökin-8 (IL-8) ve ICAM-1 gibi proinflamatuar genlerin NFkappaB aracılı aktivasyonunu baskılar. Deneylerimiz, glukokortikoid reseptörünün (GR), bu etkiyi, bu genlerin her birine bağlı NFkappaB ile protein-protein etkileşimleri yoluyla ilişkilendirerek sağladığını göstermektedir. Yani, reseptörün DNA bağlanma ve dimerizasyon fonksiyonlarını içeren GR çinko bağlanma bölgesinin (ZBR), in vitro olarak NFkappaB'nin RelA alt biriminin dimerizasyon alanına doğrudan bağlandığını ve ZBR'nin bağlanmak için yeterli olduğunu gösterdik. RelA, in vivo olarak NFkappaB yanıt elemanlarına bağlandı. Ayrıca GR'nin NFkappaB tarafından DNA bağlanmasını bozmadığını in vivo ve in vitro olarak gösterdik. Geçici transfeksiyonlarda, GR ligandı bağlama alanının NFkappaB'nin baskılanması için gerekli olduğunu ancak onunla birleşme için gerekli olmadığını ve GR'nin heterolog bir aktivasyon alanı taşıyan bir NFkappaB türevini baskılayabildiğini bulduk. Bağlı GR'nin NFkappaB ile aktifleştirilmiş transkripsiyonu baskıladığı mekanizmayı anlamak için transfekte edilmemiş A549 hücrelerinde kromatin immünopresipitasyon analizlerini kullandık. Beklendiği gibi, inflamatuar sinyal TNFalfa'nın IL-8 ve ICAM-1 promotörlerinde ön başlatma kompleksi (PIC) düzeneğini uyardığını ve bu komplekslerdeki RNA polimeraz II'nin (pol II) en büyük alt biriminin serin 2 ve 5'te fosforile edildiğini bulduk. karboksi terminal alanında (CTD) heptapeptid tekrarları (YSPTSPS); bu değişiklikler transkripsiyonun başlatılması için gereklidir. Dikkat çekici bir şekilde GR, baskılayıcı koşullar altında PIC düzeneğini inhibe etmedi, bunun yerine pol II CTD'nin serin 2'sinin fosforilasyonuna müdahale etti. |
14386505 | Miyeloid hücreler geniş proinflamatuar, yıkıcı ve yeniden yapılanma kapasiteleri sayesinde kronik inflamatuar hastalıklarda önemli roller oynarlar. CD200, çeşitli hücre tiplerinde geniş çapta eksprese edilirken, yakın zamanda tanımlanan CD200R, miyeloid hücreler ve T hücrelerinde eksprese edilir. İn vivo CD200 silinmesi, miyeloid hücre düzensizliğine ve otoimmün enflamasyona karşı duyarlılığın artmasına neden olur; bu, CD200-CD200R etkileşiminin immün baskılamada rol oynadığını gösterir. Bu çalışmada CD200R agonistlerinin fare ve insan miyeloid hücre fonksiyonunu in vitro olarak baskıladığını ve ayrıca reseptör ekspresyonu ile hücresel inhibisyon arasında bir doz ilişkisi tanımladığını gösterdik. Fare peritoneal makrofajlarından IFN-gamma ve IL-17 ile uyarılan sitokin salgılanması, CD200R etkileşimi ile inhibe edildi. LPS ile uyarılan yanıtlar etkilenmediğinden, engelleyici etkiler evrensel değildi. U937 hücre sitokin üretiminin inhibisyonu, CD200R ekspresyon seviyeleri ile korelasyon gösterdi ve inhibisyon, yalnızca CD200R agonistlerinin daha fazla çapraz bağlanması durumunda düşük CD200R eksprese eden hücrelerde gözlemlendi. Tetanoz toksoidinin neden olduğu insan PBMC IL-5 ve IL-13 salgılanması, CD200R agonistleri tarafından inhibe edildi. Bu inhibisyon, CD200R'nin monositler üzerinde çapraz bağlanmasına bağlıydı ancak CD200R'nin CD4+ T hücreleri üzerinde çapraz bağlanmasına bağlı değildi. Toplamda, CD200-CD200R etkileşiminin hem fare hem de insan sistemlerinde monosit/makrofaj fonksiyonunu kontrol ettiğine dair doğrudan kanıt sağlıyoruz ve ayrıca CD200R agonistlerinin kronik inflamatuar hastalıkların tedavisi için potansiyel klinik uygulamasını destekliyoruz. |
14390137 | AMAÇ Hepatit C (HCV) enfeksiyonu, test ve tedavi oranları, şizofreni, madde kullanım bozukluğu veya birlikte ortaya çıkan şizofreni veya şizoaffektif bozukluk ve madde kullanım bozukluğu olan hastalar ile bir kontrol grubu arasında karşılaştırıldı. YÖNTEMLER Kuzeybatı Gaziler Sağlık İdaresi'ne bağlı 293.445 hasta hakkında bilgi elde edildi. BULGULAR Madde kullanım bozukluğu grubu örneklemin yüzde 13,6'sını oluşturuyordu; şizofreni grubu yüzde 1,6; ve birlikte ortaya çıkan bozukluklar grubu, yüzde 1,4. Bu grupların HCV testi yaptırma olasılıkları sırasıyla kontrol grubuna göre yaklaşık dört, iki ve altı kat daha fazlaydı ve enfekte olma olasılıkları da yaklaşık yedi, iki ve sekiz kat daha fazlaydı. Madde kullanan grupta ve eşlik eden bozuklukları olan grupta interferon (IFN) tedavisi oranı anlamlı derecede düşüktü. Ancak farklılıkların boyutu önemli değildi; bu da bu yüksek riskli grupların IFN tedavisinden dışlanmadığını gösteriyor. |
14395738 | Sahra altı Afrika'da yapılan araştırmalar, yoksulluk nedeniyle savunmasız hale gelen çocukların HIV'den orantısız bir şekilde etkilendiğini ve birçoğunun anneden çocuğa bulaşma yoluyla HIV'e maruz kaldığını gösteriyor. HIV ile yaşayan gençlerin hayat kurtaran tedavi rejimlerine uyumları, ailelerini zorlayan ve aynı zamanda sağlık sorunlarını daha da kötüleştiren karmaşık ekonomik ve sosyal koşullardan muhtemelen etkilenecektir. Ulusal Çocuk ve İnsan Gelişimi Enstitüsü (NICHD) tarafından finanse edilen Suubi+Adherence çalışmasından elde edilen temel verileri kullanarak, bireysel ve bileşik eşitlik ölçümlerinin, 10-16 yaşlarındaki Ugandalı ergenler (n = 702) arasında kişisel olarak bildirilen bağlılığı ne ölçüde öngördüğünü inceledik. HIV'le yaşamak. Sonuçlar, daha fazla varlık sahipliğinin, özellikle de ailenin yedi veya daha fazla maddi varlığa sahip olmasının, kişinin bildirdiği bağlılık oranının daha yüksek olmasıyla ilişkili olduğunu gösterdi (OR 1,69, %95 GA: 1,00-2,85). Analizlerimiz ayrıca en yakın sağlık kliniğine olan mesafenin gençlerin ARV rejimine bağlılığını etkilediğini gösterdi. Kliniğe en yakın yerde yaşadığını bildiren gençlerin optimal uyumu bildirme olasılıkları önemli ölçüde daha yüksekti (OR 1,49, %95 GA: 0,92-2,40). Ayrıca, bileşik eşitlik puanlarını uygulayarak, hanehalkı varlıklarına sahip olma, finansal tasarruf ve bakıcı istihdamı açısından daha fazla ekonomik avantaja sahip olan ergenlerin uyum oranlarının 1,70 (%95 GA: 1,07-2,70) oranında daha yüksek olduğunu bulduk. Bu bulgular, ekonomik ve sosyal eşitsizliklere yönelik müdahalelerin, özellikle Sahra altı Afrika'da ekonomik açıdan savunmasız gençler arasında antiretroviral tedavi (ART) alımını artırmada faydalı olabileceğini düşündürmektedir. Bu, ekonomik açıdan savunmasız HIV'li gençler arasında ART'ye uyumda eşitlik sorununu ele alan ilk çalışmalardan biridir. |
14402338 | Hücresel metabolizmayı oluşturan yollar birbirine oldukça bağlıdır ve bireysel enzimlerdeki değişikliklerin geniş kapsamlı etkileri olabilir. Sonuç olarak, gen ekspresyonunu ölçen global profil oluşturma yöntemleri, bireysel bir fonksiyonun kaybının hücreyi nasıl etkileyeceğini tahmin etmede sınırlı değere sahiptir. Bu çalışmada Mycobacterium tuberculosis'in büyümesi için gerekli genleri doğrudan tanımlamak için yeni bir küresel fenotipik profil oluşturma yöntemi kullandık. Farklı koşullara maruz kalan karmaşık mutant kitaplıkların bileşimini karakterize etmek için yüksek yoğunluklu mutajenez ve derin dizilemenin bir kombinasyonu kullanıldı. Bu, Mtb'nin in vitro büyümesi için gerekli olan genlerin kesin olarak tanımlanmasına olanak sağladı ve önceki yaklaşımlara göre önemli bir gelişme olduğu kanıtlandı. Konakçıda kalıcılık için gerekli olan fonksiyonları daha fazla araştırmak amacıyla enfeksiyon sırasında kritik bir karbon kaynağı olan kolesterolün kullanımı için gerekli yolları tanımladık. Tanımladığımız genlerin çok azı daha önce transkripsiyonel profilleme yoluyla bu adaptasyona dahil edilmişti ve yalnızca bir kısmı sterol katabolik fonksiyonlarını kodladığı bilinen kromozomal bölgede kodlanmıştı. Bu genler, fare dokusunda bakteriyel büyüme için gerekli olduğu daha önce gösterilenlerin beklenmedik derecede büyük bir yüzdesini içermektedir. Dolayısıyla bu tek beslenme değişikliği, konakçıya adaptasyonun önemli bir kısmını oluşturur. Bu çalışma, bugüne kadar bir sterol katabolik yolunun en kapsamlı genetik karakterizasyonunu sağlıyor, karakterize edilmemiş virülans genleri için varsayılan roller öneriyor ve potansiyel ilaç hedeflerini kodlayan genleri tam olarak haritalandırıyor. |
14405193 | Reseptör ticaretinin seçici kontrolü, uyarıcı sinapsların reseptör kompozisyonunun yeniden modellenmesi için bir mekanizma sağlar ve dolayısıyla sinaptik iletimi, plastisiteyi ve gelişimi destekler. GluN3A (eski adıyla NR3A), yalnızca GluN1 ve GluN2 alt birimlerinden oluşan NMDAR'lara kıyasla NMDAR kanallarına düşük kalsiyum geçirgenliği ve azaltılmış magnezyum duyarlılığı sağlayan NMDA reseptörü (NMDAR) alt birim ailesinin geleneksel olmayan bir üyesidir. Bu özel özelliklerden dolayı GluN3A alt birimleri, uyarıcı sinapsların plastisitesini ve olgunlaşmasını sınırlamak için moleküler bir fren görevi görür ve GluN3A'nın çıkarılmasının nöronal devrelerin gelişiminde kritik bir adım olduğuna işaret eder. Ancak GluN3A'nın endositik uzaklaştırılmasına aracılık eden moleküler sinyaller belirsizliğini koruyor. Burada GluN3A'nın sitoplazmik C-terminal kuyruğunda yer alan ve bunun klatrin adaptör AP2'ye bağlanmasına aracılık eden yeni bir endositik motifi (YWL) tanımlıyoruz. GluN3A endositik motifi içindeki alanin mutasyonları, klatrine bağımlı içselleştirmeyi inhibe etti ve hücre yüzeyinde GluN3A içeren NMDAR'ların birikmesine yol açtı; oysa tirozin kalıntısının fosforilasyonunu taklit etmek, rekombinantta immünositokimyasal ve elektrofizyolojik yaklaşımlarla gösterildiği gibi içselleştirmeyi teşvik etti ve hücre yüzeyi ifadesinin azalmasını sağladı. Birincil kültürdeki sistemler ve sıçan nöronları. Ayrıca tirozin kalıntısının Src ailesi kinazları tarafından fosforile edildiğini ve Src aktivasyonunun nöronlarda yüzey GluN3A ekspresyonunu sınırladığını gösterdik. Sonuçlarımız birlikte, GluN3A içeren reseptörlerin fonksiyonel yüzey ekspresyonunu GluN3A alt birimlerinin fosforilasyon durumuyla birleştiren GluN3A içselleştirmesi için yeni bir moleküler sinyal tanımlar ve sinaptik plastisite ve nörogelişim için çıkarımlarla NMDAR alt birim kompozisyonunun düzenlenmesi için moleküler bir çerçeve sağlar. . |
14407673 | GEREKÇE Transkripsiyon faktörü Krüppel benzeri faktör 2'nin (KLF2) hemizigot eksikliğinin, hiperkolesterolemik farelerde aterosklerozu arttırdığı daha önce gösterilmiştir. Ancak KLF2 eksikliğine bağlı artan aterosklerozdan sorumlu olan hücre tipi tanımlanamamıştır. Bu çalışma, aterosklerozda miyeloid hücreye özgü KLF2 inaktivasyonunun sonucunu inceledi. YÖNTEMLER VE SONUÇLAR Hücreye özgü nakavt fareler, Cre/loxP rekombinasyonuyla üretildi. Miyeloid spesifik Klf2 nakavt (myeKlf2(-/-)) farelerden izole edilen makrofajlar, aktivasyon, polarizasyon ve lipid birikimine yanıt olarak myeKlf2(+/+) makrofajlara benzerdi. Ancak myeKlf2(+/+) makrofajlarla karşılaştırıldığında myeKlf2(-/-) makrofajları endotel hücrelerine daha sağlam bir şekilde yapıştı. MyeKlf2(-/-) farelerinden alınan nötrofiller ayrıca endotelyal hücrelere daha sağlam bir şekilde yapıştı ve myeKlf2(+/+) nötrofilleriyle karşılaştırıldığında daha az sayıda myeKlf2(-/-) nötrofili kültürde 24 saatlik bir süre boyunca hayatta kaldı. myeKlf2(-/-) fareleri Ldlr(-/-) fareleriyle çiftleştirildiğinde ve daha sonra yüksek yağ ve yüksek kolesterol diyetiyle beslendiğinde, myeKlf2(-/-)Ldlr(-/-) farelerinde aterosklerozda önemli bir artış gözlendi myeKlf2(+/+)Ldlr(-/-) yavru arkadaşlarıyla karşılaştırıldığında. MyeKlf2(-/-)Ldlr(-/-) farelerinde artan ateroskleroz, myeKlf2(+/) ile karşılaştırıldığında lezyon alanlarında miyeloperoksidazın yanı sıra klorlu ve nitrosile edilmiş tirozin epitoplarında karşılık gelen artışla birlikte nötrofil ve makrofajların yüksek varlığıyla ilişkilendirildi. +)Ldlr(-/-) fareler. SONUÇLAR Bu çalışma, aterosklerozun modüle edilmesinde miyeloid KLF2 ekspresyonunun rolünü belgelemektedir. Miyeloid spesifik KLF2 eksikliği ile artan nötrofil birikimi ve ateroskleroz ilerlemesi, aynı zamanda nötrofillerin vasküler oksidatif stresi ve aterosklerozu teşvik etmedeki önemini de vurgulamaktadır. Toplu olarak bu sonuçlar, KLF2 ifadesinin yükseltilmesinin aterosklerozun önlenmesi ve tedavisi için yeni bir strateji olabileceğini düşündürmektedir. |
14408200 | BAĞLAM Hastanede başlayan metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) enfeksiyonlarının oranlarının azaldığı bildirilmektedir, ancak toplum başlangıçlı S. aureus enfeksiyonlarının son zamanlardaki oranları daha az bilinmektedir. AMAÇLAR Ulusal bir sağlık sistemindeki toplum başlangıçlı ve hastane başlangıçlı S. aureus bakteriyemisi ile deri ve yumuşak doku enfeksiyonlarının (SSTI'ler) genel ve yıllık insidans oranlarını karakterize etmek ve S. aureus bakteriyemisi ve SSTI'ler ve MRSA'ya bağlı oran. TASARIM, YERLEŞİM VE KATILIMCILAR Ocak 2005'ten Aralık 2010'a kadar tüm Savunma Bakanlığı TRICARE yararlanıcıları üzerinde yapılan gözlemsel çalışma. Yıllık ilk pozitif S. aureus kanını ve yara veya apse kültürlerini metisiline duyarlı S olarak tanımlamak ve sınıflandırmak için tıbbi kayıt veritabanları kullanıldı. aureus veya MRSA ve toplumda veya hastanede başlayan enfeksiyonlar (hastaneye kabulden >3 gün sonra toplanan izolatlar). ANA SONUÇ ÖLÇÜMLERİ 100.000 kişi-yıllık gözlem başına düzeltilmemiş insidans oranları, MRSA'ya bağlı enfeksiyonların oranı ve 2005 ila 2010 arasındaki yıllık eğilimler (doğrusal eğilim için Spearman sıralama korelasyon testi veya Mantel-Haenszel χ2 testi kullanılarak incelenmiştir) . SONUÇLAR 56 milyon kişi-yıl boyunca (aktif olmayan görev: 47 milyon kişi-yıl; aktif görev: 9 milyon kişi-yıl), 2643 kan ve 80.281 yara veya apse yıllık ilk pozitif S. aureus kültürü vardı. Yıllık insidans oranları, S. aureus bakteriyemisi için 100.000 kişi yılı başına 3,6 ila 6,0 ve S. aureus SSTI'leri için 100.000 kişi yılı başına 122,7 ila 168,9 arasında değişmektedir. Toplum başlangıçlı MRSA bakteriyemisinin yıllık insidans oranları 2005 yılında 100.000 kişi-yılı başına 1,7'den (%95 GA, 100.000 kişi-yılı başına 1,5-2,0) 100.000 kişi-yılı başına 1,2'ye (%95 GA, yüzde 0,9-1,4) düşmüştür. 100.000 kişi-yıl) 2010'da (eğilim için P = 0,005). Hastanede başlayan MRSA bakteriyemisinin yıllık insidans oranları da 2005 yılında 100.000 kişi-yılı başına 0,7'den (%95 GA, 100.000 kişi-yılı başına 0,6-0,9) 100.000 kişi-yılı başına 0,4'e (%95 GA, 0,3-0,5) düştü. 2010 yılında 100.000 kişi-yıl başına) (eğilim için P = 0,005). Eş zamanlı olarak, MRSA'ya bağlı toplum başlangıçlı SSTI'nin oranı 2006'da %62'ye yükseldi ve ardından 2010'da yıllık olarak %52'ye düştü (eğilim için P < .001). SONUÇ Amerika Birleşik Devletleri'nin dört bir yanından her yaştan kadın ve erkekten oluşan Savunma Bakanlığı popülasyonunda, hem toplum başlangıçlı hem de hastane başlangıçlı MRSA bakteriyemisi oranları paralel olarak azalırken, MRSA'ya bağlı toplum başlangıçlı CYBE'lerin oranı arttı. daha yakın zamanda reddedildi. |
14419116 | 12 ila 16 günlük sıçanların torakolomber omurilik dilimlerinin intermediolateral hücre kolonundaki sempatik preganglionik nöronlardan (SPN'ler) tam hücre yama-klemp kayıtları yapıldı ve hipofiz adenilat siklaz aktive edici polipeptit (PACAP)-38'in etkileri N-metil-D-aspartat (NMDA)- ve kainat (KA) kaynaklı içe doğru akımlar üzerinde incelenmiştir. Tutma akımlarında önemli bir değişikliğe neden olmayan konsantrasyonlarda (10-30 nM) PACAP, NMDA'nın indüklediği akımları tersine çevrilebilir şekilde arttırdı, ancak KA'nın indüklediği akımları artırmadı. Daha yüksek konsantrasyonlarda (>30 nM), peptit sürekli bir içe doğru akım üretti. PACAP'ın güçlendirici etkisi, dilimlerin adenilat siklaz inhibitörü MDL-12,330A (25 mikroM) ile önceden inkübasyonuyla geçersiz kılındı. Ayrıca dilimlerin, fosfodiesteraz inhibitörü 3-izobütil-1-metilksantin ( 700 mikroM) NMDA akımlarını arttırdı. Bu sonuç, PACAP'ın sıçan SPN'lerinde NMDA reseptörü aracılı yanıtları muhtemelen siklik-AMP'ye bağımlı bir mekanizma yoluyla seçici olarak arttırdığını ve peptidin sinaptik plastisitede yer alabileceğine dair kanıt sağladığını göstermektedir. |
14434123 | Yıkıcı bir nörodejeneratif bozukluk olan AD, yaşlılarda demansın en sık görülen nedenidir. AD'li hastalar, nöritik plak birikimi, nörofibriler yumak oluşumu ve nöron kaybı dahil olmak üzere nöropatolojinin üç özelliği ile karakterize edilir. Giderek artan kanıtlar, kalsinörin 1'in (RCAN1) düzenleyicisindeki düzensizliğin AD'nin patogenezinde önemli bir rol oynadığını göstermektedir. Anormal RCAN1 ekspresyonu, nöronal apoptozu ve Tau hiperfosforilasyonunu kolaylaştırarak nöron kaybına ve nörofibriler yumak oluşumuna yol açar. Bu derleme, RCAN1 ekspresyonunun düzenlenmesi ve fizyolojik fonksiyonlarındaki son gelişmeleri açıklamayı amaçlamaktadır. Ayrıca AD risk faktörlerinin neden olduğu RCAN1 düzensizliği ve bunun nöron kaybı, sinaptik bozukluklar ve nörofibriler yumak oluşumunu teşvik etmedeki rolü özetlenmiştir. Ayrıca, RCAN1 düzensizliğinin APP işleme, Aβ üretimi ve nöritik plak oluşumu üzerindeki etkilerine ve altta yatan olası mekanizmalara ve ayrıca yeni bir terapötik yaklaşım olarak RCAN1'i hedefleme potansiyeline dair bir bakış açısı sağlıyoruz. |
14437255 | ETİKETSİZ Uyumlu görsel-işitsel konuşma, gürültüsüz koşullarda bile konuşmacıyı anlama yeteneğimizi geliştirir. Uyumsuz işitsel ve görsel bilgiler aynı anda sunulduğunda, dinleyicinin algısını engelleyebilir ve hatta her iki modda da sunulmayan bilgileri algılamasına neden olabilir. Bu etkilerin sinirsel temellerini araştırmaya yönelik çabalar sıklıkla, mekansal ve zamansal olarak uyumlu ayrık görsel-işitsel hecelerin özel durumuna odaklanmış, doğal, sürekli konuşma durumu üzerinde ise daha az çalışma yapılmıştır. Son elektrofizyolojik çalışmalar, sürekli işitsel konuşmaya kortikal yanıt ölçümlerinin çok değişkenli analiz yöntemleri kullanılarak kolayca elde edilebileceğini göstermiştir. Burada, bu tür yöntemleri görsel-işitsel konuşma durumuna uyguluyoruz ve daha da önemlisi, sürekli konuşma bağlamında çoklu duyusal entegrasyonun indekslenmesi için yeni bir çerçeve sunuyoruz. Spesifik olarak, devam eden görsel-işitsel konuşmanın zamansal ve bağlamsal uyumunun, elektroensefalografi kullanarak insanlarda konuşma zarfının kortikal kodlamasını nasıl etkilediğini inceliyoruz. Konuşma zarfının kortikal temsilinin, uyumlu görsel-işitsel konuşmanın gürültüsüz koşullarda sunulmasıyla güçlendirildiğini gösterdik. Ayrıca, bunun muhtemelen tek modlu uyarım sırasında özellikle aktif olmayan nöral jeneratörlerin katkısına atfedilebileceğini ve hece hızına (2-6 Hz) karşılık gelen zamansal ölçekte en belirgin olduğunu gösterdik. Son olarak verilerimiz, işitsel ve görsel akışlar hem zamansal hem de bağlamsal olarak uyumsuz olduğunda konuşma zarfına sinirsel sürüklenmenin engellendiğini göstermektedir. ÖNEM BİLDİRİMİ Bir konuşmacının konuşurken yüzünü görmek, konuşmacının ne söylediğini anlamada büyük ölçüde yardımcı olabilir. Bunun nedeni, konuşmacının yüz hareketlerinin, konuşmacının ne söylediği hakkında ve daha da önemlisi, konuşmacının bunu ne zaman söylediği hakkında bilgi aktarmasıdır. Beynin sürekli işitsel ve görsel konuşmadan elde edilen bilgileri birleştirmek için bu zamanlama ilişkisini nasıl kullandığını incelemek geleneksel olarak metodolojik olarak zor olmuştur. Burada, nispeten ucuz ve invaziv olmayan kafa derisi kayıtlarını kullanarak bunu yapmak için yeni bir yaklaşım sunuyoruz. Spesifik olarak, eşlik eden görsel konuşma sinyali aynı zamanlamayı paylaştığında beynin işitsel konuşmaya ilişkin temsilinin arttığını gösteriyoruz. Ayrıca, bu gelişmenin en çok ortalama hece uzunluğuna karşılık gelen bir zaman ölçeğinde belirgin olduğunu gösterdik. |
14446279 | Lamin içermeyen Saccharomyces cerevisiae mayasında, nükleer gözenek kompleksinin (NPC) kromatin organizasyonunda bir rol oynadığı öne sürülmüştür. Burada, canlı hücrelerde floresan mikroskobu kullanarak, Nup84 çekirdek kompleksinin nükleer gözenek proteinlerinin, Nup84p, Nup145Cp, Nup120p ve Nup133p'nin nükleer periferde telomer XI-L'yi sabitlemeye hizmet ettiğini gösterdik. Bu kompleksin bütünlüğünün, bu kromozom ucunun subtelomerik bölgesine yerleştirilen bir URA3 geninin baskılanması için gerekli olduğu gösterilmiştir. Ayrıca, bu kompleksin bütünlüğünün değiştirilmesi, onarım mekanizması işlevsel olsa bile, yalnızca subtelomerik bölgede üretildiğinde DNA çift iplik kopmasının (DSB) onarım verimliliğini azaltır. Bu etkiler Nup84 kompleksine özgüdür. Dolayısıyla gözlemlerimiz, NPC'nin Nup84 kompleksi aracılığıyla kromatinin işlevsel organizasyonunda oynadığı rolü doğruluyor ve genişletiyor. Ayrıca telomerlerin sabitlenmesinin, burada meydana gelen DSB'lerin etkili bir şekilde onarılması için gerekli olduğunu ve genom bütünlüğünün korunması için önemli olduğunu da belirtmektedirler. |
14460402 | Yetişkin nöral öncü hücrenin (NPC) hayatta kalmasını düzenleyen ve dolayısıyla yetişkin nörojenezini sürdüren moleküler mekanizmalar iyi tanımlanmamıştır. Burada, bir p53 ailesi üyesi olan p63'ün farelerde yetişkin NPC fonksiyonundaki rolünü araştırıyoruz. Yetişkin NPC'lerde veya p63 haploin yetmezliğinde p63'ün koşullu ablasyonu, hipokampusun ve lateral ventriküllerin nörojenik bölgelerinde ve koku alma soğanında NPC ve yeni doğan nöron sayısının azalmasına yol açtı. Bu azalmalar, NPC'lerin ve yeni doğan nöronların artmış apoptozuna atfedilebilir ve kaspaz aktivitesinin, p53'ün veya p53 apoptotik efektör PUMA'nın (p53 ile düzenlenmiş apoptoz modülatörü) inhibisyonu ile kurtarıldı. Üstelik bu hücresel eksiklikler işlevsel olarak önemliydi çünkü hipokampusa bağlı hafıza oluşumunda bozulmalara yol açtılar. Bu sonuçlar, p63'ün yetişkin NPC'lerin ve yetişkin doğumlu nöronların yanı sıra nöral kök hücreye bağımlı bilişsel işlevleri de düzenlediğini ve bunu en azından kısmen p53'e bağlı hücre ölümünü inhibe ederek yaptığını göstermektedir. |
14461101 | Bazı bakteriyel adezinlerin, bir patojenin konakçı hücrelere girmesinden ziyade hücre dışı yaşam tarzını teşvik ettiği görülmektedir. Bununla birlikte, bu tür patojen konakçı hücre etkileşimleri sonucunda ortaya çıkan uyaranlar hakkında çok az şey bilinmektedir. Burada, tip IV pili (Tfp) üreten Neisseria gonorrhoeae'nin (P(+)GC), konakçı hücrede anında kaveolin-1 (Cav1) alımını tetiklediğini ve bunun daha sonra aşağı akış fosfotirozin yoluyla hücre iskeleti yeniden düzenlemelerini tetikleyerek bakteriyel içselleştirmeyi önlediğini rapor ediyoruz. sinyal verme. Tirozin fosforile edilmiş Cav1 için potansiyel etkileşim ortaklarının geniş ve tarafsız bir analizi, Rho ailesi guanin nükleotid değişim faktörü Vav2 ile doğrudan bir etkileşimi ortaya çıkardı. Hem Vav2 hem de onun substratı olan küçük GTPaz RhoA'nın, bakteriyel alımın Cav1 aracılı önlenmesinde doğrudan rol oynadığı bulundu. Enteropatojenik Escherichia coli'ye kadar genişletilen bulgularımız, Tfp üreten bakterilerin konakçı hücre alımını nasıl önlediğini vurgulamaktadır. Ayrıca verilerimiz, Cav1 fosforilasyonu ile patojen kaynaklı hücre iskeletinin yeniden düzenlenmesi arasında mekanik bir bağlantı kuruyor ve kaveolin işlevine ilişkin anlayışımızı geliştiriyor. |
14464451 | Yeni nesil dizileme (NGS), geleneksel Sanger dizilimine kıyasla çok daha yüksek veri çıkışı ve çok daha düşük maliyeti nedeniyle genom birleştirme alanında devrim yarattı. Bununla birlikte, NGS, yeni genom derlemesi için yeni hesaplama zorlukları ortaya çıkarmaktadır. Zorluklar arasında, NGS verilerindeki GC yanlılığının genom birleşimini kötüleştirdiği biliniyor. Bununla birlikte, GC yanlılığının genel olarak genom düzeneğini ne ölçüde etkilediği açık değildir. Bu çalışmada, GC yanlılığının genom birleşimi üzerindeki etkileri üzerine sistematik bir analiz yapıyoruz. Analizlerimiz, GC önyargısının yalnızca GC önyargısının derecesi bir eşiğin üzerinde olduğunda montajın bütünlüğünü azalttığını ortaya koyuyor. Güçlü bir GC yanlılığında, GC yanlılığından kaynaklanan düzeneğin parçalanması, bir genomun GC'den fakir veya GC'den zengin bölgelerindeki okumaların düşük kapsamı ile açıklanabilir. Bu etki, incelenen tüm montajcılar için gözlenmiştir. Toplam NGS verisi miktarının arttırılması, böylece GC önyargısı nedeniyle montaj parçalanmasını kurtarır. Ancak tam bir kurtarma için gereken veri miktarı GC içeriğinin dağıtımına bağlıdır. GC yanlılığından dolayı hem düşük hem de yüksek kapsama derinlikleri montaj doğruluğunu azaltır. Bu bilgi parçaları, GC önyargısının varlığında daha iyi bir de novo genom birleşimine yönelik rehberlik sağlar. |
14471161 | Sirkadiyen bozulması kanserin ilerlemesini hızlandırırken, sirkadiyen takviyesi onu durdurabilir. P03 pankreas adenokarsinomlu fareler (n = 77) senkronize edildi ve istenildiği kadar (AL) veya Zeitgeber zamanı (ZT) 2'den ZT6'ya kadar normal veya yağlı diyetle yemek zamanlaması (MT) ile beslendi. Tümör gen ekspresyon profili, endojen sirkadiyen zaman (CT) 4 ve CT16'da DNA mikrodizileri ile belirlendi. Karaciğer ve tümörde Rev-erbalpha, Per2 ve Bmal1 saat genleri, Hspa8 ve Cirbp hücresel stres genleri ve siklin A2 geni Ccna2 için sirkadiyen mRNA ekspresyon modelleri belirlendi. Telemetreyle ölçülen dinlenme aktivitesi ve vücut sıcaklığı ile plazma kortikosteron ve insülin benzeri büyüme faktörü-I'deki (IGF-I) 24 saatlik modeller değerlendirildi. Kalori alımından bağımsız olarak AL'ye (P = 0.011) kıyasla MT'nin kanser büyümesini yaklaşık %40 oranında inhibe ettiğini gösterdik. Saat geni transkripsiyonu, beslenme programı veya diyetten bağımsız olarak tümörlerde aritmik kaldı. Ancak CT'ye göre MT, 423 tümör geninin ekspresyonunu yukarı veya aşağı doğru düzenledi. Dahası, hücresel stres, hücre döngüsü ve metabolizmada rol oynayan 36 gen, bir BT'de yukarı regüle edildi ve 12 saat arayla aşağı regüle edildi. MT, tümörlerde Hspa8, Cirbp ve Ccna2'nin >10 kat sirkadiyen ekspresyonunu indükledi. Kortikosteron veya IGF-I paternleri, tümör büyümesinin inhibisyonunda hiçbir rol oynamadı. Buna karşılık MT, vücut sıcaklığının sirkadiyen genliğini sürekli olarak iki katına çıkardı. Zirve ve çukur sırasıyla tümörlerde Hspa8 ve Cirbp'nin zirve ifadelerine karşılık geldi. Konakçı sirkadiyen zamanlama sisteminin MT ile güçlendirilmesi, saat eksikliği olan tümörlerde kritik genlerin 24 saatlik ritmik ekspresyonunu indükledi ve bu, kanser büyümesinin inhibisyonuna dönüştü. Sirkadiyen saatlerin hedeflenmesi, kanser tedavileri için yeni bir potansiyel zorluğu temsil etmektedir. |
14474178 | Bu çalışmanın amacı, tavuk melanomu farklılaşmasıyla ilişkili gen 5'in (MDA5), edinsel bağışıklığa köprü oluşturan doğuştan gelen bağışıklığı tetiklemek için bulaşıcı bursal hastalık virüsü enfeksiyonunu algılayıp algılamadığını belirlemekti. HD11 hücrelerinde IBDV enfeksiyonu sırasında, IBDV titreleri ve RNA yükleri, enfeksiyondan 24 saat sonra (hpi) sırasıyla 3,4 x 107 plak oluşturucu birim (PFU)/mL ve 1114 ng/μL'ye kadar arttı. HD11 hücrelerinde IBDV enfeksiyonu, tavuk MDA5'in (59 kat), interferon-β (IFN-β) (693 kat), dsRNA'ya bağımlı protein kinazın (PKR) (4 kat) ekspresyon seviyelerini önemli ölçüde yukarı regüle etmiş (p < 0.05) indüklemiştir ), 2', 5'-oligoadenilat sentetaz (OAS) (286 kat), miksovirüs direnç geni (Mx) (22 kat), interlökin-1β (IL-1β) (5 kat), IL-6 (146) -kat), IL-8 (4 kat), IL-10 (4 kat), indüklenebilir nitrik oksit sentaz (iNOS) (15 kat) ve majör doku uyumluluk kompleksi sınıf I (MHC sınıf I) (4 kat) ). Kültür süpernatanlarındaki nitrik oksit üretimi, 24 hpi'de 6,5 μM'ye kadar önemli ölçüde (p < 0,05) arttı. Eksprese edilen chMDA5 ve IBDV'den türetilen dsRNA, IBDV enfeksiyonu sırasında HD11 hücrelerinin sitoplazmasında lokalize edildi. ChMDA5-yıkma HD11 hücreleri, 24 hpi'de önemli ölçüde daha yüksek (p < 0.05) IBDV RNA yüklerine sahipti ve tavuk MDA5, IFN-β, PKR, OAS, Mx, IL-1β'nin önemli ölçüde daha düşük (p < 0.05) nitrik oksit üretimi ve ekspresyon seviyelerine sahipti. , IL-6, IL-8, IL-12(p40), IL-18, IL-10, iNOS, MHC sınıf I ve CD86, 24 hpi'de. Ek olarak, HD11 hücrelerinde chMDA5'in aşırı ekspresyonu, 16 ve 24 hpi'de IBDV titrelerinin ve RNA yüklerinin önemli ölçüde azalmasına (p < 0,05) ve nitrik oksit üretiminin önemli ölçüde artmasına (p < 0,05) neden oldu. Aynı zamanda tavuk MDA5, IFN-β, PKR, OAS, Mx, IL-1β, IL-6, IL-8, IL-12(p40), IL-10 ve önemli ölçüde daha yüksek (p < 0.05) ekspresyon seviyeleriyle sonuçlandı. 2 hpi'de iNOS. Sonuç olarak, sonuçlar chMDA5'in tavuk makrofajlarında IBDV enfeksiyonunu algıladığını ve bunun IBDV'nin indüklediği IFN-β ekspresyonu ve sonradan edinilmiş bağışıklık tepkisini aktive eden ve IBDV replikasyonunu sınırlayan doğuştan gelen bir bağışıklık tepkisinin başlatılmasıyla ilişkili olduğunu göstermektedir. |
14475235 | Son kanıtlar, babanın yaşlanmasının, yavruların hastalık duyarlılığı üzerinde bir rol oynadığını göstermektedir. Çeşitli nöropsikiyatrik bozuklukların (şizofreni, otizm vb.), trinükleotid genişlemesiyle ilişkili hastalıkların (miyotonik distrofi, Huntington vb.) ve hatta bazı kanser türlerinin yaşlı babaların çocuklarında görülme sıklığını arttırdığı iyi bilinmektedir. Bu değişikliklerin yaşlı babaların doğurduğu çocuklarda daha yaygın olduğuna dair güçlü epidemiyolojik kanıtlara rağmen, çoğu durumda bu süreçleri yönlendiren mekanizmalar belirsizdir. Bununla birlikte, epigenetiğin ve özellikle DNA metilasyon değişikliklerinin muhtemelen bir rol oynadığına yaygın olarak inanılmaktadır. Bu çalışmada olgun insan sperminde yaşlanmanın DNA metilasyonu üzerindeki etkisini araştırdık. Bir metilasyon dizisi yaklaşımı kullanarak, 17 fertil donörde sperm DNA metilasyon modellerindeki değişiklikleri, her bireyden 9-19 yıl arayla toplanan 2 numunenin sperm metilomunu karşılaştırarak değerlendirdik. Bu tasarımla, yaşla birlikte önemli ölçüde ve tutarlı bir şekilde hipometile olan 139 bölge ve yaşla birlikte önemli ölçüde hipermetile olan 8 bölge belirledik. Bu değişikliklerin temsili bir alt kümesi bağımsız bir kohortta doğrulandı. Toplam 117 gen, metilasyon değişikliklerinin bu bölgeleriyle (promotör veya gen gövdesi) ilişkilidir. Şaşırtıcı bir şekilde, sperm DNA metilasyonunda yaşa bağlı değişikliklerin bir kısmı, daha önce şizofreni ve bipolar bozuklukla ilişkilendirilen genlerde bulunuyor. Verilerimiz nedensel bir ilişki kurmasa da, spermde gözlemlediğimiz aday genlerin yaşla ilişkili metilasyonunun, yaşlı erkeklerin çocuklarında nöropsikiyatrik ve diğer bozuklukların görülme sıklığının artmasına katkıda bulunabileceği olasılığını artırıyor. Ancak nedensel bir ilişkinin var olup olmadığını ve ne ölçüde var olduğunu belirlemek için daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır. |
14479433 | Yenidoğan kolestazı, hızlı tanı gerektiren potansiyel olarak yaşamı tehdit eden bir durumdur. Birkaç farklı gendeki mutasyonlar ilerleyici ailesel intrahepatik kolestaza neden olabilir, ancak bilinen genler tüm ailesel vakaları açıklayamaz. Burada, safra asidi metabolizmasını düzenleyen, safra asidiyle aktifleşen bir nükleer hormon reseptörü olan farnesoid X reseptörünü (FXR) kodlayan NR1H4'te yenidoğan kolestazı ve mutasyonları olan, ilgisiz iki aileden dört kişiyi rapor ediyoruz. Şiddetli, kalıcı NR1H4 ile ilişkili kolestazın klinik özellikleri arasında yenidoğan başlangıcı ile son dönem karaciğer hastalığına hızlı ilerleme, K vitamininden bağımsız koagülopati, düşük ila normal serum gama-glutamil transferaz aktivitesi, yüksek serum alfa-fetoprotein ve saptanamayan karaciğer safrası yer alır. tuz ihraç pompası (ABCB11) ifadesi. Bulgularımız FXR'nin safra asidi homeostazisinde ve karaciğer korumasında çok önemli bir işlevi olduğunu göstermektedir. |
14482051 | ARKA PLAN Panobinostat, gliomada antineoplastik ve antianjiyojenik etkileri olan ve bevacizumab ile sinerjistik olarak çalışabilen bir histon deasetilaz inhibitörüdür. Tekrarlayan yüksek dereceli glioma (HGG) hastalarında panobinostat ile bevacizumabın kombine edildiği çok merkezli bir faz II denemesi gerçekleştirdik. YÖNTEMLER Tekrarlayan HGG'li hastalar, iki haftada bir 10 mg/kg bevacizumab ile birlikte haftada 3 kez, iki haftada bir oral panobinostat 30 mg ile tedavi edildi. Birincil son nokta, tekrarlayan glioblastomalı (GBM) katılımcılar için 6 aylık ilerleme ücreti hayatta kalma (PFS6) oranıydı. Tekrarlayan anaplastik gliomalı (AG) hastalar çalışmanın araştırma kolu olarak değerlendirildi. SONUÇLAR Ara analizde, GBM kolu devam eden tahakkuk kriterlerini karşılamadı ve GBM kolu kapatıldı. Kapanmadan önce toplam 24 GBM hastası tahakkuk etmişti. PFS6 oranı %30,4 (%95, GA %12,4-%50,7), medyan PFS 5 ay (aralık, 3-9 ay) ve ortalama genel sağkalım (OS) 9 ay (aralık, 6-19 ay) idi. . AG kolundaki tahakkuk tamamlanmaya devam etti ve toplam 15 hasta kaydedildi. PFS6 oranı %46,7 (aralık, %21-%73), medyan PFS 7 ay (aralık, 2-10 ay) ve medyan OS 17 ay (aralık, 5 ay-27 ay) idi. SONUÇLAR Tekrarlayan GBM'li katılımcılarda panobinostat ve bevacizumab ile ilgili bu faz II çalışması, sürekli tahakkuk kriterlerini karşılamadı ve çalışmanın GBM kohortu kapatıldı. Oldukça iyi tolere edilmesine rağmen, bevacizumab'a panobinostat eklenmesi, her iki kohortta da bevacizumab monoterapisinin geçmişteki kontrolleri ile karşılaştırıldığında PFS6'yı anlamlı düzeyde iyileştirmedi. |
14492339 | Periferik kan monositleri, dolaşımdaki lökositlerin heterojen bir popülasyonudur. Monosit homing ve in vivo farklılaşmayı araştırmak için bir fare adaptif transfer sistemi kullanarak, fare kanı monositleri arasında iki fonksiyonel alt grup belirledik: aktif olarak işe alınan kısa ömürlü bir CX(3)CR1(lo)CCR2(+)Gr1(+) alt grubu iltihaplı dokulara ve iltihaplanmamış dokulara CX(3)CR1'e bağımlı alım ile karakterize edilen bir CX(3)CR1(hi)CCR2(-)Gr1(-) alt kümesine sahiptir. Her iki alt grup da in vivo olarak dendritik hücrelere farklılaşma potansiyeline sahiptir. CX(3)CR1 ekspresyonunun seviyesi aynı zamanda fare alt gruplarıyla fenotipi ve hedef bulma potansiyelini paylaşan iki ana insan monosit alt kümesini, CD14(+)CD16(-) ve CD14(lo)CD16(+) monositlerini de tanımlar. Bu bulgular inflamatuar hastalıklarda yeni tedavi stratejilerinin potansiyelini arttırmaktadır. |
14492964 | Amfibi gastrulasının Spemann organizatörü tarafından salınan sinyaller, ektodermden sinir dokusunu doğrudan uyarabilir ve kas oluşturmak için ventral mezodermi dorsalize edebilir. Salgılanan polipeptit noggin bu aktiviteleri taklit eder ve organizatör sinyaline katılmak üzere uygun zaman ve yerde ifade edilir. Nöral indüksiyon ve mezoderm dorsalizasyonu, bunun yerine epidermisi ve ventral mezodermi indükleyen kemik morfogenetik proteinleri (BMP'ler) tarafından antagonize edilir. Burada noggin proteininin BMP4'e yüksek afiniteyle bağlandığını ve aynı kökenli hücre yüzeyi reseptörlerine bağlanmayı bloke ederek BMP4 aktivitesini ortadan kaldırabildiğini rapor ediyoruz. Bu veriler, organizatör tarafından salgılanan noggin'in, BMP sinyalini kesintiye uğratarak embriyoyu şekillendirdiğini göstermektedir. |
14496749 | Oksidatif stres, hücrenin hayatta kalmasını ve homeostazisini etkiler, ancak oksidatif stresin biyolojik etkilerinin altında yatan mekanizmaların açıklığa kavuşturulması gerekmektedir. Burada, protein kinaz MST1'in, FOXO transkripsiyon faktörlerini doğrudan aktive ederek birincil memeli nöronlarında oksidatif stres kaynaklı hücre ölümüne aracılık ettiğini gösterdik. MST1, çatal başı alanı içindeki korunmuş bir bölgede FOXO proteinlerini fosforile ederek bunların 14-3-3 proteinleriyle etkileşimini bozar, FOXO nükleer translokasyonunu teşvik eder ve böylece nöronlarda hücre ölümüne neden olur. Ayrıca MST-FOXO sinyal bağlantısını nematodları da kapsayacak şekilde genişletiyoruz. C. elegans MST1 ortologu CST-1'in yıkılması yaşam süresini kısaltır ve doku yaşlanmasını hızlandırırken, cst-1'in aşırı ekspresyonu yaşam süresini uzatır ve yaşlanmayı geciktirir. Cst-1'in neden olduğu yaşam süresi uzaması, daf-16'ya bağımlı bir şekilde gerçekleşir. FOXO transkripsiyon faktörlerinin, MST1'in ana ve evrimsel olarak korunmuş hedefleri olarak tanımlanması, MST kinazlarının, oksidatif strese ve uzun ömürlülüğe hücresel tepkiler dahil olmak üzere çeşitli biyolojik süreçlerde önemli roller oynadığını göstermektedir. |
14500725 | ARKA PLAN Doktorların Sahraaltı Afrika'dan (SSA) yüksek gelirli ülkelere büyük ölçekli göçü ciddi bir kalkınma kaygısıdır. Amacımız Amerika Birleşik Devletleri'nin hekim işgücünde bulunan SSA hekimlerinin mevcut göç eğilimlerini belirlemekti. YÖNTEMLER VE BULGULAR Dünya Sağlık Örgütü'nün (WHO) Küresel Sağlık İşgücü İstatistikleri'nden elde edilen doktor verilerinin yanı sıra, şu anda SSA ülkelerinde eğitim almış veya doğmuş olan ve halihazırda ABD'de görev yapan doktorlara ilişkin 2011 Amerikan Tabipler Birliği Doktor Ana Dosyası'ndan (AMA-PM) mezuniyet ve ihtisas verilerini analiz ettik. ABD. Göç oranlarını, ABD'ye giriş yılını, göçten önceki çalışma yıllarını ve ABD'de geçirilen süreyi tahmin ettik. 2011 AMA-PM'ye göre 28 SSA ülkesinde 10.819 doktor doğmuş veya eğitim görmüştür. Yüzde altmış sekizi (n = 7.370) SSA eğitimi almış, %20'si (n = 2.126) ABD eğitimi almış ve %12'si (n = 1.323) hem SSA hem de ABD dışında eğitim almıştır. Aktif hekimlerin (yaş ≤ 70) toplamın %96'sını (n = 10.377) temsil ettiğini tahmin ettik. SSA eğitimli doktorlar arasındaki göç eğilimleri, biri hariç tüm ana kaynak ülkeler için 2002'den 2011'e arttı; bunun istisnası, ABD'ye doktor göçünün %8 (-156) azaldığı Güney Afrika'ydı. Son on yılda göçteki artış Nijerya'da (+1.113) ve Gana'da (+243) >%50, Etiyopya'da (+274) >%100 ve Sudan'da >%200 (+244) oldu. Liberya, 2011 AMA-PM'de tahmini doktorlarının %77'si (n = 175) ile ABD'ye göçten en çok etkilenen ülke oldu. SSA eğitimli doktorlar ortalama 18 yıldır ABD'de bulunuyor. ABD'ye girmeden önce 6,5 yıl boyunca pratik yaptılar ve neredeyse yarısı yapısal uyum programlarının uygulama yıllarında (1984-1999) göç etti. SONUÇ SSA'nın kaynak olduğu ülkelerin çoğunda SSA'dan ABD'ye doktor göçü artmaktadır. ABD ve SSA ülkeleri tarafından geniş kapsamlı politikalar uygulanmadığı sürece, mevcut göç eğilimleri devam edecek ve ABD, en çok ihtiyaç duyulan kıtadan göç eden SSA doktorları için önde gelen bir varış noktası olmaya devam edecek. Lütfen Editörün Özeti için makalenin ilerleyen bölümlerine bakın. |
14501880 | Triptofan metabolizmasının kinurenin yolu, çeşitli beyin hastalıklarının patogenezinde rol oynar, ancak fizyolojik işlevleri belirsizliğini koruyor. Bu yoldaki bir metabolit olan kinurenik asidin, C. elegans'ta gıdaya bağlı davranışsal plastisitenin düzenleyicisi olarak işlev gördüğünü rapor ediyoruz. C. elegans'ta oruç tutma deneyimi, oruç sonrası yiyecekle karşılaşıldığında beslenme hızı da dahil olmak üzere çeşitli davranışları değiştirir. Nöral olarak üretilen kinurenik asit seviyeleri açlıkla tükenir, bu da NMDA reseptörü eksprese eden internöronların aktivasyonuna ve hayvanlar yiyecekle yeniden karşılaştığında artan serotonin salınımı yoluyla yüksek beslenmeyi destekleyen nöropeptit-y benzeri sinyal ekseninin başlatılmasına yol açar. Yeniden besleme sonrasında kinurenik asit seviyeleri sonunda yenilenir ve artan besleme süresi sona erer. Triptofan esansiyel bir amino asit olduğu için, bu bulgular kinurenik asidin fizyolojik rolünün, metabolizmayı geniş bir davranış ve fizyoloji yelpazesini düzenleyen NMDA ve serotonerjik devrelerin aktivitesine doğrudan bağlamak olduğunu göstermektedir. |
14530534 | Kromatin izolatörleri, heterokromatin sınırlarının korunması yoluyla gen susturulmasını önleyerek veya güçlendiriciler ve destekleyiciler arasındaki etkileşimleri bloke ederek gen aktivasyonunu önleyerek gen ekspresyonunun seviyesini düzenleyen DNA elemanlarıdır. Her yerde eksprese edilen 11-çinko parmaklı DNA bağlama proteini olan CCCTC bağlama faktörü (CTCF), omurgalılarda yalıtkanların oluşturulmasında rol oynayan tek proteindir. CTCF çeşitli düzenleyici işlevlerde yer alırken, CTCF insan genomunda yalnızca sınırlı sayıda hücre tipinde incelenmiştir. Bu nedenle, CTCF bağlanma bölgelerinde tanımlanan hücre tipine özgü farklılıkların işlevsel olarak anlamlı olup olmadığı açık değildir. Burada, DNA Elementleri Ansiklopedisi (ENCODE) konsorsiyumu tarafından belirlenen 38 hücre tipinde insan genomundaki hücre tipine özgü ve her yerde bulunan CTCF bağlama bölgelerini tanımlıyor ve karakterize ediyoruz. Bu hücre tipine özgü ve her yerde bulunan CTCF bağlama bölgeleri, benzersiz derecede çok yönlü transkripsiyonel işlevler ve karakteristik kromatin özellikleri gösterir. Ek olarak, CTCF bağlamanın yalıtkan bariyer fonksiyonunu doğruladık ve CTCF'nin DNA replikasyonundaki yeni fonksiyonunu araştırdık. Bu sonuçlar, CTCF'ye bağımlı izolatörlerin ve bunların insan genomundaki çok yönlü rollerinin kapsamlı ve sistematik olarak anlaşılmasına yönelik kritik bir adımı temsil etmektedir. |
14535322 | Son deneysel çalışmalar ve teorik modeller, öznel bilinçli deneyim ile ölçülebilir nöronal aktivite arasında nedensel bir bağlantı kurma zorluğunu çözmeye başladı. Mevcut inceleme, harici veya dahili bir bilgi parçasının nasıl bilinçsiz işlemenin ötesine geçtiği ve bildirilebilir bir öznel deneyimin varlığıyla karakterize edilen bir geçiş olan bilinçli işleme erişim kazandığına ilişkin iyi tanımlanmış bir konuya odaklanmaktadır. Bilinçli ve bilinçsiz işlemler arasındaki minimum deneysel kontrastlar sırasında elde edilen yakınsak nörogörüntüleme ve nörofizyolojik veriler, bilinçli erişimin nesnel sinirsel ölçümlerine işaret etmektedir: ilgili duyusal aktivitenin geç amplifikasyonu, beta ve gama frekanslarında uzun mesafeli kortiko-kortikal senkronizasyon ve "ateşleme" büyük ölçekli bir prefronto-parietal ağın Bu bulguları, gelen bilginin uzun menzilli aksonları yoğun olarak dağıtılmış bir nöron ağı aracılığıyla birden fazla beyin sistemine küresel olarak erişilebilir hale getirilmesiyle bilinçli erişimin gerçekleştiği Küresel Nöronal Çalışma Alanı (GNW) modeli de dahil olmak üzere bilinçli işlemenin mevcut teorik modelleriyle karşılaştırıyoruz. prefrontal, parieto-temporal ve singulat kortekslerde. Bu sonuçların genel anestezi, koma, vejetatif durum ve şizofreni açısından klinik etkileri tartışılmaktadır. |
14541844 | Ökaryotik hücreler arasında yüksek oranda korunan AMP ile aktifleşen kinaz (AMPK), karbon metabolizmasının merkezi düzenleyicisidir. Mayadaki (Snf1) AMPK etrafındaki etkileşimlerin tam ağını haritalandırmak ve düzenleyici alt birimi Snf4'ün rolünü değerlendirmek için vahşi tipte, Deltasnf1, Deltasnf4 ve Deltasnf1Deltasnf4 nakavt suşlarında global mRNA, protein ve metabolit seviyelerini ölçtük. Yeni DOGMA alt ağ analizi de dahil olmak üzere yeni geliştirilen dört hesaplama aracını kullanarak, mayada küresel Snf1 kinaz rolünü ortaya çıkarmak için üç seviyeli ome-veri entegrasyonunun faydalarını gösterdik. İlk kez Snf1'in gen ve protein ekspresyon seviyeleri üzerindeki küresel düzenlemesini belirledik ve maya Snf1'in enerji metabolizmasını kontrol etmede daha önce bildirilenden çok daha kapsamlı bir işleve sahip olduğunu gösterdik. Ek olarak Snf1 ve Snf4'ün tamamlayıcı rollerini belirledik. AMPK'nin insanlardaki işlevine benzer şekilde, bulgularımız Snf1'in düşük enerjili bir kontrol noktası olduğunu ve mayanın, memelilerde AMPK'nin küresel düzenlemesinin altında yatan moleküler mekanizmaları incelemek için bir model sistem olarak daha kapsamlı bir şekilde kullanılabileceğini gösterdi; metabolik hastalıklara. |
14544564 | Sterol algılayan nükleer reseptörler ve insülin benzeri büyüme faktörü sinyali, yaşlanmanın kontrolünde evrimsel olarak korunmuş roller oynar. Nematod Caenorhabditis elegans'ta, dafakronik asitler (DA'lar) olarak bilinen safra asidi benzeri steroid hormonları, korunmuş nükleer reseptör DAF-12'ye bağlanarak ve onun aktivitesini düzenleyerek uzun ömrü etkiler ve insülin reseptörü (InsR) ortologu DAF-2, yaşamı kontrol eder. FoxO transkripsiyon faktörü DAF-16'yı inhibe ederek yayılır. DA/DAF-12 yolunun, yaşam süresini kontrol etmek için DAF-2/InsR sinyaliyle nasıl etkileşime girdiği tam olarak anlaşılamamıştır. Burada özellikle ligandlı ve ligandsız DAF-12'nin azaltılmış DAF-2/InsR sinyallemesi bağlamında yaşam süresi kontrolündeki rollerini araştırdık. Daf-2/InsR aktivitesi azalmış hayvanlarda, DA biyosentezini azaltan veya DAF-12 aktivitesini tamamen ortadan kaldıran mutasyonlar yaşam süresini kısaltır; bu da ligandlı DAF-12'nin uzun ömürlülüğü desteklediğini düşündürür. Daf-2/InsR RNAi tarafından indüklenen azaltılmış DAF-2/InsR aktivitesine sahip hayvanlarda, hem ligandlı hem de ligandsız DAF-12, uzun ömürlülüğü destekler. Bununla birlikte, daf-2/InsR mutantlarında, ligandlı ve ligandsız DAF-12, kontrol yaşam süresine karşı hareket eder. Dolayısıyla birden fazla DAF-12 aktivitesi, azalan DAF-2/InsR sinyallemesi bağlamında yaşam süresini farklı şekillerde etkiler. Bulgularımız, yaşam süresi kontrolünde korunmuş bir steroid sinyal yolu için yeni roller oluşturuyor ve yaşlanmada DA biyosentetik yolları, DAF-12 ve DAF-2/InsR sinyallemesi arasındaki etkileşimleri aydınlatıyor. |
34436231 | Olgunlaşmamış T hücreleri ve bazı T hücresi hibridomaları, T hücresi reseptör kompleksi yoluyla aktive edildiklerinde apoptotik hücre ölümüne maruz kalırlar; bu, muhtemelen gelişmekte olan T hücrelerinin antijen kaynaklı negatif seçimiyle ilişkili bir olgudur. Bu aktivasyonun neden olduğu apoptoz, ölmekte olan hücrelerdeki aktif protein ve RNA sentezine bağlıdır, ancak bu işlem için gerekli genlerin hiçbiri daha önce tanımlanmamıştır. C-myc'ye karşılık gelen antisens oligonükleotidler, T hücre hibridomalarında c-Myc proteininin yapısal ekspresyonunu bloke eder ve bu hücrelerde lenfokin üretimini etkilemeden aktivasyonun indüklediği apoptozun tüm yönlerine müdahale eder. Bu veriler c-myc ekspresyonunun aktivasyonun indüklediği apoptozun gerekli bir bileşeni olduğunu göstermektedir. |
34439544 | BCL-2 (B hücreli CLL/Lenfoma) ailesi, hücrenin hayatta kalmasını sağlamak veya apoptozu başlatmak için işbirliği yapan yaklaşık yirmi proteinden oluşur(1). Hücresel stresin (örn. DNA hasarı) ardından, pro-apoptotik BCL-2 ailesi efektörleri BAK (BCL-2 antagonistik öldürücü 1) ve/veya BAX (BCL-2 ile ilişkili X proteini) aktive olur ve dış mitokondriyal bütünlüğü tehlikeye atar. mitokondriyal dış membran geçirgenleştirmesi (MOMP)(1) olarak adlandırılan süreç. MOMP oluştuktan sonra pro-apoptotik proteinler (örn. sitokrom c) sitoplazmaya erişim kazanır, kaspaz aktivasyonunu teşvik eder ve apoptoz hızla gerçekleşir(2). BAK/BAX'in MOMP'yi indüklemesi için, BCL-2 ailesinin başka bir pro-apoptotik alt kümesinin üyeleriyle, yalnızca BCL-2 homoloji alanı 3 (BH3) proteinleri (BID (BH3-etkileşimli) gibi) ile geçici etkileşimlere ihtiyaç duyarlar. alan agonisti)(3-6). Anti-apoptotik BCL-2 ailesi proteinleri (örn., BCL-2 ile ilişkili gen, uzun izoform, BCL-xL; miyeloid hücreli lösemi 1, MCL-1), BAK/BAX ile yalnızca BH3 arasındaki etkileşimleri sıkı bir şekilde kontrol ederek hücresel hayatta kalmayı düzenler BAK/BAX aktivasyonunu doğrudan indükleyebilen proteinler(7,8). Ek olarak, anti-apoptotik BCL-2 proteininin mevcudiyeti, BAD (hücre ölümü BCL-2 antagonisti) veya PUMA (apoptozun p53 ile düzenlenmiş modülatörü) gibi yalnızca BH3'e duyarlı/baskılayıcı olmayan proteinler tarafından da belirlenir. anti-apoptotik üyeleri inhibe eder(7,9). Anti-apoptotik BCL-2 repertuarının çoğu OMM'de lokalize olduğundan, hayatta kalmayı sürdürme veya MOMP'yi indüklemeye yönelik hücresel karar, bu membrandaki çoklu BCL-2 ailesi etkileşimleri tarafından belirlenir. Büyük tek katmanlı kesecikler (LUV'ler), BCL-2 ailesi etkileşimleri ile membran geçirgenliği(10) arasındaki ilişkileri araştırmaya yönelik biyokimyasal bir modeldir. LUV'ler, solventle ekstrakte edilmiş Xenopus mitokondriden lipid kompozisyon çalışmalarında belirlenen oranlarda bir araya getirilen tanımlanmış lipitlerden oluşur (%46,5 fosfatidilkolin, %28,5 fosfatidiletanoloamin, %9 fosfatidilinositol, %9 fosfatidilserin ve %7 kardiyolipin)(10). Bu, BCL-2 ailesi fonksiyonunu doğrudan araştırmak için uygun bir model sistemidir çünkü protein ve lipit bileşenleri tamamen tanımlanmış ve izlenebilirdir; bu, birincil mitokondride her zaman geçerli değildir. OMM genelinde kardiyolipin genellikle bu kadar yüksek olmasa da bu model, BCL-2 ailesi işlevini desteklemek için OMM'yi aslına sadık bir şekilde taklit eder. Ayrıca, yukarıdaki protokolün daha yeni bir modifikasyonu, polianyonik bir boya (ANTS: 8-aminonaftalin-1,3,6-trisülfonik asit) içeren LUV'lara dayanan protein etkileşimlerinin kinetik analizlerine ve membran geçirgenliğinin gerçek zamanlı ölçümlerine olanak tanır. ) ve katyonik söndürücü (DPX: p-ksilen-bis-piridinyum bromür)(11). LUV'ler geçirgenleştikçe, ANTS ve DPX dağılır ve floresansta bir kazanç tespit edilir. Burada yaygın olarak kullanılan rekombinant BCL-2 ailesi protein kombinasyonları ve ANTS/DPX içeren LUV'ları kullanan kontroller açıklanmaktadır. |
34445160 | ARKA PLAN VE AMAÇLAR Hepatik yıldız hücre aktivasyonu, karaciğer hasarına karşı yara iyileştirici bir yanıttır. Bununla birlikte, kronik karaciğer hasarı sırasında yıldız şeklindeki hücrelerin sürekli aktivasyonu, aşırı matriks birikmesine ve fibrozise ve sonuçta siroza yol açan patolojik skar dokusunun oluşumuna neden olur. Bu patolojik süreç için sürekli yıldız hücre aktivasyonunun önemi iyi bilinmektedir ve TGFβ-, PDGF- ve LPS'ye bağımlı yollar gibi yıldız hücre aktivasyonunu teşvik edebilen çeşitli sinyal yolları tanımlanmıştır. Ancak aktivasyonun ilk adımlarını tetikleyen ve yönlendiren mekanizmalar tam olarak anlaşılamamıştır. YÖNTEMLER VE SONUÇLAR Hippo yolunu ve onun efektör YAP'ını, yıldız hücre aktivasyonunu kontrol eden anahtar yol olarak belirledik. YAP bir transkripsiyonel ortak aktivatördür ve yıldız hücre aktivasyonu sırasında gen ekspresyonundaki en erken değişiklikleri yönlendirdiğini bulduk. Farelere CCl4 uygulanmasıyla in vivo yıldız hücrelerinin aktivasyonu veya in vitro aktivasyon, nükleer translokasyonu ve YAP hedef genlerinin indüksiyonu ile ortaya konduğu üzere YAP'ın hızlı aktivasyonuna neden olmuştur. YAP ayrıca nükleer lokalizasyonunun da gösterdiği gibi insan fibrotik karaciğerlerinin yıldız hücrelerinde de aktive edildi. Önemli olarak, YAP ekspresyonunun devre dışı bırakılması veya YAP'ın farmakolojik inhibisyonu, in vitro hepatik yıldız hücre aktivasyonunu önledi ve YAP'ın farmakolojik inhibisyonu, farelerde fibrogenezi engelledi. SONUÇ YAP aktivasyonu, hepatik yıldız hücre aktivasyonunun kritik bir itici gücüdür ve YAP'ın inhibisyonu, karaciğer fibrozunun tedavisi için yeni bir yaklaşım sunar. |
34469966 | İnterlökin-1β (IL-1β), biyoaktivitesi inflamatuarın aktivasyonu ile kontrol edilen bir sitokindir. Bununla birlikte, lipopolisakarite yanıt olarak insan monositleri, klasik inflamatuar uyaranlardan bağımsız olarak IL-1β salgılar. Burada bunun fare sisteminde gözlenmeyen, türe özgü bir tepki oluşturduğunu rapor ediyoruz. Aslında, insan monositlerinde lipopolisakarit, NLRP3-ASC-kaspaz-1 sinyallemesine dayanan, ancak piroptozom oluşumu, piroptoz indüksiyonu ve K(+) akış bağımlılığı dahil olmak üzere herhangi bir klasik iltihaplanma özelliğinden yoksun olan bir "alternatif iltihap"ı tetikledi. Bir monosit transdiferansiyasyon sisteminde altta yatan sinyal yolunun genetik diseksiyonu, alternatif inflamatuar aktivasyonun, NLRP3'ün yukarı akışında sinyal veren TLR4-TRIF-RIPK1-FADD-CASP8 tarafından yayıldığını ortaya çıkardı. Önemli olarak, bu sinyalleme kademesinin katılımı alternatif inflamatuar aktivasyonla sınırlıydı ve klasik NLRP3 aktivasyonunu kapsamadı. Alternatif inflamatuar aktivasyon, TLR4'ün hem hassasiyetini hem de karışıklığını kapsadığından, insanlarda TLR4 kaynaklı, IL-1β aracılı immün yanıtlarda ve immünopatolojide bu sinyalleme kademesi için çok önemli bir rol öneriyoruz. |
34481589 | Biyolojik ajanlar romatoloji, dermatoloji ve inflamatuar barsak hastalıklarında yaygın olarak kullanılmaktadır. Son on yılda tüm bu terapötik endikasyonlar için bunların etkinliği ve güvenliğine ilişkin kanıtlar güçlendirilmiştir. Biyobenzer ajanlar, daha önce onaylanmış biyolojik ajanlara benzer monoklonal antikorlardır. Avrupa Birliği'nde, immün aracılı inflamatuar hastalıkların (IMID'ler) tedavisindeki tüm endikasyonlar için onaylanmıştır, ancak şu anda yalnızca romatoid artrit ve ankilozan spondilit ile ilgili veriler mevcuttur. Biyobenzerlerin etkinliği, güvenliği ve immünojenitesine ilişkin doğrudan kanıtlar, çocuklarda olduğu kadar sedef hastalığında, psoriatik artritte ve inflamatuar barsak hastalığında da zorunludur. Literatürdeki mevcut kanıtlara dayanarak, İtalyan Romatoloji, Dermatoloji ve İnflamatuvar Bağırsak Hastalığı Derneklerinin IMID'lerde biyobenzerlerin kullanımına ilişkin ortak resmi pozisyonunu sunuyoruz. |
34498093 | Dynein motor alanı bir kuyruk, kafa ve saptan oluşur ve ATPaz döngüsü sırasında kuyruğu başa doğru sallayarak mikrotübüllere bir kuvvet oluşturduğu düşünülmektedir. Bu "güç vuruşu" için dyneinin kuyruk salınımını sapın ucundaki mikrotübül birleşimi/ayrışması ile koordine etmesi gerekir. Her ne kadar ilk sürecin ayrıntılı bir resmi ortaya çıksa da, ikinci sürecin açıklığa kavuşturulması gerekiyor. Dictyostelium sitoplazmik dineinin tek başlı rekombinant motor alanını kullanarak, motor alanının bir mikrotübül ile etkileşiminin ATPaz adımları tarafından nasıl modüle edildiği, iki mekanik döngünün (mikrotübül birleşimi/ayrışması ve kuyruk salınımı) nasıl olduğu sorularını ele alıyoruz. koordine edilir ve motor alanındaki birçok bölge arasında hangi ATPaz bölgesi koordinasyonu düzenler. Kararlı durum ve kararlı durum öncesi ölçümlere dayanarak, iki mekanik döngünün ATPaz döngüsündeki ara durumların çoğunda eşzamanlı olarak ilerlediğini gösterdik: felç sonrası durumdaki motor alanı, bir K(d) ile mikrotübüle güçlü bir şekilde bağlanır. ) yaklaşık 0,2 mikroM'dir, oysa felç öncesi durumdaki motor alanlarının çoğu mikrotübüle zayıf bir şekilde K(d)> 10 mikroM ile bağlanır. Bununla birlikte, sonuçlarımız, mikrotübül afinite değişiminin ve kuyruk salınımının zamanlamasının, kuyruğun vuruş sonrası pozisyondan vuruş öncesi pozisyona sallandığı toparlanma vuruşu adımında kademeli olduğunu göstermektedir. Motor alanının AAA1 modülündeki ATPase bölgesinin bu iki mekanik sürecin koordinasyonundan sorumlu olduğu bulundu. |
34498325 | Tüm organizmalardan (Mikoplazma hariç) ve organellerden Gln, Lys ve Glu'ya özgü transfer RNA'ları, yalpalama nükleozidi olarak bir 2-tiouridin türevine (xm(5)s(2)U) sahiptir. Bu tRNA'lar His/Gln, Asn/Lys ve Asp/Glu bölünmüş kodon kutularındaki A- ve G-bitiş kodonlarını okur. Ökaryotik sitoplazmik tRNA'larda üridin'in 5. pozisyonundaki korunmuş bileşen (xm(5)-), 5-metoksikarbonilmetildir (mcm(5)). TRNA'nın 32. pozisyonundaki 2-tiyositidin sentezi için gerekli olan TtcA bakteriyel proteinine benzeyen mayadan elde edilen bir proteinin (Tuc1p), bunun yerine yalpalama pozisyonunda (pozisyon 34) 2-tiyoüridin sentezi için gerekli olduğu gösterilmiştir. ). Görünüşe göre, TtcA ailesinin eski bir üyesi, Eukarya ve Archaea alanlarındaki organizmaların tRNA'larında U34'ü tiyolat edecek şekilde evrimleşmiştir. TUC1 geninin silinmesi, mcm(5) yan zincirinin eksikliğiyle sonuçlanan ELP3 geninin silinmesiyle birlikte, Gln, Lys ve Glu'ya özgü sitoplazmik tRNA'ların yalpalayan üridin türevlerindeki tüm modifikasyonları ortadan kaldırır ve hücre için öldürücüdür. Bu üç tRNA'nın değiştirilmemiş formunun fazlası, çift mutant elp3 tuc1'i kurtardığından, mcm(5)s(2)U34'ün birincil işlevi, yanlış anlama hatalarını önlemek yerine aynı kökenli kodonları okuma verimliliğini artırmak gibi görünüyor . Şaşırtıcı bir şekilde, tek başına mcm(5)s(2)U içermeyen tRNA(Lys)'in aşırı ekspresyonu, çift mutantın yaşayabilirliğini yeniden sağlamak için yeterliydi. |
34537906 | Anafaz başlangıcından sonra, hayvan hücreleri, sitoplazmik bir köprü ile birbirine bağlanan iki yavru hücre oluşturmak üzere plazma zarını daraltan bir aktomiyosin kasılma halkası oluşturur. Köprü sonuçta sitokinezi tamamlamak için kesilir. Omurgalılarda, böceklerde ve nematodlarda sitokineze katılan proteinleri tanımlamak için sayısız teknik kullanılmıştır. Yaklaşık 20 proteinden oluşan korunmuş bir çekirdek, çoğu hayvan hücresinde ayrı ayrı sitokineze katılır. Bu bileşenler kasılma halkasında, merkezi mil üzerinde, RhoA yolu içinde ve zarı genişleten ve köprüyü kesen kesecikler üzerinde bulunur. Sitokinez ek proteinleri içerir, ancak bunlar veya sitokinezdeki gereksinimleri hayvan hücreleri arasında korunmaz. |
34544514 | ARKA PLAN İndometasin, patent duktus arteriyozusun (PDA) kapatılması için standart tedavi olarak kullanılır, ancak çeşitli organlara kan akışının azalmasıyla ilişkilidir. Başka bir siklo-oksijenaz inhibitörü olan ibuprofen, daha az yan etkiyle indometasin kadar etkili olabilir. AMAÇLAR Erken doğmuş, düşük doğum ağırlıklı veya erken doğmuş ve düşük doğum ağırlıklı bebeklerde patent duktus arteriyozusun kapatılmasında indometasin, diğer siklo-oksijenaz inhibitörü, plasebo veya müdahale yapılmaması ile karşılaştırıldığında ibuprofenin etkinliğini ve güvenliğini belirlemek. ARAMA YÖNTEMLERİ Mayıs 2014'te Cochrane Kütüphanesi, MEDLINE, EMBASE, Clincialtrials.gov, Controlled-trials.com ve www.abstracts2view.com/pas'ı araştırdık. SEÇİM KRİTERLERİ Bir hastalığın tedavisi için ibuprofen ile ilgili randomize veya yarı randomize kontrollü çalışmalar. Yeni doğan bebeklerde PDA. VERİ TOPLAMA VE ANALİZ Veri toplama ve analiz, Cochrane Neonatal İnceleme Grubunun yöntemlerine uygundur. ANA SONUÇLAR 2190 bebeğin kaydedildiği 33 çalışmayı derledik. İki çalışma intravenöz (iv) ibuprofen ile plaseboyu karşılaştırdı (270 bebek). Bir çalışmada (134 bebek) ibuprofen PDA'nın kapatılamaması olasılığını azaltmıştır (risk oranı (RR) 0,71, %95 güven aralığı (CI) 0,51 ila 0,99; risk farkı (RD) -0,18, %95 GA -0,35 ila -0,01; ek bir faydalı sonuç için tedavi edilmesi gereken sayı (NNTB) 6, %95 GA 3 ila 100). Bir çalışmada (136 bebek), ibuprofen bebek ölümleri, okulu bırakan bebekler veya kurtarma tedavisi gerektiren bebeklere ilişkin bileşik sonuçları azaltmıştır (RR 0,58, %95 GA 0,38 - 0,89; RD -0,22, %95 GA -0,38 - - 0,06; NNTB 5, %95 GA 3 ila 17). Bir çalışma (64 bebek) oral ibuprofeni plaseboyla karşılaştırdı ve PDA'nın kapatılma başarısızlığında önemli bir azalma olduğunu kaydetti (RR 0,26, %95 GA 0,11 ila 0,62; RD -0,44, %95 GA -0,65 ila -0,23; NNTB 2, 95) % GA 2 ila 4). Yirmi bir çalışma (1102 bebek), indometazin (oral veya iv) ile karşılaştırıldığında ibuprofen (oral veya iv) ile PDA kapatılmasında başarısızlık oranlarını bildirdi. Gruplar arasında anlamlı bir fark yoktu (tipik RR 1,00, %95 GA 0,84 ila 1,20; I(2) = %0; tipik RD 0,00, %95 GA -0,05 ila 0,05; I(2) = %0). Nekrotizan enterokolit (NEC) gelişme riski ibuprofen için azalmıştır (16 çalışma, 948 bebek; tipik RR 0,64, %95 CI 0,45 ila 0,93; tipik RD -0,05, %95 CI -0,08 ila -0,01; NNTB 20, %95) CI 13 ila 100; I(2) = hem RR hem de RD için %0). Solunum desteğinin süresi, iv veya oral indometazin ile karşılaştırıldığında ibuprofen (oral veya iv) ile azalmıştır (altı çalışma, 471 bebek; ortalama fark (MD) -2,4 gün, %95 GA -3,7 ila -1,0; I(2) = Oral ibuprofeni indometazin (oral veya iv) ile karşılaştıran yukarıdaki çalışmaların bir alt grubundaki sekiz çalışma (272 bebek) PDA kapatılmasında başarısızlık oranları bildirmiştir. Gruplar arasında anlamlı bir fark yoktu (tipik RR 0,96, %95 GA 0,73 ila 1,27; tipik RD -0,01, %95 GA -0,12 ila 0,09). NEC riski, indometazine (oral veya iv) kıyasla oral ibuprofen ile azalmıştır (yedi çalışma, 249 bebek; tipik RR 0,41, %95 CI 0,23 ila 0,73; tipik RD -0,13, %95 CI -0,22 ila -0,05; NNTB) 8, %95 CI 5 ila 20; I(2) = hem RR hem de RD için %0). PDA'yı oral ibuprofen ile kapatmada başarısızlık riski, iv ibuprofen ile karşılaştırıldığında azalmıştır (dört çalışma, 304 bebek; tipik RR 0,41, %95 GA 0,27 - 0,64; tipik RD -0,21, %95 GA -0,31 - -0,12; NNTB 5, %95 GA 3 ila 8). İndometazin ile karşılaştırıldığında ibuprofen alan bebeklerde geçici böbrek yetmezliği daha az görüldü. Yüksek doz ve standart doz iv ibuprofen, erken ve beklenen iv ibuprofen uygulaması, ekokardiyografi eşliğinde iv ibuprofen tedavisi ve standart iv ibuprofen tedavisi ve sürekli ibuprofen infüzyonu ve aralıklı ibuprofen bolusları ve uzun süreli takip de incelenmiştir. herhangi bir sonuca varmak için birkaç deneme. YAZARLARIN SONUÇLARI İbuprofen, PDA'nın kapatılmasında indometasin kadar etkilidir ve şu anda tercih edilen ilaç gibi görünmektedir. İbuprofen NEC ve geçici böbrek yetmezliği riskini azaltır. İbuprofenin oro-gastrik uygulaması, iv uygulama kadar etkili görünmektedir. Daha fazla öneride bulunmak için, yüksek dozda standart doz ibuprofenin etkinliğini, ibuprofenin erken uygulanmasına karşı beklemede uygulanmasını, ekokardiyografi eşliğinde standart iv ibuprofene karşı ve sürekli infüzyona karşı aralıklı ibuprofen boluslarının etkinliğini değerlendiren çalışmalara ihtiyaç vardır. İbuprofenin PDA'lı bebeklerde uzun vadeli sonuçlar üzerindeki etkisini değerlendiren çalışmalar eksiktir. |
34559336 | Üç Pol X ailesi üyesi, memelilerde homolog olmayan uç birleştirme (NHEJ) ile ilişkilendirilmiştir. Şablondan bağımsız TdT, V(D)J rekombinasyon ara maddelerinin NHEJ'e bağımlı onarımı sırasında çeşitliliği destekler, ancak şablona bağımlı polimerazlar mu ve lambda'nın NHEJ'deki rolleri belirsizliğini koruyor. Burada pol mu ve pol lambda'nın, uçlar kısmen tamamlayıcı çıkıntılara sahip olduğunda boşlukları doldurmak için NHEJ faktörleri tarafından benzer şekilde işe alındığını gösteriyoruz, bu da NHEJ'de doğruluğu destekleyen eşdeğer roller öneriyor. Bununla birlikte, yalnızca pol mu immünoglobulin kappa rekombinasyonu sırasında doğruluğu arttırır. Bu ayırt edici in vivo rol, primer terminalleri şablon iplikçiğinde tamamlayıcı bazlardan yoksun olduğunda pol mu'nun TdT benzeri yeteneği ile ilişkilidir, ancak pol lambda değil. Bununla birlikte, TdT'den farklı olarak, bu bağlamda pol mu tarafından yapılan sentez, öncelikle başka bir DNA molekülünden gelen bir şablon tarafından yönlendirilir. Şablon bağımlılığının bu bariz derecesi büyük ölçüde üç polimerazın hepsinde mevcut olan ancak farklı olan küçük bir yapısal elemente atfedilebilir. |
34582256 | Bu çalışmanın amacı, endotoksin kaynaklı ateşle ilişkili ısı üretimindeki artışta kahverengi yağ dokusunun (BAT) ve sempatik sinir sisteminin rolünü değerlendirmekti. Oksijen tüketiminin (VO2), 24 saat arayla verilen iki doz endotoksin (Escherichia coli lipopolisakkarit, 0,3 mg/100 g vücut ağırlığı) sonrasında 4 saatlik bir süre boyunca önemli ölçüde arttığı (%28) bulundu. Karışık bir beta-adrenoseptör antagonistinin (propranolol) enjeksiyonu, endotoksinle tedavi edilen sıçanlarda VO2'yi %14 oranında azaltırken, seçici beta 1- (atenolol) veya beta 2- (ICI 118551) antagonistleri, VO2'yi %10 oranında baskıladı. Bu ilaçlar kontrol hayvanlarında VO2'yi etkilemedi. İn vitro mitokondriyal guanozin 5'-difosfat (GDP) bağlanması ölçümlerinden değerlendirilen BAT termojenik aktivitesi, yıldızlararası BAT'ta %54 ve diğer BAT depolarında %171 oranında yükseltilmiştir. İnterkapular deponun bir lobunun cerrahi denervasyonu bu yanıtları önledi. Endotoksin, protein eksikliği olan diyetlerle beslenen sıçanlarda GDP bağlanmasını uyarmakta başarısız oldu. Bunun nedeni, BAT termojenik aktivitesinin, bu diyetlerle beslenen kontrol sıçanlarında zaten yüksek olması veya endotoksinin, protein eksikliği olan hayvanlarda gıda alımının belirgin bir şekilde baskılanmasına neden olması olabilir. Sonuçlar, BAT'ın sempatik aktivasyonunun endotoksine verilen termojenik tepkilerde rol oynadığını ve bunların diyet manipülasyonu ile değiştirilebileceğini göstermektedir. |
34603465 | Kolin, epigenetik düzenleme için gerekli olan önemli bir besin ve metil donörüdür. Burada, kolin kullanan tek bir enzimden yoksun bir mikrobiyal topluluk tasarlayarak bağırsak mikrobiyal kolin metabolizmasının bakteriyel uygunluk ve konak biyolojisi üzerindeki etkisini değerlendirdik. Sonuçlarımız, kolin kullanan bakterilerin bu besin maddesi için konakçıyla rekabet ettiğini, metil donör metabolitlerinin plazma ve hepatik düzeylerini önemli ölçüde etkilediğini ve kolin eksikliğinin biyokimyasal belirtilerini özetlediğini göstermektedir. Yüksek düzeyde kolin tüketen bakteri barındıran fareler, yüksek yağlı diyet bağlamında metabolik hastalıklara karşı artan duyarlılık gösterdi. Ayrıca, bakteriyel kaynaklı metil donör mevcudiyetinin azalması, hem yetişkin farelerde hem de onların yavrularında genel DNA metilasyon modellerini etkilemiş ve davranışsal değişikliklere yol açmıştır. Sonuçlarımız bakteriyel kolin metabolizmasının konak metabolizması, epigenetik ve davranış üzerindeki yeterince takdir edilmeyen etkisini ortaya koymaktadır. Bu çalışma, optimal besin alımı gereksinimleri belirlenirken mikrobiyal metabolizmadaki kişilerarası farklılıkların dikkate alınması gerektiğini göstermektedir. |
34604584 | SR proteinleri, ekzonik birleştirme arttırıcılara (ESE'ler) bağlanarak ekson katılımını destekleyen iyi karakterize edilmiş RNA bağlama proteinleridir. Ancak model genlerden çıkarılan düzenleyici kuralların genel olarak hücredeki SR proteinlerinin aktivitelerine uygulanıp uygulanmayacağı açık değildir. Burada, fare embriyosu fibroblastlarında (MEF'ler) eklemeye duyarlı diziler ve CLIP-seq kullanarak iki prototip SR proteini olan SRSF1 (SF2/ASF) ve SRSF2'nin (SC35) global analizlerini rapor ediyoruz. Beklenmedik bir şekilde, bu SR proteinlerinin in vivo olarak ekzonların hem dahil edilmesini hem de atlanmasını teşvik ettiğini bulduk, ancak bağlanma modelleri bu tür zıt tepkileri açıklamaz. Daha ileri analizler, bir SR proteininin kaybına, etkilenen ekzonlardaki diğer SR proteinlerinin etkileşiminde koordineli bir kayıp veya telafi edici kazanç eşlik ettiğini ortaya koymaktadır. Bu nedenle, bir SR proteini tarafından düzenlenen ekleme üzerindeki spesifik etkiler aslında memeli genomlarındaki diğer birçok SR proteini ile olan karmaşık ilişkiler dizisine bağlıdır. |
34615397 | İnsan tüberküloz granülomu, tüberkülozun sonucunun merkezinde yer alan lokal bağışıklık süreçlerinin morfolojik temelini oluşturur. İnsan hastalardaki bilgi kıtlığı nedeniyle bu çalışmanın amacı, sızan dokunun işlevsel ve yapısal özellikleri hakkında fikir edinmekti. Bu amaçla lezyonlardaki mikobakteriyel yük ve farklı doku lokasyonlarına yayılımının yanı sıra konakçı immün hücrelerinin dağılımı, biyolojik fonksiyonları ve etkileşimleri araştırıldı. Eskiden sağlıklı olan akciğer dokusunda erken granülom oluşumunun analizi, mikobakteriyel enfeksiyon bölgelerine uzay-zamansal hücresel infiltrasyon dizisini ortaya çıkardı. Gelişmekte olan granülomun, nekrotik merkezi çevreleyen az sayıda CD8(+) hücre içeren bir iç hücre katmanından ve mikobakteri içeren antijen sunan hücrelerin yanı sıra CD4(+), CD8'i barındıran bir dış lenfosit infiltrasyon alanından oluşan genel bir yapısı tanımlandı. (+) ve ikincil lenfoid organlara benzeyen aktif folikül benzeri merkezlerdeki B hücreleri. Granülomların periferik kenarındaki foliküler yapıların, akciğer tüberkülozunda kalıcı konakçı yanıtının düzenlenmesi için morfolojik bir substrat görevi gördüğü sonucuna varılmıştır. |
34630025 | Eozinofiller, nöromiyelitis optikadaki (NMO) inflamatuar demiyelinizan lezyonlarda bol miktarda bulunur. NMO patogenezinde eozinofillerin rolünü ve eozinofil inhibitörlerinin terapötik potansiyelini araştırmak için hücre kültürü, ex vivo omurilik dilimleri ve NMO'nun in vivo fare modellerini kullandık. Fare kemik iliğinden kültürlenen eozinofiller, NMO otoantikorunun (NMO-IgG) varlığında aquaporin-4 eksprese eden hücre kültürlerinde antikora bağımlı hücre aracılı sitotoksisite (ADCC) üretti. Kompleman varlığında eozinofiller, komplemana bağımlı hücre aracılı sitotoksisite (CDCC) mekanizması yoluyla hücre ölümünü büyük ölçüde arttırdı. NMO patolojisi, NMO-IgG ile tedavi edilen omurilik dilim kültürlerinde eozinofillerin veya bunların granül toksinlerinin dahil edilmesiyle üretildi. Eozinofil stabilize edici etkilere sahip olan ikinci nesil antihistaminikler setirizin ve ketotifen, NMO-IgG/eozinofile bağlı sitotoksisiteyi ve NMO patolojisini büyük ölçüde azaltmıştır. Canlı farelerde, NMO-IgG ve komplemanın sürekli intraserebral enjeksiyonu ile üretilen demiyelinizan NMO lezyonları, belirgin eozinofil infiltrasyonu gösterdi. Transgenik hipereozinofilik farelerde lezyon şiddeti arttı. Anti-IL-5 antikoru veya gen delesyonu ile hipoeozinofilik hale getirilen farelerde ve ağızdan setirizin alan normal farelerde lezyon şiddeti azaldı. Sonuçlarımız, ADCC ve CDCC mekanizmaları yoluyla NMO patogenezinde eozinofillerin rol oynadığını ortaya koymakta ve onaylanmış eozinofil stabilize edici ilaçların terapötik kullanımını önermektedir. |
34733465 | ARKA PLAN Kistik fibrozlu hastalarda plazma yağ asitlerinin seviyeleri değişmiştir. Daha önce kistik fibroz nakavt farelerden etkilenen dokularda araşidonik asit seviyelerinin arttığını ve dokosaheksaenoik asit seviyelerinin azaldığını göstermiştik. Bu çalışmada, kistik fibrozis transmembran iletkenlik düzenleyici (CFTR) geninde mutasyon bulunan insanlarda, CFTR eksprese eden dokularda benzer bir yağ asidi defektinin olup olmadığını belirledik. YÖNTEMLER Nazal ve rektal biyopsi örneklerinden, nazal epitelyal kazıntılardan ve plazmadan elde edilen yağ asitleri, kistik fibrozisli 38 denekten analiz edildi ve 13 zorunlu heterozigot, 24 sağlıklı kontrol, 11 inflamatuar barsak hastalığı olan birey, 9 üst düzey hastalıklı birey ile karşılaştırıldı. solunum yolu enfeksiyonu ve 16 astım hastası. SONUÇLAR Kistik fibrozlu ve pankreas yeterliliği olan deneklerden ve kistik fibrozlu ve pankreas yetmezliği olan deneklerden alınan mukozal ve submukozal nazal biyopsi örneklerinde (P<0.001) ve rektal biyopsi örneklerinde (P=0.009) arakidonik ila dokosaheksaenoik asit oranı arttı. sağlıklı kontrol deneklerindeki değerlerle karşılaştırıldığında. Nazal dokudaki bu değişiklik, araşidonik asit seviyelerindeki artışı ve dokosaheksaenoik asit seviyelerindeki azalmayı yansıtıyordu. Nazal mukozadaki hücrelerde, sağlıklı kontrollerle karşılaştırıldığında kistik fibrozisli deneklerde araşidonik ila dokosaheksaenoik asit oranı arttı (P<0.001), zorunlu heterozigotlardaki değerler bu iki grup arasında orta düzeydeydi (P<0.001). İnflamatuar barsak hastalığı olan kişilerde bu oran artmamıştır. Astımı olan kişiler ve üst solunum yolu enfeksiyonu olan kişiler, kistik fibrozlu kişiler ile sağlıklı kontrol deneklerdeki değerler arasında orta düzeyde değerlere sahipti. SONUÇLAR Bu veriler, yağ asitlerindeki kistik fibroz nakavt farelerdekine benzer değişikliklerin, kistik fibrozlu deneklerden alınan CFTR eksprese eden dokuda mevcut olduğunu göstermektedir. |
34735369 | Hücreler arası yapışma alanındaki son gelişmeler, altta yatan aktin hücre iskeleti ile yapışık bağlantı birleşiminin önemini vurgulamaktadır. Deri epitel hücrelerinde yapışık bağlantı oluşumunun dinamik bir özelliği, bitişik hücrelerin zarına fiziksel olarak çıkıntı yapan ve uçlarında yapışık bağlantı protein komplekslerinin kümelenmesini katalize eden filopodia'yı içerir. Buna karşılık, bu komplekslerin sitoplazmik arayüzünde aktin polimerizasyonu uyarılır. Mekanizma belirsiz kalmasına rağmen, VASP/Mena protein ailesi bu bölgelerde aktin polimerizasyonunun düzenlenmesinde rol oynuyor gibi görünüyor. İn vivo olarak, yapışık bağlantı oluşumunun, epitelyal tabakaların, örneğin embriyonik gelişimde ventral kapanmada veya doğum sonrası hayvanda yara iyileşmesinde stabil hücreler arası bağlantılar oluşturmak için fiziksel olarak yakınlaştırılması gereken süreçlerde filopodia'ya dayandığı görülmektedir. |